3QR3A

Crystal structure of cel5a (eg2) from hypocrea jecorina (trichoderma reesei)
Total Genus 129
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
129
sequence length
329
structure length
329
Chain Sequence
MGVRFAGVNIAGFDFGCTTDGTCVTSKVYPPLKNFTGSNNYPDGIGQMQHFVNEDGMTIFRLPVGWQYLVNNNLGGNLDSTSISKYDQLVQGCLSLGAYCIVDIHNYARWNGGIIGQGGPTNAQFTSLWSQLASKYASQSRVWFGIMNEPHDVNINTWAATVQEVVTAIRNAGATSQFISLPGNDWQSAGAFISDGSAAALSQVTNPDGSTTNLIFDVHKYLDSDNSGTHAECTTNNIDGAFSPLATWLRQNNRQAILTETGGGNVQSCIQDMCQQIQYLNQNSDVYLGYVGWGAGSFDSTYVLTETPTSSGNSWTDTSLVSSCLARKG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title A structural study of Hypocrea jecorina Cel5A.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Endoglucanase EG-II
molecule tags Hydrolase
source organism Hypocrea jecorina
total genus 129
structure length 329
sequence length 329
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.4: Cellulase.
pdb deposition date 2011-02-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00150 Cellulase Cellulase (glycosyl hydrolase family 5)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3qr3A00
5DFAA 1MW0A 4PRWA 4H04A 2CBVA 1KXVA 5DF0A 5IFTA 2D24A 3PZOA 1E0VA 4V28A 1AVAA 5E0FA 1UA7A 3L4YA 1A47A 3AIEA 1HL8A 4AD5A 2W92A 1KFWA 3W4RA 1V6YA 1PPIA 1CGWA 3AS1A 9CGTA 2GJXB 4EANA 4MJ2A 1BHGA 2GK1A 1V6VA 3B9EA 1B9ZA 5D8WA 4UFJA 3HU7A 5D8ZA 3VIMA 3BCDA 2G3NA 4XB3A 3ZT5A 3SCVA 4X0NA 2CYGA 3NIYA 1PX4A 4HU8A 2GUYA 2XVLA 3WUEA 5BYWA 4FK9A 3GXFA 4IUGA 2VX6A 3W25A 4NI3A 2OWWA 1E4LA 1GOWA 3M6DA 5IXEA 1LJYA 3O2LA 4PN2A 4D1JA 4W85A 3ZT6A 3W6MA 3PTQA 1ISWA 1O6IA 2BY3A 3AMDA 1V03A 2J8GA 3BMVA 1J0IA 3OBAA 2Y8VA 3WFZA 4BQ4A 1HP5A 3ZJ6A 2WPGA 1NWSA 4H41A 2ZE0A 1OD8A 2J7CA 4PSPA 1UD2A 3AROA 2BVYA 1NOUA 2DEPA 2QV4A 1JI1A 5A95A 4ACZB 1H0GA 1C8QA 1KGWA 2ZXDA 2V5DA 1M03A 4NZCA 2V3EA 3O9NA 1W9BM 2DT3A 4GO9A 4J27A 1GQJA 5BXPA 4HA1A 1W9VA 2OLHA 3ARPA 3DHUA 