3KONA

Crystal structure of cobalt (ii) human carbonic anhydrase ii at ph 11.0
Total Genus 73
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
73
Knots found
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
HHWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Comparison of solution and crystal properties of Co(II)-substituted human carbonic anhydrase II.
pubmed doi rcsb
molecule tags Lyase
source organism Homo sapiens
molecule keywords Carbonic anhydrase 2
total genus 73
structure length 258
sequence length 258
other databases KnotProt 2.0: K +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2009-11-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 3konA00
1H4NA 3M2XA 3MHIA 4XZ5A 3DVCA 2WEOA 2H4NA 1DMXA 4M2VA 1G0EA 1BNTA 1BNVA 3P3JA 5JGTB 3HKUA 3DV7A 1JCZA 1Z93A 5JG3B 1FSRA 4YYTA 1BV3A 1TB0X 2NXRA 3P5LA 4MLTA 3B4FA 5FNKA 5A6HA 2CBAA 4RUZA 4LHIA 3M67A 4XFWA 3V3FA 1CNJA 4RFDA 5DSMA 3RZ8A 1G1DA 3IBLA 3P58A 5G0BA 4M2UA 3DCSA 1LUGA 4Q7PA 4YXUA 7CA2A 1RZEA 4Z1JA 3U45X 1RAYA 5DSLA 1I9MA 3RG3A 1RZBA 3M3XA 4QSIA 3DVDA 3KOKA 3P3HA 4XE1A 2FNMA 4QJMA 1CINA 1TEQX 3P5AA 5BRVA 3VBDA 4ZX0A 3W6IA 3ML5A 1CVHA 3SBHA 2O4ZA 1UGEA 4YGJA 3KIGA 3T5ZA 1THKA 2AW1A 5AMLA 1G4JA 1BNNA 3MDZA 5DOHA 3M2ZA 2CA2A 3R16A 4HEZA 3M1QA 1YO1A 1I9LA 6CA2A 5EH5A 3T84A 1I90A 1I9NA 3D9ZA 4KAPA 2QP6A 3HKNA 1Y7WA 1HEDA 4GL1X 1CZMA 4KNNA 2FNNA 1YDDA 1H9QA 3PO6A 1CAJA 4XIWA 5FNLA 2FOYA 5EZTX 1KOQA 1LG5A 1FQRA 4YHAA 1BN1A 3M5EA 3D92A 4K1QA 2HFWA 1CNGA 1HCBA 4QSJA 5JGSB 1CAIA 2WEJA 2WD3A 5FLRA 1DMYA 3EFIA 5SZ6A 5SZ5A 3FW3A 1UGGA 5EKJA 8CA2A 2CBBA 1EOUA 3F7BA 3L14A 4Q6EA 5FNIA 4CNXA 3V3JA 3BETA 1OKLA 5E5UA 1IF5A 4QK2A 1ZE8A 3ZP9A 2POVA 2ZNCA 4WR7A 4DZ9A 3M04A 1JD0A 1CNXA 1FSQA 5SZ1A 4RUXA 2NNOA 1IF7A 4BF6A 1RZDA 2Q1BA 1CVFA 3S71B 2W2JA 5E2NA 4ILXA 1KWRA 4E3GA 1YDCA 4Q0LA 2FW4A 4QY3A 3T5UA 4UOVA 3R17B 5FDCA 4YXIA 1LZVA 4KP5A 4BF1A 2CBCA 2CBEA 3DC9A 4HEYA 1G48A 1XQ0A 2HD6A 1F2WA 4IWZA 5EKMA 3PJJA 1FR7A 5FLOA 5IPZA 5DSJA 1CAHA 1IF9A 2NWYA 2NXSA 4KNMA 5HPJA 3S8XA 1V9IC 3RYJB 1UGAA 4MDMA 3NI5A 4RIUA 4Q83A 5G03A 4YX4A 5E2SA 2H15A 5EHVA 1V9EA 4IDRX 4QSBA 1AZMA 3SAPA 4FRCA 3M2NA 3JXGA 5AMGA 5SZ4A 3RYVB 