3MJNA

Crystal structure of the complex of c-lobe of lactoferrin with isopropylamino-3-(1-naphthyloxy)propan-2-ol at 2.38 a resolution
Total Genus 113
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
113
sequence length
345
structure length
341
Chain Sequence
YTRVVWCAVGPEEQKKCQQWSQQSGQNVTCATASTTDDCIVLVLKGEADALNLDGGYIYTAGKCGLVPVLAENRKSSKHSSLDCVLRPTEGYLAVAVVKKANEGLTWNSLKDKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLIVNQTGSCAFDEFFSQSCAPGADPKSRLCALCAGDDQGLDKCVPNSKEKYYGYTGAFRCLAEDVGDVAFVKNDTVWENTNGESTADWAKNLKREDFRLLCLDGTRKPVTEAQSCHLAVAPNHAVVSRSDRAAHVEQVLLHQQALFGKNGKNCPDKFCLFKSETKNLLFNDNTECLAKLGGRPTYEEYLGTEYVTAIANLKKCSLEACAF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Crystal Structure of the complex of C-lobe of lactoferrin with isopropylamino-3-(1-naphthyloxy)propan-2-ol at 2.38 A Resolution
rcsb
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Lactotransferrin
total genus 113
structure length 341
sequence length 345
ec nomenclature ec 3.4.21.-:
pdb deposition date 2010-04-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3mjnA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3mjnA02
3VVEA 3PV0E 3DP8A 3E3KA 1N76A 2Z23A 3G3IA 1XC1A 4IY6A 1IIWA 2F7BA 3TCGA 1SW4A 1FQEA 1ATGA 4HTGA 3TPAA 4OYVA 3U1OA 4O3AA 3TEPA 1M5CA 3M3FA 2ZXTA 3TTMA 3I5OA 3EQ1A 3DLNA 4LZ5A 3K0VA 2QMWA 5EHMA 1NFTA 2OK2A 4YMAA 3HPIA 1UTBB 1B0HA 1NMUA 2DXRA 4ZDMA 4MLQA 2XXUA 2O51A 1M5FA 2DWAA 3TTNA 5TU0A 1XT8A 2UXAA 4GXAA 3MJNA 1Y1MA 2A5TB 5DVIA 4OVJA 2HZKA 3HCQA 4P0GA 1B3LA 1VFDA 3VLVA 2Q2AA 2Q9TA 4JWYA 2RC8A 3K2DA 4ELPA 1J1NA 4IO3A 3FVNA 1B05A 1MXWA 2DOJA 3PMWA 3E13X 3T9XB 2DSFA 2X7PA 2V3QA 3S2VA 1UTHB 1POY1 1EZOA 3FVGA 3QXMA 1B0LA 1N04A 2XD2A 1MM6A 5F1QA 3S9NC 1UIUA 4H6DA 4X48A 5L9SA 1DTGA 1BP5A 1M5EA 3K01A 1PB9A 5DTBA 1LBCA 3UN6A 1MQHA 3FVKA 1O7TA 1HSEA 1NL5A 2Z8DA 1MXXA 3A09A 2VD2A 3TCHA 1SQYA 3B6TA 2PMSA 1OMPA 2VHAA 3SEWA 5JTYB 1F9BA 2ZNUA 4Z0IA 3RT8A 3Q27A 1ZBMA 4U23A 4G8NA 1FCKA 5JK4A 4GFRA 3UORA 1MH4A 2IEEA 1D9VA 3KOTA 4N07A 3VE1B 4Z7EA 5CBSA 1B46A 2THIA 5A5XB 