3OELA

Crystal structure of glun2d ligand-binding core in complex with d-glutamate
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
280
structure length
264
Chain Sequence
QHLTVATLEERPFVIVEPADPISGTCIRDSVPCRSQRCCKGFCIDILKRLAHTIGFSYDLYLVTNGKHGKKIDGVWNGMIGEVFYQRADMAIGSLTINEERSEIVDFSVPFVETGISVMVARGTTVSGLSDRKFQRPQEQYPPLKFGTVPNGSTEKNIRSNYPDMHSYMVRYNQPRVEEALTQLKAGKLDAFIYDAAVLNYMARKDEGCKLVTIGSGKVFATTGYGIALHKGSRWKRPIDLALLQFLGDDEIEMLERLWLSGICE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Ligand-specific deactivation time course of GluN1/GluN2D NMDA receptors.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transport protein
source organism Rattus norvegicus
molecule keywords Glutamate [NMDA] receptor subunit epsilon-4
total genus 82
structure length 264
sequence length 280
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-08-12
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3oelA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3oelA02
1MXXA 3KN8A 3VXBA 3FXRA 1OMPA 2H25A 3KBRA 1GGGA 3VXCA 1MM7A 3E13X 2F97A 2B3BA 1AIVA 4XIGQ 3C34A 1FQEA 4MH5A 1NH7A 3FVOA 4OENA 3EPEA 4F19A 3E3KA 4QFLA 1B46A 1OLCA 3IJOB 2REGA 4LA9A 1ELJA 5EHMA 3MQ9A 4ZECA 1OVTA 3L6HA 1H43A 1QKAA 4LONB 2O69A 2PX1A 2HQ0A 2ZYMA 5CMCA 1CE2A 1LGBC 2IEEA 4IO3A 4G8NA 3T9UA 3M8UA 4EXKA 4YB6A 1B1XA 2Z8FA 3SESA 2DVZA 3KJ7A 2OLBA 3TDJA 4NF8A 3LUYA 2Q2CA 4IO5A 5ITOA 3DLNA 1OVBA 4OHNA 3ZS6A 3S9MC 1DTZA 3N6TA 4NE4A 2X7PA 1SW1A 3DP8A 3OSRA 2HAVA 4H0WA 4ND9A 1IXCA 3FGSA 5ISUA 5IAIA 4R73A 3PPOA 3SEYA 3U72A 1IUDA 3CFXA 3OSQA 3IK6B 1DPEA 3B6QA 1GVCA 3PV0E 5ITPA 5BWJA 1B0LA 4KCCA 1QKBA 4KFQA 3PPPA 2VOZA 3EQ1A 1S50A 4Q5TA 4RA1A 3KOTA 4KYSA 4OWDA 4C1UA 3N5LA 4O3BA 3OO9A 4IY6A 4NF8B 2OZZA 2HCAA 3VVEA 3RTWB 3RTFB 2XD2A 4ZE9A 1N7WA 3SKPA 1MXVA 4LZ5A 4YAHX 3TFLA 3EHUA 