1T9NA 3S72B 4KV0A 1ZSBA 4YGNA 2X7UA 2EU2A 4YXOA 1UGBA 4PXXA 5BRUA 4QSAA 4RIVA 3OIKA 1XPZA 1CCTA 2POWA 1G3ZA 3MNJA 3T85A 5FLPA 1CVBA 4JS6A 4ZWXA 3N0NA 1ZFKA 4M2RA 5SZ0A 3KNEA 1BNWA 3BL1A 3MZCA 2NWPA 4ZAOA 4L5WA 1AM6A 1YDAA 4HT0A 4MLXA 1CANA 1RJ6A 12CAA 2X7TA 4RUYA 5FNJA 3M1JA 2NWOA 3TMJA 4Q7WA 5C8IA 4JSZA 4WUPA 3MNUA 1I9QA 5EH7A 3U3AX 4CNRA 1OQ5A 1J9WA 4Q6DA 1CNBA 4L5UA 1RZCA 3OYSA 2ABEA 2FMGA 1HUGA 3KOIA 5EOIA 3M96A 1IF4A 1CNKA 4E3FA 3HKTA 1YO2A 4WUQA 5JQ0A 4G0CA 4MTYA 3M14A 5JESB 1CRMA 4Q90A 3S78B 3P55A 5DSRA 5DSIA 5SZ2A 1FLJA 1CAZA 4KNIA 4Q06A 5EHEA 4PQ7A 5E2KA 5CA2A 4Q87A 4ZX1A 4CQ0A 3K34A 5J8ZA 3MNIA 1CNWA 2QO8A 5FNGA 3Q31A 4E3DA 3CA2A 1JV0A 2NXTA 1G46A 3K2FA 4E4AA 4QK1A 1CAMA 3SAXA 3GZ0A 5E2RA 1ZNCA 3F7UA 1BNMA 1TBTX 1I9PA 5FLSA 5CLUA 1FR4A 3RYYA 3OIMA 2ILIA 1ZSCA 4Q7SA 3IAIA 1ZGFA 1KEQA 4TWLA 3UYNA 5CACA 4Q09A 4ZWIA 3S97A 2QOAA 3RZ7A 1TE3X 4C3TA 3HS4A 2FMZA 4Q07A 5CJFA 3D8WA 3MHCA 1RAZA 3PYKA 1UGFA 5G0CA 4LP6A 1BICA 1FQLA 5LMDA 2EU3A 1CCUA 5E28A 3S73B 3V2MA 2WEHA 4JSSA 4MDGA 3DCWA 1CA2A 4FVOA 1CNHA 1UGDA 4ETQC 3TVNX 5DSNA 1TG9A 4M2WA 1BZMA 2Q38A 3MHOA 3OILA 3M1WA 1A42A 5SZ3A 4R59A 3V3IB 4QIZA 3M40A 1H9NA 1CAYA 4E5QA 1IF6A 3DA2A 4DZ7A 3RG4A 1BNUA 1CALA 3RJ7A 5SZ7A 1ZFQA 1G52A 1I8ZA 1UGCA 3RYZA 3P44A 3DVBA 4YVYA 3S77B 4PZHA 3V5GA 5JQTA 1DCBA 1BCDA 4JSWA 4Q7VA 4QIYA 4QTLA 4N0XB 5BRWA 3IBIA 2CABA 4Q08A 3M2YA 1KWQA 1CVEA 3KS3A 4Y0JA 2Q1QA 1FQNA 5FLQA 3V2JA 5FLTA 4FU5A 1DCAA 3KWAA 5FNHA 1LGDA 3CYUA 3HLJA 1CVCA 5JEGB 5L6KA 4QJ0A 3V7XA 4Z1NA 2X7SA 5JG5B 1HVAA 4CA2A 1CAKA 1MOOA 4Z1EA 4HT2A 4YGLA 1I91A 3DCCA 3MHMA 1CCSA 2FNKA 3NJ9A 4HF3A 3TVOX 4KUYA 4YGKA 5JEPB 3IBUA 1TG3A 3MMFA 3MNKA 3JXHC 4K0ZA 5DSKA 3DBUA 4QJXA 2NNVA 1HEAA 2WD2A 4MO8A 5EIJA 3EFTA 3OKVA 1FQMA 2FOVA 2IT4A 1CIMA 1ZH9A 1URTA 1BN3A 3HFPA 4RFCA 5DSPA 4Z0QA 3CZVA 2AX2A 1CNIA 3RYXB 4Q9YA 1YDBA 4HU1A 3FFPX 3LXEA 1CVDA 3RZ0B 3KKXA 2HOCA 3S74B 3DAZA 1YO0A 3D93A 1FSNA 3MHLA 2OSFA 3IEOA 5EHWA 3RLDA 4KNJA 4KP8A 4CNVA 4ZWZA 1CNCA 4KUVA 5DRSA 1G45A 3IGPA 4FL7A 3MWOA 1I9OA 3F8EA 4Q8XA 4CNWA 1G0FA 1G6VA 1Z9YA 3IBNA 1KOPA 4COQA 1TH9A 2EZ7A 3N4BA 2HNCA 1G4OA 1TEUX 3T83A 1XEGA 1HCAA 5G01A 9CA2A 3RZ5A 3CAJA 4R5BA 3MNAA 