3PJ8A

Structure of cdk2 in complex with a pyrazolo[4,3-d]pyrimidine bioisostere of roscovitine.
Total Genus 79
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
79
sequence length
299
structure length
288
Chain Sequence
GMENFQKVEKIGEGTYGVVYKARNKLTGEVVALKKIRETEGVPSTAIREISLLKELNHPNIVKLLDVIHTENKLYLVFEFLHQDLKKFMDASALTGIPLPLIKSYLFQLLQGLAFCHSHRVLHRDLKPQNLLINTEGAIKLADFGLARAFGVVVTLWYRAPEILLGCKYYSTAVDIWSLGCIFAEMVTRRALFPGDSEIDQLFRIFRTLGTPDEVVWPGVTSMPDYKPSFPKWARQDFSKVVPPLDEDGRSLLSQMLHYDPNKRISAKAALAHPFFQDVTKPVPHLRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
molecule keywords Cell division protein kinase 2
publication title Pyrazolo[4,3-d]pyrimidine Bioisostere of Roscovitine: Evaluation of a Novel Selective Inhibitor of Cyclin-Dependent Kinases with Antiproliferative Activity.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 79
structure length 288
sequence length 299
ec nomenclature ec 2.7.11.22: Cyclin-dependent kinase.
pdb deposition date 2010-11-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3pj8A02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3pj8A01
3MVHA 2BHEA 3F69A 5IMXA 1BL6A 1GJOA 3FMLA 5ANDA 2O63A 3HNGA 5EFQA 4BKYA 4CLJA 5AV0A 4O0YA 3AXWA 4P5QA 4CFNA 5CS6A 4DC2A 1GIJA 2GS7A 5CTPA 2RIOA 3WF7A 4A7CA 5IUGA 3VBTA 2OFVA 3R28A 1R78A 4BDAA 2XH5A 5M53A 2ZB0A 4QP6A 3UC4A 3G33A 3L9PA 3MS9A 4GUBA 4XV3A 4OT6A 4EHGA 3PUPA 3TV6A 4FSYA 3ZO4A 4FZ6A 4UZDA 3VBWA 3BWJA 2BFXA 4GFMA 3NNUA 4E7WA 4LUDA 2C6OA 4RIWA 4H58A 4LOOA 5FUTA 5LOHA 4XBUA 3COHA 4XBRA 3S3IA 3IGOA 2BRMA 2YIYA 1XH7A 1ZOGA 2GNGA 3FLWA 3PXKA 4C0TA 4BY9E 3ZSHA 4AT3A 4DA5A 3NS9A 3UMWA 2EB2A 3NYNA 3R8UA 4QMPA 4IIRA 4O7YA 3EB0A 3SQQA 4QTBA 2OJ9A 4R6VA 3PZEA 4R1YA 2VWYA 1LEZA 2BAKA 3VBVA 3DNEA 3BHHA 4QYHA 2OSCA 1F3MC 4JQ7A 4HJOA 4O6LA 1PKGA 2PY3A 2WQNA 3EKKA 4L3LA 1YXTA 3VJOA 5BVFA 5IMEA 1FVTA 2P55A 5IDNA 1A06A 4MH7A 5CSXA 2B9HA 4E8AA 3OCTA 4Z3VA 3KXXA 3P78A 4LG4A 2ITWA 4TN6A 5ANKA 4FVPA 3ROCA 2OXXA 4FV8A 2WMBA 5LQFA 3V5QA 2QCSA 1DI9A 3RAIA 1Q5KA 3SOCA 5I9ZA 4CYJA 4XP0A 3NVKI 2PHKA 5IU2A 4QMVA 1FOTA 5HVJA 4ZJJA 3ZLYA 4AGDA 3QWKA 4M3QA 