3EPTA

Structure of the rebeccamycin biosynthetic enzyme rebc with reduced flavin
Total Genus 156
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
156
sequence length
527
structure length
516
Chain Sequence
b'APIETDVLILGGGPVGMALALDLAHRQVGHLVVEQTDGTITHPRVGTIGPRSMELFRRWGVAKQIRTAGWPGDHPLDAAWVTRVGGHEVYRIPLGTADTRATPEHTPEPDAICPQHWLAPLLAEAVGERLRTRSRLDSFEQRDDHVRATITDLRTGATRAVHARYLVACDGASSPTRKALGIDAPPRHRTQVFRNILFRAPELRSLLGERAALFFFLMLSSSLRFPLRALDGRGLYRLTVGVDDTMDSFELVRRAVAFDTEIEVLSDSEWHLTHRVADSFSAGRVFLTGDAAHTLSPSGGFGMNTGIGSAADLGWKLAATLRGWAGPGLLATYEEERRPVAITSLEEANVNLRRTMDRELPPGLHDDGPRGERIRAAVAEKLERSGARREFDAPGIHFGHTYRSSIVCGEGGWRPSARPGARAPHAWLTPTTSTLDLFGRGFVLLSFGTTDGVEAVTRAFADRHVPLETVTCHAPEIHALYERAHVLVRPDGHVAWRGDHLPAELGGLVDKVRGAA'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule keywords RebC
publication title The FAD cofactor of RebC shifts to an IN conformation upon flavin reduction
pubmed doi rcsb
source organism Lechevalieria aerocolonigenes
molecule tags Oxidoreductase
total genus 156
structure length 516
sequence length 527
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-09-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01494 FAD_binding_3 FAD binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.9.50 Alpha Beta 2-Layer Sandwich D-Amino Acid Oxidase; Chain A, domain 2 D-Amino Acid Oxidase; Chain A, domain 2 3eptA02
3.40.30.120 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3eptA03
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 3eptA01
2ZBWA 2X8GA 3AE8A 5U63A 2ZZBA 2JB3A 1CL0A 1KFYA 1JRXA 4A5LA 4ZCCA 1Y56B 3UKPA 5KRQA 2B9XA 2YG7A 1BZLA 3CPIG 4OPTA 3CGDA 3NLCA 2YLSA 2BXSA 1Y0PA 3RNMA 3LXDA 3UCLA 1B8SA 2XFPA 3AE5A 3GD4A 2YLRA 1MOKA 3RP7A 2IIDA 3FG2P 2BYBA 4BK3A 3UOYA 1PBEA 2GR2A 5FMHA 5ER0A 1B37A 1FOHA 3UKQA 3UOZA 2AQJA 5JCLA 2XVEA 4EM4A 3F8DA 4OPDA 4YTPA 1OJTA 3K30A 3O0HA 4O5UA 4U8OA 5CKUA 1CJ2A 3DGZA 1YQ4A 2GEWA 4REKA 4Y4NA 2QA1A 2BK3A 3P4RA 4JQ9A 3RHAA 4H4UA 3LB8A 2Q0KA 3QFBA 4A6NA 1L0VA 4GRTA 4P9SA 3H8LA 1FEBA 2BACA 2GB0A 2XCGA 4YWOA 3AYJA 5U25A 3KU9A 1NPXA 3QFAA 1ONFA 4GF7A 3I6DA 4H4QA 2R0GA 1VDCA 