3N6UA

Effector binding domain of tsar in complex with its inducer p-toluenesulfonate
Total Genus 55
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
55
sequence length
205
structure length
205
Chain Sequence
GHITFAASPAIALAALPLALASFAREFPDVTVNVRDGMYPAVSPQLRDGTLDFALTAAHKHDIDTDLEAQPLYVSDVVIVGQRQHPMANATRLAELQECRWAFSSAPRGPGAIIRNAFARYGLPEPKLGLVCESFLALPGVVAHSDLLTTMPRTLYERNAFKDQLCSIPLQDALPNPTIYVLRRHDLPVTPAAAGLIRWIQHHAL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Structural studies on the effector binding domain of TsaR
rcsb
molecule tags Transcription regulator
source organism Comamonas testosteroni
molecule keywords LysR type regulator of tsaMBCD
total genus 55
structure length 205
sequence length 205
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-05-26
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3n6uA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3n6uA02
2D5WA 5M2VA 1OMPA 4C1TA 2DWJA 4G2ZA 2O6AA 4QHQA 3PPRA 1POY1 2HQ0A 5DYHA 2DP8A 1DOTA 3QK6A 4N13A 1US5A 3OD7A 4I8CA 4HS7A 1MXXA 5ISUA 3TCFA 2Z8FA 3KSXA 1Y9UA 3HSTA 1Y3QA 3SEYA 3RLFE 1ELJA 1EH3A 1B4ZA 3FXRA 1EZ9A 1UQWA 4HW8A 3CG1A 3CFZA 2Z8DA 1PB8A 3CFXA 3WAFA 5CM6A 3MP6A 4G77A 2RCBA 4RYAA 3VE1B 4DLDA 1ATGA 1GGGA 3C9HA 3S9EA 1Z7ME 4QSEA 1Q1KA 1S50A 3FGSA 3FZVA 1OVBA 1NKXA 3GXAA 1B5HA 4GXAA 4G8HA 1YAEA 3LR1A 1MRPA 1N7WA 3IX1A 2ZNSA 3IK6B 5AA2A 2GH9A 1IXIA 1B7UA 3FJMA 4RNSA 3TCGA 4EDPA 1FTLA 3EF7A 1LLSA 3KGCA 3PMWA 4Q8RA 4RK2A 1ZLQA 1D9VA 2F8DA 3UN6A 4OETA 1POTA 3ECRA 3RQTA 1LAGE 3I3VA 1T0KA 1MQGA 3K1MA 4ND9A 4OHNA 1VSOA 1FQBA 4GOTA 5HBCA 1Y20A 2F7AA 4RPNA 1N84A 1MXWA 4OEVA 1R9QA 1EZPA 3V83A 1QW0A 2F78A 1VFEA 1LB9A 2H9BA 3HN0A 4JWXA 4YMBA 1SW5A 1FTOA 1GV8A 3K6WA 3I5OA 2HZKA 2XXIA 2DWAA 1NNTA 3IOWA 3Q26A 4KPTA 4JXIA 1JW1A 1YTVA 4F29A 