3IHGA

Crystal structure of a ternary complex of aklavinone-11 hydroxylase with fad and aklavinone
Total Genus 164
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
164
sequence length
535
structure length
535
Chain Sequence
MNDHEVDVLVVGAGLGGLSTAMFLARQGVRVLVVERRPGLSPYPRAAGQNPRTMELLRIGGVADEVVRADDIRGTQGDFVIRLAESVRGEILRTVSESFDDMVAATEPCTPAGWAMLSQDKLEPILLAQARKHGGAIRFGTRLLSFRQHDDDAGAGVTARLAGPDGEYDLRAGYLVGADGNRSLVRESLGIGRYGHGTLTHMVGVIFDADLSGIMEPGTTGWYYLHHPEFKGTFGPTDRPDRHTLFVEYDPDEGERPEDFTPQRCVELIGLALDAPEVKPELVDIQGWEMAARIAERWREGRVFLAGDAAKVTPPTGGMSGNAAVADGFDLAWKLAAVLQGQAGAGLLDTYEDERKVAAELVVAEALAIYAQRMAPHMAEVWDKSVGYPETLLGFRYRSSAVLATDDDPARVENPLTPSGRPGFRGPHVLVSRHGERLSTVDLFGDGWTLLAGELGADWVAAAEAVSAELGVPVRAYRVGAGLTDPESAVSERYGIGKAGASLVRPDGIVAWRTDEAAADAAQTLEGVLRRVLDR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Flavoprotein, oxidoreductase
molecule keywords RdmE
publication title Structural basis for substrate recognition and specificity in aklavinone-11-hydroxylase from rhodomycin biosynthesis.
pubmed doi rcsb
source organism Streptomyces purpurascens
total genus 164
structure length 535
sequence length 535
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature ec 1.14.13.180: Aklavinone 12-hydroxylase.
pdb deposition date 2009-07-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01494 FAD_binding_3 FAD binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.9.50 Alpha Beta 2-Layer Sandwich D-Amino Acid Oxidase; Chain A, domain 2 D-Amino Acid Oxidase; Chain A, domain 2 3ihgA02
3.40.30.120 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3ihgA03
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 3ihgA01
3GDNA 4Z2TA 2XFOA 1V59A 2V5ZA 2C70A 3GMCA 3DK8A 4ZCDA 3RHAA 1CJCA 3CGEA 2C65A 2JB2A 2YQUA 3DJGX 4JNQA 5J7XA 3UOVA 3RP6A 3BI4A 3NKSA 1NENA 3K30A 2XVFA 4AT2A 3IHMA 3NNEA 2R0GA 3CNJA 2WS3A 3CIRA 3K7QX 4AOSA 4D03A 1VQWA 1S2QA 4CY6A 2PYXA 2YR6A 2JB3A 4JY2A 4U2TA 4YTMA 4EQSA 5KXJA 2UZZA 1TDOA 2Q0KA 2RGOA 1ELIA 1NDAA 1F8WA 2OA1A 3R9UA 1EL7A 2OALA 3BHFA 1CHUA 4RSLA 4BV6A 3FPZA 4LA1A 3VR9A 2C64A 3DJJA 3VRAA 3LB8A 1PBBA 1O95A 1DJQA 2Z5YA 2WPFA 1JU2A 4U8NA 4I59A 4H2RA 2WPEA 