3MY0A 2HZ4A 3E7OA 3R04A 4ASEA 2HAKA 4BDJA 5C8KA 2R9SA 5FP5A 4AT4A 4ZY5A 2H8HA 5BVOA 2J2IB 4W4YA 3F5PA 1BX6A 2BDFA 1ZYSA 4FZFB 3KCFA 3PXYA 4FKQA 1KE7A 2UZVA 3ZMMA 1GIHA 4FTTA 3LLTA 1MP8A 2XVDA 1W84A 1NVRA 5IEVA 3QRTA 4NM3A 5A4QA 3NYVA 3VS7A 4FIGA 4EBVA 4FEXA 1O6KA 3R9HA 3V8WA 3E92A 4YBJA 3U55A 4I6QA 3FZRA 2W1CA 1SYKA 2YM8A 1VR2A 1ZAOA 1OITA 4APCA 3KF4A 1F5QA 5ANOA 2B7AA 3EIDA 2OO8X 2O64A 4MTAA 1Q8WA 1XHAA 2XZSA 5TR6A 4AAAA 5HX8A 4HCTA 4MXZA 3UNKA 2UZDA 2PE2A 1U4DA 4I6BA 1TKIA 4FICA 4G9CA 2HXQA 5L3AA 2Z8CA 1CTPE 2WZJA 2GMXA 4JBQA 3G15A 2WMTA 3DOGA 4R5YA 4M68A 2DS1A 2WQEA 4HVGA 4FGRA 4C3RA 2XIKA 3GU5A 4C59A 4D55A 4DFBA 3WI6A 2R3FA 4RVMA 4FKPA 1ZY5A 3HV7A 4PP9A 4Z9LA 4EHZA 5K0KA 3ZYAA 5AX3A 5K4JA 3FY2A 3TKIA 4PTEA 2I0HA 4J7BA 3KMMA 1JQHA 4DGNA 3LZBA 4RT7A 3WZKA 4M0ZA 1RQQA 4YJTA 5C03A 1DAYA 4L67A 4NK9A 2G1TA 3PP1A 5KBQA 4OTDA 3BBWA 2RL5A 1H25A 2VV9A 3LFNA 2WEVA 4IZ5A 3HP2A 3A7GA 2VGPA 4TZRA 3VF8A 4JXFA 3ZC5A 4WNKA 2C69A 1Q8ZA 5CY3A 3UP2A 2XEZA 3DLZA 3ATSA 4FKJA 4CMOA 3R00A 4IM0A 4ZLOA 1E9HA 5JZNA 3LM0A 3F5UA 5CU6A 5CAOA 3S0OA 3ELJA 4XMOA 3ZOSA 2RFSA 5TE0A 3VQUA 3RGFA 2HXLA 1WCCA 4GT4A 2BPMA 4ORKA 3UZPA 2YM5A 4HOKA 4Y95A 3FQSA 4ZLYA 5IDPA 3TM0A 3OWLA 4RC4A 5M44A 1M2PA 4FL1A 2UZBA 4DHFA 4DFYA 5IQCA 3RNIA 3L9MA 3OCSA 3EMGA 4Q5HA 3C0IA 3PXZA 2R3MA 3IW4A 4WNMA 3C7QA 5CX9A 4I23A 4U3YA 4QMNA 5E90A 4UN0C 3ROYA 3F61A 1YRPA 4FV3A 4FF8A 4XNEA 5AR3A 4FT3A 3Q53A 4F4PA 3CGOA 3EZRA 2Q0BA 2YIXA 3HMNA 2OXYA 1REKA 4USFA 3KXZA 4R78A 1JKSA 2VAGA 3COIA 4M69A 2BDWA 4AGWA 5AAEA 3PSDA 4AOIA 3OC1A 4CV8A 2IG7A 2CKEA 2G01A 4O2ZA 3VUKA 5AP3A 3BBTB 3LMHA 2CHLA 3H9FA 3KC3A 4MHAA 3NIZA 4XOZA 5L2WA 3LW0A 3Q9WA 5FD2A 1OIUA 2GNIA 3B8RA 2PL0A 2XCHA 3L9NA 4BCFA 4JX3A 4BR3A 4FNXA 4M12A 5DLSA 3R8ZA 4O82A 1KV2A 4LL5A 3TZMA 3U6JA 4HPTE 4TYJA 3RWPA 2B55A 5IA3A 4RVTA 3UODA 1FGKA 4O7LA 1Q41A 4BC6A 1SMHA 3TKHA 3D5VA 2YLEA 2W1FA 3HAVA 2QOFA 4RZVA 3PA3A 4ZLZA 5HBEA 5CQWA 5E8SA 1UU8A 3RM6A 3MVJA 4FZAB 3AC4A 2VWUA 2UW8A 3C51A 3HKOA 4ANSA 3QQFA 3VNTA 3HA8A 5L8LA 1NXKA 2F57A 3MY1A 4IAZA 2NP8A 4KWPA 1UWJA 4PRJA 4UY9A 3P08A 4K9YA 2V22A 2RG5A 4ZTNA 3RAKA 3W55A 5FQDC 