3BO9 | Genus

Total Genus 100

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	100
sequence length	314
structure length	314
Chain Sequence	HMTVRTRVTDLLEIEHPILMGGMAWAGTPTLAAAVSEAGGLGIIGSGAMKPDDLRKAISELRQKTDKPFGVNIILVSPWADDLVKVCIEEKVPVVTFGAGNPTKYIRELKENGTKVIPVVASDSLARMVERAGADAVIAEGMESGGHIGEVTTFVLVNKVSRSVNIPVIAAGGIADGRGMAAAFALGAEAVQMGTRFVASVESDVHPVYKEKIVKASIRDTVVTGAKLGHPARVLRTPFARKIQEMEFENPMQAEEMLVGSLRRAVVEGDLERGSFMVGQSAGLIDEIKPVKQIIEDILKEFKETVEKLRGYIE

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Crystal structure of putative nitroalkan dioxygenase (TM0800) from Thermotoga maritima at 2.71 A resolution rcsb
molecule tags	Oxidoreductase
source organism	Thermotoga maritima msb8
molecule keywords	Putative nitroalkan dioxygenase
total genus	100
structure length	314
sequence length	314
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 1.3.1.9: Enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase (NADH).
pdb deposition date	2007-12-17

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF03060	NMO	Nitronate monooxygenase