4UZUA 1TE1A 3SUSA 3ZO9A 3M7SA 3WNPA 2E0PA 1BYBA 3WQ8A 2XHYA 3F5LA 4PMDA 4EAMA 3F5KA 3W29A 2CKRA 2E40A 1V3JA 2D2OA 3WNNA 3NUKA 2YA2A 3CMJA 1QI3A 4J3SA 5CSYA 1WDPA 3EDKA 3CPUA 1E0XA 4PMZA 2UY3A 3OLGA 4D71A 3CMGA 2D23A 1ISVA 3W38A 3CUIA 5CLWA 3PBGA 3AMKA 4LGXA 3HJEA 2IXVA 4AZGA 3I3DA 2X05A 1KWKA 3EBVA 1EOKA 2VX4A 4JFSA 4M80A 4W89A 2WMKA 1GNXA 1HVXA 2ZX6A 4AZ7A 2WC4A 3W82A 1OINA 3WEOA 3WDPP 4GO8A 3W81A 3SCUA 4U3AA 3F4VA 1NOFA 2NW0A 2DIJA 2ZX8A 3NJ3A 5D9MA 2BVDA 1W1TA 4QLLA 2WC3A 4PMYA 1KQYA 3POCA 4D1IA 3JUGA 3N15A 3QOMA 1E73M 1H2JA 3GNPA 1ODZA 1FFRA 1V0MA 3QOKA 3WSUA 1G0CA 3FW6A 1HJXA 2VMFA 2WSKA 3PZIA 2W62A 3RCNA 3AS0A 2VRKA 3AYRA 4GXPA 1JAKA 1W2VA 2WMGA 3W24A 1C8XA 3AQUA 4M82A 4UZSA 5AYIA 3KL0A 3ZOAA 3ARSA 1XRVA 4YPJA 1J0YA 1J9YA 4AD1A 1JYNA 2WXDM 3TA9A 1W3LA 4AD4A 2BVTA 1QBAA 1CENA 1QOXA 1AMYA 2O92A 3TTOA 1CBGA 4FLOA 3WQWA 1SMDA 1UD5A 1E4NA 3VGEA 2DIEA 1MWOA 1EDGA 4E4PA 1UKQA 4AIUA 5D4YA 2PBGA 2WVTA 1VFOA 3RM9A 3EDFA 1UR2A 2XJ7A 3VIGA 2DT2A 3OZOA 2VJXA 4M8UA 3WNLA 2E9LA 2HVMA 4FLSA 5HPCA 3L4UA 2W63A 3U7VA 4H8UA 4KH2A 2JF6A 4TTUA 3VVGA 1US3A 1FP8A 1EOMA 3N04A 2VVNA 1RH9A 4U33A 5IFPA 4YHGA 3VO0A 2DH3A 2BY0A 2G3JA 4AEEA 1CLVA 1E15A 1JNDA 3PTMA 2BHYA 3NDZA 3WDHA 3GYCA 2Y5EA 3GXIA 4WSKA 4CVWA 4P7QA 2PWFA 4AMCA 1GQLA 4ATLA 1XGZA 1XHGA 3AXHA 2D3LA 1QNRA 3L4TA 1B31A 1TR1A 3CHFA 1ZJBA 5BCAA 1JF6A 1V3KA 1G01A 3AXXA 1C3FA 4JFUA 3T2OA 1CLXA 1NP0A 3N11A 3VNZA 2VZUA 1KXQA 1C91A 2ZWZA 3W6LA 1OSEA 2C7FA 2OSXA 2WYSA 4CN6A 2FHFA 3T0DA 1UH3A 3ZSTA 1VJZA 3CH9A 2J62A 2V38A 1MFUA 1W9UA 3EYPA 4H7VA 1UWRA 1OWQA 2DSVA 1HJUA 2WMIA 2J74A 2J7BA 2DSUA 2UY5A 1HKIA 1KCKA 2WCGA 3ALFA 4BQ2A 1U2YA 5GNXA 5M03A 4DWSC 3CZ8A 4P8XA 2ZX7A 1BVNP 1XSJA 1D2KA 5FCZA 2OSYA 1E4IA 4D6CA 1HF6A 1GONA 4W5ZA 3AYSA 4MNLA 4PMQA 5LA0A 4UQAA 4UQ9A 1LG1A 2AMGA 4U3CA 3TOPA 1UD4A 3B9DA 4A3YA 4PMVA 2DQXA 4PMNA 1AQHA 3CZGA 1VIWA 3RO8A 1QI0A 4FLQA 3S6TA 3IANA 3AHZA 2WHKA 2WZEA 