3AZRA

Diverse substrates recognition mechanism revealed by thermotoga maritima cel5a structures in complex with cellobiose
Total Genus 125
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
125
sequence length
311
structure length
311
Chain Sequence
MGVDPFERNKILGRGINIGNALEAPNEGDWGVVIKDEFFDIIKEAGFSHVRIPIRWSTHAYAFPPYKIMDRFFKRVDEVINGALKRGLAVVINIHHYEELMNDPEEHKERFLALWKQIADRYKDYPETLFFEILNEPHGNLTPEKWNELLEEALKVIRSIDKKHTIIIGTAEWGGISALEKLSVPKWEKNSIVTIHYYNPFEFTHQGAEWVEGSEKWLGRKWGSPDDQKHLIEEFNFIEEWSKKNKRPIYIGAFGAYRKADLESRIKWTSFVVREMEKRRWSWAYWEFCSGFGVYDTLRKTWNKDLLEALI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Diverse substrate recognition mechanism revealed by Thermotoga maritima Cel5A structures in complex with cellotetraose, cellobiose and mannotriose
pubmed doi rcsb
molecule keywords Endoglucanase
molecule tags Hydrolase
source organism Thermotoga maritima
total genus 125
structure length 311
sequence length 311
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.4: Cellulase.
pdb deposition date 2011-05-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00150 Cellulase Cellulase (glycosyl hydrolase family 5)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3azrA00
3SCRA 1E40A 1OGSA 1C8QA 1MXDA 1IT0A 5A8PA 1C91A 5FKYA 3DC0A 5I23A 4C7FA 2J62A 3MO4A 2YBTA 4NRRA 1TR1A 1QBBA 4TTGA 1R8LA 2PB1A 4EE9A 3WY1A 4PMNA 5AYBA 3WUGA 2J8GA 3GH5A 3PZUA 2WC4A 1BTCA 3AJ7A 2V38A 3GXIA 5EB8A 3BSHA 5M03A 3ARXA 2WC7A 1X6NA 4WKHA 1KBKA 5IHRA 2YIHA 3AIBA 3WNOA 2DT1A 1EQCA 2WBKA 4CN1A 1TFVA 1LWJA 1XCWA 3WIJA 1G9HA 4WIWA 1UD5A 5ABFB 3WNLA 3U7VA 1AQHA 2NT0A 2XGIA 2WZEA 3PZQA 1KQYA 2OYKA 3W4RA 4CU8A 4ZXLA 1HKIA 2WNWA 1V02E 1OB0A 1VFFA 4ATWA 5BRPA 3MUY1 1LG1A 1RPKA 3ZJ7A 1LF1A 4W7UA 2GSJA 2JALA 1GCYA 4H7VA 3GDBA 1WB0A 4OKDA 1CXFA 1UWIA 2WMHA 5JIWA 1FH8A 3TTQA 4D6HA 3TA9A 1XSJA 2GFTA 3KZSA 1VBRA 4BCEA 2VTFA 4GQRA 4F8XA 2Y8VA 2XFRA 3VGFA 1QNRA 5ABFA 3GXDA 