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	3bo9A00

5D33A 3PUOA 1WBHA 4NU7A 1H5YA 2VFFA 5I3IA 3W70A 2NXIA 1P0KA 3TC6A 1SZEA 2FPTA 2OZ0A 3NQ6A 1OX4B 3HO8A 1QMLA 1MEWA 3W3OA 3IVSA 3B0PA 3UWZA 1VLWA 4ZZ9A 4N9BA 4DPPA 1AL8A 4UNLA 3KVLA 4FNQA 3L66A 5DCDA 3CC1A 1HO1A 1TREA 3DHDA 4POCA 3SECA 3TUUA 3DFQA 3IRDA 2GJNA 1CW2A 1WAUA 4ZQCA 4R34A 3HGOA 1H61A 4MZYA 4HNVA 4ADSA 4O52A 3W73A 4QQ3A 2OT0A 3VCRA 1OG0A 4UTHA 2HTMA 4LUJA 1FWSA 2YZRA 1QAPA 4FF7A 4I7VA 2DZVA 1YTKA 4WY0B 3NQFA 5CZ0A 5D2WA 3ATYA 1UB3A 1ADOA 5F2GA 3LRKA 1VCGA 3T40A 3B04A 5BMWA 4A22A 3MO7A 4FO4A 1A5AA 4YXGA 3W7RA 4X2RA 4H3DA 2NV2A 5D37A 3YPIA 1FWWA 1Q6OA 3I7SA 4LOCA 4AWTA 3VNDA 4O19A 1AG1O 4LS0A 2BLEA 4H6KA 3NPXA 2GVLA 2QUVA 3LHYA 4RV8A 4UMCA 5CPLA 4O10A 3C61A 5LHFA 2YR1A 1FDYA 1YPFA 3NOEA 4WXZA 3W2JA 5C54A 1L6YA 3NAVA 4L4MA 1TPDA 3NQAA 5EY5A 3W07A 1WYIA 2YYTA 3G8EA 1RQHA 4UTWA 1GYLA 3LHVA 3QQ1A 4XQ6A 1RVGA 4ZQRA 3N3MA 4JEQA 4O1DA 4IGHA 1JCNA 3LHWA 4CCDA 3TDFA 1C9DA 2QF7A 3OIXA 1KM5A 5DBTA 2VFEA 1TRIA 3BV4A 4JTGA 1J4EA 2EF9A 2NWSA 3M5VA 4JY8A 3OVQA 1VYRA 4PL2A 1HL2A 4D2JA 3EXRA 5AHIA 2BZNA 2V30A 3FEMA 2A7PA 4UUIA 3VI2A 5KITA 5LNSA 1B3OA 4LC6A 3QW4B 4UFHA 3W23A 3PB2A 1W54A 1DQWA 3UWQA 1EB3A 3DXIA 2Y7FA 3BGJA 1JQXA 4LVFA 4MYAA 2V5BA 3W1QA 1VJIA 2JGYA 4R53A 2JGQA 1W3TA 4HKPA 5LSMA 2VFHA 2B0MA 3RNDA 3TSDA 4K36A 1Q6LA 3O8AA 1K8ZA 2Y89A 4U28A 1SPQA 1H1ZA 1DJNA 5KSWA 1K8XA 2PRHA 1QWGA 3LGEA 5G4WA 2ISWA 3MP4A 1T8XA 3LV5A 4DBDA 4I9AA 1PHQA 4LVBA 4O50A 3MYPA 1QR7A 2Y63A 3JS3A 3W2NA 3H54A 3GDKA 3EWXA 4NZJA 5HUPA 3U8GA 4AHOA 1WA3A 3CB8A 5LGXA 1W5OA 1XBYA 3OA3A 4TR9A 3VFLA 1K7XA 4AAJA 2VOMA 4X9SA 3S1XA 3LRMA 1VH7A 5I3JA 2FLIA 1SZGA 3FKRA 3I6RA 3MP5A 3MI2A 5HQEA 1ZAIA 4MZ1A 3RF9A 1QPOA 1DBTA 1G4TA 2H8XA 4MFEA 3P8JA 1PL9A 4DF1A 3QMTA 1VHCA 4O12A 1TPUA 3TAKA 3Q94A 3S5OA 3USBA 4TU1A 2NUYA 3GDLA 3FS2A 4OBTA 8TIMA 2XN2A 4ALDA 1FDJA 4CNPA 2ATMA 2WNNA 4DELA 2PC4A 5K9XA 2E09A 4AMAA 1LOQA 5G2IA 1T96A 3LV6A 3N19B 2DP3A 3TJXA 1YDNA 2J27A 3G1XA 2CW6A 2EHHA 1OFAA 3W1UA 4MYXA 4MY9A 3S6DA 2ZYFA 2Z6IA 3PUDA 3DFOA 4WXYA 5AC7A 5HMSA 4ZQMA 3M1ZA 3ZS4A 1WBJA 1W8SA 5KTLA 3LRLA 4S2BA 1SU5A 3GYEA 1KM6A 4UCGA 1N55A 3G1AA 1DVJA 1XFBA 5EMUA 4E2BA 1LBMA 1OX6A 1TQJA 3P82A 1EX5A 1KM0A 3QM3A 3NA8A 3LCIA 4O0KA 2VENA 5F4WA 4CNOA 1FCBA 3P5ZA 1W37A 4LW7A 4XKYB 3QRHA 3IIVA 3E02A 2OX1A 2QJIA 1WX0A 3TQKA 3PBYA 1TPC1 3HF3A 3L5LA 3HG5A 4N6EA 4OV9A 3STEA 1NFBA 4A2SA 5D02A 5CPNA 4OU1A 2DU2A 3W7GA 3NQ7A 1S5WA 3PBVA 2OT1A 1SO5A 2YW3A 4ORMA 4MJZA 