4JL2A 3AHTA 2VX7A 4MB5A 3FHAA 1TMQA 1BPLB 2O9TA 5CQ1A 3CHDA 3N18A 3AMCA 1KBBA 2WVVB 3UEQA 4HOZA 2QF8A 1TVNA 5E09A 3VILA 2VI0A 2CERA 4B9YA 1Y7VA 4LX4A 3I3BA 3RIKA 2FHCA 1DWHM 5E0CA 4B9ZA 3UCQA 1VBRA 4ZXOA 3EMZA 3VUPA 4WLCA 1MYRA 4CCCA 1Q4NX 1KB3A 4QCEA 1VFFA 4JFWA 1PZ3A 2WWCA 4CN4A 4PTVA 1E40A 3SCSA 4J3WA 1OBAA 4URIA 4F9DA 1HVQA 2EPOA 4HPHA 5BROA 1KWGA 4E8CA 2JIEA 3CUGA 3RPMA 1UWSA 3WUBA 3APGA 1MVYA 3LPPA 1LLOA 1W3KA 4ATDA 5BXRA 3T09A 2WHMA 2D22A 2Y24A 3WNKA 5HNNA 1DWIM 1E0WA 2Q8XA 3VMPA 5BWFA 5CPQA 2E8YA 4AXNA 2XVKA 4CU8A 3UESA 2XUCA 4V27A 2FH6A 2EPNA 3UG3A 4BA0A 1JXKA 5F7UA 2QPSA 1H4PA 1JIBA 3VIPA 2CBUA 3WH8A 4JZ5A 1A3HA 5IHRA 2BNJA 3I3EA 4IISA 1NQ6A 5A94A 2FGLA 4UFLA 1CNVA 5A8PA 2BHZA 2PB1A 1BF2A 3VTRA 3QHOA 1W1YA 1KGUA 3AJ7A 3G6LA 4W86A 1E5NA 3VU2A 2G3MA 3WF4A 1EO7A 5A6MA 4N0RA 4PMXA 4AD0A 1KR1A 4ZE4A 2GSJA 2J25A 2EPLX 2WLYA 1E71M 1W2PA 2JF7A 4V2XA 4Z2HA 4C7FA 4UFMA 1TUXA 2CBJA 5CG0A 5A69A 3ECQA 2PF0A 1HJWA 4AZ5A 3AHYA 2ZXQA 2JEQA 5CGTA 3WD2A 3L2MA 1BVZA 1E6ZA 1HT6A 3FXYA 5EFFA 1EH9A 2BS9A 4AZ6A 1QHPA 3AFBA 1JYVA 4Y7EA 2WZHA 2C0HA 3TP4A 3A6OA 3BH4A 2YBUA 3TTYA 1OGBA 3WBAA 1NOWA 4J3VA 2EPMX 5CLTA 1ZB5A 3WENA 1MXGA 2HISA 1I1WA 2WNWA 1B2YA 3VINA 1CXKA 2RGMA 2F2HA 2XFYA 4JIEA 3WMCA 2XIBA 3OLIA 3BAIA 2BV9A 4H8HA 4LYRA 3NYDA 2V5CA 1Q6GA 5A2AA 4BS0A 3WBEA 2W66A 1J12A 4JHZA 3VNYA 3KZSA 1FP9A 1J01A 1UKOA 5JIWA 3CIVA 3T0BA 1JL8A 1CZ1A 1TFVA 4KGLA 3BSHA 4JKKA 5JBFA 1JZ7A 2XM1A 3VDCA 2JFEX 3POHA 8CGTA 1V6UA 3W0KA 5LA2A 3WD3A 4GZIA 1GOOA 2YL5A 5HXMA 3ZM8A 1PIFA 4MJ4A 2DSKA 4ATWA 4GPNA 3WMSA 4PTXA 4AW7A 1WDSA 3ZMRA 3VGFA 3CGTA 1HNYA 3S2CA 3TTQA 1JI2A 2WZIA 3FNDA 1X6LA 2OYMA 2YOCA 3KE0A 2X2YA 4X9YA 1LG2A 1ZBKA 3WH9A 4PTMA 3GH5A 2Y2WA 2CIPA 2J8FA 1O7AA 4XZBA 3BAYA 1F4AA 3VM7A 2WC7A 2YDQA 1HX0A 1VEOA 1H3GA 3OB8A 5CGMA 3WDQA 4DUVA 1D7FA 3SCQA 4OBSA 4LYPA 3ARRA 1B3XA 1GQIA 3WF3A 1K9FA 3MMWA 2Y4SA 3ZJKA 1GQKA 2ZOXA 5I24A 4Q7NA 2WBGA 