3RSJA

Structure of hcrf in complex with ganglioside gd1a
Total Genus 105
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
105
sequence length
413
structure length
406
Chain Sequence
IKDNSILDMRYENNKFIDISGYGSNISINGDVYIYSTNRNQFGIYSSKPSEVNIAQNNDIIYNGRYQNFSISFWVRIPKYFNKVNLNNEYTIIDCIRNNNSGWKISLNYNKIIWTLQDTAGNNQKLVFNYTQMISISDYINKWIFVTITNNRLGNSRIYINGNLIDEKSISNLGDIHVSDNILFKIVGCNDTRYVGIRYFKVFDTELGKTEIETLYSDEPDPSILKDFWGNYLLYNKRYYLLNLLRTDKSITQNSNFLNINQQRGVYQKPNIFSNTRLYTGVEVIIRKNGNTDNFVRKNDLAYINVVDRDVEYRLYADISIAKPEKIIKLIRTSNNSLGQIIVMDSIGNNCTMNFQNNNGGNIGLLGFHSNNLVASSWYYNNIRKNTSSNGCFWSFISKEHGWQEN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Toxin
molecule keywords BoNT/F
publication title Unique ganglioside recognition strategies for clostridial neurotoxins.
pubmed doi rcsb
source organism Clostridium botulinum
total genus 105
structure length 406
sequence length 413
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 3.4.24.69: Bontoxilysin.
pdb deposition date 2011-05-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07951 Toxin_R_bind_C Clostridium neurotoxin, C-terminal receptor binding
A PF07953 Toxin_R_bind_N Clostridium neurotoxin, N-terminal receptor binding
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 3rsjA01
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 3rsjA02
1JTCA 2ZACA 1FWUA 2LIQA 1ILR1 2W08A 3UL2A 1Z0HA 4P6AA 4GALA 1BQPA 2JE9A 3IIRA 2VXRA 2D3SA 1SLAA 2ZHMA 4FOQA 1Q03A 1HKDA 3USUB 2JDZA 3AYDA 4AGVA 1F31A 1IRPA 3BA4A 1AX2A 4PCRA 3WMUA 3Q7YA 4XOGA 2AUYA 3FJCA 2DTYA 3N35A 5KXEA 5CB7A 1UZZA 3UJOA 3WG2A 1DJSB 2HWAA 1LESA 2CTVA 5DZEA 4YM1A 2ET2A 1Q04A 1N1VA 4BLIA 2A6WA 1WLDA 1MS3A 2EAKA 4AWDA 4EKXB 9ILBA 4HR6C 3SH3A 2QN4A 