1GR2A 1ZU0A 1ZLQA 5K2YA 4P0IA 5I56A 4GIZA 1B4HA 4F2OA 2GHBA 1MXYA 2OCUA 5L8DA 3H7MA 2QMWA 5AA4A 2RCAA 3WAEA 2E1SA 2Y7RA 3HN0A 2F78A 3RGYA 4I8CA 5I57A 3HHFA 4TLLB 2I3VA 3S2VA 4RK9A 3RNNA 2ABHA 3VDFA 2PVUA 2HEUA 4F22A 2ZYKA 2UYFA 3MVXA 3PUXE 3M3LA 3IO4A 3KN3A 4PQJA 4R75A 3C33A 5B7DA 5EHSA 1WODA 4FECA 3O2AA 1FQDA 2Q9TA 4KD5A 4YZZA 1QVSA 4EUOA 1MPBA 3U1OA 3IB2A 3K4UA 1B5JA 2F5XA 3PUWE 3RT8A 1YAEA 4KYEA 3MC2A 5AA4B 2ZNTA 1OLAA 1O64A 1F9BA 1N76A 3T66A 3Q27A 1BLFA 4QFOA 1MRPA 1XVXA 5DEXA 3I6VA 1UIVA 3UK4A 2RKMA 3H4ZA 4THIA 4POXA 3PD9A 1MXZA 2XXWA 3B6WA 4JXIA 2O68A 3TQWA 3G3KA 4OEVA 4JWXA 4F39A 1JW1A 2XXHA 2NVUB 4OQOA 1QUKA 3KGCA 3LSXA 1P1QA 3TAJA 5I84A 3TYHA 3PUYE 4G2ZA 2ONSA 3DP6A 3MAMA 4LUBA 3RQTA 1B3GA 4RYAA 4JDFA 4GQOA 3K6WA 3C32A 4F3GA 4DCYA 3QK6A 3BFUA 5EYFA 1NH8A 3QYTA 1LCTA 4BDRA 1VR5A 3UP9A 3RLFE 2M8CA 3OENA 3ODBA 3CFLA 5DEXB 4QF9A 1OQHA 2THIA 4NEDA 5KDTA 4PFYA 1S9TA 3O6IA 3C31A 1DSNA 4FATA 3U8QA 4MLVA 3SDFA 1RYOA 4FORA 4ESWA 4R74A 2D3IA 2NXOA 3QSLA 1MY3A 2UVJA 1NKXA 3HCQA 2H99A 2HZLA 4HW8A 4C0RA 4EF2A 1JNFA 1B4ZA 2G93A 2KLFA 5I2KA 4LQ5A 4R9GA 4OFJA 1M5CA 2DWIA 5BUUA 1IXHA 4BDOA 5KZTA 3I5OA 3TQLA 5DVFA 4QSDA 2V3UA 4P11A 5KDTB 5F1QA 3FZVA 4IGRA 2BJJX 2Y7KA 1P1WA 1H45A 1WDNA 1JEUA 1B3HA 4DLDA 3T93B 1MQIA 4RNSA 1B32A 4WEPA 2QMXA 5I58A 4YMBA 2RINA 5FHOA 2ZYOA 4OFOA 3PMVA 4NMYA 1SW4A 4QSCA 3OO7A 1JVXA 3TPAA 3BKIB 4OFLA 4H8JA 1SI1A 3TTLA 1Z7ME 1DPPA 3MVYA 4NF6B 2FA7A 5TP9B 1USYH 3KFMA 2QS4A 3H6VA 4YMAA 4JWOA 3R6UA 1HSJA 3IOTA 1P1NA 4ELPA 1A55A 3GBBA 3Q29A 4FAJA 4ZS9A 2V25A 2RCBA 4LZ7A 1Y4TA 4U4XA 3HSTA 2ZNUA 4EQ9A 2QJEA 5I58B 3GLBA 2D5WA 3KG2A 1H44A 4O3CA 1SQYA 3PPNA 4YKJA 3TTNA 3T9VA 3DELB 1MS7A 1VSOA 4OTEA 4X9TA 3CG1A 3K1PA 3M3FA 5DTBA 4EQBA 4GLIA 1Q35A 2QS3A 4RJZA 5CMMA 1ZTYA 2Z23A 4KCDA 3HPIA 1T0KA 1I69A 5LOMA 4AQ4A 4LZ8A 