The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
18
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sequence length |
95
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structure length |
95
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Chain Sequence |
PSSNGPLEGTRGKLKNKPRDRGTSPPQRAVEEFDDGEKVHLKIDPSVPNGRFHPRFDGQTGTVEGKQGDAYKVDIVDGGKEKTIIVTAAHLRRQE
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Ribosome
|
| molecule keywords |
50S ribosomal protein L2P
|
| publication title |
Mutations outside the anisomycin-binding site can make ribosomes drug-resistant.
pubmed doi rcsb |
| total genus |
18
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| structure length |
95
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| sequence length |
95
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2008-02-23 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| Q | PF01157 | Ribosomal_L21e | Ribosomal protein L21e |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | Ribosomal protein L21 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1VQ4 Q; 3CCV Q; 2QA4 Q; 1YHQ Q; 3CCQ Q; 1Q81 R; 3CC7 Q; 3CCM Q; 1KD1 R; 1YJ9 Q; 1YI2 Q; 1VQK Q; 3CD6 Q; 3CPW P; 1Q7Y R; 2OTJ Q; 1VQM Q; 3CC2 Q; 3CCR Q; 3CMA Q; 1VQ9 Q; 1QVF P; 1K9M R; 1VQ6 Q; 1VQO Q; 3G4S Q; 1Q82 R; 1NJI R; 2OTL Q; 1K73 R; 3CCS Q; 3OW2 P; 1VQN Q; 3CCE Q; 1W2B P; 1QVG P; 1YIJ Q; 1YIT Q; 3G6E Q; 1Q86 R; 1VQ7 Q; 3CXC P; 3CCJ Q; 1M1K R; 1KC8 R; 1JJ2 P; 3G71 Q; 3I55 Q; 3CCL Q; 3I56 Q; 3CME Q; 1N8R R; 1K8A R; 1M90 R; 1VQL Q; 1KQS P; 2QEX Q; 1VQ5 Q; 3CC4 Q; 1YJW Q; 1S72 Q; 1VQP Q; 1YJN Q; 3CCU Q; 1VQ8 Q; #chains in the Genus database with same CATH topology 1KFZ A; 2M9U A; 2QYZ A; 3JCM f; 5LJ5 h; 4PNO A; 4C5G A; 2D9T A; 3TU4 K; 4OMO A; 4PJO C; 1KG1 A; 2DIQ A; 2M0Y A; 5GJV B; 4CC7 A; 2CZ6 B; 3CXC S; 4C8Q E; 2KSS A; 1E6H A; 4DBF A; 1QVG P; 2VWF A; 1QP3 A; 4E7I A; 2CZ1 B; 1LJO A; 1YFN A; 4MDW A; 1M30 A; 3REB B; 2K2V A; 3PIP A; 4JRP A; 1QCN A; 4C92 F; 1OX8 A; 2DRK A; 3M0P A; 1JXM A; 3CPW A; 3SHW A; 4XTY A; 1WNL A; 4KUI A; 