2D6OX 2VXTI 1WW5A 3NBNA 4LO1C 3WG4A 4H55A 5GLTA 3IPVB 2W52A 2KI4A 3AKFA 1RINA 5GALA 1DZDA 1GZ9A 3ZXJA 1ULCA 1MZ5A 1UPSA 1IOBA 1LCLA 2A3YA 5CNAA 3AFKA 2DVBA 1Q1UA 2ZGNA 3WDWA 3LSDA 2YZ4A 3AKHA 1S0EA 1IS4A 4OEFA 4XE9A 1I3HA 2GDFA 3BAQA 1V6MA 1WW4A 5L73A 4HL0A 4YOLA 5HCAA 1V6IA 4FPJA 4XMAA 4FPFA 1HDKA 1SLBA 2R1BA 4L8QA 3TAYA 2D7IA 1IOAA 3UK9A 1W3AA 3FGMA 3FJ9A 1AJOA 1ENSA 2Z49A 3FBYA 5GLZA 3CA1A 2ZGPA 4EFQA 3BAVA 2E7QA 5EYYA 2EXKA 1TFMB 1PUMB 1JT5A 1AJKA 4G9NA 4BPZA 1XHBA 5GM0A 2PHRA 4WV8A 4D0TA 3POYA 4MYEA 4ZLBB 3WO3A 5FZUA 2A7AA 4I4UA 5D62A 1DLLA 4CRQA 3FLPA 1QDCA 1GICA 4IYBA 1BXHA 2AREA 4PF5A 1JT4A 3VKFC 1CIWA 1HKNA 3WDYA 4LO0A 1D2SA 3CRGA 4ZFUB 3N0KA 3LCPA 1QQLA 1C1LA 2Y9WC 21BIA 1CESA 1BLDA 1SACA 4LO3A 3AX4A 2KKIA 4YZ4A 4BMEA 3SNVA 4EFRA 3B00A 3FJEA 4XILA 4I4RA 5E89A 5EWSA 2WLQA 1DQ5A 1RY7A 3UJ0A 2DURA 3ZSKA 3IM7A 1YBIA 3NV2A 3BAOA 1LOCA 3A21A 5FNWA 2ZHKA 1KRIA 4YM3A 2Q5TA 1MACA 1S0IA 2PHFA 1GZWA 1D0HA 1YYNA 4UW4A 4J23B 2WSVA 3U4XA 4OWLA 2DUQA 1ISZA 3T2TA 2CY6A 4M3CB 1UZYA 5FZYA 3AZWA 5F9TA 3QLQA 1GZCA 4Y22B 1LHOA 4H9WA 1X50A 5H9RA 5FZZA 3D6EA 1ENRA 2EIGA 2GNMA 4GWMA 1W3FA 4EB2B 4R9BA 3GALA 5F8WA 1BFBA 3HALA 4I4PA 2VUAA 1W6PB 4YW1A 1S0JA 1S0FA 2R49A 4IZEA 3AZYA 1S0BA 3MALA 2VLCA 1FMMS 4USPA 5BP5A 5HCFA 1FYUA 2GMEA 1LGNA 2ZQOA 2VSEA 4DEPA 4OUJA 2LALA 1WBCA 1JYCA 1AXZA 4FP3A 3SH4A 4P9XA 2ERMA 3FJ8A 2DWRA 4XDQA 2HZ9A 4DQAA 2E51A 4XFTA 1DHKB 5T5JA 1AFCA 2A5ZA 1FQ9A 1II4A 1QGLA 2ZHNA 4D69A 4CTEA 41BIA 1LEMA 3O0WA 3BRDA 2D23A 1RG8A 2A6YA 1JLYA 3DGTA 1BKZA 5E88A 3MW4A 4M3CE 4XYXA 4AGRA 3AP9A 1CVSA 3R4SA 2ZGQA 5H9SA 1SCSA 1W3GA 2WT1A 3JU9A 4GOVA 2A70A 1SFYA 1O4YA 4AVVA 1ULEA 2ZHLA 4TZDA 4ZBVB 1VALA 1KDMA 4R9DA 1GGPB 3I2XA 3UD9A 2DTWA 4I4QA 3OBRA 1G86A 