3ODBA

Haemophilus influenzae ferric binding protein a -iron loaded -open conformation
Total Genus 113
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
113
sequence length
308
structure length
308
Chain Sequence
DITVYNGQHKEAATAVAKAFEQETGIKVTLNSGKSEQLAGQLKEEGDKTPADVFYTEQTATFADLSEAGLLAPISEQTIQQTAQKGVPLAPKKDWIALSGRSRVVVYDHTKLSEKDMEKSVLDYATPKWKGKIGYVSTSGAFLEQVVALSKMKGDKVALNWLKGLKENGKLYAKNSVALQAVENGEVPAALINNYYWYNLAKEKGVENLKSRLYFVRHQDPGALVSYSGAAVLKASKNQAEAQKFVDFLASKKGQEALVAARAEYPLRADVVSPFNLEPYEKLEAPVVSATTAQDKEHAIKLIEEAGL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title The role of vicinal tyrosine residues in the function of Haemophilus influenzae ferric binding protein A.
pubmed doi rcsb
molecule tags Metal binding protein
source organism Haemophilus influenzae
molecule keywords Iron-utilization periplasmic protein
total genus 113
structure length 308
sequence length 308
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-08-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3odbA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3odbA02
4NTLA 3HPIA 1MDQA 4G8NA 1WODA 3FV2A 1O64A 5ICTA 2XX7A 2F35A 4KD5A 2ESNA 3MVZA 4KPTA 4JXIA 2YPNA 4XKNA 3IJOB 3UA8A 3T96B 1MXXA 4LA9A 5IKBA 3RT8A 1URSA 2F7CA 1SBPA 4H5FA 4HS7A 3H7MA 1TWYA 3QYTA 3M3LA 5TP9B 2XXQA 1UTHA 4AB5A 1ZKBA 1A40A 3CSBA 4F2OA 4NF8B 1CE2A 1B1HA 1ZTYA 2QJEA 4ZZEA 4QF9A 1N3WA 3TQWA 5FHNA 2IA4A 1SI1A 3G7WA 1SQYA 2G93A 5EYFA 2XXRA 2VGQA 3QAXA 3IOVA 3CR9A 1NMUA 2FYIA 4MH5A 4YB7A 2O6AA 4GFRA 1P1QA 3H3GA 3KGCA 2PT2A 4LZ5A 5AA4B 5AA1A 3T22A 3RGYA 3O6GA 4BLAA 4XIGQ 5TU0A 1B58A 4OWDA 4F3GA 2UYEA 5K2YA 4GOTA 2XXXA 3ZKKA 3GBBA 4ELRA 5DVIA 1BLFA 5H8HA 3C35A 5H8NB 1Y1ZA 1M5CA 4YMBA 2UVHA 3LSXA 3OMBA 3THIA 2RKMA 1CB6A 1SW5A 2Y7KA 4Q0CA 1P1UA 4NF6B 4O3CA 2HXWA 1OQGA 3TFLA 3L6GA 3QSLA 5IAIA 