1BP5A 2AL4A 3U1OA 2QSXA 1PEBA 3TFLA 3S9MC 1B0LA 1D4NA 4PE5B 3LC8A 3FV1A 4OENA 4NF5B 4WEDA 4F1YA 4PFTA 1QJMA 1P1UA 4H1XA 5TU0A 1FTMA 1MXVA 4IO2A 4KCCA 1M5CA 4P0IA 4BDMA 4QSCA 4C0RA 1DTGA 1M5BA 2HEUA 3V89B 3W9VA 2AL5A 2FA7A 2D3IA 2ABHA 3C36A 1MPCA 1ZIUA 2I6EA 2KLFA 3C4MA 4ELRA 4DXCA 2Z22A 1VR5A 5F7VA 1MS7A 4LZ8A 1IEJA 3UIFA 5HM4B 4QFKA 4EF2A 4O3CA 4DXUA 2QL3A 3MVYA 3ODBA 1F9BA 3IJXB 2F5XA 3OOAA 3OXNA 4YMAA 3GZGA 5CC2A 2UXAA 3VVDA 3OO7A 1JW5A 4Z0IA 2PBWA 3I6VA 1PB7A 1ZJLA 1LCTA 3VFJA 2QPQA 1JETA 3DP6A 5A5XB 2I4BA 1OLAA 3PUWE 4F1VA 3OSRA 1B3EA 2VD3A 2NUVA 1JNFA 4GD5A 5ICTA 1I69A 3MVWA 3IORA 4N07A 1USYH 3SEUA 3TQLA 4LQ5A 1BTJA 4RY1A 4H65A 4JWYA 3A09A 4F3PA 1SW1A 4ECFA 5CMMA 2XX8A 3EHSA 2NVUB 5I84A 1MY1A 2ZNUA 4EQ7A 4G8NA 1UIUA 4EUOA 1IXGA 2REGA 3G3IA 4F39A 1RYXA 3FXQA 4Q0CA 4YAHX 5DEXA 2RC9A 5I56A 3CRBA 1CE2A 3O66A 5F1QA 5ELVA 3TTRA 2F6PA 4DXBA 3O6IA 3SEVA 5H8QA 1XS5A 4R75A 4O3BA 1XVXA 1FQFA 1XVYA 1FQDA 1H76A 2V3UA 3PUYE 1SVXB 4QF9A 5H8NA 1R9LA 1LBBA 4GF8A 3T22A 2OWTA 2A5SA 1NH7A 2PYYA 3WAEA 1MQJA 2B3FA 2YPNA 3R7XA 1LBCA 4XKNA 4H8JA 3RUMA 3UA8A 2NXOA 3MZ1A 2UVHA 4GL8A 1N7XA 3W15C 3Q27A 5CMKA 5KCJB 4R74A 2HXWA 4U23A 4F3BA 1N3WA 2R71A 3MVZA 4NE4A 2HAVA 3M3KA 2OBGA 3N94A 3FVNA 4KHZE 2P1SA 1TFDA 4PFYA 1B7ZA 5H8SA 4XKPA 1IXCA 3ZKLA 4NF8A 1DPPA 4IY5A 1WVJA 2NWJA 2XXPA 3U92A 2O51A 2CZLA 4OESA 2DOJA 4ZZEA 1UTBB 3H4ZA 1OVTA 5L8DA 2I3WA 3G3FA 3PD9A 4KR5A 2Z8EA 3KN3A 3JYRA 1H43A 5DTBA 3H6VA 1GTKA 3F11A 1VFDA 2PVUA 3H7MA 3MW0A 4GLIA 1MQIA 3TTLA 5I57A 3UORA 5K2XA 3KJTA 5B7DA 5TPAA 4R6KA 4OMBA 1NH8A 3M3FA 1MY2A 2XXYA 5DVJA 1H3DA 4QFPA 4NF4A 3CFLA 1PDAA 1B3FA 3CG3A 5ITOA 2RC7A 1J1NA 4F22A 1P1NA 3B7DA 1US4A 3O29A 1B58A 2DVCA 1TFAA 5EYFA 4JBZA 3SEXA 3U94A 5EHSA 5CI5A 3PUZE 4YZZA 3KOTA 2PX1A 4U21A 5H8HB 5ITPA 2F6GA 3OEMA 1QVSA 4U2RA 