3AZSA

Diverse substrates recognition mechanism revealed by thermotoga maritima cel5a structures in complex with mannotriose
Total Genus 126
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
126
sequence length
308
structure length
308
Chain Sequence
DPFERNKILGRGINIGNALEAPNEGDWGVVIKDEFFDIIKEAGFSHVRIPIRWSTHAYAFPPYKIMDRFFKRVDEVINGALKRGLAVVINIHHYEELMNDPEEHKERFLALWKQIADRYKDYPETLFFEILNEPHGNLTPEKWNELLEEALKVIRSIDKKHTIIIGTAEWGGISALEKLSVPKWEKNSIVTIHYYNPFEFTHQGAEWVEGSEKWLGRKWGSPDDQKHLIEEFNFIEEWSKKNKRPIYIGAFGAYRKADLESRIKWTSFVVREMEKRRWSWAYWEFCSGFGVYDTLRKTWNKDLLEALI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Diverse substrate recognition mechanism revealed by Thermotoga maritima Cel5A structures in complex with cellotetraose, cellobiose and mannotriose
pubmed doi rcsb
molecule keywords Endoglucanase
molecule tags Hydrolase
source organism Thermotoga maritima
total genus 126
structure length 308
sequence length 308
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.4: Cellulase.
pdb deposition date 2011-05-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00150 Cellulase Cellulase (glycosyl hydrolase family 5)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3azsA00
2W67A 3OLDA 4C7DA 3VPLA 4PTVA 4H2CA 2DT1A 1DP0A 1CGTA 4CD8A 2VCCA 1DWIM 1HF6A 2YDQA 1UKOA 1EO7A 4JKLA 3VKKA 5JUVA 5A95A 3EMZA 4KGJA 1B31A 3APGA 3TONA 3MSGA 3W81A 2WCSA 3SUUA 5D4YA 5BXSA 3OIHA 6TAAA 2V3GA 2Y24A 1Q6GA 3BCFA 1G1YA 4A4AA 2AOSA 1EIBA 4AYSA 4CVUA 3WQWA 5BXRA 2D3NA 3BSGA 1C92A 1W32A 2XWEA 4ZXOA 3WMCA 3CLWA 2W5FA 4UFHA 3CTTA 4PSPA 2XVNA 3FAWA 1CZ1A 4YHGA 3WQ8A 1DWHM 2WLYA 3O6AA 5CPTA 5A6BA 2DIJA 5FOOA 1A3HA 1V3JA 3O9NA 3WF4A 2YLAA 3OGRA 5C71A 1G94A 3PZQA 1JI1A 1MQPA 2C0HA 3PZNA 4JHOA 4U3AA 1H09A 2E40A 1GNXA 4JCMA 1M04A 2ZOXA 2UY2A 2VRJA 3BXWA 3BSHA 5A8QA 2G3NA 3A47A 2YIHA 1UH2A 3WFLA 4W7WA 3LMYA 4IUGA 3SUSA 4JAWA 2ZX5A 4UFKA 4GINA 4BF7A 2CETA 