3MYQA

Crystal structure of human carbonic anhydrase isozyme ii with 2-chloro-5-[(1h-imidazo[4,5-c]quinolin-2-ylsulfanyl)acetyl]benzenesulfonamide
Total Genus 77
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
77
Knots found
sequence length
257
structure length
257
Chain Sequence
HWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Indapamide-like benzenesulfonamides as inhibitors of carbonic anhydrases I, II, VII, and XIII.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Carbonic anhydrase 2
molecule tags Lyase
source organism Homo sapiens
total genus 77
structure length 257
sequence length 257
other databases KnotProt 2.0: K +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2010-05-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 3myqA00
2VVAX 3N0NA 3RZ1B 1I9MA 5DOHA 1XPZA 1G1DA 4R5AA 3V3IB 4FVNA 1FQNA 3RGEA 2Q1BA 1RJ5A 3F7BA 1G52A 5L3OA 3RYXB 3HS4A 5CACA 1BNVA 4Q83A 1DMYA 4E3GA 3ML5A 4Q08A 2FOVA 5A25A 1ZGFA 2WEGA 3PYKA 5EH5A 4G0CA 3M1QA 3HKNA 4RUZA 4Q6EA 3MNHA 5C8IA 4Q99A 2FMZA 1ZSCA 1TE3X 9CA2A 3M04A 3EFIA 1HEDA 1CIMA 3M2NA 4G7AA 4YGKA 5AMGA 4E4AA 1OKLA 4FVOA 5DRSA 1CNXA 1Z93A 2NWZA 4QIYA 5A6HA 1YDDA 1LZVA 2WD2A 3RYJB 3DC9A 4Q09A 1CANA 3K2FA 1FR4A 1CA3A 3DVBA 4Q8XA 3FE4A 3TMJA 3P5AA 3M5SA 1CCUA 3M2YA 3MNKA 3ZP9A 4Q81A 5FDCA 1FQLA 1UGGA 3GZ0A 4CNRA 4Q7WA 3MMFA 3OILA 1DCAA 1IF9A 5IPZA 1UGCA 3NI5A 4CACA 4YXIA 4QTLA 5CJFA 1AVNA 2NXSA 5FNLA 3RZ5A 4YXUA 1ZSAA 3IBLA 2HOCA 1JCZA 2X7UA 4Z1KA 3W6HA 5DSNA 1BNMA 3N2PA 2Q38A 5E2SA 5SZ7A 4XIWA 1BNUA 1G4JA 3MNAA 1G4OA 2FNNA 3PJJA 1BV3A 4PYYA 1CNJA 3DCSA 3T5ZA 4MO8A 3MYQA 3KNEA 3V3JA 4ETQC 1CNCA 3S75B 4RN4A 4L5UA 4ILXA 3B1BA 4E5QA 2CBBA 3HKUA 3V3GB 1KOQA 4QJMA 1CVFA 4ZAOA 1TG9A 4E9OX 1EOUA 4YX4A 4XIXA 3C7PA 4YGJA 1TH9A 3KKXA 3TVOX 4JSAA 1CVDA 3IBNA 3KOIA 2H4NA 5DOGA 3N3JA 1G48A 1H4NA 2CA2A 1I8ZA 3DD0A 3S72B 4K0SA 4TWLA 3JXHC 3TVNX 3BL0A 4CA2A 3K7KA 3LXEA 1IF6A 3MHLA 1CZMA 4M2WA 1KWRA 2CBDA 3NB5A 4ZWYA 1I9PA 3S78B 5DSQA 2W2JA 4HF3A 3U7CA 4BCWA 1HEBA 4R59A 2NN1A 3MZCA 4QK3A 4WL4A 2CABA 12CAA 1YDBA 1XEVA 1A42A 3SAXA 3BETA 5E28A 3SBIA 1HECA 1KEQA 4KUWA 2ABEA 4HBAA 4E3HA 3OY0A 3M5EA 4ZWZA 3M3XA 3MNIA 4KP8A 5CA2A 2NWYA 3SAPA 