The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
56
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sequence length |
146
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structure length |
146
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Chain Sequence |
VQWSAEEKQLISGLWGKVNVADCGAEALARLLIVYPWTQRFFASFGNLSSPTAILGNPMVRAHGKKVLTSFGDAVKNLDNIKNTFAQLSELHCDKLHVDPENFRLLGDILIIVLAAHFTKEFTPECQAAWQKLVRVVAHALARKYH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Oxygen storage, oxygen transport
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| molecule keywords |
Hemoglobin subunit alpha-A
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| publication title |
Crystal structure of Ostrich (Struthio camelus) hemoglobin in oxy form
rcsb |
| total genus |
56
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| structure length |
146
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| sequence length |
146
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| chains with identical sequence |
D
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2009-01-09 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| B | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1HBH A; 2ZWJ A; 1HDA A; 3HXN B; 3AQ8 A; 1GBU B; 1A0Z B; 2QFN A; 2QU0 B; 2R1H B; 1CLS A; 2ZS0 D; 111M A; 4HRR A; 4MXK A; 1LH6 A; 2H8D B; 1U7R A; 1O1M B; 2DN1 B; 1XZV B; 1MLS A; 3WCU D; 5KER B; 4ROM B; 1Y7G B; 2QSP B; 3G4W A; 3ECL A; 3AT6 A; 5SW7 B; 1FAW A; 3PIA B; 3WCV D; 2IG3 A; 3NG6 B; 4M4B A; 3WFT A; 1YHR A; 1CMY B; 4B3W A; 4TWV A; 1PBX A; 1YIE A; 1K0Y B; 2AUQ A; 3ZOL A; 1YEV A; 1XCH A; 3D1K B; 2W72 A; 1IBE B; 1C7C B; 1RTX A; 1DUO A; 2ZS1 B; 1G9V A; 3UHV A; 2MBW A; 3OO4 B; 1QPW A; 1Y7D B; 2VRY A; 1GDL A; 1Y85 A; 4HBI A; 3LR7 A; 1MLK A; 1RVW A; 3PI9 A; 4ILZ A; 5JDO D; 1ABY B; 3MVC A; 3IXF A; 1A01 A; 1Y7Z B; 1G0B A; 2ZS0 A; 1WVP A; 1YIH B; 4LPI A; 1LJW B; 4GZG A; 4N8T B; 2HBC B; 3SZK B; 1X9F B; 3QJB A; 1NIH B; 5D1V A; 3M3A A; 1RQ3 A; 3WCP A; 5HBI A; 3P5Q B; 1O1P A; 2KSC A; 3ORD A; 3CY5 B; 2ZFB B; 2C0K A; 1OR4 A; 1DLY A; 3D1A B; 2D2M B; 2D60 B; 1MBA A; 3A9M A; 1DO7 A; 1RQA B; 1HBR B; 3ASE A; 1NGK A; 2MB5 A; 3KMF C; 5E83 A; 3M38 A; 3NML A; 2EVP A; 1HBI A; 3OK5 A; 2Z6T A; 1GCW B; 1V4X A; 1YEO A; 1YEQ A; 1BZ1 B; 5F2A A; 3WCT D; 2W6X A; 1UIW B; 1IRC A; 2V1F A; 2ZS1 C; 3MJP A; 1C7D A; 4HHB B; 1Y5F