1L5TA 2XX8A 3SEWA 3OOAA 4HTGA 1GTKA 3BFUA 2E1SA 4AB6A 3MBPA 1USYH 1PB7A 2HCAA 1LCFA 2Q2AA 4JWXA 4QSEA 2XXUA 4JWYA 3FXQA 5AA2A 3FVGA 2HAVA 1XVXA 3MP1A 1B3GA 5I84A 1MY1A 4DCYA 1WDNA 4LP2B 4L17A 3KBRA 2DQVA 3KJ7A 3SEVA 3CG1A 2OWSA 3O6HA 4M1VA 3RUMA 4PFWA 3CFLA 1A54A 4ESWA 4F1UA 4NMYA 2I6EA 3G3GA 4IO3A 4G68A 4DE8A 4RPOA 4X48A 3R26A 5H8QA 2QMXA 3MP6A 1MPDA 1RYOA 4KR5A 1OMPA 4NE4A 1VFDA 4YKKA 2P2AA 1GV8A 2GHBA 3PMWA 1F9BA 3QUJA 5FHMA 4N6PA 1I69A 1NNKA 4ELPA 4FORA 1US4A 3FD3A 4FJPA 5AA2D 1GVCA 3E13X 1QVSA 4ZZAA 1T0KA 3IB1A 5DTBA 1AL3A 3MC2A 1XS5A 1URGA 3FJ7A 3G3IA 3BBRA 5I2KB 1MM6A 2VHAA 1Q1KA 1N3XA 3KG2A 5KCJB 3RT6B 4BDQA 1DTZA 3S9MC 1Y3NA 5FHOA 1MXZA 3KFMA 5AE4A 3G3KA 5EHSA 2NXOA 4R74A 4YZZA 1OQHA 4IO6A 3TDJA 4QRZA 4JBZA 1BKAA 4PFTA 3ZS6A 1LB8A 1B9JA 5HBCA 1OLAA 3IORA 3K4UA 1Q35A 2QL3A 3CSGA 2F5XA 4PFUA 5JK4A 4NF4A 4C1TA 3OO7A 4QFKA 3OELA 3JV9A 3IL1B 3KOTA 4ELOA 1EH3A 2DE4A 5B70A 2I4CA 2XXHA 2Z22A 4GL8A 1ELJA 1FTJA 2H5YA 3PUVE 3HSTA 2PMSA 5BUUA 1OVTA 4KCDA 1POTA 4C0RA 1NL5A 4EQ9A 2DXRA 2QRYA 4IO2A 4EF2A 3G3FA 5DEXB 4F29A 4KI0E 5H8FB 1QUIA 3E3KA 3PUYE 1PB8A 1HSJA 3TTMA 1EZPA 3FZVA 3FVKA 3T93B 2H99A 3OEKA 3TMGA 4ZS9A 2ZYMA 3VV5A 3PD8A 1IXGA 3KN8A 1B0LA 1B5JA 1O7TA 4YAHX 3ZKLA 3PUXE 3O2AA 5ELVA 2V93A 4MLVA 1LAHE 3QIMA 4ZEIA 4JSOA 3C4MA 4AQ4A 1R6ZA 2GRVA 4OQOA 4RJZA 3RN8A 1B3LA 2H98A 3VVDA 4OEUA 4ZDMA 2Y7RA 3IB0A 2DS9A 2GFEA 1Y3PA 3MVWA 4IB2A 1FQCA 4WXJA 4GXAA 2XXTA 4PP0A 2QPQA 3MZ9A 1JW1A 3WAEA 3ECRA 2F7BA 1YAEA 4POXA 4G4PA 1NKXA 2V3QA 4Q30B 1MXWA 3CFXA 2ZNUA 5I59B 3FUZA 1PBQA 3OENA 2I58A 5I57A 2Q9TA 1AH5A 2DOJA 4EQBA 2DYXA 3CG3A 4DLDA 1Z7NE 4R6HA 1QUKA 3VLVA 5H8SA 1AOVA 5I56A 1MY2A 4ZEBA 4YB6A 3ODBA 1TT1A 3SDFA 2ANJA 3UIFA 4LQ5A 5ITOA 1EZ9A 1B46A 1XC1A 1TFAA 5TPAA 3LUYA 4KYEA 1IUDA 1ZBMA 2PX1A 4X1DA 1M5DA 1MS7A 4UACA 1SW4A 3MZBA 1S7YA 4OESA 3N94A 2Q2CA 