3K4DA 2VC9A 3J7HA 2J74A 4EANA 1EQCA 5ECUA 2JALA 1V6XA 1C90A 4AZGA 2EO7A 3U5YA 3RMEA 1PJ9A 4WSJA 3VM5A 3K8KA 3WF3A 1UKPA 2VRQA 3OGVA 1LL7A 4PMDA 5FCZA 3VDAA 1H41A 1V03A 4H04A 2J8GA 1E6ZA 3WUFA 2J47A 3K46A 3PZTA 1UR0A 1V6WA 3AHVA 3EYPA 1ISWA 3AYRA 1C3FA 3VIIA 1UYQA 3ARPA 4GXPA 3TOPA 3U7BA 3ECQA 3DHPA 4U3CA 1EO5A 2WVTA 1UR8A 1PBGA 2QMKA 3WD4A 5A6JA 4AMCA 2PBGA 4CD6A 5CQ1A 2VNCA 2NT1A 4PMOA 3BAIA 4HPHA 4ZE4A 4BQ2A 3WNOA 4N42A 4L4OA 2D23A 2XIBA 3UG4A 1BYCA 4CU8A 3T2PA 2O9TA 4TVUA 4DWSB 3CZ8A 1PAMA 2G4FA 2NT0A 2CCRA 3PN8A 3F5KA 5FL0A 2QHAA 3GH7A 4P8WA 4M81A 1HJSA 5DMYA 3VMNA 4DM2A 1GPFA 3HMCA 1PX3A 2WCGA 1WDPA 1WZKA 3AIUA 4W86A 4KGLA 4D6CA 5A6KA 1E6RA 1TE1A 1XRVA 1UZ1A 3W27A 3VD5A 3MUY1 2ZUVA 1B3ZA 1MVYA 1OGSA 2EEXA 3N13A 4HMEA 5HPCA 1LL6A 4IM4A 4D6IA 4AIOA 4D6EA 2X0HA 5HBFA 4CKQA 5HDRA 4HOXA 1E6PA 1QHOA 2JE8A 4PCTA 4BZYA 1BTCA 5I78A 1WO2A 2CBUA 2EJ1A 1B90A 1JL8A 3NCOA 4JIEA 4S3JA 3UCQA 3U57A 2CNCA 2NW0A 2BXZA 1VEOA 3T0BA 3KZSA 1TZ7A 3W26A 3W6LA 1Q6DA 1R7OA 2WMIA 3CUHA 4FLQA 1H1NA 3SCPA 2GJPA 4CCCA 1FA2A 3WEOA 1XYZA 2UY5A 2OYLA 5JIWA 1UD4A 1JZ5A 1BQCA 2GSJA 1MW0A 1CXIA 2VX7A 3ZMRA 2CPUA 3VVGA 2WMFA 3VD7A 4HPGA 3FNDA 2ZWZA 3G6LA 2CEQA 1QNOA 5CGMA 1RP9A 1PX8A 3D5HA 2CKRA 1ITCA 2V5DA 1KR1A 1OINA 4PMVA 3GNPA 3AMGA 1E15A 2D3LA 4WF7A 4CN6A 3PBGA 5D9OA 3L4UA 3RJYA 3W38A 2J25A 3IANA 3VGGA 3CUJA 4E8DA 3EDKA 3IJ8A 2WHKA 2VRKA 1ODUA 5A8MA 1FH7A 1E40A 4ATWA 1JI2A 3VDCA 4JFWA 4P8VA 3BAJA 2FHBA 2YKKA 3VX0A 2J8FA 4MB4A 3WDHA 3QOMA 1BG4A 4F79A 3WUEA 2CKSA 2WMHA 2ZXBA 1B3YA 1RP8A 1GONA 3NDYA 3ARRA 5EB8A 5IDIA 3WKZA 3AXXA 1W3HA 2W4XA 1X6NA 3FW6A 4URIA 5JBDA 1NWSA 3UETA 3A4XA 2WC4A 3AOFA 4ACZB 4CU7A 1MFVA 4AEFA 1GZJA 1LJYA 3II1A 3QGVA 1IZKA 7CGTA 2WZEA 5D9PA 2YL8A 3WH7A 1QVBA 2YA0A 1HXJA 4P7LA 2WXDM 3AIQA 1K9EA 4MB1A 1HKIA 2WKLA 3BH4A 3WENA 2AAAA 4D6JA 1TR1A 2G3MA 2YA1A 1J0YA 1WCGA 4UQBA 4X9YA 3OZPA 3QHMA 4CD4A 4QP0A 4WKAA 5A94A 1GORA 3RM9A 4OKDA 4QCFA 