3CCLN

Structure of anisomycin resistant 50s ribosomal subunit: 23s rrna mutation u2535c. density for anisomycin is visible but not included in model.
Total Genus 45
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
45
sequence length
186
structure length
186
Chain Sequence
ATGPRYKVPMRRRREARTDYHQRLRLLKSGKPRLVARKSNKHVRAQLVTLGPNGDDTLASAHSSDLAEYGWEAPTGNMPSAYLTGLLAGLRAQEAGVEEAVLDIGLNSPTPGSKVFAIQEGAIDAGLDIPHNDDVLADWQRTRGAHIAEYDEQLEEPLYSGDFDAADLPEHFDELRETLLDGDIEL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Mutations outside the anisomycin-binding site can make ribosomes drug-resistant.
pubmed doi rcsb
molecule tags Ribosome
molecule keywords 50S ribosomal protein L2P
total genus 45
structure length 186
sequence length 186
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-02-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
N PF17144 Ribosomal_L5e Ribosomal large subunit proteins 60S L5, and 50S L18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.100 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3cclN00
1OVYA 3CC2N 4IO9L 1M1KO 1Q86O 1Q81O 4WFNL 1KC8O 1VQKN 3DLLL 1KD1O 4WF9L 3CCLN 1Q7YO 3CF5L 1KQSM 3G71N 1Q82O 2QA4N 1VQNN 5GAHP 1K8AO 1YI2N 2OTJN 5JVHL 3CD6N 3CPWM 3PIPL 3CC7N 5DM6L 5DM7L 1VQ5N 3G4SN 1VQ6N 4WFBL 4U67L 3CMAN 1YHQN 3CCRN 1M90O 1JJ2M 5GAEP 3CCSN 3J7ZO 3CCEN 4WFAL 5HL7L 1YJNN 1VQ9N 5JVGL 1S72N 3I55N 4UY8O 1VQ8N 1VQON 1VQMN 5GADP 5GAGP 3CCQN 1ILYA 3CCMN 5H1SQ 1VQPN 1NJIO 2QEXN 5MLCQ 1QVFM 2ZJPL 3OW2M 3G6EN 1YJ9N 3PIOL 1K9MO 1YJWN 3CXCM 1VQ7N 3CCJN 2ZJRL 3CCUN 1YIJN 3CMEN 1QVGM 1W2BM 1VQ4N 4WCEL 3CC4N 1K73O 1N8RO 3I56N 1VQLN 2OTLN 3CCVN 4IOAL 4IOCL 1YITN 2ZJQL