4OOUA 4CVWA 2CNCA 2Y5EA 2YA0A 3KEHA 4B9ZA 4CN6A 3ARRA 2YL8A 4FLRA 3AS1A 1CXEA 4AWEA 3DYMA 1JXKA 2VZTA 4MNLA 1CZ1A 1GQLA 1DWJM 3EMCA 3OA5A 1VIWA 4BQ3A 1YQ2A 4MDPA 2X1IA 3IJ7A 4HU8A 3LPFA 2VO5A 4DUVA 4NF7A 1M03A 1EOKA 4CGTA 2CBJA 2WMJA 3WNPA 3PZNA 2XHYA 2VX4A 2ZXBA 5CPTA 3UERA 5CGTA 2WVTA 5AY7A 1HJWA 1BYCA 4QLKA 1GONA 5D9MA 3W25A 3ZM8A 3A4WA 1E5JA 3UCQA 1C90A 1VRXA 1UA7A 3MSGA 3ALGA 4JHOA 3PTKA 1G5AA 4R5EA 3T08A 3BMWA 7CGTA 3HN3A 5M17A 4BF7A 3OLEA 1L8NA 2VR5A 2FH8A 1UH2A 5IDIA 2RGLA 2YDRA 4Z2LA 2DT3A 1OGGA 4C7GA 1B9ZA 3U57A 2EPLX 1JF5A 4AD5A 4A4AA 3QOMA 5ECUA 2AAAA 3DHUA 2BY2A 2X8RA 4N42A 2CERA 1OT1A 4JFWA 3MV11 3ZOAA 4CN4A 1MQPA 1Y7VA 2ZWZA 3MSDA 3VIGA 4M24A 2WKLA 3EDJA 4XZWA 2JF6A 3O2LA 3FN9A 1UKQA 4AD2A 3OG2A 1JAKA 1JDDA 4QCFA 1QHPA 3BGAA 1UHVA 1E70M 1GOMA 2WVUA 1JNDA 4QFUA 1E71M 4P8XA 3VMPA 2UWFA 2W5FA 3AXXA 2D23A 2GJRA 3CUIA 3SUTA 5HPCA 4OZOA 1DWHM 3ZIZA 1OGBA 4AZGA 4PRWA 4CCDA 1WNOA 2GK1A 3VD4A 1K6AA 3ARVA 2EPKX 2WMIA 3TP4A 2DEPA 4U33A 2YL5A 4GXPA 4FMVA 1PIFA 1IV8A 5KEZA 2O9PA 1VFOA 2PWGA 2W61A 4NI3A 4WJXA 5EFFA 1BHGA 1MQRA 5CPQA 1H09A 3A3HA 1HXJA 1JYNA 1DWIM 1V0MA 4HA3A 5IHSA 1HL8A 4AD3A 2D20A 3L2LA 3ARTA 2UY4A 4YPJA 4DWSA 1BLIA 1W1PA 4WKAA 3ZSTA 2NSXA 3W38A 3ZR5A 3CHEA 4AZCB 3ARPA 1HL9A 4KH2A 2VZUA 3BMVA 3QR3A 3O6AA 3O9NA 3PZTA 1FH9A 3AIWA 4MB3A 3WMCA 2DT2A 1QNPA 3CZEA 2XIIA 1CPUA 4ATLA 1KWKA 3PZMA 2VCCA 5ABGA 4R27A 1E0XA 1W1YA 4QDMA 1XSKA 3CZGA 1U2YA 1GQJA 3B9DA 4LX4A 4FK9A 1JGIA 2WZIA 2WCGA 3GNOA 1D3CA 3NSMA 2VX7A 2J8FA 1UUQA 1DWAM 1GW1A 4RE4A 2EXOA 3EMZA 4D6FA 1J0IA 3VDHA 4XX6A 3T2PA 1R87A 1JZ4A 3CZ8A 3S6TA 1KGXA 3SCUA 4WSKA 4AZIA 3RILA 4PEEA 5JBDA 2A3AA 1E72M 1CYGA 3ZT7A 1RH9A 2VX5A 5KZ6A 2ZX7A 1XD0A 4U2ZA 3L4ZA 2CKSA 4E4PA 1FFQA 2GJXB 1BF2A 3WENA 3HMCA 3K8MA 1E1EA 4M82A 5AYIA 4F9JA 1PAMA 1UR9A 3MMWA 2E8ZA 3AIQA 1CLVA 1JFHA 4H2CA 4ACZB 2QMKA 4DUWA 4U2YA 1ECEA 4JKLA 3FY1A 1BYAA 1UR1A 1QOXA 1V3MA 2J7EA 5LA1A 3FW6A 5CLWA 3OZOA 