3R4UA

Cell entry of botulinum neurotoxin type c is dependent upon interaction with two ganglioside molecules
Total Genus 99
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
99
sequence length
428
structure length
422
Chain Sequence
SMANINDSKILSLQNRKNTLVDTSGYNAEVSEEGDVQLNPIFPFDFKLGSSGEDRGKVIVTQNENIVYNSMYESFSISFWIRINKWVSNLPGYTIIDSVKNNSGWSIGIISNFLVFTLKQNEDSEQSINFSYDISNNAPGYNKWFFVTVTNNMMGNMKIYINGKLIDTIKVKELTGINFSKTITFEINKIPDTSDNINMWIRDFYIFAKELDGKDINILFNSLQYTNVVKDYWGNDLRYNKEYYMVNIDYLNRYMYANSRQIVFNTRRNNNDFNEGYKIIIKRIRGNTNDTRVRGGDILYFDMTINNKAYNLFMKNETMYADNHSTEDIYAIGLREQTKDINDNIIFQIQPMNNTYYYASQIFKSNFNGENISGICSIGTYRFRLGGDWYRHNYLVPTVKQGNYASLLESTSTHWGFVPVSE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title The biological activity of botulinum neurotoxin type C is dependent upon novel types of ganglioside binding sites.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Botulinum neurotoxin type C1
molecule tags Hydrolase
source organism Clostridium botulinum
total genus 99
structure length 422
sequence length 428
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.4.24.69: Bontoxilysin.
pdb deposition date 2011-03-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07951 Toxin_R_bind_C Clostridium neurotoxin, C-terminal receptor binding
A PF07953 Toxin_R_bind_N Clostridium neurotoxin, N-terminal receptor binding
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 3r4uA01
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 3r4uA02
1SLAA 5DUYA 4X39A 4C1XA 4Q8LA 1FATA 1UL9A 4LO1C 4LBJA 1VAVA 3HBWA 3UD9A 1MS4A 4R6UB 1WLCA 1W6NA 3OJVA 3PVNA 4C1WA 2LIEA 4LO7B 4AVTA 3O4AA 1SBDA 4H9WA 4M3CF 2DVBA 1AVUA 4GWNA 4LO0A 4XILA 1TWEA 1QKQA 3VUOA 4XFSA 1FNZA 4I8MA 2FGFA 1AXZA 5BXSA 2CYFA 2R1DA 1CONA 1JN2P 2AFGA 4DPNA 1DFQA 1HKNA 