3PUYE 5DVJA 3R26A 5H8QA 1QUIA 2B3BA 3T9UA 1EZPA 2H5YA 4ONYA 1ZMGA 3TCFA 3UGWA 3FATA 4F19A 4QFPA 4EXLA 4GIZA 3RGYA 3H7MA 2HCAA 4P11A 1NNFA 1SI1A 3O6IA 1Y9UA 3HV1A 1PDAA 3KJ7A 3PMXA 3OO9A 3OMBA 2HZLA 3PUVE 4FATA 2VP1A 4NF5B 4PFTA 4ZEDA 4BDLA 3FJ7A 2OWSA 4NTLA 1AIVA 4NF4B 3CG3A 1TT1A 1B1HA 4IO7A 4WEPA 3MPLA 3AXFA 1M5BA 1OVBA 1ZLQA 1N7WA 2PBWA 1MM7A 3MP8A 1AL3A 3V83A 2B65A 2DYXA 4RXLA 4G2ZA 4I9DA 3BFUA 3K6UA 2B3FA 3U8QA 5AA2D 3KSJA 4N13A 4YB7A 2H4IA 4O3CA 2F97A 3BBRA 1PBQA 3T22A 3TAJA 2REGA 2AYSA 3H3GA 2FNCA 1JETA 1LAHE 4QRZA 4DE8A 4JBZA 1IXCA 4U22A 2XXRA 4XKPA 3F11A 2OWTA 3U93A 3K02A 3KBRA 3LSLA 4R73A 2NXOA 4KQPA 1YTVA 4LZ7A 1S9TA 1DOTA 1LFIA 4HS7A 1MQGA 3IL1B 2UVHA 1MQDA 2FA7A 1FQAA 2ZYNA 3IB0A 1R9LA 1LB9A 1O63A 2DE2A 1USYH 4ZZAA 3T96B 3C9HA 3M3LA 4TLLB 3VXBA 1NNKA 1OLAA 2XXIA 3ZSFA 3CR9A 3TZAA 4C1TA 3K1NA 1FW0A 1DTZA 1US4A 4EDPA 2HQ0A 3KEIA 1LSTA 1IZ1A 2XXPA 3OXNA 1HSJA 3OO6A 4ISUA 2DP8A 3C32A 4GD5A 5DT6A 3PD9A 2UYEA 3O6HA 5ISUA 3B6QA 3C31A 3IJXB 3KFMA 3H03A 4YZZA 4GXSB 3CFXA 4DIGA 1QUJA 4EQ7A 1TWYA 1B40A 2OZZA 1MY4A 3TTLA 4NWCA 3TTRA 1PEBA 4KR5A 2Q88A 2QS1A 3QUJA 1PB8A 2DE3A 5I2KB 1LBBA 3G7WA 3TTKA 2ZNTA 3MW0A 4I1DA 1JNFA 5KDTA 2XHDA 1ZIUA 5I59A 1LLSA 1VFEA 1SD3A 1DMBA 2O7UA 4FAJA 1P1OA 2I3WA 3FVOA 4PFYA 1H44A 3D4GA 3MVWA 4H65A 1PC3A 4ELOA 3KOSA 3FJMA 4R6HA 4YKPA 4HW8A 3DM0A 3K1PA 3JYRA 3QSLA 3FGSA 2Y7KA 2Y84A 5CRYA 3FIRA 4MH5A 3MQ9A 1XVYA 2Z22A 5AA2B 4DXUA 3K6XA 1MRPA 3PUWE 2QMXA 3DP4A 4AB6A 4PETA 1QUKA 4Q0CA 1B3GA 3PPQA 4DLDA 4FJPA 3N26A 1P1QA 3GXAA 4H0WA 1URSA 4F1YA 1YAEA 3C34A 2XXTA 4LUBA 3CIJA 5ITPA 4C1UA 2R71A 4EQ9A 4LQ5A 5CBRA 1D3KA 2BJJX 5CI5A 4YKJA 1L5TA 1TXFA 4OERA 1A54A 4H67A 4Q8RA 1EU8A 1JEUA 1LCTA 3LSXA 1FTMA 1MQIA 5I56A 3IO4A 1H45A 4XIGQ 4G8MA 2NUVA 4G68B 3Q29A 1IQ7A 3N6UA 2HAUA 4EF2A 3LBSA 3PUZE 1B2HA 2O6AA 4BDRA 1NH7A 1FQFA 3N5LA 2NWJA 1EH3A 5LOMA 3S4UA 4GQOA 4F3SA 4NMYA 4ZEIA 2O84X 1P1WA 1NNTA 2VGQA 4JWXA 3PPRA 4LATA 3CFZA 5BUUA 2D5WA 2I58A 4GL8A 3MVZA 4RK9A 4DCYA 4OFOA 4WXJA 5KCJB 5EHSA 1WVJA 4X1DA 4X1BA 4F3GA 4F1VA 3RQTA 1BLFA 4R6KA 4RPNA 3G3FA 