5DZFA 4P0KA 3ZYRA 2ZMNA 4IY9A 3W9TA 1FAYA 3P6JA 3V65A 1LOGA 2FDBM 1ISVA 5LK5A 1FN0A 1SLCA 2ARXA 1V00A 3SNMA 2I1BA 5EC5A 4F83A 1O4ZA 2P3IA 4Z8BA 4AN7B 3AJZA 2A71A 1GLHA 3PVEA 1N3PA 4II0A 3Q7XA 3A22A 4M01A 3N7JA 2WQZC 3N7MA 2DU0A 3V79C 1V6JA 1YTOA 1CPNA 2EXHA 2Q3NB 3HR9A 4LO2A 4Y20B 2P37A 4JP0A 4GAIA 1CN1A 3ZVXA 1FWVA 5T55A 1C4RA 1G9FA 3V0AB 3NV3A 3VSFA 1ULDA 5GZEA 1WD4A 3BX1C 2A6XA 3RSJA 4LO1A 4XJ9A 1PZ8A 2E4MC 2Z42A 2R9KB 4YW4A 2KH2A 4WZFA 3ZC8A 3POKA 4LBOA 4FQ4A 3AXDA 3D5OA 1Z78A 4YM0A 5F90A 4GXLA 1URXA 1Z2VA 1GNZA 3O4DA 4FOYA 2D20A 4J2SA 1WW6A 3WINA 4ISRA 1VAVA 1U0AA 3UJQA 4K1YA 3V64A 1SBDA 1ULGA 1IS6A 1Z4SA 2Q9XA 2FFUA 5HCBA 4IZXA 2D24A 3AH4A 1C1FA 1BFCA 2NN8A 1VLNA 4M3CA 3FLTA 1KDKA 1APNA 3W58A 2AH2A 3V0BB 2VY0A 1GNHA 4FGFA 3W59A 3WOGA 4Y22A 3M3CA 1JT3A 3FJKA 2D7FA 4H04A 1AVXB 5T5LA 3H6SE 1HCDA 3BODA 2JKBA 5DZGA 1XG6A 3AJ6A 1W6PA 1MVEA 1IJTA 1JLXA 1GANA 3WG1A 3APBA 4LBQD 3WVJA 1AZDA 2L5XA 1GYKA 2NYYA 5JOYA 1UN1A 5GAQA 3UDAA 5DXDA 2I2SA 1DIWA 2NMNA 4BLJA 2YUGA 1BFFA 3UD8A 1F9KA 3K1XA 5CA6A 2OW4A 5GZCA 1M16A 2YV8A 2EALA 1ULFA 2DYCA 3ASIA 4ZOTA 4XIKA 2PHWA 1LHWA 1E0OA 2ZABA 1DQ4A 1CPMA 1SCRA 4P9WA 4JAWA 3AJ5A 2D1ZA 1FNZA 5JLVA 1DQ0A 4JPZA 2KM2A 1WCSA 1QOTA 1VCLA 1SLIA 3HOMA 2D22A 5DVHA 3M3QA 1R8OA 3WDXA 4BM8A 1BYHA 2ESUA 2VW0A 4W65A 4JKXB 8I1BA 5BQUA 4G1RA 4I4VA 4I1BA 3OJMA 1A3KA 5JMCA 2ZAAA 1SBFA 1VAMA 2ZKNA 3UJ4A 1Q8QA 5DUWA 4OEEA 4FPGA 1FGAA 4YZ1A 1G9CA 1LHNA 4YZ2A 5EXOA 4YW2A 5D61A 3OY8B 4YLZA 4XXPA 4WVWA 4Q1PA 5GLWA 7I1BA 3UD7A 4ENDA 2IHOA 2JD4A 3LSEA 4LO7C 3PG0A 4L4IA 2V73A 4OEGA 4C1WA 2Y9GA 2EXIA 1MS1A 4XHXA 4QD2C 1HWMB 1N1SA 2PHTA 3T1LA 2B7YA 1QNWA 4BMBA 1KJLA 1MS4A 4JCKA 3H6RA 4XBLA 1MS0A 4LBQB 4G9MA 1LOEA 4JKQA 4A7YA 2GNBA 1EPWA 2DVFA 3O0XA 