4L4HA 1ZA4A 4LO1A 2DVFA 3BAVA 2F2FC 2PHTA 3AP9A 1DYKA 2DTYA 4FPKA 3UJOA 3K1XA 4M01A 2K43A 3D5OA 1W6PA 2FFUA 4I4UA 5GLUA 3I4IA 3UJ4A 2ZBJA 3FBYA 5IK8A 2J3PA 1CPNA 3TC2A 1MS5A 3FLRA 1ENSA 4A7KA 3AZYA 3BODA 4Q9GA 1S0BA 3LCPA 2BQPA 4FPOB 4OWKA 2VY0A 1GBGA 1P63A 5F90A 3IPVB 4M3CE 1JLXA 1JT7A 4JCKA 3TB0A 4R9CA 1GNZA 4QO3A 1GLHA 4UW4A 3RQ0A 4EB2B 1G9CA 1DZDA 1SLCA 3WDYA 4LBNA 2C9AA 4Y1UA 2AENA 2ZHNA 3WINC 1CQ9A 3EF2A 4HJJA 3CA1A 1GNHA 2RSTA 2VW1A 3U4XA 2A3XA 2D6KA 3UDAA 4ISQA 2JECA 4LBQA 1FWUA 1BXHA 1O4ZA 4Y24A 5D61A 4P0LA 2WBCA 1WLDA 4LO7C 3WCSA 3POWA 1WCSA 4IZXA 4IHZA 3O3QA 4YG3A 1FQ9A 3SNMA 1T9FA 2BEAA 3O12A 5CAZA 3P6JA 1NXD1 3WDVA 2NP0A 3UJQA 1G7YA 4QD2B 3AZVA 3ZVXA 1EYLA 1QQKA 3LTQA 3WINA 4FPEA 4CRQA 1KITA 1DQ0A 1LODA 1LGCA 3OJBA 1UPSA 1D2SA 5DG2A 3RMYA 2R0FA 2E7TA 3BAQA 4OW4A 5CA6A 4XTMA 1RY7A 3M3CA 4G6MA 2R16A 1V6MA 1AXMA 3ZXGA 1LOBA 5FNXA 4U2AA 2GNBA 4ITCA 4JPZA 2ARBA 2VXRA 1F9KA 2JDZA 4OWJA 1V6WA 2W68A 1UAIA 3BRFA 3CA3A 1S0LA 3NJ5A 4Y1VA 1BFFA 3B9CA 3QLQA 1Q8VA 3M1HA 4PBOA 1Q1UA 1LHWA 1LECA 4IYBA 4ZFYB 2W52A 2ZGKA 4YM2A 3N35A 3BADA 2CTVA 1SR4C 1S0CA 1GICA 1EPWA 5KXBA 2HYKA 5BVPI 1LU1A 5DZGA 5KXEA 4JKQA 1W3GA 3FGMA 2NZ9A 4JC1A 2WRYA 2Y9XE 2E6VA 3FLTA 1LOCA 1YTOA 2DUPA 3FJFA 1CPMA 3SLIA 1N3QA 1BARA 3D4KA 4GP3A 3S8JA 1CN1A 3POYA 4DENA 4YZ3A 3IPVA 3FJIA 4EFQA 4GAIA 1IS4A 1BKZA 4YGDA 4I1EA 2WT1A 1VALA 2IHOA 2WKKA 3CRIA 4YZ2A 2ZAAA 5DZEA 3T1MA 4EEEB 4XHBA 5CB7A 3A22A 1DQ2A 4FOVA 1H9WA 1A78A 1S0EA 1MACA 5D62A 1W6MB 1IILA 3B3QE 5EWSA 2DU1A 4DRRA 5HCAA 2ESUA 2ZR1B 4XJAA 2OUHA 2DWRA 3WZ1A 4PCRA 1DLLA 1AJKA 1A8DA 2WSVA 3I29B 3IM6A 3VT1A 3HOMA 3M3OA 4W65A 2KI6B 1H30A 3OBTA 1ENRA 1JY0A 2A7AA 1FN0A 5BXPA 1WBLA 2HW9A 5T5JA 5CNAA 2VSEA 4YW5A 1KQRA 5DUVA 2UWAA 1LOAA 4SLIA 1KJLA 5GLZA 1ULCA 4CJMA 3D7WB 4LO3C 4AGRA 3NBEA 3D6EA 2KH2A 3UK9A 4BMEA 