3PTYA

Crystal structure of the c-terminal extracellular domain of mycobacterium tuberculosis embc
Total Genus 65
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
65
sequence length
333
structure length
284
Chain Sequence
SVGRSNLQALAGKTCGLAEDVLVELDPNAGMLAPVTAPLADALGAGLSEAFTPNGIPADVGTTAAPGINGSRARLPYNLDPARTPVLGSWRAGVQVPAMLRSGWYRLPTNEQRDRAPLLVVTAAGRFDSREVRLQWATDEQAAAGHHGGSMEFADVGAAPAWRNLRAPLSAIPSTATQVRLVADDQDLAPQHWIALTPPRIPRVRTLQNVVGAADPVFLDWLVGLAFPCQRPFGHQYGVDETPKWRILPDRITELLMRATTVASYLKDDWFRDWGALQRLTPYY
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title The C-Terminal Domain of the Arabinosyltransferase Mycobacterium tuberculosis EmbC Is a Lectin-Like Carbohydrate Binding Module.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
source organism Mycobacterium tuberculosis
molecule keywords Arabinosyltransferase C
total genus 65
structure length 284
sequence length 333
ec nomenclature ec 2.4.2.-:
pdb deposition date 2010-12-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF14896 Arabino_trans_C EmbC C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.940 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 3ptyA02
3.40.190.160 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 3ptyA01
3PTYA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4AEMA 4PFTA 1GP4A 3LA2A 3N35A 2NYYA 2GN7A 4WVVA 4UT5A 2B5HA 1WW6A 3VLUA 3WW1A 4GBWA 5A80A 3DV8A 4JRAA 2ZZVA 2DE3A 2W52A 5H8FB 3TEWA 2ZMBA 3Q8FA 2PHXA 3VFJA 4YM1A 2WS92 2RS11 1Q8QA 4HKLA 5FZ3A 2MEV3 4LKSA 2RC8A 1C4RA 2AEYA 5EV7A 4GJYA 3SEVA 2HWC1 2VTXJ 5A3UA 5GALA 1SLTA 3H8RA 2ZMLA 5F1QA 2Y7IA 3KV6A 4NE9A 4R72A 1TFAA 3GNEA 4RFRB 3ZYPA 3PNAA 3J8F3 3CG3A 2XWIA 4XIKA 1KDKA 5CBRA 3PPPA 2QS1A 3ATGA 3PJYA 2DFCA 2QQNA 2UURA 3MPPG 1LCFA 4UFHA 2Q2AA 3RPWA 4P1EA 2VXJA 5JTYB 2ES3A 3QACA 1D4VB 4ZKTB 4GX4A 3I2FA 4N6PA 4D6QA 1JHJA 3V5AA 2VMFA 4QGLA 1C8M3 1QEXA 1QJX3 4F39A 1W9FA 1OSGA 1RYOA 1RUC2 3CRBA 4JRLA 2DTWA 2JWPA 3K2OA 5FYBA 1GYKA 2WKYA 1CR7A 4LO8A 3I3MA 1J1TA 1MS3A 1S50A 3VD9A 4N91A 5A33A 3IX1A 3CLPA 3POSA 3WF1A 3ZIXA 1AJKA 5A32A 1EV11 3MGUA 4F22A 4BDRA 5JEIA 1IG3A 1EPZA 5A6ZA 1SLAA 5BNPB 3OEKA 3WNNA 