3AXXA

Functional analysis of hyperthermophilic endocellulase from the archaeon pyrococcus horikoshii
Total Genus 140
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
140
sequence length
377
structure length
377
Chain Sequence
QTPTGIYYEVRGDTIYMINVTSGEETPIHLFGVNWFGFETPNHVVHGLWKRNWEDMLLQIKSLGFNAIRLPFCTESVKPGTQPIGIDYSKNPDLRGLDSLQIMEKIIKKAGDLGIFVLLDYHRIGCTHIEPLWYTEDFSEEDFINTWIEVAKRFGKYWNVIGADLKNEPHSVTSPPAAYTDGTGATWGMGNPATDWNLAAERIGKAILKVAPHWLIFVEGTQFTNPKTDSSYKWGYNAWWGGNLMAVKDYPVNLPRNKLVYSPHVYGPDVYNQPYFGPAKGFPDNLPDIWYHHFGYVKLELGYSVVIGEFGGKYGHGGDPRDVIWQNKLVDWMIENKFCDFFYWSWNPDSGDTGGILQDDWTTIWEDKYNNLKRLMD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Functional analysis of hyperthermophilic endocellulase from Pyrococcus horikoshii by crystallographic snapshots
pubmed doi rcsb
molecule keywords 458aa long hypothetical endo-1,4-beta-glucanase
molecule tags Hydrolase
source organism Pyrococcus horikoshii
total genus 140
structure length 377
sequence length 377
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature ec 3.2.1.4: Cellulase.
pdb deposition date 2011-04-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00150 Cellulase Cellulase (glycosyl hydrolase family 5)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3axxA00
3VMPA 3VDAA 1QPKA 3UR8A 2WM0A 2RGMA 3QHMA 1CLVA 4XZBA 3CMGA 2VRQA 4K68A 3APGA 2WC7A 1JNDA 3AZTA 3JUGA 3FAXA 4KRTA 1G5AA 2ZX7A 3BAKA 3ZJ6A 4NSBA 4B3KA 2XGIA 2DSZA 3N1AA 3LPFA 4AMCA 3WDHA 3WD1A 2C0HA 2VZSA 4HOXA 3SCRA 1CECA 3FXYA 2WW5A 3WDJA 1BFNA 4E8CA 2OYLA 3K1DA 4H8VA 3WQ5A 3SCSA 1CXLA 3AQUA 1UG6A 2YA0A 4LGXA 1WO2A 4F8XA 2VZUA 3EDEA 4UFKA 1UKPA 2VNCA 4N0RA 4OUEA 1UKOA 2A3HA 4D6HA 2D23A 1VF8A 5TD4A 1GHSA 3AIUA 1V6XA 3L4ZA 4D71A 3NSNA 4PSPA 1KCLA 4ATDA 2W4XA 5BXRA 4D1JA 5A6AA 1NWUA 1OD8A 1HP4A 1Z32X 5I0DA 2ZUWA 4W8BA 3UG4A 1EQPA 3VINA 4MADA 5A8QA 5A1AA 4HPHA 3KE0A 3NYDA 2V38A 6A3HA 2OWCA 2CHNA 1JZ6A 3LPOA 3FNDA 3WQVA 