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2Q0RA 1SL1A 3CFOA 1C0MA 4MQ3A 3ZCMA 1XC9A 3VQ8A 5BPLA 3TAEA 1VQKN 3AO2A 4FLWA 1DT9A 1J6ZA 4H5NA 4BRQA 1YVUA 2YHBA 3VENA 2O8FB 4YOXA 1QQMA 3D2EA 4DU4A 4BRDA 3J8AA 4BE2A 3AARA 1MWMA 1BI4A 3FZLA 4OVLA 3PUFA 3NF9A 2WBNA 4BVOA 2RHKA 3VEOA 2Z1HA 5DM6L 2IAJA 4DQQA 3THVA 3B6PA 3OYGA 2E6MA 3NF7A 3NDKA 3E1YA 4DFPA 1RBRA 3LP0A 3HJFA 4RW9A 1D9DA 4NB4A 3OTOK 3UE5A 4GKJK 3AV9A 3VF2A 2W6KA 3OYFA 5FROA 4JS4A 4QS8A 2Q97A 1IG9A 1X3NA 2P9UA 4YOWA 1OH6A 3ZYYX 3HSTB 4O8UA 2ZQBA 3AO3A 4CCHA 2DFHA 2I5JA 4Y1CA 3UIQA 4JKGA 4FLZA 4RW7A 3WQTA 4FJXA 2O8BB 1UWBA 3HYFA 3AA4A 1O1WA 1YJ9N 2E20A 3B6OA 4NCAA 1Q8IA 2P9SA 2Z1GA 5B8HA 4CGJA 4WQ4A 5EOYA 3VPZA 1YIJN 2F8SA 3EKUA 4GKKK 1NKBA 4CGGA 5AQMA 4DS4A 3SI6A 3OYDA 4NLCA 4FJ8A 4WCEL 2JGUA 1ASUA 2HHQA 3THXA 1XUPO 3AO1A 5FDLA 4CJWA 2P9NB 4BQLA 3RR8A 5J2PA 3DXMA 3TTCA 4CFCA 1J9AA 4CZGA 5BRHA 4FWPA 2A42A 4PY5A 4H0TB 3NBPA 4ILGB 2EX3A 2NRXA 3D2FA 1HYVA 1HKBA 5C24A 4FW1A 2ZGYA 2YHAA 3LWMA 1BL3A 1UA1A 3KHYA 2HVHA 4FOIA 2W42A 4NCGA 2GV9A 3U6FA 4BRNA 3DYAA 3HPOA 2HW3A 3ZSWA 4HWIA 4IFVA 2AJQA 2XRIA 3HTVA 4JRPA 5AQIA 2VGNA 3EZWA 4RTFD 3SBGA 3OYBA 2P5GA 3OYIA 1Q9XA 4OKKA 1TKDA 2D0AA 1NGDA 1TAQA 1HYSA 3FFKB 4WE1A 3VEXA 1U6ZA 4FWLA 1RT7A 3DXKB 4J2BA 5C15A 1T6DA 4OJRA 1SKWA 5J2QA 3OYMA 4Z4HA 1HLUA 2RKIA 4XEIA 1U49A 3VQBA 1WN7A 2NRZA 4RW6A 3LZIA 5I9EB 4DSFA 4DR4K 1VQ8N 3LP1A 4N5SA 1EETA 5CY4A 4WQ5C 5C25A 1NOZA 3AA3A 3RRGA 4ISFA 2ASPA 4CEAA 4YOYA 1J5EK 5CE3A 2KZMA 1WAFA 4OGEA 1OH8A 2G8WA 4BR2A 2O8FA 5AQSA 3BF1A 2HNDA 1RTJA 3P39A 1T05A 3CM6A 4AHRA 3CXCM 2ZJRL 2B6AA 3AVLA 1S22A 4CHQA 3DLGA 1BA0A 5CZ2A 3QEVA 3VQCA 3F2KA 3KK3A 1NBWA 3C0BA 3L4QA 3NH0A 4IOAL 2VWJA 1NJYA 3R6MA 4IFYA 5AZIA 4WFNL 1IKXA 1CLQA 4CEDA 3DLHA 4LFCK 2HHSA 4FJGA 3QEWA 1EKEA 4B3SK 3H45C 2ATQA 1HNXK 4A5AA 3TSQA 1GOAA 4IDKA 2B5JA 4CHOA 3CG7A 4FJJA 1VSJA 1HQUA 3L6QA 4CJPA 4XH1A 5FLXO 5J2MA 1HPMA 2HBMA 3QDKA 3N4QA 2HF4A 4CGHA 5EVZA 3NGZA 4M3RA 1VSHA 2QWNA 2O8BA 4U67L 3VGKA 3ZT0A 3K5LA 4LF5K 4FK0A 4GMJB 4K8ZA 