The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
77
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sequence length |
206
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structure length |
201
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Chain Sequence |
SMKQYVARLEKDFSLKEEEQRALTDYKSNDGEYIKKLAFLAYQSDVYQVRMYAVFLFGYLSKDKEILIFMRDEVSKDNNWRVQEVLAKAFDEFCKKIEYKKALPIIDEWLKSSNLHTRRAATEGLRIWTNRPYFKENPNEAIRRIADLKEDVSEYVRKSVGNALRDISKKFPDLVKIELKNWKLESKEINQVYKLASKFID
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
The Crystal Structure of smu.31 from Streptococcus mutans UA159
rcsb |
| molecule tags |
Unknown function
|
| source organism |
Streptococcus mutans
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| molecule keywords |
Putative uncharacterized protein smu.31
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| total genus |
77
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| structure length |
201
|
| sequence length |
206
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2010-01-05 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF08713 | DNA_alkylation | DNA alkylation repair enzyme |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Methyltransferase, Methionine Synthase (B12-binding Domains); Chain A, domain 1 | Methyltransferase, Methionine Synthase (B12-binding Domains); Chain A, domain 1 | ||
| Mainly Alpha | Alpha Horseshoe | Serine Threonine Protein Phosphatase 5, Tetratricopeptide repeat | ARM repeat domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2B6C A; 4X8Q A; 3L9T A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1O1R A; 1N4P A; 3CV0 A; 4I2Z A; 3QJZ A; 5FTP A; 4UQZ A; 3E4B A; 2M63 A; 3PDN A; 2XGM A; 4DX1 A; 2IJG X; 2R05 A; 4DPR A; 4U0S A; 3FU0 A; 3B7S A; 3UM1 A; 4AM9 A; 2WXJ A; 4CYM D; 3P1U A; 4LUN U; 4F1P A; 5C2Y A; 5CCL A; 2FBN A; 3FUD A; 3T5V A; 4M7C A; 4WNG A; 1G3N B; 4N3C A; 4CZ2 D; 2LUH A; 4U8Y D; 3APD A; 1D8E A; 3NOG D; 4EBA A; 2EIL E; 4I2W A; 4LG6 A; 2XEE A; 4U63 A; 4LCT A; 5JJ7 A; 2E0I A; 3LJN A; 3R7Q A; 4J8Y A; 4RQI A; 3NZS A; 2KBX A; 4XE0 A; 5AQB A; 2XS8 A; 3ASO E; 2XPY A; 3FHE A; 1PY1 