3PY0A

Cdk2 in complex with inhibitor su9516
Total Genus 88
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
88
sequence length
298
structure length
294
Chain Sequence
MENFQKVEKIGEGTYGVVYKARNKLTGEVVALKKIRTEGVPSTAIREISLLKELNHPNIVKLLDVIHTENKLYLVFEFLHQDLKKFMDASALTGIPLPLIKSYLFQLLQGLAFCHSHRVLHRDLKPQNLLINTEGAIKLADFGLARAFGVPVRTYTHEVVTLWYRAPEILLGCKYYSTAVDIWSLGCIFAEMVTRRALFPGDSEIDQLFRIFRTLGTPDEVVWPGVTSMPDYKPSFPKWARQDFSKVVPPLDEDGRSLLSQMLHYDPNKRISAKAALAHPFFQDVTKPVPHLRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
molecule keywords Cell division protein kinase 2
publication title Discovery of a Potential Allosteric Ligand Binding Site in CDK2.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 88
structure length 294
sequence length 298
ec nomenclature ec 2.7.11.22: Cyclin-dependent kinase.
pdb deposition date 2010-12-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3py0A02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3py0A01
3BKBA 3WIGA 4P5ZA 4OLIA 3GC8A 2P4IA 5AV4A 4L46A 2B53A 1YWNA 2F49A 3NDMA 2WMRA 1U46A 4W8EA 3FI2A 3BHYA 5DNRA 3JR1A 2XYUA 5L6WL 4I23A 4BC6A 1Z57A 1U5RA 3PRFA 5GJFA 3WBLA 2OIQA 2XNBA 4D5HA 1MRYA 3PVWA 4RIXA 4Z55A 4KUJA 4GSBA 4F1TA 4IB0A 2C3KA 2CSNA 4UALA 3GOKA 5A4TA 3EN4A 2J2IB 5CXHA 3RCJA 2XP2A 3VC4A 5L3AA 3TUBA 3G33A 4KS8A 3QD0A 4JG7A 5HTCA 3I6UA 3A7FA 5HBHA 2C0OA 2VTQA 4C2VA 3R9HA 4TYIA 3PXZA 4I6QA 5DN3A 3RZFA 4BDDA 2BILB 1UKHA 2XZSA 4OTIA 1XH4A 1JKKA 4YJOA 4ZK5A 4O21A 3KXHA 2YCRA 3P7AA 5AP2A 5EDRA 3W8QA 4EC9A 3ULIA 2WMBA 1J7LA 2X8IA 4PNKA 3BU6A 3L9PA 5JZNA 2H96A 1IA9A 4D4VA 4JBQA 2UW0A 4MF1A 3UYSA 4ZEGA 2GNJA 2WMVA 3IOPA 3ZO1A 5CEQA 4YLJA 2VZ6A 3WZDA 4GJ3A 2HXLA 1E9HA 3F5GA 1YHVA 3SOAA 3ET7A 4WSYA 1ZYLA 4AN3A 5E8SA 4Y5HA 2ZYBA 3D94A 2QONA 5AP5A 5EW9A 1JKLA 4M69A 3JVSA 5HO8A 4HJOA 2J0KA 3PWYA 4D0WA 2QKRA 4F09A 4QTBA 3A8WA 4NTSA 1GIJA 3DKFA 1WAKA 4MVFA 4ARKA 2E9NA 3NS9A 1ZOHA 3C4WA 4EHVA 1OIYA 4XG8A 4BZOA 3TZ8A 2CGVA 4I3ZA 3Q32A 2BDFA 4YZMA 3MDYA 4L01A 5A9UA 1OPLA 2GPHA 3AQVA 3W8LA 3TZMA 4S31A 4RT7A 4CMTA 2W5AA 5EOBA 4HPUE 5ANEA 4BDJA 3TM0A 