3IBLA

The crystal structure of the human carbonic anhydrase ii in complex with an aliphatic bis-sulfamate inhibitor
Total Genus 76
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
76
Knots found
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
HHWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Carbonic anhydrase inhibitors. Comparison of aliphatic sulfamate/bis-sulfamate adducts with isozymes II and IX as a platform for designing tight-binding, more isoform-selective inhibitors
pubmed doi rcsb
molecule tags Lyase/lyase inhibitor
molecule keywords Carbonic anhydrase 2
total genus 76
structure length 258
sequence length 258
other databases KnotProt 2.0: K +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2009-07-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 3iblA00
1XPZA 3HLJA 1G6VA 4CNVA 2Q1QA 4Q49A 5EKJA 5L3OA 1CAKA 3S77B 3RYJB 6CA2A 4CNWA 4QEFA 5DSLA 4QJMA 5EH8A 1FSRA 4R5AA 4ILXA 3L14A 4BCWA 1KWRA 1CAHA 3M96A 5DOHA 5E5UA 2OSFA 3KONA 7CA2A 3BETA 1G4JA 4QJXA 2NMXA 1YDCA 3MNKA 3RZ0B 1UGDA 3MNJA 5DOGA 4L5WA 3SBIA 4FU5A 3RG4A 4QJWA 2QOAA 2VVAX 3DV7A 1FQRA 9CA2A 5CJFA 5DSNA 3RLDA 3V3GB 4IWZA 1G0EA 1Z97A 4KNMA 1DCBA 3KOIA 4YGLA 4LU3A 3EFIA 3P3HA 5IPZA 2NWPA 1BN4A 1TB0X 3DCSA 1YO2A 3BL1A 5FLSA 3ZNCA 4N0XB 1HEAA 1TE3X 1ZFKA 4XFWA 1IF8A 1TTMA 1XEVA 3KIGA 5FDCA 4FRCA 2WEOA 1I90A 3DCWA 1CAMA 4CQ0A 1DCAA 2WEHA 3S74B 5EHVA 3P55A 3K2FA 3V3JA 3MNAA 5SZ7A 1FSQA 2FOSA 3NB5A 3D0NA 1RAZA 1RJ5A 1H4NA 5SZ1A 4QJPA 3S78B 1YDDA 3OIMA 3MHIA 1JV0A 4CNRA 2EZ7A 4Z1NA 1BNNA 3N2PA 3S8XA 4JS6A 4UOVA 5FNKA 4TWMA 3W6IA 5FNIA 1CILA 4E3HA 3NJ9A 1G4OA 1F2WA 1ZH9A 5EH7A 3T85A 5FNJA 4RIUA 3S71B 5SZ5A 2CABA 5FNMA 3DVCA 3FFPX 2CBBA 4HU1A 1XQ0A 3GZ0A 4YHAA 5FNGA 1CAYA 3V3HB 4JSZA 2X7SA 2FOYA 4MTYA 4JSAA 4QTLA 1CINA 4FPTA 1RZAA 4JSWA 4YGJA 5JQ0A 5JDVB 12CAA 4MLXA 3IBIA 5BRUA 4QK2A 4BF1A 5JG5B 4E3DA 3UYQA 3IGPA 3RZ7A 3MYQA 4PYXA 1G53A 1UGGA 2X7UA 3RGEA 1G0FA 3TMJA 4KP5A 1BICA 2EU2A 3SBHA 2IT4A 1TEUX 4QSJA 1IF6A 4GL1X 3RYZA 1HECA 3ML2A 4KUYA 2ZNCA 4Z1JA 3K34A 1KEQA 3N4BA 1CNBA 1V9IC 4K0TA 1TEQX 1UGEA 5JEPB 1G54A 1UGFA 3M67A 3P3JA 3F8EA 2OSMA 3N3JA 1CCTA 1CAZA 2WD2A 1H9NA 3HKQA 4RUYA 5JEHB 4MDMA 4QY3A 