4BRGA 4E3SA 1NG9A 2XY5A 1C1BA 3TWHA 3O4WA 1JL1A 5FPDA 3NVKA 3P83D 3O5BA 1W97L 2D0PA 4LF6K 3QIOA 3DLKA 4B9NA 5AZJB 1G99A 4E0DA 2FBTA 2RN2A 1YT3A 3O9SA 4KREA 3HVTA 1TUYA 2R7YA 1RCHA 4BGBA 1Y64A 3LAMA 2GWJA 2P9NA 1QZ5A 3QLHA 2D1KA 5HRPA 3AGRA 1JL2A 4CEFA 3TSUA 3F9MA 3K5MA 4FXDA 4CEZA 2A6AA 4Y0WA 4QCLA 3SJJA 3H3NO 4DQRA 5C10A 1Q9YA 2ZJPL 1KVCA 5FPNA 4IG3A 3MEEA 2P9PB 1LOTB 3ASMA 3QIPA 1K9MO 4KTZA 1NMDA 4CZEA 4JKCA 4M3XA 3QNOA 1N6QA 3SJHA 3M8PA 5BPMA 3WNHA 3CCUN 1QSSA 3O80A 4DSIA 2YKNA 4KHUA 4C8NA 3C7NB 4K41A 3T19A 1FKPA 4JEPA 5AQGA 4ELUA 2PY5A 5BPNA 2P51A 1HPZA 5F2RA 1SL2A 3RWUA 3SV4A 3IDHA 4HUEA 4AM7A 4HHTA 1BA1A 3MCAB 1BDGA 1GOBA 2PZSA 2FF6A 4B3RK 2YI1A 4JAXA 5JICA 3LP3A 3DXKA 3IRXA 4Z94A 1IBMK 4BC5A 4FWRA 2XY6A 4BR9A 3FE1A 4C1NK 1N5YA 3VF4A 1IBLK 3O4QA 3V9UA 4FJIA 4DR5K 4H03B 4B9LA 2IOCA 5TKYA 2E5LK 1IKYA 2ASOA 5F0XA 4FM0A 3ZSRA 4PUOA 1MWKA 4DSEA 4IO8A 4DFMA 5M1NA 3M8RA 4E7HA 1RT2A 1L3VA 1RBTA 4CIGA 5T7BA 4K0KK 1X9MA 2YKMA 4KB0A 3LALA 5AQJA 4M3UA 3SMPA 5LY3A 2VQEK 4MLHA 3KJVA 2QWLA 3UKRB 2Q1NA 3O08A 1RT3A 3KLFA 1L5UA 4EHUA 1NGJA 1S72N 4LD0A 2OPRA 1TK8A 5IT9O 3WQUA 5BR9A 1EWRA 5KQDA 5ADXA 1JLCA 4KHSA 4IZ9A 1FXXA 3IAYA 3SV3A 3T1HK 1ILYA 3H1QA 3R3LA 3JYTA 4CBUA 1VRUA 2QWMA 1ATRA 1YUWA 2P9KB 1HX1A 5K14A 3TABA 4JKEA 3CFRA 3S9HA 3U3GA 2O8DB 1UA0A 4B3OA 1NGIA 1ZBLA 2VYPA 1VHXA 2O8CB 4RWTA 1T44A 4DV4K 4CI6A 3SUNA 3ZETB 1VQ4N 4CJEA 3SLCA 4M41A 4H4MA 3CC4N 4FLVA 3LDPA 3FGUA 4CHNA 2P1JA 4DTRA 4CF8A 1SKRA 1U04A 3K2PA 3CCVN 4BDPA 1A5XA 3OJSA 3DLRA 4BR0A 4CFBA 2YNIA 3TPQA 2CH6A 4BRAA 4XH4A 5AQVA 2JLEA 4OPHA 4B1VA 4DTUA 3S41A 3A0IX 1OKJA 4CD3A 4KTWA 4BWJA 3AO5A 3L2QA 5AZJA 4DTMA 3CF5L 3VQ9A 2HMIA 2ITMA 1NGEA 3DLBA 1XMQK 3QO9A 2CGJA 1DKGD 4J2EA 1Q82O 4C8OA 1LW0A 1RGIA 3ULDA 1HNZK 2CGLA 3VQAA 5FRNA 4GW6A 4O4GA 1Z05A 3ZSOA 3TI0A 2W41A 3P31A 2E1YA 1MDUB 4AF1A 3PIPL 3JSMA 1IKVA 