3QXMA

Crystal structure of human gluk2 ligand-binding core in complex with novel marine-derived toxins, neodysiherbaine a
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
250
structure length
250
Chain Sequence
RSLIVTTILEEPYVLFKKSDKPLYGNDRFEGYCIDLLRELSTILGFTYEIRLVEDGKYGAQDDANGQWNGMVRELIDHKADLAVAPLAITYVREKVIDFSKPFMTLGISILYRKGTPIDSADDLAKQTKIEYGAVEDGATMTFFKKSKISTYDKMWAFMSSRRQSVLVKSNEEGIQRVLTSDYAFLMESTTIEFVTQRNCNLTQIGGLIDSKGYGVGTPMGSPYRDKITIAILQLQEEGKLHMMKEKWWR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Binding and Selectivity of the Marine Toxin Neodysiherbaine A and Its Synthetic Analogues to GluK1 and GluK2 Kainate Receptors.
pubmed doi rcsb
molecule tags Membrane protein
source organism Homo sapiens
molecule keywords Glutamate receptor ionotropic, kainate 2
total genus 82
structure length 250
sequence length 250
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-03-02
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3qxmA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3qxmA02
1DTZA 1Z7ME 3L6HA 3GBBA 4HTGA 4EXKA 1O7TA 3ECRA 4OQOA 4JWXA 2O68A 4XXUA 2HAUA 3TELA 3TODA 5CM6A 2Q2CA 2PMSA 2V3QA 1SD3A 2O7UA 2VD3A 5FTIA 1CE2A 4G77A 3CG1A 4F2OA 4ISUA 4QFNA 3K02A 3K1PA 4IO7A 2E1SA 5A5XA 3IOVA 5CBRA 4K3FA 1WVJA 4F3BA 3CRBA 1MPCA 1B7ZA 2DE2A 4JXIA 3PUYE 2P2AA 1MDP1 2XXRA 3MP8A 1SBPA 1DPPA 5CMKA 1B4HA 4N07A 3R26A 2I58A 2G29A 1JVYA 3K4UA 3K1MA 3PPOA 4YB7A 5L9MA 3PD9A 5L9OA 5TP9B 1AMFA 2Z8EA 4O3AA 3Q29A 3PUZE 5H8QA 2ONSA 1JW5A 3R6UA 3QUFA 4X1BA 3KJTA 1Z7NE 5HBCA 3LSLA 2P0SA 3LBSA 3CR9A 1LAHE 1MXYA 2H99A 2Z22A 3Q26A 4R9GA 1MXUA 4MLQA 4GL8A 3ONMA 2DSFA 1LAGE 4GL0A 2OZZA 4R74A 2ZYOA 1MQHA 5JTYB 4LZ5A 2V3UA 1MG1A 2ZYNA 4POXA 1MPDA 4KQPA 4RA1A 1GGGA 1Y3NA 4DZ1A 1R6ZA 2DXRA 2NOOA 3ZKKA 1TFDA 2R71A 3K6XA 3MJNA 5FTHA 1QUKA 2THIA 