4D6GA 4A3HA 2EPKX 4J28A 1W3JA 4KRUA 1CWYA 3L4XA 4HTYA 3VDHA 1MXDA 3THCA 1G9HA 4CN1A 4KMQA 4HOWA 1Q6DA 3BAKA 1UWQA 6A3HA 3CBWA 3VOCA 3WD4A 1JDDA 1GUVA 3AI0A 5IDIA 2WKGA 1CXIA 5I79A 3WFLA 1PIGA 1QVBA 4NSBA 5FKYA 4U2YA 3A4WA 5DO8A 3AIQA 1UUQA 2DGAA 2WHJA 3MS8A 4QP0A 1HJQA 3AS3A 1UR9A 1VF8A 3VD5A 1WCGA 4WKFA 5FD0A 4UQEA 1QI4A 2VL4A 4JFTA 3VMNA 5BRQA 3UG4A 1UWIA 3SCPA 5GNZA 3PZVA 1FH9A 1I1XA 2YA1A 3RJXA 4EE9A 2VZTA 1G94A 3SEPA 3ZR5A 1QNQA 4D6JA 4YHEA 3A3HA 2D3NA 3QGVA 2J7FA 4OOZA 1J0JA 3WNMA 3CHCA 3UR8A 1CEOA 4UTFA 3SCRA 2X0YA 2A3BA 1JDCA 2WSPA 2W4XA 3QHMA 3VD7A 2XGBA 2IUZA 2WVVA 1J11A 3ARXA 4QFUA 3CUHA 3ZQ9A 5ABEA 1OIMA 1V6WA 2WHLA 3MUZ1 4PMUA 2VQUA 4U5KA 4PMOA 3LMYA 1XH2A 2DSZA 4AIOA 3GDBA 4DUXA 1B3VA 6CGTA 1GW1A 3BLKA 2XVGA 4U31A 4U2ZA 4MNKA 4TOQA 3D5HA 5C71A 1LWHA 4DUWA 2TAAA 3MMUA 3SUTA 5I0DA 1BYCA 1M53A 4QLKA 1EDQA 2G8ZA 4OOUA 1IV8A 1VFUA 5A6AA 2XTKA 3MUAA 5E70A 2YLLA 4P7RA 2ZWYA 3L2LA 3DYMA 1US2A 4PCTA 1EQCA 3RJYA 2DT1A 1UA3A 1GOQA 1BLIA 4WKAA 1L8NA 2DT0A 4N42A 2BXYA 3AIBA 3GNOA 4PCSA 4CVUA 3B9AA 2E4TA 3OGVA 1GZJA 5CJ5A 1FA2A 3NDYA 4R5EA 5AY7A 4DWSB 2X0HA 5CPSA 2QHAA 1M7XA 4GI9A 1TCMA 1BSIA 1UR4A 5A6KA 1UD3A 2V3DA 1NWRA 3M07A 2G41A 2CHOA 3WH7A 4AD3A 3T2PA 1JZ6A 4JKLA 1QHOA 2EXOA 1SMAA 4D6HA 4MNMA 4XUYA 1V3HA 3WDIA 2WCAA 1WNOA 4FLRA 1BFNA 2WK2A 3CUJA 3SCWA 3ARQA 4ZE5A 2VO5A 3KL5A 4H8VA 2XFRA 4P7NA 4TX6A 5E9AA 4Z2LA 7A3HA 1JAEA 1WDQA 3IK2A 1XCXA 4AIEA 1H0IA 1E6PA 1OCQA 5D9NA 1JF5A 3AMLA 3AOFA 2O9PA 2YDRA 2EO7A 1UR8A 4Z2JA 5A8NA 3VX1A 5C8BB 5I78A 2VVSA 4MAZA 3PTKA 1JYXA 4W8BA 4PBGA 1WO2A 2BY1A 1DWFM 3PZUA 5GPRA 4XX6A 2UY2A 2J77A 1NWUA 2WMHA 1TA3B 2J78A 4AY1A 2PC8A 1JFXA 2OYKA 3WD0A 1I75A 1JFHA 2WB5A 3WELA 2ZUMA 1QW9A 3AS2A 3UG5A 4GKLA 1MW1A 1B90A 2ZUVA 2ZX9A 2ZUUA 4HMCA 4PTWA 3TONA 4Z2GA 3EMCA 3W37A 4H2CA 1NM9A 2CHNA 1PZ2A 2FH8A 3WY1A 3K8KA 3W27A 3DYOA 4BZYA 1H11A 1Z32X 4WJXA 1EIBA 4AZCA 2VRJA 2YL9A 1S46A 3MUY1 1OT1A 