3P2AA

Crystal structure of thioredoxin 2 from yersinia pestis
Total Genus 36
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
36
sequence length
145
structure length
145
Chain Sequence
NAMNTVCTACMATNRLPEERIDDGAKCGRCGHSLFDGEVINATAETLDKLLQDDLPMVIDFWAPWCGPCRSFAPIFAETAAERAGKVRFVKVNTEAEPALSTRFRIRSIPTIMLYRNGKMIDMLNGAVPKAPFDNWLDEQLSRDP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal Structure of Thioredoxin 2 from Yersinia pestis
rcsb
molecule tags Oxidoreductase
source organism Yersinia pestis
molecule keywords Putative thioredoxin-like protein
total genus 36
structure length 145
sequence length 145
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-10-01
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.20.28.140 Mainly Beta Single Sheet Rubrerythrin, domain 2 Rubrerythrin, domain 2 3p2aA01
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3p2aA02
3ZYWA 1GTAA 3QPMA 4P3YB 1I9DA 2H1BA 2K6VA 2HXKA 1W89A 3GKNA 5J9BA 2DJKA 3WGXA 1HQOA 1B48A 2E0QA 4HU7A 1GRXA 1O6JA 1ABAA 3GSSA 5ABRA 2L59A 2JSZA 3DYRA 2QSIA 3NZNA 4GTUA 2J23A 2YN1A 4MK3A 3CTFA 3BD2A 4GF0A 1SL2B 2YWOA 4BVYA 3LYKA 2L6CA 4XS6A 2DIZA 1Z3EA 2JZSA 3A2XA 3Q19A 5ECQB 1YKAA 3H1NA 2PN8A 2AJQB 1GNEA 5KEJA 5JWRB 5D9VA 2HFDA 2X8CA 4Q5NA 1T4ZA 2J9UB 3LFLA 3GX0A 4WF5A 2LV3A 2PWJA 3QOUA 4AGSA 3KP8A 4OCFA 3TJGA 3UAPA 1GTIA 3RAZA 4H86A 2AV4A 1UVZA 1GNWA 3CXGA 4MPGA 5E59A 1J9BA 1O8XA 3E9JB 4ZB8A 1BAYA 2VLUA 4XCSA 4HU9A 1A2JA 2H0IA 4ZBDA 4QL9A 3GKKA 5J3RA 1X9WB 5ECPB 4XS4A 1YF1A 4KW6A 2X99A 3DEXA 13GSA 4HJ2A 1OE7A 10GSA 2DJ0A 3ME7A 4FYBA 3RDWA 1SYXA 4POMA 4ID0A 2P5RA 4G10A 4MH3A 1HNBA 3EC3A 3C73A 2NBSA 4ML6A 3UOMA 3KXOA 2YNXA 3CSJA 9GSSA 2O87A 3FY7A 1V9WA 2H6XA 3LG6A 4CW9A 