3M8UA

Crystal structure of glutathione-binding protein a (gbpa) from haemophilus parasuis sh0165 in complex with glutathione disulfide (gssg)
Total Genus 158
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
158
sequence length
508
structure length
508
Chain Sequence
DKTFINCVSRSPTGFSPALVMDGISYNASSQQVYNRLVEFKRGSTDIEPALAESWTVSDDGLTYTFNLRKGVKFHSNKEFTPSRDFNADDVVFSFQRQLDPNHPYHNVSKATYPYFKAMKFSTLLKSVEKVDMHTVKITLNRQDATFLASLGMDFISIYSAEYADKMLAAGKPETIDTTPIGTGPFLFAGYQVDQKSRYLAHKEYWKGKADIDRLIFEIVPDATARYAKLQAGACDLIDFPNAADLEKMKTDPKVNLHSQSGLNIAYIAFNTEKAPFDNVKVRQALNYAVDKNAIIDAVYRGAGVAAKNPLPPTIWGYNNEITGYEYSPEKAKQLLKEAGFENGFETDIWVQPVVRASNPNPRRMAELVQSDWEKVGVKSKLVSYEWGDYIKRTKAGELTAGTYGWSGDNGDPDNFLSPLFGSENVGNSNYARFKNPELDALLHKAVGLSDKAERAKIYEQAQVLLKEQAPWINVAHSINFAPTSKRVQDYKQSPFGYTYLYGTKLAD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Glutathione import in Haemophilus influenzae Rd is primed by the periplasmic heme-binding protein HbpA
pubmed doi rcsb
molecule tags Transport protein
source organism Haemophilus parasuis
molecule keywords Heme-binding protein A
total genus 158
structure length 508
sequence length 508
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-03-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00496 SBP_bac_5 Bacterial extracellular solute-binding proteins, family 5 Middle
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.105.10 Alpha Beta Roll Dipeptide-binding Protein; domain 3 Dipeptide-binding Protein; Domain 3 3m8uA03
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3m8uA01
3.90.76.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Dipeptide-binding Protein; domain 1 Dipeptide-binding Protein; Domain 1 3m8uA02