1TDFA 3GYJA 2R0PA 4A6NB 3RNMA 1JEHA 2B9YA 1RP0A 4J56A 3NYFA 3O0HA 2YM1A 3QFBA 4IA5A 4YWOA 3LXDA 3VRBA 4JDRA 3NYCA 4USQA 3BNMA 3ATQA 1NHPA 4IA6A 1GPEA 4B69A 1NG3A 1B37A 3DA1A 4OPCA 3NK1X 3CPHG 1N4VA 2GRTA 4OPUA 2FJEA 1FEBA 1OJTA 4H7UA 1JRYA 3LJPA 3CNPA 2C72A 1GEUA 3EAOA 4A7AA 3F8PA 1D4DA 4UDRA 4K5RA 1D7LA 3AWIA 1IUUA 2JAEA 3UTEA 3ATRA 4YSXA 2BCGG 4EIPA 4PAAA 1K0IA 2X50A 2V61A 2B9WA 4TM1A 5J60A 3P4PA 2ZZ0A 4B68A 4CCQA 3AE1A 1N4WA 1X31B 2I0ZA 4UDPA 1E1KA 3QVPA 3GRTA 1XDIA 2C75A 4CBQA 3AEGA 4NZHA 4K5SA 1OJCA 1VG0A 3CNDA 2AAQA 1Y56B 1H84A 1H7XA 2GAGB 5KWFA 1D7YA 3AYIA 2FJAA 1ONFA 3M13A 2A8XA 3EANA 4B67A 1B4VA 1B5QA 2XLRA 4BK3A 1M64A 2R45A 1H7WA 1GRBA 3NTAA 3GSIA 3LZXA 3REDA 4OPIA 1FCDA 3H8IA 1OJAA 4Y4MA 4YKFA 4J34A 4BURA 4ZN0A 4BK2A 3L8KA 4P9SA 2WOVA 2YR5A 4YTPA 3SFEA 3GMBA 4TLXA 4YTNA 1RSGA 4OPDA 2V6OA 5HXIA 4FDCB 1P2HA 3UKKA 1ZDLA 3DK4A 4EMIA 2VVLG 3G5RA 1GRTA 1HYUA 4DNAA 2YG3A 2OAMA 1PXBA 2Q0LA 3L1RA 2GF3A 1LJ1A 2YG4A 3NH3X 3CGBA 4XXGA 5CQFA 4A6NA 4DSHA 5IQ1A 4U8MA 4MJWA 1E1MA 1CF3A 1CBOA 3ALLA 1CJ3A 1KSUA 3DH9A 2FBWA 5JCMA 2NPXA 2X8GA 1QO8A 3Q6JA 4REKA 1NHRA 5FS9A 4CY8A 2GB0A 2GVCA 2QCUA 4Z43A 1YKJA 2Q7VA 3ISHA 4WCTA 3NRNA 1F8RA 2VVLA 3AE2A 1Q9IA 4BJZA 5EOWA 3AE8A 1GRFA 2EQ8A 2GEWA 3BNUA 3QSSA 4ICYA 5EB5A 4CNKA 1ZP0A 3AEAA 2WBAA 4OPLA 1TYTA 1OJDA 1GV4A 3I6DA 1KNPA 2GH5A 3UP5A 1LTXR 2VQ7A 4H4VA 4A99A 3JSKA 2C67A 3PO7A 2YVJA 3NK0X 1TDNA 1OJ9A 2YAUA 1L0VA 1CC6A 4J2WA 2XFPA 4NTDA 1F8SA 4TM4A 1P2EA 2B9XA 1GALA 1KFYA 3EF6A 3RP7A 1LQUA 2XLPA 4EQRA 2BC1A 1MO9A 2H88A 3FIMB 1F6MA 2YLWA 5BRTA 2GQFA 1KSSA 4OVIA 4K7ZA 3B6DA 4H4XA 1GXFA 3DGHA 5BULA 1D5TA 1ZOYA 2XLTA 5EB4A 4O5QA 4YSZA 3UKAA 3AXBA 3NLCA 3NN6X 3IHGA 3ZYXA 1YQ4A 1L9DA 1BGNA 2WDVA 2DKHA 1PS9A 4U2SA 3SQPA 3AD8B 2GR3A 1ZKQA 2YWLA 3C4AA 4H50A 4H4WA 3E1TA 2YG5A 5JCIA 1B8SA 3DJEA 2C73A 1F3PA 1S3EA 1GRHA 3I3LA 1CJ2A 1GNDA 1BGJA 1ZY8A 3KVEA 1JNZA 2WPCA 2C7GA 2RABA 2B7SA 3V3NA 2WP6A 4H4TA 4X9MA 4GR1A 5HYMA 1DJNA 2XVEA 3RP8A 1K4QA 4RG4A 4H2NA 1N4UA 3BI5A 4I58A 4WX1A 4USRA 2XLSA 1YY5A 1PBDA 4OCGA 2BACA 2Y6RA 3NHOX 1O94A 4B64A 1DXLA 3IF9A 2XFQA 4IVMB 3AYJA 4EQXA 1EL9A 1VRQB 4OPTA 1GETA 1XPQA 4JY3A 2X8CA 3DGZA 4FK1C 5GSNA 4E0VA 4BK1A 