3BTA | Genus

Total Genus 336

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	336
sequence length	1295
structure length	1277
Chain Sequence	PFVNKQFNYKDPVNGVDIAYIKIPNVGQMQPVKAFKIHNKIWVIPERDTFTNPEEGDLNPPPEAKQVPVSYYDSTYLSTDNEKDNYLKGVTKLFERIYSTDLGRMLLTSIVRGIPFWGGSTIDTELKVIDTNCINVIQPDGSYRSEELNLVIIGPSADIIQFECKSFGHEVLNLTRNGYGSTQYIRFSPDFTFGFEESLEVDTNPLLGAGKFATDPAVTLAHELIHAGHRLYGIAINPNRVFKVNTNAYYEMSGLEVSFEELRTFGGHDAKFIDSLQENEFRLYYYNKFKDIASTLNKAKSIVGTTASLQYMKNVFKEKYLLSEDTSGKFSVDKLKFDKLYKMLTEIYTEDNFVKFFKVLNRKTYLNFDKAVFKINIVPKVNYTIYDGFNLRNTNLAANFNGQNTEINNMNFTKLKNFTGLFEFYKLLCVRNDLCIKVNNWDLFFSPSEDNFTNDLNKGEEITSDTNIEAAEENISLDLIQQYYLTFNFDNEPENISIENLSSDIIGQLELMPNIERFPNGKKYELDKYTMFHYLRAQEFEHGKSRIALTNSVNEALLNPSRVYTFFSSDYVKKVNKATEAAMFLGWVEQLVYDFTDETSEVSTTDKIADITIIIPYIGPALNIGNMLYKDDFVGALIFSGAVILLEFIPEIAIPVLGTFALVSYIANKVLTVQTIDNALSKRNEKWDEVYKYIVTNWLAKVNTQIDLIRKKMKEALENQAEATKAIINYQYNQYTEEEKNNINFNIDDLSSKLNESINKAMININKFLNQCSVSYLMNSMIPYGVKRLEDFDASLKDALLKYIYDNRGTLIGQVDRLKDKVNNTLSTDIPFQLSKYVDNQRLLSTFTEYIKNIINTSILNLRYESNHLIDLSRYASKINIGSKVNFDPIDKNQIQLFNLESSKIEVILKNAIVYNSMYENFSTSFWIRIPKYFNSISLNNEYTIINCMENNSGWKVSLNYGEIIWTLQDTQEIKQRVVFKYSQMINISDYINRWIFVTITNNRLNNSKIYINGRLIDQKPISNLGNIHASNNIMFKLDGCRDTHRYIWIKYFNLFDKELNEKEIKDLYDNQSNSGILKDFWGDYLQYDKPYYMLNLYDPNKYVDVNNVGIRGYMYLKGPRGSVMTTNIYLNSSLYRGTKFIIKKYASGNKDNIVRNNDRVYINVVVKNKEYRLATNASQAGVEKILSALEIPDVGNLSQVVVMKSKNDQGITNKCKMNLQDNNGNDIGFIGFHQFNNIAKLVASNWYNRQIERSSRTLGCSWEFIPVDDGWGERPL

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

publication title	Crystal structure of botulinum neurotoxin type A and implications for toxicity. pubmed doi rcsb
molecule keywords	PROTEIN (BOTULINUM NEUROTOXIN TYPE A)
molecule tags	Toxin
total genus	336
structure length	1277
sequence length	1295
ec nomenclature	ec 3.4.24.69: Bontoxilysin.