5EB5A 1CC2A 2WP6A 3AB1A 3COXA 3AYIA 3G5SA 1E1NA 3FIMB 1E1MA 2RGJA 3BHFA 2YM1A 2PHHA 4TLXA 2H88A 4BJZA 4H2NA 2YG6A 1IUUA 3II4A 1BGJA 2JBVA 2OAMA 1NHQA 3I3LA 1GXFA 3FMWA 1KSUA 3GSIA 1PBFA 2BS3A 3UKAA 4J56A 4AT2A 1H7XA 4U8IA 3AD7B 3K7MX 1REOA 1K4QA 1MO9A 3GYJA 3CPHG 4WCTA 4B68A 4H4SA 2GMJA 4FK1A 2X8HA 2EQ6A 5KWFA 1EL9A 1TDNA 2WS3A 3EF6A 2R0PA 1H82A 4U8PA 2Z5YA 1YKJA 3VR9A 2B9WA 3AYLA 1KNPA 3KKJA 4U2SA 4U8NA 5FS6A 3BI4A 1GV4A 1D4DA 2GAHB 2JB2A 5U1OA 4KX6A 1GESA 2OLNA 2C3CA 1O5WA 1GRFA 3SQPA 2XLTA 4AOXA 2QA2A 4H4YA 1PHHA 2VVLG 3CGEA 3DK8A 4USQA 1H86A 3KD9A 2R4EA 1HYUA 2YLXA 2EQ9A 4H7UA 5JCIA 3QSSA 2FBWA 1PDHA 3DMEA 2V6OA 4O5QA 5J7XA 3NYCA 1TDOA 3GYIA 1GERA 3NG7X 4DNAA 3NNEA 4K5SA 1X31B 3M0OA 1AOGA 1N4WA 2GV8A 3CPJG 1YQ3A 2BC1A 3NGCX 2ARDA 4ZN0A 3EPTA 1TDFA 1KDGA 1OJDA 2WDRA 4EQRA 5JCNA 3DK4A 1D7YA 1O94A 3H8IA 4X4JA 5M0ZA 2WESA 4K8DA 2DKIA 4MJWA 1NDAA 4YSXA 2OA1A 1M64A 4EQSA 1GTEA 1CC6A 1PXAA 2VQ7A 1XDIA 4IA6A 2GH5A 2DKHA 2C75A 3AE9A 3NIXA 4H2RA 1UKVG 2BABA 2XVHA 4Z43A 1IJHA 1TYTA 1ZOYA 1NEKA 4X9MA 4BJYA 2E1MA 1B5QA 2E5VA 4UDQA 1PBCA 1XPQA 3NN0X 2JB1A 2C65A 4J36A 5KXJA 4Y4MA 2C64A 3NKSA 3VRBA 4RG4A 3UKKA 2QAEA 2WU2A 3GDPA 4Z44A 3C96A 2ZZCA 4B1BA 4Z2TA 1Y56A 1K0LA 3P9UA 3NK2X 1F6MA 3BHKA 3B3RA 1H6VA 4Z26A 1JU2A 4BV6A 2VOUA 1KSSA 1GNDA 2R0CA 5GSNA 2OALA 2YAUA 2YG3A 4YKFA 2BA9A 1GRBA 4OPIA 5FS8A 1LTXR 3UTHA 3EAOA 2YLTA 2YR6A 2Q6UA 3LADA 2TPRA 3Q6JA 3V76A 4A65A 1RP0A 3D8XA 4C3YA 4ICYA 4B65A 1GPEA 4NEWA 1CJ3A 2YG5A 2RGHA 3S5WA 3NT6A 3SFDA 4YXDA 2WHDA 3ADAB 2C66A 2XDOA 1GRGA 2V3AA 2AR8A 2YR4A 2WU5A 3C4AA 5L46A 1H81A 4DSGA 2Z5XA 1CHUA 4A79A 4YKGA 5KOXA 4LU6A 2EQ7A 5KVHA 1E6EA 1VG0A 3SM8A 4H4RA 4TM3A 5C2TA 2V60A 3GWDA 2X3NA 4J33A 4B63A 1PBDA 4GCMA 1GRTA 4UDPA 1RYIA 4K22A 4EIQA 2VRLA 4J2WA 4NTCA 1FECA 2YG4A 2YLWA 2W0HA 3AEBA 3Q9TA 4TM4A 3G5QA 3VQRA 1LQTA 1E1LA 2RGOA 4C5OA 5IPYA 4NTDA 1JOAA 3VR8A 2CFYA 4RG3A 4CCRA 3AE7A 3CNPA 3V3OA 2OLOA 3CNJA 3DJDA 4YTMA 4NZHA 2WQYA 4B69A 4Z2UA 3WE0A 3QSEA 4D03A 1LQUA 1XANA 3ATRA 1IUWA 4U8LA 3P4PA 2WEUA 2HQMA 4GR1A 3VRAA 5HXIA 4H4XA 4FDCB 4C77A 5JCMA 2Y6QA 3DJEA 4H4WA 4U8KA 2YM2A 4ADWA 3AEAA 1D4EA 4TM0A 1E39A 2ACZA 