1SI1A 1UTHA 1IIWA 4RXLA 1YCJA 3U8QA 1Q35A 1MH3A 3Q28A 4MFIA 1UIVA 5IKBA 2O69A 3BFTA 2H98A 1KWHA 2H5YA 4NEDA 2ONSA 4F2OA 1LAHE 3T9XB 4QFNA 1RYOA 4YKKA 3V5AA 3FJGA 3BFUA 3H6UA 1MM7A 2XXVA 1RKMA 2GRVA 3PGFA 1EU8A 2PT1A 3GBBA 3SESA 4ZEIA 3UK4A 5I58B 4KYSA 3KJ7A 3SEWA 4X1DA 1QUIA 4TLMB 5I2KB 3DM0A 2RF1A 3O6HA 1MXZA 3IB1A 3QIMA 5H8FA 4GRKA 3MPKA 2F7BA 1SQYA 3A3UA 3G7WA 1NNKA 4U1ZA 4EQ9A 4N6PA 1B05A 1OIBA 2UVGA 3MC2A 1DPEA 2UYEA 3H3GA 3K1NA 3N5LA 3B6WA 5EHMA 3FUZA 2Q8JA 2DXYA 5FTHA 3H03A 3O6GA 1Y4CA 5FHOA 1N76A 2ANJA 4BDOA 4XIGQ 1O63A 5DVFA 1N3XA 4OTEA 4FEDA 1MY3A 2ZYKA 5CBSA 1S7YA 3SDFA 3OSQA 1SD3A 3C31A 5DT6A 3EHUA 3O97A 1PB9A 4R2FA 4M4GA 3HHFA 2DWIA 5AA4A 4KD5A 3U93A 5L9OA 5AE4A 2QMWA 4F19A 2UVJA 3MZ9A 1M5DA 2ESNA 4FEBA 2B3BA 4L17A 4EXKA 2O1LA 1B32A 5JTYB 3K01A 4YKPA 1GR2A 3MPLA 2Y7KA 3E13X 3MWBA 2IA4A 4Q30B 3PUVE 3CVGA 4OVJA 3RGYA 1R6ZA 4QRZA 3MP8A 2GFEA 2OZZA 4IO6A 4GVOA 4LA9A 4NF6B 3QSLA 3ZS6A 3PV0E 5TP9B 4R2BA 2X7QA 3KN7A 4KQPA 5CBRA 2ZXTA 4HCWA 2DWHA 4KFQA 2Y7RA 1O7TA 3OO8A 3PPQA 3HHGA 1DMBA 3L6HA 3T9HB 4ZEDA 2DQVA 3ZSFA 4ZECA 3M3LA 4YICA 3JV9A 2QRYA 2GHBA 4RK9A 4JWOA 1N04A 3C33A 3FIRA 4YB7A 1L5TA 1I6BA 2XXUA 4RA1A 2VGQA 3RTWB 3IOTA 1AOVA 2Y7IA 2V93A 3FJ7A 5KDTB 1NMUA 4F1UA 1P1WA 3C32A 3L6GA 4AB6A 3S9NC 3KFMA 4THIA 1O64A 1A55A 4UACA 1IXHA 4OXVA 1B5IA 1FQAA 1A99A 5AA3A 1D9YA 3LSXA 4R9FA 2HCAA 1B40A 4BDQA 1Y1ZA 2Q2CA 1MXYA 5A5XA 5J1DA 3IL1B 3U72A 4XXUA 4DZ1A 4U4SA 3LSLA 4X1BA 4DDDA 2H25A 1MDQA 2ZMBA 3E9XA 3EPEA 3ILUB 3ILTB 3O28A 2E1SA 3PMXA 2YLNA 2Y7PA 2YJPA 3K6XA 4LONB 1B3LA 3DP8A 3OENA 4LZ7A 4F18A 5AA1A 2VHAA 4LP2B 2Z23A 3IOVA 3CI8A 2XXTA 4DCXA 3DLNA 5L9SA 3O9PA 2XXXA 1OQGA 3MJNA 1WODA 3OMBA 4AQ4A 4YKJA 1TXFA 1SBPA 5LOMA 3TTNA 1FQCA 4ZEFA 1TWYA 1Y1MA 2O7UA 3K6VA 1MXUA 2VP1A 3DELB 2CMOA 2OJTA 2I58A 4POWA 2P2AA 