The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
55
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sequence length |
145
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structure length |
145
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Chain Sequence |
HWSAEEKQLITSIWGKVNVADCGAEALARLLIVYPWTQRFFSSFGNLSSATAISGNPNVKAHGKKVLTSFGDAVKNLDNIKGTFAQLSELHCDKLHVDPENFRLLGDILVIILAAHFGKDFTPECQAAWQKLVRVVAHALARKYH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Oxygen storage, oxygen transport
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| molecule keywords |
Hemoglobin subunit alpha-A
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| publication title |
Purification, Crystallization and X-ray Diffraction Studies of Pigeon Hemoglobin
rcsb |
| total genus |
55
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| structure length |
145
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| sequence length |
145
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| chains with identical sequence |
D, F, H
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2008-06-18 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| B | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1X9F B; 1B86 B; 3A5B A; 1FHJ B; 1DO4 A; 2EVK A; 3WHM B; 1DWT A; 2OH9 A; 1MYJ A; 4MQI A; 1S5X B; 3ARL A; 3ZJS A; 2M6Z B; 3PEL B; 3BJ2 A; 2MGA A; 2ZS1 D; 4U8U A; 1DO1 A; 1J7W A; 1J7Y B; 1YOH A; 1A3O B; 1HCO B; 1PBX B; 2R80 B; 2MGL A; 1Y7G A; 1C7C A; 2ZFO B; 4HHB A; 1C40 A; 4HRT A; 3M38 A; 3TLD A; 2HCO A; 1RQ4 A; 1BVD A; 1CH4 A; 2EVP A; 3MVC A; 1V75 B; 1ECD A; 1DUO A; 2D2M A; 3MJU B; 1WMU B; 3V2Z A; 1FLP A; 3PI9 B; 3OZU A; 3M3B A; 2Z6T A; 3UH5 A; 2G12 A; 1DLW A; 1UIW A; 1X9F A; 5F2A A; 4UUR A; 2O58 X; 3WHM A; 1LH3 A; 2LH5 A; 4TWV A; 5ILP A; 1IBE B; 3MJP A; 3HEP A; 2W72 A; 4NI0 B; 1V4W B; 1A0U A; 1SI4 B; 2QMB A; 1J7Y A; 4DC7 A; 2V1I A; 2EKT A; 1ECO A; 1S56 A; 1HCO A; 1MLR A; 1R1X B; 2HHB B; 1O1O B; 1HGA B; 3ARJ A; 2ZSP A; 1D8U A; 2ZT1 A; 3WCU D; 1O1I B; 5HLX A; 1M6C A; 5B84 A; 1F5P A; 1UFJ A; 2ZS0 B; 2MGH A; 3RJ6 A; 1U7S A; 2MBW A; 2GRH A; 3MJU A; 3IXF A; 3MN0 A; 1YIE B; 3PI9 A; 2AUO A; 2AV0 A; 3S65 B; 2GRZ A; 2QFN A; 2SPO A; 4O4Z A; 3WCV D; 1MWC A; 3QM9 A; 2O5Q X; 1MLO A; 1IBE A; 3OVU C; 3H58 A; 3LQD B; 4NI0 A; 1V4W A; 2BNL A; 3PT8 B; 2QSS B; 1SI4 A; 4KJT A; 2O5M X; 1BZP A; 1JY7 B; 