3PXRA

Apo cdk2 crystallized from jeffamine
Total Genus 84
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
84
sequence length
298
structure length
294
Chain Sequence
MENFQKVEKIGEGTYGVVYKARNKLTGEVVALKKIRTEGVPSTAIREISLLKELNHPNIVKLLDVIHTENKLYLVFEFLHQDLKKFMDASALTGIPLPLIKSYLFQLLQGLAFCHSHRVLHRDLKPQNLLINTEGAIKLADFGLARAFGVPVRTYTHEVVTLWYRAPEILLGCKYYSTAVDIWSLGCIFAEMVTRRALFPGDSEIDQLFRIFRTLGTPDEVVWPGVTSMPDYKPSFPKWARQDFSKVVPPLDEDGRSLLSQMLHYDPNKRISAKAALAHPFFQDVTKPVPHLRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transferase
molecule keywords Cell division protein kinase 2
publication title Discovery of a Potential Allosteric Ligand Binding Site in CDK2.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 84
structure length 294
sequence length 298
ec nomenclature ec 2.7.11.22: Cyclin-dependent kinase.
pdb deposition date 2010-12-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3pxrA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3pxrA01
4AA4A 5AFVA 3BQCA 2PZIA 3E7OA 3A62A 2QLQA 2VTLA 5CAUA 2B9JA 4QMQA 4BN1A 3KRXA 2OZOA 4O0WA 3RAKA 4TT7A 3FLYA 2IW9A 4FGRA 1SYKA 4KIQA 1REKA 3EQHA 1NXKA 3GQIA 4J98A 4KIPA 4N70A 2BRBA 2ZV7A 5CZIA 4ZZMA 4CXAA 2QO2A 4MXXA 4NW6A 1ZZLA 2UW4A 3CY2A 3CE3A 4DYMA 5CEIA 4ZS4A 4MD7E 3HNGA 1PMEA 2Z7RA 2X4FA 3NIEA 3ZHPC 4QMPA 3R7GA 4BVUA 2C6MA 3ZM9A 5HORA 3FWQA 2J51A 4RJ5A 4R7HA 3P7BA 5HIDA 3QD0A 4KA3A 4OTQA 4FBXA 4AGCA 1X8BA 4XOZA 4CKRA 3PSBA 3EZRA 2XNOA 2O3PA 4EI4A 3OBJA 5DHJA 5HX8A 4XP0A 3MJ2A 4FI1A 4O7ZA 3NUXA 4FR4A 1XH7A 3DDQA 3IW5A 3PVWA 5CU2A 2GSFA 4OTWA 4JAJA 2F7XE 5H8EA 3DGKA 5HGIA 4X3FB 4JDIA 4TYJA 4AE9A 2Y4PA 2V5QA 2VWWA 2Y6OA 1JQHA 3PVBA 4GRBA 3IW7A 4D5HA 4V0GA 4WNPA 1PXNA 4AZTA 3KGAA 5H8GA 4GL9A 3W33A 2J0LA 5KUPA 4FL1A 5CXHA 3VNTA 5DR6A 3PJ2A 3VWAA 4K33A 4LRMA 5EH0A 4RJ8A 4W4YA 4FT3A 4LGGA 5IH6A 3ZFYA 1PXOA 4PPAA 4FZDB 2XM9A 4BTJA 4CZYB 3PJ3A 3NLBA 4LUEA 4M97A 5KHWA 2YDKA 3Q4UA 4DFNA 3DLSA 2CDZA 3T9IA 3EKNA 1CSNA 2QOBA 4IACA 1ERKA 4WSYA 5KKRC 3I81A 1OBGA 3FEGA 3EHAA 3ORNA 2Y4IB 3P08A 5EM8A 3RJCA 4LRKA 5ICPA 3BX5A 3KRLA 3MIAA 3PSDA 4AACA 