3MZ1A

The crystal structure of a possible transcription regulator protein from sinorhizobium meliloti 1021
Total Genus 50
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
50
sequence length
212
structure length
208
Chain Sequence
LPKGRLRVETASAFANLVIIPALPEFHKKYPDIQIDLGVSDRTYLAENVDCAIRAGTLTDQSLIARRITEMKFVACASRDFLERHPVPQHPSDLEKNCYVVGYFLPKQQMPFHFRRGNEEIEVSGRYTMAANESTTYLAAARAGLGVIQAPLFMVREDLRNGTMVPVLPDWQVEPMPIYLVYPPNRHLSSRLRVFADWVVKVMAQSQN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The crystal structure of a possible TRANSCRIPTION REGULATOR PROTEIN from Sinorhizobium meliloti 1021
rcsb
molecule tags Transcription regulator
source organism Sinorhizobium meliloti
molecule keywords Putative transcriptional regulator
total genus 50
structure length 208
sequence length 212
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-05-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00126 HTH_1 Bacterial regulatory helix-turn-helix protein, lysR family
A PF03466 LysR_substrate LysR substrate binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3mz1A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3mz1A02
1ZBMA 3CRBA 4HCYA 1URGA 3TFLA 5H8NB 1A40A 5DT6A 1RKMA 4XKNA 3UORA 2UVIA 2HAUA 2Q8JA 3H6VA 4EQ9A 2V3QA 1B1XA 3V5AA 1B5HA 1MQGA 3PMWA 4EXLA 4TOZA 4YKJA 4QHQA 5BUUA 2DWIA 3CI8A 4YKPA 3TTKA 3W9VA 1CE2A 4DE8A 2HCAA 1OVBA 2QMWA 4OWDA 3VVEA 3PPPA 4X48A 4R72A 4ONYA 2Q89A 4X9TA 4LZ8A 3ZKKA 1LCTA 3R6UA 3IB0A 3QXMA 2QSXA 3VXBA 3MAMA 1VSOA 1S9TA 3FXQA 3RNNA 1B05A 2F36A 4JWYA 4H1XA 4IO7A 3IAZA 4ZS9A 1LB9A 2XXQA 4TLMB 2F35A 1P99A 4F2OA 2XXXA 3PD9A 2Z22A 2ABHA 1ZJLA 3TCGA 4KCDA 2H99A 4BDQA 4OFJA 4QFPA 4GXSB 4IB2A 4IO3A 5K2XA 4P0IA 3G3FA 2LAOA 2PMSA 2CMOA 2HFBA 1B7HA 3CVGA 3K1MA 3M3FA 5H8NA 4GWOA 2YPNA 5TPAB 2Y7KA 4OMBA 4N6PA 1US5A 4DCYA 4N07A 4EF2A 4DXUA 1N0TA 