3OEMA

Crystal structure of glun2d ligand-binding core in complex with n-methyl-d-aspartate
Total Genus 86
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
86
sequence length
281
structure length
268
Chain Sequence
QHLTVATLEERPFVIVEPADPISGTCIRDSVPCRSQLNKRCCKGFCIDILKRLAHTIGFSYDLYLVTNGKHGKKIDGVWNGMIGEVFYQRADMAIGSLTINEERSEIVDFSVPFVETGISVMVARGTTVSGLSDRKFQRPQEQYPPLKFGTVPNGSTEKNIRSNYPDMHSYMVRYNQPRVEEALTQLKAGKLDAFIYDAAVLNYMARKDEGCKLVTIGSGKVFATTGYGIALHKGSRWKRPIDLALLQFLGDDEIEMLERLWLSGICH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Ligand-specific deactivation time course of GluN1/GluN2D NMDA receptors.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transport protein
source organism Rattus norvegicus
molecule keywords Glutamate [NMDA] receptor subunit epsilon-4
total genus 86
structure length 268
sequence length 281
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-08-12
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3oemA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3oemA02
4WEPA 2DVCA 4YICA 2DS9A 3SETA 1B0HA 2A5TB 5I2NB 5I2KB 1ZTYA 2XX7A 1IXGA 2Z8EA 2UVJA 3KN7A 2OK2A 2QPQA 1NNPA 4KI0E 4NEDA 1A40A 4FEBA 3T96B 5TPAB 4ISUA 1LFIA 5AA2A 2NOOA 2Q89A 3KOSA 1H45A 1R9QA 2HXWA 3V83A 1B1HA 2FNCA 4R75A 3H3GA 5H8FB 4Q8RA 1FQCA 4RPNA 1DPEA 4F1UA 4U21A 1GR2A 2RF1A 3ZKLA 1SW5A 4ZEBA 4G8HA 1N7XA 3TQLA 5AA4B 4G8NA 4R74A 2UVGA 4Z7EA 4HTGA 2NVUB 4ONYA 5CRYA 4YZZA 1A8FA 4MFIA 5HBCA 5IKBA 2A5TA 5DYHA 5I2NA 5I2KA 1FQEA 2QS3A 3SERA 3HPIA 3TTKA 1N84A 1IITA 5AA3A 3UIFA 1GGGA 1OLCA 4LQ5A 1B4HA 4KD5A 1S9TA 1HSLA 5TPAA 4POXA 1FCKA 1B58A 2DVZA 4LP2B 1MY3A 5H8FA 4EUOA 3C36A 4RK2A 2XD3A 3EHSA 5AA4A 4XKNA 3MUQA 3LBSA 2Y7RA 4JWOA 4YMAA 4QSEA 5CBSA 4M4GA 4O3CA 5AA2D 3PUWE 2Z8DA 1H3DA 4R6YA 1D9YA 3IOWA 1QVSA 5I58B 3S4UA 1LAGE 4F19A 1MQIA 1D9VA 