3EPTA

Structure of the rebeccamycin biosynthetic enzyme rebc with reduced flavin
Total Genus 156
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
156
sequence length
527
structure length
516
Chain Sequence
APIETDVLILGGGPVGMALALDLAHRQVGHLVVEQTDGTITHPRVGTIGPRSMELFRRWGVAKQIRTAGWPGDHPLDAAWVTRVGGHEVYRIPLGTADTRATPEHTPEPDAICPQHWLAPLLAEAVGERLRTRSRLDSFEQRDDHVRATITDLRTGATRAVHARYLVACDGASSPTRKALGIDAPPRHRTQVFRNILFRAPELRSLLGERAALFFFLMLSSSLRFPLRALDGRGLYRLTVGVDDTMDSFELVRRAVAFDTEIEVLSDSEWHLTHRVADSFSAGRVFLTGDAAHTLSPSGGFGMNTGIGSAADLGWKLAATLRGWAGPGLLATYEEERRPVAITSLEEANVNLRRTMDRELPPGLHDDGPRGERIRAAVAEKLERSGARREFDAPGIHFGHTYRSSIVCGEGGWRPSARPGARAPHAWLTPTTSTLDLFGRGFVLLSFGTTDGVEAVTRAFADRHVPLETVTCHAPEIHALYERAHVLVRPDGHVAWRGDHLPAELGGLVDKVRGAA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords RebC
publication title The FAD cofactor of RebC shifts to an IN conformation upon flavin reduction
pubmed doi rcsb
source organism Lechevalieria aerocolonigenes
total genus 156
structure length 516
sequence length 527
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-09-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01494 FAD_binding_3 FAD binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.9.50 Alpha Beta 2-Layer Sandwich D-Amino Acid Oxidase; Chain A, domain 2 D-Amino Acid Oxidase; Chain A, domain 2 3eptA02
3.40.30.120 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3eptA03
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 3eptA01
2E4GA 3ABVA 4LA1A 3DK8A 3O0HA 3M13A 4USRA 5U63A 4AP3A 2VOUA 3LADA 2BS2A 4IA6A 2XFUA 1EL5A 1B8SA 3UKFA 1IUTA 2CVJA 1Q1WA 4H2RA 4AOSA 1D4EA 3NK1X 3HZLA 2YVJA 2YLWA 5LV9A 2BCGG 1F3PA 2OLOA 4H4TA 1NHRA 4YTMA 2XFQA 4ZCDA 4K22A 4DNAA 2XVHA 3VRBA 3UKAA 3QJ4A 4FK1C 3NK2X 1B37A 4Y4MA 3NYEA 1M6IA 3UKQA 2APGA 4B65A 3FG2P 1GSNA 2AAQA 4GCMA 4O5UA 3QFBA 2YR4A 3EPTA 1JNRA 3RP7A 3OC4A 3VQRA 1EL9A 3AWIA 3DGZA 2WQYA 1HYUA 2XCGA 1GRTA 1PJ7A 2C66A 3DGHA 3ALLA 1ZDLA 3AE7A 1JOAA 2XVFA 1LQUA 2NPXA 4A65A 1QO8A 1H7XA 1H83A 4EQXA 4IVMB 3I3LA 1YQ4A 4RSLA 4ADWA 1GREA 1CC6A 2XVIA 1ZP0A 2IIDA 3CGBA 1GRAA 2Q0KA 4TM0A 4U8IA 4YXDA 