2POWA 4Q07A 3P3JA 3HLJA 4XZ5A 5FDIA 3B4FA 3DVCA 2O4ZA 3F8EA 4QJOA 1IF8A 5FNHA 5EZTX 3RYZA 2CBCA 5SZ3A 3KLDB 4QJ0A 5FL5A 1UGFA 1FQMA 3M2XA 3IEOA 4QK2A 1G54A 1YDCA 4QK1A 5EOIA 1I9NA 2Q1QA 4YHAA 3M5TA 3JXFA 2QOAA 1RZCA 5JDVB 1I9LA 5JGSB 4Z1EA 4HEYA 2HNCA 3BL1A 3OYQA 2POUA 3ML2A 4RUXA 3F4XA 4K0TA 4QY3A 3SBHA 1CAJA 3U47A 4CNWA 3U45X 4Q7VA 3V2JA 3M1KA 6CA2A 4KP5A 8CA2A 3RG4A 3IBUA 5JG3B 5E2KA 4WW8A 5E5RA 5BNLA 1ZH9A 2FOQA 1OKNA 3KONA 3L14A 4UOVA 5DSOA 1JD0A 1OKMA 1RZEA 3RYVB 4CNVA 1CALA 4HEWA 5BYIA 4LP6A 3MDZA 3S77B 2ZNCA 4JSSA 4YWPA 4E3DA 5FLTA 4ZX0A 4Q8YA 1CAHA 2X7SA 4RUYA 4MDLA 4ZX1A 1JV0A 4X5SA 5DSLA 3T82A 1CNKA 1ZFKA 5JGTB 3P5LA 4KNJA 3UYQA 3PO6A 5LMDA 4QSAA 4C3TA 1HUGA 1TEQX 4LHIA 5DSMA 4QSJA 1CVBA 3D92A 4WUQA 2VVBX 2FOUA 1CVAA 4Q87A 1THKA 2NNGA 2WEOA 1G46A 4YGLA 2EZ7A 3MNUA 3CZVA 1CRAA 2QO8A 1MUAA 1YO0A 3VBDA 5FLPA 1J9WA 1ZE8A 3IBIA 5DSRA 2NWPA 4L5WA 4QJWA 2NNOA 1CCTA 2FNKA 4DZ9A 3T5UA 3S71B 5JEPB 4Z0QA 4TWMA 3RZ8A 1CAMA 4KV0A 4Q78A 3DD8A 1FSRA 1LGDA 1RZBA 1BN3A 1G6VA 2EU3A 3HFPA 4ZWXA 4MDGA 5EKJA 1XEGA 1ZNCA 5FLSA 2NN7A 4FPTA 1CNIA 4PYXA 5J8ZA 1CAKA 5FNJA 5E2NA 5FL6A 3K34A 4WW6A 3M1WA 4COQA 1G0EA 3V2MA 2NNSA 3OIMA 4XFWA 1ZGEA 2NWOA 5BRUA 4Q9YA 5E5UA 3D9ZA 1BICA 3DV7A 4QJXA 2GD8A 4Q90A 2OSFA 3IGPA 5G01A 4L5VA 5SZ6A 3P3HA 3V3HB 4N0XB 5SZ0A 3M96A 1KOPA 1CAIA 4KNIA 3ZNCA 2GEHA 3RYYA 1CINA 4PZHA 4Z1JA 4ITOA 5JEGB 5JEHB 3DC3A 1CNYA 4Q7PA 5DSPA 5DVXA 1FLJA 1Y7WA 5FLOA 5DSIA 3MHIA 3HKTA 4K13A 2WEHA 3KOKA 2H15A 1G53A 5HPJA 1BNQA 2AW1A 4IWZA 1I91A 1HEAA 3OYSA 4Z1NA 1RZDA 3RZ0B 4QEFA 5EKHA 2AX2A 4KUYA 3P58A 1LG5A 2ILIA 4WR7A 1ZSBA 3EFTA 2NXRA 4Q06A 4GL1X 3CYUA 1CNHA 4M2UA 5JQ0A 4JSZA 4XE1A 4Q7SA 3T84A 1CAYA 4HT2A 4RIUA 3W6IA 4R5BA 1V9EA 3KS3A 1I90A 1CAOA 1BNTA 2HD6A 3P44A 4Q49A 3U3AX 5FNKA 4WUPA 3DAZA 3M40A 3KIGA 3M98A 3D8WA 1IF5A 3S76A 1FR7A 5FLRA 2HKKA 4FIKA 2CBAA 3F7UA 4MDMA 5SZ5A 4QJPA 4E3FA 1HCBA 1LUGA 4HEZA 1CNBA 4BF6A 1CVHA 1DCBA 2OSMA 2WD3A 4RFDA 4Q8ZA 3RLDA 5BRWA 4HT0A 4RH2A 3QYKA 1UGDA 4YVYA 1CA2A 4E49A 3P4VA 1HCAA 3DVDA 1CCSA 4DZ7A 3DA2A 1F2WA 4FRCA 5L6KA 1BCDA 5DSKA 3T85A 2NMXA 4JS6A 4QSBA 1TEUX 1TB0X 5DSJA 4ZWIA 1AM6A 3RG3A 2F14A 3FFPX 4QIZA 3OKUA 5EHVA 4MTYA 1UGBA 4N16A 