3PUVE

Crystal structure of an outward-facing mbp-maltose transporter complex bound to adp-vo4
Total Genus 114
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
114
sequence length
374
structure length
374
Chain Sequence
KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTRITKASAS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Snapshots of the maltose transporter during ATP hydrolysis.
pubmed doi rcsb
molecule tags Hydrolase/transport protein
source organism Escherichia coli
molecule keywords Maltose-binding periplasmic protein
total genus 114
structure length 374
sequence length 374
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-12-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
E PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3puvE02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3puvE01
4Q8RA 4GVOA 3K01A 2NOOA 4OXVA 3O29A 1GTKA 2PX1A 3HO7A 3EHSA 3O9PA 4G68B 2D21A 4ZZAA 2O7IA 3N6UA 4FECA 1B5JA 3QXMA 2QS2A 1POY1 3IJOB 5JTYB 1MS7A 1B0HA 3L6GA 3OO6A 4LVQA 4FATA 5EYFA 3T96B 3IJXB 4KHZE 3KJTA 3WAFA 2F35A 3RQTA 5B7DA 1Y9UA 2DYXA 3K6VA 5TP9A 1MQJA 1XHYA 5I59B 4R6YA 1CE2A 4YMAA 1URGA 4PFYA 3C31A 5HM4B 4OETA 1MM6A 4XKQA 4OHNA 2V3QA 2CMOA 2F7CA 4U1ZA 2V84A 5I2KA 4XXUA 4YB7A 5I2NA 1USYH 2X7PA 2DWHA 5TU0A 3IOUA 3V5AA 4TOZA 3E3KA 3K1PA 1SI0A 1NH7A 1GV8A 3VE1B 1Z7NE 3RY3A 5A5XA 3FV2A 2LAOA 3PMWA 4OYVA 1PBQA 4GD5A 1PB9A 2RF1A 1JETA 1IXHA 1FQFA 4ZECA 3FVKA 2XXRA 1YAEA 4PP0A 3RT8A 5H8HA 3WAEA 5I57B 1MY3A 2PMSA 1TFDA 4POXA 3S9EA 4YZZA 1B4HA 4E0XA 1B5IA 3PPNA 3KBRA 2VOZA 1SBPA 3CR9A 4P11A 1PEBA 2AL4A 2WKYA 5ELVA 5B70A 2XD3A 1MDQA 1BTJA 3U1OA 2YLNA 5DTBA 2QL3A 3FUZA 3QIMA 3TMGA 4M4GA 1UTBB 4H65A 3M3KA 4LZ7A 2DP8A 4IGRA 3PUXE 4PETA 1MDP1 2ZYOA 4R74A 1O63A 5L9OA 3V89B 3MUQA 3IK6B 2XXVA 3U8QA 4KYEA 4BDLA 3MVZA 2DWJA 1YTVA 3AXFA 3S9LC 1B3GA 4ZEDA 3C32A 2Q88A 3S2VA 2OWTA 2H99A 3FJMA 4ND9A 3GXAA 1M5CA 4F2QA 1KWHA 2Y7PA 2F78A 5LOMA 1QUKA 4G8HA 3H7MA 3FATA 2Z8FA 3QAXA 3CG1A 1B0LA 5H8FB 2AIXA 