3IAS2 3ED3A 3P7XA 5CO3A 5CRWA 3VPTA 5F06A 3HKRA 2H73A 4POBA 3WT1A 1Z5YE 3LJRA 1U3AA 1XCCA 2DJ2A 3RPPA 1URMA 1IYIA 4GLTA 3FR9A 4MDCA 4GCIA 2VM1A 2YV9A 1EGRA 2A2SA 2VL2A 4FIWA 2RLIA 4L8EA 1FHEA 3L4NA 2HSHA 4HS1A 5ECHB 4OD7A 2H6YA 1FO5A 3APOA 2LQOA 2FUG2 1JFUA 4GWRA 4GQFA 1GP1A 1ERWA 2IPAA 2R4VA 1YJ6A 1Y25A 2H75A 3QAVA 4ECIA 1S3DA 4ZIJA 1EWXA 1OE8A 4WF4A 1BYEA 2VD0A 3TJFA 3H4KA 2ZCTA 4IQ1A 2VCZA 3DD3A 4HUAA 5ID2B 3KD0A 2I3YA 1F3BA 2AB6A 2RUEA 3UL3A 4MF7A 2YZHA 1Z6NA 4EF0A 4N0ZA 3C1RA 1FW1A 4WBRD 1Z9HA 1UA5A 6GSUA 2IMIA 22GSA 2EC4A 2LSTA 5DVBA 5HR2A 3F6DA 1N8JA 4HEA2 3KH9A 3RPNA 1GULA 4X1UA 1ILOA 5G30A 3KH7A 1Y6EA 1ZZYA 1PN9A 4O92A 1X9SB 3IBHA 5ECIB 2CZ2A 3ZLPA 1FVJA 4XXBB 1V58A 4MF5A 4LA1A 2WDUA 1Z7RA 4WETA 3UEMA 4BWQA 1JLWA 1TDIA 2H72A 1KTEA 4RUVA 4MABA 2CQ9A 4DVCA 2C3QA 3KM6A 3UBLA 1WMJA 1ML6A 2XC2A 4IN0A 2K18A 4GSTA 4IQAA 3FW2A 4ILFA 4RQRA 1AQVA 3D4MA 1IYHA 3LYPA 2VLTA 3VPQA 2YV7A 3FRCA 4PUFC 2GLRA 2YANA 5IMDA 5G1LA 3ZIJA 1GSEA 2JADA 4YQMA 1XOAA 4KDXA 3O76A 5ECOB 3TKRA 1XFLA 5J9CA 2K8VA 2YP6A 5AIVA 2GQMA 4QQ7A 1QK8A 2WS2A 4IW9A 3TGZA 1PA3A 4LL1B 4J56E 3UIWA 5DAKB 5C04A 3UVHA 2HLSA 5HR0A 2V41A 2AUVA 4PXOA 2LQQA 3GTUB 5D9XA 2H19A 1U87A 1DBYA 3IHQA 2V6KA 3GHAA 5IPGA 1A2LA 3B08B 1WJKA 3ZIVA 2B5XA 5COHA 2KP1A 1M9AA 5D8IA 5GAPD 4J2FA 2VUPA 3RHBA 3RHCA 2MMAA 3VWUA 1GSDA 4MZCA 3C7MA 1XW6A 3GMFA 3ISOA 1K0DA 2ES7A 3HJOA 3FKFA 3M3MA 3V1WA 2KHPA 3WT2A 3MSZA 1PRXA 2OE0A 4TVEA 4OO4A 1AQXA 1Q4JA 1ERTA 2OJLA 1ACVA 4KB3A 2GQKA 3VFIA 1ST9A 1R4WA 1K0BA 5IPHA 2YJHA 4IELA 1WWJA 1MD4A 2GGTA 3GKXA 4BA7A 5ECSA 5CRGA 3VI7A 4XHMA 2ALBA 4AJ7A 3TDGA 3FZ5A 1RW1A 2QKEA 3VWWA 2L6DA 1SKSB 4ULXA 4KH7A 3FZ4A 2B6MA 2H74A 3HY2A 2YCDA 3L9VA 5H5SA 2V1MA 3HZ4A 4E8HA 