2GHAA 2NWJA 3MQ9A 4QRZA 2O51A 1JVXA 1DTGA 1AIVA 3FZVA 4GL0A 3TZAA 4ZS9A 1XT8A 1Y3NA 4F2OA 3LSLA 3H7MA 4XIGQ 3D4GA 1A54A 1LCFA 1FW0A 1B7ZA 1FTLA 1PC3A 1D3KA 4ESWA 1YTVA 1H76A 1L5TA 3P7IA 4C0RA 4R6KA 5M2VA 1LB9A 4R2BA 1PBPA 1VFEA 3T66A 2ZXTA 1WVJA 5I58A 3S9EA 4H8JA 3V89B 4BDQA 3F11A 2R71A 4WXJA 4R2FA 4LZ8A 2XXUA 1NNTA 1S7YA 1DOTA 5I56B 4H5GA 1MM6A 3DP4A 4JSDA 1UTBB 4NE4A 3C31A 1N3WA 3SEUA 4DXBA 3ZKKA 4POWA 2REJA 4Q0CA 4QSCA 4Q5TA 4U22A 4LUBA 5I57B 4OFOA 4BDLA 1MXWA 5H8HB 4OXVA 3EQ1A 2UYEA 5FHOA 3LSWA 4XTCQ 3UGWA 3W15C 4WEDA 2OWSA 3O28A 3TCHA 2Z22A 4JWYA 3LC8A 1QUJA 4C1TA 3K00A 5CMMA 4IY6A 3TQWA 5JEIA 5I56A 3RPWA 1SW1A 3GBBA 1UTHB 2I6EA 3H6TA 1UTBA 4OESA 4H67A 1P1OA 2O1MA 3THIA 2VD3A 1B52A 1B3GA 3B6WA 3CFLA 1MQGA 5I57A 1DPPA 1VFDA 5H8HA 4LONB 3USDA 3H4ZA 3TCFA 4EQ9A 1EU8A 2LAOA 3FXQA 2NXOA 5CMBA 4FAJA 1O63A 2O68A 4YAHX 1SW4A 3MZ9A 2VHAA 4ZEFA 4OZ9A 3LR1A 1UTHA 2I49A 3MBPA 3BBRA 3PPOA 3U72A 3PUYE 3DP8A 5KDTB 3N5LA 1MY0A 3PPRA 5HPQA 1XOCA 1ZBMA 1LFHA 1LAHE 4KCCA 4FIMA 4U4SA 1Z7ME 2XXPA 4ZZEA 3VVFA 2O7IA 4RK9A 3OSQA 4KYSA 4N07A 2F6PA 2HZKA 3OEKA 3UORA 1AH5A 2F36A 1SI1A 1US4A 1IXHA 4LATA 3OEMA 4GLIA 4Z0IA 3K6UA 1BLFA 4YMBA 3FATA 3E3KA 1MH3A 5KDTA 4X1DA 4AQ4A 3G3GA 1II5A 4MH5A 5LOMA 2ZYOA 3FGSA 4R9FA 5ICQA 1B46A 3FJMA 1BP5A 3UP9A 4QFNA 4E0XA 1POY1 1J1NA 2HFBA 4MLVA 4OFJA 3RY3A 4DDDA 3VE1B 4H5FA 4HS7A 4OYVA 2DE4A 2Y7WA 4EDPA 1B3HA 4NF6B 3O6GA 3TPAA 1P1NA 2XXVA 4JSOA 3LSFB 1S50A 5CC2A 5ITOA 1N04A 3WAEA 4OQOA 3Q28A 3N26A 3MAMA 1B4ZA 3HHGA 4OTEA 4AB6A 3IOUA 1PDAA 3PUZE 1EZOA 2B65A 2DSFA 3SKPA 2ONKE 3IO4A 4IB2A 3C4MA 3CG1A 3ECRA 2PYYA 3S9MC 1ELJA 2UYFA 2XHDA 3MPLA 4ZEDA 2NUVA 3OO6A 4NF6A 3H6UA 4FEDA 2ABHA 4RNSA 3U93A 4MBPA 3TUSA 4FECA 1R1NA 4E0WA 3TYHA 3PPNA 3M3LA 2V25A 2BJJX 4EQBA 1LGBC 1WODA 2XXRA 1MY2A 1ATGA 3LSXA 1OIBA 3KFMA 3MWBA 1PB7A 