3OSQA

Maltose-bound maltose sensor engineered by insertion of circularly permuted green fluorescent protein into e. coli maltose binding protein at position 175
Total Genus 187
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
187
sequence length
614
structure length
607
Chain Sequence
IEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENHLSHNVYIMADKQKNGIKANFKIRHNIEDGGVQLAYHYQQNTPIGDGPVLLPDNHYLSTQSKLSKDPNEKRDHMVLLEFVTAAGITLGMDELYKGVSKGEELFTGVVPILVELDGDVNGHKFSVSGEGEGDATYGKLTLKFICTTGKLPVPWPTLVTTLVQCFSRYPDHMKQHDFFKSAMPEGYIQERTIFFKDDGNYKTRAEVKFEGDTLVNRIELKGIDFKEDGNILGHKLEYNFNGGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELVKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEDLKDAQTRIT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title A genetically encoded, high-signal-to-noise maltose sensor.
pubmed doi rcsb
molecule tags Fluorescent protein, transport protein
source organism Escherichia coli o157:h7
molecule keywords Maltose-binding periplasmic protein,Green fluorescent protei
total genus 187
structure length 607
sequence length 614
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-09-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13416 SBP_bac_8 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.155.10 Mainly Beta Beta Barrel Green Fluorescent Protein Green fluorescent protein 3osqA03
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3osqA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3osqA01
3RTWB 2A54B 2IOVA 3PIBA 3TCFA 4ZF5A 2NXOA 3DQNA 2DWHA 3QK6A 4DKMA 2HFCA 3O78A 4XKPA 5LK4A 3FXUA 3SSLA 3T9VA 1EMLA 2AHAA 3NF0A 3DQ3A 1P1WA 3SSHA 4EDOA 1I6QA 5DT6A 5BTTA 5CRYA 2B3QA 2RH7A 2ZMBA 2DQVA 3LF3A 3UA8A 3GJ1A 5HW9A 5LTPA 1LAXA 4LJDA 3SVCA 1VSOA 4KW9A 3RWAA 4OVJA 2YE1A 4LQUA 4ONYA 4PFTA 4Z0IA 3H06B 1Q73A 3VFJA 4WEPA 1EMCA 4F3BA 1PDAA 1M5BA 3RTFB 3JYRA 1XSSA 2V25A 1MRPA 4H5GA 5KZTA 3M8UA 2QPQA 1AMFA 2DWIA 3THIA 3W1CA 3QUJA 4RPOA 1B9CA 3VVEA 1VFEA 2QLHA 2POXA 2O24A 2X26A 4HQ9A 3RUMA 1EMEA 3E4RA 2OTEA 4U23A 1LCTA 1YHHA 2Z6ZA 1PEBA 2IB6A 3LSAA 3ST0A 4EQBA 2A5SA 3PPQA 3VHTB 4YKPA 1MXWA 5FHOA 2VVHA 2EMOA 4LP2B 3FXQA 3K1KA 1JNFA 2LAOA 2A53B 4KF5A 1ZJLA 4HW8A 5DQBA 