5KDTA 1N7WA 4IB2A 3ZKKA 1SW4A 1IIWA 1A99A 2NXOA 4H8JA 2H98A 1II5A 1S7YA 2ONSA 3KSXA 4NF5A 3IB1A 3DP8A 2Y7KA 2ZYNA 3C9HA 5I58B 1FTOA 4R2FA 4NF6B 1MQDA 4U21A 1LAGE 3RUMA 2QS3A 3TKDA 1ZBMA 2G29A 3PUYE 1I6QA 4NWDA 1NMUA 4F1YA 3W9VA 1S50A 1Q1KA 4MLQA 3FZVA 4KI0E 4R2BA 4N6PA 1A8EA 4HS7A 2A5TA 2Y7RA 3FV1A 2HFBA 3K2DA 2O84X 1PC3A 4PE5B 4YU0A 3V83A 1B7UA 4RA1A 3KN7A 2P2AA 1PDAA 1B7HA 4ZEIA 4EDPA 3FVNA 3SKPA 3IAZA 2H25A 4G2ZA 1SYIA 1FTJA 2HAUA 1B58A 3QSLA 4ESXA 3SEYA 1MM7A 2XXIA 3LSFB 1HSJA 3TYHA 2ONKE 3R7XA 1MY0A 3T9HB 2E1SA 2HQ0A 3TQWA 4LQ2A 4BDRA 2ZXTA 4GOTA 2DE2A 2OJTA 1SD3A 4JBZA 4F3SA 3LBSA 1WVJA 4DCYA 3I6VA 3EPEA 3PUWE 1B3HA 1GVCA 3T93B 3MAMA 2V93A 4NF8A 3VVEA 4YKKA 1PB8A 2V3UA 2QMXA 1QVSA 1UIUA 1JEUA 4GXSB 1FQAA 3S9MC 3TDJA 5AE4A 4EQ9A 3B6TA 4FE8A 5F1QA 2HEUA 1QKAA 4BDOA 1DOTA 5TPAB 4FIMA 1UQWA 5AA2A 4O3CA 2AYSA 3THIA 3JV9A 1AOVA 3H03A 2ABHA 4H1XA 4H5GA 4EUOA 3VLUA 4U2RA 5DVFA 4F2OA 4KYSA 1OVBA 3SEXA 2O7UA 3OOAA 2DWAA 4YB6A 5AA1A 1Q35A 2Y7IA 3FIRA 3GBAA 4ZS9A 1B3EA 4GL8A 1US4A 1M5EA 2F6PA 1Y1MA 4NWCA 2DOJA 2VD3A 2O68A 3SEWA 4OENA 5CRYA 1LAFE 3MVYA 2F8DA 3KOSA 2B3FA 4NF4A 1FTLA 2I0CA 2F7BA 3T9XB 1POTA 1S9TA 4ZEBA 1B9JA 3KN8A 2UYEA 1MXXA 4U22A 1JW4A 1R1NA 4H6DA 2FNCA 1T0KA 3MBPA 3MP1A 1MXYA 3CRBA 1MY2A 1PB7A 3SEUA 3IB2A 2I4CA 1LB9A 3PPQA 1XOCA 4HCYA 2RKMA 3HHFA 3K6UA 1NNPA 4P0IA 5DEXA 4GL0A 2P0SA 4WXJA 3PPOA 5H8QA 3ILTB 4XKPA 1L5TA 4IO7A 4L17A 1BP5A 1FW0A 4YKPA 5AA4A 2GHAA 1XVXA 1EZ9A 2VGQA 5L9SA 1AH5A 2Z22A 3FJGA 3RLFE 1JVXA 4OFLA 4O3BA 4QSDA 4OMBA 1Y3QA 2I3WA 1M5DA 3KFMA 1GR2A 4GXAA 3OSRA 4FORA 4JSDA 3GZGA 1YPNA 2I3VA 3CVGA 2DE4A 1ZIUA 3TZAA 5KCJA 4GRKA 4F3PA 3SERA 1N3WA 5CBSA 1UTHA 3RT6B 1IXCA 3O66A 4ISUA 2QMWA 5I2KB 3N26A 3LSWA 1Y20A 2DQVA 3W15C 4KR5A 1EZOA 3JYRA 3TQLA 1OVTA 1TWYA 2RCBA 3A3UA 4G68A 4Q0CA 3O6IA 3Q26A 2Z8DA 3UIFA 4X1BA 2O1MA 1B52A 4IO3A 2OCUA 3U92A 5J1DA 5JTYA 3KEIA 4ELOA 4I1DA 5ISUA 3OXNA 1JW5A 3MPLA 2DVCA 2XXYA 3B6WA 3PMVA 2A5SA 4UACA 3Q28A 3SETA 1URSA 2I58A 5I59A 3ONMA 3TUSA 3DELB 1Y1ZA 