1J12A 2VZVA 5A1AA 1K9FA 4PMXA 5I77A 1LL4A 1E0WA 5GNZA 1UA3A 2UWFA 4UOQA 2E9LA 4GZIA 3K8MA 3W4RA 4AWEA 3DYPA 4B16A 3RM4A 1JAKA 2WSKA 1QW8A 4ACYA 2X0YA 2O92A 3SCQA 3N11A 3IJ7A 3VIJA 3CHCA 2OSXA 1V6VA 1QOXA 2XUCA 4W87A 2GK1B 1XD1A 4W84A 1TVNA 4HU0A 1C93A 5HPOA 1OBAA 1E3XA 1ZBCA 1XCXA 3CHEA 4QLLA 2G3IA 3AS1A 1JYNA 1EOMA 4R27A 1MQRA 1TG7A 2BY2A 4HA4A 5EMYA 3W6MA 4FMVA 1J0HA 3HN3A 1HJXA 2BY1A 2WCAA 3OB8A 3BCDA 5DT5A 3N18A 4JFUA 4Z2HA 3WIJA 1E72M 3T08A 2XJ7A 3AIVA 2XVPA 1KBBA 3M46A 5LA1A 1JAEA 2ZICA 2VZSA 3AZSA 1Q6FA 2IUZA 1GCYA 4MTVA 5CLWA 3ZQ9A 1KBKA 1JZ2A 1W9UA 1AQMA 3W24A 1AQHA 3M07A 1VFFA 1N82A 3NDZA 5LA2A 4MAVA 1ITXA 1TUXA 4LXFA 4P8XA 3T2QA 1BGAA 2WVVB 3VIKA 5HOSA 3DYOA 3PZOA 2EBNA 2BHZA 4Q22A 1RD6A 3RO8A 1WZLA 3CH9A 3EDFA 4KH2A 4UOZA 2DSVA 5BYWA 2CHNA 2XSAA 3CUFA 2E4TA 2CESA 4H41A 4MPKA 2ZUMA 2VZTA 1JIBA 1XC6A 3WL0A 1H11A 1TA3B 4Z2JA 3WSUA 2WWCA 5FL1A 1B0IA 4E2OA 3VIGA 2VX4A 1GOMA 2E9MA 1GOOA 4QDMA 4GKLA 2WHMA 1QNSA 2D0HA 2EXOA 4B9ZA 4AZHA 4L4PA 2E3ZA 2VR4A 4ZEPA 3T09A 2E9BA 4D6HA 5I24A 2BY0A 4AEEA 3GXFA 4V27A 3PZ9A 4WSKA 5A3HA 2VL4A 5DF0A 4MJ2A 4EKJA 1JFHA 3FXYA 4UZUA 3GBDA 4QCEA 1EDGA 5EFDA 4BA0A 5HNNA 3ZT7A 1CYGA 3AIRA 3VNZA 1IZJA 2Y4SA 5I0DA 2OWXA 5HXMA 3WD0A 4D6DA 2ZXDA 3W0KA 1E0XA 1VB9A 5BXPA 3F5LA 1W9PA 3SEPA 5I2UA 2GK1A 1KXVA 1MYRA 2WM0A 1DEDA 3F4VA 1PPIA 3N15A 2WLZA 3B9AA 1CEOA 3VD3A 4RL3A 3N12A 5I23A 5AC4A 4U5IA 3UG3A 1HX0A 2XFYA 2BY3A 1E5JA 4H7VA 3ZR6A 4UR9A 4J3TA 3WD1A 1ISZA 3OG2A 3MMUA 3EMQA 4W7UA 6CGTA 2RGLA 1FHDA 3NYDA 4MB5A 2WC7A 1HNYA 4MDPA 3ZT6A 2EQDA 1UWRA 3CZGA 3GH5A 3N04A 4ZENA 2YBUA 3VX1A 3NSMA 3ZR5A 2PWFA 3RPMA 1UWQA 5CPQA 4AD5A 3WDPP 1HJQA 3BAKA 1JZ4A 3CUGA 2G3JA 1R7AA 1H3GA 2WVVA 5A2AA 2FHFA 1ODZA 4E4PA 1JZ8A 1MW1A 3PTKA 8CGTA 4GZEA 4LYQA 4KRTA 1CGYA 1QNQA 4M56A 1KR0A 4X0VA 3BAYA 5IFPA 1VF8A 4AD3A 5M3WA 4W93A 1EGZA 1OGBA 1V02A 4PMQA 1Z32X 1JZ3A 1JYVA 5AYIA 4HOWA 1VFUA 1HL9A 2X05A 5I6SA 3W37A 5AC5A 