4JEDA 2I4AA 5AN1A 4E8EA 1WP0A 1AXDA 1YEXA 2GQLA 2XBIA 2WGRA 4JR6A 1XWKA 3FEUA 1T8EB 2RM6A 2PGTA 1DUGA 1SJZA 1XXUA 5GSTA 4MJAA 1TKDB 3N5OA 5AGYA 2F8FA 1JZWA 2BTOT 2TRCP 2R2JA 1FAAA 2M46A 4JZQA 3LXZA 2GZYA 2NVLA 5DQYA 1SU9A 2LKUA 3M1GA 4HZ2A 4RQXA 2H30A 4V2MA 3FR6A 3VWXA 3F0IA 2H0GA 1K0AA 1AUCA 1LU4A 2H1GA 1ZCPA 3UARA 4D73A 3ZMLA 4KAEA 4MZBA 1TU8A 5G1KA 1SKWB 1NM3A 4DSQA 1XBSA 1MDKA 2RIIA 1BEDA 1OVNA 1K3YA 2B7KA 4TR3A 3HCZA 4WEYA 3P8WA 5ECMB 1GLPA 1G7EA 4HJMA 3BBYA 3HVSA 1WRYA 3UJ1A 1AAZA 3ZVJD 1U6TA 1WE0A 3AY8A 4AJ8A 1F9MA 3LGCA 2C0GA 5DALA 3ZFLA 2HYXA 1AQWA 5CP1A 4F9ZA 4DSSA 4V1Ag 1VF1A 4J57E 5LNKe 1XWCA 3VI5A 1UN2A 3VURA 2C80A 4WKWA 4WXTA 4EXJA 3ZVJA 4FYUA 3SWLA 1A2MA 3GNJA 4ZBAA 4I97A 1YZXA 2CV4A 1XVQA 2H76A 3UVTA 2I81A 3GA4A 1X5EA 3A2VA 3IDVA 4ZL7A 2IMKA 3IOSA 2VCVA 4D73B 1V40A 1SL1B 3PGTA 3ZTLA 4MCUA 4O7HA 7GSSA 1RQMA 1GLQA 4AF2A 1HYUA 3QD9A 1MDJA 4FH8A 2PERA 1JHBA 2V2GA 3D21A 4NXIA 3GURA 5HFGA 2C6AA 1SJIA 3PR8A 2GSTA 4GSSA 2WJUA 4RI7A 4TR4A 1K0CA 1PKZA 1K0MA 1M7TA 2LJRA 2VIMA 1EV9A 2YJ7A 5B8AA 5DCGA 3QFBC 2VCQA 2VO4A 2NTOA 4NAXA 2VM2A 5C00A 20GSA 2OA7A 2C0FA 2IFQA 1G6YA 3WGDA 4EO3A 2FLSA 2R3XA 3TUEA 3CRUA 4XRDA 1V57A 2F8AA 2H0HA 2VCXA 4YAPA 4JU5A 1R5AA 4Q5FA 3HHVA 3O3TA 1PL2A 1TRWA 1AIUA 3BCKA 2PVQA 3DXBA 5LD0A 4YH2A 3D22A 1NHYA 3S9FA 1H75A 2C4JA 2XBQA 3M9JA 3ZFBA 1O85A 3IPZA 3CRTA 3DIEA 3H93A 2FY6A 5ENUA 5G5EA 1K0NA 1MEKA 3TRQA 3IXRA 3GSTA 2IIYA 3G7IA 4EL1A 4ZXGA 1W4VA 3GN3A 1CQGA 2IWTA 3TKSE 2OBIA 3H8QA 1TJDA 4KCAA 5CRDA 3EMXA 1QFNA 1EOGA 3D5JA 3JCML 5INYA 4Z7XA 1EV4A 1T7PB 2X8GA 3GFKA 4KGIA 4XS4B 1YF0A 1YY7A 4K0GA 1EP7A 5DQSA 4IJIA 5D9WA 1NHOA 3VK9A 2R6KA 4PX1A 5AISA 3US3A 4MJEA 1F6MC 1TI1A 1VGLA 1MTCA 2AHEA 2A2RA 2REMA 5J41A 