3IHGA

Crystal structure of a ternary complex of aklavinone-11 hydroxylase with fad and aklavinone
Total Genus 164
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
164
sequence length
535
structure length
535
Chain Sequence
b'MNDHEVDVLVVGAGLGGLSTAMFLARQGVRVLVVERRPGLSPYPRAAGQNPRTMELLRIGGVADEVVRADDIRGTQGDFVIRLAESVRGEILRTVSESFDDMVAATEPCTPAGWAMLSQDKLEPILLAQARKHGGAIRFGTRLLSFRQHDDDAGAGVTARLAGPDGEYDLRAGYLVGADGNRSLVRESLGIGRYGHGTLTHMVGVIFDADLSGIMEPGTTGWYYLHHPEFKGTFGPTDRPDRHTLFVEYDPDEGERPEDFTPQRCVELIGLALDAPEVKPELVDIQGWEMAARIAERWREGRVFLAGDAAKVTPPTGGMSGNAAVADGFDLAWKLAAVLQGQAGAGLLDTYEDERKVAAELVVAEALAIYAQRMAPHMAEVWDKSVGYPETLLGFRYRSSAVLATDDDPARVENPLTPSGRPGFRGPHVLVSRHGERLSTVDLFGDGWTLLAGELGADWVAAAEAVSAELGVPVRAYRVGAGLTDPESAVSERYGIGKAGASLVRPDGIVAWRTDEAAADAAQTLEGVLRRVLDR'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords RdmE
publication title Structural basis for substrate recognition and specificity in aklavinone-11-hydroxylase from rhodomycin biosynthesis.
pubmed doi rcsb
source organism Streptomyces purpurascens
molecule tags Flavoprotein, oxidoreductase
total genus 164
structure length 535
sequence length 535
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature ec 1.14.13.180: Aklavinone 12-hydroxylase.
pdb deposition date 2009-07-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01494 FAD_binding_3 FAD binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.9.50 Alpha Beta 2-Layer Sandwich D-Amino Acid Oxidase; Chain A, domain 2 D-Amino Acid Oxidase; Chain A, domain 2 3ihgA02
3.40.30.120 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3ihgA03
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 3ihgA01
2TMDA 4H2NA 2BK4A 3QSSA 4AOXA 5EBKA 4FK1C 2WP6A 4XXGA 2BYBA 5L46A 4NTDA 4YSZA 2GRTA 2RGHA 3FPZA 1IUTA 1D7LA 4H2RA 2C7GA 2QA2A 2YAUA 1E1NA 3NK2X 4H4YA 4H4VA 1EL5A 2BA9A 3DJGX 2JBVA 1LVLA 3RP6A 2BXRA 3NLCA 3AD7B 2X8HA 3IC9A 1VG9A 2YLRA 3AEAA 1BZLA 2XYOA 2QCUA 2WOIA 2HQMA 4AOSA 3LADA 4CCQA 4DSGA 1ZOVA 3F8RA 2XVJA 3GYJA 3ICSA 1K0LA 3IF9A 1FL2A 1BF3A 1N4UA 3UKHA 4XWZA 1LJ1A 5C2TA 2XFPA 5IPYA 1E1KA 1O95A 3NN0X 1Q1WA 1IUXA 2OALA 2WDQA 2WU2A 2YG6A 1F8RA 3AEDA 1B37A 