3DXTA 4MHUA 5B7DA 1CB6A 3ZKLA 4LA3A 1QQP2 4IW3A 1BLFA 4QHOA 4FXKB 2BDRA 1M06G 3VBFC 4PHZA 3GXUA 3EF7A 4XCAA 5I0TA 4M0NA 5IKBA 1H1IA 3BIHA 4XJWA 4XAEA 4Q30B 1JEUA 4G8HA 4CP9A 1X36A 2Q30A 1N76A 4JSDA 1LBWA 2VECA 4AHWA 3MPLA 5BUUA 3BKIB 2VMCA 3VN4A 1W2NA 4PFYA 4XBQA 1JW1A 1FATA 3MIHA 3KSCA 1A7LA 2VE1A 2A5TA 5JIUA 1OI6A 4XURA 5H9QA 4HPKA 4Y33A 3I8TA 2Z5WA 4Q4Y3 4G3YC 4ZHNA 3LSDA 1OFSA 2RE9A 4DXTA 3MV11 4AR2A 1DGWA 3OYWA 2GAUA 2WO2A 2FVZA 2ONRA 1TG7A 4AFCA 5FYHA 4IEYA 4NIIA 5AC93 4UACA 3E6DA 4HFSA 3TYHA 3MI8A 4G68A 3ZKKA 5GLZA 3H4ZA 3M3OA 1N1VA 3KV4A 5ABJB 1HW5A 3ZMNA 4NF6A 2YROA 1WZXA 2WUHA 1SQ4A 2VP1A 4ASMB 1Y1ZA 2WBKA 4UXAA 3ZFEB 1R1NA 1SLLA 1Y3NA 4XILA 4GXSB 4QQLA 4LK6A 1TFDA 4Q1PA 1G9BA 1OA2A 2VBDA 3RLFE 4AGRA 4FVVA 2Q8CA 4GB33 3H8UA 3WV6A 2PLV2 4P9WA 2DFBA 2D43A 3FVKA 4EF1A 4N15A 3C32A 1VBE1 4AOCA 4IEQA 3ACGA 4NF8A 3T9UA 3FHIB 4CEYB 2LAOA 1TZOA 3PVBB 2CAVA 4CEWB 3ZFGC 3S7IA 2HEUA 1FPDA 3B01A 5DZFA 1QUIA 4B4PA 2P3JA 4HE1A 3J7HA 3K00A 1AXZA 1NA1A 5FZ1A 2AL4A 3A09A 2OXBA 4I62A 2XLFA 2G9FA 4C0HA 2RR11 5JSOA 1OVSA 4QX2A 4UBHA 1MQIA 1MXWA 1OHFA 1LHWA 2DWIA 4LO5B 1RUG1 1JMUB 5SV8A 1U5ZA 4QQOA 1M4WA 3IN9A 1PIV1 3FJMA 3K4UA 5B4NA 4BISA 3ORJA 2Y84A 4MNCA 5F24A 2OA2A 4RHV1 4QD2A 2XPJA 3PGFA 2FDKA 3B7DA 4F3PA 4XFGA 5L9BA 4Z2AA 2ET1A 4IGTA 4LQ2A 4OQ8A 2QVRA 2Q89A 2WC2A 3THCA 4PP0A 1XNCA 5GZFA 4O7MA 2X5IB 2V73A 1N47A 3B5LB 2ZXTA 5I2NA 4N81A 3GBWA 1NZIA 5GZEA 3EHKA 3P3NA 3AXFA 4CDUA 1YFUA 1A3KA 2G29A 4PE3A 2W91A 3OY8A 2C9AA 2CZLA 3PMEA 4UYBA 5FY7A 2XXTA 1D4M3 4I3PA 1UYPA 4EYUA 1GZWB 4MHRA 3UYJA 4NAOA 5I3SA 4YICA 5J36A 1P8JA 3N9OA 3ILTB 1QH6A 1MS5A 2A6ZA 3KC1A 1DFQA 2C1FA 2XXZA 4I8CA 1PM4A 5BNQA 2VBBA 4JGYB 2UYAA 1LGCA 4P9GA 4M00A 3TQWA 2CZHA 1ZA4A 2WO7A 1DQ5A 3LPGA 4H7LA 5FV3A 1W8NA 4C8DA 3M1HA 3VBHA 2GP3A 1YNAA 3CJXA 3FIRA 4GWWA 4WVMB 1NV0A 5JOZA 3LUZA 1UKRA 4ELRA 5EYXA 4O3AA 3U93A 4Y20A 5L19A 2QS2A 2ZMNA 3MWBA 1AYN1 2R071 5C71A 3R26A 5B4XA 4IV3C 5A5XB 3UGHA 1NUKA 2WQ4A 4JX0A 4NUBA 2NPIA 1DQ0A 4GH4A 1PNFA 3K48A 1AHSA 4Q4W2 4DZ1A 3C7HA 3UKNA 4IO2A 2HFBA 3NNGA 4LIUA 1XI6A 4POXA 1RHI1 4I40A 1LKNA 4L2NA 2GC1A 3FUOA 1LOBA 5BPXA 3A29A 3VVDA 2F6BA 4Y26A 3SEXA 4MEVA 2P3IA 1LR5A 