3K1MA 3TTKA 1AMFA 4I1DA 2I3WA 4GRKA 5I2NB 5KDTB 5HPQA 1B3HA 1R1NA 1YCJA 4F19A 4RPNA 2P1SA 3JZJA 3TZAA 3PV0E 4G68C 5LOMA 5FTHA 4FEDA 1LCTA 2HZKA 5JEIA 4R2FA 5KZTA 2LAOA 1B3EA 2YJPA 3PPQA 4QFPA 4BDNA 4MLQA 3WAFA 2O69A 1ZU0A 3CRBA 1MXUA 1JEUA 2O51A 3FVOA 5FTIA 2RF1A 1ZIUA 2A5TB 4G2ZA 5CBRA 2B3BA 3N26A 3O29A 1B6HA 3KSXA 4JWOA 1GR2A 3M3FA 1RYXA 5DVFA 1A99A 3OSRA 3SETA 4RK2A 3K00A 2O7IA 3W15C 2OZZA 1QULA 1JETA 3G3JA 4ISUA 3VXCA 2DVZA 1MQHA 1SW2A 4O3AA 3N6UA 2R71A 2B3FA 4X9TA 1LAGE 3VVFA 3IB2A 2Z8EA 3B6WA 4OERA 1D4NA 1Y3QA 1DOTA 2DWHA 4Q5TA 4DZ1A 1A8EA 2X7PA 4OFJA 5AA4A 3EHSA 3HO7A 3B6TA 2H25A 2VP1A 4NF5A 4EDPA 3ILTB 1B4ZA 3SESA 4WEDA 3HN0A 4F31B 2ZYOA 3EPEA 1R9QA 1MH4A 2PYYA 4N07A 4TOZA 4OYVA 5H8NA 4ELQA 2O1MA 3TELA 5CI5A 1LGBC 3D4GA 1JW5A 1EU8A 1NH8A 2DE3A 3MPLA 4F3PA 3VLUA 3MAMA 3H6WA 1Y4CA 4JSDA 3RTWB 1Y1MA 4RYAA 4XKRA 4NF6A 3Q28A 3SEYA 1B7ZA 1FTMA 1D9VA 1BP5A 1I6BA 1LAFE 4U1ZA 1IEJA 3C34A 3O28A 1ZJLA 4WEPA 3EN3A 4BDMA 3CIJA 2ALUA 4U4XA 4EQ7A 2ZXTA 4TQUQ 1SI0A 2XX9A 5ITPA 3F11A 4GVOA 2HAUA 1RKMA 5CC2A 4I62A 4GWOA 2NUVA 3K0VA 1UTBA 2F6PA 2HQ0A 2DWAA 1B7HA 4E0XA 1FQBA 1LFGA 4JB7A 3I3VA 1XOCA 2QS2A 2PT1A 4NWDA 3FASA 1LSTA 3K6WA 3I5OA 4GIZA 3A3UA 3H4ZA 4XKPA 2Z23A 2R9JA 1FW0A 5A5XB 4R72A 4IY6A 1YPNA 3U1OA 2PVUA 3RY3A 2XXPA 3RQTA 3H6VA 4BDLA 4HW8A 4H6DA 1M5EA 3U92A 1S50A 2V3UA 2O68A 2W7YA 2CMOA 2I0CA 4F1VA 1AIVA 3DELB 4MBPA 3MW0A 5JTYB 3MVXA 3EHTA 2XHDA 2AL5A 3UP9A 3K2DA 3LSFB 2I0BA 4QHQA 4GL0A 1TXFA 3T9HB 4KFQA 2OLBA 3B6QA 1OVBA 3K01A 2O1LA 1H43A 3LR1A 4OZ9A 2RCBA 2ZYKA 1NFTA 4E0WA 4THIA 2DVCA 4R9FA 1A8FA 3C31A 1IZ1A 3IAZA 2AIXA 2VD2A 2ONKE 3O97A 2ZYNA 5KCJA 1JVYA 2DP8A 3DLNA 3C32A 4H5GA 3SEUA 2THIA 3KEIA 1IQ7A 3Q29A 4OHNA 2UVGA 3HHGA 1JNFA 3ONMA 1B2HA 1JVXA 1SD3A 1B0HA 1QW0A 1XHYA 3LC8A 3S9NC 1S9TA 2E0SA 4OXVA 4P0IA 3DP4A 2XD2A 3OEMA 3MUQA 3RPWA 