5EHMA 1SW1A 4F18A 3IOVA 1N04A 3FJ7A 2KLFA 4ESWA 5BWJA 2PT2A 1LGBC 4KYDA 1D4NA 3TAJA 3R6UA 4M1VA 3MW0A 2Q8JA 4Z0IA 5ITPA 5KZTA 3RGYA 1PBPA 1BKAA 1DPPA 1H44A 1MQGA 2ANJA 2NUVA 3VXBA 1LCFA 5ICTA 4IO2A 2F5XA 1XS5A 1US5A 3CFLA 2E0SA 2QJEA 3TTRA 3BBRA 3OO9A 5I57A 4Q30B 1UIVA 2OWSA 4BDMA 1Y4CA 3ZSFA 1MXZA 2DWIA 3H6WA 4ELQA 2UYFA 1MRPA 1YCJA 4ZDMA 2F6GA 3UN6A 1SI1A 2H9BA 1QJMA 1QULA 1EZPA 1UTBA 4LONB 4JSOA 2CZLA 2VP1A 1FTKA 2FA7A 2RC9A 4DE8A 2THIA 4GFRA 2HAVA 2QS4A 1P99A 3G3IA 1AMFA 5CMKA 5KDTB 5ICQA 3TFLA 4G8NA 3B7DA 3RTFB 3TPAA 4FAJA 3OEKA 1MXWA 3T22A 1EH3A 4RJZA 2O51A 5H8SA 3PV0E 3UP9A 1A7LA 2ZYMA 4EF1A 3PUZE 1OIBA 2XXWA 3IX1A 2REGA 4XKRA 3T66A 3N94A 2ESNA 3D4GA 4EQBA 1DMBA 2W7YA 1J1NA 4FEBA 3UA8A 5FTIA 2ZNUA 3OO8A 3ODBA 2REJA 2PBWA 3IO6A 2XHDA 3U94A 1B40A 3T9VA 3E13X 1LSTA 4G4PA 1B1HA 1LCTA 2XXQA 1D9YA 2F34A 2D5WA 5EHSA 2Z23A 1WODA 3PMXA 4YICA 5H8FA 2Q89A 4F1UA 4TLLB 2ONRA 3CSGA 4QFLA 3MZ1A 2H4IA 2GFEA 1I69A 4RY1A 2UXAA 5I58A 5K2XA 4H67A 4I9DA 1A40A 1H43A 1OQHA 2I6EA 4PFWA 4QFOA 4POWA 5M2VA 1TXFA 3I5OA 4O3AA 1DSNA 4HTGA 1OMPA 1RKMA 3BKIB 3H6VA 2XX8A 4QF9A 3VLVA 4F3GA 2UVHA 4R73A 3BFTA 3LR1A 4KCCA 1IUDA 2R71A 1GGGA 3I3VA 4ZZEA 3S9NC 2UVIA 1P1QA 4ELPA 3G3HA 1LAXA 4JWYA 2QPQA 3TCGA 5HPQA 4AB6A 1B4ZA 3G3KA 2XXXA 3MWBA 4QRZA 1LFGA 3N6TA 2GRVA 2HZLA 3FGSA 3IORA 3OSQA 4MLVA 4XKNA 5FTHA 1NFTA 3PU5A 4U23A 3ZKLA 1LAHE 3FXRA 2Q2CA 2Z8EA 4PFUA 1I6AA 3K0VA 3A3CA 4G8MA 3VFJA 1D9VA 5CM6A 3TCHA 2DXYA 2V3TA 3Q25A 3U93A 5CMBA 3IR1A 1SW2A 3MVXA 4NF4B 4RK9A 1R9QA 3G3JA 4EQ7A 1JEVA 2RC8A 1EU8A 3SDFA 3C36A 4UA8A 4QFNA 5AA3A 5DYHA 5I56B 3OEMA 1FQBA 1MQIA 3L6HA 4GWOA 3DM0A 3IO4A 1B3LA 5TPAA 1LB8A 4QHQA 4LA9A 1FTMA 3K02A 3K6WA 4IO4A 4XTCQ 4AQ4A 3BFUA 1MG1A 4Q5TA 5H8NB 1ATGA 1O64A 3CG3A 4KQPA 1NNKA 3O2AA 4IO5A 1XC1A 1QUIA 5CC2A 5IKBA 4DZ1A 4OEVA 3D4CA 4DXCA 3HHGA 4DDDA 2Q2AA 2Q9TA 5AA4B 5DT6A 1JVYA 4OFJA 3K1MA 2ZNTA 3H3GA 3T9UA 3MP6A 3M3FA 3VVFA 1FQEA 4R72A 3RPWA 3KGCA 5L8DA 2OZZA 3O97A 3VXCA 4C1TA 3MZ9A 4WEPA 1LFIA 2XD2A 2FYIA 2D3IA 