2ACZA 4Y4LA 1DOCA 3NT6A 4TLZA 1KNRA 2WDQA 4JNAA 1JNRA 1D4EA 2XFNA 4B1BA 4H4QA 4M52A 3ALJA 2BS3A 2GMJA 4Z26A 2Y6QA 1BWCA 3ZDNA 3FG2P 3VR8A 3NN0X 2APGA 4GUVA 4C3YA 4GF7A 3KPFA 4HA6A 2XYOA 1PJ6A 3CGDA 3ITJA 5U1OA 3D1CA 4C77A 1IUTA 3UTGA 1PBFA 3IC9A 5BVAA 1NEKA 2B76A 1Q1WA 4NEWA 2YG7A 4C3XA 1CC2A 2XLUA 2X3NA 4AP3A 1FL2A 3D8XA 1KF6A 2XDOA 3ABVA 2CFYA 3G5SA 4B65A 2WU2A 3FBSA 2WOWA 3DK9A 3BHKA 4A65A 3P4RA 1NPXA 3IWAA 1DOBA 4GCMA 2JK6A 4H4ZA 1E6EA 3CTYA 1H82A 4RG3A 4CCRA 3H8LA 3AE9A 4U8OA 1GOSA 4GDEA 2TPRA 3GRSA 3UP4A 3NGCX 2YVFA 5KOWA 2GQWA 2VRLA 4C74A 2C66A 3ICSA 4YT0A 2O9ZA 4U8KA 2EQ7A 3T37A 4LU6A 3KA7A 2BABA 1D4CA 2VQBA 3DJDA 5M0ZA 2R4JA 5KVHA 3F8DA 3P4SA 1EBDA 2Z5XA 1YQ3A 2VVMA 4D04A 2WETA 2H89A 4K8DA 2GR1A 1DNCA 1CL0A 3GD3A 1ZMCA 4N9XA 3CNTA 4Z25A 2C3CA 1CC4A 5FS6A 1LV0A 3UKPA 1COYA 4H4RA 4H4UA 1QLBA 3QJ4A 4YKGA 3CN8A 1PDHA 1PHHA 5FS8A 1BF3A 2OLNA 3B3RA 4Y4NA 1LVLA 2WESA 2PHHA 1DODA 3M12A 1Z6LA 1ZMDA 2YLZA 3Q9TA 4Z2RA 1GTEA 1PXAA 3GWFA 2XVHA 1GERA 4EM4A 5M10A 5HHFA 2A87A 4A9WA 1TDKA 1E39A 3AB1A 5GRTA 1K0JA 4J31A 3GYIA 1IUXA 1Y56A 5JCNA 3ICTA 3CPIG 2EQ9A 3NIXA 2ZZCA 1IUWA 3II4A 3PVCA 3UOXA 1E1LA 1W4XA 1H6VA 5KOXA 3OC4A 3QSEA 3OZ2A 3VRDB 4YXDA 3QFAA 4FX9A 1AOGA 1GRGA 4B66A 3AECA 4H4PA 1IUSA 2YG6A 1CJ4A 4PABA 2BC0A 1S3BA 1ZK7A 2BS2A 4U2LA 3PS9A 2YVGA 2IVEA 4JN9A 2BS4A 1EL8A 1NHSA 2V3AA 1FECA 4DSGA 4A5LA 1MOKA 1K0LA 4B63A 2F5ZA 3M0OA 1RYIA 2R4EA 3KLJA 1H83A 1PXCA 1S2YA 2JKCA 4CNJA 1EL5A 4UDQA 2IVDA 3FMWA 1YQZA 1SEZA 4ADWA 1GRAA 5LV9A 4O5UA 1QJDA 3KD9A 5L46A 4UP3A 1GSNA 2BK3A 1BKWA 2E4GA 2YLTA 3URHA 3QVRA 2YM2A 1NAAA 1PBEA 1VDCA 2FJBA 3GWDA 5FMHA 2DKIA 2HQMA 1JRXA 1XHCA 2RGJA 4H2PA 3AD7B 3HZLA 2XVIA 3H4KA 4ZCCA 1FEAA 2RGHA 3UOZA 1FOHA 1H81A 1NHQA 2J3NA 3P1WA 4EMWA 3UKFA 5HY5A 1E1NA 3UKQA 3AYLA 2NVKX 4GDPA 4X9NA 3GD4A 2WOIA 3NTDA 3V76A 1XANA 2V60A 4APNA 5BUKA 2QA1A 5TR3A 2ZBWA 1TYPA 2IIDA 3CNSA 1GESA 3DMEA 5EBKA 1N1PA 2GV8A 1Q1RA 3AEEA 3AE6A 3VQRA 3ADAB 1LQTA 4EIQA 1GTHA 2WHDA 4H2QA 4K22A 3UOYA 1UKVG 2WP9A 3ICRA 2C76A 4YSYA 5U63A 4X4JA 4GRTA 4Z24A 2VZ2A 3QSMA 3C96A 4NTEA 2E1MA 2XCGA 1PBCA 5IQ4A 3K7TA 4AT0A 3LADA 5IPYA 3AE5A 3P4QA 4HB9A 2WP5A 5ER0A 2XVJA 2R0CA 1L9CA 4Z2UA 2AQJA 