5CG0A 2J7EA 1NOUA 5AYBA 2DSZA 4PN2A 4XV0A 1QBAA 1UA7A 4A3HA 3MMWA 2DGAA 3WH5A 1M53A 2WANA 4DWSD 3WNMA 2O9RA 2A3AA 3BGAA 1CXHA 5IFTA 1FHLA 2F8QA 4MB3A 2W66A 2WYSA 3SCWA 3AROA 1W3KA 3ARQA 3UERA 2J7BA 3VIOA 4RE2A 3AI0A 1W1VA 4P7OA 4IPLA 1OGGA 1U33A 1HKKA 3AZRA 4X0NA 1CXFA 1V6UA 5D9MA 1WDQA 1WE5A 2VJXA 3AXIA 3PZVA 3AZTA 3UR8A 2XVGA 4CCDA 1WZAA 3VGDA 1Q6CA 1UD3A 3ZJ8A 1FH9A 1H2JA 3VGEA 4J3XA 4MNKA 4CVWA 3TA9A 5I3DA 4RE3A 1K9TA 4UQ9A 4WLCA 4GO9A 3CHFA 4PRWA 1W1PA 2YDRA 3GXIA 3K4AA 4DUVA 1D7FA 1KXTA 1ZS2A 2W61A 3TTOA 2WMGA 1VFOA 1M03A 2WW5A 3AS3A 1CLXA 3AIEA 1E6SM 2Q8XA 2FGLA 4V28A 4XB3A 1JDDA 3VUPA 4JFSA 3S6TA 4EE9A 1ZJAA 2NSXA 5BRPA 1ISXA 2PWDA 3BAXA 3L4YA 4UFJA 1GQKA 3W82A 3SCVA 7TAAA 1E6QM 4XUYA 3AMCA 4UQCA 1IT0A 1R86A 1VFMA 1E43A 3VO0A 1EDQA 3WMSA 1E9LA 1KXHA 2VCAA 3VM7A 3SCSA 1OD0A 1US2A 3I3DA 2QPUA 3QHOA 3IJ9A 1SMDA 1GUVA 4MAZA 4B15A 1E70M 1LLOA 4AD4A 4DWSC 3AS0A 2VI0A 3W25A 2VCBA 4HTYA 1R85A 2QPSA 2EPLX 1AMYA 2D22A 1HKJA 3ZJ7A 1GHRA 4M24A 3GZAA 1AVAA 1C8XA 1I1XA 1QI0A 3ARTA 3WL1A 2WBGA 3ARWA 1ZB5A 2XVKA 5A2BA 2Z1SA 3VTRA 2XFFA 1KQZA 2WK2A 2PI6A 4CU6A 3WUGA 5I79A 4PTMA 1QHPA 2E8YA 1E0VA 3CIVA 3WN6A 4AZ5A 1PX4A 3CZLA 2Y8KA 4BQ5A 4DUWA 1NP2A 1BPLB 3AFBA 5M17A 4CD7A 4AD2A 3AS2A 4F9JA 4V2XA 1J18A 4ZE5A 3WH9A 2XIIA 1IV8A 1JXJA 3B9DA 2CITA 4ATDA 3GNRA 1X1NA 3OBAA 3POHA 4LYRA 3W28A 5CZKA 2G8ZA 2PWEA 4AISA 2WZIA 1UR4A 3WFZA 5BXTA 1PZ3A 1V3MA 1O7AA 4UOJA 1HVQA 3DECA 1G01A 4W7VA 5ABGA 1KCLA 2BFGA 3SCTA 2XHYA 3LPPA 2CBVA 3PZUA 3WUBA 2WMKA 4PUDA 2E8ZA 1F4HA 3WD3A 2JEPA 4PMNA 4J27A 2YL5A 1X6LA 1QBBA 1PEZA 1KXQA 3WBEA 1BAGA 1C7TA 1JD9A 2RGMA 1D3CA 3MV01 1OWQA 2DH3A 4HA1A 4DWSA 1KCKA 3HU7A 3WBAA 5DT7A 1GQJA 3WH8A 2VR5A 3AQUA 5A6LA 1JF6A 1XH1A 2PF0A 4YPJA 4J7RA 3W53A 1EQPA 4CN4A 1Y7VA 4B3LA 4RE4A 1E6NA 1XSIA 4P8UA 4BS0A 3T0AA 1TCMA 1ISYA 4U31A 3PZMA 1QW9A 4PMUA 4NZCA 1BVNP 5DEZA 1WP6A 2XGIA 4Y7EA 4U2ZA 1JFXA 2A3BA 2J78A 3WDIA 2EPMX 1V08A 