2DQVA 3FXQA 4JB7A 2P1SA 5CM6A 2V84A 4KPTA 2I3VA 1Z7NE 2O68A 2GFEA 2RC9A 4R2BA 4Q5TA 3KGCA 1MY1A 4QFOA 3GZGA 3U72A 1R9QA 1JW1A 2PT2A 5DVFA 5AA4A 4KCDA 2IA4A 3EHSA 3EF7A 1SW2A 2F36A 1A8EA 2ABHA 1Y4TA 2Z8EA 2H98A 1N7XA 1FQDA 4KYDA 4U21A 1OVTA 1B3EA 1H76A 4ND9A 4GLIA 3VDFA 3I3VA 2HEUA 3I6VA 1FTOA 2P0SA 2A5SA 2QL3A 3S9EA 1OQGA 4ZEKA 4MLVA 4EQBA 5TPAB 5K2XA 1ZJLA 1N3XA 3H06B 1PBPA 1UIVA 2QS3A 4EXKA 4NF8A 4F39A 2CMOA 4FIMA 4H8JA 4NF6B 1IXGA 4OHNA 3FUZA 4DXCA 1XHYA 3KJTA 2F78A 4FECA 3SEUA 1TFDA 4MBPA 1RYXA 2QRYA 5FHOA 1R1NA 4OMBA 1EZ9A 2PVUA 2RKMA 5L9MA 1US5A 1SYHA 4BDQA 2GHAA 4U2RA 1Y3NA 2FYIA 1MY0A 1M5DA 3HSTA 4F29A 4XKNA 3TMGA 5I58A 3CRBA 3CI8A 4GF8A 2Q8JA 1WDNA 5FHNA 1MQJA 1VSOA 1MY2A 1NNPA 1Y3QA 3FXUA 2PYYA 3V89B 3JZJA 2DWIA 5CMKA 1OLCA 1B52A 2I0CA 2F6GA 3MZ9A 1B7HA 5H8NA 2XX7A 4H5FA 4OENA 5I56B 3TQWA 1YPNA 4F3BA 4YB6A 4WKMA 3W15C 4OEVA 2ZNSA 1IITA 5H8HA 4F3PA 4E0XA 4RNSA 1HSLA 1POTA 5K2YA 4RPOA 3V8XB 3A3UA 4FEDA 3IK6B 3LR1A 3VLUA 3OEKA 1Y1ZA 3G3JA 4QFLA 4KCCA 4ZZEA 4ELRA 1JVXA 4OFLA 1MPDA 2QS2A 3IORA 3MVYA 4IY5A 4ELQA 4IGRA 3TFLA 3IOTA 3FXRA 4GL0A 4PFUA 3MZ1A 5I2NA 2VD3A 4AQ4A 2NVUB 1FTJA 5DEXA 2I48A 2AL5A 4RYAA 2F7AA 4LQ2A 4AB5A 2V3UA 1N0TA 2F6PA 2KLFA 2DWHA 2F34A 3KZGA 1FQCA 4KI0E 3Q25A 3VVFA 3CFLA 3IO6A 3HHGA 4ESXA 5AA4B 1MDQA 4LZ8A 1VR5A 1ZU0A 2RCAA 4OFJA 5J1DA 4R6YA 3PPNA 2I6EA 2W7YA 3B6WA 4PQJA 3ONMA 1RYOA 3L6HA 3M3KA 1LGBC 3LSWA 2ONKE 3TELA 1MPCA 5H8SA 3FZVA 1YCJA 4H1XA 2R6GE 4ZS9A 3KN7A 1GR2A 1P1UA 2E0SA 4QFKA 4NF8B 1FTKA 3R6UA 2XXXA 4JXIA 4UA8A 3BKIB 2UVIA 3Q28A 4DDDA 3VLWA 1QVSA 2PX1A 1LCFA 1MY3A 1GGGA 2HXWA 4GWOA 5IKBA 1QJMA 2XXQA 3RTWB 3SDFA 2I4BA 3EPEA 3VV5A 3EHTA 2AL4A 3T9HB 4U1OA 2G93A 3O29A 1B3HA 4IO5A 3L6GA 5ICTA 4F31B 5I58B 3SESA 5H8QB 3RUMA 3K1MA 4DXBA 4QHQA 4F1UA 1DSNA 5M2VA 1B6HA 1JW4A 3UA8A 3SEVA 2PT1A 1AOVA 3K6WA 4R75A 1Y3PA 4R9FA 5L8DA 1SI0A 3HN0A 3OO8A 1MXYA 3TDJA 2OCUA 4IO2A 5H8HB 4K3FA 2DVCA 1JVYA 1VE4A 1ANFA 2ZMBA 1IEJA 5I57A 3JV9A 1MG1A 2XXWA 1JW5A 1GV8A 1B7ZA 3O28A 2Y7IA 3IAZA 1SYIA 4F22A 4F2OA 3TUSA 1B1XA 1B5JA 4ECFA 2GHBA 1OIBA 