4NEVA 3SM8A 5JCKA 3V3OA 5C3JA 3NK2X 4U8IA 2WU5A 5KRQA 1M6IA 1TRBA 2OLOA 3AEDA 2CDUA 4FK1A 4CRTA 3LZWA 2YLRA 1MXTA 4AP1A 4IVOB 4XWZA 1PJ7A 4KPRA 3UTFA 3F8RA 1IJHA 2YLSA 3AEFA 3S5WA 2TMDA 1PN0A 2WEUA 3AE7A 1JOAA 4NTCA 3CPJG 4OPGA 1H86A 2X99A 2VRMA 2JBVA 4AOXA 1GREA 2BA9A 3UCLA 4ECHA 3CGCA 1E7PA 3P9UA 1BZLA 2BK5A 1Y0PA 2BXSA 3G5QA 2E5VA 2AR8A 1VG9A 4JQ9A 1NG4A 2WQYA 5CKUA 2BYBA 5KVIA 1KDGA 2YLXA 3NG7X 3WE0A 3NYEA 3AEBA 2BK4A 1ZOVA 2QAEA 3KU9A 2VOUA 3C4NA 3SFDA 4EQWA 2GR2A 3EPTA 4TM3A 4H4SA 2B7RA 1REOA 3AE4A 3KKJA 2XFUA 5U25A 2W0HA 4LIIA 4K2XA 2Q6UA 1IUVA 3LOVA 5JCLA 2YR4A 3AE3A 4J36A 3COXA 3UKLA 2WDRA 4DGKA 1LPFA 2C3DA 4U8JA 1TDEA 4U8LA 4U8PA 2BCPA 1L9EA 4IV9A 2R9ZA 1JRZA 2EQ6A 2BXRA 4BJYA 1PJ5A 3AD9B 1DOEA 4Z44A 2CULA 3ALMA 3SGLA 4A79A 2GAHB 1ZX9A 2JB1A 2A89A 4XWRA 2X8HA 3BI2A 4EMJA 2CVJA 4C5OA 4KX6A 4YSHA 2GMHA 2QA2A 2ARDA 4TM0A 3S61A 3GDPA 2GR0A 3UKHA 3UTHA 3K7MX 1GT8A 2R46A 4H4YA 2V3BA 4J57A 4EM3A 2FJDA 5DBJA 5FS7A 4J33A 2ZZBA 1O5WA 5C2TA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3QAGA 2VCWA 1A23A 2YV7A 2XFOA 1V59A 4MABA 2V5ZA 1WP0A 1A2LA 4ZCDA 1YQ1A 2YQUA 3DJGX 4JNQA 5J7XA 3NKSA 1NENA 3L9VA 2HZFA 3CNJA 2MYGA 1XVWA 5BULA 2JB3A 4D73B 2UZZA 4USSA 3EMPA 4X1UA 2RGOA 1NDAA 4TR3A 2J9HA 2OALA 4RSLA 1CHUA 1GTBA 2DC5A 3W4JA 1C0KA 1O95A 2HZEA 2WPFA 3ZYWA 3EC3A 3UL3A 3T2KA 4A6NB 5DVBA 4IA5A 3BNMA 3ATQA 4B69A 1NG3A 3ZTLA 4OPCA 2P31A 1T00A 3NK1X 1N4VA 2GRTA 1PQNA 1SYXA 2VIMA 1FEBA 2L4CA 4V2LA 3LJPA 2OE0A 3EAOA 4A7AA 3F8PA 1VF2A 1HNAA 2NBSA 1D7LA 4DSRA 3SX6A 3CYNA 2JAEA 4QL7A 3ATRA 3F3QA 1K0IA 4X0XA 1YEPA 4TM1A 3AE1A 2FA4A 1GSQA 1AAZA 1E1KA 3QVPA 3AEGA 1C0PA 4K5SA 4PQHA 2D2ZA 1VG0A 4EVMA 2H72A 3CNDA 2AV4A 5KN0A 2F3MA 1H7XA 2LUSA 3AYIA 2MMNA 2IIYA 4GQCA 3US3A 3SY4A 2I1UA 3NTAA 1FCDA 3H8IA 3GH9A 1OJAA 3CMMA 4J34A 4BURA 5D9VA 4ZN0A 2NTOA 3L8KA 2YR5A 2KP1A 1GTUA 3KTLA 4I5QA 3A3TA 1EEJA 3HJOA 4V2NA 1HYUA 1GRTA 2WULA 2OAMA 3L1RA 3NH3X 3UTEA 2GF3A 1EV4A 2YG4A 2ZUPA 3CGBA 1UN2A 4A6NA 4MJWA 1CF3A 2C0FA 4MZBA 3DH9A 3H79A 4I2TA 1A8YA 2FUG2 2GT5A 4CY8A 4Z43A 3GN3A 1V9WA 2QSIA 2C80A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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