2RKMA 3OO9A 2DS9A 2I4CA 4R2FA 5ITOA 4LATA 1B0LA 1SDXA 1N04A 3MVWA 3SEWA 1ZU0A 3SKPA 4RNSA 1FQAA 4NWCA 5L9MA 4PETA 1N76A 2UXAA 1FTOA 1I6BA 2HAVA 4H6DA 3FIRA 2FA7A 4R6HA 3GXAA 1S50A 1M5CA 5FHOA 1SW4A 4F18A 3PUYE 3Q29A 5ISUA 1F9BA 3HHFA 2KLFA 1DOTA 4IGRA 1Z7NE 3KSJA 4KCCA 4KYDA 3OEKA 2F5XA 2PX1A 2QRYA 4POWA 1MPDA 1MM7A 3JZJA 1IXGA 1Y4CA 3PUXE 3ODBA 4P11A 4RYAA 4IO5A 1Y3NA 3CR9A 3IOUA 4C0RA 3U1OA 3H6TA 4UA8A 3QYTA 1MY0A 2DE3A 3FJMA 2I0BA 5CMMA 4ZZAA 5H8FA 4LZ5A 1O7TA 4NF8B 3EHUA 1Y3PA 1JQFA 5I56B 1AOVA 5DVIA 1GVCA 2XX9A 1B3FA 5I2KA 4LUBA 1D3KA 4OENA 1OQGA 2ESNA 2R71A 4ZEDA 3SEXA 4RJZA 1LAGE 2FYIA 3PV0E 1JW4A 3TQLA 2NOOA 1B9JA 1I6QA 3IJOB 1B2HA 4EXKA 3BKIB 4ELOA 1PC3A 2XXYA 1DTZA 2X7PA 1ANFA 1SBPA 4DDDA 4I9DA 4F39A 4YB5A 4BDOA 4Q5TA 2P1SA 4ZDMA 2XXWA 4GOTA 5I84A 3RN8A 2DWAA 2ONSA 3PPRA 3TDJA 3R7XA 4OESA 4OEUA 3KG2A 2DYXA 2V84A 3U94A 1QW0A 4DXCA 2FNCA 4G2ZA 2VD3A 3K1PA 4PP0A 2DE4A 4R9GA 3LSFB 1B5IA 3K00A 2VP1A 4KYEA 1FCKA 3HHGA 1B3GA 2E1SA 4HTGA 5DEXB 3CFZA 2O1MA 5KDTB 1LLSA 5HPQA 1PEBA 3K6WA 2XD2A 5TP9B 4YKIA 1PB8A 3S9LC 1JNFA 1PDAA 3S2VA 1H45A 2NUVA 2GH9A 1M5EA 3A09A 3KN8A 1R9QA 2HXWA 1Y9UA 4PQJA 3C9HA 2NXOA 3PPNA 2PYYA 1MDP1 2Z8FA 2BJJX 3C31A 1N7WA 1R1NA 1XOCA 2B3BA 3IORA 3N94A 1VR5A 5LOMA 3M3KA 3VLVA 3H4ZA 3KZGA 2D3IA 2IEEA 1AIVA 2DWHA 2Q9TA 4POXA 3TYHA 4FEBA 3UP9A 2ONKE 1MH3A 1M5FA 1MY2A 1XS5A 2RCAA 1USYH 4F3GA 5FHNA 4X1DA 4F3PA 1H76A 1Y1MA 1B3LA 4BDLA 3K4UA 2QJEA 1N3XA 5I2NB 1DPEA 4M1VA 2G29A 3SEYA 4G8HA 2XXVA 3MZ1A 4MLVA 1Y3QA 2YLNA 1S7YA 1NMUA 1LBBA 2O68A 1MXWA 3C36A 5L8DA 2PBWA 1JVXA 2OLBA 2I3VA 4OQOA 5DEXA 3IO4A 4JWXA 3HO7A 2REGA 1A8FA 2H4IA 4RK2A 1ELJA 5KDTA 1OLAA 3SEVA 2XXUA 4NF5B 3EHSA 3C4MA 5TP9A 3E13X 3N6TA 1N7XA 4MBPA 2ZXTA 4U4SA 3RTWB 3B6WA 2H9BA 3ECRA 1IUDA 4GIZA 1OLCA 5FHMA 4ECFA 4FAJA 3SERA 2ZYMA 3O9PA 2DQVA 3EQ1A 3OO7A 4NEDA 3G3GA 4THIA 1J1NA 