3V3IB 2HKKA 3M98A 4QIYA 4COQA 2H4NA 5A6HA 4QK1A 1V9EA 3M40A 3MHOA 4RH2A 5E2RA 1ZE8A 3U7CA 1BZMA 1MOOA 3EFTA 5AMDA 4KNJA 3D93A 1A42A 1CNGA 3KWAA 4Q7PA 3PO6A 2CBCA 1CVDA 1Z9YA 3DC9A 4WW6A 4CNXA 5LMDA 4YXUA 4QJOA 4QJ0A 2FNKA 2NWOA 4WL4A 3U45X 3RYVB 5J8ZA 4E3FA 3P4VA 3LXEA 4JSSA 4X5SA 5EZTX 1OKLA 4HT2A 1RZEA 3DBUA 3D92A 4ZWZA 1J9WA 2CBAA 2Q38A 1OQ5A 5BRVA 2POVA 1CA2A 2FNNA 3M5EA 1TBTX 4G7AA 1RJ6A 2NNOA 4RFCA 1YDBA 2HL4A 1IF9A 5DSKA 1EOUA 1CNCA 5JG3B 1ZSBA 3MNHA 3R17B 2EU3A 3CAJA 5C8IA 1TG9A 5JESB 5DSOA 4FL7A 2WEGA 2AX2A 3DVDA 5AMGA 5E2NA 5EH5A 8CA2A 4Q6EA 4Z1EA 3D8WA 3HFPA 4Z0QA 4E3GA 1UGCA 3DAZA 3U3AX 2NN7A 1G48A 3M04A 4Y0JA 4L5VA 1URTA 5G0BA 5E2KA 1I9OA 3M2NA 4PYYA 5BYIA 4HF3A 3V5GA 5A25A 2FOQA 4YXIA 2AW1A 1CA3A 5FL4A 3PJJA 4ITOA 5G01A 3OYQA 3V3FA 1DMXA 5FL5A 3M2ZA 2WD3A 1AM6A 1KOQA 4Q6DA 3ZP9A 1G46A 4FVNA 3DD8A 1OKNA 1CVFA 3V2MA 1BNUA 2FNMA 5BNLA 1CANA 1I9PA 4G0CA 3T84A 1ZGEA 3C7PA 5BRWA 4TWLA 5CLUA 5CA2A 4MDLA 1CAIA 3IAIA 4KNIA 3MMFA 1Z93A 3M14A 4FVOA 4YVYA 2VVBX 3MZCA 3OILA 2HD6A 1BNTA 3F4XA 2FOUA 2Q1BA 5FLOA 4Q06A 4LP6A 3T5ZA 3CYUA 1CIMA 5E28A 3CZVA 5E2SA 4N16A 3KKXA 4K0ZA 5EHWA 5CACA 1I9NA 2NNGA 3D9ZA 3R16A 2NXRA 3S73B 3T83A 5DSMA 4Q7VA 2ABEA 1FR4A 2CA2A 5JEGB 4PZHA 5EKMA 4XIWA 3SAXA 3RZ8A 3B4FA 1BCDA 1HEDA 4YX4A 5DSIA 2GEHA 3S97A 1CNWA 2NNVA 5DSJA 1CRAA 2NN1A 1KOPA 2FOVA 4KP8A 1JCZA 1XEGA 3VBDA 1BNMA 3N0NA 1BV3A 4WUQA 5DSQA 3OY0A 5EOIA 1RZBA 2H15A 4QSIA 4E9OX 4KV0A 3MHMA 3TVNX 4Q90A 3JXFA 3FE4A 1CVCA 3KOKA 1ZFQA 3M2XA 4HT0A 4Q87A 1AZMA 4Q99A 2FMGA 1TG3A 3F7UA 5DRSA 3BL0A 2NXTA 2NWYA 5G0CA 3MNUA 1JD0A 4E4AA 1FQLA 1CAJA 4Q08A 1IF4A 1I9QA 3V2JA 4PQ7A 3OKUA 3T82A 1CVBA 1UGAA 4ETQC 4E49A 3P5LA 5FLRA 1YO0A 5HPJA 4L5UA 1OKMA 4IDRX 4RFDA 3RZ5A 3P44A 3S76A 1CNXA 4M2RA 3IBNA 4YWPA 3KNEA 4KUWA 3S75B 3S72B 4HEWA 4Q83A 3DCCA 4CA2A 1FR7A 4MDGA 1ZSCA 4KNNA 5AMLA 1UGBA 1RZDA 2W2JA 5FDIA 3MWOA 3M1KA 1IF5A 1CNHA 5FNHA 1HUGA 3M1QA 2FW4A 1BN3A 3DC3A 3HKTA 3ML5A 1YO1A 4Q81A 5L6KA 1G45A 4Q78A 4C3TA 4LHIA 1HCBA 3P5AA 2CBDA 4DZ9A 4MLTA 4Q8XA 1ZGFA 3M5TA 2F14A 4Q9YA 4WW8A 3W6HA 1BNQA 4YGFA 3TVOX 5JQTA 1FSNA 3IBLA 4XE1A 4R5BA 1LG6A 3T5UA 4M2UA 3HS4A 4RIVA 1I8ZA 3FW3A 2NWZA 4HEYA 2CBEA 3SAPA 1HUHA 5DVXA 3M5SA 