3N26A

Cpn0482 : the arginine binding protein from the periplasm of chlamydia pneumoniae
Total Genus 65
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
65
sequence length
231
structure length
231
Chain Sequence
DRNRIWIVGTNATYPPFEYVDAQGEVVGFDIDLAKAISEKLGKQLEVREFAFDALILNLKKHRIDAILAGMSITPSRQKEIALLPYYGDEVQELMVVSKRSLETPVLPLTQHSSVAVQTGTFQEHYLLSQPGICVRSFDSTLEVIMEVRYGKSPVAVLEPSVGRVVLKDFPNLVATRLELPPECWVLGCGLGVAKDRPEEIQTIQQAITDLKSEGVIQSLTKKWQLSEVAY
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Exploiting antigenic diversity for vaccine design: the Chlamydia ArtJ paradigm.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transport protein
source organism Chlamydophila pneumoniae
molecule keywords Amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding p
total genus 65
structure length 231
sequence length 231
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-05-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00497 SBP_bac_3 Bacterial extracellular solute-binding proteins, family 3
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3n26A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3n26A02
3W15C 4YB6A 3ZKLA 5AA2D 5DEXB 3UA8A 1EZPA 2FYIA 3LSWA 1B32A 4HS7A 4U21A 1A99A 1N76A 1SQYA 3G3JA 4BDOA 4QFNA 4G4PA 4IY6A 1RKMA 4KYDA 5CMBA 3MQ9A 2YPNA 3O2AA 4QFLA 3K4UA 4THIA 2O7IA 1LFHA 3WAFA 1UTHB 4G2ZA 3CG3A 1SW1A 3SERA 5DVIA 3Q25A 3TFLA 1B0HA 2O1MA 3GBBA 4EXKA 3T22A 2RC8A 2F34A 5L9SA 1YTVA 1AH5A 3MVYA 1LCFA 4R9GA 5FTIA 1H3DA 1JW1A 3C35A 2Y7WA 3K6WA 3QXMA 1MPBA 4FJPA 4JXIA 1M5FA 3TTNA 2VOZA 4DIGA 2Z22A 2DXRA 1FW0A 4AB5A 3EQ1A 1EU8A 5H8QA 2OCUA 5I2KA 3TELA 4BDLA 4F3SA 3RGYA 1N04A 5H8HA 2P1SA 3TUSA 3SEYA 1RYXA 2I4BA 2Z23A 2P0SA 1MXVA 3HSTA 3U72A 3FZVA 2QL3A 4DXUA 2RCAA 2ESNA 2ZXTA 3BFTA 4OYVA 2REJA 3DP6A 4LZ8A 4X9TA 1FQEA 2QPQA 1KWHA 5TP9A 3N6UA 