1SPG B; 3UHR A; 2ZSQ A; 3DHT B; 3QJD B; 2ZSR A; 2HHB A; 3ODQ B; 3BA2 A; 2Z85 A; 1O1O A; 1JF3 A; 5JDO D; 3PIA B; 2AV3 A; 4QAU A; 4NK1 A; 4G1B A; 1X3K A; 1IT3 A; 1O1P B; 1DXD A; 3WCT B; 5EQM A; 1AJG A; 2ZS0 A; 1LFL B; 3UI0 A; 4NXC A; 2GNW A; 1R1Y B; 1YIE A; 1M9P B; 2MYA A; 3RGK A; 3S65 A; 3G4V A; 1YZI B; 1NAZ A; 2D2N A; 1FAW B; 3UHI A; 1GLI B; 1XZU B; 1LFT B; 4IRO B; 2GL3 A; 1GZX B; 1SDL B; 1GDI A; 2MYE A; 3PT8 A; 3ZJQ A; 3UHY A; 2QSS A; 1JY7 A; 1Y8W A; 5EOH A; 1LFZ B; 1GCW B; 1SPG A; 1KD2 B; 1C7B B; 1XXT B; 3DHT A; 4MAX A; 3QJD A; 2LH3 A; 3D1K B; 1J3Z B; 3WTG B; 2VM0 A; 1XZV B; 3PIA A; 2R4Y A; 1Y31 B; 3ZH0 A; 1Y4P B; 1DXV B; 3WCT A; 1YEO B; 4HSX A; 5HLQ A; 1LFL A; 3UGY A; 3AQ8 A; 4FWZ A; 1URY A; 2DN3 A; 2ZS1 B; 2HHD A; 5C6Y A; 2Z8A A; 1YZI A; 4F69 A; 4YU3 B; 4G51 B; 1MYH A; 3ASE A; 1MBD A; 1GLI A; 2ZLT B; 4PQ6 A; 3UBV A; 2V1F A; 5JOM A; 2ZST A; 3ECL A; 1HBH B; 1XQ5 B; 1ABS A; 2BLJ M; 4F6F A; 3KMF C; 3UHD A; 2WTG A; 3R0G A; 1KD2 A; 3ARK A; 1C7B A; 1XXT A; 3D1K A; 1VRF A; 2PEG A; 3M3A A; 4TWU A; 3WTG A; 1Y01 B; 4NI1 B; 1TU9 A; 1YVT A; 2BWH A; 5E6E B; 1Y31 A; 3PI2 A; 1DXV A; 1N9F A; 4FWY A; 2QSP A; 1K1K B; 1YEO A; 1DO3 A; 2AA1 B; 3GQG A; 3EDA A; 3OZW A; 1N9X A; 3MKB B; 1YEQ B; 2MB5 A; 1HSY A; 109M A; 3HEN A; 4FC3 B; 4G51 A; 2ZSS A; 1JP6 A; 1JZM A; 1BZ1 B; 5E29 A; 2W6Y A; 1Y8H B; 2MGB A; 3SZK B; 1RTE A; 4ODC A; 1HBH A; 1VHB A; 4MXK A; 1COH A; 3A2G A; 1MLG A; 3ZJI A; 2GNV A; 1YDZ A; 1OR4 A; 3G52 A; 1XZ4 A; 5EET A; 1ASH A; 1HDS B; 3OO4 A; 4MQK A; 4NI1 A; 1HBR B; 2W31 A; 1V4U B; 3PI3 A; 5E6E A; 3WCV B; 2EB8 A; 1A9W A; 1Y09 A; 1EBC A; 5EE4 C; 2D60 B; 4ESA B; 3MKB A; 3UHH A; 1YEQ A; 3QM5 A; 3HHB A; 1K0Y A; 2SPL A; 2W6V B; 5CHQ A; 1RPS B; 2MHB B; 2GDM A; 1QSI B; 4HRR B; 3V2V A; 1YE2 B; 1Y8H A; 1OBM A; 2ZLX A; 3SZK A; 4N7P B; 2ZLV A; 2OIF A; 5CNF A; 3NL7 B; 1OUT B; 2DHB A; 1F5O A; 2R4W A; 1HDS A; 4ROL A; 3AQ9 A; 1G0A B; 1HBR A; 1EW6 A; 1V4U A; 3GOU B; 1LA6 A; 1IWH A; 3DUT B; 1HGB A; 3NFE A; 3UHB A; 1IT2 A; 1A4F A; 1Y0T B; 3O7N A; 3KUN A; 3OGB A; 3G53 A; 1YGD A; 3RJN B; 4ESA A; 3A5A A; 2O5L X; 2DC3 A; 1UC3 A; 2W6W A; 2AUP A; 1DKE B; 1Y8I B; 1Y4B B; 1MOC A; 1Y7Z B; 1XZ7 B; 2W6V A; 3BCQ A; 112M A; 2HZ2 A; 1TES A; 4YU4 A; 1CP0 A; 1RPS A; 4VHB A; 2MHB A; 3AT6 B; 2HBF B; 1QSI A; 4ROM B; 3WI8 A; 1OJ6 A; 4N7P A; 2FAM A; 3ED9 A; 3NL7 A; 1OUT A; 3WR1 A; 1LHS A; 5F0B A; 3UH7 A; 3WCW C; 1SHR B; 3G4W