3AB1A 2XLPA 2OLOA 3BI2A 1E39A 1D7YA 3BHFA 3KPFA 3GYIA 1PN0A 3NKSA 3NYFA 3UKQA 1VRQB 4CCRA 4EQSA 2J3NA 2WS3A 5KRQA 2QA1A 3UKAA 1H7XA 2YR6A 4YTMA 1D4EA 4ECHA 3DH9A 2X99A 1E6EA 2VOUA 1CJ3A 1ZDLA 1DOBA 1S3BA 3S61A 1V59A 3P1WA 2VVMA 1TDOA 2GR1A 3KA7A 4RG3A 2YR5A 1DOEA 1GXFA 2X8CA 3DA1A 3LOVA 3ALLA 1VDCA 3VR8A 2WDRA 4CY8A 1CJ2A 2YWLA 4A65A 3K7TA 4BJZA 5HYMA 1XDIA 3H4KA 3PS9A 3AE3A 4ZN0A 1CJ4A 2BACA 5HXIA 2WPFA 3LZWA 4JNQA 1JRYA 2XVFA 3AE2A 3EPTA 3SFEA 2DKHA 2YVGA 3P9UA 2C67A 2WETA 3F8DA 1PS9A 5KOWA 1ZMCA 2BS4A 2XVEA 2QAEA 1GRGA 3CGCA 2BXSA 2XLTA 1CC6A 4J34A 4H7UA 4USRA 3CGEA 4CNJA 3NNEA 3ICRA 3FBSA 2CFYA 1EL7A 3HZLA 1S2YA 3GRSA 4K8DA 4UDPA 4ICYA 4A6NA 4I59A 2ZZ0A 3IWAA 4H4TA 3NH3X 4TM0A 1RSGA 2Q0KA 2WDVA 5FS6A 2X50A 3C4NA 2B7RA 4N9XA 1BGJA 2YLXA 1EL8A 1VQWA 3JSKA 2B76A 3DJJA 2PHHA 4Z2TA 4EM3A 2GR0A 4APNA 4Z26A 3GD3A 2C76A 2Q0LA 1JRXA 1YY5A 3L8KA 1IJHA 2W0HA 4KPRA 2R9ZA 4J31A 2O9ZA 1GALA 1NENA 3UTHA 4CNKA 1GNDA 5M10A 3GD4A 3ISHA 1TYPA 1Z6LA 1BGNA 3AYJA 2YM1A 3SM8A 3AEEA 4DNAA 4GRTA 2A8XA 3AYLA 1REOA 3V76A 1Q9IA 2GR3A 2F5ZA 3BI5A 1GT8A 4U8NA 2EQ8A 4NTEA 4D04A 3E1TA 4FX9A 4B63A 4K2XA 1KNRA 3BI4A 4H4WA 4CBQA 3P4SA 3FMWA 4YTNA 3GMCA 1B4VA 3KKJA 1NHRA 3AE9A 3DJDA 2A87A 3QFAA 3QVRA 1B8SA 2YM2A 1GRBA 4TM3A 2E5VA 2VQBA 1H81A 1H83A 2WHDA 2R46A 4C3YA 2B9YA 4AT0A 4BURA 1L9CA 4ZCCA 1OJAA 1GSNA 2YG4A 3V3OA 3NHOX 4FK1A 3S5WA 3SFDA 5IQ1A 1PBFA 3K30A 3DJEA 3NRNA 4JY2A 3AE8A 2GMHA 2YR4A 3ADAB 1PJ5A 1ZKQA 3LB8A 4A79A 4Y4NA 1GRFA 5C3JA 4H4UA 2C66A 4C5OA 1IUWA 2VQ7A 3VRAA 1XANA 1LV0A 2YLTA 3RP8A 4U8MA 3GWDA 2V3AA 1L9DA 2VRLA 1PXBA 2NVKX 1M64A 4JNAA 4UDQA 1COYA 1JNRA 1NHSA 4BV6A 1YQ4A 1PJ7A 3ZYXA 1S3EA 4B66A 1NPXA 4WX1A 4YSHA 4EQWA 4X4JA 3G5QA 1GESA 4K5SA 4Y4LA 5JCNA 3G5SA 2CDUA 1PDHA 4NTCA 3IHMA 1Y56A 5TR3A 4TLXA 2YVJA 3GWFA 1F3PA 1FOHA 4GDEA 4C74A 4NEWA 4CY6A 3KD9A 2XLUA 4IV9A 4ADWA 3NIXA 2YLWA 3AD8B 1KNPA 1LQUA 2WPEA 1AOGA 2B9WA 3UP4A 2AAQA 1GOSA 2V6OA 2C3DA 3RNMA 1GPEA 3ABVA 4EMWA 4OPGA 1OJCA 3SQPA 4YXDA 3G5RA 4Z25A 3GMBA 3NK0X 4U2TA 4JY3A 5GRTA 4Z2RA 1DXLA 1KDGA 3OZ2A 2FJDA 3D8XA 5JCKA 1F6MA 3M0OA 5EB5A 5J60A 3NYEA 2V3BA 2YLZA 2EQ6A 1GEUA 1KF6A 1N1PA 1OJDA 1TDEA 2AQJA 2WOWA 2ZZBA 1KSUA 3GSIA 3QJ4A 