3MBPA

Maltodextrin-binding protein with bound maltotriose
Total Genus 127
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
127
sequence length
370
structure length
370
Chain Sequence
KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTRITK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Extensive features of tight oligosaccharide binding revealed in high-resolution structures of the maltodextrin transport/chemosensory receptor.
pubmed doi rcsb
molecule tags Periplasmic binding protein
source organism Escherichia coli
molecule keywords MALTODEXTRIN-BINDING PROTEIN
total genus 127
structure length 370
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 1997-06-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3mbpA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3mbpA01
1FW0A 3KZGA 1FCKA 3H6WA 4LUBA 5ELVA 4QFLA 4JBZA 4F18A 3O6GA 4MH5A 5DEXA 2NUVA 4IO4A 4UACA 3V89B 3MC2A 2QS1A 4GIZA 3TKDA 4NF6A 2ABHA 3MPLA 1TT1A 1LBCA 1URDA 1OMPA 1SI1A 1N7XA 3LR1A 1B5HA 5F7VA 4JDFA 1H76A 2D21A 4IGRA 2XXTA 3Q29A 4GRKA 3U72A 3JV9A 1LCTA 4XKQA 1LB8A 1P1UA 1DTZA 4OHNA 4YICA 4DIGA 3PPQA 5I59A 3VXBA 2DQVA 3C36A 4YKKA 4LQ5A 3T66A 3OMBA 1H43A 5L8DA 3C9HA 4YKIA 3IB1A 5ICQA 3IOVA 1ZTYA 1MDP1 4ELQA 2Y7KA 4RPNA 3G3GA 4G68A 3Q28A 5K2XA 4MLQA 5M2VA 2HEUA 4OETA 3O9PA 4R2FA 3PPOA 4BDNA 1A54A 4RPOA 3KOTA 4OTEA 4ZEBA 4EUOA 3GZGA 3GLBA 5KCJA 4OYVA 1URGA 1B5JA 1JNFA 1LFHA 4YKPA 4PFTA 4TOZA 3QXMA 1LAHE 1AL3A 2AL5A 1A99A 5HPQA 1VR5A 4H6DA 3E3KA 3S9EA 2V25A 3RN8A 4RA1A 2Q89A 2XXXA 1GGGA 1DPPA 1PBQA 4QHQA 2XX9A 5H8QB 4KQPA 3MJNA 4AB5A 1LAFE 1O64A 4U21A 4G4PA 4KYEA 4I62A 1IXHA 4DLDA 3FATA 1LFGA 3W9VA 3E13X 4OVJA 2Q9TA 4R75A 3PUVE 4TQUQ 4F22A 4X1BA 4KPTA 3RGYA 1OVBA 3OSRA 4I9DA 4OXVA 4ESWA 2X26A 3MZ1A 4NF6B 4EQ7A 1LAGE 4FE8A 3H6UA 4KCDA 1EU8A 2ZMBA 2QS3A 4LZ7A 2E1SA 3C35A 4H0WA 1N76A 3KN7A 1JQFA 1LB9A 4G8MA 2ESNA 1IUDA 1Y3QA 4ESXA 3K2DA 4GL0A 3I6VA 5I59B 1SYIA 3N94A 1M5CA 4HS7A 4Q8RA 2W7YA 1B7UA 4GFRA 1YCJA 2XX8A 2GHAA 