1RKMA 1YAEA 3LUYA 4F39A 2P1SA 4U2RA 5I2NA 3S2VA 1OQGA 2HZKA 4F2OA 2IEEA 1IXHA 4O3CA 2F78A 3SEVA 3U8QA 1FQDA 1FTMA 3G3HA 1FQAA 1QUIA 1JQFA 4U1OA 1MXXA 4YB5A 1WODA 3N6TA 1LCFA 5HPQA 4KHZE 1QJMA 3LSLA 3PPQA 2B4MA 3TQLA 1LAGE 4EDPA 3LBSA 4OQOA 2HFBA 4BDRA 5HBCA 4FORA 3LVUA 3TAJA 4F2QA 1B40A 5IKBA 2QS3A 4JXIA 5FHOA 4IO6A 4G8HA 3O29A 5ISUA 3TPAA 3E3KA 3MVZA 4DCYA 4NF5A 4WEDA 1GV8A 1S50A 1LAFE 1LAHE 3F11A 3G3GA 3HHFA 3TYHA 2O1MA 2RINA 2Y84A 5I2KB 1MY2A 3LSWA 3M8UA 4K3FA 1TFDA 1H44A 4OVJA 4YZZA 1POY1 3D4CA 1LBBA 2G93A 3KFMA 4WEPA 5DYHA 1B7ZA 1YCJA 3OO9A 4F3GA 5I84A 5AA2A 4DXBA 1SW4A 5AA3A 1LB8A 4KCCA 4ZEDA 1GVCA 1JNFA 4OEVA 3VVFA 3TTMA 4LATA 3MVWA 1EH3A 4JSDA 4R74A 5B70A 4QFLA 2O1LA 3OXNA 1VFDA 3OEKA 5TU0A 5HM4B 1TT1A 3TCGA 3HO7A 3T96B 4HW8A 1IEJA 3KN8A 3TTRA 1UTHA 2HEUA 3O66A 1B7UA 3IK6B 4RY1A 5KZTA 1Z7NE 4RPNA 4HCYA 1QVSA 3K6XA 1J1NA 5ICTA 2I0BA 4R9GA 3T9UA 3K6WA 2F7BA 5L8DA 4KR5A 1P1WA 5CI5A 3GBBA 4IB2A 2WOPA 4R72A 1ATGA 1EU8A 1YTVA 3AXFA 1OVTA 3HV1A 3KSJA 1WDNA 3EHTA 4OFLA 3K2DA 1SI1A 1TWYA 3WAEA 4OENA 2Q8JA 1FTKA 3MP8A 4HS7A 1UTBA 4U1ZA 1B0LA 1NNPA 3RT6B 2GH9A 3C9HA 1OVBA 3O9PA 4NF8A 1PBPA 2THIA 3HPIA 3SKPA 1B3HA 5J1DA 2Y7WA 2E0SA 3C31A 3QXMA 2F6GA 2F5XA 3SEUA 2XXTA 4ND9A 3VV5A 4MFIA 4R2FA 3B6TA 3G3JA 5B7DA 3VVEA 1US5A 4NF4A 4MF3A 4JWYA 2FYIA 2O84X 2REGA 4H8IA 3T22A 3TFLA 3FXUA 1QKBA 5I58B 2NUVA 1IZ1A 1VSOA 3H3GA 2XXRA 3JV9A 5CMMA 3O2AA 3RLFE 5EHSA 2Q88A 4Q30B 3ECRA 1GTKA 4P0IA 2OCUA 4KYEA 3V89B 3TTNA 3TTLA 2Q89A 4IO7A 4ECFA 3FASA 1FW0A 4GQOA 5F1QA 3TQWA 4G68A 4ZZEA 1FTJA 2NWJA 3FD3A 1LAXA 2DWJA 4EQ9A 3EN3A 1UIUA 4OMBA 3N94A 1IIWA 3SEXA 2D21A 1JETA 4EUOA 1PB7A 2BJJX 3ZKLA 3IX1A 4IY6A 3FTOA 4X1BA 4QF9A 2PVUA 3IR1A 2DE4A 3PGFA 5I2NB 3E9XA 5DEXA 1PC3A 4DE8A 2I3VA 4EQBA 3O28A 5H8NB 4F3PA 4ZEKA 4X1DA 4YKPA 4FATA 1PB8A 3GBAA 2ZNTA 3BBRA 4YKIA 2FNCA 1OQHA 2H4IA 4LZ7A 2X7QA 5CC2A 3DP6A 1NH7A 3IJXB 4ZEFA 4R73A 2WOKA 1B3FA 4H5FA 3PPPA 2O6AA 3KZGA 5KCJB 1LLSA 5H8FB 2O7UA 1B58A 3DRJA 1B6HA 1P99A 4XTCQ 3TCFA 1L5TA 4I62A 5I57B 3SETA 3H6WA 1A54A 2ONSA 1PEBA 1Y3PA 3DM0A 3O6PA 3OOAA 3OENA 4IGTA 3V83A 1B3LA 2R71A 4Z7EA 5A5XB 4JSOA 2XXQA 3HCQA 5LOMA 2GHAA 2DXYA 3RNNA 2RC7A 3FZVA 1YPNA 3PPOA 4NF5B 1QUKA 2F97A 1Y4CA 3T9XB 4O3BA 5DVIA 1AH5A 4FJPA 