4YKKA 1Q35A 4X9TA 1I6BA 3G3KA 1Y1MA 4LZ7A 3FV2A 2H9BA 2ZYNA 1DTZA 4HW8A 3C34A 2UXAA 3T9UA 3G3IA 2XXQA 1JEVA 2ZYKA 1URDA 3QYTA 4R72A 4LQ2A 2P0SA 4K3FA 3JZJA 1IXIA 2F35A 2A5SA 3CIJA 4OVJA 2FYIA 1AL3A 2G93A 2O1LA 1LB8A 4F39A 1QKBA 2W7YA 4G68C 4FE8A 2QS2A 3T9VA 1IQ7A 1SBPA 3FUZA 3D4CA 1OMPA 1OVBA 4BLAA 1DMBA 4I9DA 1BIYA 4EQ7A 3KG2A 4FORA 4OWDA 3K1NA 3KOTA 3A3UA 1SYIA 3OMBA 4F3BA 4BDMA 2XXTA 3SESA 1B3EA 4EF1A 4X1BA 2QMXA 5I84A 3N94A 3R26A 3PMVA 1SQYA 4JXIA 3N6UA 3K1MA 1B5JA 1NL5A 3U1OA 1P1QA 1P1UA 1YAEA 2O69A 3DP6A 3TCGA 2V93A 3S9LC 3VLWA 3I6VA 1DSNA 2Z8FA 4RPOA 2R9JA 1JQFA 2FA7A 2PBWA 1POTA 2ZMBA 3TELA 3MP8A 5I59B 3A3CA 4OERA 5BUUA 1JETA 4TOZA 2X26A 2I48A 2DWAA 2I58A 4GFRA 2VGQA 3RTWB 2VP1A 4OEUA 2OCUA 1MQHA 1H44A 3V5AA 2F8DA 4OENA 3VVEA 1PB8A 3W9VA 3MW0A 2ANJA 4FJPA 5DT6A 2YPNA 4YU0A 2B3FA 1JW4A 2RC9A 3I3VA 1ZLQA 4KCDA 4YB5A 2O7UA 4GD5A 3TFLA 2QL3A 4Q30B 1UIVA 4H0WA 5K2YA 5KZTA 4U1ZA 3GBAA 4DIGA 3IO6A 3I5OA 3OSRA 1VR5A 5I59A 2RC7A 4UACA 3TDJA 1OLAA 4IO6A 3G7WA 3BFUA 3K02A 1NKXA 4ELQA 3U92A 4H8IA 1IIWA 2DQVA 2DXRA 5DVJA 3MVZA 1MXUA 4JB7A 1NNFA 4RA1A 3IB2A 1ZKBA 3IOVA 1A7LA 3IORA 4QFPA 3Q25A 1B3FA 4F22A 2IEEA 3E13X 1BTJA 2DYXA 1XS5A 1MPDA 4F3PA 4DZ1A 4WKMA 1TXFA 3OXNA 1FTMA 3C32A 3O9PA 4XKQA 1Y9UA 3RTFB 4EF2A 1MRPA 1YPNA 3PUVE 5HM4B 4HCYA 3FXRA 3O6HA 3KEIA 1UQWA 1QUKA 3CSGA 4AB5A 4QF9A 2PX1A 3RN8A 3RT6B 2DXYA 3U94A 3O97A 2HQ0A 4O3BA 1Y3QA 5A5XB 3TTLA 4P0IA 3VXBA 2I3VA 3L6GA 1GV8A 2AL4A 3KN3A 1M5CA 2PT2A 4KQPA 4DCXA 3VLUA 3G3HA 1MXZA 3PPPA 2H98A 2ZNSA 3QAXA 4ECFA 4O3AA 2P1SA 1EZ9A 1USYE 1ZIUA 1JEUA 3VVDA 1TFDA 3ODBA 3OO7A 1B3LA 4UA8A 1SYHA 3OD7A 4QSDA 1IUDA 4GL8A 2DP8A 1QULA 4DCYA 2Y7IA 3K0VA 5A5XA 1ZMGA 4YB6A 3MC2A 2Z23A 4F1YA 1ZJLA 5DEXB 5TP9B 2KLFA 5DVFA 5L9SA 3ONMA 3IB0A 3K2DA 5ELVA 2XXXA 2DWHA 3H6VA 3RGYA 1A8EA 4H65A 3L6HA 4C1UA 1QW0A 