1MG1A 1XC1A 2XX7A 4G8NA 3TCHA 2FNCA 3I5OA 1B3LA 3N5LA 2DP8A 4GD5A 3CSGA 5AA1A 5TU0A 3BBRA 1P1QA 1SDXA 3T22A 1R9QA 2XD2A 4AB6A 3O6IA 5AA2A 1DTGA 3FV1A 1MY0A 1XT8A 4G68B 1LFIA 3EHTA 3DELB 5AA2D 4HCYA 1BLFA 4H5FA 3CG3A 1IZ1A 4OEVA 3FJGA 1H3DA 2DWJA 5B70A 3H4ZA 1R6ZA 3O28A 3FD3A 3DM0A 4U4XA 5TPAA 3FVNA 5KCJB 1MXVA 3VVFA 2DXYA 4NWCA 1Y3NA 2ZYOA 2RCAA 1MQDA 2Z8FA 4NF4B 4F3BA 4PFYA 1LCFA 1B4ZA 2F35A 1YAEA 3THIA 3Q26A 4OFJA 5CMKA 3S4UA 5DT6A 4XKRA 4WEPA 3H6VA 5JEIA 4MLVA 4UA8A 2H9BA 3VLVA 4JXIA 4F3SA 1TFDA 5FHOA 4P0GA 2H5YA 4YB5A 4E0XA 4FEDA 2HAVA 4YMAA 4QFPA 5H8HA 2YJPA 2Y84A 3LSLA 1WODA 3ZSFA 3UGWA 2OZZA 4BLAA 2F97A 1SW4A 5FHMA 1JW5A 2R71A 3CFXA 2Q2AA 3Q27A 3C4MA 2F36A 4DCYA 3GBAA 3IAZA 2XXIA 2G29A 3KN3A 2OWTA 3TELA 1B05A 1EZPA 4H1XA 4GOTA 1TXFA 3IL1B 1FQDA 4KCCA 4R72A 3TPAA 3QIMA 4ONYA 1PEBA 1P1WA 1QKBA 3WAFA 4OEUA 3RQTA 2HAUA 4X48A 2YLNA 3V83A 2REGA 1B40A 2QL3A 4FORA 4BDOA 3LUYA 2ONSA 3TZAA 1AMFA 3T9XB 3A3UA 4ZZEA 3G3IA 1FQEA 5F1QA 1OVTA 3K6WA 2CMOA 2OLBA 4EDPA 2XHDA 4WEDA 4WKMA 1FTMA 3K00A 1RYXA 3LSFB 3N6TA 3RLFE 4ECFA 2F7AA 1NNTA 2I4BA 4OESA 2IEEA 1POY1 1QKAA 3CR9A 2P1SA 2Z8EA 5L9OA 5AA2B 3FVKA 3FIRA 2DWHA 3MWBA 4PP0A 1J1NA 3EHSA 1SI0A 5H8FA 4MFIA 3MP1A 1N04A 2RC9A 4EXKA 2A5TA 4GF8A 5TP9A 5TPAB 1VFEA 3CG1A 1Z7NE 4IY5A 4O3BA 3S9LC 3MAMA 4OERA 1B58A 2QSXA 3HN0A 4R74A 2O68A 2HZLA 1SVXB 4H67A 1NH7A 4KHZE 5AE4A 3PV0E 1O63A 1Y9UA 3W15C 3FXQA 3C31A 3K1MA 2Z22A 2QMXA 3H7MA 4F1UA 3U94A 1AIVA 2UYFA 1AOVA 3FASA 1URSA 2XXPA 3FVOA 1B3EA 4HCWA 1IXCA 1M5BA 1MXXA 1R9LA 2F78A 1A7LA 4O3AA 1USYE 1VE4A 1SD3A 3KGCA 5H8HB 4ZECA 4LA9A 3O97A 3TUSA 1D9YA 3PPPA 2Y7IA 1SBPA 3ODBA 4TLLB 1QVSA 1LSTA 3PPNA 3K1NA 4M1VA 4YB7A 1B46A 3SETA 3PGFA 4GL8A 1A8EA 3I3VA 4NF5A 4YAHX 3TTNA 1DPEA 1QULA 4LVQA 1HSJA 4ZDMA 3MUQA 3FJMA 4ZEFA 3IJOB 4JSDA 3KEIA 3VVDA 3RNNA 3SEWA 3ZS6A 5JK4A 5I84A 4RK2A 5HBCA 2UVHA 4KYSA 1N3WA 3TODA 2OJTA 4RXLA 5CBRA 2QRYA 4BDRA 4G77A 3OD7A 3USDA 2H4IA 2F7CA 5I2NB 2XXRA 1B9JA 1OLAA 2PBWA 4OQOA 4ZEKA 3PD8A 3E9XA 3M3LA 