3AZTA

Diverse substrates recognition mechanism revealed by thermotoga maritima cel5a structures in complex with cellotetraose
Total Genus 127
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
127
sequence length
311
structure length
311
Chain Sequence
MGVDPFERNKILGRGINIGNALEAPNEGDWGVVIKDEFFDIIKEAGFSHVRIPIRWSTHAYAFPPYKIMDRFFKRVDEVINGALKRGLAVVINIHHYEELMNDPEEHKERFLALWKQIADRYKDYPETLFFEILNEPHGNLTPEKWNELLEEALKVIRSIDKKHTIIIGTAEWGGISALEKLSVPKWEKNSIVTIHYYNPFEFTHQGAEWVEGSEKWLGRKWGSPDDQKHLIEEFNFIEEWSKKNKRPIYIGAFGAYRKADLESRIKWTSFVVREMEKRRWSWAYWEFCSGFGVYDTLRKTWNKDLLEALI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Diverse substrate recognition mechanism revealed by Thermotoga maritima Cel5A structures in complex with cellotetraose, cellobiose and mannotriose
pubmed doi rcsb
molecule keywords Endoglucanase
molecule tags Hydrolase
source organism Thermotoga maritima
total genus 127
structure length 311
sequence length 311
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 3.2.1.4: Cellulase.
pdb deposition date 2011-05-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00150 Cellulase Cellulase (glycosyl hydrolase family 5)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3aztA00
1E72M 4J3UA 2WM0A 3AISA 1C7SA 4URIA 3VGEA 3SCOA 4GI8A 3VD9A 3CIVA 1SR0A 2QF8A 3PTMA 2DPEA 1VIWA 4UQDA 4MDOA 2J8FA 1W1VA 3WL0A 2UWFA 2IXVA 4UQBA 1J12A 1HJQA 5BYWA 2V3FA 2XM1A 2YKKA 1MW2A 1R86A 1W1TA 3ARSA 4NRRA 5I79A 2D22A 1WZKA 2ZUTA 1JFXA 1YQ2A 3WD2A 1MFVA 1TMQA 3EMQA 1K9FA 1L0PA 3AIWA 2Z1KA 3CUFA 1XSKA 1QVBA 2W63A 4JIEA 1LL7A 1JF6A 3FN9A 1JI1A 3WELA 2BHZA 2XGBA 1ZBKA 2Y24A 3GXMA 2GJPA 1ITCA 1GVYA 1FOBA 1DWHM 4M80A 3AHXA 4MNKA 1CEOA 1V0NA 1XH0A 1XC6A 3FHQA 1G0CA 2WKGA 3D5HA 1ZBVA 4HMCA 1IT0A 4V2XA 1H0IA 1JAKA 3VKKA 4EAMA 4PYSA 4M24A 3UR8A 5E0FA 5DEZA 1C7TA 2ZWZA 2PWGA 1RP8A 2J78A 3SUUA 1HKMA 1QNPA 2G41A 3OLIA 2C7FA 1E40A 3MU7A 3WF4A 4D6EA 3SCTA 2HVMA 1XSIA 