3K6XA 1SW1A 4KI0E 1EU8A 1EH3A 3MZ9A 1MY3A 3RPWA 5CBSA 1UIUA 2UVGA 3KJTA 3T9XB 2YJPA 5AA3A 1RYXA 3PU5A 4O3AA 3TCFA 3UA8A 4IO6A 2V3UA 4NTLA 1MDQA 2X7QA 4RXLA 4PFWA 3IB2A 3WAFA 1MRPA 3HN0A 5I2NA 1LAXA 2Y7WA 3VV5A 3D4GA 4QFOA 2H98A 3A3UA 2RINA 4ELRA 1VFDA 3KEIA 1QUJA 3DP4A 4EF1A 1EZOA 4KFQA 5A5XB 4H5GA 5DYHA 2UVJA 5CMKA 4AB6A 1LFGA 2UYFA 3OO6A 2DOJA 2UVHA 4NF5A 3E3KA 1EZ9A 2Q2CA 3N26A 3EF7A 4ELQA 4YMBA 4ESWA 2QS2A 3LSWA 5H8QA 5DVJA 4KQPA 1B7UA 1JW5A 4JDFA 5M2VA 3AXFA 1MH4A 3C35A 5DTBA 3OSQA 1ZIUA 3PMVA 1B40A 2F6PA 2I0CA 1XC1A 4R2BA 4LP2B 4ZEIA 4M4GA 3QSLA 3C34A 3S4UA 1JETA 5AE4A 1ATGA 1MXXA 3O2AA 4BDRA 4DCXA 5AA2A 4YZZA 5CBRA 1URDA 3O97A 3T9VA 5I58B 3O28A 1GGGA 2GFEA 1GR2A 1A54A 4HCWA 5BWJA 1VE4A 3G3HA 3EPEA 2XXPA 3G3KA 1QULA 5B7DA 3CG1A 4F22A 3THIA 4JXIA 3DP8A 2HQ0A 2V93A 4G8NA 3MW0A 1B3EA 5A5XA 3TTNA 2H25A 5I57B 3R26A 1D4NA 4X1BA 2RC8A 4E0WA 5B70A 3FVNA 2F7BA 4MF3A 2AYSA 2DVZA 4FORA 3MUQA 4ZZEA 4OYVA 1O64A 3VVFA 2O6AA 1LCFA 3GBAA 1MXYA 3SESA 4F19A 5ITPA 1SYIA 3U93A 3TQWA 3U92A 2R6GE 4XKQA 4FE8A 2XXIA 4MH5A 5ELVA 4PFTA 3WAEA 2ANJA 2RF1A 4KPTA 1Z7ME 4R75A 1POTA 3RT8A 5L9SA 5I58A 3TODA 3HPIA 1MG1A 1B7ZA 3ZSFA 3FV2A 1D9VA 2Z8EA 4GRKA 1SW5A 5CM6A 4JWOA 4O3CA 5TPAA 1P1NA 2OZZA 1R6ZA 4QRZA 1MQJA 4F1VA 1B46A 2Q88A 2ZYOA 5H8HB 3GZGA 1MM6A 4WKMA 1BTJA 2RC7A 5I57A 2R9JA 2PT2A 3FV1A 1AL3A 2REJA 3IOVA 1IZ1A 2X26A 4LVQA 4OXVA 1LBCA 4ZEFA 1T0KA 3KBRA 2DXYA 1A55A 4H65A 5EYFA 5DVFA 4LZ7A 4MLQA 5F1QA 3LBSA 1IQ7A 1FTLA 3T9UA 3Q27A 3FASA 1LGBC 3MZBA 2QL3A 5HBCA 3SETA 1MS7A 1MQIA 3Q28A 4U1OA 1XVXA 1Q35A 1DTGA 3K0VA 2XX7A 3P7IA 3TAJA 1O63A 2G93A 4NF6B 4H67A 5JTYB 1TXFA 3T22A 4P0GA 4RK9A 5CI5A 4YB7A 3T66A 4NWDA 4YU0A 1FTMA 3L6HA 2A5TB 4R9FA 3PMXA 2AL4A 4XXUA 1ZLQA 2XD3A 2M8CA 3H6UA 3TTRA 1FW0A 1Y20A 1H44A 2O51A 4F3BA 1TWYA 2H5YA 1DPPA 3HCQA 1NFTA 1IXCA 5H8HA 2B3FA 3ONMA 4NF8A 