1NWTA 3FAWA 3MUIA 4W88A 4OJYA 1E43A 1GHRA 4D6DA 3GM8A 1CPUA 2XPKA 1JDAA 3FAXA 3KEHA 1FFQA 1HXJA 2RGLA 1CDGA 3DC0A 2QLYA 2GJXA 3MMDA 4YN5A 5ABGA 1IZKA 3MV01 1KBKA 1UOKA 4P7OA 2DSWA 1ZU8A 3ZJ8A 2E8ZA 5LYRA 3MO4A 3SIMA 4D6EA 1J0ZA 4PUDA 1BQCA 1W1PA 2D0GA 2J7HA 2ZICA 2X09A 5HBFA 4M1RA 1YHTA 2X8RA 4L4PA 1E6NA 3BAWA 1JZ2A 1VJSA 1WPCA 1KR0A 2ZIDA 3VPLA 4D72A 1KQZA 5DT7A 3GNRA 2W5FA 3WUGA 2B31A 3AHVA 3PZGA 3WDRA 1GOIA 1XYZA 2UY4A 3PN8A 4S3JA 2WMFA 4AZIA 4ZEPA 3WEMA 3DECA 3WH6A 3U5UA 3L4VA 1PJ9A 1XYFA 1UQYA 2WM0A 1CGXA 4ACZA 1V0NA 3G6MA 1B3WA 1V0LA 2VR5A 1WAWA 1KXTA 2CCRA 1V6XA 3WF2A 1LWJA 3BAXA 5EB8A 5C70A 1R85A 3GXMA 5BXTA 1BG9A 4F66A 3BC9A 2ESCA 4TUFA 4AYSA 5I5RA 4W84A 3AIUA 3VGHA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 5DFA A;  1MW0 A;  4PRW A;  4H04 A;  2CBV A;  1KXV A;  5DF0 A;  5IFT A;  2D24 A;  3PZO A;  1E0V A;  4V28 A;  1AVA A;  5E0F A;  1UA7 A;  3L4Y A;  1A47 A;  3AIE A;  1HL8 A;  4AD5 A;  2W92 A;  1KFW A;  3W4R A;  1V6Y A;  1PPI A;  1CGW A;  3AS1 A;  9CGT A;  2GJX B;  4EAN A;  4MJ2 A;  1BHG A;  2GK1 A;  1V6V A;  3B9E A;  1B9Z A;  5D8W A;  4UFJ A;  3HU7 A;  5D8Z A;  3VIM A;  3BCD A;  2G3N A;  4XB3 A;  3ZT5 A;  3SCV A;  4X0N A;  2CYG A;  3NIY A;  1PX4 A;  4HU8 A;  2GUY A;  2XVL A;  3WUE A;  5BYW A;  4FK9 A;  3GXF A;  4IUG A;  2VX6 A;  3W25 A;  4NI3 A;  2OWW A;  1E4L A;  1GOW A;  3M6D A;  5IXE A;  1LJY A;  3O2L A;  4PN2 A;  4D1J A;  4W85 A;  3ZT6 A;  3W6M A;  3PTQ A;  1ISW A;  1O6I A;  2BY3 A;  3AMD A;  1V03 A;  2J8G A;  3BMV A;  1J0I A;  3OBA A;  2Y8V A;  3WFZ A;  4BQ4 A;  1HP5 A;  3ZJ6 A;  2WPG A;  1NWS A;  4H41 A;  2ZE0 A;  1OD8 A;  2J7C A;  4PSP A;  1UD2 A;  3ARO A;  2BVY A;  1NOU A;  2DEP A;  2QV4 A;  1JI1 A;  5A95 A;  4ACZ B;  1H0G A;  1C8Q A;  1KGW A;  2ZXD A;  2V5D A;  1M03 A;  4NZC A;  2V3E A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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