4LYPA 3D3AA 2BVTA 2YL6A 2GVYA 3AIBA 3TTQA 5A69A 2F61A 1V0KA 4UZSA 3WEMA 2VOTA 2VT0A 1E56A 5DFAA 4PUEA 2WB5A 2CYGA 4CUCA 1YHTA 3SUVA 3L4TA 1JGIA 3AJ7A 2Z1KA 4MNJA 3TTYA 4AD0A 4JZ5A 2WNWA 5M03A 4A3YA 3SUWA 3ALGA 4QLJA 1W9BM 2ESCA 4D72A 3KL5A 2OLHA 3KL3A 2XTKA 2Y5EA 1EOKA 5IHRA 4UNIA 3VILA 2W62A 3LPFA 1HN1A 1E73M 4P7QA 3I3BA 1CLVA 1I75A 1CENA 2FDMA 5CJ5A 5JBFA 1QI3A 4EAMA 5KZ6A 2YJQA 1NP0A 2YLLA 4AZCB 2XGBA 2PB1A 3MU7A 2VUYA 3EDEA 2YBTA 4FLOA 3AMLA 2V3EA 3CO4A 4JKMA 2DSWA 5JBEA 1UG6A 1JNEA 4AC1X 1JNDA 5CSUA 1UOKA 1UD2A 3MV11 1VAHA 1HVXA 2WHLA 1NH6A 1V3LA 4XX6A 1M7XA 3WNPA 1EH9A 2WMJA 1BF2A 1BYDA 1CNVA 3MO4A 1HJWA 2CXGA 2ZXAA 2EPOA 3QOKA 4JKKA 1DWAM 3RCNA 1HIZA 1ZBVA 3WQ4A 3AHYA 1OIMA 3M6DA 1PIFA 4F9DA 3VINA 4BCEA 1QNPA 2DDXA 3A4WA 4NF7A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2W67 A;  3OLD A;  4C7D A;  3VPL A;  4PTV A;  4H2C A;  2DT1 A;  1DP0 A;  1CGT A;  4CD8 A;  2VCC A;  1DWI M;  1HF6 A;  2YDQ A;  1UKO A;  1EO7 A;  4JKL A;  3VKK A;  5JUV A;  5A95 A;  3EMZ A;  4KGJ A;  1B31 A;  3APG A;  3TON A;  3MSG A;  3W81 A;  2WCS A;  3SUU A;  5D4Y A;  5BXS A;  3OIH A;  6TAA A;  2V3G A;  2Y24 A;  1Q6G A;  3BCF A;  1G1Y A;  4A4A A;  2AOS A;  1EIB A;  4AYS A;  4CVU A;  3WQW A;  5BXR A;  2D3N A;  3BSG A;  1C92 A;  1W32 A;  2XWE A;  4ZXO A;  3WMC A;  3CLW A;  2W5F A;  4UFH A;  3CTT A;  4PSP A;  2XVN A;  3FAW A;  1CZ1 A;  4YHG A;  3WQ8 A;  1DWH M;  2WLY A;  3O6A A;  5CPT A;  5A6B A;  2DIJ A;  5FOO A;  1A3H A;  1V3J A;  3O9N A;  3WF4 A;  2YLA A;  3OGR A;  5C71 A;  1G94 A;  3PZQ A;  1JI1 A;  1MQP A;  2C0H A;  3PZN A;  4JHO A;  4U3A A;  1H09 A;  2E40 A;  1GNX A;  4JCM A;  1M04 A;  2ZOX A;  2UY2 A;  2VRJ A;  3BXW A;  3BSH A;  5A8Q A;  2G3N A;  3A47 A;  2YIH A;  1UH2 A;  3WFL A;  4W7W A;  3LMY A;  4IUG A;  3SUS A;  4JAW A;  2ZX5 A;  4UFK A;  4GIN A;  4BF7 A;  2CET A;  3K4D A;  2VC9 A; 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