3N26A 2P0SA 4NWDA 1D9VA 3E4RA 2DE3A 3PMWA 2H98A 2VGQA 1FTOA 1B2HA 1JEVA 4MBPA 4AQ4A 4K3FA 1ZJLA 3O29A 3D4CA 1QUIA 4DZ1A 4U2RA 4YZZA 2RCBA 3RY3A 4NF4A 4H65A 2M8CA 2O6AA 3L6GA 4ND9A 2ALUA 2NWJA 3UORA 1OLCA 3OO8A 1MY3A 3HO7A 5H8FB 3CI8A 3ZKLA 2THIA 2A5TB 1B51A 3IOTA 4H8IA 4FEBA 2FYIA 5TP9B 3HSTA 3OOAA 3MPKA 3IB0A 4QRZA 2RINA 1Y1ZA 2I58A 3S2VA 2HQ0A 1B0LA 4DXBA 1Q35A 1MPCA 1PB9A 4F31B 2ZXTA 2I6EA 5IAIA 1MPBA 1MY2A 5FHNA 1SW5A 3T93B 1LBBA 5I56A 3CFZA 4F3GA 3VXCA 1NFTA 1GV8A 4QF9A 5ICTA 2NOOA 3K6XA 1M5DA 2I3WA 1F9BA 2DWAA 3B6WA 1B6HA 1O7TA 2DYXA 5EYFA 1MQJA 3OXNA 3MZBA 1OQGA 4GVOA 5L9SA 4KR5A 1XVXA 3G3FA 3JYRA 1JEUA 4FIMA 4DXCA 3LC8A 4XKNA 1P1NA 1M5FA 2DVZA 1GVCA 3T96B 2O1MA 4HW8A 2DOJA 4G2ZA 2R9JA 3MQ9A 2ANJA 3DLNA 4F3PA 2O51A 2XXYA 2O69A 3UN6A 2XXHA 1EZ9A 1P1OA 1ZLQA 4R9FA 1B7ZA 4ZEDA 3HV1A 3MVYA 4NF5B 1ZBMA 4F19A 1T0KA 3M3FA 2ZYKA 3A09A 4PE5B 4DXUA 3TEPA 5K2YA 1UIUA 1N0TA 1ELJA 1QW0A 3KSXA 4GLIA 1MM6A 4C0RA 5L9MA 3VV5A 4R2BA 3C32A 1HSEA 5JTYB 3SEUA 1MY1A 4F29A 3TQLA 2DS9A 3GXAA 4MF3A 1A40A 2GFEA 3TQWA 4WXJA 1NMUA 3MP8A 3G7WA 5ITOA 3PMXA 1RKMA 3V8XB 4HTGA 2F5XA 2F6GA 4FECA 3VLWA 1D3KA 4ZE9A 1SW2A 1BKAA 4P11A 3CSBA 5AA3A 2REJA 4FAJA 3PUWE 1RYOA 1H44A 3C34A 3KG2A 4LQ2A 2I48A 4EXLA 3SEXA 3B6TA 3TYHA 5KDTA 3U92A 2PT1A 4IO7A 3CFLA 1Y20A 4ZE8A 3IK6B 2UVJA 5DTBA 1HSLA 1USYH 4RJZA 3R26A 3G3JA 5H8NA 5AA4B 1IQ7A 1MH3A 4Q5TA 1Y4TA 3RTFB 2VHAA 1BIYA 2UVGA 1JW4A 1POTA 3H6TA 1SYHA 5I56B 2V93A 4H8JA 3SERA 5CI5A 3FZVA 4XTCQ 1ZKBA 1LLSA 4F2OA 3R6UA 2DE2A 3BFUA 3EN3A 3TAJA 2O7IA 3ILTB 4QFNA 4RYAA 3EF7A 4DDDA 3TTRA 1NNKA 4KI0E 4FATA 2D5WA 3VVEA 4NTLA 1N3XA 3TDJA 3L6HA 5KZTA 2OWSA 1QUKA 3U1OA 2RC7A 1NNFA 5I2NA 3DP8A 3PMVA 4BDQA 5LOMA 1IIWA 2ONKE 4ISUA 2BJJX 2QS2A 4IGTA 2Y7RA 3TFLA 4ZEIA 1MXYA 1NNPA 1ANFA 1MRPA 1B3FA 1ATGA 2Y7WA 2V3QA 2PT2A 3H06B 4XXUA 3KSJA 2NVUB 3A3CA 4LATA 4F39A 2WKYA 1MXUA 1YTVA 2XXVA 1XOCA 1I69A 2IA4A 3HCQA 3KJTA 2CZLA 1L5TA 2B3FA 1JVXA 5I2KA 1Z7ME 2ZNSA 2GHBA 5I58A 4ELOA 1DMBA 2HFBA 1DOTA 2UVIA 