1IUVA 5BRTA 2WPEA 2A8XA 3GMCA 2XYOA 4J34A 2YLZA 1DOEA 4AP1A 2C7GA 4OPGA 5IQ1A 3AEEA 4BURA 3P4QA 2CDUA 1E1KA 2WOWA 4OPUA 3CIRA 1S2QA 3L8KA 4CY6A 4GDPA 1B4VA 1YQZA 2PYXA 3D1CA 5FS7A 4U8JA 5HY5A 4JY3A 2R46A 2YVGA 4CRTA 3GWFA 3NYEA 4WX1A 2WOVA 1OJ9A 1LV0A 1JRZA 1NHRA 2BXRA 1H83A 2B76A 2O9ZA 3CNDA 2GF3A 3NTAA 1L9EA 2B7SA 4FK1C 4Y4LA 3AXBA 2AAQA 2Y6RA 1LJ1A 2GR1A 3P1WA 4YT0A 1GEUA 1QO8A 2EQ8A 4RSLA 1FCDA 3PO7A 1S3BA 3DGHA 2FJAA 2XFOA 4JN9A 3SGLA 5BUKA 5BVAA 4Z24A 5KOWA 3NTDA 5JCKA 4JY2A 1BWCA 2B9YA 4LIIA 1H7WA 4OCGA 1PS9A 1JNZA 4H2PA 2WBAA 4X9NA 1GRHA 3KVEA 1Z6LA 3AE4A 3V3NA 4PAAA 2BS4A 1MXTA 2IVEA 1GSNA 2XFQA 3ICRA 3BI2A 3CNTA 4XWRA 3KLJA 1GRAA 2WDQA 4USRA 1L9DA 3AE1A 4H4ZA 4CNKA 3DH9A 1BGNA 3AECA 4PABA 2XLRA 2Q7VA 3SFEA 4CBQA 4TLZA 3M13A 1CBOA 3BI5A 1F8WA 4UDRA 3IHGA 1P2HA 2F5ZA 2GVCA 4IV9A 3UP4A 1OJCA 1TDEA 1CJ4A 2C73A 4A99A 2GAGB 2J3NA 1TRBA 1VRQB 4J31A 2WETA 3AEFA 1KNRA 2GMHA 3FPZA 4JNQA 1NAAA 3ICTA 1LPFA 3UTGA 1COYA 1PJ5A 2QCUA 4B67A 2XLUA 2B7RA 2CVJA 3ALMA 4CNJA 1NENA 2FJDA 3ABVA 3URHA 4NEVA 1SEZA 3S61A 4OVIA 1QLBA 3AE3A 3GDNA 1ZOVA 1BF3A 1GETA 4BK2A 3UOXA 4UP3A 3DA1A 4H2QA 3NRNA 2NPXA 3AEDA 1D7LA 1ZKQA 4GDEA 1DODA 1PXCA 2GR0A 4JDRA 3CTYA 3CGCA 3IC9A 5KVIA 1VG9A 4DGKA 3E1TA 3EANA 1DNCA 3NN6X 4OPCA 4IVOB 4AP3A 2FJEA 4LA1A 1DXLA 2YR5A 1NHPA 2I0ZA 2XLPA 3F8RA 3R9UA 4CCQA 2WOIA 3CNSA 4OPLA 1OJAA 3UTFA 2YWLA 2RABA 3DK9A 3M12A 2UZZA 2APGA 4I58A 2X50A 1F8RA 4FX9A 1F8SA 1L9CA 1DJNA 4IVMB 5FS9A 4A9WA 4YSZA 2WPFA 2WP9A 1H84A 4HB9A 1F3PA 5TR3A 1S3EA 1P2EA 1N4UA 1PJ6A 3GRSA 1EL8A 2R9ZA 1ZMDA 1GOSA 1JEHA 3L1RA 3NK0X 2JKCA 3OZ2A 4H4VA 3UKFA 5HYMA 4C74A 4Z2RA 3DJJA 4EMJA 3UTEA 3JSKA 4EIPA 5DBJA 4XWZA 5GRTA 2BCPA 3HZLA 3C4NA 3ISHA 1PN0A 3AD9B 2XVFA 2YQUA 1KF6A 3AEGA 3IHMA 2YVJA 1D5TA 5HHFA 1ZK7A 2Q0LA 1EL7A 1PBBA 1O95A 2V61A 4GUVA 4K5RA 2WDVA 2R45A 2R4JA 3GD3A 1IUXA 1JNRA 3PVCA 3BNUA 3ALJA 4EM3A 3AE6A 4YTNA 2CULA 4KPRA 4Z25A 1TDKA 4B66A 1YY5A 1NG3A 2C76A 3F8PA 1K0IA 2WPCA 3DJGX 1D4CA 2V5ZA 2GRTA 4H4TA 3NK1X 4D04A 4A6NB 1DOCA 4A7AA 3LOVA 3KA7A 4K2XA 1CJCA 2VRMA 5CQFA 4N9XA 1ZY8A 2XFUA 2C72A 1GREA 3ALLA 2VZ2A 5M10A 1NHSA 1M6IA 5EBKA 1DOBA 1ZMCA 3KPFA 