2ANJA 4ONYA 2ZNTA 4KYSA 1IITA 2LAOA 4U1OA 3PU5A 2AL5A 4MLVA 1B3GA 2Z8EA 4ISUA 4YU0A 3RUMA 3QUFA 2RC9A 5TPAB 3DELB 2Y84A 4RPNA 1OLCA 2ONRA 2F7BA 4KQPA 2DP8A 3M3LA 4P0GA 2V84A 4AQ4A 4IO4A 3KG2A 1N3WA 3TODA 1PDAA 3HN0A 3V5AA 3IJOB 1F9BA 2ZNUA 3MP1A 1A55A 4PFTA 1H45A 3P7IA 3MVXA 5CBRA 1URGA 4NF8A 3PPRA 2QS2A 2F7CA 3GLBA 5I59B 4LQ5A 5A5XB 3PUVE 4KD5A 3ZKKA 1SYHA 5FHMA 1QKAA 1VE4A 2OWTA 4R2BA 2IEEA 2HFBA 3FGSA 1PB9A 4JSDA 1EZ9A 2D21A 3D4GA 4JWOA 2HZLA 3O29A 4Z0IA 2RCBA 3MJNA 4EF1A 3DLNA 5DTBA 3OEKA 4EXLA 2O68A 3IOUA 3KJTA 1LCTA 4ZEDA 3LBSA 3PPPA 4DZ1A 4OERA 3K6XA 2IA4A 4NF4B 3MWBA 1J1NA 1S9TA 1B46A 1ZKBA 1GVCA 2QMWA 3TTMA 4PETA 3VLUA 4DDDA 3H06B 3LSFB 3N6TA 4QFKA 3TDJA 4F22A 4KFQA 3H4ZA 2OJTA 4YB7A 1I69A 4I62A 3UP9A 4TLMB 4KI0E 2Y7PA 1LFGA 1MXYA 2DE3A 1O63A 2HAVA 1XC1A 4G68A 4QHQA 3HCQA 3IR1A 2P2AA 3CSBA 1S50A 3ZS6A 3FVNA 2NVUB 4Z7EA 3FVGA 4YMAA 1ZBMA 2HZKA 1P99A 5KCJA 3HHGA 3E3KA 4KCCA 5HM4B 2A5TB 5CMCA 4BDRA 4IGRA 1LBBA 4DCYA 3OOAA 1P1WA 1B6HA 1B7HA 3U1OA 3N26A 1XS5A 1SI0A 2XXIA 4IB2A 2DXYA 3OELA 4I1DA 1WODA 2HXWA 5AA3A 2DWHA 2FA7A 4G8NA 3UGWA 4LONB 4WXJA 3TQLA 5BWJA 1P1UA 1SBPA 3FUZA 4IO6A 3LR1A 1PB7A 5F7VA 3TCFA 2QS1A 5FHOA 3G3HA 4EQ9A 4NF5A 1UIUA 3T9XB 5AA1A 4K3FA 3SEVA 5H8FB 4ELPA 3QUJA 2XXPA 1LLSA 2XXXA 3OENA 2PVUA 4R75A 5L8DA 4ZZAA 3IK6B 1SW4A 2A5SA 4WKMA 3L6HA 3HO7A 1B7ZA 5CC2A 4F1UA 2O7UA 1LBCA 3B6TA 1US5A 1CE2A 4OWDA 3ILTB 1NNFA 4F39A 1Y4CA 2DVZA 5HBCA 2XXRA 3H6UA 3THIA 1IUDA 4FATA 3JV9A 4ECFA 1L5TA 1AIVA 2CZLA 1M5CA 5IAIA 4R6KA 1NNKA 1B0LA 3PPNA 4AB6A 4YKKA 2NXOA 1NL5A 3O97A 1OQHA 5CBSA 4XIGQ 3RTFB 5DEXA 1B5JA 2Y7KA 1QUIA 4PFUA 3USDA 1JVXA 3EHSA 3H3GA 4MFIA 3R26A 4NMYA 5LOMA 1VSOA 3Q28A 4IO2A 3BKIB 3CFXA 4ELRA 3IX1A 4LVQA 1DMBA 3CR9A 2UVJA 1OVBA 1MDP1 1I6QA 4OETA 4TOZA 3EHTA 4PP0A 2V3TA 1BKAA 4DCXA 2WKYA 2Z8FA 1MM7A 3MVZA 1D4NA 1UTHA 2ALUA 4Q8RA 4F1VA 