3FIRA 4IY5A 3PV0E 2H25A 4RXLA 3V83A 3OMBA 1ZTYA 5KDTB 5DVJA 4GVOA 3ILUB 4IO3A 3TEPA 1SDXA 3K01A 4GXSB 3TTNA 4ZEBA 1IZ1A 2E0SA 5H8FB 2KLFA 1ZU0A 5L9SA 4KYEA 3T22A 4FAJA 2F36A 2ZNUA 1N76A 2Q9TA 4NMYA 1EZOA 3CG3A 4MFIA 4ZS9A 1A99A 5CMMA 4EQ9A 3O97A 4R72A 5I57B 2I48A 1B5HA 3C9HA 1MXXA 1OQHA 1SI1A 1NNPA 1B7HA 3CIJA 2QS2A 4OZ9A 2GHAA 4H5GA 3I5OA 3H6WA 2VGQA 2NVUB 3BKIB 3RPWA 4F3GA 2V84A 5BWJA 3UA8A 3DP8A 1SYHA 4ZEFA 3MW0A 4JB7A 5DTBA 3QXMA 1LFHA 2XD2A 1S9TA 2O51A 2F7AA 1YPNA 1M5FA 2QS4A 5DT6A 4ZE9A 1MQDA 1MY3A 2DE3A 2D3IA 3TPAA 1UIVA 3BFTA 4EDPA 1UTBB 3MQ9A 1MQIA 4ELOA 1FQBA 3HV1A 5L8DA 2XXPA 1I69A 5TP9A 2X7PA 4LQ2A 2GHBA 3MVWA 2DWIA 3H6VA 1AIVA 5AA2B 5M2VA 4H6DA 4RYAA 1PEBA 4MLVA 2AYSA 3KN7A 5AA1A 1N04A 4R73A 4OFLA 2XXWA 4OFOA 4PFYA 5ELVA 3G3KA 2RC9A 4EQ7A 1YAEA 2I4CA 1P1OA 4POWA 2H9BA 1B0LA 3S4UA 1DPEA 1LLSA 2DWHA 4R75A 3G7WA 3TZAA 1LCTA 1P1QA 4RPOA 3E9XA 5JTYA 1VSOA 4OYVA 2F78A 4DE8A 3A3UA 1MDQA 1S50A 3QUJA 4FIMA 3B6TA 4TLLB 4C1TA 1EZPA 5AA2D 4FORA 4G8MA 3B7DA 3JZJA 4H8IA 4IB2A 1VE4A 5EYFA 3SERA 3TFLA 4GLIA 5AA4B 3F11A 1USYH 3K1NA 3OSQA 1DOTA 5KDTA 4OEUA 5KZTA 2DS9A 1QKAA 1IEJA 5H8FA 1J1NA 2ZNTA 5ITOA 1I6AA 3QSLA 1ANFA 3RT6B 5H8NB 3SEYA 3UORA 3H7MA 2DQVA 1B5JA 1MM7A 1A8FA 2O84X 3O9PA 1B51A 3HSTA 4RPNA 1B6HA 3IR1A 2DVCA 1OIBA 3KSXA 3D4CA 2P1SA 4MF3A 4NF8B 4TQUQ 4OERA 5I57A 3O2AA 2F97A 2I4BA 3G3HA 4FECA 4F3PA 3FGSA 5CC2A 1N3XA 2A5SA 3W15C 2Y7IA 4YB5A 2XXXA 4YICA 1D3KA 2OWTA 3MPKA 3VLWA 2F35A 3IK6B 4ONYA 1GV8A 3O28A 1DTGA 1R9LA 4U22A 3TAJA 3PMWA 4GF8A 3DP4A 1KWHA 4ELPA 2XX7A 3BFUA 5CBSA 2IA4A 3Q28A 4F1VA 1D4NA 4LZ8A 3MUQA 3QYTA 3KOTA 1BIYA 3C32A 4BLAA 2UVIA 1FCKA 4DXUA 1LFGA 4LONB 3PUWE 3MVYA 3FATA 5HM4B 3DELB 2ONKE 4XKRA 4NEDA 4QFKA 4F3SA 1UTBA 2OBGA 4JBZA 1N0TA 3SEUA 2F5XA 2OK2A 1ZIUA 3SESA 4GOTA 1TWYA 2OLBA 1QUJA 2OCUA 2QS1A 1URGA 2QSXA 