1EDGA 4Y7EA 1OIMA 1UWUA 1VEPA 2BNJA 5IFPA 3SCVA 2CETA 5A69A 4QLLA 1J0ZA 4W93A 4W8LA 4ZEPA 3M46A 3VM5A 1E4MM 3AIEA 2WAGA 3WUEA 2BY1A 4TOQA 1JXJA 2IXUA 3VGGA 1B3YA 2OWWA 2VMFA 3M07A 1H3GA 3RMEA 4PMZA 5I5RA 3W28A 3WDJA 4ZE5A 1B30A 4PCSA 2PWFA 4E8CA 1XD1A 2VZSA 1GQIA 1TMQA 4L4PA 1BVZA 4AD4A 3GNRA 2C8NA 3PBGA 2BY3A 1GVIA 1BG4A 2BFGA 2JE8A 3KL0A 3I3DA 3DHPA 4P8VA 3OB8A 4M80A 1Q6CA 2W4XA 4LXFA 4DM2A 4P8WA 5I3DA 4U5KA 1Q6GA 4LYRA 2BXYA 4B16A 2CEQA 1M01A 2WMGA 1QHZA 1C3FA 1C7TA 2DSVA 2XSBA 3A47A 3W82A 3K4DA 2D0FA 3AIUA 4J28A 3VNYA 3K8KA 5GQBA 2ZICA 4D1IA 1AVAA 3AHZA 1K9TA 4Z2HA 1FHDA 4HA4A 5DFAA 9CGTA 2G8ZA 1FFRA 4PTMA 5JUVA 1KXQA 1Q4NX 4UTFA 1CTNA 3T0AA 1KXHA 3WH8A 2JEQA 2VURA 2HISA 1KGWA 4AZ7A 4GINA 4UFMA 4UFKA 4PTXA 3ARUA 1V3LA 2VVNA 1VEMA 1CXKA 4UCFA 3WH5A 4TVUA 3N15A 5A8MA 1GOOA 2W91A 3NUKA 3RM9A 1GNXA 3WF0A 1CXHA 4B9YA 3RIKA 4KGLA 3RPMA 1UR4A 1TZ7A 4PMVA 3K1DA 2VCAA 1JFXA 3VIPA 2VJXA 4HOXA 1TG7A 4GZJA 1QI3A 3W27A 3WDQA 3RM8A 1G0CA 2DDXA 1UD2A 2EPNA 2O92A 1NWSA 2Z1KA 2ZX9A 3WNKA 3ZSSA 1YHTA 3SUSA 4U3AA 3ARSA 4PYSA 4U31A 6CGTA 3OLDA 2C7FA 4W89A 2W62A 5DMYA 1JZ2A 5GNXA 1JZ3A 1H0GA 1SMDA 2OWCA 3VDAA 1HKMA 2QHAA 1BYDA 1K9EA 1UWSA 3RJYA 4Z2IA 1UR0A 4GIAA 4AYSA 3AHTA 4M1RA 1AQ0A 2GVYA 1HVXA 2NT1A 1G1YA 4JAWA 4PMYA 1JYXA 1JNEA 4TVCA 3SUVA 4PMOA 2VOTA 1UWQA 4W84A 3WEOA 1V03A 4BQ5A 2XVLA 3WQ6A 3ZJKA 4IISA 3WQ8A 3AI0A 3SUUA 4UQAA 1KB3A 2EQDA 2GJPA 1CBGA 1E3ZA 5A8QA 3NSXA 5HPOA 1K9FA 4WLCA 1OIFA 3WD1A 3L4VA 2YLLA 2V3DA 4D6EA 1NARA 5E0FA 5C70A 1KFWA 1RP9A 1E0WA 1ODUA 2VT0A 3MU7A 1J9YA 3W6MA 1B90A 2FDMA 1K9DA 2D3LA 1F4AA 2DSWA 5CLTA 5BXSA 1HNYA 2W92A 1GUVA 4C7DA 1PBGA 1XHGA 2ZXDA 2ZWYA 2QLYA 3CHCA 2CPUA 4NRSA 4AMCA 3WDHA 4OUEA 5F7UA 1X1NA 2BVDA 5E6ZA 3UR7A 1XYZA 3VILA 4DWSC 4J3WA 3WQ4A 5FIPA 2ZX8A 3L4XA 1V6VA 4W8AA 2FHCA 1J0YA 4L4OA 4CD4A 5A6MA 3D5HA 4GZEA 4JFSA 3RM4A 1HT6A 1B3VA 3UETA 1NWRA 3SCNA 3AHYA 4J3XA 1H11A 3IJ9A 3N1AA 1MW3A 1CXIA 2VR4A 1J0KA 