4YKJA 3FASA 2BJJX 1BIYA 3C33A 3RT6B 4UA8A 1ZLQA 1POTA 1WDNA 2NOOA 3G3FA 1Z7NE 5ITPA 1LB9A 3MP8A 3M3FA 3PUXE 3QAXA 5AE4A 1PBPA 3EN3A 1N7WA 2F35A 2UVGA 4MLQA 3RTWB 1I6BA 3K1NA 1NH8A 4LATA 1SW2A 4KHZE 3H7MA 3UIFA 4EQBA 4N6PA 2NUVA 1B4HA 3FV2A 4ZZEA 5AA2A 3RQTA 4RYAA 1Y20A 1MQIA 3G3GA 4IO7A 4P11A 4E0WA 1PC3A 5H8NB 2Q89A 1R9LA 3Q27A 1MH4A 4MF3A 2XHDA 2VD3A 1UQWA 2GH9A 1ATGA 1QKBA 1B5IA 4XTCQ 3C36A 4ZEFA 4OFJA 1O7TA 3O9PA 5TPAA 3S2VA 3FXRA 2ONSA 3VVEA 1JEUA 2Y7RA 3IORA 1UTBB 3VXCA 5HPQA 3S4UA 2O6AA 3TZAA 2OK2A 3PV0E 1QUJA 2DQVA 4GWOA 5ICTA 4GLIA 2OWSA 2XX7A 2XXUA 4F2QA 3CFLA 4YKPA 2ABHA 1SI1A 3PMWA 4OEUA 2XD3A 3L6GA 5I59A 4O3CA 5A5XA 2UXAA 1B4ZA 4X1BA 1FCKA 3MVWA 3VLVA 2Q9TA 3VDFA 5KDTB 2I58A 1DTGA 4OXVA 5M2VA 1B05A 4RK9A 1JQFA 5I56B 4LZ5A 1MRPA 1Y9UA 5ELVA 1B52A 3LSLA 4JBZA 1TT1A 1QULA 2HAUA 5DVFA 2ZYKA 4DE8A 1FTOA 3BBRA 4WEPA 3V8XB 3CFZA 3GZGA 2AIXA 4JDFA 4NF4A 3G7WA 5H8SA 1URSA 1XHYA 2XX9A 3TMGA 1Q35A 1QUKA 3S9MC 4KCDA 2V93A 2DE4A 4I9DA 1FQBA 2UVHA 1ZMGA 3MZ1A 4FAJA 1M5BA 2ZYNA 4EDPA 5DT6A 1B3FA 3RPWA 5ISUA 1YPNA 1NKXA 4R6HA 3PMXA 4NTLA 3SETA 4GFRA 2THIA 1IXHA 3FJGA 3D4CA 1II5A 4MH5A 1B1XA 1MS7A 3PPQA 1WVJA 2W7YA 4FIMA 4RA1A 3H6TA 1MY1A 1YAEA 4NWDA 3O28A 5H8QB 5I58B 5JK4A 3K2DA 3CG1A 4H8IA 4YKIA 5I2NB 1B3LA 2DVCA 3C34A 4LZ7A 4OQOA 2RF1A 3E4RA 4QRZA 1QVSA 1MY4A 3IB2A 3DP8A 2DSFA 1TFDA 3K00A 2O51A 3T66A 4G68C 3U92A 4C0RA 3FV1A 4RXLA 1FQCA 4PQJA 2M8CA 1OLAA 5K2XA 3FD3A 1US4A 2H5YA 1MH3A 3KBRA 1D9YA 4LA9A 5H8FA 4LP2B 3SESA 5TU0A 3N5LA 1UIVA 4QFPA 3S9EA 4GL0A 1JETA 3TYHA 1MQHA 2F97A 1NFTA 5JTYA 1MY3A 2DOJA 4OFLA 3IO6A 4H5FA 4N07A 1HSJA 2Z8DA 4DXCA 1DPPA 3E13X 4POWA 5ITOA 3TKDA 4NF8B 3FXQA 3OSQA 2F6PA 3OO9A 2O69A 1N3XA 1H44A 1A8EA 1ZTYA 1LAFE 5EYFA 4OHNA 1MY2A 2VHAA 3TPAA 2RC7A 5AA4B 5EHSA 4GF8A 3IOVA 3PD8A 3DM0A 4ZS9A 4JWYA 4YB5A 2OLBA 2I6EA 1Y3PA 1MY0A 3TTKA 