2W39A 2EXKA 1AF9A 1DQGA 1Z78A 3KMVA 2KI4A 2CNAA 1JT5A 4F83A 2FHRA 1HKDA 3IM5A 3JU9A 3FJ8A 2A3WA 2DUOA 2F8XC 4I30A 3NBNA 3T1LA 4GP0A 3CA0A 2D6MA 2DV9A 4Q8KA 2AH2A 4LO3A 4USOA 3BTAA 2D6LX 3MW3A 1MVQA 4JRAA 1FWVA 1V6VA 2WT0A 1YYNA 1ILR1 1R8NA 4PBPA 4BLIA 3I2XA 1JUIA 5D63A 3F62B 4YFWA 1LGBA 4D0TA 1VCLA 3OGFA 1S0FA 1DJSB 2AYHA 1V6OA 5BQUC 4R9AA 2A70A 3ZPYA 5JOWA 3QCWA 2D22A 4WBCA 1MS3A 1IS6A 1W0PA 4XIKA 2GMMA 1W6QB 5DXDA 1CVNA 1WD4A 1EVTA 1XZZA 2DUQA 3AP7A 1BQPA 5T54A 1AVWB 2DTWA 1UZZA 1PUMB 2SBAA 1VLNA 5FREA 3WHUA 1W6MA 3FFZA 1V6IA 3A0NA 2TEPA 1SCRA 2KKIA 1LENA 2Y9FA 1J0SA 4J2SA 3VSZA 1XHBA 1HDKA 4Q2FA 3BB2A 2Q3NB 1BJQA 1YF8B 4YW1A 2MC2A 5BQUA 2DREA 3W58A 3P53A 2YZ4A 3N3HA 4HANA 2PHXA 3QYDA 1YIFA 4DRVA 2AQZA 1DQ4A 2D3SA 3CA5A 1LTEA 5GLVA 4FVVA 3M3EA 1LEDA 2VH9A 1AVBA 4XMIA 4UW6A 1UMZA 5DSSB 5JOZA 3HMYA 3WLUA 4LO2C 2A3YA 2ZKNA 3FJ9A 3IIRA 4G1RA 1D0HA 3R05A 2JJ6A 3PJQA 3MPPG 2WNEA 3A21A 1N1VA 4IONA 1ITBA 1LHOA 3P6IA 4I7IA 2DRZA 5DG1A 1FYUA 4G6JA 3B69A 5H9SA 3CAHA 4I4XA 3LSDA 4IZEA 41BIA 3PVOA 5FZUA 3FUOA 5E24E 5E8AA 2ZGNA 4D8HA 1NLSA 4XZPA 1GGPB 3QR5A 3NWKA 4I3NA 4LO2A 2VUAA 4XJUA 2ZA9A 3O5SA 3V0AB 3ZSJA 4LBMA 3O4DA 2UU8A 4QBCA 4Y22B 2DS0A 4DS0A 1QU0A 3AZZA 2UUSA 4AGGA 4BLJA 1AX2A 1Q8OA 2C5DA 1GSLA 3AKHA 3FJKA 5F9TA 5GAQA 1SLBA 2VLCA 2BEBA 2Z48A 4OUJA 4XJZA 5KXDA 5GALA 4QKSA 1Q8SA 3W59A 4I96A 4FP2A 2D44A 4R9DA 3O49A 1ZM1A 2ARXA 3ASIA 3AKIA 3R4UA 5BP5C 1QNYA 1LGNA 4GAFA 2YXSA 2PHRA 4Y26A 4H04A 4BPZA 3OGGA 1HWOB 1HWMB 1W6QA 4LBKA 1IS5A 3ATGA 5GZEA 1SBFA 1M2TB 1GZWB 4QC4A 1R8OA 2HWMA 5EHAA 4IY9A 3BAOA 3AYDA 4AVSA 2IWTB 1SLIA 3WNXA 4GOVA 5IK7A 2ZMNA 4XE9A 2NN8A 1HQWA 5E88A 1FMMS 4EKXB 1S0JA 4UW5A 1AX0A 4PQ9A 2JE9A 3V65A 4HA2A 1PZZA 2D7FA 3IN9A 1JQZA 3UJ0A 3HN1A 3VWCA 2H0BA 5BP5A 4D69A 3OJ2A 4BMBA 1Y7BA 3UD8A 4I1BA 3Q7YA 1C1LA 2ZGMA 3FJCA 