5HNNA 1EDQA 3EDKA 1UKSA 1QNQA 4PMRA 2WHJA 1V0LA 3UG4A 1QNSA 1RD6A 2CBIA 3UG3A 4MAVA 4RL3A 4XUYA 5EMYA 4FLSA 4PMXA 1TCMA 1WP6A 1JF6A 2WHKA 2OSWA 1HX0A 1UOKA 4OBRA 1XYFA 2V3FA 2ZX6A 1NM9A 1CWYA 2PBOA 3BAIA 2CHOA 4IPNB 2CXGA 3MMUA 3APGA 3WSUA 1LJYA 1SFSA 4JIEA 2VZOA 1PZ2A 3W81A 1E6PA 3VINA 1AQMA 3S2CA 2ZUUA 4JFTA 2XJ7A 1WZKA 5A1AA 4MB5A 3VVGA 2ZUVA 2DQXA 2ZE0A 4P7OA 2G3MA 1VFUA 3EYPA 4URIA 1CGYA 4WK9A 4AZHA 4QP0A 4AEEA 1E15A 4Q22A 2J75A 1ISVA 4D1JA 3AMGA 5CXPA 1UD3A 1E1FA 5CPSA 1MFVA 1J01A 4CU7A 5M5DA 2DSUA 2J79A 4TXEA 4YHEA 1CEOA 1H2JA 3ZT6A 4CD6A 2AOSA 4Q7NA 5BXTA 5I2UA 3BCDA 1W1TA 1MQQA 3CHFA 4PUEA 1VEOA 3VDBA 4MAZA 3OZPA 1QI2A 5DF0A 3BXWA 4PCTA 4NSBA 3PZVA 4HMCA 2DIEA 2BS9A 2EPMX 2GK1B 4KGJA 3VGDA 1JYWA 2WMIB 1BFNA 3VIJA 3WNMA 3VX1A 3THCA 1PZ3A 2UY5A 5FOOA 2FGLA 3BAXA 1W9PA 2Y4SA 2PBGA 1DWFM 4AIOA 8A3HA 1JG9A 3AZSA 3NJ3A 3WMBA 6TAAA 1CGUA 1B0IA 2D22A 3AXIA 3MKKA 1E6QM 1R86A 2CIPA 1F4HA 3AFBA 1HJVA 3CUGA 3F5JA 2O9RA 2CITA 5HBFA 2X0HA 3KWXA 1NH6A 1WKYA 1C7SA 4F79A 1XCXA 4DWSB 1NWUA 3FAWA 3ZJ8A 2AMGA 1UQZA 4P7LA 4UOJA 2WC3A 1UQYA 3CTTA 4MJ4A 1BPLB 4UFLA 2WKGA 2WVVA 2DGAA 3LPOA 4BQ2A 2XFYA 5FCZA 2X09A 1C93A 5E6YA 4OIFA 1H49A 5A6SA 2GDVA 1XH2A 3WEZA 1HP4A 3WH7A 4GI9A 1EH9A 2CBUA 2BY0A 4FLOA 4UNIA 4EANA 4EK7A 3VTRA 2XM2A 3T0DA 1I75A 2Z1SA 1UG6A 4PMUA 1OWQA 3RJXA 5BROA 4BS0A 4EAMA 1UD6A 2J7DA 1BGAA 1IZJA 3CLWA 2V5CA 5I77A 4F66A 4HMEA 3WUFA 4H8HA 1NOWA 1TE1A 1ZBWA 3WQVA 3AQUA 1I1XA 3AHVA 1W2VA 3G6LA 4DWSD 2E9BA 3MANA 3UEQA 2A3CA 3M6DA 1DWGM 3AS3A 2G41A 4MNMA 3WDRA 2PWHA 2WSPA 3N11A 5BCAA 5ABEA 4AY1A 2UY2A 2WXDM 1PPIA 4J3TA 3WKZA 4QCEA 4AEFA 3UR8A 5M3WA 1NOFA 2E40A 1ZBKA 4H8UA 2MANA 2A3BA 3ZJ6A 1UKOA 1E6RA 2D0GA 2J4GA 1MXGA 4JZ5A 3BH4A 1V3HA 4PSRA 4W86A 3HJEA 4GI6A 5CGMA 5A2CA 3BAWA 4CD7A 1C8XA 2UY3A 1KBBA 2VCBA 1CGXA 3PZOA 4AD0A 1GOIA 2V5DA 2J7GA 1XC6A 1VBUA 3QHMA 1UKTA 5I78A 2EBNA 1BAGA 2XFFA 6A3HA 3DYOA 1GJUA 3E1F1 2X05A 2BHZA 2X2YA 4ATDA 