2POUA 1T9NA 4YYTA 1CAOA 3UYNA 1HVAA 3M1WA 3RJ7A 2HNCA 4Q7WA 4M2VA 1CVAA 4Q0LA 1I91A 5SZ2A 4QSBA 2ILIA 3DVBA 1CZMA 1CNJA 5G03A 4Q7SA 1G3ZA 5SZ3A 3MNIA 1LG5A 3M3XA 5EIJA 4KAPA 4YXOA 2NXSA 1BNWA 4M2WA 1CVEA 1FQMA 3P58A 1KWQA 1Y7WA 3QYKA 1G1DA 3RG3A 3Q31A 3OKVA 4Q09A 4Q8ZA 4Q8YA 4RUXA 5FLPA 2POWA 1AVNA 4ZX1A 5JGTB 2X7TA 4FIKA 3KLDB 1TH9A 2WEJA 1G52A 3HKNA 4MO8A 3OIKA 1DMYA 1I9LA 4ZX0A 3PYKA 4E5QA 1CNYA 1BNVA 1MUAA 4R59A 3DD0A 1RZCA 3U47A 1CVHA 2QP6A 3M1JA 1CALA 1LGDA 4ZAOA 1CNIA 4HEZA 4ZWIA 1I9MA 3M2YA 1HCAA 3RZ1B 1RAYA 3F7BA 2HOCA 3RYXB 5E2MA 5SZ4A 3S9TA 3RYYA 5FLQA 4YGNA 1H9QA 4BF6A 1CNKA 4QIZA 4QSAA 3NI5A 2FMZA 4Q07A 4WUPA 1CRMA 5FL6A 4HBAA 1CCSA 1YDAA 4K1QA 1CCUA 3CA2A 4ZWXA 4QK3A 5EKHA 1ZSAA 3HKUA 4XZ5A 5SZ6A 4WR7A 1LZVA 4DZ7A 5JGSB 3MHCA 3JXGA 1FLJA 2GD8A 1HEBA 3MDZA 3V7XA 4CACA 3JXHC 4K13A 4ZWYA 3MHLA 2NNSA 4PXXA 5EHEA 3B1BA 1BN1A 5SZ0A 4RUZA 4Z1KA 1THKA 4YGKA 5FLTA 1LUGA 3DA2A 1FQNA 2HFWA 5FNLA 4KUVA 1ZNCA 1IF7A 4RN4A 4XIXA 2QO8A 3KS3A 2O4ZA 3IEOA 4ITPA 5DSRA 3OYSA 5E5RA 3IBUA 5DSPA 3K7KA 4K0SA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1XPZ A;  3HLJ A;  1G6V A;  4CNV A;  2Q1Q A;  4Q49 A;  5EKJ A;  5L3O A;  1CAK A;  3S77 B;  3RYJ B;  6CA2 A;  4CNW A;  4QEF A;  5DSL A;  4QJM A;  5EH8 A;  1FSR A;  4R5A A;  4ILX A;  3L14 A;  4BCW A;  1KWR A;  1CAH A;  3M96 A;  5DOH A;  5E5U A;  2OSF A;  3KON A;  7CA2 A;  3BET A;  1G4J A;  4QJX A;  2NMX A;  1YDC A;  3MNK A;  3RZ0 B;  1UGD A;  3MNJ A;  5DOG A;  4L5W A;  3SBI A;  4FU5 A;  3RG4 A;  4QJW A;  2QOA A;  2VVA X;  3DV7 A;  1FQR A;  9CA2 A;  5CJF A;  5DSN A;  3RLD A;  3V3G B;  4IWZ A;  1G0E A;  1Z97 A;  4KNM A;  1DCB A;  3KOI A;  4YGL A;  4LU3 A;  3EFI A;  3P3H A;  5IPZ A;  2NWP A;  1BN4 A;  1TB0 X;  3DCS A;  1YO2 A;  3BL1 A;  5FLS A;  3ZNC A;  4N0X B;  1HEA A;  1TE3 X;  1ZFK A;  4XFW A;  1IF8 A;  1TTM A;  1XEV A;  3KIG A;  5FDC A;  4FRC A;  2WEO A;  1I90 A;  3DCW A;  1CAM A;  4CQ0 A;  1DCA A;  2WEH A;  3S74 B;  5EHV A;  3P55 A;  3K2F A;  3V3J A;  3MNA A;  5SZ7 A;  1FSQ A;  2FOS A;  3NB5 A;  3D0N A;  1RAZ A;  1RJ5 A;  1H4N A;  5SZ1 A;  4QJP A;  3S78 B;  1YDD A;  3OIM A;  3MHI A;  1JV0 A; 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