3KWAA

Polyamines inhibit carbonic anhydrases
Total Genus 73
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
73
Knots found
sequence length
256
structure length
256
Chain Sequence
HWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Polyamines inhibit carbonic anhydrases by anchoring to the zinc-coordinated water molecule
pubmed doi rcsb
molecule tags Lyase
molecule keywords Carbonic anhydrase 2
total genus 73
structure length 256
sequence length 256
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2009-12-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 3kwaA00
4XIXA 3BL0A 3DD0A 5DSRA 2CABA 4Q81A 2FNNA 3N2PA 3NI5A 4MTYA 3P4VA 3M04A 3ML5A 5SZ5A 1UGAA 3SBHA 5FNJA 2POVA 4KV0A 1YO1A 5EOIA 4HU1A 4E3FA 1I90A 1IF7A 4IWZA 2H4NA 3MYQA 3U7CA 1FSRA 2FOVA 1I9OA 1UGCA 4Q99A 1CCUA 3F7BA 4PXXA 4RUXA 4YHAA 3C7PA 3P3JA 4TWMA 4UOVA 4YVYA 4ZWZA 4HEYA 3EFIA 2NNOA 2EZ7A 1TE3X 1CNJA 5EH8A 4YXIA 1BN1A 3QYKA 3RGEA 1CILA 2QO8A 3RZ1B 1G45A 4LP6A 4Q6EA 2FMGA 4N16A 3MWOA 5FL5A 4L5WA 4CNWA 1RZAA 3MNJA 4K0SA 5JG3B 5SZ0A 2HOCA 3MHMA 3MNKA 4E9OX 4MDLA 5EHWA 2CBBA 2FNMA 4Q7SA 4MLXA 1BNNA 4QTLA 3RLDA 4QSBA 2ABEA 1FQLA 1RJ6A 2GEHA 4ILXA 5L3OA 3OIKA 5EIJA 2WD3A 1CNIA 1CNXA 2FOYA 4YGLA 3RG4A 3IBLA 4CQ0A 1HUGA 2WEHA 3MNAA 3V3HB 4Z1KA 3KOKA 3W6IA 1RZDA 4MO8A 3RYJB 5DSOA 4CNXA 1RZBA 1FSQA 3BL1A 5G0BA 1LUGA 4PZHA 4QY3A 4Q06A 1TH9A 1AVNA 5FLPA 3L14A 3FE4A 2HL4A 2NXTA 1RAYA 3RZ0B 4QIZA 4HT0A 1KOPA 1YO2A 1G48A 3EFTA 1T9NA 1OKNA 4YWPA 4QJPA 1IF5A 1G0FA 5DSMA 3R16A 1KOQA 3DC3A 1F2WA 4RFCA 3MHOA 3ML2A 1BCDA 1CVFA 4R5BA 1ZSBA 4M2UA 1G1DA 5EKMA 1G52A 5EH5A 2WEOA 3NJ9A 4Q09A 4ITPA 5EKJA 5BRWA 3M1WA 1TG9A 4Q6DA 1CNKA 1JV0A 4XZ5A 1XEVA 2Q38A 5CLUA 3DC9A 3RYYA 5FNHA 5JEGB 4ZX0A 3M5EA 1TEUX 1HEDA 5JQTA 3Q31A 2CBAA 4BCWA 1CAZA 1CINA 4PYXA 5DSPA 2FW4A 4KUYA 1CIMA 1DMYA 1ZSAA 4FVNA 4JS6A 5CA2A 5JEHB 3M3XA 4HEWA 4RN4A 3CYUA 1Z9YA 3OIMA 5E2SA 3S73B 4FU5A 3GZ0A 4WUPA 5J8ZA 3W6HA 3DVBA 3B4FA 1CVAA 4PQ7A 3U3AX 4GL1X 3B1BA 3M2ZA 4RIUA 4ZX1A 4MDMA 5E5RA 1CNCA 5SZ7A 2FOQA 3S74B 5E2RA 4Q7WA 4E4AA 4KAPA 4MLTA 4ZWXA 3U45X 3P5LA 1RJ5A 3ZP9A 2X7UA 4QSIA 5IPZA 3V3GB 