3RM9A

Amcase in complex with compound 3
Total Genus 129
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
129
sequence length
377
structure length
377
Chain Sequence
YQLTCYFTNWAQYRPGLGRFMPDDINPCLCTHLIYAFAGMQNNEITTIEWNDVTLYQAFNGLKNKNSQLKTLLAIGGWNFGTAPFTAMVSTPENRQTFITSVIKFLRQYEFDGLDFDWEYPGSRGSPPQDKHLFTVLVQEMREAFEQEAKQINKPRLMVTAAVAAGISNIQSGYEIPQLSQYLDYIHVMTYDLHGSWEGYTGENSPLYKYPTDTGSNAYLNVDYVMNYWKDNGAPAEKLIVGFPTYGHNFILSNPSNTGIGAPTSGAGPAGPYAKESGIWAYYEICTFLKNGATQGWDAPQEVPYAYQGNVWVGYDNVKSFDIKAQWLKHNKFGGAMVWAIDLDDFTGTFCNQGKFPLISTLKKALGLQSASCTAPA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
molecule keywords Acidic mammalian chitinase
publication title Identification and Characterization of Acidic Mammalian Chitinase Inhibitors
pubmed rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 129
structure length 377
sequence length 377
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2011-04-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 3rm9A02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3rm9A01
3BAIA 4J3VA 3AISA 3O9NA 2E0PA 3SUVA 4QLLA 4BQ4A 4AYSA 3BH4A 3ZJKA 3WN6A 5KZ6A 1RH9A 5DFAA 1QW9A 4HZ7A 1PJ9A 2DSKA 1YQ2A 1KGXA 1OGGA 3VMPA 1JZ2A 2YA0A 1XV8A 2WC3A 3VO0A 2DIJA 2VRJA 3PZ9A 1G9HA 5CSUA 2W66A 4TVCA 2ZXBA 1QVBA 5AC4A 2D23A 4D1JA 4PMRA 2UY5A 2WZIA 1ZBVA 2XPKA 4AIEA 4B15A 4NI3A 3MV01 1NARA 2XFYA 1WDQA 2VUYA 4QLJA 2O9OA 1W3JA 2Y8VA 2XIBA 2O9PA 2CYGA 1JXJA 2CEQA 4WIWA 1UA7A 1GOKA 5A69A 4TXEA 3WF3A 3B9DA 4P7QA 1D3CA 4M8UA 1B1YA 4JFSA 3OIHA 4A3YA 3WD4A 4UQAA 4WSKA 5I24A 4W7UA 3A4AA 4J3XA 1UD5A 1KB3A 4FK9A 2PBGA 1OIMA 3CZLA 2O9RA 3UEQA 1GONA 3WF1A 1OM0A 5FL0A 4J27A 1CGUA 1A47A 1J01A 1PBGA 4XZBA 3SCUA 1BGGA 2J7BA 3RDKA 4XX6A 3N13A 1ZB5A 4UOZA 3HU7A 3D5HA 2NT1A 3G6MA 1WNOA 2X1IA 1CENA 1NP2A 2VVNA 1BYCA 5FD0A 3OLDA 2YL9A 2QMJA 3WDPP 1NWSA 1DWJM 2DDXA 5HXMA 4UOJA 2OYLA 2VT0A 5ABHA 1TFVA 3EMCA 