3OSRA

Maltose-bound maltose sensor engineered by insertion of circularly permuted green fluorescent protein into e. coli maltose binding protein at position 311
Total Genus 191
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
191
sequence length
621
structure length
603
Chain Sequence
RWGSKIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELGGSHNVYIMADKQRNGIKANFKIRHNIEDGGVQLAYHYQQNTPIGDGPVLLPDNHYLSTQSKLSKDPNEKRDHMVLLEFVTAAGITKGEELFTGVVPILVELDGDVNGHKFSVSGEGEGDATYGKLTLKFICTTGKLPVPWPTLVTTLVQCFSRYPDHMKQHDFFKSAMPEGYIQERTIFFKDDGNYKTRAEVKFEGDTLVNRIELKGIDFKEDGNILGHKLEYNFNNPAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEDLKDAQTRITK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title A genetically encoded, high-signal-to-noise maltose sensor.
pubmed doi rcsb
molecule tags Fluorescent protein, transport protein
source organism Escherichia coli o157:h7
molecule keywords Maltose-binding periplasmic protein,Green fluorescent protei
total genus 191
structure length 603
sequence length 621
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-09-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13416 SBP_bac_8 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.155.10 Mainly Beta Beta Barrel Green Fluorescent Protein Green fluorescent protein 3osrA03
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3osrA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3osrA01
3UG0A 1FW0A 3KZGA 4W7FA 1FCKA 3H6WA 4LUBA 5ELVA 4QFLA 4JBZA 3ADFA 3DQ6A 4F18A 2A53B 3DQ2A 3DQMA 3O6GA 2G3OA 4MH5A 5DEXA 3ZULA 3ST3A 2NUVA 4IO4A 4UACA 3V89B 4W6TA 3MC2A 5DQMA 2QS1A 4GIZA 3TKDA 4NF6A 4PPLA 4Q7RA 2ABHA 3MPLA 2HCGA 1TT1A 1LBCA 5DTZA 1URDA 2H6VA 4HQ8A 1OMPA 1SI1A 1N7XA 4J89A 3LR1A 1B5HA 5F7VA 5HBDA 4JDFA 4W6DA 1H76A 2D21A 2OKYA 4IGRA 3DQ7A 3EVPA 2XXTA 1Q4BA 1YZWA 3Q29A 4GRKA 3U72A 3DQUA 3JV9A 1LCTA 4XKQA 1LB8A 2HGYA 1P1UA 1DTZA 4OHNA 3KCSA 4YICA 4DIGA 3PPQA 5I59A 3VXBA 2DQVA 1YJFA 3WCKA 3C36A 4YKKA 1YHHA 4LQ5A 3T66A 2H5OA 4KA9A 3OMBA 1H43A 5L8DA 3C9HA 4YKIA 3IB1A 5ICQA 3E5WA 3IOVA 1ZTYA 1MDP1 4ZF4A 5HZTA 4ELQA 3O77A 4ZBLA 4H3LA 2Y7KA 4W6AA 4RPNA 3G3GA 3H1RA 4G68A 2YFPA 5FVGA 3S05A 3Q28A 5K2XA 