2RG6A 3EQBA 4DE4A 4AW1A 5AFVA 4CD0A 5J79A 3QCYA 5GINE 3EKNA 3RHKA 3MA3A 5HEZA 2X4FA 3PP0A 4CG9A 2ITWA 4IJPA 4UZHA 3RKBA 2OZAA 4O86A 4QYEA 4D2VA 2XUUA 4D2PA 2ITQA 2JFLA 3MVJA 5DBXA 3TDVA 3LXKA 5CF5A 2EB3A 2ZB0A 4II5A 5HG9A 5K0XA 2UZWE 3IOKA 4YO4A 5HZNA 1WBTA 4L3LA 2WQMA 4FSRA 3G9LX 1ZYDA 3QWKA 4C58A 4ERKA 4ZS4A 2C68A 3DGKA 3K5VA 2X2LA 2P3GX 5AV1A 5ACKA 3FV8A 2R0IA 1R0EA 3CTQA 3ZOSA 5M53A 3SXSA 2DUVA 2OJJA 4U81A 1PW2A 5EOLA 4EK4A 3CQWA 2CMWA 2OI4X 4N4SA 3UMXA 4F7JA 4QMOA 2V5QA 2WIPA 4IX4A 3Q6WA 5K5XA 4NFNA 1OITA 3DTWA 4RVLA 3IW7A 4H05A 5F1ZA 4QYYA 5L8KA 1K3AA 4G9CA 4JOAA 4EYMA 3EQPA 4W9XA 1U54B 2JFMA 3IW6A 4OTWA 4DHFA 2A0CX 5HOAA 3O50A 4XLIA 3HLLA 3AD4A 3CTHA 4AGUA 4EH3A 3C9WA 3WF5A 3UPZA 1J1CA 1Q8UA 3MJ2A 2OO8X 4RIOA 5L2QA 3TDWA 4QQJA 1TKIA 4LUEA 3DTCA 4RIWA 1UV5A 2B7AA 1Y8YA 3POOA 4U80A 1U59A 4IM3A 2Z02A 2WHBA 5IDNA 1PXKA 4WNKA 3BHUA 4IAZA 3PG1A 3CLYA 4MYGA 5ETCA 4QP9A 4FEQA 5HIDA 4IWQA 2QR7A 3NUPA 4OTDA 5HVJA 4RQKA 4XYFA 2RG5A 3QUPA 2QOLA 3R28A 4E4LA 2HY81 4EZ3A 3FZSA 5J1WA 3KXZA 3GQLA 1URCA 3EWHA 4YZCA 4WRSA 1NVSA 4H39A 4A9UA 2UV2A 4ERWA 3OWPA 5K5NA 2WMAA 3MY0A 2RF9A 3KK9A 3KGAA 1H4LA 4F1OA 4FNWA 4E6CA 4WUNA 4ZLZA 2W1ZA 2QI8A 2QU5A 5AV0A 1FVTA 5TO8A 5C9CA 3PP1A 4M8TA 4AZSA 4BYJA 4UMTA 4IAIA 5AUVA 5FEQA 2XM8A 5AIKA 5BVDA 1TQMA 2YM4A 4JL9A 4RIXB 5EYCA 3S95A 4ACDA 5ICPA 1IAHA 5HCZA 3DT1A 3AMBA 2XIKA 4KIQA 5DR6A 1YWVA 3MPTA 4G1WA 3V5PA 4AOIA 4ZAUA 2Q0BA 4IAFA 2ZM3A 4IX6A 2PWLA 2GS2A 3VF8A 3UBDA 3HDNA 3VRZA 1YHSA 3F66A 4GFOA 3F7ZA 3PXYA 3O23A 3VBVA 3I0OA 1WVYA 3O0GA 5JKGA 3RAWA 3ZO4A 4RJ3A 5CWZA 2XNPA 3RAHA 4CKJA 3U4WA 3WF7A 4TKSA 2IO6A 4OAUC 3DXNA 3QRKA 4QQ5A 4AU8A 2HZIA 1PRYA 2WMTA 4HGLA 4AFEA 4AZFA 5A54A 3MTFA 3ZUVA 1SVGA 2QOFA 2VAGA 5IUGA 3NX8A 5ETAA 3PSDA 5HTBA 3NNVA 4DBXA 5CVGA 3NYVA 3F3WA 4IXPA 4I20A 3RALA 4HCVA 3NWWA 4CRSA 5JK3A 5C01A 3OTUA 3DQWA 4YC3A 4A4XA 3FHRA 2P2IA 3DXQA 2XJ1A 2J0IA 5EW8A 4CFMA 2ZMDA 3O8PA 5BUIA 4O7WA 3O17A 4W9WA 1XKKA 3VQUA 2CNUA 3DXPA 4J97A 5KX8A 4EWHA 4BKYA 4C34A 1MQ4A 4MEDA 3GC9A 2ITVA 3E88A 5CT7A 4E73A 4X2JA 3GFEA 5KBQA 5KHWA 2CNQA 4PX6A 