4UFIA 3OGVA 5IXEA 2QMKA 2XG9A 3WDJA 1DWGM 2X09A 2Q8XA 3ARYA 2ZUUA 4PMNA 1J0IA 2JFEX 3ZT5A 4NF7A 3BLKA 4PSPA 1WDSA 3CUIA 4BZYA 3TTSA 3WEOA 4P8WA 2BS9A 3BAJA 4AIOA 4DWSA 4IM4A 3EYPA 3ECQA 3WNLA 3GZAA 1CYGA 3VX1A 1B9ZA 4PYSA 1W2PA 1KWKA 4OOUA 1W3HA 1QW8A 2WZEA 1W3LA 1EH9A 4U2YA 5A6AA 2JALA 1GUVA 3WNOA 2YA1A 4EKJA 3CMGA 3GH4A 1JI2A 2V38A 4GINA 2TAAA 3ZJ6A 4V2XA 5C70A 3ZR6A 1TE1A 3THCA 2CHOA 4C7FA 2BHUA 3ZR5A 4BS0A 1CXIA 1EXPA 3AIEA 2VCCA 3IJ9A 1UKTA 2Y8KA 1J11A 4U2ZA 3VGFA 5ABFA 3QR3A 3IANA 4TOQA 3WDRA 1GHSA 3MSDA 4DUXA 2EPOA 4H8VA 1E4MM 2DT3A 1UHVA 4H8UA 3T2QA 1HL8A 1OGSA 1CGTA 2UY4A 2J77A 3W25A 1SYTA 1V08A 3OZOA 4C7DA 3B9AA 3AROA 5C8BB 2UWFA 3NJ3A 4CN4A 1CLVA 3MKKA 1JYXA 4UNIA 1WCGA 1OD8A 3WBEA 1E4LA 4M1RA 5BXSA 2Z1SA 4JAWA 1A3HA 3WF2A 5A8NA 2YL5A 4W93A 1UWIA 2IXUA 2WAGA 3W24A 4MNMA 5A6JA 5CSYA 4CD6A 1XCXA 3VPLA 2OWWA 3ARVA 3PBGA 2JEPA 4TX8A 3AHXA 4HP5A 9CGTA 1ISYA 3AS3A 1G94A 1ISXA 4JHOA 1TA3B 1H0GA 3GXMA 3OBAA 3WNPA 1UWRA 4HA1A 1EO7A 1E40A 2CPUA 2ZX5A 3VDAA 3BCFA 5DEZA 4TTUA 3GBDA 2PWEA 3SCRA 5HPOA 2GK1B 5GQBA 3CHEA 2WKLA 1M7XA 1CGYA 2WHLA 2J8FA 4F8XA 4PSRA 2A3CA 1W9UA 3CUHA 2OSWA 4M24A 2WCGA 4X0VA 1CDGA 1KR1A 3W81A 4CVWA 1B3YA 1OD0A 4CCEA 2WVVA 3S2CA 2WBKA 2VX4A 1VEOA 2J79A 2ZXQA 4WF7A 2EBNA 2WMIB 1B3XA 3W53A 1TVPA 2EJ1A 2D22A 2WXDM 4S3JA 3VNYA 1BSIA 1QNQA 1NQ6A 3EDFA 3QHOA 2YOCA 1NOUA 2ZX6A 3D3AA 1CECA 4GZEA 4Z2HA 1AVAA 4UQ9A 3AZTA 1WDRA 1UWQA 3VM7A 4BQ5A 8A3HA 1JYWA 4FLQA 1HKKA 1QI0A 3CZGA 1UOKA 4X9YA 4AY1A 2NW0A 3CHCA 1R87A 3HJEA 1UR4A 1V3IA 2ZXDA 4LX4A 2W67A 3AXHA 2BNJA 4PMZA 1CLXA 1XSJA 3T0AA 4P8UA 2J8GA 1CEOA 2X2YA 3ZOAA 2XWEA 3WF0A 3AYRA 2XVPA 4IPNB 1MW2A 2XFRA 5ABGA 3SUUA 1U33A 1J18A 3L4XA 4H2CA 2BVTA 2VC9A 4AD0A 5GPRA 1CPUA 2PWGA 5IHRA 1V3KA 4MB3A 4HOZA 1UKQA 4WSJA 5CPSA 2JE8A 2VX5A 4M81A 2WW5A 1TCMA 1UD8A 3MMDA 2PF0A 4HU8A 1XRVA 4E2OA 3ARRA 4AXNA 4HPGA 4MNJA 2XFFA 1YHTA 2GDVA 1BVZA 2GJXB 