3G4SN 4PL8A 4GNIA 4JRQA 1KVAA 4FWMA 3C6AA 3DLEA 4B9UA 2P9PA 3K9JA 1RDWX 3DI6A 4LSLA 3NFAA 1G15A 2PFUA 4LFBK 2HHHK 4PHTX 4FJHA 3CCSN 2ASMA 1C0UA 1IG8A 4KI6A 3C7NA 1ZBIA 2J4RA 1WBDA 3KIOA 5HL7L 2FSNA 3THXB 3MWTA 3AVHA 3LDNA 2NRHA 2DY4A 1JKHA 4B1XB 2OZMA 2FC0A 1X9SA 1FW6A 1ZYQA 2NRWA 1U48A 3RSEB 1W0HA 1NK9A 3IMXA 4O5FA 2Z1JA 4DTPA 1VQPN 4H8KA 4CHYA 1WLJA 1Y97A 3SAHA 4U7BA 4WYBA 4CD1A 4FLUA 2GWKA 4CJQA 2E88A 1SL0A 4WQ4C 4JD2B 3A5LC 1BQNA 1VQ7N 4FPAA 1HR0K 2IGIA 4CJRA 3HZ6A 4CE9A 4AHUA 4JHDB 5LMUK 1TL1A 5C2FA 2OPSA 3B8AX 4F2SA 4DV1K 4JKHA 1IO2A 1FK9A 3MECA 4JV5K 2HMPA 2O4GA 4CZJA 1XMOK 3LL3A 3SQ2A 4E7LA 2HHWA 4B9MA 2E2QA 1RTDA 3HPGA 1X3MA 1DTTA 1BIUA 3DOLA 4GVMA 5EX5A 3J7YP 4OPKA 2WTUA 1TAUA 4CEOA 1KC8O 3KK1A 1J54A 4CF9A 4FSVA 3E01A 4O55A 4ID5A 3L4IA 3NH1A 4DTJA 3UKRA 1K6YA 4CVNE 4KRFA 4A2AA 1TL3A 1BCMA 4B9VA 4K42A 3PY8A 1F21A 4CK3A 3OYAA 1KVBA 5BR8K 3T1YK 1XNQK 3ATUA 2G8IA 2P9KA 4E7JA 3W0LA 1TGOA 2QKKA 3K9KA 2ITGA 3NCIA 4C23A 3KTQA 3ISNC 2HNZA 2O8DA 1HQEA 4CZIA 3U9ZA 4FZYA 2LSNA 5CYQA 1TUUA 3CERA 3MXJA 3AO4A 2O8CA 4L3QA 4JI2K 4YOUA 3ZETA 4NXMK 3M8QA 2QTDA 4BRPA 1HKCA 1D4XA 5JVGL 5GIPA 2NNWA 2FSJA 3MK6A 1REVA 4FW2A 3FZHA 3QESA 2GUIA 4DV2K 5AZIB 2YJFA 1NGCA 4RG8A 1R59O 2YNHA 5KPRA 4Z4IA 2A41A 4M7YA 4FJ7A 2D0OA 3TTDA 3RMBA 2P9IB 3N4PA 1CXQA 3VTIA 3HSCA 3NE6A 4PKIA 4Z4EA 3WNFA 3ZX0A 3V1OA 3SUPA 1WBBA 5C0YA 4N76A 2HB5A 3HL8A 4CF1A 4H0PA 2W6LA 3LP2A 4TSXA 4F4KA 3EE9A 3MN6A 1YITN 4ICLA 2ZJQL 2ZGZA 1JLFA 2OA8A 4CJKA 3S3OA 2VG5A 3ZT1A 4CESA 1RT5A 3DLLL 4JI1K 1P90A 1SKSA 4BQZA 3IFRA 5AQKA 3E9PA 4CJLA 5JS2A 1Z26A 1U47A 3ITHA 3ID8A 5I3UA 4MO4A 3OYJA 1EXQA 1NU0A 1RDBA 3L3UA 3HVRA 4AILC 2OTJN 5ELZA 3RSEA 3V9SA 4FWKA 5HBMA 3BEXA 2DTUA 2YNFA 3OS2A 4KHQA 4DMNA 3CI5A 1EX4A 5AQTA 3O9RA 2Q2RA 3GL1A 4CZHA 2ZM6K 2BGGA 2HBJA 3K5OA 4JD2A 4DUZK 2GTDA 2OPPA 3CIPA 3KZBA 4DSKA 2F96A 4KBOA 