3F5XA

Cdk-2-cyclin complex with indazole inhibitor 9 bound at its active site
Total Genus 84
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
84
sequence length
298
structure length
297
Chain Sequence
MENFQKVEKIGEGTYGVVYKARNKLTGEVVALKKIRLDTETEGVPSTAIREISLLKELNHPNIVKLLDVIHTENKLYLVFEFLHQDLKKFMDASALTGIPLPLIKSYLFQLLQGLAFCHSHRVLHRDLKPQNLLINTEGAIKLADFGLARAFGVPVRTYTHEVVTLWYRAPEILLGCKYYSTAVDIWSLGCIFAEMVTRRALFPGDSEIDQLFRIFRTLGTPDEVVWPGVTSMPDYKPSFPKWARQDFSKVVPPLDEDGRSLLSQMLHYDPKRISAKAALAHPFFQDVTKPVPHLRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transferase/cell cycle
molecule keywords Cell division protein kinase 2
publication title 2-(6-Phenyl-1H-indazol-3-yl)-1H-benzo[d]imidazoles: Design and synthesis of a potent and isoform selective PKC-zeta inhibitor.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 84
structure length 297
sequence length 298
chains with identical sequence C
ec nomenclature ec 2.7.11.22: Cyclin-dependent kinase.
pdb deposition date 2008-11-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3f5xA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3f5xA01
4BDAA 5HICA 4IC8A 1UNHA 2WMUA 4K33A 3CCNA 3U9CA 4IJ9A 4X0MA 1KE7A 2Y9QA 2YM8A 3GU6A 5CYIA 5JZNA 5I9UA 4YC6A 1WBOA 4CD0A 5HD7A 4KS8A 3FXWA 4FKIA 2JD5A 4BL1A 3MY5A 4JDIA 4BDKA 2P2HA 3BU6A 5E8TA 3VS5A 3KK8A 3Q5ZA 4QO9A 4ACCA 2YM7A 2QQ7A 3R8MA 3UG2A 4NIFB 4GIHA 2CSNA 3L9LA 3II5A 4GCJA 3ET7A 3RK5A 1YXSA 4RIXB 1JLUE 2KTYA 4J53A 1BX6A 4FT9A 3LMGA 3D4QA 3UODA 3U87A 3SC1A 4MBJA 2G2FA 4KSQA 4ZY4A 3QA8A 2AC3A 4LL0A 3ACKA 4GUBA 4P4CA 2BAJA 3KA0A 5J95A 3PTGA 4FNZA 4F6WA 5HLWA 3CGFA 1O6YA 3CGOA 3EN5A 3UPZA 4TWCA 4LRMA 4RWKA 2PVLA 2XKDA 3MH1A 3O7LB 2JBOA 2B9HA 2EB2A 3CR0A 4GSBA 5AUVA 4V0GA 4DBXA 1LEWA 4FUYA 3CQUA 4G3GA 5CALA 3VN9A 3ZFMA 3C50A 3DXNA 4RIWB 2GS2A 1JSVA 1WBPA 3NLBA 4TPTA 3R7OA 2XP2A 3AC5A 4TWOA 4KD1A 4FGRA 1JPAA 3IOKA 4CYIA 4PTCA 5EW8A 1WVXA 4IM0A 4K77A 4ANLA 3ANQA 2GFSA 4NEUA 4YP8A 3GNIB 5EQEA 1UKHA 1KOBA 4FV4A 4JAIA 3NUAA 3G0EA 1VYZA 4CV8A 2WQNA 4FG8A 3A7JA 5DE2A 2WTCA 2ACXA 3Q53A 4RBLA 3EMGA 3Q4UA 2A0CX 5AMNA 3UC4A 4R5SA 3ZCLA 