4FEBA 2VD3A 3FXUA 1DSNA 1D9YA 4TLMB 5HM4B 2UXAA 4ECFA 4YKPA 4QFLA 3S9EA 4DDDA 2R6GE 3U72A 2V25A 1NNPA 3C9HA 3K6UA 3VDFA 1MQGA 2VOZA 4RXLA 2Y7WA 3M8UA 2PBWA 2XXVA 3Q27A 3TCHA 4M4GA 4YKIA 3E9XA 4O3BA 1MPCA 1VR5A 3HV1A 4FIMA 2F6GA 2QS3A 1MY3A 3N6TA 3EHUA 2Q88A 5ICQA 1DPEA 3BKIB 2WKYA 1I6AA 1FTOA 5DT6A 3MVYA 2F78A 4GD5A 4LONB 5I58B 4H8JA 4G8MA 1N7WA 3MZ1A 3U8QA 3W9VA 3C33A 4KCCA 4QFNA 1MDP1 4ND9A 3PPRA 4P0GA 1QUJA 2ONSA 3BFTA 1FQFA 3O66A 1UIUA 1D3KA 1M5FA 1LBBA 3FVNA 3KN7A 2Y84A 4OETA 1B3FA 2YLNA 5AA3A 1XVYA 4BDOA 1URDA 1NNTA 1NNFA 4PETA 1VE4A 1H76A 1B1XA 3GXAA 1UTHB 1TFDA 1IIWA 1H44A 5DVJA 2AYSA 2I48A 2XD3A 3IOWA 3PGFA 1MY4A 4N13A 1BIYA 3AXFA 4IGTA 1H45A 3Q25A 3MPKA 4GF8A 3UK4A 2DXYA 2O84X 3VFJA 1B40A 4FAJA 3KOSA 4DXCA 3UORA 5I59A 4F18A 2BJJX 4R75A 2X26A 4ONYA 3E4RA 2A5SA 3JYRA 3DP6A 4R9GA 3T9VA 3K02A 2F8DA 3QUFA 3B7DA 1MQJA 5CMMA 4POWA 4OFOA 2RCAA 2UVIA 4I8CA 3O6IA 1P99A 4XXUA 1MRPA 1Z7ME 5BWJA 1N84A 2ZNTA 4FECA 3GBAA 5H8HB 1B5HA 3EQ1A 3L6HA 4OENA 1B7UA 2I4BA 2RC9A 2AL4A 3I6VA 1SYIA 3TYHA 2IEEA 3ILUB 2ABHA 3PUZE 2CZLA 1LFHA 5CBSA 1N04A 4KYDA 3IO4A 1B51A 5I2NA 5KDTA 3C36A 3V83A 2OJTA 3S2VA 3IK6B 3N5LA 3CFZA 1IXIA 1DTGA 1MQIA 1MQDA 2XXIA 4H65A 1JQFA 3P7IA 3IX1A 4OMBA 1MG1A 3OO9A 3TCGA 2XXYA 2P0SA 5TP9A 2RC7A 3W9WA 4NF5B 3RTFB 4OFLA 4NF8A 3TODA 3TAJA 3O9PA 3MP8A 4HCWA 4RK9A 2D3IA 1BTJA 1Y20A 3K6XA 2DWIA 3MWBA 3RLFE 4EXLA 3CVGA 2QS1A 4Z7EA 5L9OA 3LSWA 3TPAA 1SYHA 2V84A 5AA2B 3TUSA 3PMVA 1IXCA 3A09A 4IGRA 4LVQA 1FTKA 5DYHA 2A5TA 4DXUA 2I49A 1SDXA 1P1WA 3K6VA 3T66A 1IITA 2H4IA 2QS4A 3EF7A 2ZNSA 4Z0IA 1OLCA 4ZE8A 3FXRA 1H3DA 4U23A 2NOOA 1ANFA 4F22A 4WKMA 5K2XA 4ZECA 1QJMA 4G77A 1B32A 3USDA 3PU5A 4H8IA 4F39A 4YKJA 4RY1A 5CM6A 2F7AA 4G68B 4JDFA 5H8QB 1A7LA 2M8CA 2NWJA 1FQAA 3QXMA 4K3FA 4YB5A 1PDAA 3FV1A 4Q8RA 3SEXA 1UTBB 3PUWE 1A55A 4KYSA 4GXSB 4XTCQ 1LB9A 