2XVGA 5A6KA 3VMOA 3WEZA 8A3HA 5JBFA 1ZBKA 3F5LA 4PBGA 1H09A 1W3JA 3MV01 2EPOA 4GZIA 3W27A 2VOTA 2Y8KA 4TVCA 4FF5A 3N9KA 5FD0A 2YKKA 2BVDA 1BGGA 1HJSA 2WKLA 1MQQA 3GNPA 5HPCA 2V3GA 1NARA 4AD4A 4GKLA 3W26A 3VGHA 1CXKA 1G94A 3THDA 4Q7NA 2DSWA 1I1WA 3VD9A 4JKKA 1QNSA 4UFIA 4J7RA 2GJPA 1G1YA 2GUYA 1KWGA 3SCVA 3U7BA 5HPOA 2JIEA 1JIBA 1QNOA 4W7WA 1W2VA 2C8NA 2ZWZA 2Z1KA 2J47A 4CD4A 4U2YA 2QPUA 3I3BA 9CGTA 3VMNA 1BTCA 1ZS2A 1MYRA 1OD0A 3M7SA 3PZUA 4Z2LA 4RE3A 2AOSA 2WBKA 2DH2A 1W32A 4ATLA 1EGZA 1E55A 1GOMA 4Z2KA 2UWFA 1OGSA 4XB3A 1WKYA 1MVYA 2WMIA 2PWEA 4CD6A 1A3HA 3VILA 4AZ6A 3PBGA 2PWHA 3ARYA 4DM2A 1UD2A 3QHOA 2YDSA 3KWXA 1OCQA 4W93A 1V6VA 3MUY1 1NWTA 4JFTA 1GOKA 3WQ4A 3ZSTA 5IHSA 2ZICA 3VDBA 2QV4A 5DF0A 3ARRA 1CIUA 4U2ZA 5DMYA 4PCSA 1KXVA 4UFJA 3AIQA 5C70A 1VFMA 2WVUA 3BCDA 1JGIA 2CETA 5EMYA 3WD4A 2VR5A 3BAIA 2XIBA 1JXKA 3UCQA 3VDHA 1GUVA 3PZ9A 3GM8A 3F5KA 5D8ZA 4KH2A 5I6SA 1H41A 1TE1A 1WP6A 2XPKA 1O6IA 2WMFA 4H7VA 2WWCA 3ARQA 4RE4A 4UOQA 3AISA 2YDRA 4IISA 5CPQA 1CGVA 1WNOA 1E15A 2CBJA 5E70A 4GI9A 1VBRA 3WF4A 1HT6A 7CGTA 3W6LA 4XUYA 3ZR5A 1V3KA 1SMAA 3VGEA 1W3LA 1E71M 2ZUUA 1VJSA 2BY3A 2YL6A 1BLIA 3MSGA 3CGTA 1MW3A 1UH2A 2BFGA 2WVSA 4GQRA 1UD6A 1W9PA 4CU6A 3MS8A 3F5JA 3ARZA 2W63A 5E6YA 1UH4A 1GOWA 1PIFA 4PTXA 3TP4A 3CZLA 1EOKA 2O9RA 4CVUA 3BAYA 1FH8A 3BC9A 3NDYA 3CH9A 2G41A 2VURA 3N12A 2YDQA 3VD3A 1PEZA 3WFLA 2AMGA 1WPCA 2F61A 1PAMA 1JNEA 4AD2A 1OIFA 4JCLA 1OGBA 3AOFA 3SURA 5I5RA 4FMVA 3VD7A 5BXTA 1NP0A 3A47A 1H0IA 2YBUA 3L4UA 3SCNA 1JI1A 1E1FA 4JIEA 4AD1A 3AHVA 4NF7A 1UD4A 3L2MA 1B1YA 3PZMA 1EQCA 3W28A 2WKGA 4KRUA 4JAWA 3VIFA 5I78A 1HL9A 1DWGM 3W29A 1KGUA 1WDSA 4BA0A 1HJUA 2JEQA 3K8KA 2WHLA 1MXGA 3GNOA 2BS9A 4MJ4A 1GJUA 3TTOA 2NT1A 5E09A 1BG4A 4JL1A 1NM9A 3VD5A 2W92A 2DDXA 2ZUMA 5A2AA 5HXMA 1DWJM 1FP8A 5A6JA 1NOUA 1CEOA 3W38A 3S6TA 3HMCA 1QI5A 3L4XA 1WB0A 1J9YA 1KR0A 4B9YA 5JIWA 5BCAA 1E40A 3BH4A 3PZGA 3I3EA 2ZX8A 2GJRA 5CSYA 5E6ZA 3FHQA 4MDPA 2VZTA 