2DAQ A; 4PLI A; 2ZPI B; 1UGS B; 3R6N A; 2L3P A; 1RLQ C; 3J81 E; 1TWB A; 5DM7 R; 1GBR A; 2VGN A; 4QKU A; 2IG0 A; 1M2O A; 5GAM g; 2P4T A; 2MI6 A; 3CC4 A; 5KE3 A; 3CCM Q; 2O2O A; 1K0S A; 4DOV A; 2GFA A; 2YRC A; 1PD1 A; 4KH1 B; 3CCR A; 4C8Q C; 3CME T; 2JTF A; 2Y90 A; 3CCE Q; 3M0R A; 1YIT Q; 2RQU A; 4M75 F; 5GAN e; 1PSE A; 2JMA A; 1AVZ C; 4PJJ A; 2QQB A; 2VXF A; 1UB4 A; 3WXM B; 2RI5 A; 2HL3 A; 3TQ7 P; 2RB6 A; 4BY6 C; 1M2V A; 2LMJ A; 2NUT A; 2KRN A; 3M56 A; 1UGP B; 3RNJ A; 3O8V A; 4C92 D; 4K11 A; 2AHJ B; 2CKK A; 1QWF A; 2VV5 A; 4E7H A; 3HFO A; 2QTX A; 2YUO A; 3QDR B; 2YLB A; 3OMG A; 4IUV A; 4HCB A; 1N8R R; 5GAN 7; 1TG0 A; 2ESW A; 1SRL A; 5GAN 6; 3C94 A; 1GCQ C; 4C5I A; 2DEU A; 1SG5 A; 4XU3 A; 4RCB A; 5GAN f; 1RAG B; 1UJ0 A; 1BI2 A; 4NL3 A; 1VQ7 T; 1Y96 B; 2DBM A; 2LNV A; 2R5M A; 1XQH A; 4M77 B; 4BAC A; 3OSS C; 2F2V A; 2P0Q A; 3I55 Q; 3J7A F; 4M75 D; 2RN8 A; 2XIC A; 4XU2 A; 3CD6 T; 1H8K A; 4QVC A; 2CZ7 B; 2YUP A; 1I0C A; 2LDM A; 4J9H A; 3VYG A; 4XU1 A; 3QXE B; 2HEQ A; 4FIB A; 2DD5 A; 1RAE B; 1LCK A; 3M54 A; 2DXB A; 2MAM A; 4ESR A; 1FYN A; 3PT9 A; 2OJ2 A; 2YXY A; 1FWZ A; 2FG0 A; 4C0D B; 5KYX A; 5DLO A; 1IRE B; 5CK9 A; 4HVU A; 3AHU A; 2V26 A; 1YJW A; 1DJ7 B; 3Q1J A; 3ZEH A; 2YWW A; 4J6W A; 3QJY A; 1LVK A; 1XJW B; 5FLX E; 3SDZ A; 3QII A; 4RMO A; 3H41 A; 4DBH A; 1VQO A; 3M0Q A; 2CYZ B; 3I5S A; 1HJD A; 3AT1 B; 2QDL A; 1HYO A; 1Y07 A; 2JUF A; 2DXC A; 1TUG B; 1EIF A; 1TXQ A; 5GMK l; 2EIF A; 2HD0 A; 2X35 A; 4RTW A; 2LCS A; 4A53 A; 4QVD A; 3CCS T; 1KSW A; 2CP7 A; 4CC4 B; 2A08 A; 2E4H A; 3G1J A; 4M7A E; 4CC3 A; 4X34 A; 3UA6 A; 1VQL T; 4F7U F; 5LJ3 e; 4MMK A; 4D6W A; 3EFO A; 2EVR A; 4RG8 A; 1X69 A; 3NTK A; 4A4G A; 1VQM T; 5CO7 A; 1PKT A; 1YHQ Q; 2DL8 A; 2X3W D; 3R6O A; 4XQ3 A; 2HSE B; 3CC7 A; 3EG9 B; 5LJ3 g; 5GMK m; 3CMA Q; 1M4Z A; 1QVF P; 1V76 A; 4OGC A; 2JMC A; 5IN1 A; 3KXT A; 3PE0 A; 3VS5 A; 2QQ9 A; 3CCL A; 4JZ4 A; 3M58 A; 5LJ3 f; 2XI9 A; 3MEV A; 3I35 A; 1C6V X; 2MYS A; 2CP0 A; 2J6F A; 4E2F B; 3FLG A; 2R5A A; 1TU0 B; 1OU9 A; 2K2M A; 2ECZ A; 1QVG A; 1VOM A; 4RUG A; 2GTJ A; 2A28 A; 2DIG A; 3QWY A; 4J6X A; 4F17 