3MPKA 3PD9A 1VSOA 3VLWA 1A54A 4U1OA 4R9GA 3HPIA 2P1SA 2PT1A 4OEUA 1ANFA 1ZLQA 3CIJA 4LZ8A 3SEVA 1HSEA 3EQ1A 3MC2A 5FHNA 3UGWA 2O1LA 3IOTA 3G3FA 2DXRA 4XIGQ 1B46A 1WDNA 3FXQA 2X26A 4EF2A 3PPRA 3KOTA 4WKMA 4BDQA 1QKBA 4GQOA 1TFAA 4KFQA 4DXUA 5F7VA 1B5HA 5TP9B 3K1NA 2AL5A 4OFOA 1DPEA 3TTKA 1MH4A 2OLBA 1H45A 2PYYA 1OLCA 3O6HA 4R9FA 4EXKA 4JXIA 3ECRA 3DP4A 4N07A 4YKJA 2B3BA 4RXLA 3FVGA 3K4UA 5I2NB 1MY4A 2OBGA 4C0RA 2IA4A 3FVOA 3MJNA 5DVIA 3V8XB 5A5XB 1IXIA 3OD7A 5CI5A 2F7AA 4NMYA 3CI8A 1NKXA 3TTLA 3C34A 5H8HB 1NH8A 4LP2B 4JWXA 1D3KA 1VFDA 2IEEA 3K6XA 2V25A 3KSJA 3KJ7A 3MVWA 4H5FA 3DLNA 4FJPA 1B51A 2XXHA 1AIVA 1OQGA 1USYE 4RYAA 3E9XA 3LUYA 4X9TA 1URDA 4GIZA 4MFIA 4YMBA 1IXGA 3K00A 1LLSA 4RPNA 4RPOA 3EF7A 1NNFA 2GHBA 3C35A 4YKIA 4BDNA 3IOWA 3QUFA 1ZMGA 1SQYA 5JK4A 4JB7A 4F19A 3HSTA 4KPTA 4OTEA 4RK2A 4MBPA 3QK6A 4TQUQ 1FQCA 4X1DA 1F9BA 3W9WA 1XT8A 3LSXA 4EXLA 3GBBA 1Y3NA 5HBCA 3IL1B 1H76A 4F1VA 2ALUA 2X7QA 1B2HA 4N13A 5FHOA 4IY6A 4MH5A 4PFTA 1QW0A 4LUBA 1MXVA 1IEJA 1N84A 2YJPA 1DTZA 3FASA 3RTWB 2DE3A 3EHTA 3VVDA 5BUUA 2RCAA 4HCWA 3C33A 3TCFA 2UVGA 2O69A 1FCKA 3KZGA 4PQJA 3E4RA 1ZTYA 3USDA 2H5YA 3CFXA 3H6TA 3TEPA 1A8FA 4E0WA 4Z7EA 3VDFA 4NE4A 1OLAA 4F22A 3ZS6A 4ZEFA 3TTNA 4GLIA 4RNSA 4NF5B 3HN0A 2I49A 2R9JA 4DLDA 1DTGA 3H6UA 1P1OA 2OK2A 1JW1A 3P7IA 4QFPA 4G68C 4OERA 5IAIA 3DP6A 4LQ5A 1HSLA 1VE4A 3ILUB 4ZEKA 4R75A 1P1WA 1BLFA 4THIA 3N5LA 2A5TB 5I84A 1H3DA 2HXWA 4MF3A 2RC7A 2Y84A 1ELJA 2DSFA 4DIGA 2Y7WA 1M5FA 1RYXA 4ELRA 1BIYA 2DVZA 4IO6A 4OQOA 2YPNA 4ZE9A 3M8UA 4LATA 2XXPA 3HCQA 4G77A 2VHAA 2I4BA 1QUJA 1SVXB 2I0BA 4U4XA 3MZBA 5K2YA 3QUJA 4GF8A 3IB0A 4F31B 1I6BA 1Z7ME 1R9LA 1Y4TA 3HV1A 4QFKA 3U72A 1R6ZA 1JNFA 1MPBA 4NF6A 4OZ9A 1B6HA 4HW8A 4TLMB 3F11A 3QYTA 1SYHA 4K3FA 4OVJA 2ZYKA 2F97A 5ITOA 4KD5A 3O28A 4OWDA 1VR5A 4AB5A 4NF8B 1TT1A 4P0GA 4R6KA 4F3BA 4BLAA 3O6GA 1AL3A 2HZKA 3CSBA 4ECFA 4YB5A 1O7TA 2DS9A 3MQ9A 4QSCA 4ZE8A 5CMCA 2NWJA 5JEIA 1XVYA 5AA2B 1ZKBA 1B32A 2XXUA 1MQHA 3Q27A 3FXUA 3PD8A 2HCAA 1IQ7A 1B3FA 