2DUHA 4MLQA 5M2VA 3NT3A 2HEUA 4OETA 3O9PA 4R2FA 3PPOA 4BDNA 1W7TA 4I2YA 1A54A 4RPOA 3KOTA 4OTEA 4W6OA 3SG2A 4ZEBA 4EUOA 1QXTA 3GZGA 4DXQA 3SVRA 1W7SA 2OTEA 3GLBA 5KCJA 2O24A 4OYVA 1URGA 4KPIA 1JBYA 2G6EA 3DQEA 1B5JA 2HGDA 4W6CA 3LVDA 3BXCA 5EB7A 2AHAA 3EVRA 1JNFA 1LFHA 1KYSA 4XVPA 4YKPA 4PFTA 4TOZA 3QXMA 1LAHE 1AL3A 3E5TA 2AL5A 1A99A 2GW4B 5HPQA 3U0NA 1VR5A 4H6DA 3EK4A 3E3KA 4ZIOA 4J88A 3S9EA 2V25A 3RN8A 4RA1A 1OXEA 2Q89A 2XXXA 1GGGA 1DPPA 1PBQA 4QHQA 2XX9A 5H8QB 4KQPA 3MJNA 3LS3A 4AB5A 1LAFE 1O64A 4U21A 3DQDA 4G4PA 4KYEA 4I62A 4W7AA 1IXHA 4IK5A 4DLDA 3FATA 1LFGA 4IK3A 3ED8A 3SVBA 3W9VA 5J2OA 3E13X 4OVJA 4XL5A 4B30A 2Q9TA 4R75A 3PUVE 4TQUQ 4X1BA 4F22A 4KPTA 3RGYA 1OVBA 3OSRA 4RYSA 4W75A 4I9DA 4OXVA 1EMEA 4XGYA 4KW4A 4ESWA 2P4MA 2X26A 3MZ1A 4NF6B 4EQ7A 1LAGE 4FE8A 3H6UA 4KCDA 1EU8A 2ZMBA 2QS3A 4LZ7A 2E1SA 3LA1A 3C35A 4H0WA 2QLIA 1N76A 3KN7A 2G2SB 1JQFA 1KYRA 1EMBA 1LB9A 4U2VA 3SSYA 4G8MA 2ESNA 1IUDA 1Y3QA 4ESXA 3K2DA 4GL0A 3I6VA 5I59B 1SYIA 5LK4A 3N94A 1M5CA 4HS7A 4Q8RA 2W7YA 1B7UA 2V4EC 3U0KA 4GFRA 1YCJA 2XX8A 2GHAA 1MG1A 1KYPA 1XC1A 2XX7A 4G8NA 3TCHA 3DQ9A 2FNCA 3I5OA 1B3LA 3N5LA 2DP8A 4GD5A 3CSGA 5AA1A 5TU0A 3BBRA 1P1QA 1SDXA 3T22A 1R9QA 2XD2A 4AB6A 3O6IA 5AA2A 1DTGA 3FV1A 4W6GA 1MY0A 1XT8A 4G68B 1LFIA 3EKHA 2O2BA 3EHTA 3DELB 2DUEA 4HCYA 5AA2D 1BLFA 4H5FA 1EMGA 2O29A 1IZ1A 3CG3A 4OEVA 3FJGA 1H3DA 4W6FA 2DWJA 5B70A 3H4ZA 1R6ZA 3O28A 3FD3A 3DM0A 4U4XA 5TPAA 3FVNA 5KCJB 1MXVA 3H1OA 3GEXA 1MYWA 3VVFA 2DXYA 4NWCA 1Y3NA 2ZYOA 2JADA 3U8PA 2RCAA 4Q9WA 1MQDA 5DQBA 3SVSA 3LF3A 2Z8FA 4NF4B 4LJDC 4F3BA 4PFYA 5EXUA 3KCTA 1LCFA 1B4ZA 2Z6XA 2F35A 1YAEA 3THIA 3Q26A 4OFJA 5CMKA 3S4UA 2QT2A 5EB6A 5DT6A 2HJOA 4EMQA 4XKRA 4WEPA 1Q4CA 3H6VA 5JEIA 4DKMA 4MLVA 4UA8A 3EK8A 2H9BA 4Z4KA 3VLVA 4JXIA 4F3SA 4LJBA 1TFDA 1H6RA 5FHOA 2V4EB 4P0GA 2H5YA 4YB5A 4E0XA 5T3IA 3IR8A 1RM9A 4Q9XA 4FEDA 3SRYA 3PJ5A 5FVIA 2HAVA 2A52B 4YMAA 3E5VA 4QFPA 5H8HA 2YJPA 4W7RA 2Y84A 3DQJA 1WODA 1XA9A 3LSLA 3ZSFA 3UGWA 2OZZA 4BLAA 2F97A 1SW4A 5FHMA 1JW5A 2R71A 3CFXA 2Q2AA 3Q27A 4JF9A 4IZNA 3DPZA 4B30B 3C4MA 2F36A 4DCYA 3M22A 3GBAA 3IAZA 2XXIA 2G29A 3KN3A 2OWTA 3TELA 1B05A 1EZPA 4H1XA 2G5ZB 2VAEA 4GOTA 4H3MA 1TXFA 3IL1B 1FQDA 4KCCA 4R72A 