pdb deposition date	1998-08-12

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
1.20.1120.10	Mainly Alpha	Up-down Bundle	Clostridium botulinum neurotoxin B, "coiled-coil" domain	Clostridium botulinum neurotoxin b, "coiled-coil" domain	3btaA02
2.60.120.200	Mainly Beta	Sandwich	Jelly Rolls	Jelly Rolls	3btaA03
2.80.10.50	Mainly Beta	Trefoil	Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A)	Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A)	3btaA04
3.90.1240.10	Alpha Beta	Alpha-Beta Complex	Zincin-like	Metalloproteases ("zincins"), catalytic domain like	3btaA01

5GLTA 4TLPA 1UAIA 1MS8A 1SCRA 1AXYA 1W3AA 1S1AA 4KTXA 4XZPA 2VW1A 5HPZA 2XHLA 4ISQA 4XE9A 1W6OB 4XXPA 5BQUC 3ZC8A 2Z42A 1DQ0A 1AVWB 1WD4A 2AREA 1KRIA 2ISGA 1GZWA 2GMMA 3LLPA 5D62A 4AN6A 3O5WB 5GLVA 3D6EA 3MW2A 3M3QA 4M01A 5H9RA 1G9DA 2KLLA 1WW5A 4P0JA 5JOZA 4XFSA 2VXRA 4UW3A 3BADA 1D0HA 3FUOA 2IMBA 3Q7XA 3D4KA 3I8TA 4P9WA 3FIIA 3IAGC 1SR4A 4JC1A 3ZXKA 5E24E 8I1BA 2HWMA 2J3PA 3CAHA 4PQ9A 1ISVA 4Y1YA 4OEEA 3PJQA 2WLQA 3O4BA 4ZA3B 3AJ6A 3FUQA 1EPWA 3FJCA 1BKZA 4P6AA 3IKWA 3WG4A 1EYLA 4XDQA 1MS9A 2YXSA 1DQOA 2A6VA 3P6IA 1G86A 5DSSB 1FGAA 2DTWA 2QYIB 4BLJA 4XBQA 2P23A 2PHWA 3INAA 3RTIB 3V0BA 1V6WA 4WV8A 2DREA 1FNYA 3RG0A 3OPZA 3S8JA 1QMJA 1LHUA 2YZ4A 5DUUA 2A71A 3PMEA 3BAQA 1BASA 4LO3C 1B09A 3AZWA 1NZKA 4Q2FA 1LHWA 2ESUA 1QKQA 1NLSA 1WCSA 3N0KA 4RL7A 1AXZA 1Y7BA 3RSJA 3POSA 3HOMA 2ZGTA 2BEAA 5DG1A 1DFQA 4DCKC 4P9XA 1AVUA 4EFQA 1MZ6A 4ZGRB 2CWSA 1HDKA 5DZEA 4GALA 2DU1A 4Z8BA 1F31A 3DUIA 1UN1A 3M3EA 3CRHA 2GNDA 4BLIA 5EXOA 2GNBA 3BB2A 3QCWA 3VKFC 1CESA 3HBWA 1TEIA 5F8WA 2UURA 4LO1A 1WBAA 4YGEA 1AX0A 1V6LA 5GZGA 1A78A 2R1DA 3MALA 2DVDA 4U2AA 1W0PA 4J23B 4FOWA 1IJTA 5E88A 2I2SA 4ISRA 3A22A 1RZOB 5JLVA 2QN0A 4DENA 4YM3A 1GNHA 3BWIA 3OGGA 3AP6A 3WZ1A 3FJHA 3H6RA 3PHZA 1ISYA 3FJ9A 1WW6A 2D6OX 4I2SA 1ILR1 2OVUA 4GOYA 2E53A 1I3HA 4C1WA 4FPYA 1KNMA 5BYNA 1TP0A 3N7LA 5GZEA 3BIWE 1WLWA 3WUCA 3VT2A 3CQAA 4IY8A 3PVOA 5BQNA 2DYCA 4JKXB 1A8DA 4XBNA 