3IB2A 5FTIA 4QSEA 1US4A 1N7WA 1MQGA 2XXWA 2Q8JA 4RK9A 3HHGA 5CMCA 4JB7A 2NXOA 4TLMB 3G3KA 1B52A 1B4HA 1D4NA 1ZU0A 1PC3A 5HM4B 2X7PA 2A5SA 2X7QA 1VSOA 1FQCA 2I3VA 2VD2A 5KDTB 4QFOA 2P2AA 3IORA 3TCFA 2O1LA 3D4GA 3KOSA 1EH3A 3MBPA 3OO7A 2DWIA 1GTKA 3T9VA 2H99A 3MZ9A 4U1ZA 2F34A 4YU0A 5H8NB 1TWYA 4GXAA 5DVFA 1FQBA 4F1YA 4R6HA 2ZNTA 4YKJA 2YPNA 1OIBA 5CMBA 2DXRA 4ZS9A 3TCGA 1MXZA 3ONMA 4C1UA 4BDLA 2DVCA 2V3TA 3RT6B 3MP6A 3WAEA 1WVJA 5I57A 3LSXA 1MQIA 1B1HA 4BDMA 2XD3A 4IO2A 5EHSA 3DP4A 4IB2A 2PVUA 3IJXB 2VD3A 1US5A 4M4GA 3KN8A 1MM7A 1PB7A 5JTYA 4EF1A 1YPNA 3M8UA 3FGSA 1GR2A 3DP6A 3V5AA 1PBPA 4NF8A 4U22A 3PD9A 4Z7EA 2OK2A 1LAXA 4POXA 2ZYMA 1MQHA 4Q0CA 3QSLA 1IEJA 1XHYA 3TTMA 3B6QA 2PYYA 3OELA 1WDNA 3ZKKA 1BP5A 4EQ9A 4F2QA 3IO4A 1M5EA 2FA7A 2HCAA 3MVZA 1Q1KA 2I0BA 4OMBA 4I8CA 4PQJA 3G3HA 5I2KB 3QUJA 4C1TA 1NH8A 1N84A 4Z0IA 5I58B 2R6GE 1IXIA 1SQYA 1XS5A 3UIFA 2LAOA 1A8FA 1JETA 3OO6A 2Y7PA 2UXAA 5AA4A 3UA8A 3UK4A 2QPQA 3U8QA 1BTJA 1NKXA 1CE2A 2O7UA 4IO3A 4KD5A 4YB6A 2O84X 5BUUA 3H03A 2OBGA 4U23A 3KJ7A 4PETA 4PFUA 1PDAA 3O2AA 2Z8DA 4LZ8A 3T9HB 3EHUA 3UP9A 2I49A 1Y1MA 4G68C 1MH4A 5DVIA 1MPDA 4QSCA 4OENA 2DSFA 2ZNUA 3FVGA 5DEXB 3RTWB 5H8SA 4JWXA 3MVXA 1UTHA 3VDFA 4XKPA 3EQ1A 1Y3PA 1A55A 4U1OA 4N6PA 3TMGA 1MS7A 1IITA 3K01A 5CC2A 3IOUA 4NE4A 4R73A 4ELRA 5J1DA 4FJPA 1B32A 2B3BA 1B1XA 1Y4CA 3KBRA 3SEVA 5EHMA 5IKBA 4G8HA 1II5A 3OEKA 2QMWA 3P7IA 3RUMA 5CMMA 3OENA 3VLUA 5I57B 1LGBC 2H25A 1VFDA 1B3GA 3GBBA 3ECRA 5CM6A 2F7BA 3OEMA 3JZJA 1B7HA 4IY6A 2Z23A 1EZOA 3TTLA 4QFKA 4RY1A 3O6HA 5B7DA 3SDFA 3PUYE 2GH9A 1S7YA 1NL5A 3HHFA 4I1DA 4NEDA 4RNSA 4NF8B 2PX1A 1XVYA 3FXUA 1SW1A 3CIJA 3FJ7A 2XXUA 2KLFA 1FQAA 2AL4A 3K0VA 1MXWA 4ZZAA 4KFQA 3FUZA 4LONB 1P99A 3BKIB 1JVYA 4E0WA 2RKMA 3MVWA 3B7DA 5A5XA 1QJMA 3W9WA 1DSNA 3MW0A 3EPEA 1UTBA 1S50A 1B3HA 4JWOA 4Q30B 2RC8A 3IOWA 2V84A 3FV2A 3Q25A 1B0HA 3PUZE 4R6YA 3QUFA 3H3GA 4O3CA 3RT8A 3VE1B 4LP2B 2E0SA 1IXGA 1UQWA 2QS4A 3OSQA 2DE4A 2QJEA 3K6UA 3PPRA 3PUXE 3CRBA 4GQOA 2I0CA 1H45A 4OFOA 