5CBRA 3QIMA 4GOTA 2OCUA 2QZ0A 3ZTFA 3DQ2A 4RY1A 5F1QA 2RC8A 4KF4A 4GXAA 4ZEDA 4NTLA 4EF1A 5EYFA 2XXIA 4W69A 1B4HA 3CG1A 2NUVA 1P99A 1MXVA 2ZYKA 4GQOA 1R6ZA 2YPNA 3SVBA 4W75A 1C4FA 1H44A 1HSLA 3IB0A 4EMQA 5FTIA 2G29A 5I2NA 3W9VA 3CBEA 2XXRA 3RQTA 1B7ZA 4GESB 2ZMUA 3FVKA 4FATA 2HQKA 3EQ1A 3GJ2A 1LLSA 2QRYA 1RMMA 4H5FA 1O7TA 2B3PA 3PUVE 4HTGA 5H8NA 2DWAA 4F3SA 3WCKA 3HN0A 5H8QB 2O1LA 1A8EA 1JVXA 1B5JA 2G6XA 2REGA 1GTKA 4LQ2A 1B3EA 4EN1A 2ESNA 4JXIA 2HCGA 2HRSA 3EVRA 3OGOA 4G8NA 3U0NA 4LONB 2Q8JA 4HE4A 4FJPA 1MXUA 1NH8A 3IJOB 1SI0A 5A5XA 3U93A 3ZUFA 5TPAB 1JBYA 2DSFA 2ZNTA 2WSOA 5LTRA 1JEVA 3S9EA 1BFPA 4GIZA 4OQOA 1KYPA 3HPIA 4NF5B 3ILUB 2A47A 2HZKA 1IXHA 2V93A 1B05A 2C9JA 1I6BA 1H6RA 3DQHA 3LSXA 5K2YA 4G68B 3O6HA 4XGYA 3LSFB 1VE4A 1SW4A 1FTMA 3MVXA 3K02A 5L8DA 4QFKA 1RMOA 1YPNA 3O6GA 2WKYA 2OWSA 4P11A 2PXSA 1FQCA 4U2RA 1A40A 5DEXB 4KPIA 4GRKA 2A56B 2DUEA 3G3HA 3MZ9A 1OXFA 1FW0A 4RYWA 4RK2A 3FVNA 1XC1A 4H47A 3KCSA 5ICTA 3MZ1A 3TELA 2ONSA 1B1XA 4YMAA 2DXYA 5H8HB 3RPWA 1DPPA 1P1OA 4ECFA 2R71A 3G3JA 4W77A 5H8FB 4BDOA 2Z6YA 3SVDA 2PMSA 3AXFA 2QMXA 2ZMWA 4W6HA 1O64A 4HQ8A 5HBCA 1XOCA 1H45A 3PPNA 3BXCA 4OENA 4KEXA 4ZZAA 1NFTA 2QT2A 2PYYA 1QYFA 1MQIA 4WEDA 4X1DA 5AA4A 2RC9A 1CV7A 2F6GA 2VP1A 5AA2D 3PMXA 3T93B 2BJJX 2Y7RA 4NF6A 1WVJA 5I57A 4NWDA 1ZUXA 3KG2A 3M24A 1SVXB 2O7UA 3GB3A 2ONKE 4TOZA 4L13A 2F6PA 3IOTA 3TMRA 1WODA 4FIMA 3DQDA 1B32A 1UTHA 4DDDA 3EK4A 1IZ1A 2VVJA 4XTCQ 3PJBA 2ARLA 4DXUA 2H99A 3C34A 4IO5A 4TQUQ 4NF4A 3C33A 3N5LA 1N3XA 4ESWA 1NNPA 1L5TA 2ABHA 2AWJA 4E0WA 2A48A 1F0BA 3SVSA 4W7EA 4W7DA 1MOUA 3DQJA 3G3FA 3Q27A 2HEUA 3TZAA 3S05A 1B4ZA 2P1SA 5EHMA 3SKPA 3SEUA 3MW0A 2FNCA 3U8QA 2OBGA 4W6AA 4ELPA 4LJCA 5EBJA 3V3DA 4TLMB 5FVGA 2P4MA 5AA2B 1WDNA 4Q9XA 1MPBA 3DQ8A 4KQPA 2Z22A 2QS4A 4G8MA 4RA1A 1EH3A 1JC0A 4YB5A 3SSTA 2DWJA 5I56B 1GGGA 4QSCA 3E3KA 1I6AA 3IR1A 3OSQA 4WXJA 5JTYB 3EKHA 1NNTA 3R26A 5KTGA 4POXA 4W6SA 1B5IA 2OZZA 4EUOA 4HCWA 1IUDA 3QSLA 3FATA 3K4UA 3HHFA 5LOMA 5CI5A 4ORNA 3H6WA 3RGYA 3BFUA 4AS8A 3I6VA 3B6TA 1VFDA 1A55A 3SVEA 3DQAA 3OXNA 4OMBA 5I58B 4AQ4A 3FVGA 3Q28A 4QHQA 1OVTA 2C9IA 2XX7A 5BTTB 1MM6A 3KBRA 1W7TA 5EJUA 1GVCA 4AR7A 1Q4CA 3K0VA 3FASA 2G3OA 4QSEA 3KN7A 2QSXA 2RF1A 3K6UA 3SVUA 