5FHOA 5JEIA 1JW1A 3TTLA 5AA2A 2ZMBA 1HSEA 5I59B 3PGFA 1D9YA 4F22A 2R6GE 1EZ9A 1USYE 5J1DA 3BBRA 1N84A 1B7UA 3OSRA 2WKYA 2IEEA 3K6UA 1MY1A 3CFZA 2UYFA 3HO7A 4HCWA 4G8HA 4U2RA 1NNTA 3T96B 1Y1ZA 1L5TA 3H4ZA 1FTMA 4PE5B 4RK2A 3EF7A 1I6QA 4KCDA 3SKPA 5IAIA 5TU0A 1PB7A 2PT2A 2V3TA 4P0GA 3THIA 2DE4A 3M3FA 1PB9A 5AA4A 4BDRA 3TTMA 1SQYA 3KEIA 5CMBA 2F8DA 4Q0CA 4FJPA 3C34A 3DP6A 3TQWA 1RYOA 1GR2A 3RN8A 2PVUA 4QHQA 4ESXA 1NNKA 5B70A 3SEXA 4PFTA 3MPLA 3UK4A 2I0CA 5H8NA 2O7IA 3OO7A 1H76A 4IO6A 4IO4A 5BUUA 5ICTA 1SW4A 4PFUA 3IB0A 3FVOA 3G3GA 4NE4A 3TKDA 4NF8A 4AB6A 5IKBA 3MVXA 2DXYA 4F1YA 3MP6A 4P11A 2Z8DA 3KGCA 4OENA 3T9VA 3TCHA 3W9VA 1XT8A 2UVHA 1SW1A 3WAFA 1FW0A 1Q1KA 4U1OA 3RLFE 1M5BA 3FJ7A 3FVGA 1JVXA 1ZJLA 1DSNA 3FD3A 5DEXB 3VFJA 4F1UA 4QRZA 4EUOA 3FV2A 4IGRA 1II5A 5DYHA 4X48A 5K2XA 1OVBA 4F39A 1BKAA 3IOTA 3ZS6A 4GWOA 3Q25A 1NFTA 4YKIA 3CSBA 1TXFA 4YU0A 4TLMB 4F18A 1PDAA 4WEPA 1LBCA 2ZXTA 3E3KA 2GFEA 2XHDA 4H67A 3TMGA 3VXBA 3K6VA 3KJ7A 5ITPA 4I62A 4OFJA 1Y3PA 3U1OA 4TOZA 3FUZA 4KI0E 4ZEKA 5I59A 1NH7A 1B1XA 1I6BA 5I56B 2PYYA 3MP1A 4LZ7A 4XKQA 2NWJA 3KZGA 1ATGA 3T9UA 2XXIA 1P1UA 3EHSA 4GIZA 2DWJA 3EQ1A 3TCGA 4PETA 4IGTA 2DVZA 1A8EA 4JSOA 2F7BA 3G3JA 4YZZA 3QK6A 4JWOA 3V5AA 4FE8A 1B32A 1FTKA 1N7XA 3LUYA 2M8CA 1XVYA 4OVJA 1UIUA 1RKMA 4KFQA 2VHAA 4JSDA 1FQDA 1NMUA 1MRPA 3O6GA 2D21A 4ESWA 3KN3A 4O3BA 1ZKBA 2X7QA 4G2ZA 3KBRA 1O64A 1MM6A 4NF4B 3PD8A 1O63A 4IO5A 4Z7EA 4QSCA 4RNSA 3JYRA 2RCBA 1TT1A 3FASA 2RKMA 4KD5A 2FA7A 4H65A 1P99A 1XVXA 4G4PA 1PB8A 2VOZA 3ODBA 3PMXA 1LAXA 3GLBA 4Q30B 1MS7A 3FVNA 3H03A 4THIA 2F6PA 4KYDA 1B1HA 4QSDA 2HXWA 3GXAA 1QJMA 4GQOA 3RY3A 2F34A 4M4GA 1VR5A 4IY6A 3N94A 4BDOA 4U23A 1LB8A 3V89B 3O66A 5ISUA 3TYHA 1IXGA 2F6GA 4YKKA 3FZVA 2AIXA 2RINA 3DM0A 3I6VA 1B52A 3VVEA 1SI0A 5F1QA 3IORA 3OO9A 1URSA 1MY4A 3MVZA 5DEXA 1Y20A 1ZMGA 