4TTUA 4B9ZA 2TAAA 3WUFA 3RPMA 3CPUA 2AAAA 3WQ5A 3M07A 4CN1A 2YJQA 5DT7A 1E5NA 2J75A 4UCFA 4JAWA 1F4AA 1HL8A 2V38A 5IHRA 1JXJA 3QHOA 3AS2A 3PHAA 4GO9A 1CXEA 5FL0A 4UFIA 2ZUUA 1KGWA 5M17A 5D9OA 2CCRA 3II1A 1HXJA 3L4YA 1KCKA 3ZMRA 4CD4A 1E3ZA 7A3HA 3TTOA 1QOXA 3T0AA 4QLKA 1K6AA 1KXVA 2CESA 2CIPA 3PZTA 4LQ1A 1PX8A 2G3IA 1PBGA 3AYRA 2OWWA 1V3IA 1E9LA 3ARRA 3IJ9A 4D1IA 5BCAA 1XYFA 2XWEA 2YLAA 2XM2A 4GKLA 4CKQA 1UR2A 4BQ3A 2BFGA 4P7LA 1X1NA 1WAWA 2WMHA 3K1DA 3WBEA 5LA0A 3WDPP 1GPFA 1HL9A 1UKQA 2YOCA 3IAPA 3T2QA 1RH9A 2GUYA 2VZOA 4MJ2A 5A2CA 4OUEA 4F79A 2JIEA 3N11A 4N42A 1DHKA 2J7EA 4KRUA 3RJYA 3BLPX 1NH6A 2QMKA 1QHPA 4AD2A 1K9TA 3TTYA 4DUXA 4FLRA 2WCGA 3WD1A 1B9ZA 3VGGA 2ZX6A 1CTNA 4PMDA 4AIEA 1ZS2A 4FLQA 3G6MA 2OSYA 2WMJA 5ABFB 5A8NA 3GXIA 1UWQA 4AZGA 3W25A 4IM4A 4K68A 1UA3A 3POCA 3WF0A 4L4OA 1GQJA 1XRVA 1B31A 2VR4A 2JE8A 3EBVA 3WD0A 4WSJA 2VX4A 1U33A 4PMUA 3B9DA 3WNKA 1ZJBA 3PTKA 1V0MA 2BNJA 2BVDA 2X05A 5E09A 5AYBA 3UEQA 4JFVA 3N15A 1VFMA 2W61A 1J0YA 3PZGA 1OSEA 1O6IA 4TUFA 4PTWA 2D3LA 3EMCA 4PCTA 4ML4A 3SCPA 3KL0A 3WIJA 3RIKA 2CEQA 1CLXA 4NF7A 4IISA 3PZMA 1BG9A 1E56A 1GOOA 1W9VA 2NT0A 3CUJA 1R87A 3ARXA 3TTSA 1QW9A 2DT3A 1J11A 1E71M 1H11A 4TX6A 5CG0A 2J7GA 5FIPA 1W9BM 1W9XA 1B3VA 1MW0A 1UH3A 2F61A 3B9AA 4W7UA 3VX0A 4UTFA 1JZ4A 4W7WA 2DDXA 3VGHA 4KRTA 1H49A 1TG7A 2X0HA 2WC3A 4MNLA 4LYQA 3WDHA 4AY1A 1VEMA 2VX6A 3FXYA 2OYKA 3MUZ1 3RM4A 3T0BA 1JDAA 2D1ZA 3SCUA 1OBAA 3ZO9A 1MXGA 1C93A 3BCDA 4PMQA 4W85A 2OWXA 5A2BA 4CU7A 5GNXA 2NW0A 4D6GA 1TVPA 1UD4A 3VNZA 5BXSA 2VC9A 4B3KA 5C70A 3VDAA 3IAQA 5D9PA 1G1YA 2ZX5A 4PUDA 4CCDA 3W29A 4IUGA 2ZOXA 1BYCA 4B16A 3AYSA 3PZOA 5D9MA 2WHJA 3ZR6A 6CGTA 1WKYA 5IXEA 1TE1A 3NJ3A 1ISVA 4S3JA 3WSUA 4S3KA 1XH2A 3VUPA 3VIKA 2GK1B 3L2LA 3WH8A 1QNQA 4FF5A 3FAXA 5I6SA 3VDBA 2JF7A 2ZXAA 4UNIA 3AXXA 2O92A 1JXKA 2ZXDA 1BG4A 2YLLA 3BMVA 3WFLA 3SUSA 1IZKA 1HF6A 1HJVA 2W91A 5CXPA 2E40A 2EPOA 1FHDA 1P6WA 3BXWA 4OBSA 3CMJA 4M1RA 