2BAQA 3DAKA 2GHLA 1PXOA 3UTOA 1GAGA 1U5RA 1H0WA 4TL0A 3VRZA 4ZXTA 2UZOA 4ZTSA 3BWFA 3ZRMA 4EH6A 2JIIA 2VZ6A 3NIEA 3LIJA 2IVVA 2VTAA 2W96B 4DGOA 2IVSA 3D9VA 4ACHA 4F6WA 5BQ0A 3UYSA 3TTJA 3S00A 3HX4A 4DH5A 3IOPA 3B8QA 4R8QA 4U7ZA 4M7IA 2JFLA 2ZV2A 4GW8A 3PSBA 3BHYA 3C0HA 5AUVA 4AE6A 4F1MA 4LMUA 3LJ2A 3OWPA 4RLKA 4GS6A 3EHAA 4FKRA 3BPRA 4IBMA 4W8EA 3EFJA 3DKFA 4OBOA 3WE8A 2OZAB 4XP3A 4ERKA 4FTUA 4EOIA 2DWBA 2ZYBA 2C6DA 2F2CB 2JDSA 2W1IA 3HMPA 3HRBA 3O0GA 3CJFA 3ORZA 4I22A 1GOLA 4EH2A 4C4FA 4TY1A 5BUEA 4DE4A 3JR1A 2YM7A 3R71A 2VD5A 3ZRLA 5IQEA 1JBPE 1YXVA 5HIBA 4L7SA 2PZIA 2XJ2A 4FC0A 3AC2A 5AIKA 5I9UA 5IQIA 1Q3DA 3NRMA 1M14A 4RC2A 1Z57A 2YCSA 2ZDTA 4NT4A 5HHWA 3MIYA 4TYHA 3R8PA 1JLUE 4O27B 4EOJA 2ITQA 3OUNB 2WELA 2YCFA 3E63A 4UMUA 1WBVA 2JFMA 3UZRA 2XKFA 4ENYA 4V0GB 3NUAA 4PX6A 1UNGA 2ITOA 4J8MA 4JX7A 3PE2A 3KK9A 4QQTA 3TNIA 3QL8A 1YDRE 4ZS0A 4BTJA 3QQJA 4ANMA 4U81A 2C5YA 4KIPA 3QRUA 1Y6BA 3G0EA 2ONLA 3PVUA 5D12A 3OOGA 3CR0A 2WQMA 1Q61A 5TOZA 4NJ3A 4ALUA 3PJ8A 5HE1A 4PMPA 1O6LA 3MWUA 5ANJA 5I4NA 4I0TA 3VN9A 3FYJX 5E8WA 1V0OA 4UALA 5BPYA 5CZHA 3CSVA 3FI4A 3E93A 3PP0A 4FKOA 4M13A 3AC8A 4XS2A 3BIZA 4FODA 2VO7A 3DBCA 4YP8A 4EH8A 4EL9A 2YIRA 2XIXA 5CF8A 4RZWA 3RP9A 1H1WA 4DH1A 4WNOA 1B38A 3BZ3A 3OP5A 5AP1A 4IANA 2QLQA 4WBBB 3KGAA 4DEHA 4IACA 3DDQA 3DZQA 2IPXA 3Q9ZA 2HYYA 4G5PA 2R3OA 2B9JA 2X0GA 5L8JA 3SRVB 1JKKA 4HYUA 4XJ0A 3IW7A 5CEIA 1JSVA 4RX7A 1U54B 2CCIA 4J1RA 1UNLA 3BU5A 4KKHA 4ACGA 3GBZA 3KRXA 4J96A 3MTLA 4EEVA 3VHKA 3CKWA 1OM1A 3BHUA 3F7ZA 4KKGA 5AUWA 3TL8A 3K5VA 4BWXA 4QP9A 4G3CA 4FOBA 1FGIA 1HCKA 3ZFMA 2X7OA 5IQAA 3CD8A 1ERKA 3LQ5A 3HYHA 3OXIA 4AZSA 2IZTA 5D7VA 5I3RA 5KMIA 4TPTA 4DFXE 5IEYA 4D1ZA 2JAVA 4AN2A 2F7EE 4I0RA 4JBPA 3QCSA 4BZDA 4CFXA 4EORA 5HG9A 4IX4A 5CI7A 2YFXA 5AX9A 3MW1A 3L8PA 2VTOA 4B99A 2CNUA 1KE9A 3C4FA 4J99A 4K18A 2QODA 3IW5A 1H24A 3NAXA 1JAMA 4AZTA 5KUPA 1YWNA 4EK6A 5M51A 4GU9A 1VEBA 3ET7A 3MH2A 3W2PA 1WMKA 3SG9A 4PL5A 5L6WL 4IVDA 2J5FA 4BZNA 3NYOA 2W9FB 3U51A 2W1DA 2X2LA 5DT3A 2CLXA 3BE2A 2ZMDA 4BCQA 4C33A 4MWIA 3RTPA 4X2FA 5G6VA 1PRYA 4C58A 5AP5A 5IA5A 4GYGA 3BQCA 3ULIA 5A6OA 3F66A 