A; 4GLK A; 2DZC A; 1AZE A; 3CCV A; 3VS1 A; 3HHT B; 4OMP A; 4AFQ C; 4MML A; 1UTI A; 1X01 A; 2CT4 A; 3OBY A; 2RI3 A; 2DLP A; 2RQT A; 4M77 G; 3VS0 A; 1WHG A; 4BDZ A; 4PJO A; 1TUD A; 4DA4 A; 5CKD A; 2HQE A; 2XID A; 2ROT A; 2NUZ A; 1K73 C; 4WTO B; 5CKF A; 5GMK j; 2DVE A; 4M77 D; 1W2B P; 1B34 A; 2EYX A; 2XDP A; 3OMC A; 1M27 C; 1PM3 A; 2PNI A; 4JLG A; 1OYX A; 3OS5 A; 2J6K A; 2E5Q A; 4QT7 A; 5LJ5 d; 1J3T A; 1MUZ A; 4ORZ A; 3S6W A; 3CC2 A; 2SEM A; 3RKX A; 2LTO A; 1KQ2 A; 4F14 A; 2CP6 A; 2Y4X A; 3GLX A; 3JB9 F; 3CME Q; 1M90 R; 2AIR B; 1ZUU A; 2D1X A; 2JTM A; 2OAU A; 1UE9 A; 4OVA A; 3HRS A; 2H8H A; 3WVE B; 2RNA A; 1MMA A; 2JS0 A; 4HA8 A; 2V1Q A; 1C1A A; 4C8Q A; 3OSV A; 3JAM E; 1YJ9 A; 2NUP B; 2RI2 A; 5FRO A; 1JXO A; 3CCJ T; 1M1K U; 2RA2 A; 3QDF A; 5GAN 4; 2DNU A; 4MZT A; 2COZ A; 1PC0 A; 4OMN A; 2CSQ A; 3JB9 J; 4E7J A; 4LUD A; 4V2S A; 2X4W A; 1MHN A; 3KFV A; 2DIL A; 1H92 A; 4J9C A; 2EFI A; 4LN2 A; 3VYH B; 4KGV B; 1ZSZ C; 1S1N A; 4C5H A; 2RHU A; 1QP2 A; 3A98 A; 5CCA A; 3BE3 A; 1HXD A; 1KHC A; 4J5Y A; 1BCO A; 1Q82 R; 3QG1 A; 1EX4 A; 1VQP T; 2DTH A; 1B07 A; 1VQ7 Q; 3HFN A; 2DVJ A; 1QCO A; 1GCQ A; 3JB9 D; 4R56 A; 1GFC A; 1S72 A; 2RPN A; 1WHM A; 6AT1 B; 2HL5 C; 5CQY A; 3QJ6 A; 2KYB A; 3CD6 Q; 3CPF A; 3OQ5 A; 2YRD A; 3EH1 A; 1W6X A; 2HQX A; 3RDV A; 2VAS A; 4Z89 A; 4OGE A; 5FU6 C; 4OB0 B; 4M7A F; 1VQ4 T; 4BI8 B; 2EQK A; 3FEO A; 2XKO C; 2E6N A; 2QI2 A; 2VVK A; 2C0T A; 2GCX A; 2EGC A; 3ZBD A; 1TS9 A; 3JCM b; 5GAN 2; 1I5O B; 1AOJ A; 1QVG S; 1BI1 A; 2BIV A; 1BIB A; 2ZPB B; 2OTL A; 4M7D E; 4JZ3 A; 2KE9 A; 3MP6 A; 3QHS A; 1U06 A; 1LOJ A; 1RUW A; 1ZQ1 A; 2DER A; 3JCM Q; 1UGQ B; 2XG8 D; 4ZNX A; 5GAM j; 2L3Q A; 2BKD N; 1D1A A; 5IXB A; 2YRV A; 2EYZ A; 2G3R A; 4FU6 A; 3G6E T; 1QVF A; 2D0Q B; 5GAN 5; 4C92 B; 3DLM A; 3CCS Q; 5KYX B; 1RI9 A; 4LD9 K; 3PMI A; 1FMW A; 2FPF A; 4KUD K; 2P84 A; 1T0J A; 3DKM A; 4KGZ B; 3C0C A; 3OYF A; 1JQQ A; 1VQL Q; 3H0F A; 2OX7 A; 2H3J A; 2H3E B; 4LNP A; 1OOT A; 3M59 A; 4KUL A; 2XU8 A; 2XDB A; 4BUG A; 2X9H A; 2DL5 A; 1N5Z A; 1VQM Q; 4PL6 A; 4ZGE B; 4JJC A; 4FT2 A; 3I5R A; 2O88 A; 2KGT A; 1D3B B; 