2PMSA 4OEVA 1MDQA 1B3EA 1D9VA 4QFOA 1OQGA 1FTMA 4GVOA 3HV1A 3K01A 3S9LC 1USYH 3MPKA 5I84A 1N0TA 2XXWA 1TWYA 3HHFA 4TLLB 2X7PA 3I6VA 2UVIA 4YAHX 4NEDA 1AMFA 1PBQA 4G68B 4H0WA 5CMKA 2QS4A 1ANFA 1POY1 1NNTA 2ONKE 3R6UA 4R72A 3MZ9A 3KN3A 2QSXA 2OBGA 1TXFA 4IGTA 5I57B 4ND9A 2HQ0A 1DPEA 2XX8A 1JW4A 3IB1A 4Q0CA 1A8FA 2Q2CA 4GIZA 3B6WA 2ZYOA 3KN8A 4O3BA 5K2YA 5EHMA 2I0CA 1XOCA 3K02A 1NNPA 2RINA 4KR5A 3KZGA 2F6GA 2GHAA 3T9VA 1GR2A 1RYOA 4U1ZA 4OESA 3U94A 2I49A 2YLNA 4RY1A 3VV5A 4RJZA 1LFIA 4OVJA 4OTEA 3EF7A 4R74A 4FEDA 4U4SA 1FTKA 2QS3A 3SKPA 3OO6A 2UYFA 2H4IA 5FTHA 4F1YA 4I8CA 3RN8A 2HEUA 3MUQA 4PFWA 2KLFA 3ODBA 2F78A 1M5EA 4GXSB 2H98A 1AOVA 1OMPA 3WAEA 4EF2A 4H67A 2PT1A 4F19A 4M1VA 3I5OA 4PE5B 2H99A 3LUYA 1BLFA 4U2RA 2UYEA 1MM6A 4ZEIA 1UTBA 1B58A 1FQAA 1QJMA 2FNCA 3PPOA 1IXCA 3PUZE 4GD5A 3QIMA 2HCAA 4ELOA 3MAMA 2R71A 5B70A 3EPEA 1O64A 3A09A 3AXFA 3ONMA 4ZEBA 1P1OA 1DSNA 5KDTA 2XD2A 2F8DA 4ZE8A 3T96B 4F29A 1TFAA 3MZBA 1MQDA 3B6QA 3TAJA 1USYE 2GRVA 1MXZA 3FVOA 1B51A 4HCWA 1Y3QA 3RY3A 5L9OA 1DOTA 4GQOA 3DP4A 2E0SA 1A54A 2V3QA 3M8UA 3Q26A 3SEXA 3GBAA 4O3AA 1LAHE 1CB6A 1IEJA 1MXXA 3A3CA 3BFUA 2GHBA 4F3GA 4BDQA 5DVJA 1PB8A 3T93B 2B65A 3E9XA 1NH7A 4GOTA 4IO3A 2RKMA 1DTZA 2NWJA 4DXBA 1B7UA 3SEUA 4IO5A 5CI5A 1P1NA 3PUWE 3MC2A 4QSCA 2ZNSA 2VP1A 1B1HA 3UN6A 1GTKA 2F36A 3H6VA 2DYXA 4PFYA 4UACA 4NF6B 2F7AA 3TEPA 2REGA 4YICA 3N94A 1MQGA 3O6GA 3HPIA 3QK6A 2G93A 3TCHA 1MXUA 5ICQA 4G8MA 5I58A 3OD7A 1XT8A 3PMVA 1R1NA 3R7XA 1R9QA 1QW0A 4N13A 4RPOA 3SEWA 3C4MA 3FATA 1SDXA 5I2NA 2PT2A 2VD2A 2ZYMA 1MXWA 4ZDMA 4C1TA 1VFEA 1ZJLA 1IZ1A 5AA2B 3K0VA 2QMXA 1SVXB 3G3IA 2Q8JA 2XXQA 1LSTA 1Y1ZA 2PX1A 3KEIA 2QRYA 4H65A 1NMUA 4ESWA 1A7LA 2G29A 1SYIA 2H25A 2CMOA 1JVYA 4H5GA 3JYRA 3U8QA 3VVFA 3A3UA 4FEBA 2I4CA 1MQJA 4QSDA 5B7DA 3PGFA 5IKBA 3FJMA 3TTLA 3K6UA 2DE2A 1B2HA 4R73A 2A5TA 1H76A 1GGGA 3Q29A 