2Z1OA 2F8DA 1MY1A 1P1QA 4KYEA 2E1SA 4EDSA 1XVXA 3SSVA 3SEXA 3CFAA 1MY0A 2DOJA 3K00A 4ZEKA 4ESXA 4G77A 3AKOA 4UTSA 4IK9A 3OO7A 4JWXA 2HAUA 4P0IA 4YMBA 2O7IA 4ZE8A 1ZU0A 1XA9A 2XD3A 2H5YA 1T0KA 4OY4A 3O9PA 1NNFA 4OFOA 3EK7A 3D4GA 4I1DA 4IO7A 1MG1A 5CMCA 4ZDMA 1EZOA 3EVPA 2DVCA 5TU0A 3V8XB 2VADA 3TTMA 2AYSA 2B3FA 1UISA 3LVCA 4IO3A 2WSNA 3TQWA 3H4ZA 2UYEA 1Y1ZA 1TXFA 2I0CA 4ZEIA 5I84A 1O63A 2OLBA 1G7KA 5EB7A 3IR8A 3MP1A 3EPEA 3PUXE 1NKXA 2G2SB 1MQJA 4K3FA 4F3PA 3OENA 3VXBA 3C36A 1JVYA 3SEYA 1ZTYA 1B3GA 3DQKA 2RCAA 4Q8RA 3OO6A 3IJXB 1LAFE 1ZGPA 5AA1A 4BDUA 4IY6A 2WHTA 2DDCA 3KGCA 2HGDA 2Q88A 3CFFA 4C1TA 3T9UA 5I2NB 3QYTA 1MM7A 2PXWA 1LFGA 4R6KA 3CVGA 1M5EA 2I48A 3T9HB 2OJKA 3DQFA 4JF9A 3UIFA 4W6LA 3DQ9A 4F39A 2ZNUA 3FJ7A 4W76A 5CMBA 2XX9A 2FA7A 3CFHA 5H8NB 2I0BA 3K01A 2A50B 4DXIA 2DE3A 3LSLA 4ELRA 1W7SA 3P7IA 5HBDA 2Q2CA 3U92A 1A7LA 4YB6A 2F97A 4OHSA 2UXAA 1CE2A 2Y7WA 4R6BA 5F7VA 4FECA 5A5XB 5H87A 4F19A 1FTLA 1B2HA 1YAEA 1JC1A 3KJ7A 1SW2A 4RNSA 1YHGA 3L6HA 4POWA 1YHIA 3O2AA 5ISUA 1QYQA 1B1HA 1GR2A 4KF5C 4ZECA 3JZJA 2XXPA 4R6HA 3K1PA 2H25A 4PFWA 1URGA 3PU5A 3MQ9A 2H6VA 4DLDA 1Q4BA 4ZEFA 1UTBA 1D9VA 1IQ7A 1EMGA 4AB6A 2ALUA 1A99A 3PUYE 4B5YA 3RWTA 2OGRA 2VD3A 3SESA 4P0GA 3UP9A 5TP9A 5BQLA 2A46A 3CIJA 3O77A 4O3CA 3O6IA 3IK6B 1MXZA 1JQFA 3SDFA 4NWCA 2WISA 1XQMA 4OXVA 3USDA 4R6DA 3EN3A 3CR9A 2ZO7A 1GFLA 2Q89A 3LVAA 5EXUA 1DMBA 1USYH 2GW3A 1N76A 3UFZA 4FEDA 3S9MC 4P1QA 3DP4A 3LA1A 3R7XA 3PV0E 2H4IA 1Z1QA 3O29A 4OEUA 3N26A 4ZFSA 4DXMA 2BTJA 1MY2A 1POTA 4M4GA 2X7PA 3DPZA 3PD8A 5CBSA 1ZGQA 4F2OA 1AOVA 2G5ZB 3NEZA 1MY3A 5AA4B 2YE0A 1GL4A 3UORA 3OSRA 4NF6B 5ITPA 1UIUA 4M1VA 5I57B 2OK2A 4L1IA 4JDFA 1B0HA 2V3TA 3B7DA 3KFMA 2ZYMA 3U8PA 4PP0A 4EQ7A 1ZBMA 5EXCI 4RK9A 1UTHB 1LAGE 3FGSA 1Q35A 2PT2A 3G3GA 4UA8A 2F35A 2QLGA 2UVJA 1NMUA 5HGEA 5FVIA 4NF4B 4TZGA 2IEEA 3OO9A 3FJMA 3PMWA 1OXEA 2VGQA 1LFHA 4DKNA 3E13X 4F3GA 1Y4CA 3LUYA 2M8CA 1QKBA 3MJNA 2XX8A 3FVOA 1QW0A 2OJTA 4U2VA 1R9LA 4HS7A 4ZBLA 3HSTA 1IXGA 5HZTA 3W9WA 3KZGA 1JW5A 3CD1A 3G3IA 1UIVA 2V4EC 5DTBA 4Q7UA 3MZBA 4JWOA 3FV2A 2HQ0A 1XVYA 4C0RA 4IK5A 2HFBA 4PPKA 1LCFA 3OEKA 1SYHA 3CB9A 5DQMA 1FTOA 3ZULA 5DVFA 3FXRA 5FHVA 4HQCA 1A8FA 5CMMA 2G93A 2NOOA 5H8SA 3BX9A 4Z4KA 