A; 5MBA A; 2GLN A; 3PI8 B; 1G0A A; 3CY5 A; 1OUU B; 3HF4 B; 2G0R A; 3GOU A; 3DUT A; 1MLH A; 1CH2 A; 2HBD B; 2LH2 A; 1NZ3 A; 2D5X A; 1MZ0 A; 3QJB B; 2KSC A; 2BKM A; 104M A; 1DKE A; 3PT7 B; 1Y7Z A; 5CNG A; 1XZ7 A; 1Y46 B; 1JW8 A; 1YE0 B; 2NRM A; 1Y0C B; 3D4X B; 4DC8 A; 3AT6 A; 1Y5F A; 1NQP B; 4ROM A; 2MYD A; 3S66 B; 5EUI B; 1NXF A; 1MWD A; 3SDH A; 1YCA A; 4O4T A; 1UVY A; 3UHV A; 1GJN A; 1NS9 B; 1BZ6 A; 4WJG A; 1JWN A; 2CMM A; 2V1E A; 3GQP B; 5CNB A; 1ECA A; 1UX8 A; 1MLL A; 3LR9 A; 4C44 A; 2O5S X; 1SHR A; 3PI8 A; 4SDH A; 2WTH A; 5CMV A; 1OUU A; 2DN1 B; 1YIH B; 4B4Y A; 1ABW B; 1MBO A; 2HBD A; 2ZT0 A; 2V1H A; 1YOG A; 1YHE B; 1JEB B; 3QJB A; 1J3Y B; 1RVW B; 4PQB A; 2RAO B; 3MYN A; 1JPB A; 3HRW A; 3P5Q B; 1V9Q A; 3AG0 A; 3GKV B; 3PT7 A; 1Y4R A; 1NWI A; 4H2L A; 1Y46 A; 1YMC A; 1O16 A; 2B7H B; 4MQJ B; 1Y0C A; 3D4X A; 3GK9 A; 2G14 A; 2MGI A; 1CQ2 A; 2C0K A; 101M A; 4F6B A; 3S66 A; 4MPM A; 1I3D A; 1CG5 B; 1BUW B; 1RTX A; 2H35 B; 1HBB B; 3UGZ A; 4WCH D; 2ZT2 A; 1A6K A; 2G11 A; 5KER B; 1NS9 A; 3GQP A; 1CMY A; 1S5Y B; 3G46 A; 1Y7C B; 1YHR B; 3KUO A; 3NG6 B; 2PGH B; 1QXE A; 1YMA A; 4X0L A; 1B86 A; 1HDB B; 1FHJ A; 4M4A B; 4NXA A; 3PI4 A; 1YFF B; 2DN1 A; 1S5X A; 1Y0D B; 1YIH A; 1LHT A; 2M6Z A; 1SPE A; 5HY8 B; 1LFQ B; 3PEL A; 3FH9 B; 1YHE A; 2ZT4 A; 3S1I A; 1J3Y A; 1RVW A; 3A0G B; 2RAO A; 1JL6 A; 3P5Q A; 4PNJ A; 1A3O A; 1PBX A; 2G0Z A; 3VRG B; 2O5T X; 2R80 A; 1M6M A; 2SPM A; 5MBN A; 1C7D B; 4U8U C; 2ZFO A; 3GDJ B; 1Y22 B; 5AZQ A; 3UHT A; 1BUW A; 2H35 A; 1V75 A; 1MNI A; 1NS6 B; 1KFR A; 1S5Y A; 1WMU A; 1YHR A; 3E5I A; 4KMW A; 5HBI A; 5ILR A; 1HDB A; 1IDR A; 1YFF A; 2D2M C; 1JL7 A; 3UHW A; 7HBI A; 5HY8 A; 1HBA B; 1X9F C; 3A0G A; 106M A; 2OHA A; 2GTL D; 1MYZ A; 1R1X A; 5M3S A; 4ZVB A; 2W72 C; 1HGA A; 1C7D A; 4GZG A; 102M A; 1GCV B; 5SW7 B; 5JGG B; 1O1I A; 3GDJ A; 3QM7 A; 1Y22 A; 6HBI A; 3ECX A; 3QMA A; 1BZ0 B; 4MQG B; 1BZZ B; 3HYU B; 4UZV A; 3GYS B; 1XYE B; 1NS6 A; 1YHU D; 2ZSX A; 2LH7 A; 3WFX A; 2LHB A; 4ILZ A; 5B85 A; 2G3H A; 1DTI A; 1Z8U B; 1WVP A; 3ZHW A; 1DWS A; 3LQD A; 3W4U B; 4F6J A; 1HBA A; 1XY0 B; 1BVC A; 4HBI A; 1VXA A; 4MBA A; 4KMV A; 1G08 B; 3ODQ A; 1MBA A; 2EB9 A; 5CN5 A; 1MLJ A; 1A6G A; 4AVE A; 3QQQ A; 1LJW B; 1MOH A; 2MYB A; 1Y2Z B; 3DHR B; 1GCV A; 1LTW A; 1MBC A; 2VYW A; 2MYC A; 1O1P A; 2G0V A; 1BZ0 A; 1YVQ B; 2MGK A; 1BZZ A; 3ECZ A; 1BIJ B; 3GYS A; 1NGK A; 1XYE A; 2YRS B; 1R1Y A; 1BBB