4RA1A 2B65A 5EHMA 1N76A 4U4SA 1P1NA 4F3SA 3R6UA 1MH3A 3V5AA 4QSCA 4DXBA 4H0WA 3VVEA 3ZSFA 4F1YA 3UGWA 2I3VA 4P11A 4LUBA 3SERA 4U21A 4TLLB 4C1UA 2ZMBA 1SW1A 4PE5B 4ZEDA 2F36A 1FQDA 3IOTA 1US5A 2V3TA 1ZMGA 4IO5A 1PBPA 4LATA 4PFYA 2Z8DA 2Y7PA 4LZ7A 4MF3A 2ONRA 1FTLA 1II5A 4U1OA 2DWJA 3VLWA 4NF4B 4KQPA 4I9DA 1B52A 4OVJA 3H6TA 3OO8A 4GLIA 3QK6A 3OXNA 3RNNA 3OO6A 2OK2A 1N7XA 1N0TA 5M2VA 4FE8A 5F7VA 3FGSA 3K1PA 3D4CA 2RC8A 1UIVA 3TTLA 3KN3A 4RNSA 3GLBA 4U2RA 1NH7A 2DSFA 5CMCA 3KZGA 1PB9A 3PPOA 3PMXA 4QFOA 1UQWA 4R2BA 4H1XA 4YICA 1B4HA 3KJTA 2D5WA 3V89B 1MXVA 1SVXB 2OWTA 3CI8A 5F1QA 1USYE 3M3KA 1GGGA 3R7XA 5CMBA 1B05A 1VFEA 3IO6A 3U94A 4ZEFA 3T9XB 3KSJA 2Q89A 1P1OA 3LBSA 2Y7IA 4LQ2A 4BDRA 2X7QA 4ESXA 5A5XA 3S9LC 3OD7A 4H67A 2G29A 1QKAA 3OSQA 5I2KA 4F3BA 1HSLA 4EXKA 1LLSA 1LBCA 2XXWA 3UN6A 1DPPA 1O63A 4NWCA 1M5BA 3PD9A 1MM7A 4X1BA 1I6QA 4OTEA 5L9SA 3VXBA 3H6UA 3TQLA 4IO7A 2FNCA 4KHZE 1DMBA 5JTYA 2NVUB 4R6KA 4UA8A 3TTRA 4XKQA 4F2QA 2REJA 3H06B 2Q8JA 3A3CA 3VE1B 2HEUA 4MFIA 1LAXA 2HZLA 3IR1A 1PC3A 2UVJA 2Z8FA 4R73A 3GZGA 3FJMA 1FQEA 3IJXB 5B7DA 2O7UA 1Y4TA 2OBGA 4EUOA 3V8XB 4HCYA 2REGA 3PPPA 5L9MA 4DIGA 4GQOA 4PQJA 4OEVA 3TEPA 4DCXA 5CMKA 5I57B 5DEXA 2FA7A 4FATA 2UYFA 4R6YA 5H8FA 3Q26A 4YMAA 1HSEA 4EF1A 3TTNA 1B5IA 4IY5A 1MPBA 3DM0A 3U93A 1VSOA 4QSDA 3PPNA 5I56B 1FCKA 4ZE9A 3DP8A 5CRYA 1YTVA 5TPAB 2KLFA 4LZ8A 3HHFA 1ATGA 2D21A 2GH9A 2F34A 3H03A 5J1DA 1WVJA 4YU0A 3SKPA 2QSXA 3K1NA 4G8HA 1PEBA 2HFBA 1MXYA 1XT8A 3MQ9A 3TKDA 1QKBA 3HCQA 2QMWA 3TCFA 3FATA 1R9LA 5L8DA 1LFIA 1IXHA 3S4UA 1J1NA 2GHAA 1EZOA 1KWHA 1Y9UA 2DE2A 4ZEKA 3FJGA 3FIRA 2H9BA 3MJNA 1JW4A 1ZLQA 4IO4A 5I58A 1MY0A 3T9UA 3IOUA 2RINA 2F97A 1POY1 4NEDA 1OIBA 1JEVA 3LSLA 2OCUA 3G3HA 4U22A 5ISUA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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