1HSJA 3EHTA 3OOAA 4THIA 1M5BA 3MVYA 3R7XA 2F7BA 3FJGA 5H8QB 5B70A 3VLVA 1NMUA 3FV1A 5F1QA 1B7UA 3TODA 1US5A 3UK4A 4KYEA 2XXYA 1URSA 2OBGA 1EZPA 5AE4A 4ZZAA 1B6HA 5DEXA 5TP9A 2REGA 2F97A 3FJ7A 3QUFA 1N7WA 1TWYA 2H25A 3KZGA 2DE2A 3JYRA 4JDFA 1MS7A 1MXXA 3IR1A 3EN3A 5EYFA 3TTNA 1Y20A 4GQOA 4G4PA 2H99A 1EH3A 3HCQA 5H8QA 4NF4B 3V8XB 2RINA 1OQHA 4XKRA 2RCAA 4ELRA 5L9MA 4RYAA 3EPEA 2DE3A 4I1DA 5H8NB 1GTKA 3IB1A 3R6UA 2PVUA 3G3FA 1LAFE 4F3SA 3K6XA 4PFTA 3TTMA 3FIRA 1SD3A 1QUIA 2E1SA 2WKYA 4KR5A 4MF3A 2HAUA 1O64A 3BKIB 4G77A 4TLMB 3MZ1A 5FTIA 1XHYA 4TLLB 1N76A 3G3JA 3K1PA 2HEUA 3PV0E 1Y4CA 5FHNA 3TKDA 3B6QA 3TMGA 5TU0A 4QFOA 2F5XA 2HZLA 1JW5A 3IJXB 4NF4A 3M8UA 4ZEIA 2E0SA 1TFAA 1YCJA 1NFTA 5H8NA 5IAIA 2F7AA 4IO3A 1NH8A 1SW2A 3MP6A 3IJOB 5FHMA 3A09A 1MDP1 4JBZA 4U2RA 2GFEA 3M3KA 1B32A 4F18A 4DXUA 2QS1A 4U4XA 4IO5A 2QJEA 1LCTA 3K6VA 3DM0A 2HCAA 1RKMA 5CBRA 3SEXA 1MXVA 1PB9A 2R6GE 5ISUA 3KJTA 1M5EA 3HSTA 1B7HA 4YB7A 2VD2A 3H06B 5CMCA 4YKJA 5CMKA 1MDQA 2I0BA 2Y84A 2XD2A 1CB6A 3T9XB 5F7VA 3O29A 3IAZA 2ZYMA 4KHZE 1B1XA 2IA4A 5CI5A 4QHQA 3KN8A 2AL5A 2M8CA 3RQTA 1QJMA 1AOVA 4EXKA 4PQJA 2OLBA 4P11A 3UA8A 1SDXA 1MM7A 2H5YA 1ZU0A 4NF8B 1N3XA 1VE4A 2OJTA 5AA1A 4LZ5A 4F3GA 4U1OA 1FQAA 2Q9TA 2THIA 1P1WA 3PU5A 3JV9A 3T9HB 1B9JA 1H43A 1MY4A 2PT1A 1Q1KA 3CVGA 4XXUA 1VSOA 2DWIA 2QS4A 1P99A 2PMSA 4XKPA 4PETA 5KCJB 3H03A 5ITPA 2XX8A 3ILUB 4IO7A 3RT8A 1MG1A 1F9BA 4NF8A 2Q88A 1B51A 3TAJA 2V3UA 3MZBA 4F1VA 2I0CA 4ZDMA 4ZE8A 3B6TA 2F34A 4KYDA 3PMWA 2XXHA 3T22A 3LUYA 3E9XA 1B5HA 3OELA 4ESXA 1IXCA 3CR9A 3CG3A 3FD3A 4DE8A 1A55A 2Q2AA 2ALUA 5J1DA 3FVNA 2XX9A 4GXAA 5KCJA 1MQDA 3DLNA 2F78A 4GRKA 2D3IA 2F6GA 4OHNA 3KGCA 4RY1A 4YKIA 3U8QA 3ZSFA 1I6QA 3IOTA 1AMFA 1FQBA 4ELOA 4OFLA 1BKAA 5JTYB 1MH4A 1JNFA 3MVWA 3SDFA 3MPKA 4IO4A 3PD9A 3FASA 1PBQA 4H6DA 4OEVA 1M5FA 3N6TA 4G68B 