2OJFE 1H26A 1M7NA 2PE2A 2F57A 2XNGA 4FTQA 5EYDA 4HVDA 3MJ1A 5K0KA 3PYYA 4FZFB 3VW6A 3FMJA 3OD6X 4XLVA 3Q52A 3RPVA 2R3OA 2RIOA 4XRLA 2OZAB 3EB0A 2V22A 3AC5A 4PP9A 4DGOA 1FOTA 5CAOA 2G01A 2O63A 3MFTA 2VTJA 4BCKA 3IK3A 1QPDA 2F2CB 2X2MA 5DT4A 3RK7A 1YXUA 3PXRA 1OKYA 4HNFA 5EH0A 2BTSA 4ZSEA 5M44A 3OOMA 4C59A 2W9FB 1QPJA 4GRBA 4PF4A 4BVUA 2B55A 3POZA 4E6QA 4QTEA 4L67A 3LFSA 3UGCA 1PXOA 4AW5A 5JFSA 3V8TA 5FRIA 5LVPA 3PFQA 3BV3A 2RSVA 5HLNA 4IZ5A 1VYZA 3CD8A 4KSQA 2YCQA 2XBAA 4J99A 4XNEA 2R3LA 4HGTA 4ACMA 5IH5A 4WIHA 4ZJIA 3A7HA 3U87A 2OIBA 3NMUF 5E8YA 2FH9A 2ITXA 5M51A 3EFJA 4I5PA 4GJ2A 5CF4A 2PVJA 3R83A 3E93A 1CSNA 3Q4CA 5FBNC 3VS5A 3KK8A 3WF6A 5I4NA 2W0JA 4O0TA 5GNKA 4O1OA 2UZOA 4NJ3A 5EHOA 4FEWA 4X2GA 5HO6A 4KB8A 3R8UA 1OM1A 4HGSA 3WE4A 3COIA 5L2SA 2ITTA 4L45A 2HY0A 4X2KA 4CYIA 1UNLA 3L9NA 3MY5A 4J8MA 3UP7A 5L2TA 5BYZA 4QQCA 2QHNA 3OOGA 2GFSA 5LCJA 1CDKA 2XA4A 4FC0A 4NCTC 2O2UA 5KMNA 4J8NA 4B99A 4JDHA 5DI1A 3BLHA 3MW1A 4NJDA 4AAAA 2JC6A 3O2MA 1WBNA 3U4UA 4ASXA 1OL7A 2BDWA 4OBOA 4BCNA 3UVPA 2I6LA 3DBEA 4DLIA 3WF8A 2BZHB 2QURA 3GU4A 2PTKA 2ITPA 4EQCA 5AR2A 1A48A 2C5XA 5CSPA 3LJ2A 1SZMA 2VD5A 2BFXA 1ND4A 3LFCA 5EK7A 2ERZE 3I5ZA 2R4BA 2W5BA 3FMEA 3C51A 2WMXA 3MY1A 4O0WA 5BX0A 3KMWA 3FUPA 1OBDA 3BE2A 3DJ6A 1FGKA 2BMCA 4YJNA 3H10A 3VWAA 3A4PA 1ZAOA 4D5KA 5M07A 2YFXA 3HMNA 4ZMEA 3BYOA 2R3PA 2C5OA 5AUTA 2IVSA 3C4XA 3CR0A 3OBGA 4RJ7A 3VS2A 5CSXA 5CU6A 3N4TA 5CTPA 5DR2A 1PJKA 4F7NA 1GZNA 2XCKA 3QZGA 1YRPA 3BBTB 5E8UA 3GP0A 1WBPA 3NAYA 3ZDIA 4XV2A 4IWOA 5EDPA 3TKHA 4FIFA 1PXIA 4WHZA 2WTVA 4JXFA 1G3NA 1UKIA 3OY1A 5I9XA 4GV1A 2C1BA 3P5KA 4FUXA 2HWPA 4QTAA 4L6QA 1R0PA 4CYJA 3AMYA 3V5WA 4YU2A 5E1SA 4AP7A 1FINA 1J1BA 3BYSA 3KL8A 3UPXA 4YTIA 3TV4A 4FZ6A 4FKJA 3EL7A 1H01A 3NCZA 1YOJA 4KIPA 4DFXE 2QKWB 4F7LA 5CEOA 5IU2A 3FKLA 4C33A 3VJOA 4RC3A 3RCDA 4ZLYA 2JKKA 5M55A 3SGCA 4C02A 3TNIA 4BCOA 3FEGA 2EU9A 3R9RA 3FZPA 3E3BX 3ZXZA 4J53A 5J95A 3R1SA 4YP8A 5FTGA 3W1FA 1PMUA 2O64A 3LFFA 4FF8A 4YUQA 2WQNA 2J4ZA 2GMXA 3TL8A 3KREA 2VWWA 4KBCA 4DTAA 5BPYA 1ZARA 4R77A 2O65A 3BX5A 4QPMA 2IZUA 1F5QA 2OF2A 3QUDA 