5CB7A 1PWAA 1S0IA 2W39A 3FJAA 4QD2B 4USPA 5GM0A 2EXJA 1Q8PA 4PC4A 1YYNA 1HKNA 5GLUA 5DUXA 1UZZA 1W6NB 2XG3A 4OW4A 2LIEA 3O5SA 2E51A 4PF5A 4MYEA 1BFFA 1AZDA 1OKQA 4I7IA 3VWCA 2GZBA 3JU9A 3UD7A 5BP5C 1MS3A 4FPJA 3AX4A 2AQZA 4LO0A 2JD4A 1W0OA 4I4SA 2UWAA 3ZXJA 1T4QA 3WDWA 1WLCA 3TAYA 1GZ9A 1MVQA 3WO3A 2AUYA 2NP0A 4BOWA 4LBLA 2GN7A 3WHTA 2ZGQA 2DS0A 5BQMA 3QW6A 3BOOA 3M3CA 4H04A 1MZ5A 5GZFA 5JVVA 1Q8QA 5DZGA 3JRRA 4LO2C 3AYDA 1LODA 3ZXEA 2NYYA 1LHNA 1TWMA 4KBBA 1TTUA 1AX1A 2ZMLA 2W2DB 5IK8A 1DFCA 1V6JA 2ZABA 1GBGA 1W6OA 1MS4A 1RITA 3R05A 2IWTB 1DJSB 1QGLA 4FPEA 1SBEA 1R8OA 1DYKA 1ITBA 3UL2A 1MC9A 1U0AA 4YZ2A 1MS0A 1AXMA 4I4PA 2JJ6A 4LO7B 1OQ1A 4XJ9A 3FBYA 4JP0A 4P14A 1H9PA 1AX2A 4EKXB 1KJRA 2YUGA 4JQ0A 3FJDA 1ZL5A 1QNWA 1LGBA 5F5QA 2A3WA 2AENA 4Q9GA 41BIA 1UPSA 4Z9WB 2FGFA 5T50A 4R9BA 5IUQA 4J1LA 3POKA 1A3KA 5GALA 3RRDA 1GGPB 4BMBA 4AGGA 3Q7WA 3QW8A 4IY9A 1SLAA 3FJIA 1DZCA 4WVVA 3WHUA 2D6KA 1GKBA 1ZM1A 3SLIA 3A0KA 1H30A 2Q5TA 3AZYA 4M3CF 1LOGA 4GP3A 4XIKA 2D3SA 2R0HA 2DV9A 1AJKA 5FNXA 3B9CA 5BXRA 4K1YA 4AYUA 1JYCA 2GMPA 4QALA 1ULGA 1QNYA 2D23A 3BTAA 4SLIA 1M2TB 3WCRA 2A6ZA 2Z49A 3UJ4A 5EC5A 3P6JA 2LALA 1HCDA 2ERMA 3H0OA 5IK7A 1V6KA 3NBDA 4JPZA 3WLUA 2A75A 2EXHA 2D3PA 1OQLB 4I4RA 3WDTA 1N1YA 1SLCA 1PZ7A 1IS6A 2KH2A 4JRAA 1ZL6A 2QN4A 2CY6A 1GYKA 1V6NA 1JLYA 3FJEA 1CR7A 1LOFC 4I4YA 3DS9A 1MR5A 5JOXA 3NV4A 2F2FC 1S0JA 3WINA 4OEFA 2K4AB 1TFMB 3Q7YA 4P9YA 3BA7A 2UWCA 1IILA 2ILPA 1S0EA 1GNZA 4IZXA 3RMYA 2G4IA 3MEPA 1ZKWA 4USOA 1QDOA 3OYWB 3RTJB 1VCLA 2G7QA 1F82A 3S8KA 1BYHA 1PZ9A 3MPPG 3WCSA 1KDKA 1LEMA 1UL9A 1ISWA 3VKMA 2A8AA 3LSDA 1WD3A 4G9MA 4YZ1A 3PVEA 4CRQA 4NO4A 5DZFA 3CU1B 7I1BA 1DQGA 2ET2A 2MIBA 1V6UA 3O0WA 2Y9WC 1ENRA 1M16A 3WDXA 3EF2A 1LHOA 1N4KA 1W6PB 4QKSA 4Q1RA 2CNAA 3FLTA 3UK9A 1SLLA 3IM5A 1N3OA 3ZSJA 1QOSA 3MW3A 4KEIA 5CBLA 2DRZA 3PUBA 2D3RA 3M2MA 4ZFUB 2EAKA 3LSEA 3VEQA 3A21A 5AVAA 1UZYA 2RQ9A 3O0XA 3TC2A 3KMVA 1S0BA 5GLWA 3BRGC 1BFCA 3ZUSA 1URXA 2GN3A 2PELA 1UX6A 4I4XA 3LTQA 1LENA 4ASMB 