1A8EA 3QCWA 3NNMA 3OUIA 2J1EA 4N53B 3CBNA 4MADA 3OPWA 3FVOA 1RUE1 3IR1A 1W8UA 4GZ9A 3TEZA 1C5HA 2WINB 3VVFA 2VTFA 5DMYA 3ZR5A 5CNAA 5L9OA 1R9LA 4H46A 1A8FA 2ID4A 4XJ8A 3PD8A 1ZU0A 3TN91 1S2BA 2TEPA 2PA7A 4F2OA 4LBLA 4COUA 1XNDA 1UIJA 3DXUA 4U1ZA 4JVCA 3DPRC 3SDFA 1ST8A 2IXJA 2ZGTA 2PX1A 3WW4A 4PE5B 4H5FA 2BU9A 2ZZQA 4OFGA 5F5QA 3VBSB 2EXJA 4XQWA 4QX8A 1OH3A 3LSXA 1VB4A 4OFLA 3LFMA 3MHZA 1DQ1A 3N9MA 3QMFA 4WVWA 3K46A 4LBQD 3TCFA 4BLAA 2LRPA 1H9PA 4QFKA 3JCIA 1M5DA 1W03A 2Y6LA 4DCYA 1RUI3 1W9YA 3ZSFA 1ASJ2 4YVWB 1JYVA 4FTBA 3VBRA 3BOWA 4WEDA 4C1XA 2ABHA 4C91A 5EQ8A 2RS13 4AGVA 5BNNC 3OGVA 2G1MA 1Y3PA 1QIQA 3MPBA 2JB8A 4GL0A 3NWKA 1QJY1 1CAVB 4K8RB 4DLDA 4AVSA 1UWWA 5DG1A 2JDUA 5JR2A 1O4ZA 4PIZA 1LB2A 2J1UA 4L8QA 1FQCA 1GU3A 1NUZA 3ZYBA 3POEA 4FPLA 4FAGA 5JSRA 4K9SA 2AUYA 3OEBA 3OBAA 3OENA 3TMGA 1RXGA 1MY3A 5I0RA 2HEYF 4GFRA 5L36A 4WEPA 3GBAA 3EXUA 2V5YA 1Y9GA 3PMSA 5DDJ2 5H8FA 4XUTA 4DFSA 2I49A 1HJGA 4QPGC 3IIAA 4XUNA 1IG0A 2GC3A 1RDXA 4KQPA 4OVEA 4H6DA 1SZBA 2XVGA 5IYYA 4LOTA 4MNIA 3LOBA 2RM22 5APAA 2VHAA 1RVF2 2WO1A 1NX9A 1AL21 4FPGA 2D6MA 5DAVA 5EWSA 5CKNA 4NF0A 4XFEA 2ZHLA 3D6EA 2JENA 2AZ5A 1XU1A 3H6UA 3FMGA 4QGMA 4XJAA 1FW0A 4QXDA 1J83A 4HTGA 1PB9A 3H9AA 4HE2A 1FBPA 2D98A 2VMEA 5LRSA 2VOXA 1R9QA 2GHAA 5BWJA 5K4LA 2Y26A 1YPNA 5HBAA 3UP9A 1FX5A 2Y7WA 4N8MA 5IVVA 4A7YA 4XFFA 2F6PA 1VBB2 1Y3QA 3OF1A 3LKJA 1NFTA 3DF0A 1FMD2 4Y4YA 3RJ2X 2FIXA 2EAAA 3KLSA 2VC9A 4FFFA 4LTAA 3M3IA 2Z8EA 4BQWA 4PQQA 5HCFA 1JYWA 3T1BA 1GFF2 1SI1A 4YG0A 4PDWC 2GMEA 3W9VA 3WG1A 4HONA 2G9GA 5IK7A 4LR4A 1B40A 3GM8A 2XH6A 1H2NA 5FKCA 5BNPA 2QL3A 4DIQA 4JV4A 2DE4A 4D8MA 1QVSA 2R16A 2RMU2 4K1YA 3MW4A 5H8SA 1GVCA 1VMFA 3ST7A 5EP9A 5CBSA 1HV1A 1WCDJ 3RWKX 5C3PA 4CCKA 3HN1A 2DTYA 2QQUA 1ULEA 3ONMA 5D2AA 1MDP1 4I2OA 3SC7X 2KR2A 3VDCA 4LZ8A 2QQKA 5FY5A 3W15C 1ANFA 4Q2FA 4O3CA 2HWB1 1AXYA 1UYYA 1HKDA 1NT0A 3PU8A 1V0AA 3DCQA 3OB8A 3PVNA 1QJFA 2REJA 2O14A 1ACCA 2E33A 3PUIA 3FLRA 1AR81 2VZTA 5JPMB 4MGZE 3CFLA 1MS7A 2R32A 4RL7A 1EAH1 1VBE3 2CU5A 2GZWA 3GBBA 4XKQA 1B4ZA 3FLTA 4OANA 3KD4A 2D6KA 3TAYA 3L6HA 3KN3A 1SLCA 2LALA 3R6SA 4HKWA 2HWE2 4YARA 3M2MA 3THTA 5ABJA 1PC3A 1YZ0A 4D3WA 4GMP1 2XXKA 