3DCSA

Use of carbonic anhydrase ii, ix active-site mimic, for the purpose of screening inhibitors for possible anti-cancer properties
Total Genus 76
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
76
Knots found
sequence length
257
structure length
257
Chain Sequence
HWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHSFQVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords Carbonic anhydrase 2
publication title Design of a carbonic anhydrase IX active-site mimic to screen inhibitors for possible anticancer properties
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 76
structure length 257
sequence length 257
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2008-06-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 3dcsA00
2CBCA 5BRWA 1JD0A 2OSFA 3DA2A 3FFPX 2NXTA 5E2KA 1LG6A 3OY0A 5EOIA 3M1JA 1H4NA 4PYXA 2FW4A 3HKNA 1MUAA 2EZ7A 4L5VA 4QJXA 4RUXA 4WR7A 2AW1A 4BF1A 4DZ9A 5DSNA 3K2FA 4ZWZA 5DOHA 1FR4A 3U3AX 2ILIA 3DD8A 4M2UA 1DMYA 1I9MA 2NXRA 5SZ1A 1CAMA 3V3JA 1ZGFA 3MHMA 3DVCA 2WD3A 5DSRA 3CYUA 2ZNCA 1G52A 5AMLA 3W6HA 1A42A 4RH2A 1ZSAA 3DCWA 3U45X 12CAA 5DSOA 4YVYA 3V2JA 4R59A 3M04A 5SZ5A 1KOPA 4JS6A 3VBDA 2HL4A 3NI5A 3P5AA 4K13A 3MMFA 4Q0LA 1RZAA 1HCBA 1BICA 1MOOA 2ABEA 1FSRA 3M5EA 2FOUA 4QK1A 3TVNX 1EOUA 1YO0A 2HNCA 1CNGA 1CVDA 4FU5A 3M3XA 2O4ZA 3JXGA 1DCBA 3OYQA 4K1QA 1RAYA 5CA2A 3S75B 1CCTA 3DD0A 3R17B 4Q08A 4MO8A 4KNMA 5JQTA 1JCZA 1HEDA 1CZMA 5DSPA 2WD2A 4YXUA 3R16A 5BNLA 4JSWA 4CQ0A 4Q6EA 3NJ9A 3U47A 2VVAX 3P3HA 4XZ5A 1G3ZA 3OIKA 3MNAA 3P3JA 4K0SA 9CA2A 3T84A 1IF7A 4IDRX 1AM6A 5E2NA 5JDVB 5JEPB 1CNXA 1Z93A 2CABA 3D0NA 5FNIA 3M96A 1KEQA 3M98A 3V3GB 4ZAOA 2GEHA 3HLJA 1LGDA 4E3GA 1UGEA 1CAIA 5FL4A 5SZ0A 4N16A 1CAOA 4E3HA 3F4XA 1LUGA 5G0BA 1BNVA 1Z9YA 2NWYA 3C7PA 1IF8A 5SZ2A 1FR7A 5DSQA 1TE3X 3KKXA 4Z1EA 5J8ZA 3FW3A 4PYYA 2POWA 5EH5A 1G45A 4QY3A 1ZNCA 3MHLA 1IF9A 1ZSCA 4FRCA 3D93A 3DVDA 5DVXA 3RZ5A 1CAJA 4QTLA 2HKKA 3M67A 3KS3A 1CIMA 3V5GA 1CA2A 4Q7WA 1TEQX 4XE1A 4Q8YA 5G01A 2X7TA 5EHVA 4JSAA 2FOVA 3KOIA 1KWQA 1Y7WA 3JXHC 5FNLA 3SAPA 1DMXA 1CRAA 1TG3A 5FNKA 1IF5A 2FOSA 1YDBA 4LHIA 4QEFA 3W6IA 5FLQA 5C8IA 3RG3A 3M5TA 2H4NA 3MNKA 5FNHA 3UYQA 5HPJA 5EKMA 4Q9YA 5FLOA 