2QEX T; 4E7K A; 5FRN A; 3A5Z B; 2YLC A; 5CKB A; 4M7D C; 2BUD A; 1JU5 C; 1PCX A; 2C0I A; 3QPH A; 1X6O A; 4EMH A; 2JOY A; 1B7T A; 1SRM A; 3E1S A; 4XTX A; 2DJZ A; 9ATC B; 5I21 A; 4PJO E; 2I0N A; 2J6O A; 1K73 R; 2RK2 A; 3LGF A; 1U8R A; 4IKF A; 4X9D A; 3OYB A; 5GMK h; 4L5G A; 2ROL A; 1KQ1 A; 3JCM g; 3CCM A; 3OYD A; 4A4H A; 3OYI A; 1MGQ A; 3DB4 A; 4HT8 A; 1V1C A; 1SEM A; 3SWN B; 3I56 T; 1UG1 A; 1W2B A; 3CCE A; 3CCU T; 2RHI A; 3EFR A; 3S3N A; 2X3X D; 1YIT A; 1W1F A; 4FCY A; 3ZFJ A; 2OAW A; 2D6F A; 1RAC B; 3E19 A; 4XAX B; 1U1T A; 3VV0 A; 1IB8 A; 1NJI U; 4HT9 A; 2DD4 A; 2K6D A; 1WHJ A; 2QG9 B; 3G71 T; 2AT1 B; 1HSQ A; 4C0Z A; 3MET A; 2LP5 A; 5GAN 3; 1YJN T; 1BI3 A; 2WSC E; 1RAB B; 2K5L A; 1JJ2 P; 1Y57 A; 4E6R A; 2LJ1 A; 1K0X A; 1QKX A; 2DEQ A; 2JW4 A; 2KQW A; 5CKE A; 3MP1 A; 2RHZ A; 3EFS A; 3LW5 E; 4OMF B; 1VQ8 A; 4Y28 E; 1ZUY A; 3LH5 A; 2CH4 W; 2P0K A; 1YIJ T; 1JO8 A; 2EWN A; 2O31 A; 2C06 A; 1KHI A; 3RER A; 2M51 A; 3UA7 A; 3OYY A; 4HCZ A; 1ZA1 B; 3RIR A; 1N9S A; 5I11 A; 2X51 A; 2PTK A; 3I55 A; 1N6A A; 4A54 A; 2FHD A; 1O75 A; 1OEB A; 2E3H A; 2QAZ A; 1Q7Y C; 3H0I A; 4Z8A A; 1I4K 1; 4EIK A; 2PU9 B; 5J26 A; 3EGD A; 1NM7 A; 1NJI C; 2KMT A; 4PFZ A; 4PFO A; 2FZG B; 3LH0 A; 1E7O A; 5LJ3 j; 1NEB A; 2KI7 A; 2XMF A; 5C0M A; 3ASK A; 4J9E A; 3CCJ Q; 2DPP B; 3JCM W; 3CCQ T; 2SRC A; 1UHC A; 4Z88 A; 2V8J A; 4C92 G; 5AYF A; 4F7U B; 2VGM A; 3M4G A; 1ZLM A; 2DK3 A; 2ENM A; 3L2R A; 8ATC B; 2E12 A; 3OYJ A; 3G4S T; 1QVF S; 1YCY A; 2MOX A; 3FB9 A; 4ZTJ A; 1X2K A; 1FX7 A; 4UC4 A; 1VQ9 A; 5GAN g; 2AKK A; 2QK0 A; 4N0A C; 3GIB A; 1SKU B; 3HPW A; 4DBR A; 4ELY C; 1K1Z A; 2FVU A; 1TUC A; 2QA4 T; 5A0G A; 1YI2 T; 1VQP Q; 5FRM A; 2MWO A; 2R58 A; 1ZSZ A; 1ZUK A; 4C8Q B; 4M77 C; 1D1C A; 1Z9Z A; 2A7Y A; 5CIU A; 4C0F A; 5KYU B; 2P0P A; 4J9G A; 3M0T A; 4M75 G; 3RMQ A; 1SSH A; 3P8B B; 2DMO A; 5GAM h; 1UFF A; 2K57 A; 4BY6 B; 2ZGW A; 2EJF A; 3RMS A; 2DL7 A; 3EGU A; 1D09 B; 1WLP B; 2LNH B; 2OTJ T; 1IO6 A; 1VQ4 Q; 2MF2 A; 1LNX A; 1G2B A; 2QDY B; 2QAS A; 3JCM P; 1VQ6 T; 1YHQ A; 1M8V A; 4II1 A; 3H9N A; 1OZ2 A; 3UAT A; 3CMA A; 3CBP A; 5FW9 A; 4M78 