4UNKA 2H90A 5G5IA 3WK0A 1NEYA 3S1VA 3NM1A 5C2XA 4O28A 2RDTA 2YSWA 2C3ZA 4RR4A 1WOAA 2ZQ0A 3LHTA 3TQVA 3WK2A 1EA0A 3S42A 2DZTA 1R30A 3BW4A 4AEOA 2O7SA 2B7OA 3IEBA 1NF7A 2ZZ7A 4IMEA 3UWYA 3WK3A 3LCFA 4Z08A 3C8FA 1LBFA 3G18A 3S1WA 3EX4A 1C29A 1D9EA 3E12A 2ZRXA 5C55A 3HPZA 3TU9A 1M7OA 3KRUA 4GUFA 4JY9A 3ATZA 2D73A 3MBFA 3U6WA 3T55A 1F2JA 2V8ZA 2R91A 4N9DA 4ADUA 3VE9A 2J9XA 3EEGA 3EB2A 3UD6A 4DQWA 1MEIA 5AFDA 2CLLA 5TQLA 1OFOA 2A5HA 2YDAA 1OVDA 5AHLA 1UBSA 4C1LA 1Q3NA 1ZENA 4UFIA 4DEFA 2CLOA 4Y8FA 4FXRA 5K9DA 1W5MA 1GJPA 3ABOA 3F4NA 3O6DA 3S0CA 2ZDRA 3W7CA 1LP6A 4Z1DA 3T44A 4K39A 2E1DA 1H1YA 3L0GA 4AF0B 4LC8A 1I8JA 4O54A 1ZAJA 3GKFA 5FF0A 3DKLA 3MYOA 4OHQA 2I1OA 3LBMA 4OV4A 1ME7A 5FF3A 4PODA 2Y7EA 4U4MA 2BX7A 1TB3A 4ZMGA 1KW1A 1LZOA 3LLDA 3W7IA 3IVTA 3P80A 4MPQA 2CLIA 5TIMA 1SO6A 5F2MA 5K4XA 4FX7A 1G7VA 2V9DA 1G4PA 5DCBA 1SFLA 1LRNA 3NQDA 3W22A 3O07A 4HPJA 3R8RA 3F03K 1TTQA 1X8FA 3NPWA 1P0NA 2G95A 1OFQA 5U4NA 1HTIA 1XXXA 3N9SA 3PC0A 1Z42A 2Z2UA 3C2FA 4GRSA 3NQMA 5AC6A 2X1TA 2FDSA 4IUOA 3A5VA 1GVSA 4RKAA 2WNZA 3P60A 1EP1A 3UXAA 4NUWA 3HQ1A 1DQXA 3OBKA 4JTLA 3HGRA 1YTEA 2TRSA 3UWWA 4LU0A 4OWGA 4Q33A 4W9TA 5HULA 3OHIA 2B7PA 2PE4A 2H3DA 3WJYA 1OX4A 2NXGA 1EUNA 2EPHA 2VC6A 2ZA3A 4G1KA 2NV1A 3MHFA 5FI8A 1XBXA 2QCFA 3B4UA 2EAWA 1N7KA 5FF7A 4K37A 2NX9A 1R2RA 2PCQA 3E9AA 1SSDA 4MIMA 4P2VA 3NZRA 2A0NA 5LKYA 3CEUA 4ML9A 2R14A 4N9CA 3QC3A 1DV7A 2BTMA 2ZRVA 2GQ9A 4OE7A 5DLCA 2YYUA 3UPWA 4K8HA 2JKEA 2NLIA 1H60A 2C1HA 3OVPA 1K3UA 1G67A 4NQ1A 3MUXA 2HS8A 5K9CA 1RZMA 3V75A 1F74A 1B9BA 3HGSA 4DF0A 5EYWA 4PCFA 1N8FA 5A5WA 3W7NA 2V2HA 3VKJA 2HSAA 4WY0A 1PS9A 3UY8A 4M7SA 3BW2A 2VELA 3JR2A 4H4IA 2AGKA 3TJLA 3TQ0A 4O16A 3PSVA 1AW5A 3LM7A 4M6VA 4XTDA 3QSTA 2B7QA 3DI0A 1FWRA 3NEVA 3L9CA 4N2YA 1RR2A 3DKJA 2JBMA 2QJGA 4QNEA 3BVJA 3TKFA 1QO2A 1GTEA 3STGA 1VHNA 3F1QA 1H7PA 4CNNA 3GDTA 4M6PA 3TSBA 4UTIA 4LVAA 4O15A 2O7QA 2G96A 4N6FA 1H7RA 5KMYA 4WY0F 6TIMA 3P61A 1I45A 3W6YA 3WFAA 4OT7A 1T99A 3B0UX 3UQNA 1I2PA 3UY7A 3LB0A 1RV8A 5HJLA 1TV5A 1EUAA 1X1ZA 5CPOA 2CLHA 2Y85A 1JCYA 2A7NA 1HUVA 3HOJA 1LYXA 5D2VA 1TTPA 1MZHA 5HWJA 3TROA 3ZWTA 3P67A 4Q4KA 3CWNA 5K2ZA 3U2OA 4XWUA 4I7WA 2ZTJA 3GAKA 3W7MA 4AH7A 4DPQA 3EX1A 2WSRA 3R5EA 2V82A 3NL6A 1X7FA 2NUWA 3L2IA 2QR6A 4MY1A 1QFEA 2OCZA 1PHWA 1VCFA 3IVUA 2VFIA 2DJXA 3W1MA 1HO4A 4JX4A 4LV9A 4O17A 3WJSA 4DBEA 2TSYA 3AO0A 2H3BA 1XDLA 1YYAA 4O13A 3DFNA 2QDHA 3DHFA 1ME8A 5F2LA 2Q8LA 1FQ0A 1GVFA 3HMJG 3NQEA 2PRMA 3IIOA 1OYBA 2CLMA 4UTMA 3A5FA 1E51A 4JYEA 1C8VA 