4FL7A 4QSIA 3T83A 3DBUA 3D0NA 3MHCA 4PXXA 1FQRA 2FMGA 5JESB 1I9QA 4HU1A 1H9QA 5EH7A 4KUVA 2FW4A 2WEJA 1V9IC 1HVAA 1YO1A 3IAIA 3V7XA 1BN4A 1H9NA 5EH8A 1MOOA 3V5GA 2FNMA 2IT4A 1RZAA 4FU5A 5JQTA 4MLTA 1BNWA 4YXOA 4CQ0A 5E2MA 5FNMA 3DCCA 4MLXA 3RJ7A 1UGEA 5EIJA 4ITPA 1FSQA 2CBEA 3M2ZA 5G0CA 4Q0LA 4YYTA 4PQ7A 4LU3A 5SZ2A 2QP6A 2EU2A 3S97A 1YO2A 5FLQA 2FOSA 3UYNA 3MNJA 5FL4A 1KWQA 1CVCA 5EHEA 4RFCA 1OQ5A 1TBTX 3R17B 1G3ZA 1IF4A 4JSWA 1CRMA 5FNGA 3M67A 3R16A 1XQ0A 1CVEA 4K0ZA 1BNNA 4KAPA 3FW3A 5AMDA 1CNGA 1G0FA 4YGFA 3P55A 5SZ1A 3S74B 5JG5B 3CAJA 2X7TA 1TG3A 3S9TA 4RIVA 4CNXA 1RAZA 1LG6A 5CLUA 4IDRX 3D93A 5FNIA 1AZMA 5AMLA 5G03A 3V3FA 3MHMA 3OKVA 1UGAA 1T9NA 7CA2A 1CAZA 3KWAA 1CNWA 3HKQA 4K1QA 4YGNA 1ZFQA 4KNNA 1TTMA 4M2RA 2NXTA 1I9OA 5G0BA 2HL4A 1CILA 3N4BA 2FOYA 3MHOA 5BRVA 4KNMA 5EHWA 3JXGA 3Q31A 4M2VA 3RZ7A 1URTA 4BF1A 3M14A 3NJ9A 3DCWA 2NNVA 1Z9YA 4Y0JA 3S73B 1HUHA 1IF7A 1RAYA 1BZMA 3M1JA 1RJ6A 1YDAA 1Z97A 1DMXA 3MWOA 5EKMA 5SZ4A 5E2RA 4Q6DA 2POVA 1G45A 2HFWA 1FSNA 3CA2A 3S8XA 1BN1A 3OIKA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2VVA X;  3N0N A;  3RZ1 B;  1I9M A;  5DOH A;  1XPZ A;  1G1D A;  4R5A A;  3V3I B;  4FVN A;  1FQN A;  3RGE A;  2Q1B A;  1RJ5 A;  3F7B A;  1G52 A;  5L3O A;  3RYX B;  3HS4 A;  5CAC A;  1BNV A;  4Q83 A;  1DMY A;  4E3G A;  3ML5 A;  4Q08 A;  2FOV A;  5A25 A;  1ZGF A;  2WEG A;  3PYK A;  5EH5 A;  4G0C A;  3M1Q A;  3HKN A;  4RUZ A;  4Q6E A;  3MNH A;  5C8I A;  4Q99 A;  2FMZ A;  1ZSC A;  1TE3 X;  9CA2 A;  3M04 A;  3EFI A;  1HED A;  1CIM A;  3M2N A;  4G7A A;  4YGK A;  5AMG A;  4E4A A;  1OKL A;  4FVO A;  5DRS A;  1CNX A;  1Z93 A;  2NWZ A;  4QIY A;  5A6H A;  1YDD A;  1LZV A;  2WD2 A;  3RYJ B;  3DC9 A;  4Q09 A;  1CAN A;  3K2F A;  1FR4 A;  1CA3 A;  3DVB A;  4Q8X A;  3FE4 A;  3TMJ A;  3P5A A;  3M5S A;  1CCU A;  3M2Y A;  3MNK A;  3ZP9 A;  4Q81 A;  5FDC A;  1FQL A;  1UGG A;  3GZ0 A;  4CNR A;  4Q7W A;  3MMF A;  3OIL A;  1DCA A;  1IF9 A;  5IPZ A;  1UGC A;  3NI5 A;  4CAC A;  4YXI A;  4QTL A;  5CJF A;  1AVN A;  2NXS A;  5FNL A;  3RZ5 A;  4YXU A;  1ZSA A;  3IBL A;  2HOC A;  1JCZ A;  2X7U A;  4Z1K A;  3W6H A;  5DSN A; 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