1URDA 1USYE 1JEVA 3H6WA 1PB7A 5AA1A 5AA3A 1I6BA 5I2NB 3RTFB 3RLFE 5A5XA 3IB1A 3M8UA 2CZLA 3W9WA 3K6VA 4E0WA 3RN8A 3N6TA 2E1SA 2DWJA 5ITOA 3SEYA 1UQWA 3UIFA 3MC2A 3KG2A 4KYEA 1LB8A 1WODA 2I49A 2RF1A 5B70A 2O1LA 3GBBA 3IX1A 1URGA 1QKAA 5HBCA 1GTKA 3RT6B 3TKDA 5CC2A 4NF5A 1SBPA 4NF4A 3VVDA 4MFIA 1LFHA 5JEIA 1AMFA 4H5GA 3CVGA 4TQUQ 3ZKLA 2LAOA 4XXUA 3O6GA 2OLBA 3H6UA 5I84A 1A55A 2O69A 1MDP1 5ELVA 3E4RA 3OO7A 1P99A 4U4SA 4UACA 3OOAA 4I62A 2H25A 3B7DA 1BKAA 3PMVA 2VOZA 5DYHA 1I6QA 2V93A 4OTEA 4RA1A 3MPKA 5TP9A 3SERA 1RKMA 4IB2A 3EN3A 2NOOA 4YICA 5KDTB 3C4MA 1IUDA 1MPBA 3HHFA 1MXVA 4KYSA 5I59B 1A99A 3FASA 4LONB 1IXHA 3D4CA 3T66A 3PGFA 3OELA 4ZE8A 4DZ1A 1ELJA 1KWHA 1TFAA 2R9JA 1I6AA 4QSDA 4TOZA 1OQHA 2QSXA 3FD3A 2ANJA 1AH5A 1LAXA 2AIXA 2REJA 1P1NA 4I8CA 4RY1A 1BIYA 1SVXB 3G3HA 2D3IA 1CE2A 1DPEA 3ZKKA 2ZYKA 4EUOA 3FV1A 2YPNA 1B32A 4NWDA 4LA9A 5FTIA 4R2FA 3MWBA 2YLNA 1T0KA 3KN3A 4POXA 5I57B 3U94A 4XKRA 2F5XA 2Y7RA 3G3GA 3IOWA 2H99A 3KSXA 4YKKA 4FE8A 5EYFA 3R7XA 3SEXA 1IXIA 4OWDA 2Q89A 4NE4A 5I2KA 4Q30B 4OEUA 5L9OA 3LSFB 3RPWA 3C36A 3MZBA 4U1ZA 2UVJA 2V25A 1GVCA 3KN8A 4IGTA 1SW1A 2QJEA 3S9MC 2I0BA 3QYTA 4M4GA 2X7QA 1A40A 3ECRA 1N84A 2OJTA 1Q1KA 4BDMA 2GH9A 4YKIA 3THIA 3ODBA 2M8CA 4WEDA 3TQLA 1B5HA 2ALUA 1FQBA 2GRVA 5H8FA 1MXZA 4BLAA 1O64A 2V3TA 3K4UA 1B9JA 1S50A 4GRKA 3P7IA 3UP9A 4YMBA 4ZECA 3OD7A 1B4ZA 3TYHA 1FTLA 3LC8A 2XX8A 5AA2A 4IO6A 2UVGA 3VXCA 1MH3A 4NEDA 1NH8A 3VFJA 4XTCQ 4M1VA 4O3BA 1ZKBA 2RINA 5FHMA 1NKXA 3BFTA 4THIA 3OEMA 1B51A 3GLBA 2I4CA 5BWJA 4LVQA 3GBAA 3FV2A 1R6ZA 4HCWA 2XXHA 4FEBA 4R72A 1DPPA 2YJPA 4OZ9A 1B5IA 4ESWA 3G3KA 2QPQA 4KD5A 3IJOB 3MUQA 2DE4A 2O1MA 4ZEFA 5TP9B 4LP2B 4N6PA 1MXUA 2OBGA 4RJZA 2ZYOA 4G68A 4PP0A 2UYFA 1B58A 3PUXE 1S7YA 4JDFA 4G8HA 1QW0A 3O2AA 5CMBA 4HCYA 4OXVA 5KZTA 2Z8FA 2D21A 3DP6A 1LAFE 1LFGA 1QULA 3H6VA 3FJGA 5F7VA 3ILTB 2Y7PA 2ESNA 1D4NA 4PFWA 3N94A 1JQFA 5KCJA 1A8FA 1XOCA 4OESA 3ILUB 3OSQA 2O7IA 4G4PA 1ZTYA 3MBPA 3UK4A 1UTBA 3C35A 3CSBA 5B7DA 5ICQA 2ZYMA 2P2AA 4QSCA 3QK6A 4GOTA 3H4ZA 3ZS6A 2QS4A 1LAGE 4F18A 3MAMA 4U4XA 2ONSA 3IR1A 