2PELA 1RITA 1S1AA 1DFCA 2QYIB 3O44A 2LALA 1C4RA 4OZXA 4DEPA 2AREA 1UN1A 3WO3A 2E7QA 2ENRA 1GANA 1KDMA 2R9KB 2D43A 1G8WA 2D6NA 1TFMB 3SH4A 3O5WB 1Z2VA 2DU0A 1HQLA 1NZKA 4I4QA 4CZSA 5F8SA 1QF3A 2GNTA 3IM0A 1N4KA 1AZDA 5JMCA 4OEFA 3BA5A 3A4UA 2I1BA 2ZZJA 1RG8A 5DUUA 3DUIA 1NUNA 3N7LA 3SNVA 4YGBA 4OWLA 4JP0A 4YW4A 1BFGA 1G9FA 1K5VA 1APNA 1ABRB 1IS3A 3I2AA 2D3PA 1OFSA 5DUXA 1BFBA 1AXYA 3CQAA 2DVGA 3AJ5A 3V0AA 4MYEA 2GNDA 2ZHMA 2EXHA 2D1ZA 1JLYA 3AYEA 3V0BB 3IAGC 1MC9A 1BLDA 1V6JA 4RL7A 1ONKB 2P2KA 3H6QA 2CWMA 3Q9OA 1JYCA 4Z8SB 2XOAA 1S0DA 5KXCA 1BASA 2ZQNA 4FPYA 4U36A 2YY1A 4AN6A 3RMXA 3IKWA 4J2XA 1HCEA 3IM7A 1N1SA 4XXPA 1SFYA 2D7RA 1URXA 4AGVA 1LHVA 1PUUB 4ZFUB 4A7ZA 2GN3A 4X3AA 2W08A 1ISZA 1JXNA 4JAWA 1SLTA 2A5ZA 2QN4A 3WDTA 4XJ8A 4BM8A 1ULGA 5HCBA 2X2TA 2Y9GA 2FFVA 3WG1A 2PHFA 1Q56A 4QD2C 3A0KA 4AWDA 1TTUA 3LSEA 3H6RB 1BFCA 4Q91A 2P3IA 4FOYA 4BOWA 1SLLA 3OJMA 1JOJA 4QBVA 3WG2A 3AYAA 4I4YA 1LHNA 1WBFA 4ISRA 4AN7B 1G9BA 4I6IA 3BRDA 3FJBA 1WBAA 3CU1B 1FV2A 3UD7A 1RZOB 4YM0A 1TP0A 3NV2A 2D3RA 1ISVA 6I1BA 1IKPA 1WUVA 4Y1ZA 4KEIA 2P37A 3VV1A 2DVDA 1W3FA 2GNMA 1CESA 3BAHA 3RTIB 1AFCA 3A23A 4I37A 2D23A 4Q1PA 3WVJA 3WA1A 1AVAC 2A6ZA 4M00A 3PUBA 4TZDA 1CR7A 3N7KA 2ZGPA 4NOTA 1Q03A 3NBCA 1U0AA 3ENRA 3PVEA 3WG4A 4K21A 3ZXFA 5T5LA 1MVEA 1SBEA 4J2YA 4ZOTA 3AYCA 2GO2A 4GXLA 1X50A 4Q26A 5T5OA 31BIA 2FO1A 3OY8B 1G9AA 1A3KA 1UX6A 2R0HA 3AH1A 4GA9A 4FPJA 1WLWA 3HALA 2YROA 3AFKA 5FZZA 2NVHA 1CE7B 1GZ9A 5GZFA 3VSFA 3V0BA 1YO8A 4CTEA 1WW6A 1HWPB 3OYWB 7I1BA 2ES3A 1OKQA 2CY6A 21BIA 3A07A 3NBDA 4D0ZA 2MLLB 3ZYRA 1LESA 3AH2A 1QXMA 2NM1A 2UURA 4I4SA 3FJAA 4ATFA 1MZ6A 1AJOA 4P14A 3AXEA 4XBQA 5GZGA 2ET2A 5CBLA 3B01A 4Y1YA 3M2MA 3AP6A 1MS0A 3AJ6A 3FLPA 4WVVA 3O0VA 2KM2A 1ISYA 4F34A 3V79C 4YM1A 5BOWA 1QDCA 3W9TA 5FZYA 5IK5A 2X2SA 5GZDA 3FUQA 3ILFA 1Q8PA 