3I2AA 3AXDA 4KEKA 1DQ4A 1CQ9A 2WQZC 1QDCA 2VSAA 4I30A 1W6NA 1ZKXA 3HSMA 2ARXA 3DEBA 2XOAA 1SCSA 4YW4A 1N47A 4I4QA 3AJYA 4D69A 3AKFA 1VIWB 4ZJXA 3CA6A 1ABRB 5BQUA 2WSVA 4Y1UA 3AYCA 3V65A 4XIOA 4Q91A 1WBLA 1LESA 2WT0A 5KXCA 4GA9A 1IS3A 3VT1A 2DUPA 2HWAA 1SZ6B 3ZPYA 4XMIA 1JW6A 4Q1PA 4F34A 5JDBA 2R1BA 4LBQD 1LECA 2DU0A 3AP7A 1YTOA 2NM1A 1ENQA 3BOPA 3O44A 2VU9A 3T8SA 1Q56A 4GWNA 5GLZA 2W2DA 3OBTA 5I1BA 1LJ7A 1T9FA 1KITA 3WOGA 4YM0A 1IKPA 4ATFA 1W6QB 4DQAA 3C8BA 2ZGOA 1FATA 5IK4A 3USUB 4YG0A 3UJOA 1FWVA 4ENDA 4DPNA 2ZGPA 3O49A 4A7YA 3IN9A 4DRVA 2XB6C 4Q9PA 5GZCA 1GV9A 5T5PA 1PC8B 3A07A 3RQ0A 4D0TA 4XTPA 2ZGNA 3ZX7A 4QBVA 3WDYA 4OUJA 2A70A 4X3AA 1YVGA 3OGFA 3CNAA 1V00A 4M3CB 1QOOA 3ATGA 1VAMA 4LO3A 4KS6A 1JT3A 1G9BA 1BZWA 3ZXLA 3WVJA 3W58A 1IRAX 3ZVXA 4W65A 4XXAA 4M3CE 1SLBA 1LULA 2C9AA 3BAOA 2I1BA 1JT7A 2RHPA 1SBFA 3QIYA 2BQPA 3BAVA 3OJMA 3JUUA 5DUYA 2WT2A 4LO1C 1C1FA 4RA0A 2JECA 2V73A 3C89A 1S0CA 2VSEA 4D8HA 2ZACA 5EHAA 3F1RA 1H9WA 2MC2A 1PZZA 2F8XC 1FN0A 2NVHA 4AVTA 1AVXB 3ILAA 3ZXGA 2WNEA 1TOOA 2YROA 3PVNA 3N7MA 1GANA 5KXDA 4C1XA 4TZDA 2KM2A 4UW6A 4YM2A 3H6SE 3B69A 3CA5A 1XTFA 4D0ZA 4LBOA 3RS6A 4ZFYB 3HALA 2VY0A 4A7ZA 2ZQNA 2GO2A 2D7RA 1DQ1A 1C4RA 4XHBA 1EVTA 1FQ9A 1JXNA 1I1EA 3AKGA 4X37A 3ILRA 3OYWA 1J0SA 3SH3A 2UUSA 4ZOTA 2R9KB 2PHTA 2AGSA 1LHVA 4EFPA 3IIRA 5LK5A 3VKNA 3OJ2A 3FJBA 3HR9A 5T5OA 4PBPA 1DIWA 1S0LA 3UDAA 2DVAA 1DBNA 4CJMA 4HR6C 2D20A 3POYA 3B3QE 5KXBA 3FJ8A 3VV1A 3AH1A 2AR6A 3AK0A 2Q9XA 4ITCA 3OBRA 3NBNA 3NF3A 2E6VA 3BAHA 4LO0C 5F8YA 5BXTA 3WMUA 4I1EA 3P53A 1W6PA 1Q8SA 3A4UA 2ZGSA 2D7FA 2WSUA 2E4MC 1ULDA 3ZUQA 2WJSA 3F62B 3WV6A 5EYXA 1XHBA 4G1RA 3L2YA 3ZYRA 4G6JA 2GNMA 2R16A 5F9TA 4K21A 2GMEA 1JT4A 2P37A 2ZGKA 2D1ZA 3SH4A 2W52A 4J2SA 2ZHKA 1O4YA 4I4OA 3ZXDA 1CJPA 3ZXFA 1L2HA 3IMNA 3LCPA 4LO2A 1KJLA 3AH4A 1Q03A 2OUHA 2A7AA 1ULCA 3UD9A 1LGNA 3UD8A 4OWKA 3TB0A 4OZXA 5EG6C 1KQRA 3FJKA 1DZDA 3NWKA 3RMXA 3I29B 1GSLA 2KI4A 3K3QB 3KM5A 1HQWA 1Z4SA 4NOTA 5EWSA 4YFZA 3BAGA 4HA2A 3BAUA 3AZZA 3VSFA 