3DP8A 3Q25A 1NNKA 4THIA 3OO8A 3W9WA 1MPDA 4RK2A 1MXUA 3PUXE 4DXUA 1EZ9A 2P0SA 4R6HA 5ITPA 1FQFA 5H8SA 1POTA 1B5HA 1LFHA 4H1XA 4G68C 1XT8A 5DT6A 3H7MA 1NH8A 2Q9TA 1B4HA 2VGQA 4G2ZA 4F3SA 1GR2A 4BDLA 3MVYA 1LFGA 5H8HA 1BP5A 4C1UA 1MRPA 4MLVA 3VDFA 3OMBA 1SI0A 1JEVA 3MZBA 1UTHB 1MXWA 2Q2CA 3IOUA 2Y7RA 2HAVA 3G7WA 1NKXA 1FQCA 3QUFA 2XXPA 3QIMA 5FHMA 4E0XA 2XX7A 3IOVA 3C33A 3RGYA 2GFEA 1MPCA 3H6UA 5CBRA 2RCBA 5FHNA 4GL8A 4FECA 4DCXA 2HZLA 3QUJA 4GXAA 4UA8A 3MBPA 3Q26A 2OJTA 4M4GA 1N7XA 1URSA 4KCDA 2Z8DA 4QFNA 4N13A 3H4ZA 5H8NA 3P7IA 3VFJA 3UORA 3K4UA 1XS5A 1D4NA 1M5FA 2AL4A 1UTBB 1MM6A 3CFLA 1JW1A 1EZPA 3JYRA 3QK6A 4NF8B 4GLIA 3FV2A 4Z0IA 3PUYE 2DSFA 5KCJA 5H8FA 4EF1A 3H6VA 4NMYA 5AA2D 1VFEA 3CR9A 3VLUA 3CSGA 2P2AA 3Q27A 1B05A 3DRFA 5I57A 4U22A 3KBRA 3PMVA 3RUMA 1MG1A 4NF4B 3SERA 4H0WA 2W7YA 1NL5A 3OSRA 3IL1B 2V84A 3RQTA 4LZ8A 3KN3A 5A5XA 3CRBA 1DSNA 3MZ1A 5CMCA 3THIA 3MAMA 4XIGQ 3ZS6A 4RNSA 3FJ7A 1R6ZA 3K02A 1UIVA 4GIZA 2V3QA 4EF2A 3K01A 3MJNA 2B3FA 4NE4A 4YICA 2ZNSA 1LBCA 3QYTA 5AA4B 3PUWE 3PD9A 5K2YA 1Q1KA 3PD8A 2PX1A 4G68B 3FXQA 1IQ7A 2UXAA 1KWHA 1I69A 4QSDA 4NF6B 2RCAA 3TKDA 2XXHA 1ELJA 3FATA 3TUSA 1UQWA 1NFTA 1ZU0A 5I56A 3I6VA 1JVYA 2R9JA 4R2BA 5H8QA 1MXYA 3C35A 4R6KA 4F3BA 3FJGA 4PFTA 2ONRA 4ONYA 5DEXB 1S7YA 3LR1A 1MQIA 1PBQA 1BKAA 2ZYOA 1XVXA 1MH4A 1P1NA 3T9VA 1IITA 3U72A 4MH5A 2VP1A 4F19A 3S4UA 1Y20A 1F9BA 4QHQA 1GGGA 2I3WA 1T0KA 4PETA 3IB0A 3CSBA 1LB9A 3HN0A 1MPBA 2ZNUA 2RKMA 4LA9A 4U21A 3VLVA 1QW0A 1SDXA 1D9VA 3H06B 2ZXTA 4YKKA 3JZJA 4DXCA 2DVZA 4GD5A 2F7AA 4YAHX 5ITOA 3EHUA 1CE2A 2UYEA 3G3IA 1LGBC 4FEBA 4IY5A 3CFXA 4DZ1A 3DRKA 1MS7A 1A8EA 3T9HB 1B0HA 1A55A 3OSQA 3ILTB 3BFUA 2OK2A 4E0WA 4BDMA 2ESNA 4IGRA 3LSXA 3ONMA 1CB6A 3TZAA 3UP9A 1A40A 3RN8A 2Z8EA 1DTZA 2UVGA 2GHBA 1FTOA 1FQBA 2Q2AA 4LQ5A 3USDA 5L9OA 3IO4A 3EQ1A 2XD2A 2DWHA 1RYXA 4BLAA 1NNFA 4GRKA 2ABHA 4Q8RA 1R1NA 1DPPA 5EHMA 2B4LA 2XX8A 5KDTA 1RYOA 3FV1A 1OIBA 5H8HB 3ZSFA 5AA4A 3IOWA 1ZJLA 2NXOA 2O69A 1SW2A 3C4MA 4G77A 