1J9WA 4RIUA 1G48A 3M1KA 1G0EA 4KV0A 4Q7VA 1OKNA 2OSMA 3F7BA 1G54A 3MZCA 1T9NA 4HF3A 1CAZA 4Z1JA 1LG5A 4WUQA 2HOCA 1G4JA 4Q8XA 4KNJA 3T5UA 1TH9A 4YGFA 5E28A 4QSAA 5FLTA 1CVHA 4ZWXA 3SAXA 1UGFA 3IEOA 4MDMA 5DRSA 4Q87A 3RYYA 3S97A 5JG5B 3RYZA 1CANA 3F8EA 1BNUA 1CNIA 1HVAA 1G53A 1RJ5A 3M2YA 5E5RA 2IT4A 3F7UA 5JG3B 3Q31A 3DVBA 1I9OA 3CA2A 4Q90A 2CBBA 1BN4A 4YGKA 4Q49A 3KONA 4FPTA 1CILA 1CNKA 1G0FA 4R5AA 4CNXA 4YGJA 4G0CA 3S71B 1BNMA 4YYTA 4MTYA 4Q81A 2NWZA 1FLJA 4KUWA 1BN1A 4LP6A 1CVAA 3MNJA 3RLDA 4CNVA 3N3JA 1FSNA 1RAZA 4HBAA 4ITPA 5SZ4A 4PXXA 2NNGA 3M2ZA 4YX4A 1HEAA 3MHOA 3MYQA 4QJPA 4QSBA 3RYJB 2VVBX 4C3TA 3S73B 2CBAA 1H9QA 1RZCA 4QIYA 3V3IB 5AMDA 4L5UA 3OYSA 3DV7A 3P55A 3S76A 4ZWYA 3L14A 3ML2A 4YGNA 4MDGA 3M40A 1I90A 1G1DA 3S72B 1BNNA 4M2VA 1BV3A 3RYXB 1I9PA 1FQMA 3GZ0A 3P4VA 5CJFA 4MLTA 4Q8ZA 3HKTA 4HT2A 4Q7SA 3T82A 4PQ7A 3IBLA 4ZWIA 1RZBA 4YHAA 1CAYA 3CZVA 5EIJA 3D9ZA 3ZNCA 3KWAA 3OILA 4HU1A 3M2NA 3T85A 1UGCA 4WW6A 3TVOX 2CA2A 2WEGA 1BNTA 2FNMA 4KAPA 5LMDA 4M2WA 4BCWA 2POVA 4Z1KA 1IF4A 4TWMA 4HEWA 5JEHB 3DC9A 4TWLA 1CA3A 1I91A 1Z97A 1AVNA 1XPZA 1CVFA 1AZMA 1TBTX 2X7UA 3EFIA 3OKVA 1KWRA 7CA2A 4XIXA 4RN4A 1OKLA 1UGGA 2X7SA 4QK3A 4IWZA 4FVNA 5L6KA 1DCAA 3MNUA 1FQRA 3DCSA 4Q99A 2FOYA 5FLRA 4XFWA 3P44A 4R5BA 1HEBA 2CBDA 4KNIA 2Q38A 1I8ZA 1LZVA 4QIZA 3V2MA 5E2RA 3MHCA 1ZH9A 5EH7A 1CNCA 3RZ1B 2QOAA 3QYKA 5BYIA 5G03A 4KNNA 5CACA 3RJ7A 2Q1QA 3K34A 2NWOA 1G4OA 4YWPA 5FDCA 1UGDA 4E9OX 3BL0A 1BN3A 3B1BA 4QJMA 5FL5A 3N4BA 4YXIA 5AMGA 3RYVB 5G0CA 3FE4A 1YDAA 1CVBA 5JGSB 1TEUX 1XQ0A 3BETA 4K0TA 1CNHA 1CNWA 4HEZA 5FLSA 2WEHA 1ZE8A 4RFDA 5EKJA 2NWPA 5DOGA 1BNWA 3KNEA 4XIWA 4X5SA 1RJ6A 4PZHA 1G6VA 2EU3A 1RZDA 3MNHA 3IAIA 3MNIA 3RGEA 4E3DA 3PJJA 1UGBA 5EKHA 3V3HB 4CNRA 2W2JA 4Z0QA 1V9EA 5SZ6A 3S8XA 3M2XA 1YDCA 1CINA 4RUZA 1JV0A 3MWOA 4MLXA 4KP5A 1CNYA 3M14A 5EH8A 3KIGA 3CAJA 1I9NA 1YO2A 2NN1A 1YO1A 3KLDB 1CRMA 4HEYA 3MDZA 2WEOA 4QSJA 2QP6A 3RZ0B 5E5UA 4Q78A 1FQLA 3LXEA 4ZX1A 2FMZA 5SZ7A 1BNQA 6CA2A 1THKA 2CBEA 4M2RA 3DBUA 1FQNA 4KP8A 5E2MA 4K0ZA 4YXOA 4G7AA 1ZSBA 4ILXA 4CA2A 3PYKA 3ZP9A 3IGPA 2Q1BA 1TB0X 1CAHA 2F14A 4QK2A 5DSKA 3RZ7A 1KOQA 4MDLA 4Q07A 2NXSA 1OKMA 1I9LA 3HKQA 1FSQA 2FOQA 4QJ0A 4WL4A 3SBIA 