1GZCA 1HWOB 5E89A 1AF9A 1G9FA 3C9ZA 4GKYA 3C8AA 3GNEA 1WBFA 5CA6A 3BA5A 3IM7A 1JUIA 4UW4A 2DVBA 3VT0A 3AYAA 1V6XA 5DVHA 3WG1A 3AJZA 1YF8B 2DVFA 1UKGA 2ZAAA 4YW5A 2YY1A 2ZA9A 2ISHA 2SBAA 4AGVA 1F5FA 2A6YA 4QBCA 3B00A 2OW4A 1V6IA 1W6QA 1I1BA 4UW5A 3USUA 1T3AA 3GALA 4IONA 5HCBA 1W3GA 3BRFA 1ZB7A 5DZUA 1N3PA 4X39A 2HYKA 1Z2VA 1MVEA 1K5UA 1ISZA 1BLDA 4LBQB 2A6WA 1FNZA 1HIBA 1F9KA 1CVSA 4BPZA 4K20A 2W68A 4GWMA 3BONA 1HQLA 4Q26A 2ZHLA 2R49A 2P3JA 1JT5A 3ZSMA 5FZUA 3WINC 2HZ9A 1DGLA 4M3CA 5CNAA 1IRPA 1VLNA 4AGRA 1R8NA 1RIRA 4YM1A 1ZN3A 3PG0A 3OJBA 3CRIA 5D61A 3C88A 2M49A 4QO3A 4U36A 3WDVA 4I96A 4LBKA 1QQLA 3DDAA 4X38A 4I37A 4XJZA 1WW7A 4YLZA 4YG3A 1NUNA 4HL0A 6I1BA 3B9UA 2PHUA 2GDFA 1QQKA 4L4IA 1DYPA 4QKRA 2K8RA 1YIFA 3WO4A 4J2KA 3AFKA 2WKKA 2FO1A 2D43A 4ZKTB 1G7YA 1V6MA 4YFWA 5DUVA 1E1HA 1IS5A 3V64A 2L5XA 3O4CA 1G9AA 2B7YA 1BFGA 4YW2A 2X2SA 4DFSA 1FAYA 4Y1XA 3AP5A 2D24A 2HW9A 4OWLA 1G8WA 4GXLA 2G7NA 4I6IA 2OUJA 2ZBJA 3K1XA 4Q8LA 3NBCA 2ES3A 4XFUA 3POWA 2ZMNA 3IM6A 1AVBA 5L73A 3BOKA 1Z78A 3ZSLA 1HKDA 3HN1A 4G6MA 4H55A 1BJQA 3T1MA 2NMOA 2AAIB 5IK5A 1CN1A 1HCEA 3I4IA 1SACA 4DEPA 1ONAA 3QYDA 4QD2C 1S0GA 1LOEA 2FFUA 3W59A 4P0KA 1LU2A 1BLAA 2D7IA 5BXSA 3BRDA 3QIXA 2DURA 3NV3A 4Y22B 4ZBVB 4HJJA 3CA1A 1SBDA 4AVVA 1JOJA 1IS4A 2KI6B 4G9NA 3T2TA 4CTEA 3N7JA 1JY0A 4JKQA 3V79C 1XYFA 2A97A 1WBCA 4IYBA 3O4OA 1WLDA 3QW7A 4XILA 2A3YA 5FREA 1MD6A 3AP4A 4WBCA 1HWMB 1FMZA 3OY8B 4FOVA 4L4HA 2WRYA 1CONA 1LTEA 1DQ6A 1SFYA 4XJWA 2R0FA 2FFVA 2EIGA 4A7KA 2NZ9A 3R4SA 3NV1A 4Q8KA 5H9PA 2FPQA 3CA4A 2PHFA 4Y20B 1SR4C 2GNTA 3AP9A 1Q1UA 1EV2A 1G9CA 3D3XA 4BQ1A 4EFRA 2WBCA 2AH2A 2H0BA 4YGDA 1SLTA 2UWBA 2ZQOA 5EYYA 3NV2A 4JAWA 1LGCA 1ISXA 4LO8B 5T52A 3ZURA 1AXKA 2ZHMA 3BODA 3QIZA 3D5OA 1V6VA 3IPVB 3A23A 3FJJA 3WNXA 4YGBA 1LOBA 3V0AB 1DHKB 5T54A 1JYIA 5FZZA 2ETFA 4YGCA 2DUOA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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3BTAA

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