2A6VA 4XHBA 3WDUA 1HWNB 2DU1A 1EV2A 2KI6B 5BOWA 3O3QA 4ITCA 4QO3A 1IT0A 4WBCA 3FJBA 3M2MA 1TTUA 3CAHA 1JN2P 3HN1A 5D63A 1YO8A 4IHZA 4Y20A 1DFQA 1AX0A 4CZSA 3I8TA 3PJQA 1DZQA 5G00A 3PVNA 5JOZA 1ISXA 1N4KA 5DSSB 1SLLA 1W6MA 3V0AA 1PWAA 1EVTA 3ZSMA 4XFUA 2D3RA 5HPZA 5F5QA 2MIBA 5GZFA 1LOBA 1G9DA 4I0YA 4HANA 1V6OA 3KQRA 4OWKA 3AYAA 4Q1RA 4U2AA 1HCEA 2MLLB 1V6VA 3VSZA 1JT7A 3CA6A 3T1MA 4QALA 4CJMA 1QKQA 3VKOA 4UW6A 3WA1A 3O49A 5FNXA 4Y1YA 3AZXA 1W6QB 1ONAA 2KLLA 4X39A 5GZGA 4U36A 3CRIA 5BVPI 1VIWB 4YG3A 1QDOA 3B9CA 3ZXGA 3OYWB 3ZYPA 4YM2A 2K43A 5BXTA 1B09A 3ZXKA 4YGDA 3RMXA 4XJAA 3PHZA 2ZQNA 3VKLA 2D6MA 3FJAA 1Q8OA 1QMJA 2FFVA 3PVOA 3JUTA 3CRHA 1QQKA 1FMZA 1ZA4A 1ONKB 3B9UA 1OQLB 2K4AB 1TWEA 2MC2A 2LIEA 4XMIA 1PZ9A 5DUXA 3FJHA 3GNEA 4LBNA 3B01A 2D43A 2D7RA 3WV6A 1IHKA 4I4OA 2IWTB 2ZGOA 3RTJB 2E4MA 4R9CA 4I4XA 4GKXA 5E24E 4C1XA 4IONA 2GZBA 3WNXA 4Q2FA 2SBAA 3E8LC 5DZUA 1LHUA 1RZOB 3ZXFA 1DQOA 1MD6A 2RG9B 4I4YA 2W39A 2ZGSA 1BA7A 4M00A 4Y24A 4FPCA 3NBCA 3USUA 5FREA 5JDBA 5E8AA 2ZGTA 2XB6C 1SR4A 5GZDA 4K1ZA 3BA7A 4K21A 1I1EA 3HMYA 3A23A 1LOFA 3BAGA 2A6ZA 4LBMA 1SZ6B 4FOWA 3RS6A 1MS8A 2WNEA 3P6IA 3IMNA 3L2YA 4PC4A 1K5VA 5DUYA 2E6VA 4XTMA 1IILA 1LOAA 1H9PA 3OJBA 2D6PA 1LGBA 2ZMLA 3CA4A 1BARA 1JYIA 4FPYA 1DQ1A 1GBGA 2WT0A 3IPVA 2F2FC 4I4SA 4A7KA 2YROA 2D6NA 4AN6A 1PC8B 1RIRA 3O5WB 3RG0A 2GN3A 4FQZA 3N7KA 1N47A 3T8SA 2RHPA 4LO0C 4YZ5A 4X37A 4YG6A 2CYFA 4PBPA 1YXWA 1JUIA 4P9YA 1V6NA 2D3PA 2GN7A 4FPEA 5GLUA 2PHUA 4XKIA 2H0BA 2WSUA 3CU1B 4ZFWB 2GNDA 2E7TA 1KJRA 1UKGA 3O4OA 4IY8A 4YGEA 4LBQA 2Y9XE 3MW2A 2HW9A 1Q8SA 2FMDA 3LTQA 1S0DA 2YMZA 1G82A 2JECA 5JOWA 4XJUA 1I1BA 3BAUA 1A8DA 1RMLA 3AYCA 3AH1A 1WBAA 2UUSA 4M3CF 3OPZA 4K20A 3IAGC 1FV2A 4GKYA 2YY1A 3R4UA 4ATEA 