2EIQA 3QCPA 2P31A 4NWYA 3A3TA 2VD1A 3M9KA 2B1LA 2M80A 3HDCA 3WD6A 3Q6OA 4IHUA 4K8MA 2XPDA 2BMXA 4KDUA 3GH6A 5H5RA 3W8SA 5A4WA 5EPFA 4RI6A 4PURA 1SK0A 4O32A 6GSWA 2HE3A 3F9UA 5H5QA 1EP8A 3TKSC 1SKRB 1EEJA 4HDEA 2OKAA 1QXHA 3I43A 2HT9A 2R37A 2B3SA 4MMMA 2QC7A 1B9YC 1ZOFA 4LMWA 1OC3A 5FT3A 1M9BA 3FZAA 5A4VA 2FWFA 2OACA 2VL3A 4OMVA 3EURA 4I8BA 3GV1A 3DRNA 3GUSA 1A8LA 4MF6A 1YDKA 2OBKA 3QMXA 4I6XA 4PQIA 2FCHA 1NW2A 4N10A 4PNFA 4O5RA 3NIVA 4TXVA 3DVXA 5D93A 3IE3A 1K3OA 2L4QA 3TRPA 1XW5A 1PX6A 3BCIA 3NOFA 2LS5A 1TTZA 2OE3A 1M0UA 16GSA 4WR4A 3P2AA 4MZWA 4TXOA 1B4PA 1BQ7A 1BJXA 3A5WA 1I5GA 3MAKA 5IM9A 5IO0A 2LRNA 5LCZA 2P5QA 3GL3A 3EYTA 5F0GA 3U5RE 1Z6MA 2B1KA 4V1Ap 3GL5A 5DDLA 1PQNA 1XOBA 5HQPA 1OKDA 2LUSA 1KNGA 2PU9C 3GKMA 3CSIA 3GH9A 3HJMA 4KA0A 3VWVA 2DSAA 4EDYA 5IMCA 3ZZXA 2YOIA 5IMZA 5HR1A 2ON5A 2VCWA 3G9BA 4K7NA 4MP4A 1R7HA 1XWBA 4IKHA 2CVDA 3E3EA 2GSQA 4POKA 2JSYA 2IJYA 4TOPA 3D6IA 1TK8B 2H70A 2J9HA 2V32A 2N5FA 1E2YA 3BOAA 3UMAA 4EUYA 2F3MA 3IR4A 1B4QA 5AIXA 2JZRA 3W6GA 1J08A 2FD3A 2A4VA 4TR1A 1PL1A 3KTBA 4TKYA 4TXOB 3L9SA 2VL9A 2GVPA 5CREA 2O7KA 2GT6A 5HR3A 3M0FA 1U88A 2H71A 2I9HA 2FA8A 3IAM2 2DMMA 1ZYEA 1O73A 1BX9A 1U3IA 4L0WA 4EVMA 3TJKA 2F51A 2HSYA 3EE2A 3C8EA 1USBA 4WR5A 3HZ8A 1A23A 18GSA 2C8UA 4L5LA 3G7YA 3I9V2 1FB6A 1KBNA 4EDZA 1JZRA 3FYGA 1MDIA 3C1SA 5E4WA 1SD9A 2K8SA 1S3CA 2G2QA 2B5YA 1OYJA 4MA9A 2M72A 4LLRA 1YEPA 2V6OA 4IGJA 4POLA 1O7UA 3ZREA 2JL4A 3L78A 1GL8A 5F8BA 2OADA 1TW9A 2LRCA 5GZZB 2ON7A 4KSMA 2VL2C 1A0FA 3GIXA 2KUCA 3KZQA 2HI7A 1JLVA 8GSSA 1M2AA 4MJCA 2CVKA 3KTLA 4PGTA 4ZB6A 2C6BA 4YAVA 3LSZA 2FGXA 2KLXA 2CT6A 2H1AA 5B6MA 2IL3A 3KMNA 2E2MA 4IBPA 2DJ1A 1TK5B 3F3QA 1XWAA 2RUFA 4OWYA 3ZL5A 4PUAA 1F37A 2YWMA 2LRTA 