3TPAA 3QIMA 4ONYA 2PXSA 1PEBA 4W6SA 3LSAA 1P1WA 1QKBA 3SG7A 3WAFA 4OEUA 3RQTA 2HAUA 4X48A 2WHUA 2YLNA 3V83A 3NF0A 4JGEA 1B40A 2REGA 2QL3A 2VZXA 4FORA 4BDOA 2QZ0A 3LUYA 2ONSA 3TZAA 1AMFA 3T9XB 3A3UA 4OQWA 4ZZEA 3G3IA 1FQEA 3NT9A 5F1QA 1OVTA 3K6WA 3GL4A 3V3DA 2CMOA 2OLBA 4EDPA 2A56B 2XHDA 4WEDA 2G16B 4KGFA 4WKMA 1FTMA 3K00A 1RYXA 3LSFB 2EMNA 3N6TA 3RLFE 4ECFA 2F7AA 1NNTA 2I4BA 4OESA 2IEEA 3DQAA 1POY1 1XSSA 5F9GA 1QKAA 2EMOA 3CR9A 2P1SA 2ICRA 2Z8EA 5L9OA 5AA2B 3FVKA 3FIRA 2DWHA 3MWBA 4PP0A 1J1NA 3EHSA 1SI0A 5H8FA 4MFIA 3U8CA 2WHSA 3MP1A 1N04A 2RC9A 2ZMUA 4EXKA 2A5TA 4GF8A 3ST0A 5TP9A 5TPAB 1VFEA 3CG1A 1Z7NE 4IY5A 4O3BA 5BTTA 3S9LC 3MAMA 4OERA 1B58A 2QSXA 3HN0A 4R74A 3OGOA 2O68A 2HZLA 4XOVA 1SVXB 4H67A 1NH7A 4KHZE 5AE4A 3PV0E 3DPXA 2QRFA 1O63A 1Y9UA 3W15C 3FXQA 1EMCA 3W1CA 3C31A 3K1MA 2Z22A 2QMXA 3H7MA 4F1UA 2VVJA 3U94A 1HCJA 1AIVA 2UYFA 1AOVA 3FASA 1URSA 3VHTA 2XXPA 3FVOA 2QLHA 4W6JA 3MGFA 1B3EA 4HCWA 1IXCA 2ZO6A 2VADA 1M5BA 1W7UA 1MXXA 2Z1OA 1R9LA 3UFZA 2F78A 1A7LA 4W7DA 4O3AA 1USYE 1VE4A 1YHIA 1SD3A 2FL1A 3KGCA 5H8HB 4ZECA 4LA9A 3O97A 3TUSA 1D9YA 3PPPA 2Y7IA 5EXCI 1SBPA 3DQCA 4P1QA 2G6YA 3LVCA 5EXBA 3ODBA 4TLLB 2A47A 1LSTA 1QVSA 3PPNA 1EMKA 3K1NA 4M1VA 4YB7A 1B46A 3SETA 3PGFA 4GL8A 1A8EA 3I3VA 4NF5A 4ORNA 1ZGQA 4YAHX 3TTNA 1DPEA 1QULA 4LVQA 1HSJA 4ANJA 3MUQA 4ZDMA 2YE1A 3FJMA 2DDCA 4ZEFA 3IJOB 4W6HA 4JSDA 3KEIA 4W69A 3VVDA 3RNNA 3SEWA 3ZS6A 3W1DA 5JK4A 3RWTA 5I84A 4RK2A 5HBCA 3DQ4A 4EN1A 2A48A 2UVHA 1EMAA 4KYSA 1N3WA 3TODA 2OJTA 4RXLA 5CBRA 2QRYA 4BDRA 1CV7A 4G77A 3OD7A 3TMRA 3USDA 2H4IA 2F7CA 5EJUA 5I2NB 2XXRA 1B9JA 1OLAA 2PBWA 4OQOA 4ZEKA 3PD8A 5BQLA 4DXIA 3E9XA 3M3LA 1QYFA 3ZUFA 3N26A 4H48A 2P0SA 3CD1A 4NWDA 1Q4AA 1D9VA 3E4RA 2DE3A 3PMWA 2H98A 4H47A 2VGQA 1FTOA 1B2HA 1JEVA 4MBPA 4AQ4A 4K3FA 3SV5A 1ZJLA 1YFPA 3O29A 5LTPA 3D4CA 5H87A 1QUIA 4DZ1A 3CB9A 4U2RA 4YZZA 2RCBA 3RY3A 4NF4A 4H65A 2M8CA 2O6AA 3L6GA 4ND9A 2ALUA 2NWJA 1QY3A 3UORA 1OLCA 1XQMA 3M24A 3OO8A 1MY3A 3HO7A 5H8FB 2Y0GA 3EVUA 3CI8A 1GGXA 3ZKLA 1MOVA 1ZGPA 2THIA 2A5TB 4DXPA 1B51A 3IOTA 5BT0A 4H8IA 2V4EA 5LTRA 4R6DA 4FEBA 2FYIA 5FHVA 5TP9B 3HSTA 3OOAA 3BXAA 3LVAA 3MPKA 3IB0A 4QRZA 2RINA 1Y1ZA 5BTTB 2I58A 3S2VA 3DQ3A 2HQ0A 