B; 1M9P A; 3AT5 B; 1YGF B; 1FSL A; 2OHB A; 1LUE A; 1BAB B; 2ZS0 C; 1FAW A; 3LHB A; 1CO9 A; 1G9V B; 1AJ9 B; 1XZU A; 1LFT A; 4IRO A; 1GZX A; 1SDL A; 1Y7D B; 6HBW B; 1XY0 A; 2D2N C; 1LFZ A; 1GCW A; 1O1N B; 2MGD A; 2Z6S A; 1ABY B; 1G08 A; 3UHE A; 3UHS A; 1CH5 A; 1DXU B; 1URV A; 1J3Z A; 3D17 B; 3ZJP A; 1XZV A; 1Y2Z A; 3GQR B; 3DHR A; 4NK2 A; 1ECN A; 1Y4Q B; 1Y4P A; 1L2K A; 1I3E A; 2VEB A; 3UHU A; 1YVQ A; 2V1J A; 2VEE A; 3ZJM A; 2GKN A; 1BIJ A; 3HEO A; 2YRS A; 1MOA A; 1HBS B; 1DWR A; 1BBB A; 2ZS1 A; 3AT5 A; 1YGF A; 3WCT C; 4YU3 A; 2D2M D; 2ZLW B; 1Y35 B; 5EYS A; 1H97 A; 1BAB A; 1FSX B; 1O1M B; 1J3F A; 2ZLT A; 1AJ9 A; 3WCU B; 1XQ5 A; 3NML A; 2NRL A; 4FH7 A; 3IC2 B; 2QLS B; 3ZJO A; 5EU2 A; 3ZJL A; 1O1N A; 1DXT B; 4F6I A; 5KKK A; 1DXU A; 3E55 A; 1HAB B; 3OK5 A; 1YEV B; 3MBA A; 3UBC A; 1KR7 A; 1VXE A; 1DTM A; 1K1K A; 5HU6 B; 1NWN A; 2AA1 A; 4G1V A; 1U7R A; 2D6C A; 1HBS A; 1QSH B; 4MQH B; 1GDL A; 4FWX A; 3LR7 A; 2GTL B; 3BOM B; 4FC3 A; 1HGC B; 1Y35 A; 1FSX A; 1BZ1 A; 4LPI A; 1GBV B; 1MGN A; 1Q1F A; 1YEU B; 3WCU A; 1Y5K B; 1NZ5 A; 1YEN B; 3IC2 A; 1A6N A; 2QLS A; 2RI4 B; 1DXT A; 1UVX A; 1YHU B; 1SWM A; 2MGE A; 1Y0A B; 4N7N B; 3QM6 A; 1MYI A; 1YEV A; 1YOI A; 3U3E A; 2MGJ A; 4N7O B; 2O5B X; 3WCV A; 1MTI A; 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1G09 B; 110M A; 1V4X B; 5HLU A; 1J41 A; 3EU1 B; 3K8B B; 1CH7 A; 1OFK A; 4JAC A; 1RQA B; 1MOB A; 3QJC A; 1YE0 A; 3MJP B; 3E5O A; 4N8T A; 2W72 B; 1MLN A; 1A0U B; 1NQP A; 1UMO A; 2QMB B; 5EUI A; 2ZSY A; 103M A; 2EKU A; 1MWB A; 1UX9 A; 1NPG A; 3ONZ B; 5ILE A; 1VRE A; 2JHO A; 4XS0 B; 3UHG A; 1JDO A; 3LB1 A; 4F4O B; 5CND A; 1CO8 A; 2XKG A; 2NSR A; 2G0S A; 3G4Y A; 1ABW A; 1MYT A; 2BK9 A; 3ZJJ A; 1Y4V A; 1JEB A; 1G09 A; 1HJT A; 1V4X A; 3QZZ A; 3EU1 A; 3K8B A; 3WFT A; 2ZSO A; 3GKV A; 1RQA A; 3QJE B; 3K3U A; 2B7H A; 4MQJ A; 3UH3 A; 1RSE A; 2BLI A; 1FN3 B; 2BLH A; 2VYY A; 1CP5 A; 1Y5J B; 1LH1 A; 3ZOM A; 1QXD B; 1MCY A; 1CG5 A; 4JYQ A; 1GDJ A; 1HBB A; 3UHX A; 1MLK A; 5KER A; 3ONZ A; 4C0N A; 2ZLU B; 3IC0 B; 1G0B B; 3WCW D; 4XS0 A; 1Y7C A; 4KN3 A; 3NG6 A; 2PGH A; 3QQR A; 4F4O A; 2ZSN A; 1CG8 B; 1Y0W B; 4O1T A; 4M4A A; 2ZSZ A; 2LH1 A; 1NZ4 A; 1Y45 B; 1Y0D A; 1OFJ A; 1MLQ A; 4FH6 A; 1V5H A; 3K9Z A; 3G4U A; 5C6E B; 1LFQ A; 1NEJ B; 2V1K A; 2R50 A; 1JP9 A; 3FH9 A; 2FRK X; 3G4R A; 1VXC A; 1N9I A; 1Y8K B; 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