2QL3A 4LONB 1QKAA 4NF6A 3A3UA 4PP0A 5TPAA 4AQ4A 2F6PA 3CI8A 5F7VA 1MQJA 4PFWA 2ANJA 4G4PA 1FQEA 3PUVE 3TODA 3EF7A 2V3UA 1QUJA 4DIGA 1JEUA 1N0TA 4GVOA 2AIXA 4P11A 4LUBA 3PAMA 1Y1MA 3KSXA 2OBGA 4TLLB 2ZYNA 4U4XA 3MW0A 3N26A 5I59B 2DE2A 2VD3A 5JEIA 4OERA 4ZECA 5JK4A 2H98A 4N07A 1IUDA 4OEUA 1N3XA 2IA4A 4JDFA 4JB7A 3CG1A 1MY3A 1XHYA 3CIJA 3U94A 2I58A 3VXCA 3S9LC 2F8DA 1FTLA 3U1OA 4GXSB 2PYYA 4FEDA 4QRZA 2M8CA 2NOOA 4EXLA 1HSJA 2B65A 4RYAA 3N5LA 3IAZA 3MP1A 1N3WA 1M5DA 4U4SA 3MC2A 3RY3A 1Y4TA 1SW1A 3DP4A 4IO4A 4ESWA 3MPKA 2YLNA 4M1VA 1R9LA 3G3KA 1B1HA 1P1OA 2HAUA 4LZ5A 3K1MA 2A5TA 1JW4A 1Y9UA 4DDDA 4IO2A 4NWDA 1A99A 4RJZA 3KOSA 4FE8A 4H67A 3U93A 1USYE 4N6PA 2RF1A 1B52A 1PB9A 3RTFB 1FCKA 2XXVA 3EPEA 4AB6A 3O6HA 1B32A 1SYHA 2VOZA 1B46A 3OO6A 3K6UA 4OXVA 5I56B 3DLNA 2QPQA 1B5IA 3HHGA 4QSCA 4NTLA 1USYH 4KD5A 5H8QB 3R26A 5BUUA 3TDJA 3B7DA 5CM6A 4WKMA 4YMBA 2DVCA 4NEDA 1XVYA 3O97A 3PPNA 1Q35A 5JTYB 2I0CA 2Y7KA 1ANFA 2HXWA 4OWDA 4F1YA 4YMAA 5ELVA 1US4A 2XHDA 2DWAA 3KGCA 4GL0A 4YB6A 3R7XA 4OTEA 4LVQA 3TELA 1AL3A 3KOTA 2YJPA 3UK4A 3I5OA 3OELA 1LFIA 3C36A 1B5JA 2ALUA 4OETA 3E13X 3W15C 1N04A 3DRHA 1HSEA 3T66A 3Q28A 4ZS9A 3UGWA 2FA7A 4XXUA 3K00A 4L17A 3VVDA 5I59A 2DOJA 4TLMB 3PUZE 3TCHA 4OFJA 4FAJA 2H25A 1LSTA 1AOVA 3KJTA 4WXJA 4XKQA 3SESA 4OFOA 3LC8A 4C1TA 2DE3A 1JW5A 1MXZA 2RC9A 1Z7ME 5BWJA 4R6YA 2DWIA 1OMPA 3K0VA 4U23A 3V5AA 1M5EA 1AMFA 5FTHA 1MM7A 4LQ2A 3RTWB 4ELPA 3K1PA 5TP9A 3CVGA 3ODBA 3BFTA 1ZLQA 2CZLA 4H65A 4JWXA 2DP8A 1IXCA 2WOLA 3ILUB 4ZEIA 4C0RA 1B51A 3SEYA 5AE4A 2OWTA 3B6WA 1D3KA 3WAFA 1B1XA 2F35A 1N7WA 1PDAA 2A5SA 5L9MA 3FUZA 5KDTB 4RK9A 5AA1A 2F7CA 4OHNA 1TXFA 5CRYA 4FIMA 3VXBA 4PFUA 1B3EA 2I49A 4ZDMA 1MY1A 2VD2A 3RYAA 3FVGA 3TEPA 1I6AA 5TPAB 1H3DA 4BDNA 5CMBA 2ZMBA 1MY0A 3IO6A 4Q5TA 1BIYA 1H45A 1MY4A 2UVJA 1I6QA 3OO7A 4AB5A 4ISUA 4LP2B 4XKNA 4DLDA 2UYFA 1URDA 5DVFA 4R75A 2OLBA 4KFQA 1SVXB 1MQHA 3VLWA 3FGSA 5JTYA 1O7TA 3D4GA 2YPNA 1SYIA 3GZGA 3C32A 4EXKA 4GFRA 1S9TA 1NMUA 2D5WA 5DVJA 