3A3HA 4AD0A 4F9JA 1KFWA 4QDMA 4PMZA 4GO8A 1XCWA 4YHEA 3VIIA 2A3CA 4PMVA 1V02E 3NSNA 1E4IA 2O9RA 3VILA 4GZEA 1UH2A 3NCOA 5FKYA 3UG4A 5A6BA 3AIQA 3ZIZA 2J77A 1QW8A 2A3AA 1OGBA 3IK2A 5CSYA 1C8YA 3ZR5A 3DHUA 3WQ4A 3F5JA 1GONA 1BAGA 3PZIA 3GYCA 3WQ8A 1ISZA 1X6NA 2WMIA 5GPRA 3SEPA 1VEOA 3WD3A 2W92A 2D3NA 1W91A 5E70A 1ESWA 7TAAA 3RJXA 3NYDA 1SMAA 5CPSA 2FHBA 3BAYA 1UUQA 2J74A 1CENA 3A47A 2VL4A 4RE4A 3ZJ6A 1CWYA 1KWKA 3CUIA 1V3HA 2XGIA 5A95A 1QHZA 4UOZA 1E43A 4ZXLA 5A6AA 2BY2A 1GW1A 1UWSA 1W2PA 3BAJA 4A3HA 1MWOA 3GZAA 1TCMA 1C90A 4MADA 4IPNB 4QLLA 4Z2GA 3TONA 2CETA 2DT2A 3QOMA 3WNPA 2UY3A 3ZQ9A 4MAZA 4JFSA 1FA2A 1HN1A 3KL3A 4AZ6A 3UERA 4FK9A 5DF0A 4HA1A 3CZLA 3SIMA 1MXDA 2QPUA 3CHCA 4WKAA 2ZWYA 4ZENA 2YL8A 4W5ZA 4V27A 4P8UA 3OLGA 5BWFA 5A69A 1HIZA 4U3CA 3VU2A 5BRQA 1PX4A 2JEQA 1CYGA 2WCSA 1ECEA 3W81A 5A3HA 3EDJA 1W9UA 1A3HA 1E4NA 3HN3A 1U2YA 3L4ZA 2WZHA 5CZKA 2GDVA 1JAEA 2UY2A 4TX8A 3VTRA 5FCZA 1PJ9A 4BS0A 1OD8A 1VBUA 3BSHA 1EHNA 1C92A 4AIUA 2C8NA 2BXZA 2FH6A 1UKSA 4GZJA 4JFTA 3GNRA 3AHZA 3CZKA 1W3KA 1UR0A 1W9PA 2WZEA 1JZ3A 1H1NA 3CBWA 4J3XA 4DM2A 3AS1A 1QI0A 4LYPA 3WL1A 3WEOA 4DWSB 3DYOA 3HU7A 3MANA 2G8ZA 4DWSA 3POHA 3ZT7A 2JEPA 4P7OA 1E73M 1FP8A 1H3GA 4AEFA 4MB3A 5I2UA 1JZ5A 2VJXA 2XVPA 2YA1A 5ECUA 3T08A 1BPLB 6TAAA 1IZJA 1UR9A 1US3A 2OSXA 1D3CA 4CCCA 2X2YA 1ISWA 2CERA 2CBUA 2WVUA 3MKKA 4OKDA 4TTGA 3WDIA 2DH3A 3TP4A 3WH6A 2VNCA 1HKIA 3T0DA 1EQPA 2PBOA 2GDUA 2BV9A 3ZM8A 1WNOA 3NUKA 2WWDA 3T09A 1UHVA 1W3JA 2XVGA 1ZU8A 1UR8A 1MW1A 1ISXA 2CHOA 1S46A 1V3JA 1I75A 1E6QM 4HOWA 3W53A 4EK7A 4PTVA 1E4LA 3WUEA 2W5FA 5A8OA 1BGAA 1QI4A 2D0GA 3ECQA 3LPGA 3WH7A 3WNLA 2W62A 1CGYA 2ZICA 1I1WA 1CGXA 1CXHA 3EMZA 4WLCA 3MV11 1D2KA 1Q6CA 5BXPA 4D1JA 3T2OA 4ATLA 1GOIA 4AD1A 3SUVA 4M56A 4W5UA 3OGVA 1FFQA 2E9LA 3N9KA 4HZ7A 5JIPA 1CXKA 1BYAA 1G94A 2GVYA 5GNZA 3IJ8A 1QI3A 3AIUA 3AFBA 2WC4A 1B3XA 4M8UA 2EXOA 1WZAA 1NM9A 2C0HA 1KGUA 3HMCA 3EDKA 5C8BB 4GXPA 5A6KA 2EPMX 