1LSTA 4ZEBA 3CI8A 1MQGA 4OEUA 3C36A 1N0TA 3UA8A 3K6UA 1USYE 4R6YA 3V5AA 3V8XB 3G3FA 4LQ2A 4IO7A 4Q0CA 1R6ZA 5DT6A 3TTMA 1IEJA 3H03A 2IA4A 2PT1A 2DP8A 3FATA 3D4GA 3UGWA 2XXTA 2I6EA 2XXQA 3N94A 2Q2AA 4XKQA 2Z8EA 3BFTA 2OBGA 3EF7A 4TQUQ 1NNFA 3G3HA 1MDQA 4EDPA 5L9OA 3UORA 3K02A 3MPKA 3MP1A 3TUSA 3AXFA 1ZBMA 3ILTB 3RT6B 3O66A 4H5FA 1D3KA 5H8HA 1YCJA 5L9SA 2V84A 5CMKA 1M5DA 4PFTA 4XKPA 4MFIA 1PB7A 4FEDA 4Q8RA 3OELA 4O3AA 4LP2B 5DVJA 5CC2A 4IO2A 1YPNA 2XD3A 5CM6A 2ZYNA 1OIBA 3JZJA 4R6HA 3HHGA 4N6PA 2O84X 1Y3QA 4IO4A 4OERA 3ILUB 1AH5A 4QHQA 3O9PA 3IJXB 1IXGA 1TWYA 3FJMA 3IOUA 3OD7A 1BTJA 4BLAA 1VE4A 1FW0A 4ZZEA 5ICTA 4Z7EA 2Y7PA 4RPOA 2QL3A 4KQPA 3QUFA 5H8HB 5CBSA 2PYYA 2R71A 3TODA 4MLQA 3G3IA 4ZE8A 2ONKE 3T96B 3OO6A 1SYIA 3U92A 4GF8A 2Z22A 4EXLA 1FQBA 2UVGA 3GBAA 2ZXTA 2YPNA 3IO6A 1SW2A 4H5GA 2G29A 1B0HA 4KR5A 4XTCQ 2ZMBA 3IOVA 1UTBA 3PPRA 4KYDA 1VFEA 3W9WA 1B2HA 2QSXA 2Q8JA 5JEIA 4GVOA 5I2NB 3JYRA 1SVXB 3S9LC 1I6BA 2F6GA 2PMSA 4E0WA 5FTHA 3VE1B 2V93A 4E0XA 4DDDA 3V89B 1FTKA 4F31B 5AA2D 3TELA 5JK4A 2ZNSA 1ZMGA 4HCYA 3TCGA 5AA2A 1Y1MA 1N3XA 5HM4B 4YU0A 4F18A 1IIWA 3PUVE 4ZEIA 3A3UA 1ANFA 2DE2A 1A8FA 1URGA 2D21A 4JSDA 1US5A 2VP1A 1UTBB 3TCHA 3IORA 4YB5A 4Z0IA 2OWSA 1MPDA 1EZ9A 2UVIA 4JWYA 1Y1ZA 4PP0A 4HTGA 4DXCA 3O6HA 1LFHA 4ZEKA 3FXUA 3H6UA 1MH4A 1R1NA 2LAOA 1TFDA 3MVWA 2UYEA 1PB9A 4GL8A 5CI5A 3CFZA 3PD8A 3TZAA 4ZEFA 5AE4A 4DXBA 1M5EA 1LAFE 2RF1A 2GFEA 3CIJA 1MY1A 1PBQA 1TXFA 1TFAA 5AA2B 1DOTA 2I3WA 3MZBA 4G68C 3R7XA 3UN6A 1MY4A 2X26A 4H65A 4JSOA 4OVJA 1LAGE 4U23A 4DE8A 2XHDA 4M4GA 1MH3A 1PC3A 1MM6A 1Q1KA 2I48A 3C4MA 3E4RA 2P2AA 4OESA 3G3GA 4OETA 1WVJA 4ECFA 4YB7A 1J1NA 1JETA 5H8SA 3KSXA 2XXYA 2ONRA 1NL5A 1ZJLA 3MWBA 3D4CA 4JB7A 1MY2A 4PFUA 3K1NA 1P99A 3K01A 4NF6A 5TP9A 2V3TA 4AB5A 1S7YA 3FASA 3WAFA 1R9QA 2I0CA 4ELQA 4BDLA 3OXNA 