1R86A 1KBBA 1ZBWA 5A69A 2O92A 1TVPA 4KGLA 2ZXBA 1NOFA 3I3DA 3VIGA 1WDQA 5LA0A 3AS0A 3NJ3A 3VVGA 4AD0A 2J7BA 4W88A 2XVNA 2CEQA 3RM9A 5I79A 2JALA 4AEFA 4GZJA 5BXSA 1XC6A 3QOKA 5FKYA 2PC8A 3VIPA 1FOBA 1ISWA 1VEOA 4QLKA 2DT3A 1E6ZA 1X6LA 3N15A 1W9VA 2VX5A 1UWUA 5KZ6A 1OM0A 3OB8A 3BAXA 4AZGA 3AXXA 4EAMA 3DYPA 2YA2A 1GZJA 2O9TA 4J3WA 1UKTA 3QGVA 1DHKA 5GNXA 1H2JA 4W8AA 3EDFA 3AMDA 3OIHA 1KWKA 3SCPA 3MUIA 3O9NA 2FHFA 1WDRA 1TUXA 1U2YA 3CHFA 1XYZA 3CZ8A 1X6NA 1UWRA 1M01A 1HX0A 4UNIA 4D1IA 2EO7A 2WANA 2EPNA 1YHTA 2VUYA 4RL3A 3ZT5A 1KQZA 2YL9A 4D6CA 1JZ2A 4ZFMA 3WDQA 4AZCB 1TA3A 5CLTA 3HJEA 1BGAA 3WNPA 3SEPA 3LPGA 1HVQA 3N17A 5M17A 1YQ2A 1JZ4A 1AQMA 2Y8VA 3GXMA 3KEHA 1R7AA 3NUKA 3GNRA 3VIOA 4IPNB 4WKAA 1HKKA 4P8UA 2E8YA 3WQ8A 2PB1A 2GK1B 4Z2JA 1Q6GA 1C7SA 2EPLX 3RILA 2VCCA 1BAGA 3VGGA 1E4NA 4W8LA 2Q8XA 1ITCA 1HN1A 3VPLA 2EPMX 1E73M 1TCMA 4M1RA 4D72A 3WUFA 1NH6A 2CITA 1KGWA 4U3AA 2X0YA 3IAQA 1K9EA 2YL5A 1WZLA 3ARSA 1UWQA 4PTWA 2A3CA 2DT1A 3TOPA 4H41A 1E3ZA 2WSPA 2WMGA 2CBIA 2C7FA 1CTNA 1B3VA 2CERA 4U5KA 7A3HA 1D2KA 2YLLA 1L8NA 3VM5A 4JZ5A 2VI0A 3WMCA 4L4OA 3EDKA 2IUZA 3E1F1 3MMDA 2VR4A 3CUHA 2DPEA 4ACZB 1AMYA 3ZSSA 3AMCA 5IDIA 1DEDA 2UY4A 2D2OA 2YLAA 2BHZA 4TVUA 1OBAA 3T2QA 4JKMA 3CMJA 1BF2A 3PTKA 2JFEX 1JYNA 4J3XA 2GFTA 1M53A 2ZE0A 2Y24A 2FGLA 1JDCA 5I2UA 2PI6A 4EANA 3FY1A 5CPSA 3T0DA 2WBGA 2ZIDA 1V3LA 2X2YA 4YHEA 1GOOA 4ATWA 4U3CA 3WF1A 1H0GA 5A6SA 3K8LA 1WZAA 3SUWA 1EOMA 3CUIA 1GVYA 3ARUA 2VQTA 1B30A 4AIEA 3WUBA 4DWSB 1HKMA 1QW9A 3WSUA 1L0PA 1FHLA 2XM1A 1UUQA 1DWFM 1UKSA 1V02E 3AYRA 2VL4A 3AIRA 3VIJA 1QI2A 1HP5A 3DHPA 2J62A 2WCSA 5ABGA 5GPRA 4TVDA 4WK9A 1W9XA 1ZBVA 3UERA 5ABFB 4MAZA 4UQEA 1E0WA 1MFVA 3BAWA 2VX4A 6TAAA 2WWDA 1I1XA 3IJ8A 3VIHA 3M07A 4LX4A 4UZUA 1TG7A 2E9BA 4F79A 1CXHA 1OIMA 2BY0A 1J18A 3VNZA 1B3ZA 2ZUNA 2J78A 5IHRA 3EMZA 4XZWA 1GW1A 5ECUA 2XSAA 5DO8A 3SUUA 1BG9A 4AZ7A 4F66A 4CGTA 1J11A 1QW8A 2WCGA 1QI3A 2V3EA 5A94A 1MW0A 3AS1A 4WKFA 1BHGA 