3UTFA 2XLSA 3C4NA 1DOBA 4NEWA 1RP0A 4YSHA 4AP1A 3DJDA 1IUXA 4D03A 4MJWA 4DSHA 3S61A 3H8LA 3AYLA 1XDIA 4H4SA 3AEEA 3NYFA 3ALMA 1OJ9A 3BHFA 4H4VA 3AE2A 1Y56A 4YKFA 4OVIA 2VVMA 3GYIA 3SFDA 1CJ2A 4LIIA 1KFYA 1B5QA 1BZLA 1DNCA 3KU9A 4OCGA 1ONFA 4FK1A 3CNJA 3ZYXA 2B7SA 1GERA 1OJTA 3K7TA 4B64A 2X8HA 3S5WA 2WPCA 4NEVA 2YLZA 3QFAA 4TM1A 4EMWA 1CL0A 3CTYA 1IUUA 4K8DA 4H4RA 3DJJA 4D04A 2B9XA 2BC1A 2BABA 3FBSA 4JQ9A 2R0CA 5FS8A 4Z24A 5EBKA 1H81A 2XVEA 2TPRA 2YG6A 4NTEA 2BXSA 4A9WA 1KNRA 2X50A 1XPQA 1ZK7A 2EQ6A 4U2TA 1FECA 2V61A 4U8NA 2GF3A 4B63A 5L46A 2WP5A 4ICYA 2XLRA 3DA1A 2WESA 2WDQA 3AD7B 3RNMA 2JAEA 1YQ3A 4IVOB 4CCRA 4XWZA 1KSUA 4TM3A 4C3XA 5HYMA 4APNA 4PABA 3GYJA 4U8PA 1LV0A 3P1WA 3JSKA 1IUSA 1EBDA 2VVLA 3KVEA 2GMHA 2B9YA 2W0HA 4GF7A 3KD9A 4K7ZA 1GOSA 2YR5A 2WOIA 3SM8A 3UKHA 1TDKA 1H86A 1F6MA 1VQWA 2B7RA 1BF3A 4EMJA 4Z2UA 2AR8A 3FMWA 1B4VA 1E1MA 1PBEA 4J33A 3DH9A 1CBOA 3ICTA 1GT8A 1BGNA 2BS4A 3NTDA 3P9UA 3AE9A 3G5SA 2C64A 2FBWA 2YVGA 3H4KA 1H7WA 4OPGA 4Z43A 4GR1A 3KA7A 2JB1A 5EOWA 2EQ8A 3QSMA 1KNPA 3AYIA 2Z5YA 1GTHA 2BXRA 2YG4A 2IVDA 1ZX9A 3KLJA 4J31A 3NKSA 4OPDA 3P4RA 4A79A 2AQJA 4EQRA 3AE5A 3GWDA 1DXLA 2OLNA 2X99A 5IQ1A 1O95A 2H89A 3I6DA 2BC0A 3BI4A 2C75A 4HA6A 5BVAA 4KPRA 4H2QA 1H82A 1LQTA 4Z2RA 4FX9A 3UOVA 3UKLA 3AE8A 3IF9A 1QLBA 1D5TA 2O9ZA 2X8CA 1NAAA 4H7UA 2GVCA 1BKWA 4Z44A 3ALJA 1CHUA 2YLTA 4X4JA 3NGCX 4WCTA 5HHFA 3SFEA 3V3OA 2A87A 3ISHA 2QAEA 3RP6A 3QSSA 1FEBA 2WHDA 4B69A 4DSGA 1EL8A 2RGJA 3IWAA 1TDEA 3AE3A 2R45A 3WE0A 4ECHA 3K30A 2XDOA 3CPIG 1VG9A 1MO9A 5KRQA 4XWRA 1IUWA 3AYJA 4GRTA 2FJBA 3AEFA 3UKKA 3CGDA 3E1TA 4EQWA 5BRTA 4J2WA 1D7YA 4X9NA 3CNTA 3CNSA 1TYTA 3Q6JA 2DKHA 1K4QA 4YSYA 4A99A 4U8OA 2C3CA 2BK5A 3BNUA 4OPCA 3UTEA 3NHOX 1P2EA 1K0JA 1F8WA 2B9WA 5CKUA 2Y6QA 5EB4A 4BV6A 2BK3A 5BULA 3NYCA 1NG3A 5JCIA 4B1BA 3COXA 1OJAA 3AE1A 4EIQA 4GDEA 3CNDA 5JCKA 3AD8B 1H84A 1ZOVA 2QA2A 4H4ZA 1S3EA 4DGKA 2CULA 1PDHA 1O5WA 3QSEA 1NDAA 2YM1A 2GAGB 4UDQA 2GAHB 3F8DA 4EIPA 2R9ZA 3VRAA 4TM4A 4RG3A 4UP3A 3IHMA 1RSGA 4EM4A 1PJ6A 2ACZA 4J57A 3BHKA 1JEHA 3AE4A 4C5OA 1GEUA 1JNZA 1JRZA 1TDOA 1REOA 3FIMB 2XFNA 3BI2A 2YQUA 3AD9B 4KX6A 2XLPA 4IA5A 