1B0LA 4DXBA 1Q35A 1MPCA 1PB9A 2ZXTA 4F31B 2I6EA 5IAIA 1Q73A 1MPBA 1YJ2A 1MY2A 3DQKA 5DRFA 5FHNA 1SW5A 3T93B 1LBBA 5I56A 3CFZA 4F3GA 3VXCA 1NFTA 1GV8A 2IE2A 4QF9A 5ICTA 2NOOA 3K6XA 1M5DA 2I3WA 1F9BA 2A50B 2DWAA 4W6IA 3VHTB 3B6WA 1B6HA 1O7TA 2DYXA 5EYFA 1MQJA 3OXNA 3MZBA 1OQGA 4GVOA 5L9SA 4KR5A 3G3FA 4Q7UA 1XVXA 3JYRA 1JEUA 4FIMA 3GJ1A 4DXCA 3LC8A 4XKNA 1P1NA 3GB3A 4W77A 1M5FA 2DVZA 1GVCA 3T96B 2O1MA 4HW8A 4W7EA 2DOJA 4G2ZA 4LJDA 5HZOA 2R9JA 3MQ9A 2ANJA 3DLNA 4F3PA 2O51A 2XXYA 2O69A 3UN6A 2XXHA 2IB5A 3CBEA 1EZ9A 1P1OA 1ZLQA 4R9FA 1B7ZA 4ZEDA 3HV1A 3MVYA 4NF5B 1ZBMA 4F19A 2AWJA 2A46A 1T0KA 3M3FA 2ZYKA 5DTLA 3A09A 4PE5B 4DXUA 3TEPA 5K2YA 1UIUA 2HQKA 1N0TA 3G9AA 4KF4A 1ELJA 1QW0A 3KSXA 3GJ2A 4GLIA 1MM6A 4C0RA 5L9MA 4W6MA 2HQZA 3VV5A 4R2BA 3U0MA 3C32A 1HSEA 5JTYB 3SEUA 1MY1A 4F29A 3TQLA 2DS9A 3GXAA 4MF3A 4PPJA 1A40A 2GFEA 3TQWA 4WXJA 1NMUA 3MP8A 3G7WA 5ITOA 3PMXA 4LW5A 3SSLA 1RKMA 1F09A 4EDSA 3V8XB 4HTGA 1Q4EA 2F5XA 2F6GA 4FECA 4Q7TA 3VLWA 1D3KA 4ZE9A 1SW2A 1BKAA 4P11A 3CSBA 2GX0A 3NEZA 5AA3A 2REJA 3U8AA 4FAJA 2BTJA 3PUWE 1RYOA 1H44A 3C34A 3KG2A 4LQ2A 5DTXA 2I48A 4EXLA 3SEXA 3B6TA 2ZO7A 4W72A 3TYHA 5KDTA 5DU0A 3U92A 2PT1A 2DD7A 4IO7A 2QU1A 3CFLA 1Y20A 4DKNA 5EHUA 4ZE8A 3SVDA 1KP5A 3IK6B 4KEXA 2UVJA 5DTBA 4BDUA 1HSLA 1USYH 4RJZA 4W6BA 3R26A 2GX2A 3G3JA 3NEDA 5H8NA 5AA4B 1IQ7A 1MH3A 4ZF3A 3WLDA 4RTCA 3ST2A 4Q5TA 4H3NA 1Y4TA 3RTFB 2VHAA 4GESB 1BIYA 2UVGA 5H89A 1JW4A 4PFEA 1POTA 3H6TA 1SYHA 3SSKA 5I56B 2V93A 4H8JA 3SERA 5CI5A 4KW9A 2H5QA 3FZVA 4XTCQ 1ZKBA 1LLSA 4F2OA 3R6UA 2DE2A 3BFUA 3EN3A 5DPHA 3TAJA 2O7IA 3ILTB 4QFNA 4RYAA 1RMPA 3EF7A 4DDDA 3TTRA 1NNKA 4KI0E 4FATA 2D5WA 3VVEA 4NTLA 1N3XA 4HVFA 3TDJA 3L6HA 4LJCA 5KZTA 3SVNA 2OWSA 3A8SA 3CFFA 1QUKA 3U1OA 2RC7A 1NNFA 5I2NA 1QYOA 3DP8A 3PMVA 5HZSA 4BDQA 3CFAA 3SG5A 5LOMA 1IIWA 2ONKE 4ISUA 2BJJX 2QS2A 4IGTA 2Y7RA 1ZGOA 3TFLA 4ZEIA 1MXYA 1NNPA 1ANFA 1MRPA 3DQ8A 1B3FA 1ATGA 2Y7WA 2V3QA 2PT2A 3H06B 2DUIA 3TMTA 4XXUA 4W74A 3KSJA 2NVUB 3A3CA 3DQIA 4LATA 4F39A 2WKYA 1MXUA 1YTVA 2XXVA 3EKJA 2VVHA 1XOCA 1I69A 2IA4A 4J8AA 3HCQA 3KJTA 2CZLA 1L5TA 2B3FA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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