1IITA 4FEDA 3FD3A 1JQFA 2ZNSA 3JZJA 1FQDA 1P1NA 3LSLA 2R6GE 3KG2A 3A09A 3KN3A 4DXBA 1MY1A 1LBBA 3M3LA 3SESA 2VD2A 3OENA 4YAHX 4NEDA 4H0WA 1MPCA 3PGFA 1Y3PA 2QRYA 1LFHA 1VFEA 1SDXA 3TODA 4U4SA 1ZU0A 5CMMA 3H4ZA 3LC8A 2BJJX 4KCDA 1N7XA 5L9MA 1B7ZA 3UORA 3G3GA 4QSEA 3PPPA 2XXTA 2RINA 1NNTA 5DEXB 1ZJLA 3TTMA 3S4UA 1CB6A 1M5BA 4X48A 5H8QB 4IY5A 5I56A 3CFZA 2M8CA 1RYOA 4F39A 4R6HA 4IGTA 3B6QA 3UK4A 4I8CA 5FHMA 2O6AA 2XX7A 3GLBA 2ZMBA 1B1XA 4F29A 3Q29A 2NVUB 4NTLA 2GH9A 3PUVE 5DVJA 3G7WA 2QS1A 3OMBA 4DCXA 3VV5A 2QSXA 5H8NA 2UVJA 2PVUA 1P1UA 3R26A 1IZ1A 1MPDA 1NL5A 4JWOA 1N76A 2XX9A 3H06B 1A55A 2I48A 2G93A 3EN3A 1N3XA 3TELA 4C1UA 1N0TA 1MH3A 5KCJB 4LZ5A 5AA2D 1B05A 4I62A 1LBCA 4ONYA 1UTHB 4JDFA 2F36A 4OESA 3C4MA 5CBRA 3EHUA 3RN8A 4WEDA 3OO7A 3MP8A 3RNNA 2B65A 1SW5A 4H8IA 3OELA 1MXUA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4Q8RA 4GVOA 3K01A 2NOOA 4OXVA 3O29A 1GTKA 4I3YA 2PX1A 1G0HA 3HO7A 3EHSA 2VPOA 3O9PA 4G68B 2D21A 5LDZA 4XEQA 4ZZAA 4P9KA 2O7IA 3N6UA 4FECA 1B5JA 3QXMA 2QS2A 4O7MA 1POY1 3IJOB 5JTYB 1MS7A 1B0HA 3L6GA 3OO6A 4LVQA 4FATA 5EYFA 3T96B 3IJXB 4KHZE 3KJTA 3A29A 3WAFA 2F35A 3RQTA 5B7DA 1Y9UA 2DYXA 3K6VA 5TP9A 1MQJA 1XHYA 5I59B 4GWUA 4R6YA 1CE2A 4YMAA 1URGA 4PFYA 3C31A 4HXVA 1G0IA 4GWSA 4OANA 5HM4B 4OETA 1MM6A 4XKQA 4OHNA 2V3QA 2CMOA 2F7CA 4U1ZA 2V84A 5I2KA 4XXUA 4YB7A 1FPFA 5I2NA 4G61A 1USYH 1KA1A 2XWOA 2X7PA 2DWHA 3RPLA 5TU0A 3IOUA 3V5AA 4TOZA 3E3KA 3K1PA 1SI0A 1FBFA 1NH7A 1GV8A 3VE1B 1Z7NE 3RY3A 5ET6A 5A5XA 4H46A 3FV2A 3KC0A 2LAOA 3PMWA 3EKIA 4OYVA 1PBQA 4GD5A 1PB9A 2RF1A 1JETA 1IXHA 1FQFA 4ZECA 3FVKA 2XXRA 1YAEA 4PP0A 3RT8A 5H8HA 3WAEA 5I57B 1MY3A 2PMSA 1TFDA 4PBQA 4POXA 3S9EA 4YZZA 1B4HA 4E0XA 1B5IA 3PPNA 5EQ8A 3KBRA 1FBPA 2VOZA 1SBPA 3CR9A 4P11A 1PEBA 1NV3A 2AL4A 2WKYA 5ELVA 5B70A 2XD3A 1MDQA 1BTJA 3U1OA 2YLNA 5DTBA 2QL3A 3FUZA 3QIMA 3TMGA 4N81A 4M4GA 1UTBB 2Q74A 4NHBA 4H65A 1FPLA 3M3KA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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