A; 1Y4B A; 3UHN A; 1DXT B; 1VHB A; 1EBC A; 4MQJ B; 1FDH A; 3HRW B; 3GQP A; 1HGA A; 1JF3 A; 1SDL B; 1JL7 A; 1DO1 A; 2ZFO B; 1MKO B; 1WMU A; 1RPS A; 2AA1 A; 1MLH A; 1UC3 A; 1CIK A; 4AVD A; 3PI2 A; 2R80 B; 1LA6 A; 3WR1 B; 1MOC A; 2GLN A; 2LH3 A; 1LTW A; 1YZI A; 2MGG A; 2HHE B; 2BLH A; 1J40 B; 2GNV A; 1M6M A; 104M A; 1VXB A; 5CMV A; 1LFL B; 1Y0T B; 1GBV A; 3A59 A; 3A5G A; 2HCO A; 1A3N B; 1YDZ B; 1R1Y A; 1O1L B; 3QJE A; 2DN2 A; 1AJG A; 4M4A A; 1A9W E; 1N9X A; 3G52 A; 3GKV A; 1G09 B; 3MYN A; 2HBF B; 2O5M X; 4FC3 A; 4DC7 A; 2GRF A; 3D7O A; 3FH9 A; 1THB A; 3BJ1 A; 4AVE A; 3AQ9 A; 1Y4F A; 1LFV B; 1I3E A; 1CP5 A; 3WCW B; 1MCY A; 1YEN B; 1DWS A; 1MLG A; 4ESA B; 1SHR B; 1UFJ A; 3CIU A; 4DWU A; 1Y7C B; 5M3S A; 3QM9 A; 4G1B A; 3GQR B; 3ZOM A; 2G0S A; 3UHB A; 1DTI A; 1Y0W B; 3QM8 A; 1HGC A; 3ECX A; 4U8U D; 4WJG A; 5IKS A; 1MLQ A; 3DUT B; 3V2V A; 2MGA A; 3WFU A; 4X0L B; 1JEB B; 1J7W B; 1YOG A; 3UHY A; 1A0Z A; 1Z8U B; 2GTL D; 2QU0 A; 2R1H A; 1MBN A; 1JW8 A; 2D2N D; 2H8D A; 1UMO A; 3AQ7 A; 2DN1 A; 2V1K A; 3NL7 B; 1XZV A; 5KER A; 4ZVB A; 4ROM A; 2SPN A; 1Y7G A; 1YEU B; 1LFQ A; 5EQM A; 3PT7 A; 2QSP A; 3VRE A; 1NWN A; 3D4X B; 1Y35 A; 3K3U A; 1B0B A; 5SW7 A; 3PIA A; 3NG6 A; 1YVT B; 3W4U A; 1CMY A; 1HV4 B; 5EV5 A; 2MGJ A; 1ECA A; 112M A; 2AUO A; 1K0Y A; 2YRS B; 1BZR A; 3D1K A; 1IBE A; 1N9F A; 2QLS B; 4F6G A; 2FRI X; 2MYA A; 5C6E B; 5CN5 A; 107M A; 1Y4P B; 3OO4 A; 3EDA A; 1B86 A; 1F65 A; 2ZSS A; 1Y7D A; 1ABW B; 2FRK X; 1EBT A; 1ABY A; 1YVQ B; 2R4W A; 1Y7Z A; 1K1K B; 1MOH A; 2GTL A; 1YIH A; 7HBI A; 5CN8 A; 2BLI A; 1LJW A; 2G0X A; 1V4W A; 2MHB B; 4N8T A; 1IT2 A; 1X9F A; 3SZK A; 3QJD B; 3HEN A; 2HBD B; 1GJN A; 4NI0 B; 2MYE A; 2XYK A; 1FLP A; 2MGI A; 1Y2Z B; 3P5Q A; 1KD2 B; 1MLL A; 1VXC A; 1DLW A; 3QQR A; 3CY5 A; 3GYS A; 4NI1 B; 1CH9 A; 2ZFB A; 2ZLT A; 3D1A A; 2D2M A; 3AQ5 A; 1RQA A; 1DKE B; 1HBR A; 3D17 B; 4VHB A; 1TU9 A; 1YHE A; 1UVY A; 3PT8 B; 3IC2 B; 1GCW A; 2W31 A; 1SPG B; 3AQ6 A; 1BZ1 A; 1L2K A; 1G08 B; 3PI8 B; 2SPL A; 1UIW A; 4O35 A; 2WTG A; 2AUP A; 5EE4 C; 2FAL A; 2ZLU B; 4PQ6 A; 4N7O B; 1BUW A; 1XZ5 B; 4MQJ A; 1SDL A; 4N7P A; 1J7S B; 1S5Y B; 2GKN A; 1MKO A; 2ZFO A; 1A6G A; 1WLA A; 3MKB B; 1D8U A; 4L7Y A; 3WCW D; 2RAO B; 1JP8 A; 2R80 A; 4YU4 B; 3WR1 A; 1CIO A; 1A3O B; 1XY0 A; 1EMY A; 108M A; 1YG5 B; 6HBW B; 3UHI A; 2HHE A; 4FWZ A; 1O1O A; 1J40 A; 2FRF A; 1C40 B; 4FH6 A; 2BK9 A; 2VHB A; 3ZHW