4DEDA 2PMLX 3UOKA 1XH7A 5AR3A 2R3HA 4PTGA 2FYSA 1OKZA 5ANJA 4JT3A 5JEBA 3RPOA 5DGZA 5KMKA 4TWNA 1KE8A 3OVVA 4U3ZA 5BMMA 2XB7A 2XIXA 4I1ZA 3OS3A 2XK9A 2PVHA 4RC4A 4XRJA 5AR7A 3LFQA 4O7ZA 5DRDA 5EI6A 4FG7A 4QP3A 4BDIA 4NKSA 4CTBA 3EQGA 5E8ZA 4C7TA 3LKMA 2Z7RA 2UVZA 3PDTA 3OFMA 3TKUA 3ZM9A 2VTRA 1QCFA 4XS2A 4ANLA 4IEBA 1RJBA 4FIGA 4RJ8A 4EC8A 4GG5A 2C6IA 4LFIA 4TY1A 4TRLA 4JG8A 4FX3A 3Q3BA 3MPMA 5HU3A 4FKWA 4BTKA 4U45A 4BI0A 4EWQA 1WBVA 4O1PA 4EBVA 1UU3A 3V04A 4Q9ZA 2Y6MA 5FG8A 3EFWA 3FXWA 4U42A 4LRMA 5JFXA 4QP2A 3R8MA 4L9IA 4MXAA 1J91A 3W55A 3GB2A 4UWYA 2X8EA 5DH3A 4A9RA 4FEUA 4A4LA 4UN0C 4RJ6A 2RL5A 1XJDA 4O22A 2O5KA 4DT9A 4K11A 4H58A 1LEWA 4KKGA 5EW3A 3TKIA 3HX4A 4FSQA 3FY2A 4IFGA 4IHPA 4QMMA 2BCJA 4FK3A 3RK9A 3RWPA 3TV7A 2IPXA 5M4CA 1O6KA 1PKGA 5DRBA 4I5HA 4BZDA 3PZEA 1UU7A 5HX8A 4ZLOA 1OGUA 1LUFA 3BBWA 5BNJA 5IPJA 2PULA 3DBQA 3QL8A 3P78A 2DYLA 4G6LA 2X9FA 4EZ5A 5K4JA 4AN9A 2Q0NA 3PA5A 1APME 3DS6A 3PPKA 3MIAA 3TIZA 1IG1A 3RMFA 3F2NA 3KRXA 4KIKA 3UQFA 4Q5HA 3PSBA 1JKSA 4DCEA 4N57A 2WXVA 3ORIA 3LQ3A 2GCDA 2C47A 2XK7A 3KXMA 2V7OA 3OF0A 3QRJA 3PY1A 5HNIX 2Y7JA 3IG7A 4IB3A 4I92A 4PL3A 3V51A 2W17A 5I9VA 4FKPA 4E26A 4FV7A 5D41A 3O8UA 3V3VA 4O0XA 2EXEA 3ZFMA 2X0GA 4C8BA 5M57A 3SLSA 1R1WA 3GCUA 3QLGA 4KA3A 4MBJA 2UZNA 3KMMA 2VTMA 3MIYA 3U6IA 1PF8A 4QMYA 4DH5A 4NIFA 5FP5A 2OGVA 3QHWA 4FTNA 1ZY5A 3U51A 4F0FA 4ZZNA 4Y5QA 2VX0A 2XVDA 5C8KA 1JBPE 4QMTA 2R64A 3HA8A 1V0PA 2W4KA 4BN1A 1H07A 2G2FA 2XNEA 2WQOA 4CFWA 4FKSA 3RPYA 3ZBFA 3VBTA 1I44A 5JMSA 4UMRA 3FKOA 1YI4A 2JDOA 2XIRA 3JS2A 1PMEA 3D7ZA 1S9IA 4BI2A 4EOQA 3BU3A 1DAWA 1NVRA 4YJRA 4YJQA 4J1RA 3H9RA 5D7VA 1Z5MA 5KKRC 3LLAA 5JQ8A 1BKXA 4GK3A 5A4QA 2W1CA 4FTLA 5CSWA 5LMKC 3GUBA 4AS0A 3WIKA 3N9XA 2WTWA 3NYXA 3QC4A 5ACBC 3O71A 4FSWA 5FWKK 5AADA 4H3QA 4BCMA 3UIMA 4GUEA 4LRJA 4FV2A 2C5YA 4X3FC 3BIZA 4GT3A 4CFNA 2UZUE 3EQCA 5AP6A 3BQRA 4FG9A 4XUFA 4FA2A 3PXFA 3QU0A 3VS0A 1PXPA 2WTJA 3ORMA 3HKOA 4EH5A 4DYMA 3ZEWA 2CN8A 1NY3A 4AA0A 1YI3A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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