2UYTA 3HI0A 5GAEP 2HBKA 5HRNA 3ZSVA 1KXPA 3L2UA 4JHDA 4JKAA 5EU7A 4WFAL 3CQXA 4FPBA 1I94K 1YVNA 4CEQA 4E7IA 1OH5A 1VQ9N 1GLFO 3DAWA 3I55N 1EWQA 1BIZA 4W5QA 2OYQA 4AHSA 1QTMA 1P8ZA 2OZSA 5KGWA 3VA0A 2VCPA 3WT0A 1HNVA 3M3ZA 2QWPA 3WXLA 3OS1A 3MEGA 4H4OA 1C1AA 3P1GA 3OW2M 2UUBK 4RW4A 2PYJA 4KO0A 5LMNK 5KGXA 1QHTA 1WSFA 3E9OA 4FJ9A 3G25A 5BRDA 4HVJA 2X74A 2WC9A 3CCJN 1ASWA 2O4IA 3RMCA 3FR0A 2DPNA 1HNIA 5DK5A 2G8UA 3C95A 3EO3A 4I6MB 1K73O 2KW4A 2GEMA 2OTLN 4YOTA 4N56A 3A5OC 4KPYA 2KFZA 4HCCA 4FJLA 1NOYA 1T3VA 2Q3SA 3NHGA 4JKFA 3S3NA 1Q81O 1GOCA 4KFBA 3KLEA 4EIAA 1BGXT 1A5WA 3CCLN 2KTQA 3AVIA 4F2RA 1K8KB 1Z6RA 3ZX2A 4HUFA 1MU2A 2QA4N 5GAHP 1QHAA 1K8AO 5C42A 3HBTA 1KSPA 1NMNA 4LF4K 1DGKN 2IC3A 3ZSYA 5JVHL 4ILHA 3CETA 2AA4A 1QS4A 3OYCA 3MCPA 1LV5A 3DM2A 3THWB 4X66K 3UB5A 1VSDA 1ASVA 2P9IA 3VGMA 4IBNA 4ZHRA 3L8BA 2OPQA 4FM1A 3O4NA 5J1EA 1OH7A 3OYEA 5CYMA 2G8KA 4ISEA 1EP4A 5CR4A 4JNEA 5AQFA 4FLYA 1N34K 3H08A 5E41A 2NUBA 2QWRA 1ZBFA 3EKSA 4PA1A 3DMJA 1SZ2A 3A5NC 4BR7A 3H46O 1RDCA 3ZLJA 1KAXA 3MXIA 4CERA 3CCQN 4DQSA 1GLBG 3CJCA 2OCEA 4BC4A 1E4FT 4FJMA 1X1PA 4A57A 1RTIA 4BREA 5LJWA 2Q31A 4JI5K 2NZTA 3D6RA 1BUPA 4JN4A 4BWMA 1NK0A 4O0JA 3NVMA 4OGCA 3FLCO 4LF8K 1BISA 4BROA 2HSTA 1B9DA 1VQLN 2KZZA 4X62K 3HO1A 1IH7A 2HHVA 4H5WA 1RILA 3KVGA 3DJCA 1WSHA 3KLHA 1QSYA 4B9TA 5HRSA 3K57A 2FLOA 3GBTA 2F4VK 3VEZA 2YJEA 4CK1A 3AVFA 4IJNA 3MEDA 4JK7A 1NK6A 4EP5A 1U4BA 1Q18A 4BE0A 4Z4FA 1RT4A 1UAXA 4DR2K 2FBVA 1H1VA 3MX2A 3HP6A 3K5NA 1S6PA 4ELTA 3TU5A 3F5TA 3WNGA 1YI2N 3BDPA 3K59A 1DLOA 1QZ6A 4BDZA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1OVY A;  3CC2 N;  4IO9 L;  1M1K O;  1Q86 O;  1Q81 O;  4WFN L;  1KC8 O;  1VQK N;  3DLL L;  1KD1 O;  4WF9 L;  3CCL N;  1Q7Y O;  3CF5 L;  1KQS M;  3G71 N;  1Q82 O;  2QA4 N;  1VQN N;  5GAH P;  1K8A O;  1YI2 N;  2OTJ N;  5JVH L;  3CD6 N;  3CPW