2W1FA 4EYJA 4I23A 5JQ5A 5IH4A 2BKKA 3WE4A 5GIPE 4L7SA 2IWIA 1UVRA 2C5VA 2F7ZE 4FV1A 5CXZA 4GJ2A 1ZAOA 4AW1A 4IC8A 4XLVA 4E93A 3LKMA 1Q8YA 4L67A 4OBOA 3BYOA 3EFLA 1YHVA 1UU3A 3RBWA 4DFZE 3PE1A 5EM5A 2BAKA 4RA5A 3ATSA 2YEXA 1JWHA 1XKKA 2C0TA 1IA8A 4AZWA 2BVAA 4ZIMA 4E4XA 4YP8A 4DLJA 2CKOA 2XJ0A 5FEEA 1PXJA 4PRJA 4QYGA 3REPA 3R9DA 4FZ6A 4YJOA 4O0RA 5DR2A 2CN5A 5IA4A 3QU0A 3UNJA 3MI9A 4NIFB 2WMBA 3Q6WA 3FKLA 3L8SA 3OTVA 1KSWA 2PVYA 4ONAA 5LMAA 3ERKA 3NVMB 5HX6A 4RX8A 5E1SA 4S31A 4AZVA 1H00A 5EQEA 4FV3A 3OCBA 3MPMA 4GW8A 4ASDA 3PA3A 3D15A 4O1OA 5IUHA 5KBQA 2GHMA 4FK3A 2FA2A 4RMZA 3ZONA 3GC8A 3THBA 2BR1A 2NRYA 4KAOA 1H1PA 3MBLA 4RIXB 5LOHA 4FMQA 4QMZA 4LM5A 2W4KA 2ESMA 2GS7A 5CTPA 3FMDA 1OECA 5BMMA 5FTOA 4I22A 3LFSA 2JDTA 1J3HA 4AZFA 2Z7QA 4V04A 3W2RA 4DFLA 5AA8A 2ITUA 3M42A 5EOBA 3UQGA 3PWYA 1WAKA 4O91A 3ZLSA 4NSTA 5GINE 2EXEA 4OR5A 2WGJA 1XH4A 5FGKA 1YWNA 4QMUA 5T3QA 5E8UA 5D9HA 2Z7LA 4ACGA 2Q0BA 3R0TA 2YWVA 4O1PA 4PTGA 2OJJA 3R8ZA 4O6EA 1SVEA 2IJMA 4MXYA 3HDNA 2XH5A 4FEXA 5F20A 4AAAA 2JIIA 4MBJA 5DVRA 2R7IA 3W2CA 4O7SA 4O7TA 2WTVA 4QMYA 2UW8A 2QOIA 4FKQA 3BBTB 4AFJA 4K0YA 4LOOA 2EU9A 3EN9A 4YNEA 3VF8A 2GQRA 2R0IA 2IPXA 3R73A 4UX9A 3DLZA 2XRUA 4I41A 3FLQA 3VUMA 3AXWA 3A7IA 3H3CA 1G5SA 3LXLA 3HLLA 3Q52A 4QPAA 5M55A 3S95A 4RZVA 4ZJIA 4FTCA 4UY9A 3F7WA 3GT8A 3Q96A 4MQ1A 3RALA 1JKLA 3S2PA 4FEQA 2WOUA 5HG8A 4YTFA 4CCBA 4WG4A 5KMMA 3MH0A 1A06A 3E62A 3IG7A 4ZTQA 2OIDA 2WQBA 3V04A 2I0EA 2UW3A 3C4WA 4BDJA 5I9WA 3MTFA 2QOCA 1VEBA 3I6UA 2UW9A 3DK3A 3P7CA 1NY3A 4LGHA 4EKKA 1OIUA 3KK8A 3BQRA 4FIGA 4QNYA 4E3CA 4IZ5A 5BVFA 5JRQA 3TNWA 5AM7A 5ANEA 5CANA 5J79A 2H8HA 4MNEB 3L1SA 4Y85A 3U87A 4CGAA 4BCNA 4NL0A 2XNGA 5ACKA 4FGBA 4IFCA 2X8IA 3OWPA 3QLGA 5DEWA 3BYSA 5EDQA 3R8PA 4C2WA 2C6IA 3PJCA 3ZO3A 5M57A 3KRRA 4YPSA 4O84A 1RQQA 3QQFA 4WUNA 4U8ZA 2W5AA 4IADA 2QNJA 4AT3A 5IA0A 4CFMA 3FUPA 5D10A 3DB8A 3PIXA 4HNFA 4X3JA 1VYWA 3HUBA 4J7BA 4YGAA 1CKIA 5DRBA 4L45A 4E7WA 4C38A 3DTWA 1G8SA 3C0GA 3TV6A 3W10A 3M1SA 3DS6A 3B8QA 4JVGA 4FEVA 3R21A 3BWFA 4EQMA 5EKOA 5FQDC 3ZRMA 3NUSA 3OP5A 4C57A 4EJ7A 4KS7A 4M15A 