2EPLX 1ISVA 2D2OA 4WKFA 1H5VA 3AIWA 4CN1A 3SCNA 1ITCA 1W2VA 2YDRA 1UZ1A 2X05A 2PC8A 3N18A 3UG5A 3VILA 3UCQA 3WFLA 4URIA 3N9KA 5BYWA 3A4WA 3WQ6A 2WANA 3M46A 4EAMA 1H49A 1JD7A 1JIBA 2OSYA 1NOWA 3KL3A 2VURA 1DP0A 2V5CA 4HZ8A 2V3EA 1GQJA 3WH7A 2WPGA 4NSBA 2EPKX 2G3NA 3DYPA 3VD5A 5BWFA 2WWCA 1LL6A 1W32A 2Y24A 3WMCA 4NRRA 4D6GA 3N15A 3WH8A 1C90A 4MNLA 1GQIA 5CGTA 1E3XA 2VR5A 3PN8A 3CPUA 3ZJ8A 4CD5A 2B31A 1EDTA 1VEMA 3WD1A 1W1YA 1LWHA 2XGBA 1BLIA 1LL4A 2FHBA 4JKLA 1C7TA 2FH8A 1GVIA 2JF6A 4PMXA 1UR2A 4AW7A 1D7FA 1HXJA 3LMYA 2WYSA 1BG4A 4PMDA 1GQLA 2BVYA 3T0BA 5DMYA 5EMYA 1H4PA 1V3JA 3VD9A 2RGMA 3RO8A 1W9VA 1E6QM 3U5UA 2VZSA 4DUVA 3WQ8A 4PMVA 4KWUA 1K9EA 5TD4A 3ARQA 3KEHA 5A8PA 2CBUA 2ESCA 1XD0A 1WB0A 4W85A 3ZT6A 1NOFA 3FW6A 1J0JA 4AZCA 8CGTA 5I78A 2A3HA 3VOCA 3VDHA 4AZIA 4GZIA 4JKMA 1BAGA 3IJ8A 2OSXA 2BXZA 1X6LA 5GNYA 4FLSA 4DWSC 1E4IA 4UQDA 2D20A 3CGTA 1EDQA 2CBJA 3VVGA 4HA4A 2E40A 4D1IA 2G3JA 3UESA 3K8KA 1HNYA 1GJWA 4PCSA 3AXIA 3ALGA 1R7OA 3APGA 3BLPX 3CBWA 2OYMA 4UZSA 1O7AA 3GNPA 4UR9A 3PZNA 5E9AA 4ZE5A 3WQVA 3SCTA 4MJ2A 4B3KA 4B9YA 2VX6A 1QNSA 3AIRA 4FMVA 3W37A 5FIPA 3WUFA 2E8YA 2WK2A 1VBUA 1S46A 1UYQA 2WC4A 3MUAA 1KQYA 3WH9A 2VQUA 3GXIA 3WMBA 2UY2A 4CGTA 1EHNA 1W9XA 2ZOXA 5CLTA 3MV11 5BXTA 3DC0A 3SUSA 3L2LA 5E0FA 1JL8A 5CPTA 3CHFA 1HKIA 4D6IA 2CKSA 1FH9A 1QI3A 5GNZA 3AXXA 4W7WA 2OYKA 1I75A 3RJYA 1EHAA 2YJQA 1VF8A 3KWXA 1PX4A 3SIMA 2WHMA 2Y4SA 1XSKA 4JHZA 3DYMA 3S6TA 1CTNA 3QOMA 2GUYA 1TZ7A 4XUYA 1QNRA 2AMGA 2YIHA 4D6EA 3RM9A 2WLZA 2EEXA 4PMOA 1AQ0A 1MFVA 3M7SA 3WQ5A 3BMWA 3KL5A 4WK9A 3AMKA 4MB1A 3N17A 4KGJA 1QOXA 1XHGA 3TONA 2WZHA 2C7FA 2VJXA 4PTWA 3WBAA 3M07A 5I5RA 1GNXA 4AD3A 1NWTA 1C3FA 1VFMA 3W26A 1GOQA 4W8AA 3AYSA 1MQPA 3WUEA 3SCQA 4MTVA 1V02E 1N82A 1WO2A 3WQWA 5A6LA 4JCMA 3EMZA 3SUTA 4JFUA 4AD4A 1JG9A 4QCEA 2EPNA 2XVKA 2J75A 4BCEA 1C7SA 3CLWA 5ECUA 1VAHA 1EQPA 3AQUA 3BSGA 4PCTA 5LA2A 4CUCA 4FLOA 1EOKA 