3EQFA 4EK6A 5BPYA 5IUHA 4M3QA 1Y6AA 3R73A 5EQPA 2XF0A 4DG0E 3OTUA 3SDJA 5D41A 4LRKA 2QURA 4FKSA 4OAUC 4A4OA 5JQ5A 4EK3A 4DGLC 4EBWA 1P5EA 5CF8A 5E8WA 4AW1A 2W05A 4HCTA 3PJCA 3FYJX 3UE4A 4F7LA 1Q3DA 3LFBA 5HVJA 4K0YA 3QD0A 4QNAA 4E4XA 5EKNA 4FKQA 2H6DA 5KX8A 5AP0A 4O86A 2R3PA 2RSVA 2PTKA 4LG4A 1GIJA 1H28A 4EHVA 5CSPA 4HVGA 3GEQA 3VUMA 2IZSA 4LUEA 4K8AA 3AG9A 3OBJA 4QMTA 2CKOA 4F6SA 3ORZA 4I6BA 4PL5A 4FA2A 1QPCA 4QP3A 3LFCA 3ZH8A 3R7GA 3AD6A 5BUEA 3UPXA 3H4JA 3QQHA 2HZ0A 1JVPP 3PIXA 4HGTA 5L2TA 2C0IA 4H58A 4ANNA 3LMIA 4IAZA 4R1YA 2WOTA 1ZMUA 3W2CA 1GZNA 4I0SA 4MD9E 4AF3A 1OECA 2BZHB 4FIGA 3BWJA 3LOKA 4TT7A 2ITPA 4O0UA 1PHKA 3F3UA 3R1YA 1XH5A 4FSZA 4PPBA 4QMWA 3WZUA 4IEBA 2BUJA 5DT4A 1XH4A 3NR9A 5FTQA 3ATTA 4O83A 3SKCA 4D4RA 3PDTA 2IWIA 1NVSA 1PXIA 2PHKA 3EN9A 3I7CA 3ENMA 4S30A 4P2KA 4BI1A 5IMXA 4EOOA 1LUFA 1S9JA 3FMLA 2F2CB 4WNMA 4TYGA 4DFZE 4BTFA 3WF7A 3CE3A 1V0OA 3V5PA 2A27A 4C4EA 4XYFA 2QO2A 1P4OA 3KN5A 3VF9A 1JSUA 4U42A 4BC6A 3F6XA 2O2UA 3CPBA 3EQIA 4FIFA 4GIIA 4LV8A 3DFAA 4H3QA 2VO0A 5FM3A 4A7CA 2PZRA 5FTGA 4CRSA 4UMQA 1KE5A 4WOVA 4RZVA 5FBOA 2Y7JA 5LARA 3VS7A 3FLZA 5EYDA 1H27A 3W2PA 4ZJVA 2QONA 3ZUVA 4B6LA 2WTVA 2F9GA 4EH3A 4USFA 4C36A 2UW6A 4OBOA 5K0KA 4DFLA 2BDJA 1G5SA 3JY9A 3D5XA 2J5EA 3EQBA 4GRBA 4XV2A 4EORA 2F49A 4FIEA 2YABA 4O0SA 4TY1A 3MIYA 4XX9A 4ANSA 5I9ZA 3OUKA 4IQ6A 2QU5A 1BMKA 4BI2A 4ERWA 4AACA 5AA8A 4RX9A 4G3DA 3E92A 1KE9A 3BYOA 5DRDA 3G6GA 3OXTA 3BHVA 2RL5A 5DOSA 5LCKA 5HBJA 3PWYA 4I6QA 2OJFE 5GZ8A 3TDVA 5CEPA 4XG6A 5L2SA 4FV3A 4IACA 2JIVA 2QR8A 3D9VA 3COIA 1LP4A 3JVSA 2VTMA 3V5JA 1TVOA 4E3CA 5ANJA 2XK6A 3LHJA 4II5A 3NYOA 4K6ZA 5AR2A 5M55A 1J7UA 4FSNA 2ITNA 4LUDA 4JNWA 3RAIA 3A8WA 3EKNA 4YJPA 1MP8A 2YA9A 2ZJWA 1M2RA 3ROYA 2XRUA 2W5AA 1OB3A 2YCSA 4NU1A 4C59A 3QZFA 4FKWA 1X8BA 3RWQA 5A4CA 1Q41A 3FLYA 3BYSA 4BDGA 5IH6A 2WMVA 3E7VA 3BGPA 4QMVA 4FVRA 3CS9A 5T68A 2UVXA 3GENA 3P7BA 5H8GA 3TIYA 1CMKE 2I40A 2X6DA 1PMNA 3KB7A 2XKCA 4AT4A 2Y4IC 3D7TB 2C6TA 3D14A 5IQDA 2UW9A 3OWLA 4I6FA 3R8UA 2OXYA 4BBFA 4MWIA 4CMOA 3JYAA 2ITTA 5DIAA 4FV0A 4CEGA 1UNGA 3QTWA 3PG3A 4QTBA 4G6LA 5BYYA 3FAAA 2OH4A 2CNUA 4O22A 