5H8HB 1LGBC 4QSEA 4OHNA 3OXNA 3T9XB 3W9WA 5I58B 1SW5A 4H8JA 1MQGA 4ECFA 2A5TB 1F9BA 1OVTA 4QFOA 3IJXB 1MQJA 4RY1A 2V25A 2Q88A 1AH5A 3PUXE 3B6QA 2NUVA 1QUIA 2YLNA 1A7LA 4BDMA 2GH9A 1DMBA 3N26A 3EHTA 2QL3A 1H44A 2QJEA 2X26A 4WKMA 1XOCA 1FTOA 3ILTB 3Q27A 3A3CA 4WEDA 3PPQA 5TPAB 4U21A 4Q8RA 3GZGA 2O6AA 3USDA 1BP5A 1HSLA 1M5DA 2XXTA 3MBPA 5I56A 2UYEA 5JK4A 2REJA 3OOAA 3M8UA 4ZDMA 1FQAA 4F31B 4XTCQ 3P7IA 2D5WA 3IAZA 4I9DA 1JQFA 1QULA 4XIGQ 1ZBMA 4KCCA 4NWDA 4DIGA 3G3FA 2HAVA 1UQWA 5DVIA 3JV9A 1MXVA 4YAHX 4I8CA 2ESNA 1Y9UA 2ABHA 4ZE8A 2ONRA 1B3FA 3HHFA 1CB6A 2O69A 3M3KA 3CFXA 1PC3A 3CVGA 3N6UA 4QFPA 1B3GA 1MPBA 4H1XA 1MXZA 3H06B 3CFLA 4E0XA 3IOUA 4G68C 3U8QA 4NF4A 1MH3A 1IXCA 3EPEA 1MXWA 1IIWA 3O6IA 3DLNA 5AE4A 3EHUA 4GRKA 4QF9A 3VXCA 3KFMA 4LQ5A 5I2NB 4H5FA 4DCYA 2G93A 2QPQA 1LSTA 1Y1MA 1B40A 4G8NA 1PBPA 1POY1 4OETA 2HCAA 4RJZA 1SYIA 1NKXA 5EHSA 1LAFE 3MAMA 4U4XA 5LOMA 1B3LA 3VDFA 4L17A 2ANJA 4YMBA 3T93B 4C0RA 3AXFA 1B4ZA 1Y3QA 3UIFA 2VD2A 1URDA 1B3EA 2H98A 3K00A 2ZNSA 2VP1A 3FV1A 2O1MA 4LP2B 2HZKA 4R6YA 3MWBA 3H6TA 5I84A 1PBQA 4XKPA 5H8HA 1JW4A 2V93A 5I58A 4PP0A 2UVGA 1P1WA 4R9FA 3RT8A 2A5TA 3RQTA 3HHGA 2PBWA 1XHYA 2XD3A 1MH4A 4R6HA 5FHMA 4ZEIA 3VVDA 4IO2A 1US5A 4AQ4A 1EH3A 4FATA 1B46A 1GTKA 1NH8A 3SEWA 4I1DA 3LC8A 4OTEA 3FJMA 5TPAA 3RTFB 1UTHB 4H0WA 5I2KB 2Y7KA 4ZECA 3SETA 2Q8JA 2I3WA 2XXUA 3S9LC 3IOWA 3I3VA 2RCAA 3VLVA 2DOJA 3LSWA 5FHNA 4FEDA 4NF5B 4O3CA 1US4A 3VVFA 1JNFA 3OEKA 4JDFA 2H4IA 3D4GA 4UACA 2CMOA 3LSFB 3U92A 2QMWA 4X1DA 3CI8A 1D9VA 1FQCA 1QVSA 5K2YA 1B2HA 2QMXA 1FTLA 1H3DA 3SEVA 4WXJA 3IX1A 3PMVA 4OMBA 1BLFA 2F7CA 5I2NA 4ZEDA 3ZSFA 5EHMA 5ICQA 2H5YA 5HPQA 3RNNA 4NF6B 4YKPA 4BDLA 3MC2A 2FNCA 4Q5TA 4UA8A 3PPNA 1QKBA 3H3GA 3S9MC 4R6KA 3O6HA 2XXQA 1B0HA 4DXBA 5AA3A 1ELJA 2I0BA 2R9JA 3TCFA 3EN3A 4E0WA 1TFAA 2B65A 3OELA 3A09A 1B58A 