4R6KA 4F1VA 3F11A 3IO6A 3SKPA 3SEYA 4JWYA 5ISUA 1OQHA 2G93A 3AXFA 5FTHA 2PMSA 2VOZA 2D3IA 3K4UA 4EF2A 3KFMA 1UTHB 1I6BA 4N13A 5DVJA 4OWDA 3IR1A 4OFLA 4JSOA 3HPIA 3QK6A 1CB6A 3R7XA 4THIA 4GWOA 2Q88A 3O66A 4U4SA 3CVGA 5DYHA 2Q2CA 1FTKA 4LZ5A 1TFAA 1R1NA 1ZMGA 4H5GA 3QAXA 3K1PA 2UYEA 2AYSA 4POWA 3N6UA 3FXRA 4R9GA 2AIXA 1I6AA 2I4CA 1FTLA 4KYDA 1ZIUA 2B65A 1PB8A 4QSDA 1JW1A 4X1DA 4YMBA 3ILUB 1MDQA 3LBSA 4ELPA 3S9NC 2ONRA 2OCUA 4X9TA 4EQBA 3QYTA 1MY4A 4P0IA 4OZ9A 3RPWA 1I6QA 3TTKA 4GXSB 2V3UA 4IO5A 3SESA 1B5IA 2HZKA 2GRVA 1FQFA 3VFJA 3M3KA 5ITPA 2ZYNA 3OO9A 1UIVA 3T9UA 2F8DA 3K02A 1S9TA 3IX1A 2RF1A 3BFTA 4DCXA 2HXWA 1AH5A 5CRYA 3U93A 5BWJA 4PFWA 4IO6A 4XIGQ 3LSWA 4DE8A 4N07A 4NMYA 5CBSA 3S9MC 2VP1A 5H8QA 2XXQA 4L17A 3K6VA 5A5XB 1UTBB 1FTJA 3PU5A 3C33A 1QUJA 1KWHA 2F6PA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2KR0A 1FW0A 3KZGA 5J16A 1FCKA 1YXIA 3H6WA 4JVIA 4LUBA 5ELVA 4QFLA 4JBZA 4F18A 3O6GA 4MH5A 5DEXA 2NUVA 3PTYA 4IO4A 4UACA 3LUZA 3V89B 3MC2A 2QS1A 4GIZA 3TKDA 4NF6A 2ABHA 3MPLA 1TT1A 1LBCA 1URDA 1OMPA 1SI1A 1N7XA 3LR1A 1B5HA 5F7VA 4JDFA 1H76A 2D21A 4IGRA 2DDKA 2XXTA 1FRPA 4P8BA 3Q29A 4GRKA 3U72A 5EQ7A 3JV9A 4P3LA 1LCTA 4XKQA 1LB8A 1P1UA 1DTZA 4OHNA 4YICA 4DIGA 1LBVA 3PPQA 3VXBA 2DQVA 5I59A 3C36A 4YKKA 4LQ5A 3T66A 3OMBA 1H43A 5L8DA 3C9HA 4O7IA 4YKIA 3IB1A 5IZ3B 5ICQA 2XWOA 3IOVA 1ZTYA 1MDP1 5EYHA 2Y5LA 4ELQA 2Y7KA 4RPNA 3E79A 3G3GA 4G68A 3Q28A 5K2XA 4MLQA 5M2VA 4QBAA 2HEUA 4OETA 3O9PA 4R2FA 3PPOA 4H45A 4FBPA 4BDNA 5I7IA 1A54A 1NV7A 4RPOA 1NV4A 3KOTA 4OTEA 3NOHA 4ZEBA 4EUOA 3GZGA 2ZZWA 1LEVA 3GLBA 1NV1A 5KCJA 1FPJA 5LDZA 4OYVA 1NV0A 1URGA 1B5JA 4OVQA 3E78A 4N4UA 2PCRA 4P47A 1JNFA 1LFHA 2WBDA 1LBYA 4YKPA 4PFTA 4TOZA 3QXMA 1LAHE 1AL3A 2AL5A 1A99A 5HPQA 1VR5A 4H6DA 3IFCA 3E3KA 3S9EA 2V25A 3RN8A 4RA1A 4MIJA 2Q89A 2XXXA 1GGGA 1DPPA 1PBQA 2XWIA 1FBDA 4QHQA 2XX9A 5H8QB 4KQPA 5T3JA 3MJNA 4AB5A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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