4WZFA 3C2UA 4WV8A 1DZCA 3H6RA 4XJ9A 2P39A 1WBCA 3ZC9A 1FNYA 4ENDA 2VW2A 3AJYA 2LIQA 1DQ6A 2ZABA 4AVVA 3VKNA 5DZUA 2Y9WC 4KEKA 2Q9XA 3FJEA 2GALA 3BIWE 4FPCA 5L73A 5EC5A 5GLWA 3GNEA 3WDUA 4JQ0A 1GZCA 3ILNA 1N3PA 2Z49A 1QOTA 4HR6C 3BRGC 1LU2A 4YGEA 4P0KA 1V6UA 3KQRA 1JBCA 2AXMA 4EFPA 4XYXA 4FP3A 2NYYA 5JVVA 4ZFWB 1MZ5A 5GZCA 1PWAA 2I2SA 2D6OX 2ZMLA 4K20A 4K1YA 3AJZA 1C1FA 4P0JA 1B09A 2E4MA 2D24A 1H9PA 3AX4A 4GKXA 1DGLA 1QMJA 3OY8A 1S0GA 3BA7A 4I4OA 3O4CA 4XBLA 1GKBA 1KNMA 1Z0HA 4AYUA 5FNWA 1IT0A 4XDQA 3WMUA 1JHNA 3ILRA 4YGCA 1F31A 4ZXKA 2ZMKA 1RINA 3OYWA 4IY8A 1DZQA 5DZFA 3BOPA 3MW2A 3B00A 2ZGTA 3POKA 4FPLA 3T8SA 3RS6A 1DQ1A 2DYCA 1AXKA 2M49A 1TIEA 2EIGA 2ZACA 4XMAA 4DCKC 3ZSKA 2NTDA 4TLPA 1KDKA 4NO4A 1RMLA 2JKBA 1TOOA 2Z42A 5F5QA 3POSA 1LOEA 1GYKA 5GLTA 3O4BA 1WW7A 2P3JA 3N36A 3R4SA 1V6NA 3WO4A 1WD3A 5EXOA 1JT3A 4Z9WB 2WT2A 4K1ZA 3NV4A 2HWAA 4FQ4A 4Y20B 5F8YA 1DYPA 2EALA 1V6LA 4JKXB 2A71A 2UWBA 1ULEA 4LO8B 4X38A 4G9MA 2AGSA 2PHUA 1I1BA 1N3OA 2P3KA 1C57A 4Q1RA 3VT0A 4ZGRB 3N7MA 1RIRA 2E53A 4YOLA 4FQZA 2CL2A 3O4OA 1ISWA 2F2FA 4WVWA 2JE7A 3WMVA 1LJ7A 2WLQA 2VU9A 2RQ9A 5JOYA 5IUQA 3H6SE 3LLPA 1WW4A 8I1BA 4QKRA 1JTCA 3WHTA 5T52A 1QQLA 3CRHA 3ZXEA 1W3AA 2Q5TA 5GM0A 1QNWA 3AH4A 1G9DA 1J1TA 1V6KA 3JRRA 3USUB 2GMPA 5T5PA 1IHKA 4XKIA 4ATEA 3O0XA 3WOGA 1TEIA 1ENQA 2OVUA 5AVAA 3WCRA 3NV3A 3PG0A 2XB6C 1FV3A 2VXTI 2ZHLA 3I8TA 2DVAA 3JUTA 5HCFA 2VSAA 2YMZA 1M16A 1BZWA 1XG6A 3FJDA 5EG6C 1AX1A 3BAGA 4PF5A 2ZGRA 2E51A 4FPHA 2ZGOA 1N47A 3RRDA 2D6PA 4GOYA 4YG6A 2NMNA 4IQPA 1II4A 4L8QA 1F5FA 5E89A 1JYIA 3BA4A 4FPFA 3ZXLA 3F1RA 2SLIA 1DIWA 4J2KA 1LEMA 4Y22A 2EXJA 5BXTA 4A7YA 3B9UA 1EV2A 1QGLA 4QALA 3H0OA 3UL2A 4H55A 2ZGSA 1QDOA 5JDBA 2NMOA 4M3CB 3AZWA 2AR6A 3ZYPA 4UW3A 4TYSA 5G00A 1S0IA 1ISXA 3AKGA 4YZ1A 3AKFA 1T4QA 4L4IA 4XFTA 2WSUA 2AUYA 2ERFA 1DHKB 