4Z2TA 4BJYA 5ER0A 1GTEA 3GRTA 3D8XA 4YSXA 4AT0A 1GESA 1CJCA 3GDPA 3NN0X 3AEAA 4YWOA 4A7AA 4EMIA 1FEAA 1D7LA 3GMCA 1O94A 4AOXA 5KWFA 2X3NA 4U2SA 3AE6A 3LZWA 2C76A 4K5SA 2E5VA 2ZBWA 4YT0A 1ZKQA 3ZDNA 1E1LA 1H6VA 2WP6A 3PS9A 3UTGA 4UDPA 1YY5A 2JB3A 3DK4A 4A5LA 1ZMDA 2WP9A 3EAOA 2C70A 1F8RA 1ZY8A 2GQWA 3EF6A 1QJDA 2HQMA 2Q0LA 4M52A 5EB5A 1S2YA 2JKCA 5FS9A 3SQPA 2VQBA 1N1PA 1NHPA 2BYBA 3M12A 4H50A 1N4UA 4J34A 4TLZA 3CN8A 1JU2A 1JRXA 4XXGA 1DJNA 5U1OA 1XHCA 2WPEA 5GRTA 3F8PA 4BK2A 1Y0PA 2GQFA 2WDRA 3QVPA 4H2PA 3VR8A 1TDFA 1W4XA 3M0OA 1OJCA 2WBAA 1E1NA 2WEUA 1V59A 1MOKA 2XVJA 2C65A 3AEBA 3G5QA 3IHGA 1PHHA 2FJDA 1GRFA 4NZHA 4U8KA 1E1KA 1VDCA 1PXBA 3VR9A 1IJHA 1X31B 4HB9A 3CPJG 4H4XA 1BGJA 3OZ2A 4I58A 4JN9A 3R9UA 1M64A 1OJDA 4ZN0A 4NTDA 2WETA 2GB0A 3FPZA 2B76A 2XFOA 2YG7A 3II4A 4YKGA 2WU5A 3B6DA 1PN0A 5J7XA 2BACA 3ITJA 2EQ7A 4CCQA 5HY5A 1COYA 1PXCA 3UOYA 4A6NB 5JCNA 4AT2A 2BA9A 2PYXA 2E1MA 3NG7X 1GPEA 3B3RA 2R46A 5KOWA 1FCDA 2Q6UA 2C72A 4USQA 1GRGA 2CDUA 1NENA 4CRTA 2WU2A 4OPIA 4JY3A 1XANA 3V76A 2J3NA 2NVKX 3P4PA 2C67A 3LOVA 1IUVA 1E6EA 1F8SA 3C4AA 4GDPA 1NHSA 2YLRA 1PJ5A 3UOXA 4WX1A 3UOZA 1CJ3A 3QVRA 1JRYA 2YAUA 2OAMA 1NPXA 4OPLA 2ZZBA 1GV4A 4H4QA 3ICRA 5FS7A 1PXAA 3AEGA 2A8XA 3UCLA 1N4WA 4EM3A 2H88A 1PBFA 2YM2A 1ZOYA 2WPFA 2GRTA 4LU6A 4U8JA 1NG4A 2QA1A 2GR1A 2RGHA 4I59A 1NHQA 1EL7A 5KOXA 2Z5XA 1S3BA 2X8GA 3K7MX 5JCLA 4FDCB 3K7QX 4P9SA 2YLSA 4H2NA 1VRQB 3CPHG 3PO7A 2I0ZA 3P4SA 4H4YA 1P2HA 2BCPA 3T37A 1L0VA 3LJPA 4U8MA 2RGOA 2WDVA 3C96A 1GETA 5BUKA 4TLXA 2XLTA 3UKPA 4X9MA 3DJEA 4JNQA 5IPYA 5C3JA 3GD4A 3P4QA 1PBDA 1ZMCA 2ARDA 5DBJA 4BK3A 3NT6A 2VVLG 2IVEA 1PBCA 3BNMA 4H4PA 4J36A 4Y4LA 4C3YA 1DJQA 2R0PA 4JDRA 3CGCA 4Z25A 1K0LA 4BJZA 2XFPA 1CJ4A 5C2TA 3UP4A 1KSSA 2ZZCA 4JY2A 1L9DA 2OALA 3Q9TA 3KPFA 5JCMA 2XLUA 1PBBA 1AOGA 1GRHA 1BWCA 5FMHA 1DODA 2QCUA 4A6NA 4REKA 5GSNA 1GNDA 4K5RA 2VQ7A 2A89A 2ZZ0A 1CC4A 4B66A 2UZZA 3KKJA 4H4WA 2V6OA 3AECA 4GUVA 2GMJA 3ATQA 5KVHA 2FJEA 3D1CA 1E7PA 2V60A 3LXDA 4CNKA 3NH3X 1LTXR 5J60A 1FOHA 4CNJA 2R4JA 2GR3A 2JK6A 4CY6A 2WS3A 3NLCA 3NRNA 1GXFA 4RG4A 4C77A 5CQFA 2DKIA 2JB2A 1YKJA 3ADAB 3GRSA 2GR0A 3GSIA 