1RYXA 5F7VA 3N6TA 1OQGA 4ZZEA 1JEVA 3C4MA 1XS5A 1LFIA 1H45A 4GD5A 4LA9A 5CMCA 4U4SA 1R1NA 3FXQA 1A54A 4Z0IA 1T0KA 4N13A 4YMAA 3FXRA 1B5IA 2XXVA 3VLUA 2Q2AA 4EF2A 2PT1A 2REGA 4LVQA 3U94A 3CSGA 5KCJB 3L6GA 3HPIA 4DCXA 3C33A 2Y7PA 4PFWA 3OO6A 1HSJA 2AL5A 2B3FA 2PX1A 4BDNA 4KYSA 4ELRA 1OMPA 4F2QA 1IXIA 4HS7A 2XX9A 1IQ7A 1OLAA 4QFLA 1FQFA 3K6WA 3S9EA 3LSXA 2XXYA 3OENA 3SDFA 3FJGA 3RGYA 1VFDA 3KSJA 1LBBA 2DYXA 2ZYKA 1BTJA 1A40A 1UTHA 5I2KA 3LR1A 1M5CA 4G68B 1NNFA 5CRYA 2AL4A 2BJJX 4R2FA 5DVFA 4LATA 3PPPA 1ZLQA 3PPRA 2I6EA 4DXCA 1B9JA 3TUSA 1YTVA 3VE1B 2GRVA 2Y7WA 1FTJA 5CI5A 2RF1A 4F29A 3R7XA 3V8XB 4GXAA 4ZZAA 3IO6A 1N3WA 4NF5A 1NL5A 2Q89A 3K0VA 3KOSA 3ZKLA 4BDQA 1MY0A 1JETA 4C1UA 2HFBA 4KPTA 2RC7A 3C35A 1H43A 1SW2A 2OWSA 4DDDA 4GFRA 1JEUA 3M3LA 4YB6A 4JWYA 1AOVA 2O1LA 1LB9A 3OD7A 2ZYMA 4EQBA 1EU8A 4N6PA 5H8SA 3K2DA 1GVCA 1B05A 4DLDA 2YPNA 3TTKA 2I3VA 2Y7RA 4P0IA 3IO4A 1VFEA 3PU5A 2CZLA 4R2BA 4NF6A 4OESA 3IJOB 2DWAA 5A5XB 4OXVA 4U1ZA 1POTA 3N5LA 1FQEA 2Y84A 4F19A 1IXHA 2XXHA 3MZBA 2UXAA 3MZ9A 3WAEA 3OO8A 1YCJA 4OEVA 1SVXB 4HCYA 3T66A 2ALUA 3IB2A 4ND9A 1S7YA 2UVJA 4M1VA 4MBPA 2QS3A 2RC8A 4RK9A 3B6WA 5H8QB 1WDNA 2I49A 3E4RA 3RUMA 5KCJA 4EF1A 3PUVE 3FVKA 3KG2A 4PQJA 4YKJA 3QAXA 1B3HA 1XC1A 3S2VA 3QIMA 1Y4CA 4KHZE 3H6UA 1R9QA 4AB5A 2HEUA 3IB1A 4OWDA 3TQLA 2QRYA 3U72A 3UP9A 3TDJA 4ELQA 3KN8A 2W7YA 3UN6A 5B7DA 3FXUA 3RTWB 1Y4TA 3HCQA 3MZ1A 4X9TA 2Z23A 2HQ0A 3HN0A 1M5EA 3GBAA 1IITA 1N7WA 1QW0A 3O29A 1OLCA 2NXOA 4XKNA 4FEBA 4MH5A 1P1NA 2B3BA 4EXLA 3UGWA 1MY2A 4HW8A 4NTLA 3U93A 2DP8A 3T9HB 2OJTA 1AL3A 2HZLA 4G68A 3VV5A 2YJPA 4KR5A 2XX8A 3S9NC 1Q35A 4NWCA 2Z8FA 3TTRA 3G3IA 4LUBA 3IL1B 3C36A 2FYIA 2LAOA 3C31A 1IUDA 1WODA 1A55A 3OEMA 1LCFA 3E13X
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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