4JS8A 4G2FA 4NJDA 5J87A 2WU7A 3SA0A 2VGOA 4IWQA 3A62A 2RF9A 3C9WA 4FZAB 4O2ZA 3MYGA 5DEWA 3H10A 4FTJA 4DEGA 4LOQA 2XKFA 4FTIA 4U44A 2EU9A 4E1ZA 3PZHA 4G34A 4GK3A 3A7FA 3QZIA 3JY0A 4ARKA 4RZWA 1LEZA 5KBQA 4FMQA 4G3EA 1EH4A 2ITWA 3FYKX 1OVEA 5HU3A 4R77A 4RWLA 4O7WA 2JKOA 2WGJA 2IJMA 4TKSA 4ZAUA 5JK3A 2P0CA 3I7BA 5IMEA 2Y8OA 3FZSA 4CMUA 4UXQA 2CKQA 4Y95A 5ANIA 4Q9ZA 2NRYA 5IQFA 4MHAA 3LKMA 2CN8A 5KZ0A 4FNWA 5J79A 4RIWA 3BHUA 4DYMA 5A6NA 4EOPA 4M15A 4YZNA 3I6UA 4FEWA 3H9OA 4FTLA 3NEWA 1Q24A 4G3FA 3DBCA 2UZWE 3NNWA 4IWDA 1R0PA 5IA5A 3R7UA 3TZ7A 4BCOA 3K54A 5K5NA 3BELA 4YJTA 5CEMA 4HPTE 1UV5A 2R64A 1ZXEA 4YSJA 5EK7A 4XBRA 4ACGA 4AN2A 4TL0A 4J8NA 2QG5A 5KZIA 4L3LA 3OD6X 3FKOA 1UWJA 3TNPC 2W1GA 1OGUA 3QX4A 4KKHA 4TWNA 3TJCA 1PKGA 2B54A 5CEQA 3A7HA 1IA8A 4BHZA 5JH6A 5KKRC 1VYWA 3KXXA 3F7ZA 2XKEA 3O50A 4O7TA 3H3CA 3NW5A 4XOYA 4MX9A 1YI3A 4IMYA 4FV9A 1REJA 4MXZA 2OFUA 3R22A 3DKCA 5HIDA 4AXAA 4D58A 3MVLA 2JDRA 1ZZ2A 2XIZA 3OS3A 2GFCA 1XJDA 4MWHA 2ITOA 1YXTA 5AV1A 4HPUE 3T3VA 4L44A 5CZIA 3C7QA 3V5QA 4BICA 4E26A 1OKZA 5CU2A 3Q2JA 2I0EA 2W1ZA 3OWJA 2X2LA 3F5UA 3DBEA 2QOLA 3QC9A 4QMPA 2UZNA 5HD4A 4K11A 2PE1A 3RTPA 1GIIA 1DAWA 1M2QA 1UVRA 4DFXE 5AIKA 5GHVA 5HBEA 4RJ6A 4GUEA 4WHZA 2VO6A 5DT3A 2HW6A 1XHAA 1NW1A 3SRVA 3LXNA 2QCSA 4I5CA 5HIBA 5JGDA 3OT3A 3JXWA 1HOWA 3W2RA 3LVPA 2ERKA 4QP9A 3ULZA 2ETMA 2VTAA 3L8SA 3UDBA 4AZWA 4EEVA 3MDYA 3RMFA 5A9UA 4Y5HA 4JQ8A 4DT9A 4XLVA 4EL9A 3FI8A 3JPVA 4NJ3A 4EUTA 3OFMA 4RLLA 3JUHA 4MQ1A 4O7VA 2BDWA 3ZRMA 3LCSA 3OUNB 4ASZA 3QCXA 1CTPE 4Z9LA 2OJ9A 3PXZA 1STCE 2G9XA 3CD3A 1OIQA 3HLLA 3UOJA 3NUNA 3PPZA 2IG7A 1YRPA 3SAYA 4KA3A 2VD5A 4L45A 4B7TA 2UZBA 5FM2A 4QQCA 4N6ZA 4X6RA 4NW5A 4YZBA 5CVGA 3SG8A 4HYUA 4EOIA 3AGMA 4MEDA 4ACHA 1XBAA 4HGSA 3P23A 4F9YA 1PYXA 3PIZA 4FTMA 1JKSA 1W83A 4IVDA 1YXUA 5FRIA 4CZTA 4TYIA 3BU3A 1OKVA 4R3PA 3LJ2A 2GQGA 3TG1A 3D2KA 2W4OA 2ESMA 2JITA 5BVKA 4L67A 3A61A 2V0DA 2QODA 3E8NA 4J71A 4P5ZA 1SM2A 3UQFA 1PMVA 3C51A 2C6IA 5M09A 2XK4A 5KMMA 2VTOA 3R1QA 2VRXA 2CCHA 1CKIA 2OK1A 3FMJA 2XIKA 2YJSA 1MQBA 2UW5A 5HNIX 5JFSA 2CPKE 2HCKA 1ZMVA 5HLPA 5TKDA 2W1CA 5IA3A 2G15A 5AR8A 4KINA 