1LLOA 1C8YA 1Y7VA 2ZUTA 2CBVA 3PZTA 1GOQA 1C8XA 3CZKA 1V03A 3AMGA 1GNXA 1HVXA 4W85A 3OA5A 4WKHA 2FHBA 1K6AA 1CGUA 4CKQA 1VFFA 5CG0A 1RH9A 1CGYA 4UQCA 1M7XA 4OZOA 3T09A 1E6PA 2Z1SA 5M5DA 3WNNA 5D9OA 2XFRA 1QI4A 4H2CA 4UFHA 1PX3A 1QNRA 5I3DA 5A6LA 2CBUA 2D3NA 2XM2A 1UQZA 4HTYA 4DWSC 4GI6A 2Y2WA 4BCEA 1CGTA 1B9ZA 2PWGA 1WCGA 2Y5EA 3AXHA 3CUJA 5ABEA 1PX8A 1N82A 4P7LA 3B9DA 3GXIA 3ZM8A 3WH7A 2W61A 4JFVA 4HOZA 4AZIA 3OLEA 4URIA 1B3WA 5DEZA 3BMWA 2XIIA 1BYDA 2OYMA 3AFBA 1BVNP 4W89A 3G6MA 1XD1A 2DT0A 1C90A 4J27A 4AZ5A 3NCOA 3CZEA 2PWFA 3SIMA 1RD6A 1TVNA 4GINA 1KXHA 1R7OA 1DWAM 5I24A 1OT2A 1V0LA 4A3YA 5E0FA 3SUVA 3O2LA 1J10A 1VENA 5C8BB 3K4DA 3WMBA 2DSVA 1FH9A 4V28A 4C7DA 2E4TA 1UA7A 1UZ4A 4M24A 5A2BA 3ZJ8A 1SFSA 1V3IA 4GQQA 1EIBA 1CXIA 2VC9A 3HN3A 3B8SA 4PYSA 1CDGA 1G0CA 4S3JA 1WZMA 1VFOA 3EMCA 4WIWA 5JIPA 1R85A 1EHAA 1H49A 2J79A 3AHTA 3AIVA 1OB0A 1UR8A 2OWWA 1V3JA 1W1YA 4TTGA 3WQ6A 1UOKA 2OSWA 1FA2A 1EO7A 4AD3A 2WHMA 2WK2A 3VO0A 2GSJA 1B31A 1V6YA 2EQDA 4CD7A 4E8DA 3PTMA 3GH7A 2YIHA 1H1NA 3NIYA 5FL1A 1IZKA 3ALGA 4M82A 3SCWA 4UOZA 3FN9A 2XVPA 2CPUA 4JL2A 4OIFA 3U5YA 2BHUA 1XSKA 1EXPA 5LA1A 1GONA 1JI2A 2G3JA 1EO5A 1S46A 1ECEA 4PMQA 6CGTA 1VEMA 3AHYA 3UG5A 1B3YA 5ABHA 4KMQA 1O7AA 5EB8A 4JFSA 5GQBA 3VTRA 5A8MA 4H8HA 1LJYA 1UHVA 4TX6A 3AZSA 4HZ8A 4YHGA 1JZ8A 5M3WA 2BY2A 5CXPA 2NSXA 1J0JA 3N13A 2BV9A 2G3MA 4OKDA 4BZYA 2CKRA 1E4LA 1E6QM 1NWSA 3PZQA 1LWHA 3GBEA 4CCCA 4PMRA 1W1PA 1V6WA 1JFHA 3THCA 3BSGA 2D24A 4AXNA 1XRVA 5I77A 1LL6A 1K9DA 3KL0A 5A95A 1KQYA 2IXVA 3A4AA 1JZ7A 3SUTA 1CLXA 1W1VA 1E4IA 4HOWA 1PZ3A 1QI0A 3NSMA 3T08A 5HBFA 3WELA 3OZOA 2V5DA 5D8WA 5KEZA 2XUCA 5CSUA 1V3HA 2JF6A 1BSIA 1XCXA 4UCFA 3ZQ9A 1V08A 3ZIZA 4U5IA 3ZMRA 1UWSA 1RP8A 3A4XA 2GJXB 3CLWA 3DHUA 1G01A 2YJQA 1M03A 3DC0A 4Y7EA 3N11A 3WENA 4F9JA 2FGZA 3BLPX 1X1NA 4J3SA 3MSDA 3PZOA 1PIGA 1UD5A 3GDBA 2DIJA 3CZGA 5HOSA 1PZ2A 4PMXA 3UG3A 4GZEA 4Z2GA 4MNJA 3SUSA 3II1A 4XX6A 3ZT7A 2MANA 3ARXA 1ZB5A 