3MHCA 1CAHA 1FR7A 1UGGA 4LU3A 3T82A 1LZVA 4WR7A 1OKMA 3KKXA 1HEBA 3IGPA 1DMXA 5E2MA 5FLOA 4ETQC 1CA2A 3M2XA 2NN7A 4YGJA 1CNWA 5EHVA 4COQA 4Q0LA 3MNUA 5FLSA 9CA2A 1MOOA 5BRVA 3MDZA 4KUWA 3SAXA 3KONA 1KWRA 4RUYA 1EOUA 1HCBA 4YGFA 3S76A 3PJJA 4FPTA 3HKQA 3DBUA 1FR4A 4QSAA 4KNJA 1BNWA 1UGBA 2NNGA 2F14A 3P44A 3M1KA 5DVXA 4ZWIA 5DSNA 3P55A 4JSWA 2AW1A 2NXSA 4XFWA 3OILA 1HECA 3DCSA 1CVHA 1FLJA 3JXHC 5A6HA 4Q83A 3RYXB 2WEGA 4M2VA 4RFDA 1BN3A 4FL7A 1I9NA 1H9QA 4WW6A 4Q08A 5FNGA 1CANA 1TBTX 3TVOX 3RG3A 1G54A 3KWAA 5DSLA 4KNNA 5DSJA 4RIVA 1ZFKA 1TB0X 4Q49A 3MNIA 5FDIA 1Y7WA 3P58A 4HBAA 1CAMA 2EU2A 1THKA 1HUHA 3DA2A 2NWZA 3M1JA 5FLTA 3D8WA 4WUQA 1FSNA 2ZNCA 4N0XB 3T5ZA 3T84A 5FL4A 3DAZA 1CAIA 4WL4A 1G46A 1KWQA 5AMLA 1HEAA 1I9MA 4YXUA 3V3JA 3V7XA 5FLRA 3M5SA 4QK3A 5SZ4A 5DSQA 5JQ0A 1URTA 3TVNX 1H9NA 5BYIA 1CNGA 1BICA 2ILIA 4QEFA 3IBIA 3DCWA 3UYQA 1V9EA 1BZMA 1CAKA 1CCTA 5AMDA 1JD0A 3LXEA 4JSSA 4E49A 3IBUA 3F8EA 3S8XA 1CAYA 3V3FA 2X7SA 3CZVA 3RZ7A 4HF3A 3FW3A 4E5QA 5E28A 4DZ9A 5FDCA 1JCZA 1YDAA 4Q8YA 1BN4A 4XIWA 5JG5B 4TWLA 1AZMA 1ZNCA 5E2NA 5EHEA 2NN1A 1KEQA 1CCSA 1BNVA 4QSJA 3IBNA 1LGDA 3P5AA 5JESB 2OSFA 5CACA 4RUZA 2QOAA 2WEJA 4CNVA 1UGEA 3D0NA 3D92A 5SZ1A 5A25A 3M96A 1HVAA 1BNTA 3MNHA 1G4OA 4M2WA 4CACA 1YO0A 5DSKA 1XEGA 1Z93A 3RZ5A 4RH2A 4M2RA 1IF6A 1YDCA 4K13A 5G0CA 3F4XA 3U47A 6CA2A 5DSIA 3R17B 3DV7A 1CNHA 5EKHA 4MDGA 3UYNA 4KP8A 4QIYA 4FVOA 5BNLA 3M2NA 1CNYA 4YGKA 3HKNA 4Z1JA 4Q90A 1RZCA 3MMFA 2W2JA 3S75B 5G03A 4LHIA 3DVDA 3KOIA 1CALA 5LMDA 3T83A 5EZTX 3S77B 1CVBA 4C3TA 1XQ0A 3RZ8A 1TEQX 1UGDA 4YXOA 3MHLA 1ZSCA 4QJWA 4Z1EA 4K1QA 5CJFA 2NWPA 3RYZA 1ZGFA 4Y0JA 3JXGA 1G6VA 1H4NA 3K2FA 3VBDA 3HFPA 1V9IC 2POWA 1RZEA 2HNCA 4KNIA 5DOGA 3V2JA 4ZWYA 5SZ6A 1HCAA 1FQRA 3JXFA 5DRSA 4K0TA 1ZH9A 5AMGA 5FNLA 4DZ7A 1I91A 3OY0A 4KNMA 2CBCA 1CVCA 2FOUA 5C8IA 1I9LA 1IF4A 1TTMA 2CA2A 4QJ0A 3M14A 2HKKA 2HFWA 3KS3A 5FNMA 1FQMA 3CA2A 3SAPA 1CVEA 1UGFA 2NMXA 1LG6A 1ZGEA 2HD6A 4ITOA 4Z0QA 3V2MA 5BRUA 5EH7A 3OYQA 3M1QA 5JDVB 3KIGA 3N4BA 4E3GA 3HKUA 1I9QA 4FIKA 4JSAA 3T85A 4E3DA 5E5UA 5FLQA 2NWOA 3M40A 2VVBX 1BV3A 3HS4A 5L6KA 4Z1NA 3DCCA 1RAZA 3SBIA 