2Q88A 1B3FA 3LSWA 3K00A 2QS1A 2NWJA 4R2BA 4NF5A 2UVHA 3Q26A 4X1DA 4IY5A 1QUIA 4YICA 1LCFA 1QJMA 3PGFA 2A5TA 4XKRA 3H6WA 3LSFB 2PT2A 1D9YA 4RY1A 3OEMA 2UXAA 4L17A 3ONMA 3T22A 3OO8A 2PBWA 1JW5A 3DP4A 4F3BA 5ICQA 1B40A 5B70A 2I49A 3MP8A 5HBCA 3THIA 4N07A 4GRKA 1AL3A 1HSEA 1P1OA 3LR1A 3L6GA 3RY3A 1UIUA 2I4CA 1MQJA 5F7VA 1PDAA 3Q25A 3H3GA 1NMUA 1FTLA 2VGQA 2VD2A 1ATGA 3IAZA 1FQAA 3BBRA 4NF5B 4ISUA 2OWTA 3MZ9A 4G8MA 4U4SA 2DE4A 1JQFA 4PFWA 2A5TB 1IZ1A 3RN8A 1B51A 3IL1B 2E0SA 1L5TA 2XX9A 2F8DA 2O7IA 1JW4A 1N7XA 2FNCA 2R9JA 3KJTA 1B5IA 4F1YA 3K1MA 2DQVA 3KN7A 1MQDA 1XT8A 4WEDA 1B7UA 2ANJA 3KZGA 4R6KA 2HFBA 4LATA 3VLWA 2Z8DA 1A7LA 4QFPA 2QS2A 3U94A 3MUQA 1MQHA 4G68A 2GH9A 2YLNA 1ZKBA 2DOJA 1JVYA 3CRBA 3ECRA 4KI0E 5TU0A 2HZKA 4AB6A 1R9LA 3IX1A 3K6VA 1ZIUA 4DIGA 1LBBA 4F1VA 5DVIA 2QRYA 5HPQA 3SEWA 1GTKA 4NWCA 2QPQA 1UQWA 2XXXA 2F7BA 2F34A 3K2DA 3TTKA 4GWOA 4YKIA 2VHAA 3CSGA 5AA1A 1LB9A 5ELVA 1QW0A 2DYXA 1SDXA 2B3FA 4I9DA 3FVGA 1B1HA 2F7AA 1B3EA 1Z7NE 3VV5A 3IR1A 3JV9A 3K6XA 1MG1A 3QIMA 4H8IA 3CSBA 4G8HA 1UTHA 4G77A 4ZDMA 3SEUA 1FCKA 3S9NC 3A3CA 1NNTA 3HO7A 4G68B 1NFTA 1SI0A 3U93A 3FJ7A 3H6TA 4G4PA 3MBPA 3MPLA 3USDA 1O63A 1B5HA 1AOVA 1YTVA 4FE8A 3K0VA 5AA3A 1EU8A 1D4NA 5I59A 4BDQA 1OQGA 1A99A 2VD3A 4UACA 4H1XA 4ESXA 3SERA 3FIRA 4HS7A 2YJPA 4R9FA 3VLVA 2W7YA 4NF4A 5J1DA 3EHTA 4U2RA 4K3FA 1NNKA 2F35A 1Y4CA 3VFJA 4POWA 3KSJA 3SEXA 1B7HA 2O1LA 1UTHB 4ZZAA 4C1TA 3TCFA 2DVCA 2RC7A 3TMGA 4GD5A 1MY0A 4OZ9A 1TT1A 4ELRA 1LAHE 1RYXA 1GV8A 1FTJA 3N6UA 1PB8A 5DYHA 4ZEDA 3E9XA 1FTOA 4IO6A 5I2NA 1SW5A 1N04A 4I1DA 4RPNA 4DCXA 2Y7IA 4ELOA 4XKNA 4GL0A 4IGTA 5I59B 2CZLA 2DXYA 2DS9A 1N3WA 3T9XB 1KWHA 4NTLA 1SYHA 3FJGA 2NOOA 4NF4B 2REJA 1XC1A 2H98A 3B7DA 4BDNA 4GOTA 3G7WA 2H9BA 4H67A 3IB0A 5L9MA 4HCWA 3FVNA 1JEVA 4F3SA 1II5A 1B05A 3TKDA 4Q30B 1MDP1 3MJNA 