1H51A 2HMCA 4NNCA 3TFCA 2A21A 2ZZ5A 4X22A 3O6CA 4O57A 1IXNA 1ZY9A 5CZSA 3NR0A 5IBXA 1G7UA 4C1KA 3GVGA 1OJXA 1FUYA 2GJLA 5C6MA 1KLZA 3KRSA 1ZALA 3TW7A 4QAIA 5AHMA 3NQ2A 1LROA 3SY5A 1SUXA 3E96A 3EWWA 5HINA 1TO3A 4Q32A 1MSSA 1AW1A 3A23A 4HT3A 1SW0A 4AB4A 4NT0A 1IF2A 4PC8A 1KM4A 4UR8A 5FF4A 1Q45A 1TPFA 4OGZA 5F4XA 1OF8A 2YCEA 3KX6A 1DOSA 1LDCA 1ZJIA 4FNUA 4FNRA 3QH2A 4N4PA 2FPVA 3FOKA 1BWLA 1O5KA 2XN0A 4NJIA 3TV8A 3QSRA 4K8EA 5K3VA 3B03A 3QPZA 4JTEA 3L5MA 2BXVA 3GR7A 1GQNA 1JCJA 4Y96A 1LLWA 1R2TA 2FIQA 4BF9A 1FCVA 1SR9A 3Q37A 2ZTKA 5DN1A 3G24A 2Y7GA 5LNRA 3A21A 3P8IA 2R8WA 1JUEA 1PCWA 2QAPA 4EVZA 4WQ6A 3PF3A 1JUKA 4DXVA 6ALDA 4Z1BA 4KWWA 1K8YA 1YLVA 5G1TA 3S5YA 4O1BA 3S9YA 3M9YA 4XKYA 3HGJA 1Q6QA 4X3ZA 3KVJA 2DZSA 1SW3A 2G5WA 4NX0A 4O0ZA 5D09A 1ML1A 1YDOA 5CZTA 4JX6A 2NZLA 3FJLA 3TC7A 2XN1A 4JTUA 4R33A 4ZQNA 1JCMP 3KAOA 4PTNA 3BPWA 3JRKA 4IJBA 5D04C 3NL5A 4DO5A 5T26A 1YADA 4IX0A 3GKAA 1F73A 3W1LA 3P5YA 3CIXA 4Y6GA 2ABAA 1ICQA 2WJZA 1KBJA 4MOZA 3FA5A 4HSNA 1ME9A 3FJ6A 1WQ5A 1TV8A 2ATSA 4FIRA 4N4QA 4XBKA 3DFPA 1XKYA 4XZ9A 2HS6A 2E5CA 3STFA 3SGUA 3DU0A 1W3NA 2OMAA 3LHUA 3A9IA 4UMBA 1IXPA 2X16A 1XUUA 4UMAA 3N73A 3EX6A 5D2YA 4DO6A 2VEPA 1EEPA 4NNBA 1AMKA 3CU2A 4ZQPA 4KFOA 2GVGA 3W1RA 4E0CA 1XM3A 2C6QA 4BK9A 3G1FA 4AWSA 2ZBTA 3GXNA 1H63A 3LHZA 3O16A 5G2HA 3L5AA 1L6WA 1OFBA 3EWYA 4NJKA 4MFDA 1TV7A 3TE9A 3W2UA 3MMTA 3WJWA 4AF0A 3TNOA 1LCOA 1XCFA 3FYOA 4S1FA 5DXXA 1F6KA 1QPRA 2CZEA 4GJ1A 2CWNA 3L21A 1EP3A 1QPNA 2CU0A 3DI1A 3LCXA 2RDWA 2QUUA 3DBPA 3M43A 4HN4A 5E0KA 1LOLA 1NSJA 3GNNA 4PEKA 4TMCA 1EPXA 3W2KA 2ZRUA 3EWBX 1M6JA 1TRDA 5U7SA 1SZNA 4JIQA 2QCGA 4LS2A 5DXYA 1S5TA 1LORA 1Z44A 4O1CA 5GVJA 2QCLA 3ABSA 3IV3A 1K7FA 4JS3A 2KZHA 4JDBA 3C52A 4JIPA 1JCLA 5H2ZA 4QITA 2E68A 5AB3A 4O8RA 5BRBA 1AL7A 1LRTA 2C15A 3VE7A 3TA6A 5BW6A 1OFPA 4FNPA 3C2EA 2VXNA 4NJGA 1TPWA 3M5ZA 1YTDA 4K7VA 5CPMA 3W7EA 1OYCA 3EWZA 4XBSA 2FB3A 3QYQA 3I7RA 1JUBA 3CTLA 3S5NA 3CT7A 5CZJA 4GUIA 5LGZA 3G0UA 3NZ1A 5LZLA 1KBIA 1TJPA 2A85A 4IMCA 5FEZA 3LX9A 5F1UA 2QCCA 3GAYA 5HNRA 2A7RA 3UNDA 3IGXA 4JTFA 4CCEA 3W72A 2AAMA 1TCDA 3UZJA 4FX6M 2Y88A 2ZA2A 1ONRA 3NYZA 3M7WA 4BR1A 1L2UA 2C19A 4WOZA 5CKSA 2TYSA 4GUHA 4WD0A 3CM4A 4AXKA 4YMZA 4AVFA 2UV8G 3WJZA 3E0IA 1KV8A 4JTIA 1P1XA 3NDOA 1Z41A 3M41A 2PRLA 5HUOA 1JCXA 3CPRA 3SGZA 1VGAA 1Q6RA 3EX3A 5G2WA 1G4SA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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3BO9A

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