4LU3A 4RUYA 4WW8A 5E2SA 2EU2A 1XEVA 1YDDA 1UGAA 4FVOA 4UOVA 5DSMA 2H15A 4KUVA 5L3OA 3IBNA 2NNSA 5SZ3A 3U7CA 4WUPA 5FNGA 2QO8A 1XEGA 4HT0A 3PO6A 3S78B 1CVEA 1TG9A 1BZMA 5FNJA 3TMJA 5DSIA 1G46A 1URTA 3P5LA 3T5ZA 4JSSA 3JXFA 4N0XB 2AX2A 1IF6A 4YGLA 1CNBA 2NNOA 2HFWA 2HD6A 2FMGA 5FNMA 2NNVA 1OQ5A 4CACA 8CA2A 5JQ0A 4COQA 5EHWA 3S74B 1V9IC 4ZX0A 4QJWA 4RFCA 3V7XA 1CCUA 2FNKA 4JSZA 3UYNA 4Q09A 1ZFQA 3K7KA 3M1QA 4BF6A 3N2PA 3EFTA 1CAKA 1F2WA 3OIMA 3DAZA 1CNJA 2NMXA 3NB5A 3IBIA 3T83A 4QJOA 5IPZA 2FNNA 1CCSA 5DSJA 1CALA 5JGTB 3B4FA 1RZEA 4E5QA 1HUHA 5DSLA 3RG4A 4E49A 5BRUA 5FL6A 4Z1NA 1TTMA 5FLPA 4FIKA 5CLUA 5BRVA 5EZTX 3P58A 5A25A 1H9NA 5FDIA 3HKUA 3V3FA 2GD8A 4Q06A 1HCAA 3S77B 5EHEA 1CVCA 3S9TA 4Q6DA 3D92A 5A6HA 2WEJA 5JEGB 3N0NA 4QSIA 3BL1A 3M5SA 4Q7PA 4DZ7A 3M1WA 1ZGEA 4FL7A 1HECA 3DCCA 3SBHA 5JESB 4GL1X 3KOKA 4ETQC 3RZ8A 4RIVA 1HUGA 3IBUA 2POUA 4L5WA 3MHIA 3OKUA 3D8WA 3HS4A 4ITOA 1I9QA 4Y0JA 4Q83A 3HFPA 3DC3A 4KUYA 3ML5A 4CNWA 1ZFKA 4E3FA 2NN7A 1BCDA 4E4AA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2CBC A;  5BRW A;  1JD0 A;  2OSF A;  3DA2 A;  3FFP X;  2NXT A;  5E2K A;  1LG6 A;  3OY0 A;  5EOI A;  3M1J A;  1H4N A;  4PYX A;  2FW4 A;  3HKN A;  1MUA A;  2EZ7 A;  4L5V A;  4QJX A;  4RUX A;  4WR7 A;  2AW1 A;  4BF1 A;  4DZ9 A;  5DSN A;  3K2F A;  4ZWZ A;  5DOH A;  1FR4 A;  3U3A X;  2ILI A;  3DD8 A;  4M2U A;  1DMY A;  1I9M A;  2NXR A;  5SZ1 A;  1CAM A;  3V3J A;  1ZGF A;  3MHM A;  3DVC A;  2WD3 A;  5DSR A;  3CYU A;  2ZNC A;  1G52 A;  5AML A;  3W6H A;  1A42 A;  4RH2 A;  1ZSA A;  3DCW A;  3U45 X;  12CA A;  5DSO A;  4YVY A;  3V2J A;  4R59 A;  3M04 A;  5SZ5 A;  1KOP A;  4JS6 A;  3VBD A;  2HL4 A;  3NI5 A;  3P5A A;  4K13 A;  3MMF A;  4Q0L A;  1RZA A;  1HCB A;  1BIC A;  1MOO A;  2ABE A;  1FSR A;  3M5E A;  2FOU A;  4QK1 A;  3TVN X;  1EOU A;  1YO0 A;  2HNC A;  1CNG A;  1CVD A;  4FU5 A;  3M3X A;  2O4Z A;  3JXG A;  1DCB A;  3OYQ A;  4K1Q A;  1RAY A;  5CA2 A;  3S75 B;  1CCT A;  3DD0 A;  3R17 B;  4Q08 A;  4MO8 A;  4KNM A;  5JQT A;  1JCZ A;  1HED A;  1CZM A;  5DSP A;  2WD2 A;  4YXU A;  3R16 A;  5BNL A;  4JSW A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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