3QSLA 2X7QA 2RCBA 3FXUA 4YKPA 1XVYA 3KJ7A 3Q29A 2P2AA 1MQJA 1FQFA 2O84X 1B0LA 4ZECA 3KSJA 2XXIA 3PUXE 4N13A 3S2VA 3C9HA 3VFJA 2CZLA 3IL1B 5L9OA 2UVIA 1FTKA 1URGA 2GRVA 3CFXA 4GIZA 2I4CA 2RKMA 4QFKA 5L8DA 3PGFA 4JWXA 2D21A 3HHFA 2X7PA 1CE2A 3GZGA 3VV5A 4BDNA 1T0KA 5H8SA 5JTYA 3QIMA 5CM6A 3OENA 3EF7A 3FVGA 1Y1ZA 1NNKA 2RC8A 3GLBA 1M5DA 4G68A 2OWTA 1R6ZA 4LA9A 4ND9A 4IGRA 2GHBA 1TT1A 2V3TA 1B5IA 1LBCA 2OZZA 4GWOA 1MXYA 2Y7KA 5DTBA 1B05A 3VXCA 1Z7NE 4I8CA 3TEPA 1B40A 4QFLA 4ZEKA 3KBRA 3M3FA 1MPBA 3RUMA 5FTHA 1A99A 4FATA 2YJPA 2DWJA 3SEWA 3ZS6A 4MLQA 4GOTA 3WAFA 1FTOA 3K6WA 4NWDA 3HN0A 2QRYA 2ZNTA 3ILTB 1FQDA 1RYOA 4IO2A 1UIUA 2DOJA 4F31B 4R73A 4DXCA 4I62A 4NTLA 3T93B 3H6WA 5B7DA 5EHSA 3AXFA 3TTRA 2AIXA 2UVHA 3SEYA 2ONSA 3SEVA 3MVXA 4DLDA 1JW1A 1I69A 4KFQA 1I6AA 2Q2CA 2YLNA 1SVXB 2G29A 3CRBA 3O66A 4PFWA 3OO8A 1Y3PA 3DELB 2XXWA 1IEJA 3FVKA 4NMYA 1XC1A 3B7DA 2D5WA 4KPTA 4OETA 4M1VA 2AYSA 1R9LA 1KWHA 4RJZA 3HV1A 3GXAA 5JK4A 1GVCA 2VOZA 3OO9A 4GVOA 4EXLA 2O6AA 1XVXA 3CSBA 1MY1A 4LVQA 1LFGA 5EHMA 1IZ1A 4IGTA 1N0TA 3UN6A 3PPQA 3FVOA 4RXLA 3W9WA 1Y4TA 3PMXA 3CI8A 3IX1A 1OQGA 1LBBA 4BDOA 2Y7PA 4NWCA 3QXMA 3EHUA 4PP0A 3K4UA 1ANFA 1B2HA 1FTJA 1PEBA 3K01A 2ESNA 4P0GA 3QUJA 3IK6B 4IY5A 3O2AA 1OVTA 1WDNA 4NF5B 3RLFE 4PFUA 4GXSB 3PD8A 4G2ZA 3CFZA 5ICTA 4F29A 3MP1A 3O6IA 4X48A 3HO7A 2QMWA 3KSXA 1HSEA 1D4NA 4G8MA 1USYH 4GF8A 4ELPA 1LSTA 2V84A 2ONRA 4ZE9A 4R6HA 2GH9A 2HAVA 3C33A 4N6PA 1LLSA 4PFYA 2CMOA 1RYXA 5K2XA 3VDFA 3BFTA 2F7CA 3E4RA 3Q27A 3QK6A 3S9NC 4H1XA 1SI0A 2QSXA 3RNNA 3Q26A 2Q8JA 1QKAA 4NF5A 4U23A 4PE5B 4R9GA 3MJNA 2V3QA 1O7TA 5AA2B 5DVIA 2H4IA 5BWJA 2ZNUA 4BDRA 1LAXA 4HCWA 3C35A 4L17A 1MPCA 1NH7A 2I4BA 4F2QA 1JVYA 2I3WA 2B3BA 4TQUQ 4OMBA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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