1FATA 1HQWA 1S1AA 2GO2A 2DVDA 3ZX7A 4J2YA 4GAFA 1WLWA 4R6UB 1MS9A 3VT2A 1DGLA 3O44A 4G6MA 1ZM1A 4I6IA 1BZWA 4ZXKA 1XYFA 3O4CA 5BP5C 3POSA 3FFZA 3I4IA 2ZGMA 1AF9A 1CR7A 2R1DA 1OFSA 4I2SA 1JOJA 3VKMA 4QBVA 5EHAA 3C9ZA 3MW3A 4ISQA 4I8MA 4EFPA 4X3AA 4P0LA 4YFWA 1HIBA 1W6QA 1JXNA 5BXRA 1DYPA 4EEEB 2ZGKA 1W6OB 1CONA 1LEDA 4DRRA 1BASA 1S0GA 3OBTA 3Q7WA 1IRAX 4ZA3B 2HYKA 4OW4A 4IQPA 2K8RA 3WUDA 2PELA 5SV8A 2SLIA 1GZWB 3SITA 3VWCA 2XOAA 1LENA 4XJ8A 4LBLA 3VT0A 4YZ3A 4AVTA 3BIWE 3FJDA 5CBLA 2ENRA 3ZSLA 2W68A 2BEBA 1J0SA 2DVAA 4KEKA 3A0NA 4JC1A 2D44A 4XBQA 2CWMA 1JBCA 4I30A 2DREA 2BQPA 4X38A 5T5PA 4LO8B 4DENA 4PQ9A 1MVQA 1QXMA 3AXEA 5JVVA 2P39A 3A07A 3BRFA 5T54A 4I96A 3NJ5A 5IUQA 1G9BA 3AYEA 1MZ6A 1ABRB 1PZZA 4I7IA 4FP2A 4Y1ZA 3B69A 1MC9A 4QC4A 2NZ9A 1JW6A 2UURA 2FHRA 5BXSA 3N3HA 5BYNA 2EF6A 4GWNA 2FGFA 3ILNA 1V6XA 4NOTA 3WHUA 3PUBA 3CQAA 3AH2A 3WHTA 3NBDA 3ILRA 4FOVA 4D0ZA 3ZSJA 4PBOA 1ISWA 3B3QE 1L2HA 5B2HA 1BFGA 2P34A 1ISYA 4FPOB 1HWPB 5BXPA 1AXYA 1HWOB 2DVGA 1WW7A 4AVSA 3BOPA 1AXKA 5JOXA 4YW5A 4LO2C 5DG2A 1XZZA 2YXSA 2WRYA 2P23A 3AZZA 2AYHA 2HWMA 5EYXA 1NLSA 1HLCA 1N3QA 5IT6A 1V6LA 2A75A 4KBBA 1T4QA 1FV3A 1PZ7A 2VSAA 2OUHA 5IK8A 3WO2A 1V6UA 1W6NB 4Z8SB 3FJIA 1BJQA 2RQ9A 3DUIA 2AXMA 2G4IA 3NV4A 5KXDA 1FX5A 4RL7A 3ZPYA 3HBWA 3M3OA 4YGCA 1P63A 2C5DA 2AGSA 1S0LA 3WINC 2JJ6A 3BB2A 2P3JA 1JHNA 4XJZA 3F1RA 2F8XC 4Q27A 2WJSA 1LGCA 2J3PA 4I1EA 3VT1A 3SISA 2A3WA 3BRGC 1N1YA 3RRDA 4Q8LA 1AVAC 4Q9GA 5GLVA 3C2UA 4HA2A 3IN9A 4QKSA 2ES3A 2AAIB 3FJFA 1LHVA 3FUQA 3FUOA 1UX6A 4UW5A 4BQ1A 3ZXDA 1UAIA 1SBEA 4TYSA 1DQ6A 3AP4A 2F2FA 1YI7A 3PMEA 1G9AA 2DUOA 3HSMA 3AZVA 3LLPA 1N1TA 3RQ0A 4LO7B 1YIFA 2DS0A 2BFHA 1CQ9A 2NM1A 1LJ7A 4A7ZA 4Q9PA 3VEQA 1CJPA 1Q8PA 2VH9A 2DUPA 2VW2A 4QD2B 