4LZ5A 4XKQA 4MBPA 3IO6A 3TCHA 3T9UA 3A3CA 3T96B 1MM6A 1A54A 2XXRA 1A8EA 5L9MA 3VXBA 1LSTA 1JQFA 5KCJA 1YPNA 3AXFA 4NWCA 3IAZA 3TMGA 3N6UA 2V25A 4TLLB 4OQOA 1FW0A 1B3HA 4ONYA 1H45A 5FHNA 3CSGA 4QFLA 1D3KA 1ZTYA 2A5TA 3SERA 2RC8A 2AYSA 2V3QA 3TEPA 3GLBA 1NNFA 4XKRA 4GXSB 5I59B 2Q89A 1I6AA 3IOUA 4H67A 3TTMA 3VVFA 5ICQA 3OELA 4X48A 3TTKA 1ANFA 1CB6A 4G68A 1QKBA 5K2YA 4GFRA 4LUBA 2B65A 2DE4A 4OZ9A 3N26A 4K3FA 1XHYA 4ELQA 1BLFA 2WKYA 4ZEBA 4QSDA 1Y3PA 3JZJA 1B51A 4KI0E 2XX7A 3KN8A 1AMFA 3TZAA 4XTCQ 3FASA 2O84X 4OWDA 5I57B 4JSOA 2I49A 1OQHA 3G3HA 3RT8A 4ELOA 4NWDA 4MH5A 4PETA 3C35A 3S4UA 3D4CA 2O7IA 1B9JA 4IB2A 4H0WA 3KSJA 2P0SA 1A7LA 5I2NB 1OLCA 4O3AA 5H8HA 5BUUA 1M5FA 1IZ1A 4UA8A 4JB7A 2OLBA 1DTZA 4HTGA 4F3SA 2M8CA 3HV1A 1QUJA 3QXMA 4RPOA 1FTJA 4EXLA 1MQHA 3QUJA 4QFOA 2ZYNA 1ZBMA 1AH5A 4ZZAA 3TKDA 4G68C 4TOZA 1I6QA 5JK4A 1BIYA 1UTHB 1B1XA 1ZKBA 3IB0A 4H5FA 3LUYA 3T93B 2ZYMA 3USDA 3RY3A 3E3KA 5JEIA 1H44A 4R9GA 3MBPA 3THIA 5I58A 4FORA 3K1PA 5CMBA 4NTLA 2DYXA 4F31B 2H4IA 5I2KA 1Y3NA 2I0BA 5KZTA 3LBSA 2DE3A 3OEKA 4LVQA 4EF1A 1QULA 3KEIA 1MY4A 3RN8A 1SDXA 2RCAA 3TDJA 2V3TA 5H8FB 5IAIA 1FCKA 1SYHA 1XOCA 4OYVA 2ALUA 3D4GA 1M5EA 4WKMA 1FQEA 4I9DA 3W9WA 1SYIA 3VV5A 3VLWA 3TUSA 3V8XB 1Y4TA 2O68A 1JEUA 4BLAA 1JVXA 3H6TA 4IO3A 4ZDMA 2PMSA 2Y7WA 4IO4A 2DE2A 3H06B 1R1NA 5AA2B 4ZE9A 3VLVA 5JTYA 3PPOA 3LSFB 4DIGA 3PPPA 3Q29A 3G3GA 3P7IA 1PC3A 4E0WA 4LQ2A 4H5GA 3VDFA 3KBRA 5AA4B 1JW4A 4RJZA 2QMXA 3T9VA 1LB8A 5DVIA 2OK2A 2I0CA 3HCQA 4EQBA 4NF6A 2QS2A 4MLQA 2Q2AA 5AA2D 4ISUA 2UVIA 3C34A 3N6TA 5TP9A 1S9TA 2G93A 2F34A 3PPNA 3G3JA 4H8IA 4AB5A 4NF5A 5B70A 2RKMA 4FJPA 2DVZA 1TT1A 2Q9TA 1ZMGA 2R6GE 4IO5A 3K2DA 3PD8A 3TAJA 3OO9A 4OEUA 4FECA 4R6HA 3HO7A 4R72A 4IGRA 1BKAA 2XX9A 4POXA 1MG1A 2NOOA 3IR1A 1MPBA 2G29A 3TPAA 3VLUA 4BDLA 3R26A 3CR9A 