A; 5FJY A; 4Q96 A; 4JXT A; 1XGW A; 3ZHE B; 5FQ4 A; 2ETC A; 2IO2 C; 4WWP A; 1DCE A; 2CFZ A; 3DSU A; 3G2U A; 5KNG A; 4ACL A; 3SQV A; 4HNA D; 4U0Z A; 4FHK A; 1BLX B; 1OT8 A; 5CED B; 5T8I A; 1K3Z D; 4GTR A; 3TAX A; 3CVN A; 4FLB A; 2J49 A; 3SFX A; 3TG5 A; 5HKP A; 4Y6C A; 1MX2 A; 3SY2 A; 1INZ A; 2MYO A; 4OAV B; 4BX9 A; 1TNZ A; 5ENO D; 4ATZ D; 3UPV A; 2FUL A; 5AIJ A; 3PNL B; 1IHB A; 2CHZ A; 4N3B A; 4C9B B; 5H7P A; 2IF4 A; 3QNK A; 2C0L A; 2XCB A; 4D10 C; 4M0M A; 3ASN E; 2MHK A; 4BES A; 4BT8 A; 4U0U A; 4EBA G; 3HRA A; 4GA2 A; 3AS8 A; 4EZK A; 5CRV A; 2J4B A; 3CVQ A; 2OND A; 2XGO A; 2Y0B G; 3RAU A; 3KEZ A; 1K7Y A; 2AXV A; 4R7L A; 4PDX A; 4GAA A; 4AP2 A; 2BED A; 3HIZ A; 5FQ7 A; 4GPM A; 3ZU7 B; 3HVE A; 4KVM A; 4GA0 A; 1SUY A; 2HM8 A; 2GRO B; 2H6I A; 3B13 A; 4XKC A; 1V2Z A; 5BNW A; 3UT7 A; 3NAW A; 3QWV A; 1N94 A; 3M1M A; 2WXP A; 3MGB A; 5CHE E; 4BFR A; 3R9M A; 4ILI A; 3ULQ A; 5E76 A; 5B1A E; 1RZ4 A; 1VDY A; 4G2V A; 3KSL A; 2ZU6 B; 2LXL A; 5AQA A; 5BPP A; 2AWI A; 3J5Q B; 2FEZ A; 4AXH A; 5ENQ D; 4HS2 A; 2XRY A; 4B93 B; 5ENP D; 3RJV A; 1ZBP A; 3ZGQ A; 3IHV A; 2XQ0 A; 3MKR A; 3CHP A; 3CGH A; 3ZXS A; 4FJZ A; 2QZA A; 5LP0 A; 1QYM A; 3ZNG A; 1LD7 A; 1OY3 D; 3LY9 A; 4NIK A; 2IY0 C; 3BG0 B; 2WMO A; 1OWN A; 2ION A; 4DX2 A; 5G04 C; 5BV0 A; 4JW1 A; 4GTT A; 4UWF A; 3ASG A; 1U3D A; 4DJA A; 1E7U A; 3PZ4 A; 4GZC A; 4I1O B; 5AYW D; 4U8V D; 5D66 A; 3ZPJ A; 3L08 A; 1TN6 A; 2F8Y A; 3O48 A; 4GML A; 3KAE A; 4DLO A; 2MOW A; 4FJY A; 3LEW A; 3TWT A; 1IHG A; 4HEH A; 3IKO B; 3QOU A; 1KZP A; 4OYS A; 1IQU A; 3ZYQ A; 3UI2 A; 5ENS D; 4BT9 A; 2JAB A; 4WWN A; 4J8D A; 3JXJ A; 4LNG A; 5C5E A; 4TXR A; 3TWS A; 4GTM A; 4BX8 A; 3PE3 A; 2JLB A; 2QY7 A; 4FC8 A; 5EIL A; 3EZX A; 2X6J A; 2XEV A; 4Z68 A; 5KBA A; 1HH8 A; 4HH3 C; 1FVH A; 4K5A B; 4U8H A; 4Y6W A; 1QBQ A; 3V30 A; 4DUI A; 4GTV A; 4XX5 A; 1JPL A; 2J09 A; 3HXD A; 4AY6 A; 1TYQ G; 5HQ8 A; 2HO1 A; 2R2L A; 4EHM A; 3ZYL A; 5KCM A; 1OXJ A; 1MYO A; 2WQH A; 4QFV A; 3CVY A; 4GZ6 A; 1AP7 A; 1FVF A; 4ATG A; 3D9P A; 2P9K G; 3HHM A; 1TR4 A; 1EF1 C; 5M72 A; 2KXP C; 1MX6 A; 2CHX A; 4HLE A; 2UWJ G; 5AAO A; 3LDZ A; 5J90 A; 4DX5 D; 5HRY A; 2YIN A; 4DLQ A; 4JGI A; 2FO1 E; 5EYL A; 1NA0 A; 