5I2KB 1M5DA 5H8HB 2DWAA 4GL8A 3C9HA 2AYSA 4OMBA 4L17A 2V25A 3ECRA 3VXBA 1IXIA 1SW5A 3RNNA 2O84X 1LB8A 2I3VA 3CSGA 2I0BA 3I3VA 2I48A 3V83A 5AA4A 5BUUA 3IJXB 1P1QA 3VFJA 4X48A 5FHNA 4EUOA 3QYTA 4YMBA 3KN7A 3B7DA 2R6GE 3EHUA 3FVKA 4R2FA 2XXHA 2X7QA 5TP9B 1A40A 2DS9A 4HTGA 3KOSA 3PD9A 3SDFA 1SD3A 5CMMA 1GV8A 5J1DA 3PUYE 3OO8A 4ZECA 3IOTA 4BLAA 1S7YA 3OO7A 5KZTA 5DYHA 2VGQA 1Y1MA 2B3FA 4WEDA 4ZEKA 3O6IA 1FQFA 4FE8A 1ZU0A 2OZZA 2PBWA 3MP6A 1Z7ME 2D3IA 4JB7A 3VLWA 3LSXA 5CM6A 5JEIA 3CRBA 4IY5A 1FTJA 2QJEA 3V89B 3GXAA 4JWXA 4XKNA 5I57A 4EQ7A 3FJ7A 1EZOA 4XKQA 1VR5A 3VE1B 1H43A 1LAGE 1XVYA 1JW5A 1Q1KA 4HW8A 4QSEA 2E1SA 3U93A 2AL4A 4HCYA 3MPLA 1I6AA 3OEMA 4NE4A 2D5WA 3LC8A 2DWJA 3IAZA 4LQ2A 4BDNA 4RNSA 1IQ7A 3W9VA 2XXTA 3TTRA 4ZE9A 4H8JA 3OSRA 1HSEA 1OVTA 1B3HA 1XVXA 2Q88A 3C32A 3JZJA 4LUBA 2B3BA 3UK4A 1T0KA 1MG1A 4G77A 3CVGA 4Q30B 3TCGA 3C31A 3ZSFA 4QF9A 1YCJA 3CI8A 3IO4A 4XXUA 3OMBA 3H6WA 4YZZA 2X26A 2F5XA 2YJPA 1BP5A 2DWIA 1JNFA 3O66A 3T9UA 4RK2A 5JTYB 2O1LA 3S9NC 2XXVA 1FTLA 4DLDA 5KCJB 3W9WA 2Y7IA 3FXUA 3KSJA 3MBPA 4ESXA 4H1XA 3KFMA 4OENA 1BTJA 4POXA 3M3KA 2H9BA 3UORA 3CIJA 3H03A 4R6YA 3KOTA 4U22A 5L9MA 3IOWA 1IXGA 4GRKA 4E0XA 3ILUB 4GXAA 1PEBA 3TQWA 4F3PA 2I3WA 2Q2AA 4XKRA 2ZMBA 4JSOA 4G8HA 1B5HA 3G3KA 4FECA 4NF5B 5F1QA 4H6DA 4C1UA 4MBPA 4Q5TA 3RLFE 4F2OA 5H8NA 1R6ZA 3KJ7A 3VVDA 4OFOA 1LAXA 3MW0A 1IIWA 4TQUQ 1D3KA 4OZ9A 4XKPA 3K6VA 1VFDA 1JEVA 1LGBC 3F11A 3KSXA 4U23A 5CRYA 2XXYA 4U4XA 1MPCA 1Y4TA 1N84A 1EH3A 1ELJA 3QSLA 2GFEA 2V3UA 1B40A 1HSLA 1Y3NA 3RT8A 4F31B 4BDMA 4KPTA 4R9FA 1ZIUA 3IB0A 4ELQA 3K1PA 1B9JA 1URDA 4P0IA 4F18A 1OIBA 3FIRA 4NF6A 3T9HB 3OXNA 3K1MA 1N7XA 1AL3A 2R9JA 4M4GA 2PYYA 4F3BA 4X1DA 5I56A 1MPDA 4FORA 3KGCA 1FQDA 3O6HA 4KYEA 4NWCA 3IL1B
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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