4U22A 4PFUA 1JVYA 1OIBA 5CRYA 3IB1A 5I56A 1IITA 3K02A 5ICTA 1MPBA 2THIA 1B0HA 1FQCA 1A99A 4ZEKA 1LFIA 2I49A 1QKAA 5JEIA 5ICQA 4BDMA 2QS1A 3H03A 3MVXA 3IK6B 4U1ZA 4R74A 3VLUA 1Y1ZA 1SI0A 1QKBA 4FEDA 1YPNA 1A8EA 3CFLA 3E9XA 4IY5A 5AA2D 4H0WA 3S9MC 2F7AA 1IEJA 2OBGA 4AB5A 2NWJA 4BLAA 3RTFB 2ALUA 3BFUA 4U2RA 4NF6A 3T96B 5JTYA 2I6EA 1JEUA 2HEUA 1WDNA 2DWJA 1H43A 2F34A 3PPOA 4AQ4A 1P1UA 3TTLA 5FTIA 2V25A 2RC9A 4QSEA 3TTMA 2E0SA 3I5OA 4EUOA 1TT1A 3FXRA 3MP1A 1BP5A 2XXRA 3RY3A 3IJXB 2F78A 3V89B 4F1YA 1LAFE 3CSGA 3EHTA 3TZAA 3ZS6A 3TCHA 4QFLA 4KHZE 2ZNTA 3F11A 4NE4A 4Z7EA 2Y7IA 2OCUA 4GQOA 1PBQA 4IY6A 4YKKA 1HSJA 4F31B 1JEVA 5EHMA 3MWBA 4JSOA 2F6GA 3IR1A 5TU0A 1QUKA 2Q2AA 4F1UA 4R6YA 1YCJA 3IX1A 1R9LA 3CSBA 1KWHA 4RPNA 3FJGA 3BFTA 1N3WA 3OSRA 4JB7A 2W7YA 3LR1A 3TMGA 2I4BA 2O7UA 3MP6A 2O1LA 3USDA 4R73A 1NNPA 2F7CA 1US4A 2V3TA 3CG3A 1BLFA 4IO4A 3U72A 1LFHA 3DELB 5J1DA 3FVKA 4GXAA 3OMBA 4QSCA 1LB8A 1NH7A 5IAIA 2QS4A 4Q8RA 3KSXA 4ZE8A 4OEVA 4WEPA 4HS7A 2XXHA 2P0SA 2Z8DA 4OERA 1Y4TA 3MC2A 4IGTA 1L5TA 3CIJA 3JV9A 2IA4A 1CB6A 1MPCA 1WODA 1M5DA 4ZECA 1FTKA 1ZMGA 3W15C 3LSXA 4G4PA 3OEMA 3B7DA 5K2YA 3N6UA 2CZLA 2PVUA 4H8IA 1AH5A 4JBZA 1ZTYA 3H06B 3KOSA 1II5A 2QPQA 1AMFA 2O69A 3RLFE 3K2DA 4R6KA 3GBBA 3H6WA 4QFKA 2AL5A 2QMXA 2DSFA 3OELA 1FQFA 3MPKA 4K3FA 2RCBA 5CMCA 3D4CA 3V8XB 5EHSA 3KFMA 3FJ7A 4RA1A 4LA9A 1OQHA 4YICA 3HV1A 4G68B 3I6VA 1MQDA 3LUYA 1B52A 1OMPA 3MVZA 3O6IA 2Y7PA 2DVCA 3PPQA 1B4ZA 3RQTA 1QJMA 4UACA 1B6HA 1P1WA 4GF8A 2OJTA 2P2AA 2XHDA 3LSLA 4GFRA 4HW8A 5FTHA 2DXRA 1EZPA 1XVYA 1MXVA 4EQ7A 3TPAA 4G77A 3G3JA 3K6UA 4GLIA 1B4HA 2O7IA 1SI1A 3MBPA 3C32A 3FGSA 5H8FB 3W9WA 3S9NC 3PUVE 4OVJA 5CC2A 3IO6A 2WKYA 1USYE 3B6QA 5I2KB 4IO2A 4FIMA 1NKXA 3L6GA 4C1UA 3PUWE 2I58A 4GD5A 4FECA 4ZE9A 4XKRA 3OOAA 3H3GA 1VFEA 3TEPA 5KZTA 3CFXA 4O3BA 1HSLA 2VD2A 3FVOA 4G68A 4EDPA 3VFJA 3VE1B 