3IRAA 4XIHA 4IS0A 3G7JA 5D96A 1G7OA 1AW9A 2C0DA 2GTUA 4ECCA 3FHKA 5ECNB 2VLVA 5B7CA 3QAWA 1OKTA 2JU5A 2LNSA 4KE3A 4EE0A 3HJPA 1CQHA 3DVWA 2LNTA 2L5OA 4G9HA 2HNLA 2MMNA 2FNOA 4HZ4A 5FHIA 4F0CA 4YQVA 5IOXA 11GSA 3TJJA 4K9ZA 1H4OA 2ZUPA 1V2AA 4TN8A 2L5LA 2AYTA 3DGQA 4L0UA 3TCOA 2MBTA 14GSA 2ZNMA 1V98A 3D0ZA 1T1VA 1QUWA 1JZOA 5F07A 3P90A 1HNCA 1M99A 3TKQA 1OC8A 1TRVA 3E0UA 3M8NA 4HQZA 5ECLB 4XS1A 4EC0A 2PPTA 4N0VA 1LBKA 5JWQB 2HRFA 3J7Yb 2TRXA 1X5CA 1N2AA 2CAQA 1B8XA 4JRRA 3HVVA 3PH9A 5IOWA 1HNAA 4K6XA 3WYWA 1J0FA 1PMTA 4ZL8A 2DJ3A 3TB2A 3LORA 2D2ZA 2MYGA 3IA1A 1ERVA 2G0FA 5IMAA 3LQ7A 1FG4A 2H1DA 4K1FA 5DALB 1SD8A 1THOA 4DSSB 1XPVA 1ZMAA 3IC4A 1NSWA 1GUMA 5KN1A 2MBSA 5HFIA 5HFKA 2CX4A 2K9FA 3KCMA 1EZKA 4BL7A 4IVFA 5KN0A 4G2EA 1X5DA 5CYYA 5G31A 3KP9A 4JBBA 2KOKA 1LJRA 1VRSD 3WGEA 1T3BA 2PVOC 3FZ9A 3KIJA 2DBCA 4OFTA 3B0AB 1GSYA 1F3AA 2CVBA 2PBJA 2Z9SA 4IP1A 4I2UA 2NPBA 3KEBA 3F3RA 3F4TA 1PSQA 4OO5A 2N5AA 5B6NA 3O6TA 4PQ1A 3LWAA 5EY6A 3I6AA 5CAXA 2WRTA 1RK4A 4ISDA 2B7JA 2IMFA 4NPBA 1ERUA 2IMEA 4K0NA 4ZILA 1PD21 1VF3A 3CTGA 3HYPA 1XWGA 3DKSA 3IV4A 1K0OA 1R26A 3A2WA 1YKCA 3ZITA 3GX8A 2AAWA 2C3NA 3HD5A 5JCGA 17GSA 4K7IA 3KGKA 1WIKA 5ECRB 3UBKA 5D9TA 4IJ3A 3FR3A 1X0RA 2KP2A 4JR4A 3U6VA 3IK7A 5ID2A 4JE1A 4G19A 4NV5A 4XRAA 5KN2A 4MLYA 2IFQB 3QDNA 1EEMA 2H01A 1OC9A 4TR0A 1GSQA 1THXA 1WOUA 1PX7A 2MMOA 4DSRA 4KNDA 3TRXA 5EL8A 5IIZA 6GSXA 1ZL9A 2WULA 4AJ6A 2DJJA 2LJAA 4KCEA 4Q5QA 2YWNA 4NV2A 5F05A 4ZB9A 1G0TA 3Q74A 2VOCA 2F9SA 1F2EA 3H79A 3HXSA 3ZRDA 1FOVA 4Q5RA 1TU7A 4TW5A 2E7PA 1SYRA 4ML1A 4BWSA 1M2BA 4L5OA 1SL0B 1R5PA 5GSSA 2LEGA 5A4UA 19GSA 2L57A 4I5QA 1TOFA 1O81A 2C1YA 4N11A 2GZPA 2IMDA 4NMUA 1GSSA 5ELGA 3LXTA 3EVIA 2IN3A 4ECBA 1OC9B 2H6ZA 