1SVX A; 1K1A A; 1OWP A; 5JMN D; 4J8F A; 2J70 A; 5CER B; 2VJ8 A; 2IQC A; 1AWC B; 3UUX A; 3MKQ B; 2WQ7 A; 1TNO A; 4WUY A; 2WQ6 A; 2P9U G; 4GYW A; 2H6H A; 2OOE A; 4WNF A; 4YVO A; 3CHM A; 2P9I G; 3FUK A; 4GCO A; 3DSV A; 1TN8 A; 3HYM B; 3T8K A; 1JWF A; 4OVV A; 2V5Q C; 2IO3 C; 2LNI A; 3JYS A; 4CDM A; 1BU9 A; 2RKK A; 4A3T A; 4YDW A; 3LKU A; 4UWH A; 1N95 A; 4AOF A; 4DX7 D; 1ELK A; 1SA5 A; 3BU8 A; 3CK8 A; 4ANV A; 3CEQ A; 5ANR A; 2WM9 A; 3LVR E; 3CHO A; 1UOH A; 2EIJ E; 2FMM E; 3CQC B; 3CHQ A; 2WXI A; 3MZL B; 5LX8 A; 4IRU A; 3S2A A; 2DYS E; 3CK9 A; 3U64 A; 4GZD A; 2PZI A; 3D9N A; 2BUG A; 3L17 A; 1UTU A; 4O6F A; 2OVB A; 3C72 A; 5ENR D; 4JEH A; 5FQ8 A; 2VSY A; 3AG4 E; 3IHY A; 3ONL A; 4BWR A; 2X6F A; 2BF0 X; 4DI4 A; 3MX3 A; 1TNY A; 4Q94 A; 4HQD A; 3UKR G; 2XHE A; 4U95 D; 1SA4 A; 4YDO A; 3R7R A; 3EU9 A; 2ZXW E; 4LER A; 5CBN A; 2IU1 A; 3MKQ A; 5BXU A; 3RKV A; 1NP7 A; 3EHM A; 2Y4U A; 3OTN A; 4E85 A; 2X6I A; 3PRZ A; 3DXK G; 5AEN A; 1U2V G; 4CT4 A; 3GZ1 A; 1Z5S C; 2UY1 B; 5KJK A; 2VQ2 A; 3RK6 A; 1S0P A; 4O1P A; 3JQ0 A; 1WY6 A; 4TUU A; 4I1M A; 2WVI A; 5EN5 D; 3S7B A; 3Q75 A; 4K0R A; 3RU0 A; 1E8W A; 3AG1 E; 2P9S G; 5JA4 D; 3FUL A; 3E30 A; 4DRX E; 3MV2 B; 4KYO B; 1E7V A; 4NUR A; 3OXL A; 3B7U X; 4QQI A; 5B3S E; 5A7D B; 3RRM B; 2V4H C; 1LF8 A; 3ABM E; 2A5U A; 3O4Z A; 3UIN C; 5KJN A; 3W9F A; 5LCW J; 4GZ5 A; 2FI7 A; 2DYR E; 4JEU A; 4WNE A; 4FHJ A; 5CMW A; 4PUC A; 3Q4A B; 2L0I A; 3LXU X; 2I6H A; 4TXP A; 5AN8 A; 3D3M A; 3DEO A; 3FU5 A; 1D8D A; 3DXM G; 2KZT B; 3IEG A; 3C3R A; 3Q79 A; 5AJD A; 1PAQ A; 4RVB A; 3F6Q A; 4A1S A; 2WXG A; 4W9R A; 3CVW A; 3IBE A; 4HXI A; 1U3C A; 2X6H A; 4I9C A; 3EUV A; 3ZVV A; 1EYH A; 1LD8 A; 3ISM C; 2YHC A; 4BTB A; 2GW1 A; 3CSF A; 4J6I A; 2XCC A; 2VSX E; 4AEZ C; 1EPU A; 3UX4 A; 4UQX A; 3APC A; 1Z3X A; 3ZYK A; 3ASD A; 4Q69 A; 3QC1 A; 2CG3 A; 3PZ1 A; 4ACK A; 4TRQ A; 2I9C A; 2BKG A; 3FTW A; 3S7J A; 5A6C A; 2UY1 A; 3L54 A; 4GTQ A; 3D9I A; 5CRU A; 4A3V A; 3PE4 A; 1HG2 A; 4I43 A; 4N39 A; 3E33 A; 2A5E A; 1QTE A; 1H6K A; 3DEP A; 3DRA A; 4AJW A; 2YHE A; 1UJJ A; 3Q9N C; 1EDU A; 3ZYM A; 5FIN A; 3VLE A; 1L5J A; 5JJT A; 4GB9 A; 4HOQ A; 3V31 A; 3I4R B; 3IVA A; 1XNF A; 4G8L A; 1HZ4 A; 5HI7 