3Q3BA 2XEYA 4R5SA 2IVTA 2W1GA 4ZTMA 3Q2JA 2OH0E 5GJGA 1YWVA 4M67A 5AP7A 4RGJA 4G6NA 1YOMA 4UYAA 2H9VA 2BZIB 3V8SA 2OJJA 5DVRA 5AUYA 4FG7A 3A60A 5IH5A 2BALA 5BYLA 5M55A 2G2IA 3KMWA 1CMKE 1PJKA 2VTSA 4WRSA 5IF1A 5E8ZA 4IX6A 5KZIA 1OL6A 1J7IA 1JKLA 3BKBA 3GFWA 2AUHA 3VUHA 2YJSA 3FHRA 3NW7A 2C6MA 5C4LA 3FC2A 4WRGA 5C8NA 3KRRA 3LFDA 3AC1A 4XV2A 4Y5HA 1ZZ2A 3DQXA 2HWPA 5L2TA 5EDRA 4FTMA 2WMQA 3GC0A 4AP7A 3DJ5A 3OXZA 3LXKA 4OLIA 3GU7A 3VHEA 5TF9A 3A8XA 4EK5A 1YOJA 1FVVA 1Q8YA 3LCKA 4M66A 4PDSA 4C2WA 2BVAA 1H28A 4B8MA 3LE6A 4NU1A 3A2CA 4RX9A 3I1AA 3MVMA 4BRXA 2OJGA 4JS8A 1NW1A 4GKHA 1KOBA 3GCUA 1URCA 2XA4A 5EW9A 3ZZEA 1OL7A 4L68A 4WD5A 3DLSA 4K2RA 4QTDA 3QTUA 4FK6A 4WKQA 5EYCA 2JIVA 3AMBA 3BYUA 3FZPA 4L53A 1OKYA 1H27A 3R9DA 4BWKA 4X2NA 1XH4A 3W1FA 4AFJA 4X2GA 4DEEA 1FQ1B 4DH8A 4QP2A 3G0FA 5LVMA 2KTYA 2OZOA 3E64A 1JNKA 1GNGA 2WOTA 5FXSA 3VS5A 3WF9A 4DCAA 2GNFA 4QMLA 4E3CA 3Q4CA 2YN8A 4YTHA 1PMEA 3GCPA 5HESA 4PF4A 4JAIA 3UOHA 1OECA 3KU2A 4CSVA 5BNJA 2V0DA 3VW6A 4FIFA 3RBWA 2X9FA 3TIZA 2FH9A 4EC9A 5HORA 1LEWA 3RI1A 3ZU7A 4D4RA 3DBEA 3PIYA 2EUFB 3Q2MA 2PWLA 3RZBA 4F0IA 5IG1A 3A99A 3G9LX 4UWBA 1ZYDA 1JKTA 4BKJA 3OTUA 3V6RA 3PFQA 2V5QA 4I1ZA 3VS6A 4E4XA 3Q6WA 4L9IA 1YHWA 3PIZA 2B52A 5AIRA 4G9RA 3FAAA 3HV3A 5LMAA 4IHPA 5DR6A 4F1TA 4USEA 4RA5A 4QQJA 4E5WA 2OU7A 4BBMA 1R0EA 5DMZA 4OTIA 1RE8A 3BYSA 3RK7A 4CXAA 4O0VA 4OTWA 4UZHA 4JAJA 3AD4A 4YBKA 3H0ZA 3FL4A 2XRWA 5L6PA 2B53A 4EOMA 4L3JA 3QYWA 4FG9A 1XH6A 1LPUA 4G34A 4QPAA 4QD6A 4NIFA 4L6QA 3BLHA 1OPLA 5BX0A 2WTJA 4J95A 2HW6A 3G6HA 4OBQA 3GOPA 2GQGA 3PTGA 1PXMA 4XH6A 4DH7A 4KBKA 3UG1A 4RFYA 4X3FB 3PXFA 2QR8A 1Q4LA 4QPMA 2ZJWA 3R02A 5GJFA 3CD3A 4D1SA 4S32A 2C3JA 4Y73A 3OCBA 4QYEA 3AGMA 1OKVA 2GS2A 3ZDIA 3UOKA 4CFMA 4ZSLA 2CN5A 4E4NA 3VBQA 4EBWA 2Y8OA 2YDIA 4ZZMA 2X9EA 3OVVA 3UYTA 2QONA 4O81A 3S1HA 1G3NA 2W4OA 1JOWB 4CCUA 4EC8A 4Y8DA 3FPMA 3MJ2A 3IECA 3OD6X 5FG8A 4W9WA 5KHXA 2XK8A 2E9VA 2R0UA 3ZS5A 4ZJIA 3E8DA 3VS3A 4GKIA 5C1QB 4IDVA 5E8XA 2YAKA 1PXKA 3ZLSA 5JT2A 3VBXA 5A4EA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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