2BY2A 1PZ2A 1VIWA 3OLIA 1K6AA 1HJVA 3F5JA 4QP0A 3L2MA 4ACZB 3OG2A 4P7OA 5I79A 3PHAA 4JFTA 4D72A 1HKMA 3ZSSA 2X0YA 1CIUA 4AZGA 1JZ5A 3II1A 3VIGA 1B0IA 3NDZA 4PN2A 5A94A 3WUGA 3VMOA 4CCDA 1G1YA 1DTUA 3ARUA 3L4YA 1J0ZA 3PZQA 1KBBA 2CXGA 3ARWA 4S3KA 3TOPA 1HF6A 5A2BA 2XSBA 4U31A 3AMLA 3GH7A 1R85A 2CBVA 1PIFA 3DECA 4W84A 5A8OA 1LWJA 4CCCA 4AZ7A 5CQ1A 3PZGA 4PTXA 1GCYA 2J25A 1QBBA 2XVNA 4AZBA 4ZE4A 1HJSA 4J3TA 3TTQA 4TTGA 3SCSA 1UD4A 1UWSA 3VIIA 1AQHA 4H8HA 3EBVA 1H1NA 4RE2A 1VJSA 2VOTA 3RCNA 1NWRA 3B9EA 5AC5A 1PIGA 2C8NA 3AIUA 2DQXA 3VMNA 4GIAA 4M29A 2WHKA 2ZUSA 4K68A 2DEPA 5GNXA 3GH5A 1B31A 4ZXLA 1ISZA 4LXFA 2CHNA 1IT0A 5DO8A 1V6XA 1H3GA 1VBRA 3NSMA 1UR9A 2WVUA 3FAXA 1E6SM 1OGBA 1M01A 2XTKA 3M6DA 3AIQA 3RPMA 4NZCA 1US2A 5BXRA 1UG6A 3CTTA 3KZSA 1CXKA 4B16A 3WF4A 1Z32X 4PRWA 2JIEA 3TP4A 2ZUMA 1GHRA 1V0LA 3O6AA 2BVDA 1BG9A 5AY7A 5IHSA 4PTMA 2W4XA 5D9NA 3WELA 2VRKA 1UKSA 2J78A 1W1PA 1NP0A 1UQYA 4A3HA 2YL6A 2PWHA 3CZJA 3AHVA 3UG3A 5BRQA 2YBUA 1HT6A 3SCWA 2DT0A 2W61A 1E6XM 4P7RA 5D9PA 3VGDA 4BF7A 3AHTA 4AZ6A 4PEEA 1AQMA 3VUPA 3AI0A 4AD1A 3POHA 1OBAA 4HMDA 2WM0A 4ZEPA 5CPQA 1PX8A 3VGHA 3OA5A 3WDHA 3ZQ9A 1JNEA 1BYDA 3DYOA 1TG7A 2C0HA 3QHMA 4MB5A 4HMCA 4CN6A 1TMQA 3VIFA 4PBGA 2Y5EA 1PAMA 1HKJA 2DPEA 4F66A 3W38A 3FAWA 1NWUA 2F8QA 1BYAA 2WMKA 3CHDA 1E1FA 1MYRA 2VL4A 3WMSA 1WP6A 4XZWA 1QI2A 1FA2A 1VJZA 3I3EA 3N1AA 1B90A 5I23A 5FOOA 3N12A 3O2LA 5I2UA 1BHGA 1JZ8A 1GOMA 3RM8A 2VCBA 1W9PA 3VD3A 2FGLA 4OKDA 3ZM8A 4JFWA 4GZJA 5A8MA 3U7VA 1E4NA 3N11A 3CUFA 3AIBA 2VQTA 3K8LA 1B3VA 1JDAA 2WNWA 2V3DA 5IFTA 2A3AA 3POCA 2WMHA 2D0GA 4QAWA 2PWFA 1XC6A 4M56A 1V0KA 1E43A 3NYDA 1V3HA 2X0HA 5E09A 5E6ZA 4MB4A 4TX6A 4PUDA 2QF8A 3T2PA 1ZJAA 1R86A 2VZOA 3OGRA 4EK7A 1OIFA 3WDIA 2WBGA 4E8CA 3VGEA 2J7FA 3PTQA 4BQ2A 3L4TA 3VGGA 1FH8A 1DWHM 4J7RA 2GJRA 2ZIDA 4ACYA 1CGVA 4MPKA 3BGAA 1UUQA 3MU7A 5JIPA 2GFTA 2VR4A 1UD6A 1J9YA 4HOXA 3MMUA 4WKHA 5JBFA 