A; 1MBO A; 1LFL A; 1Y0T A; 3PEL B; 2OH8 A; 3R5I B; 3UGY A; 3NMM A; 1A3N A; 3UHC A; 5AZQ A; 1MLJ A; 3A2G A; 3O7N A; 2QFK A; 4NS2 A; 1YH9 B; 1MOA A; 1F5O A; 1QSH B; 3WCU C; 2HBF A; 1Y0C A; 1YMB A; 1MOB A; 2VYZ A; 3V2Z A; 1LFV A; 4MQC B; 2MGF A; 3WCV C; 3ARL A; 2D5Z B; 2H8F B; 1AJ9 B; 1JF4 A; 3OZW A; 3WCW A; 3UH5 A; 1YEN A; 2O5B X; 4ESA A; 1SHR A; 4G1V A; 1Y7C A; 1QI8 B; 3GQR A; 1J3F A; 2Z6N B; 5HLX A; 3A0G B; 1Y5K B; 4NZI A; 3SDN A; 1Y0W A; 1A00 A; 3S48 C; 1FDH G; 1MDN A; 3DUT A; 3UHH A; 1J7W A; 5JDO C; 2R4Y A; 3VRG B; 3NFE A; 3H57 A; 1JZM A; 4G51 A; 1W92 A; 3QM5 A; 4ODC B; 3NL7 A; 1A6K A; 2ZSR A; 1RQ4 B; 4C0N A; 1BZ6 A; 2E2Y A; 3D4X A; 1HBS B; 1MBC A; 4NK1 A; 3ZJH A; 1IOP A; 1XXT B; 1YVT A; 1HLM A; 1ECD A; 1HV4 A; 3QM6 A; 1J41 B; 4KJT A; 1F5P A; 1GZX B; 1S56 A; 1IRD B; 5CNF A; 1YOI A; 1CH4 A; 2QLS A; 4UIQ A; 1Y4P A; 1CO9 A; 4YU3 B; 1Y0D B; 3ONZ B; 4F6I A; 1ITH A; 3S1I A; 1ABW A; 1FSX A; 5EU2 A; 3WCT C; 1NEJ B; 1YVQ A; 1NPF A; 1K1K A; 4F6D A; 3M39 A; 3GDJ B; 1DXC A; 1OFK A; 1HDS A; 1XZ7 A; 1OJ6 A; 3AT5 A; 2MGB A; 2VM0 A; 2MHB A; 2ZST A; 1QXE B; 1FN3 B; 1XYE B; 2V1I A; 2DN3 B; 2HBD A; 4NI0 A; 1HLB A; 1Y2Z A; 1CG5 B; 1DXU B; 1KD2 A; 4F6F A; 1S0H B; 1M9P B; 1VRF A; 1MGN A; 4NI1 A; 2ZSO A; 2GNW A; 5JDO F; 1XZ2 B; 1HBA B; 1A6N A; 5HY8 B; 1N9H A; 1DKE A; 2GL3 A; 1OUU B; 3D17 A; 4HRT B; 4XS0 A; 101M A; 2VLY A; 2ZLX A; 1R1X B; 3PT8 A; 1SPG A; 1XZU B; 3UHX A; 3ARJ A; 1XQ5 B; 1MLU A; 1JP6 A; 1YE2 B; 3OZV A; 109M A; 1RTE A; 3WTG B; 1LFY B; 2ZLU A; 3DHR B; 3ZJN A; 4N7O A; 2R4Z A; 4B4Y A; 1XZ5 A; 5CN4 A; 1H97 A; 3QM7 A; 1NAZ A; 1J7S A; 1S5Y A; 1QXD B; 2BNL A; 4MQI B; 1OFJ A; 3MKB A; 3O89 A; 2RAO A; 4MXL A; 5CN9 A; 1QSI B; 6HBW A; 2AV0 A; 2O5L X; 4N7N B; 1C40 A; 1HJT A; 1BJE A; 4U8U C; 2Z8A A; 1V07 A; 1MBD A; 3TLD A; 1Y09 B; 110M A; 2O5T X; 3IC0 B; 2GRZ A; 3PEL A; 3R5I A; 1Y4Q B; 1DUK A; 5F0B A; 1Y4V B; 3GKT A; 3PI4 A; 1GCV B; 2D2N C; 4O2G A; 1ASH A; 1LFZ B; 1QSH A; 1LH7 A; 4NXC A; 2HHD B; 2SPO A; 2BW9 M; 1VRE A; 2ZSN A; 2O5Q X; 5HAV A; 2H8F A; 1AJ9 A; 4TWU A; 1MTI A; 1Y83 A; 1Y8K A; 5MBA A; 1A4F A; 2IN4 A; 4XDI A; 1BIJ B; 4F68 A; 1QI8 A; 4H2L A; 1V4U B; 2G0V A; 2Z6N A; 5JGG B; 3A0G A; 2EF2 A; 1BVC A; 1Y5K A; 1HDB B; 1V75 A; 3VHB A; 5E29 B; 2GRH A; 2MGC A; 1YGF B; 3S65 A; 2HZ3 A; 2HBS B; 3VRG A; 1O1I A; 2JHO A; 3QZZ A; 3BOM B; 1VXA A; 3S66 B; 2LH5 A; 1Y8H B; 1JY7 B; 1SDK B; 4ODC A; 3QJC B; 