1Z97A 3ZNCA 3DC3A 2GD8A 3BL0A 4K0TA 3DD8A 2F14A 1HECA 5AMDA 5DVXA 1G54A 4PYXA 3B1BA 3QYKA 1XEVA 3W6HA 3OY0A 3OKUA 3M1KA 1RJ5A 3DD0A 4KUWA 4ITOA 3N2PA 3NB5A 4FPTA 5BNLA 1RZAA 4XIXA 4PYYA 4LU3A 4Q8YA 3D0NA 4Q8ZA 4JSAA 4ZWYA 1LG6A 4Q49A 1G53A 4MDLA 3P4VA 4Z1KA 2NN1A 2FOSA 5EH8A 4CACA 2NWZA 4YWPA 3OYQA 2NNSA 3RZ1B 4FVNA 1CNYA 5E2MA 2NNGA 4Q78A 1HUHA 5FL5A 2NMXA 4WL4A 4WW6A 5DOGA 4G7AA 1CAOA 5DSQA 1OKNA 4R5AA 4WW8A 3S76A 1CA3A 1BNQA 3KLDB 3ML2A 5FDIA 3RGEA 4QEFA 2GEHA 3M5TA 4E9OX 4YGFA 3FE4A 4K13A 2FOQA 4ITPA 1CILA 1AVNA 4TWMA 4E49A 1ZSAA 1HEBA 3SBIA 3UYQA 2HL4A 1BN4A 3V3HB 3KONA 3MNHA 4Q99A 4RN4A 5EKHA 3S9TA 1TTMA 5E5RA 2NN7A 5DSOA 4E3HA 4QJWA 2OSMA 5BYIA 3N3JA 2FOUA 2VVBX 5JEHB 1IF8A 4HBAA 4QK3A 2CBDA 3MYQA 3U47A 3K7KA 3C7PA 4FIKA 4K0SA 4N16A 1ZGEA 1CVAA 3HKQA 4RH2A 5JDVB 2WEGA 2VVAX 3F4XA 4Q81A 3M98A 5L3OA 2POUA 4QJOA 2HKKA 1CRAA 3V3GB 4L5VA 5FNMA 5A25A 3T82A 4QJPA 4X5SA 3JXFA 5FL6A 1OKMA 3U7CA 5FL4A 3M5SA 3S75B 4HEWA 1MUAA 4BCWA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1H4N A;  3M2X A;  3MHI A;  4XZ5 A;  3DVC A;  2WEO A;  2H4N A;  1DMX A;  4M2V A;  1G0E A;  1BNT A;  1BNV A;  3P3J A;  5JGT B;  3HKU A;  3DV7 A;  1JCZ A;  1Z93 A;  5JG3 B;  1FSR A;  4YYT A;  1BV3 A;  1TB0 X;  2NXR A;  3P5L A;  4MLT A;  3B4F A;  5FNK A;  5A6H A;  2CBA A;  4RUZ A;  4LHI A;  3M67 A;  4XFW A;  3V3F A;  1CNJ A;  4RFD A;  5DSM A;  3RZ8 A;  1G1D A;  3IBL A;  3P58 A;  5G0B A;  4M2U A;  3DCS A;  1LUG A;  4Q7P A;  4YXU A;  7CA2 A;  1RZE A;  4Z1J A;  3U45 X;  1RAY A;  5DSL A;  1I9M A;  3RG3 A;  1RZB A;  3M3X A;  4QSI A;  3DVD A;  3KOK A;  3P3H A;  4XE1 A;  2FNM A;  4QJM A;  1CIN A;  1TEQ X;  3P5A A;  5BRV A;  3VBD A;  4ZX0 A;  3W6I A;  3ML5 A;  1CVH A;  3SBH A;  2O4Z A;  1UGE A;  4YGJ A;  3KIG A;  3T5Z A;  1THK A;  2AW1 A;  5AML A;  1G4J A;  1BNN A;  3MDZ A;  5DOH A;  3M2Z A;  2CA2 A;  3R16 A;  4HEZ A;  3M1Q A;  1YO1 A;  1I9L A;  6CA2 A;  5EH5 A;  3T84 A;  1I90 A;  1I9N A;  3D9Z A;  4KAP A;  2QP6 A;  3HKN A;  1Y7W A;  1HED A;  4GL1 X;  1CZM A;  4KNN A;  2FNN A;  1YDD A;  1H9Q A;  3PO6 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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