2XVIA 2GR3A 2X99A 2GQWA 3BNMA 3AE2A 2XFNA 3UP5A 3AD8B 3IWAA 3UOVA 3H4KA 4BK1A 2V3BA 3K7TA 1IUTA 3LZWA 2BCGG 4IA5A 4J57A 1K0JA 3P4SA 1RSGA 4HA6A 1ZDLA 4H50A 1CF3A 2VVLA 3ZDNA 2YVFA 3UKLA 1GT8A 2BK4A 2E4GA 2TMDA 4U2TA 5J60A 4AT0A 5IQ4A 3AWIA 1PJ7A 5EB4A 1QJDA 1NG4A 1FL2A 5LV9A 2GQFA 4CY8A 3G5RA 4XXGA 2C67A 1N4VA 1FEAA 4YSYA 3ITJA 1N1PA 4APNA 3NYFA 3FBSA 2JAEA 3NH3X 3QVRA 1Q9IA 4M52A 1ELIA 1S2YA 2ZZ0A 4EQWA 3ZYXA 3VRDB 2JK6A 2BK5A 1JRYA 2A87A 3T37A 2A89A 3B6DA 4YSHA 4ECHA 4U8MA 2VQBA 1Q1RA 3K7QX 3GRTA 5BULA 3UKHA 4EMIA 1IUSA 2FJBA 1BKWA 4JNAA 1GTHA 3RP6A 4AOSA 1CC4A 1VQWA 1V59A 2BS2A 3NHOX 4EQXA 4TM1A 3CGBA 1TYPA 3QVPA 3LZXA 4NTEA 5EOWA 2H89A 1XHCA 3OC4A 2C3DA 2X8CA 4H4PA 1EL5A 3GMBA 3RP8A 1W4XA 1PXBA 4C3XA 1Q1WA 3IF9A 4U2LA 4DSHA 4EMWA 4B64A 4ZCDA 2NVKX 2IVDA 3CN8A 2C70A 1LVLA 4K7ZA 1ZP0A 2VVMA 3REDA 3LJPA 1E7PA 4I59A 4E0VA 1GALA 3QSMA 3QJ4A 2XLSA 1DJQA 1ZX9A 2XVJA 3PS9A 2WP5A 3ICSA 5C3JA 1EBDA 3ATQA 2BC0A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1B48A 2JSYA 2X8GA 3RHCA 2NBSA 3AE8A 2JB3A 2IFQB 3TJBA 3UKPA 5KRQA 3KTBA 2L6CA 2YG7A 4XS4A 1BZLA 2BXSA 3RNMA 3LXDA 3UCLA 1FAAA 2DC5A 1EZKA 4HS1A 2YLRA 2B7KA 3FG2P 2CVKA 4XS4B 1RK4A 2BYBA 3RBTA 5FMHA 2VCZA 2RLIA 1FOHA 3UKQA 1I5GA 2AQJA 4EM4A 4YTPA 3K30A 4O5UA 1KEBA 1PN9A 1DE2A 1SKSB 4X43A 1ZYQB 2BK3A 3MDKA 4II3A 3QFBA 1PSQA 2IL3A 4I2TA 2HE3A 3H8LA 2IMFA 4LL1B 1R7HA 4YWOA 1BX9A 3A5IA 5U25A 4HEA2 1NPXA 2I9HA 3I6DA 4H4QA 4PX1A 5EB5A 1CC2A 1C72A 3COXA 3G5SA 1E1NA 2RGJA 3BHFA 2DMMA 2N5FA 2PHHA 2O7KA 4TLXA 2PUKC 2C1YA 1IUUA 2OAMA 22GSA 1GXFA 3GSIA 1MD4A 2FA4A 4WR4A 3UKAA 2JACA 2I81A 4U8IA 1G7EA 3SZ0A 5B6NA 3APQA 3CPHG 4B68A 2DLXA 1OVNA 5DAKA 2Z5YA 3KKJA 4N0VA 1HNBA 4U2SA 3BI4A 4KX6A 5DAKB 2IN3A 2CZ3A 1O5WA 1GRFA 5HR2A 2XLTA 2CAIA 2QA2A 3FZ4A 4H4YA 3DK8A 3KD9A 2LS5A 3ZLPA 2ZCTA 4YAPA 1A8LA 2CX3A 5G1LA 3TKSC 3D4MA 5J7XA 2GSSA 4EE0A 3NYCA 2J23A 1TDOA 3GYIA 2BMXA 2VCQA 4DNAA 3NNEA 4K5SA 1AOGA 2H71A 2GV8A 4TOPA 3EPTA 3TGZA 1SJIA 1SK2A 1XWBA 4EDZA 2B1LA 5JCNA 4IVFA 2WESA 4K8DA 2DKIA 3G7IA 2YNXA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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