3OKUA 4YX4A 3V3IB 2NNSA 3RYVB 1J9WA 4Q87A 1FQNA 1LG5A 2NWYA 3S71B 2O4ZA 4Q7PA 1YDBA 1G53A 2Q1BA 4Q9YA 4QJOA 2FNKA 3NB5A 2EU3A 1G0EA 4ZAOA 4R59A 3BETA 3N3JA 5FL6A 3TMJA 3IAIA 3ZNCA 4BF1A 1YDDA 4Q7VA 5SZ3A 4Q78A 1Z97A 4BF6A 3V5GA 4IDRX 1BNMA 3M5TA 1CVDA 3K34A 2QP6A 1IF8A 4K0ZA 1DCAA 7CA2A 1ZE8A 5SZ2A 1CRMA 5DOHA 3T5UA 2IT4A 2NNVA 1AM6A 12CAA 3S72B 1A42A 3OYSA 4KP5A 3D9ZA 4Q8XA 1OQ5A 4QJMA 1CRAA 5FNIA 2NXRA 4G0CA 1I8ZA 5G01A 4L5UA 1CA3A 3CAJA 3N0NA 3MHIA 3K7KA 2VVAX 5JEPB 3IEOA 4E3HA 2GD8A 1TG3A 3OKVA 5JGSB 3M98A 2Q1QA 3S78B 1G3ZA 1BNUA 2FMZA 3KNEA 3RJ7A 4YGNA 4HEZA 2POUA 4Q07A 2CBDA 1XPZA 2WD2A 4CA2A 4G7AA 4CNRA 3S97A 4X5SA 3D93A 2OSMA 1IF9A 1DCBA 4QK1A 4JSZA 3S9TA 1CAJA 2AX2A 4QJXA 4PYYA 3P3HA 3KLDB 8CA2A 3MZCA 4YYTA 4KUVA 5JGTB 1OKLA 1CNBA 1I9PA 3PO6A 1BNQA 4L5VA 3HKTA 3M67A 3FFPX 4FRCA 4Q8ZA 1ZFQA 5FNKA 1G4JA 3M2YA 1CZMA 3DVCA 5HPJA 1CAOA 5E2KA 2FOSA 4R5AA 3HLJA 2X7TA 3DD8A 4QK2A 1MUAA 2CBEA 4XE1A 4HT2A 3PYKA 3F7UA 4WW8A 2H15A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4XIX A;  3BL0 A;  3DD0 A;  5DSR A;  2CAB A;  4Q81 A;  2FNN A;  3N2P A;  3NI5 A;  4MTY A;  3P4V A;  3M04 A;  3ML5 A;  5SZ5 A;  1UGA A;  3SBH A;  5FNJ A;  2POV A;  4KV0 A;  1YO1 A;  5EOI A;  4HU1 A;  4E3F A;  1I90 A;  1IF7 A;  4IWZ A;  2H4N A;  3MYQ A;  3U7C A;  1FSR A;  2FOV A;  1I9O A;  1UGC A;  4Q99 A;  1CCU A;  3F7B A;  4PXX A;  4RUX A;  4YHA A;  3C7P A;  3P3J A;  4TWM A;  4UOV A;  4YVY A;  4ZWZ A;  4HEY A;  3EFI A;  2NNO A;  2EZ7 A;  1TE3 X;  1CNJ A;  5EH8 A;  4YXI A;  1BN1 A;  3QYK A;  3RGE A;  1CIL A;  2QO8 A;  3RZ1 B;  1G45 A;  4LP6 A;  4Q6E A;  2FMG A;  4N16 A;  3MWO A;  5FL5 A;  4L5W A;  4CNW A;  1RZA A;  3MNJ A;  4K0S A;  5JG3 B;  5SZ0 A;  2HOC A;  3MHM A;  3MNK A;  4E9O X;  4MDL A;  5EHW A;  2CBB A;  2FNM A;  4Q7S A;  4MLX A;  1BNN A;  4QTL A;  3RLD A;  4QSB A;  2ABE A;  1FQL A;  1RJ6 A;  2GEH A;  4ILX A;  5L3O A;  3OIK A;  5EIJ A;  2WD3 A;  1CNI A;  1CNX A;  2FOY A;  4YGL A;  3RG4 A;  3IBL A;  4CQ0 A;  1HUG A;  2WEH A;  3MNA A;  3V3H B;  4Z1K A;  3KOK A;  3W6I A;  1RZD A;  4MO8 A; 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