1KFWA 1LG2A 4RE3A 2EXOA 1H41A 4FLRA 4PTVA 4MNKA 3BAXA 3VD4A 2WVTA 4AWEA 4D6DA 3VIKA 2BXYA 1X1NA 3MMWA 4HZ6A 3N04A 5C71A 4WKAA 4TUFA 4UZUA 2XSAA 1UR0A 1E5NA 2WHJA 4P8VA 1QI4A 5D4YA 4ZFMA 5M17A 3RIKA 4CD8A 4CU7A 4W89A 4GI6A 3W27A 2D3LA 1KXTA 2GJPA 4WJXA 3F5LA 5F7UA 4OBRA 2PWDA 2A3BA 1BVNP 5A6SA 2AAAA 2BFGA 4KMQA 4W8LA 2WMGA 2YKKA 3SUWA 4LYPA 4BQ3A 4ATWA 1JGIA 4BA0A 1W91A 3EDEA 1V0NA 2V5DA 3VINA 2J4GA 2Y2WA 1LL7A 3A4XA 3I3BA 2DH2A 1JZ4A 1VRXA 1HN1A 3DHPA 4UFMA 3VIMA 2EPMX 1OT1A 4UCFA 4YN5A 2E9BA 1CGXA 1JFXA 4HTYA 1GOWA 4AZ5A 1JZ7A 4PMUA 3AMDA 2QLYA 1JZ3A 1KXQA 1H0IA 3OLEA 3ZIZA 2CKRA 1TVNA 4GKLA 5I0DA 1B2YA 2AOSA 4W5UA 4D6CA 3A47A 3VIJA 4F9JA 4ZENA 4Z2LA 5JBDA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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 4JL1 A;  1EQC A;  2VX7 A;  4XB3 A;  4E4P A;  4E8D A;  3AS0 A;  3GTN A;  3MUZ 1;  1E0V A;  4JFV A;  3WUB A;  4B3L A;  4LYQ A;  5HOS A;  3QHN A;  2O9T A;  4QCF A;  1PPI A;  3IAQ A;  2KGJ A;  4AMC A;  2W62 A;  3K8M A;  1ITX A;  1B3W A;  5JIW A;  1XCW A;  1HJX A;  2F2D A;  3AS2 A;  1ZJB A;  2FHC A;  2WMI A;  3WNN A;  3VDB A;  4JFM A;  4W88 A;  3SCP A;  1HVX A;  3WH6 A;  2V3G A;  1KCK A;  1MXD A;  1DHK A;  1CGW A;  1MW1 A;  3AHY A;  1AMY A;  2DH3 A;  1ROT A;  1FKG A;  1QNP A;  5E70 A;  4R5E A;  2ZIC A;  1WZL A;  4W87 A;  1Q6U A;  4CD7 A;  2ZUV A;  4JL2 A;  1FOB A;  4J3S A;  4MDP A;  1J0K A;  1Q6E A;  3W29 A;  1ZK6 A;  1R8L A;  1V3M A;  4DRK A;  4QFU A;  1SFS A;  4UQC A;  3MSG A;  5JUV A;  3HN3 A;  3BC9 A;  3PZI A;  4H7V A;  1PEZ A;  1UR1 A;  1KGW A;  3VNZ A;  5A6M A;  4X0N A;  4H41 A;  1DWI M;  3WSU A;  1H2J A;  1UR8 A;  1N1A A;  1US3 A;  2BY0 A;  4KRU A;  3U7B A;  1MW3 A;  3B7X A;  3OGS A;  5A2A A;  1GVY A;  2VZT A;  3UR8 A;  4N0R A;  2WVV B;  4P7L A;  4C02 B;  1XYF A;  3ZT7 A;  1KWG A;  3EDK A; 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