3UHS A; 2ZS1 D; 1Y8I A; 1MTK A; 1RQ4 A; 3E5I A; 2MGE A; 3ZJI A; 1M6C A; 3EOK B; 4MQG B; 3GLN A; 1HBS A; 3HXN A; 1GBU A; 1XXT A; 3TM9 A; 3G4U A; 1NZ5 A; 2G0R A; 1Y0A B; 2EKT A; 1J41 A; 1O1M A; 1H1X A; 1GZX A; 1IRD A; 1X9F D; 3HF4 B; 1YOH A; 3UH3 A; 3ZH0 A; 1URY A; 3ECZ A; 1KR7 A; 3G4Q A; 4YU3 A; 5EET A; 1Y0D A; 3ONZ A; 3GK9 A; 4MPM A; 1LH5 A; 3KMF A; 5CND A; 4PNJ A; 1HBG A; 2G12 A; 3SDH A; 5HLU A; 2WY4 A; 2D2M D; 2W6V B; 3GDJ A; 2FRJ X; 1Y8W B; 5JDO E; 1UT0 A; 1C7C A; 2ZS1 A; 5EYS A; 1X3K A; 1FN3 A; 4JYQ A; 4ROL B; 1XYE A; 2AUR A; 2OHA A; 3PI1 A; 1C7B B; 2DN3 A; 1ECN A; 1YHU C; 4HRR B; 2NX0 A; 5CNE A; 1CG5 A; 1DXU A; 5CNG A; 3HYU B; 1JZL A; 3B75 B; 2MGH A; 3WFX A; 2W6W A; 1O1K B; 1HBA A; 2XKG A; 5HY8 A; 1HAC B; 2OLP A; 2HBC A; 2ZLV B; 1FAW B; 4M4B B; 1BIN A; 1FCS A; 1NIH A; 1OUU A; 1YHR B; 1NPG A; 4HRT A; 1R1X A; 2ZFO D; 1XZU A; 105M A; 2HZ1 A; 1XQ5 A; 1GDJ A; 2R50 A; 1A0U B; 3UHE A; 1LH3 A; 2PGH B; 1YE2 A; 3ODQ B; 1RSE A; 1NZ2 A; 1O1N B; 2D60 A; 4HSX A; 3WTG A; 1LFY A; 1Y85 B; 5E6E B; 3DHR A; 1X46 A; 2OHB A; 1Y01 B; 4JAC A; 3OO5 B; 3WHM B; 1A01 B; 3BA2 A; 2RI4 B; 3ZJM A; 2V1J A; 2ZS0 B; 3UGZ A; 3BJ2 B; 1A6M A; 2ZSQ A; 4WJG 1; 1MLO A; 1MYJ A; 3QJB B; 1Y5J B; 4HHB A; 3WCU B; 1DTM A; 4MBA A; 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3G53 A; 1FSL A; 1YEU A; 1LUE A; 1PMB A; 1T1N B; 5EUI B; 2B7H B; 1HGB B; 5ILE A; 5KDQ B; 1Y4G B; 2PEG B; 2YRS A; 3E5O A; 2W6V A; 1YFF B; 3GQG B; 5HU6 B; 1Y8W A; 4FWY A; 4O4Z A; 3KUO A; 2G10 A; 5C6E A; 2MGL A; 3FS4 B; 3UHW A; 3R0G A; 4ROL A; 4FH7 A; 1C7B A; 5ILR A; 2DXM B; 1BBB B; 3HYU A; 3B75 A; 4SDH A; 2D5X B; 1MZ0 A; 1LFQ B; 1O1K A; 3PT7 B; 3VRE B; 1A9W A; 1Y35 B; 1HAC A; 3ZJO A; 1I3D A; 2ZLV A; 5EYJ A; 3UHD A; 1MWD A; 3W4U B; 3QJD A; 1MNO A; 1LH2 A; 1MNI A; 1MYH A; 1NQP B; 1A0U A; 3ZJS A; 2PGH A; 3ODQ A; 1NZ4 A; 3UHZ A; 1MBI A; 1O1N A; 3MN0 A; 1Y45 B; 4U8U B; 1B86 B; 1SPE A; 5E6E A; 3QMA A; 3OO5 A; 3WHM A; 1NS6 B; 4NXA A; 2RI4 A; 1G0A B; 2GTL B; 5CHR A; 3MBA A; 3IC2 A; 2VEE A; 2D2N B; 3BJ2 A; 1G08 A; 1IT3 A; 2G3H A; 3PI8 A; 1V4W B; 2QSS B; 1YCB A; 5JOM A; 4ZVA A; 1Y5J A; 1UVX A; 3WCU A; 4KMW A; 3BJ3 B; 1CH7 A; 3ED9 A; 1Y31 A; 3UI0 A; 4F4O B; 3E55 A; 1TES A; 1MYZ A; 1GLI B; 4L2M A; 2DHB A; 4UZV A; 3WCV A; 2M6Z A; 3UHU A; 3GYS B; 1OBM A; 3UHK A; 1HHO B; 2ZLT B; 1V5H A; 2OH9 A; 3EU1 A; 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