4KX6A 4HA6A 5U63A 1Y0PA 2B7SA 2WP9A 3ATRA 3OC4A 4B67A 3QVPA 2R0CA 3B6DA 3H8IA 3CNJA 1W4XA 5FS9A 2IVDA 1PBBA 1O5WA 4P9SA 5GSNA 4YTPA 3BHKA 2Y6QA 4IVOB 1ZMDA 3NTDA 2H89A 4H2PA 3AEGA 4TM4A 1OJTA 4IVMB 3EANA 3P4RA 2BCPA 4EMJA 5LV9A 1H82A 1FEBA 1XHCA 1JRZA 1PBDA 1PXCA 4TLZA 4O5UA 2JB1A 2XFOA 3DK9A 4K5RA 1RP0A 1P2HA 3BNUA 2I0ZA 5BRTA 4J2WA 4H4XA 4J56A 1TRBA 2JAEA 2EQ9A 3AE1A 5BVAA 3M12A 4J57A 3AEFA 1TDNA 4UDRA 2GF3A 3RP7A 2UZZA 3NT6A 3PVCA 1GTEA 4U8PA 3UKPA 2GVCA 1D4CA 2RABA 1QO8A 3EAOA 1GRAA 2XLRA 1ZK7A 4OCGA 1M6IA 3Q6JA 2BK3A 4NZHA 5BULA 3EF6A 2B9XA 3C96A 1CC2A 4B1BA 1JNZA 2TPRA 1TYTA 4RG4A 3UOYA 1NDAA 4MJWA 4LIIA 2PYXA 3P4PA 4PABA 3T37A 2VZ2A 4IA6A 4JQ9A 1Y56B 1K0JA 1N4WA 2ZZCA 4U2LA 1YQZA 4H4RA 4U8OA 3ALMA 3VQRA 1PHHA 2Q7VA 4ZCDA 2YG5A 3DMEA 3QSMA 5HY5A 2XFNA 4Z43A 2GMJA 2IIDA 2X8GA 1F8SA 4LA1A 3F8PA 1O94A 3AE7A 3UTFA 3NK1X 2V61A 2GQWA 2XCGA 5CKUA 4X9MA 4YKFA 1GTHA 2V60A 2R0GA 2XFUA 3DGZA 3AXBA 2Z5XA 1P2EA 3PO7A 1H6VA 2WQYA 1EL9A 3CNPA 4H4QA 5JCLA 3NN6X 4GCMA 5BUKA 2BCGG 3P4QA 1NG4A 2GB0A 1ZX9A 3VRBA 2GAGB 4H4ZA 4BJYA 1IUVA 4OPCA 5EOWA 1GERA 3CNDA 4YSYA 4YSXA 1OJ9A 4BK2A 2CULA 1PXAA 4EIPA 1DODA 1EBDA 1B5QA 2BC0A 3CNTA 2YVFA 3NG7X 4C3XA 1E1MA 4JDRA 2YLSA 4Z2UA 2GR2A 2BC1A 1IUUA 2VRMA 5FMHA 3KLJA 3UTEA 2R0PA 4EQXA 4GDPA 1ZY8A 1UKVG 1H84A 4WCTA 4GF7A 3CPHG 4A6NB 1H86A 3LJPA 1E7PA 1N4VA 2C3CA 1ZOYA 5JCMA 5HHFA 4H2QA 1L0VA 1Q1RA 3UOXA 2FBWA 3CPIG 5U1OA 2OAMA 1K4QA 2WEUA 2XFQA 1NHQA 4NEVA 5FS7A 1CL0A 3B3RA 3SGLA 3AE6A 1GV4A 2DKIA 2FJEA 1D4DA 5M0ZA 1SEZA 3UOZA 1ZP0A 2VVLG 4FDCB 1NHPA 4I58A 4B65A 3CTYA 2BS3A 2WU5A 2FJBA 2BS2A 5ER0A 3CGBA 3CPJG 3LXDA 1GRHA 4CRTA 1LPFA 3AE5A 3AE4A 2Q6UA 2R4EA 3GRTA 1QLBA 4DSHA 4X9NA 1DJNA 4PAAA 3ITJA 1NAAA 2AR8A 3BNMA 4YWOA 3ALJA 5KVHA 4B68A 3ICTA 1ONFA 2RGOA 4U8IA 5JCIA 4K7ZA 2R4JA 3UKFA 2BABA 1FCDA 4A9WA 3AWIA 4Z24A 1FECA 3I3LA 1F8WA 1K0IA 1GREA 2WPCA 4EM4A 3ZDNA 4AT2A 1D5TA 2EQ7A 1MO9A 4OPUA 4BK3A 1FEAA 3O0HA 3K7MX 3UTGA 4OPTA 3Q9TA 1PBCA 4IA5A 4OPDA 3R9UA 3QSEA 3L1RA 1CF3A 1JU2A 4U8JA 1L9EA 4H4SA 3II4A 3FG2P 4GUVA 3UKLA 3WE0A 3FIMB 3D1CA 4DGKA 1HYUA 4H4PA 3ATQA 2OA1A 1MOKA 2XVHA 4LU6A 1DJQA 1S2QA 2E4GA 1E1LA 5U25A 4OVIA 2YG3A 3QFBA 1YQ3A 3REDA 