5EW8A 4IB3A 4XJ0A 4C3PA 2CJMA 5EI8A 3OS3A 4CYIA 3UC3A 5JFXA 3SXSA 5JQ8A 3F3ZA 4BGQA 3PXFA 3ZUTA 1CMKE 3ORIA 4I20A 4BDDA 2W5HA 3ANQA 4AGUA 2GQSA 3R6XA 4ZSAA 3KB7A 2UZEA 1OL5A 4HYIA 3OBGA 4JDKA 2EVAA 4I5PA 2H96A 5FDXA 3EFWA 3AMBA 1CTPE 4TNBA 1J1CA 4P2KA 3GQLA 4EK5A 2WELA 4IB1A 4KABA 4MNFA 4ZOGA 4U44A 5HCYA 1MP8A 2GQGA 1YDRE 4FKUA 1G8AA 1XH6A 3OG7A 3KA0A 5HD7A 4CV9A 4L00A 4S34A 1ZYLA 2QU6A 4H39A 4QOXA 4RIWA 5CEKA 4CFUA 2IZSA 3IDBA 5LXMA 2JDRA 2JGZA 3E88A 4IWQA 4XRJA 4D0WA 5IF1A 4GJ3A 4FG8A 5EYDA 4HZRA 4H05A 1WVYA 3VHKA 5HCXA 3NAXA 3TN8A 2P33A 3BI6A 3E8EA 4OTHA 1GJOA 4BBFA 2C0IA 3UVQA 3IW6A 2R3FA 3PPZA 4NJDA 5H8BA 4FKPA 5EDPA 5HG9A 5HIEA 4BDGA 1R0EA 2VGOA 4QMMA 4W8EA 3SC1A 4I24A 3KF7A 5K4JA 4QPMA 2X8DA 5HCZA 4ZLYA 1HOWA 2XJ2A 2HY0A 5F1ZA 5C4LA 3QD4A 4R3PA 1DAYA 2R2PA 3LJ2A 4G9CA 4UMPA 3O71A 4D1ZA 1XBCA 5AUTA 5FP6A 4AW0A 3UMWA 3G6GA 4NM7A 5ETCA 3VC4A 4G31A 3CIKA 5CU0A 3C51A 2HW7A 4L8MA 2CLXA 3KFAA 3R1YA 1J7UA 5AP1A 3FKNA 2ITQA 4G6OA 1JSUA 2J9MA 4YJSA 3ORZA 4FKGA 2WQNA 2HZNA 1YHWA 3U6IA 4DEGA 2XKFA 1P4OA 4XYFA 3UGCA 2JEDA 4G1WA 4C3FA 5E4HA 1R78A 3CD8A 4RC3A 3BV2A 3D7TA 3B2TA 4E4MA 4Y83A 4N4SA 2HZ4A 3BGQA 3FY0A 4QQJA 3FI3A 3R02A 2JAVA 2W1ZA 2PZRA 5HLNA 1SVHA 4FOBA 2C5YA 5CENA 4L52A 3B2WA 4XLIA 1GOLA 1REJA 3VUIA 5FG8A 2HELA 4BKJA 3VRYA 4F70A 5IKWA 3SXFA 2ETMA 3QRJA 3MVLA 3MVHA 5AR3A 3EL7A 3ZMMA 4PDSA 2VTMA 5CF6A 4FKJA 3FXXA 4ACHA 4D2TA 2QCSA 4GYIA 3DXQA 1P14A 3O2MA 4IDVA 1IEPA 2J50A 2J6MA 2YJRA 2GNIA 1WBVA 4HCTA 2VO6A 4UN0C 4ZAUA 1Q5KA 4YBKA 1DI8A 3FYJX 1CM8A 3GGFA 1OVEA 1YWVA 3ZTXA 2WZJA 4JIAA 4KNBA 3T9TA 5JSMA 3ZDIA 5L3AA 1URCA 5C9CA 4D4VA 2FGIA 4IX6A 1IAHA 2WTDA 3CY3A 4NT4A 2IZRA 1OPJA 2P4IA 3WBLA 2XKEA 3MH1A 2WFYA 5DT4A 4ZJJA 2CN8A 3MS9A 4IVDA 3PWDA 1QPDA 4FIEA 5C26A 3NAYA 3P5KA 2PVNA 3GCUA 4M67A 3C4ZA 5JT2A 3C5IA 3W8QA 4BF2A 4IM3A 5CU3A 3ZRLA 5HNBA 4LI5A 2BPMA 5HZNA 5AUZA 2VUWA 4RFYA 3NW7A 4D9TA 4XS2A 3PLSA 2JD5A 4KRCA 2VNYA 3FJQE 4PDPA 4WSQA 4EH6A 5BQ0A 1E1XA 1YQJA 3UIXA 3PRIA 5FM3A 4MEDA 5I0BA 4AN3A 3COKA 5K5XA 3C50A 1XH9A 3GEQA 5DA3A 4F65A 5E1EA 2ETKA 4TYIA 3AC1A 5HOAA 4DINA 