1URSA 4KYSA 4OGSA 3A3UA 2D21A 3I5OA 3S2VA 4L17A 4GF6B 4DXCA 2I58A 3P8UA 5DVJA 4IY5A 5K2XA 4KW8A 3SSPA 4I2YA 2HCAA 1R9QA 4RYAA 1M5FA 4IO6A 3SVRA 2V4EA 3DQ4A 1QXTA 1DTGA 1PB7A 3SSYA 4R74A 2PT1A 3CG3A 2AL5A 4H8JA 2DDDA 5J2OA 3HV1A 3EVUA 2YDZA 2W7YA 2IB5A 2RKMA 1Q1KA 4N07A 1YCJA 2AL4A 3DPXA 3MC2A 2G3DB 2CZLA 3SG5A 1XS5A 1YTVA 4W6OA 1FTKA 3VE1B 4G2ZA 2O84X 3H6TA 3FZVA 2P2AA 4JEOA 2UVGA 1Y1MA 4GOBA 3K2DA 4IK1A 4IZNA 1MXXA 4W6FA 2Z8EA 1IXIA 5IKBA 5EXBA 3LBSA 2H9WA 5B70A 4ND9A 1Q4AA 3KOTA 2YJPA 3LC8A 4H3NA 5HZOA 3ILTB 3IOUA 1XT8A 4XOWA 3LS3A 2H5OA 2AH8A 4W7FA 1ANFA 2F7BA 4GLIA 4IK3A 2V84A 4NE4A 4PPLA 2Z6XA 3A8SA 4YB7A 1YFPA 4RXLA 3LVDA 2DUGA 2NVUB 4W6PA 4EF2A 3UN6A 4X1BA 1S50A 1XMZA 1OVBA 1A54A 3TAJA 1QUIA 3G7WA 3CRBA 3P28A 4YICA 4J8AA 4NMYA 4LZ5A 2Q2AA 4JFGA 4NWSA 3S9LC 2A52B 3GBAA 4QFPA 2ZYOA 5DRFA 2GX0A 1B9JA 5KCJA 1SD3A 3PPOA 4JC2A 5BUUA 3B6WA 2OWTA 2E0SA 4EQ9A 4QFOA 4PETA 5DY6A 3SEVA 5DTLA 3SEWA 4Q30B 4LVQA 1HUYA 3N6TA 2RCBA 4KW4A 1MDP1 4QFLA 5I2KA 1B7HA 1LBCA 2X7QA 4DZ1A 4ZE9A 3MGFA 2DXRA 2H9BA 2ZYNA 3CFZA 3IOWA 4I62A 2Z8DA 4OESA 3DQLA 3T22A 1JETA 1NL5A 2QS3A 3QXMA 1S7YA 3PJ5A 3M3FA 5LTQA 1N7WA 4XKRA 1PBQA 4W7CA 3D4CA 2HZLA 2XXQA 3U94A 4G68A 4XOVA 1UQWA 1IIWA 2XXTA 3NEDA 4E0XA 1PBPA 3GZGA 4XKNA 1OXDA 1YJFA 2ZXTA 3C31A 3TYHA 3UG0A 4BLAA 2A5TA 1KYRA 3SRYA 1OLAA 3W15C 2VHAA 4W74A 1FQFA 3FV1A 1MOVA 3U0KA 4H65A 3ZKLA 2FL1A 4OFJA 1JEUA 3PMVA 4MLQA 4YKJA 3TODA 4YZZA 1UTBB 3MP8A 2DYXA 2O69A 3KSXA 2H98A 3PJ7A 1AIVA 1DPEA 3ST4A 3TTLA 1F09A 3M3LA 5TP9B 2FZUA 4FAJA 4I9DA 4FORA 3PD9A 4IGTA 2I3WA 4DXNA 2QJEA 3K6XA 3EHSA 4NEDA 4L12A 2DUFA 4TLLB 1S9TA 4KCCA 4F31B 4W7AA 3H6UA 4W6BA 5AA3A 3VLVA 2ZNSA 4DE8A 4XL5A 3FIRA 3U0MA 4LATA 3O66A 1QJMA 4QSDA 1LB9A 1RYXA 3F11A 4XVPA 4OETA 3ONMA 3FJGA 4LQTA 4BDLA 4EULA 3U1OA 1YJ2A 4KFQA 3KN8A 1H43A 1Q4EA 3E5WA 3ADFA 4FEBA 4F1VA 4OERA 1JW4A 2Z23A 1B7UA 1PC3A 3GXAA 4IO4A 3SERA 2XXYA 4BDNA 2YFPA 3C4MA 4Q7RA 1ATGA 4RTCA 4OZ9A 1J1NA 3VK1A 3DM0A 4RPNA 4YKIA 1B3LA 4ZF4A 5DTZA 1MPDA 1DTZA 2F34A 4KA9A 2VZXA 1ZGOA 3MAMA 2AWMA 2DE2A 2PBWA 4PFEA 2O2BA 3H1RA 2I49A 4KI0E 1SBPA 2R6GE 4JB7A 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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