1BKWA 4B64A 4K22A 2ARDA 5EB4A 1RYIA 2NPXA 3UKKA 2C73A 1LQTA 4TM1A 1CC4A 1PBEA 1LTXR 1YKJA 2XVIA 1VG0A 2JK6A 3VRDB 4EIQA 4USQA 4J36A 4Y4MA 3KVEA 5FS8A 4REKA 5KXJA 2JB2A 2YQUA 4D03A 1TDKA 1KSSA 4H50A 3CN8A 3CNSA 3RHAA 2YG7A 4AP3A 2E1MA 3DGHA 4Z44A 3V3NA 2RGJA 2ZBWA 1TDFA 4B69A 2GAHB 2GV8A 3GDNA 1CJCA 2C75A 1X31B 3I6DA 4J33A 5DBJA 1BWCA 4HB9A 4C77A 2GH5A 1CHUA 2WBAA 3CGDA 4OPIA 1CBOA 3UCLA 3AD9B 2WESA 2WOVA 4U8KA 2JB3A 3COXA 4OPLA 4A7AA 3KU9A 1IUSA 5KOXA 3UP5A 4A99A 5J7XA 1JOAA 1XPQA 3CIRA 4M52A 3NGCX 1JEHA 2ACZA 2V5ZA 5KVIA 3AECA 2XLSA 5IQ4A 3NTAA 2C70A 2C65A 3AEBA 2OLNA 4O5QA 2JKCA 2CVJA 1ELIA 3K7QX 4YT0A 4GR1A 2C64A 2GEWA 2Z5YA 1H7WA 1NEKA 4BK1A 2APGA 1DNCA 1GETA 1DOCA 2R45A 2XDOA 3URHA 4U8LA 2C72A 1GRTA 4E0VA 2H88A 3AYIA 1NG3A 3IHGA 1KFYA 2FJAA 2WP5A 3LZXA 2A89A 1MXTA 3NYCA 3M13A 2BK5A 3VR9A 3DK4A 3GDPA 4EMIA 2IVEA 4A5LA 5KWFA 2VVLA 1QJDA 4XWRA 1PJ6A 3H8LA 4JN9A 4UP3A 4EQRA 5CQFA 4U2SA 2Y6RA 2GQFA 3C4AA 4AP1A 4YKGA 3UOVA 3DK8A 2X3NA 4RSLA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2TMDA 3QSSA 2TRXA 5EBKA 4XXGA 4LL1B 1WMJA 4BPYA 1HNAA 5L46A 2I9HA 3A3TA 3ZITA 2GRTA 2RGHA 1X5EA 2QA2A 4H4VA 1MDKA 4PNGA 1EL5A 2BA9A 3DJGX 2JBVA 4KCEA 4KDYA 2BXRA 1MTCA 1TTZA 2X8HA 3IC9A 1VG9A 1BZLA 2XYOA 2RUEA 4GF0A 4FIWA 1TRWA 4AOSA 1ZOVA 2JL4A 2AYTA 2XVJA 3IF9A 1A0FA 1FL2A 2VOCA 4TR4A 1O85A 5ECMB 1N4UA 5C2TA 5IPYA 1O95A 1Q1WA 2HSHA 3EINA 2L57A 5G5EA 3AEDA 5EB4A 5J5NA 1B37A 1TRVA 1VRSD 1E39A 4ML1A 1D7YA 3GYIA 4G9HA 2J3NA 2DJKA 2YR6A 4BWQA 4ECHA 4LMWA 2PVOC 4ZL9A 2TIRA 1TDOA 2GR1A 4RG3A 2YR5A 1F6MC 3LOVA 3VR8A 14GSA 2EC4A 5G5FA 1SL2B 2C4CA 1SJ6A 1XDIA 1J9BA 4MP4A 1FAAA 3DD3A 2C67A 3FZ9A 3SZFA 1TI3A 2HFDA 1ZMCA 2QAEA 1T4ZA 4JU5A 1CC6A 4QFDA 2PMTA 2E7PA 3D0ZA 3NNEA 5E59A 3UVTA 3ICRA 2RLIA 2YN1A 1C72A 4A6NA 1KNGA 4ICYA 2ZZ0A 4DEJA 4IQAA 6GSXA 2C3TA 1RSGA 1Z7PA 2WDVA 3EC3A 5FS6A 4GRFA 5CO3A 5KMQA 3JSKA 3KP9A 3TRPA 5LD0A 2R4VA 2QC7A 4L0UA 1E2YA 2GR0A 4Z26A 2FWHA 3WT1A 3ISOA 2PPTA 3L8KA 2E0QA 3UEMA 2R9ZA 4J31A 4TR0A 5IOWA 2O9ZA 2REMA 5M10A 5G31A 3GD4A 1Z6LA 3GX8A 5GAPD 3DMLA 2TRCP 1TRUA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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