A; 3QAR A; 1JCQ A; 4MS6 A; 2RD0 A; 3TWR A; 2GRR B; 3AG3 E; 1V55 E; 2J9Q A; 5FZR A; 3NOC D; 4JHK A; 3L22 A; 3V2O A; 5T3R A; 2I1K A; 5AJL A; 1MQS A; 5KNH D; 3MCX A; 3NQP A; 3WHP A; 1UW4 B; 1UN9 A; 2WB2 A; 3FUJ A; 4GTO A; 2KZT A; 1WG0 A; 3WG7 E; 4ABN A; 5BUZ A; 1NI1 A; 3DSX A; 3U4T A; 3CLJ A; 4URK A; 2LSU A; 3GYZ A; 3TXN A; 4BEP A; 4BSZ B; 2R59 A; 1ELW A; 1H19 A; 1H2U A; 1OWO A; 3BEE A; 5EX3 A; 1X81 A; 4FA6 A; 4HVB A; 1UG3 A; 2AXZ A; 2H6G A; 1YYH A; 1E8Y A; 4WWO A; 3RRU A; 5KJM A; 3QWW A; 3E37 A; 2A4Z A; 3FFL A; 4CT0 A; 1IKN D; 3ZKJ A; 4CCA A; 5ENN A; 4G11 A; 3EHN A; 4HOR A; 4HRM B; 4UQY A; 5EID A; 5G05 C; 5JHA A; 4BY6 A; 3ESL A; 4G86 A; 3S7D A; 3TGO A; 2WXF A; 1HX8 A; 3FUM A; 2ZGD A; 3D9H A; 1HO8 A; 3OXG A; 4LSZ E; 3ZHE A; 4EZJ A; 3TWW A; 2R02 A; 4L2Y A; 3NZU A; 2PNN A; 5D0O D; 4F53 A; 1HE8 A; 1TEZ A; 4LNB A; 1RW2 A; 4A1G A; 5T4Y A; 4HI8 A; 2WXQ A; 4XZ4 A; 1N54 A; 1ZU2 A; 4P29 A; 1ZB1 A; 1S64 A; 5FQ6 A; 3ESK A; 3AS4 A; 4CDN A; 3D9O A; 4HBD A; 2J08 A; 2P58 C; 3C3Q A; 4U04 A; 4GA1 A; 1UN8 A; 4APF A; 2PQR A; 4CGV A; 2VGE A; 1QQE A; 2AW6 A; 4YDY A; 3TL5 A; 4B0Z A; 2NSZ A; 3NBN B; 4HB5 A; 4IUL A; 4LEU A; 3MV3 B; 3PVL A; 1SZ9 A; 3B7T A; 4GU5 A; 4IYP A; 5LOZ A; 1OCC E; 3FTS A; 3I4G A; 1LTX A; 4J8E A; 3ZRH A; 3PUK A; 3VLD A; 3SD5 A; 1MHQ A; 3SF4 A; 2QYJ A; 4HOT A; 2PL2 A; 3ZIM A; 4A63 B; 1N9A A; 2B0O E; 2VGY A; 1Q6B A; 3T8M A; 3CVV A; 5A23 A; 2NYJ A; 3MA5 A; 4K5C A; 4ILG A; 3N71 A; 3JXI A; 1H2T C; 2XS1 A; 1X5B A; 5FWQ A; 4JA7 A; 4J8S A; 3TWQ A; 4FLH A; 3Q9U C; 3C98 A; 4LRZ A; 2KAT A; 3GZ2 A; 4RSY A; 4EQF A; 4C0E A; 5ENT D; 3SZ7 A; 1QSA A; 4MLP A; 4UI9 C; 3RO3 A; 2L0T B; 3B7R L; 1SV1 A; 2AJA A; 1SLY A; 4JZY A; 1GW6 A; 2P2C P; 3AS5 A; 4HRL A; 3TWX A; 2XPI A; 1JCS A; 4K5B A; 1E96 B; 3U9W A; 2J07 A; 3CKB A; 4GTP A; 3Q7A A; 3D9K A; 3CQG B; 4RLY A; 3SNX A; 2FF4 A; 4XI0 A; 2ILR A; 4K03 A; 2RG8 A; 3EJN A; 2GRN B; 1OWL A; 3MYV A; 3Q47 B; 4PS3 A; 5FZQ A; 4YND A; 1FCH A; 4I6J A; 1DVP A; 5EDS A; 3FUH A; 3L13 A; 2GRQ B; 1H6P A; 3LY8 A; 1BMT A; 3T9K A; 4ME2 A; 3I5P A; 3ASH A; 3DPD A; 3UM2 A; 4I6G A; 3E34 A; 4U07 A; 1QNF A; 4KZC A; 4L1B A; 3JQ1 A; 3AU4 A; 1Z6T A; 4FU3 A; 3L9T A; 2EQX A; 3NF1 A; 