3SCQA 3WQVA 3WNMA 3U57A 5DT5A 1E6SM 3CHDA 4P8XA 1C91A 2JF6A 2EO7A 2ZX9A 1V08A 1B0IA 4JL1A 3MV01 3PZNA 1U30A 1KR1A 1HJUA 2VO5A 3W37A 4UFKA 4PRWA 1B2YA 1RD6A 1TVNA 3NIYA 3GBDA 1OM0A 3WF2A 2XPKA 1WCGA 3EDDA 3WH9A 2PWHA 2BVYA 2J25A 4AD3A 5HOSA 1LL4A 3DECA 1FH7A 3LMYA 3WDJA 1OINA 3QHMA 2PWEA 4CD8A 2WHLA 4GQRA 4MAVA 4PN2A 4UR9A 5I77A 1FP9A 3GXDA 5JBFA 2VRQA 3AROA 2CNCA 4D71A 4P8VA 4P7RA 3PN8A 2VUYA 1JZ6A 1FHLA 1E4MM 1TR1A 5KEZA 3WUGA 2GSJA 3MUAA 2WBGA 2E4TA 1M7XA 5HDRA 2J47A 4LXFA 4RL3A 3VX1A 1NWSA 3NDZA 1WPCA 2Y4SA 1GQIA 4AEEA 4D6IA 3AZSA 4XX6A 4J7RA 3WFZA 2ZUNA 2BXYA 4PMXA 1CNVA 4CD6A 4PTMA 5ABEA 1KXTA 2WVVB 1HVQA 2WVVA 2J8GA 1ZBCA 1GQLA 5D8WA 3CGTA 2RGLA 2WSKA 1VBRA 1MQPA 2OLHA 2ZXQA 5FOOA 2VX5A 3FAWA 3AS3A 2W4XA 3VM7A 3CZGA 1Q4NX 8A3HA 1H41A 1JD7A 1LWHA 5KZ6A 1CXFA 3OGSA 1VJSA 4QCFA 1HT6A 3WQWA 1Q6FA 3WMSA 2W67A 4NSBA 1JG9A 3A4AA 3AMLA 1JNEA 3EDEA 2VTFA 4ZE5A 3UG5A 1PIFA 5EFDA 4TOQA 4LGXA 3AI0A 3AS0A 4MNJA 4QP0A 4AYSA 2VRJA 2XVNA 1WP6A 1XHGA 4PMOA 5ABFA 4DUWA 5CSUA 5LA2A 1V6UA 4D6CA 2AOSA 3W38A 5M03A 3MMWA 3L4UA 1DWAM 2DSUA 1UR1A 2VR5A 1UD8A 2WKLA 1US2A 1MVYA 3BSGA 4MPKA 3DC0A 5D9NA 1UD6A 2D20A 1J18A 2G3JA 4YN5A 1NARA 5EB8A 5LYRA 2NSXA 4M82A 1AVAA 2X1IA 3OLEA 5A6LA 4PUEA 4JCMA 2V5CA 2PF0A 2E8ZA 3ARTA 3W28A 4PBGA 4BA0A 2WWCA 2QHAA 1CDGA 4H04A 5AY7A 4QAWA 1K9EA 2WMKA 1DWFM 1JNDA 1HVXA 3CUHA 1OWQA 3ZSTA 4OZOA 1Y7VA 3THDA 3VDHA 1UYQA 2O9OA 1CPUA 3WDQA 4PSPA 3QGVA 1R7OA 3KWXA 5CLTA 2DSZA 2PB1A 1BYBA 1QBAA 5IHSA 5A6BD 3A4WA 4W86A 1IV8A 3PZUA 4W8BA 1ZB5A 3WH5A 1HNYA 3HJEA 4UOJA 4H8UA 4EANA 2DQXA 4JFUA 1CBGA 2EPKX 5AC4A 4OJYA 2ZUSA 4WF7A 3I3BA 1Q6EA 4UFLA 4P8WA 5BROA 2DIJA 1XD0A 2WXDM 1TUXA 4KGJA 3CHFA 4AZCB 1UOKA 1UWIA 5I24A 4AZCA 2VCBA 1SYTA 1DP0A 2OYLA 1UD3A 4P7QA 2BHYA 2WYSA 4HZ6A 2Y8KA 1KB3A 4Z2LA 1UD2A 2WLYA 3MUIA 4UFJA 2D2OA 4JL2A 4B3LA 1LL6A 5DO8A 5TD4A 9CGTA 2DSWA 5A6MA 2JALA 4D6FA 2RGMA 5CLWA 1ZJAA 1VFFA 4HA4A 3DHPA 3WEZA 4XV0A 4ATWA 4OOUA 