1HKJA 3GH7A 4PUDA 1V6XA 1IZKA 3PZIA 1B3WA 2G3NA 4GO8A 4J3VA 1DHKA 1J0JA 3EDDA 3NSNA 3F5LA 4V2XA 3WUBA 1V6UA 3CPUA 4LPCA 4OJYA 3RCNA 3CIVA 3VGHA 3CMGA 1XSIA 3VKKA 2VVSA 1H1NA 1UR8A 1UD4A 4V27A 1CLXA 4UOQA 2BHYA 4TVDA 5BYWA 8CGTA 4W5UA 3WDIA 4EKJA 2WWCA 1E3XA 3VNZA 1NQ6A 3WDPP 3A6OA 5TD4A 4GI8A 2WM0A 1MW2A 2JIEA 1JYVA 5I6SA 4XV0A 1V02A 5FL1A 4J3SA 5BRQA 2CBVA 3GTNA 5E0CA 1E6SM 1ISZA 4H04A 2VQUA 2YL6A 3VIFA 2JF7A 2E0PA 1P6WA 3GNPA 3IK2A 5I0DA 1E43A 3LPGA 2YJQA 2W67A 4HMDA 2E3ZA 2E9LA 3WQWA 4Z2KA 2VL4A 3FXYA 5A94A 4MNJA 2ZUNA 1TUXA 1OBAA 4AZ6A 4MJ2A 4M81A 4LYQA 1I1WA 5AC4A 1E6ZA 1HKKA 4D6JA 3PHAA 3CZJA 4TX8A 3AOFA 3OGSA 5A3HA 4D6DA 3F5KA 1MW1A 4B3LA 1KXTA 4MTVA 2BVYA 2XVNA 4S3JA 1OD0A 1O7AA 1C8YA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3SCR A;  1E40 A;  1OGS A;  1C8Q A;  1MXD A;  1IT0 A;  5A8P A;  1C91 A;  5FKY A;  3DC0 A;  5I23 A;  4C7F A;  2J62 A;  3MO4 A;  2YBT A;  4NRR A;  1TR1 A;  1QBB A;  4TTG A;  1R8L A;  2PB1 A;  4EE9 A;  3WY1 A;  4PMN A;  5AYB A;  3WUG A;  2J8G A;  3GH5 A;  3PZU A;  2WC4 A;  1BTC A;  3AJ7 A;  2V38 A;  3GXI A;  5EB8 A;  3BSH A;  5M03 A;  3ARX A;  2WC7 A;  1X6N A;  4WKH A;  1KBK A;  5IHR A;  2YIH A;  3AIB A;  3WNO A;  2DT1 A;  1EQC A;  2WBK A;  4CN1 A;  1TFV A;  1LWJ A;  1XCW A;  3WIJ A;  1G9H A;  4WIW A;  1UD5 A;  5ABF B;  3WNL A;  3U7V A;  1AQH A;  2NT0 A;  2XGI A;  2WZE A;  3PZQ A;  1KQY A;  2OYK A;  3W4R A;  4CU8 A;  4ZXL A;  1HKI A;  2WNW A;  1V02 E;  1OB0 A;  1VFF A;  4ATW A;  5BRP A;  3MUY 1;  1LG1 A;  1RPK A;  3ZJ7 A;  1LF1 A;  4W7U A;  2GSJ A;  2JAL A;  1GCY A;  4H7V A;  3GDB A;  1WB0 A;  4OKD A;  1CXF A;  1UWI A;  2WMH A;  5JIW A;  1FH8 A;  3TTQ A;  4D6H A;  3TA9 A;  1XSJ A;  2GFT A;  3KZS A;  1VBR A;  4BCE A;  2VTF A;  4GQR A;  4F8X A;  2Y8V A;  2XFR A;  3VGF A;  1QNR A;  5ABF A;  3GXD A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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