2OCC E; 3R9A B; 3UT4 A; 3ABL E; 3X2Q E; 1R8J A; 3JUE A; 3HXF A; 5CMY A; 2GGF A; 3FUN A; 3AAA C; 4V3I A; 4DI3 A; 2PQN A; 4ZHB A; 2X38 A; 1H2V C; 2LAH A; 4BTA A; 3RO2 A; 5DBK A; 3URZ A; 2IOS A; 2L6J A; 1FT1 A; 3IXE A; 4ANX A; 3CR3 A; 2MRI A; 3ZN3 A; 5JHB A; 3FWV A; 3AG2 E; 3KEA A; 2J4D A; 1Z3Y A; 4UUC A; 3EU5 A; 4N2Q A; 3FU3 A; 2DZO A; 2J6Z A; 4L7T A; 2EIM E; 3LVQ E; 3UTM A; 5EIB E; 3Q49 B; 3DST A; 4G8K A; 1N0R A; 2DWZ A; 1E8Z A; 4U7E B; 2B6C A; 1N4Q A; 2ETA A; 4JD2 G; 3SGH A; 3TXM A; 4F6R D; 4MKT A; 3MJW A; 4BET A; 2GRM A; 4EPZ A; 4JC8 A; 4OVU A; 1WM5 A; 4C48 B; 2ETB A; 5AQ9 A; 2WXH A; 4I9E A; 3RSE G; 1BD8 A; 4OAU C; 5CBO A; 1N52 A; 2CHW A; 4BSX A; 2DBA A; 3PZ2 A; 3FTY A; 3BUL A; 4NQ0 A; 4AV7 A; 5CEA A; 2I2O A; 3G2V A; 5EKQ D; 4IN3 B; 4F1S A; 1OWM A; 1DNP A; 2BTD A; 4A55 A; 1KPS B; 3TWU A; 3SFZ A; 4JB8 P; 4NRH B; 3CKC A; 2OV8 A; 2FO7 A; 3FU6 A; 3L16 A; 1KT1 A; 2IOL A; 2R03 A; 3G2T A; 2EIK E; 1IQR A; 3FDH A; 4O1O A; 3SBT B; 3FY4 A; 2VTB B; 3BUA A; 3V79 K; 3D9L A; 1SZA A; 2AVP A; 3FH7 A; 3UT8 A; 3FH5 A; 2HE0 A; 1D9S A; 4I1A A; 5CEC B; 3HXC A; 5C1D A; 1IXV A; 3IV0 A; 3QKY A; 1S70 B; 1OCZ E; 4KT6 B; 3BJD A; 3UQ3 A; 3SHF A; 4WND A; 2IFU A; 3PUJ A; 3HXE A; 1Q6A A; 2YQ8 A; 2PM7 A; 3PRE A; 4PS7 A; 2GRL A; 4H7Y A; 3LS8 A; 4HOU A; 4J0U A; 3ASF A; 3EHQ A; 1V54 E; 3DBS A; 4KXK B; 3DSW A; 4I6E A; 1KT0 A; 3BQO A; 4GMJ A; 4G24 A; 3DPY A; 2XEN A; 4GTS A; 1Y6I A; 2XZT G; 5AQ7 A; 4AVX A; 1SQM A; 3JUI A; 4NAC A; 3EIJ A; 2P9L G; 2AXU A; 5FT9 A; 2DIW A; 3PS6 A; 3NB2 A; 4L23 A; 2L9B A; 1MJ0 A; 3CVX A; 3CK7 A; 4XIF A; 1HFA A; 3HVE B; 3FH8 A; 3ONK A; 3TG4 A; 5KJL A; 1N11 A; 4TUM A; 4L9P A; 1N4S A; 5DIZ A; 3B7B A; 4H7X A; 3LYA A; 1NFI E; 2J6Y A; 1YMP A; 1QZ2 A; 2OEV A; 3GZS A; 3ML8 A; 3Q78 A; 1TJC A; 3EDT B; 3UXG A; 3ULE G; 1FT2 A; 5KWD A; 3HDX A; 2JEK A; 3QK0 A; 4GZ3 A; 4PH4 B; 5CCM A; 4G23 A; 2XZD G; 4GYO A; 2ZGG A; 2WXO A; 3Q7F A; 2VTB A; 5C8D A; 2WXL A; 1NL4 A; 1OCO E; 3K9I A; 4X8Q A; 4JL0 A; 5HS0 A; 1E8X A; 4N5C A; 1O1S A; 2IEJ A; 3Q15 A; 2VGX B; 4XEI G; 4YVQ C; 4KZ0 A; 3EIQ C; 4DX6 D; 3CVL A; 4JPS A; 3APF A; 1E90 A; 3JCK C; 2P9P G; 4HI9 A; 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