3VGBA 1UZ4A 3PBGA 4XZWA 2CBJA 2IXUA 5CJ5A 1CGWA 4JHZA 2GK1A 5C71A 3TA9A 3WF1A 5A8QA 2VRKA 2ZIDA 1BYDA 3TTQA 1GHRA 2Z1SA 3UG3A 1ODZA 1OIFA 3ZJ7A 3NSMA 1CGTA 1AQMA 3BH4A 1CXLA 4BF7A 4RE2A 3L4XA 4EKJA 1G01A 1UKTA 3VOCA 1B3ZA 1I1XA 1KWGA 1E6RA 2GJXB 4XZBA 4J3WA 1KBKA 1TFVA 1PAMA 3DYMA 3K4DA 1UQZA 3BAXA 3IANA 3SCVA 2J7DA 2A3HA 1H0GA 1BGGA 4AC1X 1Q6DA 1C8QA 2YBUA 4BQ4A 3VO0A 4E4PA 5CGTA 1ISYA 2ZUWA 4WSKA 3MSDA 3VIFA 4U5IA 2J7CA 3AMKA 1XH1A 4GINA 2D23A 2Q8XA 1NP0A 1BSIA 1OCQA 1OB0A 3BAWA 2UY5A 3NSXA 2XHYA 4Z2KA 1XSJA 2XVLA 1BVNP 1DWIM 3WN6A 4J3SA 1EDQA 3A6OA 5BRPA 3O9NA 1LWJA 3OZPA 1B30A 4FMVA 1Z32X 4W88A 4GIAA 4YPJA 4DWSD 1KXHA 3CZ8A 1DTUA 1V6VA 4W93A 2WK2A 4AZ5A 1B3YA 5EFFA 4V28A 3AHVA 2EJ1A 1KR0A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1E72 M;  4J3U A;  2WM0 A;  3AIS A;  1C7S A;  4URI A;  3VGE A;  3SCO A;  4GI8 A;  3VD9 A;  3CIV A;  1SR0 A;  2QF8 A;  3PTM A;  2DPE A;  1VIW A;  4UQD A;  4MDO A;  2J8F A;  1W1V A;  3WL0 A;  2UWF A;  2IXV A;  4UQB A;  1J12 A;  1HJQ A;  5BYW A;  2V3F A;  2XM1 A;  2YKK A;  1MW2 A;  1R86 A;  1W1T A;  3ARS A;  4NRR A;  5I79 A;  2D22 A;  1WZK A;  2ZUT A;  1JFX A;  1YQ2 A;  3WD2 A;  1MFV A;  1TMQ A;  3EMQ A;  1K9F A;  1L0P A;  3AIW A;  2Z1K A;  3CUF A;  1XSK A;  1QVB A;  2W63 A;  4JIE A;  1LL7 A;  1JF6 A;  3FN9 A;  1JI1 A;  3WEL A;  2BHZ A;  2XGB A;  1ZBK A;  2Y24 A;  3GXM A;  2GJP A;  1ITC A;  1GVY A;  1FOB A;  1DWH M;  4M80 A;  3AHX A;  4MNK A;  1CEO A;  1V0N A;  1XH0 A;  1XC6 A;  3FHQ A;  1G0C A;  2WKG A;  3D5H A;  1ZBV A;  4HMC A;  1IT0 A;  4V2X A;  1H0I A;  1JAK A;  3VKK A;  4EAM A;  4PYS A;  4M24 A;  3UR8 A;  5E0F A;  5DEZ A;  1C7T A;  2ZWZ A;  2PWG A;  1RP8 A;  2J78 A;  3SUU A;  1HKM A;  1QNP A;  2G41 A;  3OLI A;  2C7F A;  1E40 A;  3MU7 A;  3WF4 A;  4D6E A;  3SCT A;  2HVM A;  1XSI A;  4TTU A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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