3ZEWA 3KULA 4EK4A 3TTIA 5BMSA 4DEHA 3TTJA 5A4TA 2CLXA 5I4NA 3KRJA 4LGHA 3DBFA 3RK9A 3U8WA 3HP2A 3OCSA 3N4VA 2X2MA 5EOBA 4FI1A 1SVHA 1DS5A 2X7FA 4IXPA 2J90A 3LFNA 3BHYA 3CBLA 4MNFA 3IW4A 2HAKA 3O23A 4DEIA 2XNNA 3NRMA 3PXYA 4CLJA 2X8DA 5JSMA 3DXPA 3VS2A 4D2TA 3FMKA 5BVDA 2WFYA 4EZ5A 4EI4A 3QCYA 2R3KA 4GV1A 4YGAA 5G6VA 4M69B 4RC2A 3DB6A 4LQMA 3ENHA 4R3CA 5E92A 4ZS0A 3W2OA 3F5GA 2W4KA 3O51A 5HE1A 3V8WA 5DR6A 5M08A 3ID6C 3MVHA 4F70A 4PP7A 3KXMA 2YIYA 2H9VA 3THBA 3HP5A 4B8LA 2IVTA 1ZZLA 3A2CA 4RIOA 4RQKA 3F3WA 5HE2A 3VUKA 5A14A 4UX9A 5EI2A 3VF8A 5A54A 4I5PA 4DH7A 3CPCA 3R6XA 2WZJA 4L43A 4BVUA 4R7BA 4F99A 2WNTA 1XBCA 3U4UA 5I9WA 2DWBA 3D5WA 2RKUA 3TNIA 2JAMA 3QUDA 4HGEA 4RIYA 5FDXA 4CZUA 2BZJA 3PXRA 4XP3A 5M44A 4J8MA 3PY1A 4XNEA 4E6AA 1U5QA 4U7ZA 3B8RA 4I92A 3E3BX 5F4NA 3UP2A 2GDOA 3DAJA 4NH1A 1OIYA 4KAOA 1Q8ZA 2HWPA 5LWMA 4M67A 5L8JA 3HRCA 3NYVA 1RJBA 3GC9A 2IN6A 3KXHA 4IW0A 5FD2A 3I6WA 3TV4A 3IW7A 3PVBA 3QXPA 2ZDTA 4FKUA 4CFNA 4MNEA 2B1PA 3MB7A 3RBWA 2VTJA 3ZLSA 3REPA 3C0HA 3R9OA 3MWUA 5D10A 5EM7A 3UIUA 1FGIA 4HYHA 4I6HA 3VS3A 4BIBA 4O7NA 1S9IA 3DS6A 3GCSA 1ZYSA 3LXPA 5L2QA 4HW7A 1KOAA 2B53A 1FVTA 5EM5A 5AAGA 3EIDA 4MXXA 1ZY5A 5HOAA 3R2YA 4IWPA 2C0OA 3RGFA 4WD5A 3HMPA 3VWAA 5JGAA 3BIZA 4JOAA 3DB8A 1IA9A 1QCFA 2JDTA 2WMBA 2OXXA 3ZUUA 4CLIA 4EONA 5CX9A 2ETRA 3UZPA 3LFQA 3VULA 2WMSA 2I0HA 2JIIA 4KRDA 1URWA 3EN7A 1CKJA 3GU4A 4JT3A 3SQQA 5IA1A 4YZMA 1JBPE 3QQFA 2OZAB 4IZ7A 3HX4A 4FICA 4DLJA 3R83A 5GZAA 2VWIA 5KMKA 2JDVA 4EBVA 4HJOA 5I5ZA 3DFCB 1R1WA 4HYIA 5M06A 3EOCA 3RPYA 4XEYA 4RVKA 4GMYA 4RJ7A 2QLUA 4W4WA 3RPRA 2ZV9A 3WF8A 2IPXA 4QPSA 2QLQA 3P5KA 1GAGA 3H9FA 4S2ZA 5T6KA 4BGQA 2VTQA 4FT0A 2B52A 3BX5A 4JG7A 4ZSAA 4BTMA 2P33A 3LLAA 3D83A 3DXQA 3UTOA 3DK6A 3DZOA 4FL3A 2FSLX 5H9BA 4FIHA 2OKRA 2UZUE 3SD0A 4XH6A 1OL5A 2Q0NA 5I3OA 4A9TA 4RA5A 3EQPA 1T45A 3NUXA 4DITA 1W0XC 4RGJA 4IIRA 5H2UA 5HQ0A 4D0XA 1DI9A 2VU3A 3D5VA 4L46A 4DFBA 4PMSA 4IX4A 3EQCA 3Q2MA 2VTSA 5AM7A 4EQCA 4ZTQA 3VUGA 4AG8A 5LOHA 4ASXA 2FUMA 5AX9A 2HYYA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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