3GRXA 1X9MB 4XTSA 3EMPA 4X43A 2GSRA 4NHZA 3FK8A 4DEJA 4LMVA 1BG5A 1TRUA 5G5FA 5J5NA 2CAIA 2BJXA 4HOJA 4V2LA 1PGTA 3L9UA 2EIRA 5DAKA 1XVWA 2X64A 2MZCA 4NHWA 5JCUA 3ERGA 3PINA 1TK0B 1OAZA 1TI3A 2XPEA 3GTUA 3F8UA 1GTBA 4PQHA 3IK9A 3EWLA 3I69A 4YQUA 2L4CA 2C3TA 2FA4A 4GRFA 1XW9A 1DE2A 1M2DA 5DBQA 2FWGA 3ZMKA 1MD3A 6GSVA 3CMIA 2O8VB 3R2QA 3MWHA 2PMTA 5G2ZA 1FVKA 2NDOA 1E6BA 6GSTA 1G6WA 2JACA 2P0GA 3D4TA 6GSSA 2FWEA 4HQSA 5CRHA 1Q98A 1EOHA 2I1UA 4F0BA 3OR5A 1TP9A 2EIOA 4BVXA 4FO5A 2H66A 5DCHA 3MDKA 2FHEA 2CX3A 4MJBA 3APQA 3TJBA 4N30A 1PKWA 4GQCA 4IP6A 2VCTA 5ELAA 1FB0A 3BJ5A 5D73A 3J7Yk 5EVOA 5DJLA 1B9XC 2CA8A 3ME8A 1DSBA 3F4SA 5DJMA 4KSOA 1SK2A 1QQ2A 4CDOA 5CNWA 1UC7A 4X0XA 4PNGA 3K8NA 1GWCA 4OFMA 2VAFA 3VLNA 4F2IA 5IMVA 2GDRA 2O89A 4CHSA 2OE1A 4ACSA 5IMFA 4KDYA 4EKZA 12GSA 1GUKA 1YQ1A 2DIYA 2YZUA 5GAND 2MMZA 2GS3A 5JWOB 2HRNA 2E2GA 4GSNA 3ERFA 1T4YA 3APSA 4F82A 1SK1A 1QMVA 3DWVA 3EINA 3TOUA 3RBTA 3KJYA 5A5KA 4K7OA 4KUNA 3ERWA 2H8LA 5IQYA 2HZEA 3HVXA 3QAGA 2C0EA 1VF2A 1XIYA 5JCWA 4ECJA 5KN3A 2WFCA 3SBCA 3W8JA 4OFNA 2CZ3A 2JZTA 3F63A 2DLXA 2DMLA 5J4UA 6GSYA 1A0RP 1AC1A 5L71A 2GZZA 2N5BA 1T00A 1SENA 4GXZA 1DE1A 2RM5A 3LEFA 1SJ6A 1JZDA 1ZYQB 4KX4A 1GH2A 2PUKC 2R5GA 4MPFA 3CYNA 5FWGA 1TRSA 1TXXA 5B8BA 2X8HA 4I2TA 1HD2A 2XHFA 2B5EA 2LTKA 4F03A 1O8WA 2GT5A 1A8YA 2TIRA 4LL4B 2WZ9A 4MH2A 1K3LA 3QFAC 4TR1B 2YWIA 3KMOA 4BPYA 2GSSA 2WB9A 3TKSA 1WPIA 4ZL9A 3QR6A 1Z7PA 1C72A 2YPMA 4OCEA 1KEBA 3MNGA 1ON4A 4FYCA 4ZBBA 1ZGNA 2HZFA 3CSHA 1GSUA 2HZEB 3CBUA 3Q18A 4WBJA 3EU4A 3EU3A 3F4RA 4HI7A 2LJKA 5IO2A 1XZOA 4QL7A 1GTUA 1S3AA 1A24A 3HA9A 2QGVA 2DC5A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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