5FTHA 4FORA 4BDNA 2A5TA 3MP6A 3PD8A 3U92A 3T93B 2Y7WA 1Y4CA 5CMMA 4KHZE 3C33A 2RCBA 3K00A 4QSEA 1D9YA 4F2QA 3PPPA 4GVOA 3CSGA 3O9PA 3WAEA 3IOUA 3MP1A 2DXYA 3CG1A 3Q26A 4JWOA 4POWA 1UTHA 4KFQA 4ZE9A 4RK2A 1B7UA 4YU0A 4C0RA 4YB5A 1Z7ME 4PE5B 5H8NB 5TPAA 1B4HA 3IB2A 2HAVA 3O97A 1Y20A 2DVZA 5AE4A 4R9GA 1Q35A 1II5A 4NF6A 3QAXA 4R74A 2F35A 2XXYA 2XD3A 3S9LC 5H8FB 2XX9A 3T9VA 4QF9A 5HPQA 1SDXA 3PU5A 2HFBA 1N3WA 5JTYA 3IOVA 4X9TA 1H3DA 2RC7A 2XXVA 4H8IA 3O66A 1B3FA 4P0IA 4MF3A 3TODA 2X26A 4G68C 4JSOA 3OSRA 3E9XA 4BDOA 3MVXA 3QIMA 2ONRA 3SKPA 3RNNA 3EHUA 5DEXB 4YAHX 2WKYA 4L17A 4XKQA 3V5AA 4OQOA 3QUFA 4DCXA 2F8DA 1CB6A 4JSDA 5CMCA 3W9VA 4OETA 5HM4B 2Q2CA 3LUYA 2F7CA 1A7LA 3PPOA 2DS9A 3OENA 1BTJA 3WAFA 3SETA 4EF1A 1QKBA 3DELB 3HO7A 1SW5A 3A3CA 1MS7A 4G77A 4TLMB 4QFNA 1I69A 3USDA 4IO4A 4ZEBA 2H9BA 5IAIA 1H43A 3RY3A 3H6TA 1XS5A 1XVXA 2G29A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3E78A 3U65A 3VVEA 3PV0E 3DP8A 3E3KA 1N76A 2Z23A 3G3IA 1XC1A 4IY6A 1G0HA 1IIWA 2F7BA 3TCGA 3MYUA 1SW4A 1FQEA 1ATGA 4HTGA 1DBZA 3TPAA 4OYVA 3U1OA 4O3AA 3TEPA 4LN5A 1M5CA 3M3FA 3IFAA 2ZXTA 3TTMA 3I5OA 3EQ1A 5ET6A 3DLNA 4LZ5A 3K0VA 2QMWA 5EHMA 4N91A 1NFTA 2OK2A 3PTYA 4YMAA 4MHFA 3HPIA 1UTBB 1B0HA 1NMUA 2DXRA 4ZDMA 4MLQA 1FPGA 2XXUA 2P3VA 2WBBA 2O51A 1M5FA 2DWAA 3TTNA 2QVRA 5TU0A 1XT8A 2UXAA 4GXAA 2HHMA 3MJNA 1Y1MA 2A5TB 5DVIA 4OVJA 2HZKA 3HCQA 4P0GA 3BIGA 1B3LA 1VFDA 3VLVA 2Q2AA 2Q9TA 4JWYA 2RC8A 4O7MA 3K2DA 4ELPA 1J1NA 5EQ8A 4IO3A 3FVNA 1B05A 1MXWA 2DOJA 3PMWA 3E13X 3D1RA 3T9XB 2DSFA 2X7PA 2V3QA 3S2VA 2XA5A 1UTHB 1POY1 1EZOA 3FVGA 3QXMA 1B0LA 1N04A 2XD2A 1MM6A 4HE2A 5F1QA 1XI6A 4GWSA 4H6DA 1UIUA 4X48A 5L9SA 3S9NC 1DTGA 1BP5A 1M5EA 3K01A 1PB9A 2QVVA 2XWIA 5DTBA 1LBCA 3T0JA 2GQ1A 3UN6A 1MQHA 3FVKA 1O7TA 2DDKA 1HSEA 1NL5A 2Z8DA 1MXXA 3A09A 2VD2A 4QXDA 3TCHA 1SQYA 3B6TA 2PMSA 1OMPA 2VHAA 3SEWA 1VDWA 5JTYB 1F9BA 2ZNUA 5EYGA 4Z0IA 3RT8A 3Q27A 5I3SA 1ZBMA 4U23A 4G8NA 1IMEA 1FCKA 5JK4A 4GFRA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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