E; 3HKS A; 5J39 A; 2A3L A; 3U23 A; 1QMC A; 1JRI A; 2HBW A; 3FIF A; 2LC4 A; 1BU1 A; 1VIF A; 3JRZ A; 5CR2 A; 1KD1 U; 1G3W A; 2K3B A; 4XK8 E; 4MZP A; 2M1H A; 4N4H A; 2JM8 A; 3UT1 A; 2GFU A; 4ZGD B; 3THK A; 1W2B S; 2RJF A; 5KYW A; 4BI3 A; 4EMK B; 1K8A U; 1SPK A; 4PJO F; 1VQ5 T; 3G6E Q; 2VKN A; 3HL8 A; 5CQX A; 1VYU A; 2HDA A; 5M9O A; 3P8D A; 4Y91 A; 2K7A A; 4J6Y A; 2JT4 A; 1T3L A; 1MMD A; 1VQN T; 2DL3 A; 4JS4 A; 3X28 B; 2KT8 A; 1OPK A; 3KBG A; 3OA6 A; 5D6X A; 1K9M R; 4M78 C; 2PVO B; 1I81 A; 4FYY B; 2D0N A; 2CP2 A; 5IH2 A; 1Q86 R; 1K76 A; 3TCJ A; 3EG3 A; 3MEW A; 4JRQ A; 2BZX A; 2QEX Q; 3X25 B; 1WQ7 A; 1KD1 C; 2KT1 A; 4NOY A; 5J3B A; 3BW1 A; 1IRX A; 2ATC B; 4RTU A; 3CPW S; 5IT9 E; 2LRQ A; 4LDW A; 4M7D A; 3OS2 A; 4PLL A; 4OB3 B; 1K8A C; 3JSC A; 3OYE A; 1AT1 B; 3HSB A; 1PRL C; 4C8Q F; 2EYY A; 3VKI A; 1PG5 B; 1Q81 U; 1GCP A; 2ED1 A; 2RF0 A; 1U1S A; 1WQW A; 3GOX A; 1MNE A; 2RH2 A; 5HK3 A; 1PSF A; 3SD4 A; 2O4X B; 5IXF A; 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2KEA A; 2RD1 A; 1R77 A; 2YHT A; 3MO8 A; 5HK0 A; 4E7S A; 2EGE A; 4M4Z A; 3E2U A; 3E9G A; 2DRM A; 2QA4 Q; 2PVG B; 2W10 A; 1YI2 Q; 3L2W A; 4KGX B; 3OYA A; 4N0A A; 1AWJ A; 3C12 A; 3HTR A; 5A2Q E; 2QGF B; 1IGU A; 3JB9 G; 4OB2 B; 4DQ2 A; 2KXC A; 1IHV A; 3CCS A; 4GY5 A; 1NLP C; 4HVW A; 4M77 A; 2RHX A; 3GP8 A; 3VS7 A; 2DF6 A; 5CKH A; 1VQL A; 2PUO B; 1M2V B; 2NUT B; 1PNJ A; 1YWO A; 2KRO A; 2JJ9 A; 3CQT A; 3EG1 A; 4LDV A; 3O5Z A; 2O9V A; 3LGL A; 4IUR A; 4NS5 A; 2OTJ Q; 5IAY A; 4PK4 A; 3F70 A; 1SF9 A; 4VUB A; 1VQM A; 3FRN A; 3OS1 A; 1VQ6 Q; 2E70 A; 3NGP A; 1M1K C; 2V8K A; 1N8R U; 1RAA B; 4GBQ A; 5CAI A; 3MHX A; 1ZSZ B; 1G8X A; 3A1P A; 2A36 A; 1AWW A; 3OB9 A; 3UWN A; 2BE9 B; 3MEU A; 4P5N A; 1KD1 R; 4BB7 A; 1VIE A; 2EPD A; 4IUQ A; 4M75 E; 5DY9 A; 3CC4 T; 2L5Q A; 2FB7 A; 2J7I A; 5GAM d; 4AFS C; 3X24 B; 1UGR B; 2I2L A; 1VQ5 Q; 1WFW A; 5C6S A; 2EQM A; 2WAC A; 4C92 C; 3CCR T; 2L8D A; 5GJW B; 2CP5 A; 3BY7 A; 2Y4Y A; 4JRK A; 2L3S A; 4M7A G; 1NPR A; 3TSZ A; 5GMK e; 3WVD B; 1B3Q A; 1VQN Q; 3JB9 I; 1N8R C; 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