1SW5A 3UA8A 2XX9A 3E4RA 1A7LA 3C34A 4RPOA 4I8CA 1II5A 1I6BA 4POXA 2PT2A 4HTGA 3O6IA 4ELRA 5K2XA 2G29A 1R9QA 3MUQA 3M3KA 3T93B 3TMGA 3G3FA 2F34A 2KLFA 1DOTA 1WVJA 3FXRA 2QMXA 1TFAA 4RXLA 4JBZA 3EHSA 3PMXA 2DQVA 4RA1A 3IB2A 3DRGA 1Y3QA 5IAIA 3PPRA 2B3BA 4OZ9A 5CBSA 1B4ZA 3CHGA 1D9YA 1P1QA 4GF8A 4NWCA 3K6VA 2XD3A 2GRVA 2QS2A 3A09A 2ZYMA 1LCTA 3RPWA 2A5TB 4YB7A 3KG2A 2QRYA 2QS1A 1MDQA 2V3TA 1MH3A 4F22A 4KQPA 3L6GA 1SQYA 3GXAA 2ONKE 2XXWA 4PQJA 3SDFA 4BDQA 2O68A 3FIRA 4KI0E 4QFPA 3IJOB 3M3LA 3MPLA 3TTKA 1ZIUA 3MWBA 4KYDA 3FVKA 2ZYKA 1ZMGA 3B6QA 4X48A 4ZE8A 5L9SA 2AL5A 2X26A 3KEIA 1M5BA 2WKYA 2QMWA 3Q29A 3OD7A 1XC1A 1Y1ZA 3SEWA 1H43A 2XXUA 3VE1B 1AIVA 2I6EA 2UVIA 3RYBA 3IB1A 5I2KA 2E1SA 2REJA 2H99A 3IORA 3HSTA 2Z8FA 4UACA 4GWOA 3FJMA 1JVXA 4F29A 4IO5A 4F1UA 4R9FA 3ZKKA 2Z22A 4Q0CA 2O7IA 1VR5A 1OLAA 2XXXA 2OZZA 4QFOA 1MDP1 3DELB 3MZ9A 1DPEA 2Y7PA 1DMBA 1H76A 3IOTA 1B7HA 2R6GE 3MVXA 1URGA 2OWSA 1DTGA 4H8JA 5DTBA 4OYVA 3S9MC 2HQ0A 3UIFA 2NVUB 1O63A 2QJEA 1BLFA 1ZBMA 4HCWA 2H5YA 3PV0E 3BKIB 2DS9A 2PBWA 4BDOA 2UVHA 1ZKBA 2O51A 1N84A 3I3VA 3R6UA 5TP9B 4G8NA 1BTJA 2XXYA 3UN6A 1MXVA 2X7PA 3KN7A 1ZTYA 3KJ7A 1MQGA 4PE5B 4MBPA 3N6UA 3L6HA 4ELOA 1M5CA 3PU5A 4I9DA 4OESA 2HCAA 4IO3A 4QSEA 3O6GA 4POWA 3OEMA 2DYXA 1XOCA 2LAOA 3MQ9A 4ESXA 1Y3NA 2PT1A 1IXGA 3GLBA 4H6DA 4O3AA 4G8MA 3M3FA 3V8XB 3CFZA 4F1VA 2RC8A 2XXIA 5ICQA 2Y7IA 4F31B 1HSLA 4ZE9A 3QSLA 1MQDA 3U92A 3S9EA 1SBPA 4TOZA 4H5GA 5M2VA 4P0GA 3RT8A 2I4CA 1O64A 1QULA 2QSXA 2V25A 1NNTA 4F18A 1SD3A 4YU0A 4XKRA 5AA2B 1N76A 3W9VA 4GOTA 2D3IA 3CG3A 5I58A 5FTIA 2CMOA 1IXIA 2DXRA 1P1UA 4I1DA 2F36A 3A3CA 1VE4A 1B2HA 3PMWA 4ZEBA 4TQUQ 2V93A 2PMSA 4QFKA 3QAXA 3H6TA 1B9JA 4KPTA 4ELQA 3FVOA 1A8FA 4PFYA 2I48A 3MP6A 1EZOA 4ZZAA 2AYSA 5CMKA 2H9BA 2QS4A 3S9NC 4XKPA 2Z23A 4KYSA 4X9TA 4JWOA 1OLCA 3K1NA 4EQ7A 2VHAA 1B3GA 3H03A 4YKJA 3FVNA 3LSFB 4MLQA 2I4BA 3DRIA 5EYFA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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