2H4IA 1P1UA 2DXRA 3KEIA 5CRYA 4PE5B 1MXUA 3EN3A 4F2QA 1A54A 1PEBA 5K2XA 3IB1A 4IB2A 1CB6A 4PETA 1LAXA 1IITA 3O28A 5H8QA 4KPTA 2XXUA 3ZKLA 4X1BA 3SEVA 4QRZA 5I56B 4YKKA 2P0SA 5TPAA 2O6AA 4YKPA 4TOZA 3N26A 3O97A 4FIMA 1VFDA 1B3LA 2HAUA 2O1MA 2XXIA 3PU5A 5I57B 3I3VA 4X48A 2Y84A 4P0GA 5H8FA 4UA8A 2AYSA 3CG3A 4GFRA 1BIYA 2RC9A 3KOSA 4R2FA 4LVQA 1IXIA 3H06B 2HXWA 4F3PA 1XOCA 5H8QB 4JBZA 4U1OA 4RK2A 2DWJA 3HV1A 5M2VA 3B6TA 2DSFA 4WKMA 2RC8A 5TPAB 2X7QA 1D9VA 1M5BA 1NNPA 4OYVA 4MBPA 3P7IA 4QSEA 2GRVA 1BKAA 2XXRA 4WXJA 2XX7A 3G3JA 2XXPA 5FHMA 3IOWA 3F11A 3OMBA 3M3KA 5H8FB 4QFNA 2FYIA 3ZKKA 3MW0A 3FUZA 1US4A 1HSLA 2R6GE 3T9HB 2B65A 4U1ZA 2XX8A 1B52A 3LSLA 2GHAA 1A8EA 1LB8A 3GZGA 1SBPA 4KHZE 1SD3A 4I62A 3LBSA 2H5YA 3TTRA 1I6AA 2Y7WA 1AMFA 4XXUA 3FXQA 4EQ7A 3SETA 1FQCA 1DMBA 3C35A 5A5XA 5CBRA 4EF1A 4ONYA 3LC8A 3O6GA 2I0BA 3S4UA 3O29A 3W9VA 1MPCA 2F6PA 2I4BA 2NUVA 1URSA 1B9JA 1XVYA 1IQ7A 1Y9UA 4H6DA 5CMBA 1XS5A 1PBPA 1A40A 3Q28A 1LFIA 2ALUA 3PMXA 3PUZE 3DM0A 3W15C 3MVZA 4FJPA 4BDMA 1N84A 1Y3PA 3FD3A 4U21A 2AL5A 3MZ1A 3VVFA 4F1UA 1QULA 4MF3A 4OMBA 4DXUA 2V3QA 3CR9A 1B6HA 2WKYA 1MXWA 5H8NA 3CVGA 2DWHA 3FVKA 3EHSA 2AIXA 2OJTA 1LFGA 2P1SA 1O7TA 4M1VA 2O51A 4TLMB 1H76A 5A5XB 5JTYA 1XHYA 5IKBA 3RPWA 5I2KB 4N13A 5KCJA 3PPQA 4R72A 3V83A 2AL4A 1EZOA 2F36A 2Q89A 3QUJA 4GXAA 1M5FA 1BP5A 2ESNA 3ZSFA 3QXMA 1EZPA 4F29A 3RUMA 3R26A 3C9HA 3GXAA 4DZ1A 2DE3A 1FQFA 3VLUA 3QAXA 1LBCA 1POTA 3FV2A 4FEBA 3OOAA 4NWDA 3OEKA 2O7UA 3PMWA 4QFKA 2F7CA 1B7ZA 1Y3NA 4RXLA 2I58A 3MP6A 1B58A 2DWAA 3VVDA 1FTMA 2OK2A 5H8NB 2CMOA 1H3DA 5FTIA 3FV1A 1RKMA 2A5SA 5FHNA 4OXVA 2XXVA 3TEPA 1POY1 3S9EA 5JTYB 1Y20A 1QUJA 5KCJB 1DTGA 1URDA 3UIFA 4U22A 3A09A 4GXSB 1I6QA 1LLSA 1EH3A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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