1IXIA 3FUZA 2PT1A 4GL8A 1B1HA 1P1OA 2ZMBA 3K01A 4XKPA 3ILUB 1RYOA 3MQ9A 3T9HB 2VHAA 1XT8A 4RPOA 3SEUA 3C33A 3PGFA 4BDNA 4YB6A 4Z0IA 1D9YA 1H3DA 4OZ9A 3T93B 1BKAA 4F2QA 1UQWA 4H5FA 1P1QA 1LAHE 4XTCQ 2F8DA 4NF4B 3U8QA 3O6GA 1SVXB 2HZKA 4H8JA 4OETA 3MP8A 4U23A 1NNKA 4QF9A 3MPLA 1PB9A 1PBPA 2ONRA 5IKBA 5AA4B 2OK2A 2NVUB 3V83A 1B32A 1DSNA 2AIXA 4F3SA 1SW2A 1MY4A 2I48A 3M8UA 3KOTA 1NNTA 3B6TA 1UTBB 1PB7A 4YAHX 4N13A 3DLNA 3FZVA 4DZ1A 2A5SA 1SYHA 3PD8A 4G68C 4DIGA 1BIYA 2XX8A 4NMYA 3I3VA 1QUIA 2O84X 3IOWA 5I59B 4DLDA 3DP6A 3OENA 3K6VA 4I62A 1TFDA 3UN6A 2B65A 4ZEBA 4C1TA 4OFLA 1ZKBA 1M5BA 4U21A 3HSTA 1UTHB 3K1NA 4FATA 4OTEA 1MQHA 2ZYNA 2VGQA 2QS3A 4EQBA 1FTJA 3UIFA 2Y84A 2I3WA 3KN7A 3RUMA 3G3IA 4G8MA 3VVDA 3E4RA 4NF4A 1N84A 2ZYKA 3O29A 2D5WA 1B58A 2Y7RA 3EN3A 3VLWA 1LSTA 4LQ2A 2F97A 1YAEA 1UIVA 1URSA 3LC8A 5L9OA 3O66A 3TELA 2VOZA 5AA4A 4RY1A 3M3LA 1OVTA 3KN3A 5H8SA 4E0XA 1B5JA 2XXTA 4FJPA 4PE5B 4WXJA 1MXZA 5JK4A 1WVJA 4KR5A 5KCJB 4DXBA 3KJ7A 1UTBA 4MFIA 3KGCA 1MXUA 1GTKA 2DP8A 4YMAA 3OO8A 3QIMA 1IXHA 3G7WA 1IIWA 1NNFA 3DM0A 4KYSA 4ND9A 5I59A 1NL5A 4I1DA 1DMBA 2A5TA 4GL0A 3N5LA 4Q30B 3VDFA 4ELPA 4ISUA 1Q1KA 2HZLA 4TLLB 3RGYA 4JSDA 2OWSA 5HM4B 1UTHA 2ZNSA 1MY1A 4L17A 4QFNA 4XIGQ 5CMBA 3BBRA 2GRVA 1TFAA 1HSEA 3QUFA 4I8CA 1JW1A 3GLBA 1FQBA 3RT6B 5F7VA 2D21A 2UYEA 3O6HA 3UK4A 4LQ5A 1SD3A 3QUJA 2ZNUA 3UGWA 1I69A 2GHBA 3IOTA 1QVSA 3VXCA 4OHNA 1A7LA 1FQDA 3ILTB 2DE2A 5H8QB 5AA1A 1B51A 4LONB 3FD3A 4OFOA 2GHAA 3TKDA 4Q0CA 3Q26A 1B3HA 3H7MA 3MVYA 3OXNA 5KCJA 3FVGA 3A3CA 1SQYA 1NH8A 1FQEA 2Z23A 3TUSA 3ZKLA 4TQUQ 3QK6A 4ESXA 3IL1B 3Q25A 3SDFA 3FXUA 1POY1 3OD7A 4QSDA 4U4XA 5AA2B 4PFYA 4WEDA 3S9EA 1YTVA 2OWTA 1GV8A 3MJNA 4F29A 3QAXA 3FATA 1XHYA 1I6AA 3JYRA 4GVOA 3PUZE 4KD5A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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