3D3AA 1CNVA 4D6JA 4IUGA 4ML4A 3WBEA 3AHXA 3CUFA 4TXEA 2ZWYA 4AZBA 2YBTA 2OSXA 3AZRA 3WUEA 5EBAA 3AICA 4AIOA 5DT5A 3BXWA 2WLZA 3VD4A 4CD8A 4QP0A 3W37A 2FH8A 4M29A 1SMDA 5DT7A 2WVVB 1W9UA 4P7NA 3PZIA 2JIWA 1QHPA 5HDRA 4KWUA 5JUVA 5AC5A 1OSEA 1KR1A 4HZ7A 3W6MA 1AVAA 1CXEA 1VB9A 2WSKA 5A6BA 1D3CA 1QNPA 4OJYA 1J0KA 4QAWA 1FP9A 2X09A 4AZCA 2VRKA 3WDRA 2BXYA 4WF7A 2OWXA 2X1IA 4JFUA 3NSXA 1QBBA 2J74A 1VJZA 2WMHA 2WVTA 4M8UA 4ZXOA 4W5UA 1XH0A 1ZJAA 2E40A 3CIVA 4X0VA 1US3A 4QCEA 4CCDA 3WH6A 1J0HA 4KGJA 1US2A 3MV11 3WF3A 4UFMA 2UY3A 3QOMA 4JCMA 5D4YA 2PWDA 2X05A 1HKJA 1K9TA 5D9MA 2GK1A 3PN8A 5A6MA 4OOUA 1C91A 3CO4A 3SCTA 3CHDA 5JBEA 2WZIA 3VKKA 3WNKA 1QHOA 4OBSA 1MFUA 4J3VA 4W7UA 3K46A 2WMJA 3GBDA 3PZVA 1WZKA 2DSUA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3VMP A;  3VDA A;  1QPK A;  3UR8 A;  2WM0 A;  2RGM A;  3QHM A;  1CLV A;  4XZB A;  3CMG A;  2VRQ A;  4K68 A;  3APG A;  2WC7 A;  1JND A;  3AZT A;  3JUG A;  3FAX A;  4KRT A;  1G5A A;  2ZX7 A;  3BAK A;  3ZJ6 A;  4NSB A;  4B3K A;  2XGI A;  2DSZ A;  3N1A A;  3LPF A;  4AMC A;  3WDH A;  3WD1 A;  2C0H A;  2VZS A;  4HOX A;  3SCR A;  1CEC A;  3FXY A;  2WW5 A;  3WDJ A;  1BFN A;  4E8C A;  2OYL A;  3K1D A;  4H8V A;  3WQ5 A;  3SCS A;  1CXL A;  3AQU A;  1UG6 A;  2YA0 A;  4LGX A;  1WO2 A;  4F8X A;  2VZU A;  3EDE A;  4UFK A;  1UKP A;  2VNC A;  4N0R A;  4OUE A;  1UKO A;  2A3H A;  4D6H A;  2D23 A;  1VF8 A;  5TD4 A;  1GHS A;  3AIU A;  1V6X A;  3L4Z A;  4D71 A;  3NSN A;  4PSP A;  1KCL A;  4ATD A;  2W4X A;  5BXR A;  4D1J A;  5A6A A;  1NWU A;  1OD8 A;  1HP4 A;  1Z32 X;  5I0D A;  2ZUW A;  4W8B A;  3UG4 A;  1EQP A;  3VIN A;  4MAD A;  5A8Q A;  5A1A A;  4HPH A;  3KE0 A;  3NYD A;  2V38 A;  6A3H A;  2OWC A;  2CHN A;  1JZ6 A;  3LPO A;  3FND A;  3WQV A;  2XVG A;  5A6K A;  3VMO A;  3WEZ A;  8A3H A;  5JBF A;  1ZBK A;  3F5L A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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