M;  3PIP L;  3CC7 N;  5DM6 L;  5DM7 L;  1VQ5 N;  3G4S N;  1VQ6 N;  4WFB L;  4U67 L;  3CMA N;  1YHQ N;  3CCR N;  1M90 O;  1JJ2 M;  5GAE P;  3CCS N;  3J7Z O;  3CCE N;  4WFA L;  5HL7 L;  1YJN N;  1VQ9 N;  5JVG L;  1S72 N;  3I55 N;  4UY8 O;  1VQ8 N;  1VQO N;  1VQM N;  5GAD P;  5GAG P;  3CCQ N;  1ILY A;  3CCM N;  5H1S Q;  1VQP N;  1NJI O;  2QEX N;  5MLC Q;  1QVF M;  2ZJP L;  3OW2 M;  3G6E N;  1YJ9 N;  3PIO L;  1K9M O;  1YJW N;  3CXC M;  1VQ7 N;  3CCJ N;  2ZJR L;  3CCU N;  1YIJ N;  3CME N;  1QVG M;  1W2B M;  1VQ4 N;  4WCE L;  3CC4 N;  1K73 O;  1N8R O;  3I56 N;  1VQL N;  2OTL N;  3CCV N;  4IOA L;  4IOC L;  1YIT N;  2ZJQ L; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 2Q0R A;  1SL1 A;  3CFO A;  1C0M A;  4MQ3 A;  3ZCM A;  1XC9 A;  3VQ8 A;  5BPL A;  3TAE A;  1VQK N;  3AO2 A;  4FLW A;  1DT9 A;  1J6Z A;  4H5N A;  4BRQ A;  1YVU A;  2YHB A;  3VEN A;  2O8F B;  4YOX A;  1QQM A;  3D2E A;  4DU4 A;  4BRD A;  3J8A A;  4BE2 A;  3AAR A;  1MWM A;  1BI4 A;  3FZL A;  4OVL A;  3PUF A;  3NF9 A;  2WBN A;  4BVO A;  2RHK A;  3VEO A;  2Z1H A;  5DM6 L;  2IAJ A;  4DQQ A;  3THV A;  3B6P A;  3OYG A;  2E6M A;  3NF7 A;  3NDK A;  3E1Y A;  4DFP A;  1RBR A;  3LP0 A;  3HJF A;  4RW9 A;  1D9D A;  4NB4 A;  3OTO K;  3UE5 A;  4GKJ K;  3AV9 A;  3VF2 A;  2W6K A;  3OYF A;  5FRO A;  4JS4 A;  4QS8 A;  2Q97 A;  1IG9 A;  1X3N A;  2P9U A;  4YOW A;  1OH6 A;  3ZYY X;  3HST B;  4O8U A;  2ZQB A;  3AO3 A;  4CCH A;  2DFH A;  2I5J A;  4Y1C A;  3UIQ A;  4JKG A;  4FLZ A;  4RW7 A;  3WQT A;  4FJX A;  2O8B B;  1UWB A;  3HYF A;  3AA4 A;  1O1W A;  1YJ9 N;  2E20 A;  3B6O A;  4NCA A;  1Q8I A;  2P9S A;  2Z1G A;  5B8H A;  4CGJ A;  4WQ4 A;  5EOY A;  3VPZ A;  1YIJ N;  2F8S A;  3EKU A;  4GKK K;  1NKB A;  4CGG A;  5AQM A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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