4P9XA 4XBNA 4Y20A 1LOFC 2V5YA 1G86A 2DURA 1IRPA 2R49A 5JOXA 3VT2A 1OQLB 3SH5A 1W6OB 4FOWA 2WQZC 2FDBM 3TAYA 2LTNA 4FOQA 4G9NA 3VKFC 1UKGA 3KM5A 4Z8BA 1HWNB 5BXRA 1G82A 1GZWA 1PZ8A 3NV1A 3O0WA 2FMDA 4FGFA 2UWCA 1HIBA 3MW4A 4YZ5A 1LHUA 1V6XA 2ZGUA 4XJWA 4YLZA 5H9QA 2GZBA 1FAYA 3SH3A 1YRZA 1BYHA 1Z4SA 3OPZA 1VIWB 3S8KA 5IT6A 3AK0A 5F8WA 3AP5A 1YI7A 1ONAA 3VKMA 2GMEA 4P6AA 4GALA 3DGTA 3Q7WA 1LOFA 2ZQOA 1HCDA 1PC8B 2L5XA 4FPGA 3BAUA 5EYXA 1SR4A 1AVXB 1JT4A 4Y1XA 2XG3A 5LK5A 3V64A 3ZSMA 4YZ4A 2ZGQA 3L2YA 3USUA 4LBOA 3AXDA 4I2SA 1SCSA 2KLLA 1SACA 2K4AB 2AAIB 1O4YA 5BYNA 3ZSLA 4Q9PA 1LCLA 5FRAA 1UZYA 1I3HA 1KRIA 5H9RA 3RSJA 4USPA 1SZ6B 3CA6A 4XXAA 5H9PA 3BX1C 1KJRA 2JD4A 4EFRA 1OQ1A 9ILBA 4OEEA 2MIBA 2A6XA 1BA7A 4XFUA 2A75A 1FMZA 3CA4A 2A6WA 4II0A 1MS9A 3ILAA 2EAKA 3RTJB 4BQ1A 2D20A 4DQAA 3Q7XA 2ZHKA 4HL0A 1JW6A 4I0YA 1Q04A 4PC4A 1IOAA 1V00A 1CIWA 3VEQA 3ZXKA 4XOGA 3PMEA 4KEJA 5SV8A 4Q27A 3WO2A 1ULDA 1XYFA 4KBBA 2ERMA 4ZBVB 4OEGA 3VKLA 1QOOA 1W6NB 4ZA3B 2K8RA 5T55A 5HPZA 2B7YA 1YBIA 1N1YA 4LBLA 3SISA 2EXIA 1FX5A 2BFHA 2HZ9A 4I4RA 2ZGLA 5IK4A 4GKYA 4M3CA 2OUJA 3N7JA 5DUWA 3FJJA 1MS1A 1N1TA 4P9YA 5GJ6A 1LULA 4XTPA 3FJHA 3JUUA 2G4IA 3PHZA 3INAA 1I1EA 4ZKTB 1E0OA 1VAMA 2PHWA 3AP4A 2GDFA 4ASMB 1W6OA 1HLCA 3MEPA 1R1ZA 4XHXA 1W6PB 4KC3A 1FGAA 1Q8QA 3WDWA 4YG0A 4GWMA 4YM3A 2EF6A 3OBRA 1PZ9A 2V73A 4P9WA 1TWMA 2YUGA 3APBA 3C9ZA 1IJTA 2OW4A 3HSMA 3HR9A 1LOGA 1QOSA 3CNAA 2DRYA 3ZC8A 1PZ7A 4LBQD 4I4VA 3WV6A 3WUCA 4YW2A 2P23A 4YW3A 4DFSA 1DQOA 3IMNA 2RHPA 2E4MC 5B2HA 3AZXA 4YFZA 1DBNA 3SITA 4I4PA 1K5UA 4RA0A 4X37A 2R1BA 2D7IA 3ZXDA 3E8LC 3WG3A 1L2HA 3VKOA 4ZLBB 2P34A 1XQNA 1IKQA 1GV9A 3T2TA 1CJPA 1BLAA 3GALA 2A6YA 4LBQB 1W0OA 3M3QA 4J23B 2VW0A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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