3RT6B 4IEUA 4R9GA 1VAVA 3VDBA 1J59A 3ZFEA 1JHNA 5JSPA 4PCRA 3HR9A 4B29A 2UU8A 5FZMA 3EPEA 5FPVA 1MXVA 2ZHMA 1VMJA 2VPNA 4LHSA 3TZAA 4EROA 3VUOA 3MDPA 1VFDA 1VRH2 2DURA 4IEWA 2EICA 2XA5A 1AX0A 4YRDA 5TP9B 3H3UA 4P47A 4XETA 3WHTA 4K21A 3URFA 4CEYA 2Y0IA 1XYOA 4F3GA 5EQUA 2AH2A 4FPEA 1HRI2 4CEWA 2XONA 4UFMA 1B32A 2JXAA 4OI2A 5LA9A 4IV1C 5FPAA 1LEMA 3QH7A 3MF9A 1UAIA 1PVC2 1SPPB 4KCCA 1MQDA 1ZBA2 2ZOEB 3RT8A 2W2IA 2I48A 4Z92B 1SCSA 2P3KA 2QUOA 2QQPA 4XABA 3OSRA 5JXHA 1PO12 5JVVA 4AI0A 1LJ7A 4FO9A 1ZNPA 1OUSA 1W6QB 2K2SA 2I45A 4NMIA 3SKVA 4LZ7A 4BZ4A 4NQ8A 2ZHNA 1WMFA 5FY1A 4C1UA 3UIFA 3T4HB 2X5IA 1AR73 1NV3A 4OVTA 4M3CB 3E5XA 1VIWB 4Q4W3 5KXEA 3IAQA 3M7AA 2WFPA 1EZOA 5FP7A 2W68A 4YGEA 2CTVA 1JUIA 2ZEZA 3WNOA 1OVTA 3UGWA 1AYN3 2DCTA 2VNVA 1GZWA 2B9VA 3IB1A 2CL2A 3ZXKA 4BDQA 3POFA 3LDRA 3LDKA 4OVJA 1W9TA 4PAKA 1IHMA 1QMJA 1ND2C 4KGGA 1SMVA 3R4SA 1W0OA 1S0BA 1EP0A 3M3FA 5GLUA 4R6KA 1XNKA 1FTMA 3O2AA 3POGA 2CDOA 4V2VA 2GNBA 3S6PA 2IXIA 4ZU7A 1AZDA 4RFT0 3C7OA 1QUJA 2CNAA 2WS91 3U07A 2VAUA 3KEIA 5FREA 2HBUA 5E1RA 1N04A 3E4RA 4WVMA 1Y4WA 1GSLA 4KL1A 3BIGA 1B6HA 1K9ZA 1IXGA 3TTKA 4X8PA 3ALQA 4GIZA 3MIGA 3N9PA 2VU9A 1G9FA 3VDFA 1QY4A 3O0XA 4DINB 1J3QA 5JMCA 4R74A 4DXRA 3I2KA 5A5XA 4GWJA 4FATA 4LOSA 4TTGA 4XTPA 4EN9B 4G77A 1YJKA 3SCFA 4PGNA 5FP9A 1Y7BA 4N07A 1LAJA 2FDHA 1SYHA 2VUJA 3WHUA 4FEDA 4XF5A 1PB7A 1DGWX 2YFUA 4QBAA 3WX5A 1MEC1 4OHVA 2H99A 3OD0A 2EXKA 1RUC1 3LPFA 1Y3TA 4IEOA 3QD6A 2H98A 3KN8A 2HAVA 4N53A 4R9BA 4NO4A 4EXLA 5FXVA 2X10A 1QDOA 1RUF3 3MZ1A 3E5UA 2OQ7A 1X33A 2R49A 1PZ9A 3EB7A 1NUWA 5FMBA 4C1WA 4QM8A 2XL7A 4GQOA 3AMMA 2VCCA 2RDNA 3A0KA 2A73B 1S0CA 2FDJA 1QQP1 5DDJ3 2HKXA 1JYCA 4LPLA 4ZU4A 2V3UA 4Q4V2 4MGYE 4QM9A 1R092 3TNQA 3QAXA 1NOVA 1LFGA 4ZZAA 5IJRA 4H1XA 4RGAA 3RZKA 3B93A 4XJZA 2KR0A 1E5SA 2RM23 4QQ2A 2BNOA 1PM7A 1PGL2 1LOFA 1N7WA 4IXLA 2PMSA 3P1IA 2BOJA 2Q1FA 4WZFA 4YVWA 5FZAA 5C4WC 1IIWA 2R0FA 1SFPA 4ZE8A 4XUPA 4UF0B 4C1TA 2CGPA 1Q43A 2XXIA 5FO8B 1IMAA 1NQJA 4UWDA 1C1FA 1FPGA 5CISA 4XQ4A 1LODA 3BODA 1CAVA 2XOMA 5FO9B 1NV7A 3ZFFC 2R043 4YW2A 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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