4LATA 1JEVA 4I62A 1FTKA 2QS4A 4IGTA 3RNNA 2REJA 3MVXA 1LFIA 2Q88A 5FTIA 5HPQA 5KDTA 3UP9A 3MZBA 3Q25A 3RTFB 3HPIA 3SETA 1QKAA 2OWSA 1LAFE 3TQWA 4P0GA 3M8UA 2ZNTA 4MLVA 4U22A 2GHAA 1SW4A 3IJOB 4Q5TA 1SW2A 1URDA 1ZU0A 2V84A 1LFGA 1MQDA 1PBQA 3ZKKA 4P11A 2F97A 1B5JA 2I4CA 1B7HA 2E0SA 3B6QA 1B2HA 1AIVA 4JSDA 1DSNA 4U4XA 5BWJA 2W7YA 4I1DA 3B6TA 2VD2A 1II5A 4PFWA 4BDRA 4F2QA 1JVYA 3DP4A 4R6YA 3FVKA 4U1OA 2ONRA 2F35A 3KZGA 4GIZA 4YB5A 4ESWA 4DCYA 4FIMA 1IITA 3T66A 1MDP1 2XXHA 3EQ1A 4MF3A 4TQUQ 5FHMA 3BKIB 3G3KA 2DXRA 3GBAA 1B4HA 2XHDA 1VE4A 2HZLA 3KG2A 3MUQA 4GWOA 1LGBC 3EHTA 1URSA 4ESXA 1P1OA 1SI0A 4F3GA 2BJJX 3R6UA 4PQJA 4ZS9A 1Z7NE 2QS1A 4GQOA 3K6UA 5DEXB 5I56B 4HCYA 5H8QB 3QUFA 3FXUA 2R9JA 3IB2A 2F36A 4GL0A 4BDNA 2X26A 3E4RA 4X9TA 4KYEA 5H8NB 3LSWA 1EZOA 1NL5A 4H6DA 4OFJA 2X7PA 1B6HA 4YU0A 3CIJA 2THIA 2Y84A 3MQ9A 1LAXA 4PFUA 2O1MA 1B3GA 1B52A 3CSBA 4G4PA 2H99A 5CMCA 4IO7A 5I59A 4OFOA 3IO4A 1LCFA 4FE8A 4ZE8A 3RPWA 2DSFA 2VOZA 4OERA 2XD3A 3PMVA 2A5TB 2FYIA 1UTBA 3KOSA 3FATA 4NMYA 4IY6A 3H6WA 4NF8B 1USYE 2ZYOA 4WXJA 1A8FA 3MAMA 2RINA 2XD2A 4YB6A 4G8MA 3SKPA 4FATA 3PUXE 3K02A 4G68B 2XXQA 3QAXA 5CRYA 3TYHA 3EN3A 3BBRA 3K0VA 2OCUA 1PBPA 3FVOA 4ZEKA 1XC1A 3TELA 1HSJA 4C1UA 1QUKA 3PU5A 1HSLA 5TPAB 4DE8A 1NFTA 1A40A 4PP0A 2DS9A 3O2AA 3K00A 1IQ7A 3FVGA 1URGA 3UGWA 1B1HA 3FD3A 1GVCA 4NF4B 3OO6A 4M1VA 4YKIA 5I2NA 4E0XA 2PT2A 4ELPA 4Z7EA 2IEEA 3K4UA 3TODA 2HFBA 3S9LC 1NNPA 3ONMA 2LAOA 1MH4A 3FV2A 3VVEA 1AL3A 1B46A 4JDFA 1P1QA 3VXCA 3QYTA 2I3VA 2AIXA 4KCDA 2ONKE 2FNCA 4R73A 1N0TA 1B0HA 3RT6B 2QS3A 1MY0A 2UYFA 1WDNA 4WEPA 3MP1A 2I48A 3S2VA 2F7CA 2D21A 4OFLA 1P99A 4FAJA 4KYDA 1XT8A 1IUDA 2HAUA 1MPDA 1LFHA 2QJEA 1HSEA 2XXWA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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