5IQ4A 2F5ZA 3IC9A 2R4EA 1VG0A 1TYPA 2JBVA 1CC2A 1GRBA 2CFYA 3GDNA 3NTAA 1TRBA 4U8LA 5KVIA 1YQZA 2BS3A 2GH5A 2V3AA 3F8RA 4N9XA 4NTCA 1GALA 1CF3A 1PS9A 4UDRA 4YTNA 1SEZA 1Q9IA 3GD3A 4PAAA 2PHHA 3L1RA 1D4DA 3H8IA 4B67A 2BK4A 1S2QA 2YG5A 3CNPA 4IV9A 4BURA 2RABA 2GR2A 3ICSA 3REDA 1MXTA 4J56A 5HXIA 4C74A 2Q7VA 1NEKA 2YVFA 3DJGX 4OPTA 3AXBA 1D4CA 5TR3A 5M10A 4ZCCA 2R0GA 3ATRA 3EANA 2V5ZA 2FJAA 5M0ZA 2VZ2A 2YWLA 2GEWA 4H4UA 1N4VA 3AEDA 3NNEA 3DK9A 2EQ9A 4O5QA 1TDNA 4JNAA 3G5RA 3RHAA 3L8KA 1KDGA 4BK1A 1L9EA 4Z26A 1DOCA 1LPFA 1Z6LA 4K2XA 1Q1RA 2V3BA 4EQSA 5KXJA 4B68A 1UKVG 3CGEA 1RYIA 3NN6X 2Y6RA 3SGLA 4YTPA 1DOEA 3CIRA 3GMBA 1KF6A 3NK0X 2VRLA 2YG3A 3LZXA 4OPUA 5U25A 3UTHA 3URHA 4U2LA 4CBQA 3AB1A 2YLXA 3V3NA 4E0VA 2WOWA 2GV8A 2OA1A 1Y56B 3RP8A 2C3DA 2XYOA 1K0IA 3GWFA 3LB8A 4YSZA 1LVLA 2C7GA 3UP5A 1L9CA 2VRMA 3PVCA 2YR6A 1E39A 1LJ1A 1FL2A 2TMDA 3NIXA 2WOVA 5FS6A 3BI5A 3VRDB 4Y4NA 2C73A 3DMEA 4CY8A 1ELIA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5FT3A 2KOKA 3VPTA 3O0HA 4AP3A 4IA6A 1BX9A 3LADA 4L8EA 1Q1WA 4H2RA 2B5YA 2OE1A 5LV9A 4GLTA 4H4TA 2L4CA 3D5JA 4N0VA 4YTMA 2XFQA 4KA0A 4K22A 4ZCDA 5IMAA 3L0HA 3QJ4A 2FD3A 4NWZA 3BBYA 3O76A 3GFKA 3UKQA 4KUNA 1F37A 3FG2P 3F4RA 5CRWA 2VM2A 2CV4A 3M1GA 4O5UA 4WBJA 7GSSA 1KEBA 1X5EA 3IHQA 1JNRA 3I9V2 3OC4A 4BVYA 1OE7A 4ML1A 2GSRA 3HCZA 4L5LA 1A2JA 1PJ7A 2C66A 1ZDLA 4USSA 4A65A 4QL9A 1QO8A 4L0WA 4LMWA 4ULXA 1H83A 1GTUA 3I3LA 3IE3A 5COHA 5DAKA 3GYKA 5KN3A 1ZP0A 4OWYA 4U8IA 1IYHA 1O8XA 3GKXA 1LJRA 5IPHA 2DIYA 4AP1A 4MJWA 4DSHA 22GSA 4KDXA 4MCUA 3AEEA 3NYFA 2CX3A 4K0GA 4KX4A 4IJIA 3CBUA 1Y56A 3SFDA 5DJMA 4YQUA 1KIFA 1CJ2A 3TJJA 2H1BA 1B5QA 1BZLA 4OCGA 4IKHA 3CNJA 4X1UA 1U88A 5GSTA 3T2YA 2N5BA 4MP4A 2X8HA 2WPCA 4ZB6A 5ECRB 2OBKA 3QFAA 1GSDA 1CL0A 5DQYA 4TW5A 3M9JA 4D04A 2BC1A 4KSOA 4RQXA 4EUYA 1WRYA 4NTEA 2YG6A 2BXSA 5FHIA 1Z6MA 1ZK7A 4U2TA 4U8NA 3EE2A 3EMPA 2GF3A 1ERVA 2WP5A 5G1LA 2MMNA 2WESA 3RNMA 3GSSA 3A3TA 1F9MA 4CCRA 2DJ0A 2ALBA 2I81A 1DDOA 4U8PA 2WZ9A 3JSKA 2V1MA 2N5AA 2VVLA 3KVEA 2W0HA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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