5EHOA 4ITIA 3RPVA 4ANQA 4L7FA 4DG2E 4L01A 4D4YA 4D2PA 4C4FA 5TOZA 1O9UA 2PZPA 3EQRA 4PP7A 4O2ZA 4OT6A 4NEUA 5E8SA 2FH9A 4ANLA 2YM7A 1TQPA 3PUPA 5EQYA 5HD4A 3DZOA 3TUDA 3QTUA 4MX9A 3LFFA 1UU9A 4XBUA 3AT2A 5AP7A 3UE4A 2VWYA 3ZC6A 4CT2A 5ANJA 3W18A 2PU8A 2C6DA 4EHZA 4HVIA 4ZSEA 1K3AA 3FMNA 1JPAA 5EM7A 1JOWB 3MV5A 5J9LA 1IA9A 4XG8A 1PXLA 4WO5A 2IW6A 3SV0A 5EK7A 3W55A 3ZXZA 4EUTA 4UB7A 3UQFA 2B9IA 5IEXA 4L44A 2XK6A 3GXLA 4U42A 2BZKB 5DWRA 5J9YA 2ZV8A 2C69A 3KXXA 3PVUA 4WNOA 4OTIA 4ANOA 2C6EA 5C4KA 2R7BA 1H1RA 4JOAA 4G3EA 5IPJA 4O38A 2OIQA 3AC5A 3LAUA 4EH2A 2EUFB 3MFSA 4RFMA 5DR9A 2C5OA 4I1ZA 4NWMA 5JZJA 3F82A 1PKDA 2GNJA 2QD9A 4QT1A 4ZTSA 4I0TA 3NMUF 5M06A 2ZJWA 3DJ7A 3H0ZA 5TF9A 4NFMA 3VW8A 5ETIA 3H0YA 3ZEPA 3ZBXA 1F3MC 2V55A 2XA4A 3F3UA 3ZO1A 2FVDA 4KSQA 4QP9A 4XG2A 4CMTA 4IVCA 4K9YA 4LMNA 2O65A 3RM6A 3LXPA 4GKHA 2VN9A 3W32A 2DYLA 2ETRA 2VTAA 4CSVA 4NM3A 4QMXA 3MW1A 4YNOA 4IE9A 2V0DA 4IX5A 4R3CA 4CLIA 4EK6A 4IEBA 5IMXA 2OFUA 5CY3A 5F9EA 2CNUA 2O63A 4ZY6A 3ORXA 4DE4A 2W1IA 3E5AA 3OD6X 2IW8A 3RZFA 4IWOA 4HVSA 4ZMEA 3HGKA 1O6KA 3EQIA 3QALE 4FTIA 1ZYJA 5L4QA 3KRWA 1OIQA 4BICA 1S9IA 1RJBA 3KXHA 4QMLA 5IA1A 2RFSA 3A8XA 5F4NA 5HO7A 2V7OA 3EL8A 4LL5A 3FLSA 2BAJA 3CKXA 3T8OA 3CQUA 4HVDA 4ZK5A 3TNQB 2YN8A 2ZM4A 3COHA 4GK3A 4U97A 5HKMA 3BLRA 1JKKA 1OL1A 4ALWA 3U6HA 2BZJA 4TNDA 3DK6A 4YTHA 3C13A 4RVTA 3EN7A 3FKOA 2UW5A 4H36A 4EH9A 5D12A 2BUJA 5LWNA 4CFFA 3Q2JA 4ANNA 1PMNA 4HCVA 4QPSA 4BI2A 4ANBA 1HCKA 1SNUA 1IR3A 2ACXA 3QD2B 4ZSLA 3ATTA 1QCFA 5CVGA 4C37A 3IK3A 4F7LA 2R3PA 5FXQA 4J52A 5CU6A 3SG9A 1W98A 1LEZA 4HJOA 4OBPA 3M2WA 2IVVA 5DH3A 4FSUA 3UO5A 2WIHA 4CQEA 3C4EA 4TYEA 2A19B 4G9RA 4E4NA 1Q24A 3GFWA 2X2KA 4UALA 3UOLA 5IISA 4BGGA 2VGPA 5CSPA 1PKGA 3TZMA 3HP2A 3NDMA 1P4FA 5L6WL 2VTIA 3EN5A 3GI3A 4FG7A 3EQDA 5BX0A 4DCAA 5FXRA 2FUMA 2WMAA 3P79A 2EXCX 3VUDA 1R1WA 2QI8A 2R3OA 3UQCA 2XEZA 4QRCA 4NH1A 2YA9A 3QZFA 4E6AA 3GCPA 4U0IA 4JIKA 4M66A 3VUGA 2PMNX 4PNKA 4W4XA 3EN4A 3S1HA 4AG8A 2X39A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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