3P53A 3D4KA 2VU9A 2AR6A 5IK5A 3A4UA 4DPNA 1LTEA 2PHXA 4FPLA 2WT2A 4DFSA 3H0OA 4YG0A 2BEAA 1LU1A 5GJ6A 4XBNA 4G6JA 4D8HA 1G8WA 2GNTA 5KXCA 1G7YA 4AGGA 6I1BA 3N7LA 3ATGA 5T5OA 1DFCA 3WG3A 3CA3A 1W6OA 4Y1VA 1AVUA 2D6KA 2GMPA 1NXD1 1TWMA 3AJYA 1Q56A 3AK0A 1KITA 1KNMA 4OWJA 3OJVA 1IS5A 2RSTA 1A78A 3V0BA 3OGFA 3A0KA 3VV1A 5H9QA 2UWBA 2DV9A 4SLIA 1T9FA 5BQUC 3AKIA 1MR5A 1IKQA 5FRAA 3MPPG 5AVAA 3VKNA 4WVVA 2ZA9A 1NUNA 1IS3A 3WUCA 4XFSA 1GSLA 2D6LX 3RTIB 2WBCA 3WDVA 1IKPA 1N3OA 3POWA 4Y26A 4Z9WB 1UMZA 4I3NA 3VUOA 2EXJA 1TP0A 5T52A 3WMVA 3H6QA 1JY0A 2ARBA 4USOA 5IK7A 4ZGRB 1YF8B 4GP3A 3NWKA 5CAZA 4HJJA 3F62B 2R16A 4LBJA 1WLCA 3WDTA 2NVHA 3AKGA 5F8YA 5EG6C 1LULA 3ILFA 4JRAA 1EYLA 4FVVA 4QKRA 2P2KA 1LODA 3SLIA 3O5SA 4AYUA 3S8JA 3TB0A 5DG1A 2X2SA 1BLAA 2DRZA 2DRYA 5H9PA 3JRRA 5KXBA 3O12A 4L4HA 2UU8A 2UWCA 1TIEA 3NBEA 4DS0A 3ZC9A 2ZGLA 4ASMB 1LU2A 2E53A 4JQ0A 3OY8A 4J2XA 4NO4A 1FNYA 4YW3A 1H9WA 4P14A 3CA0A 3O4BA 4YGBA 1AVWB 3ENRA 1V6KA 2ERFA 1SLTA 1AVBA 1OQ1A 2FO1A 5I1BA 3MEPA 1ENQA 4GP0A 3JUUA 4XZPA 3QCWA 2AFGA 2OVUA 1WD3A 4P0JA 2OUJA 3QR5A 4LO3C 3I2AA 1W6NA 1PUUB 1R1ZA 3Q9OA 4UW3A 1GKBA 4FPHA 1YRZA 2VW1A 3IM0A 1MS5A 4Y1XA 3M3EA 2CL2A 1Y7BA 2Z48A 4Q26A 4ATFA 1V6WA 3BADA 3H6RB 4XTPA 3IM5A 2ZGUA 3IM6A 2NP0A 4GOYA 4I37A 4KC3A 3EF2A 2ZBJA 3WO4A 4RA0A 5IK4A 4YFZA 2X2TA 1H30A 1C57A 3AP5A 2GALA 3INAA 5F8SA 2XG3A 2QYIB 4ZKTB 1KQRA 2WKKA 2M49A 4R9AA 1QF3A 4F34A 2Y9FA 1HQLA 1QOSA 1CVNA 1K5UA 5DUVA 3BA5A 1WBLA 1AXMA 3SH5A 4DRVA 4Y1UA 1W0OA 1W6MB 2NTDA 1J1TA 3IKWA 3FJJA 3OJ2A 1XQNA 2A3XA 2CWSA 1F5FA 1QU0A 4DCKC 3AP6A 5DUUA 2ZMKA 2GMMA 2R0FA 3S8KA 4LBKA 3NV1A 4TLPA 4KEJA 3I29B 4KEIA 3N36A 1W0PA 3WCRA 2C9AA 1TEIA 1NZKA 1ITBA 3RMYA 1QOOA 1AX1A 3BAHA 4BOWA 3M1HA 3O4AA 1M2TB 1DQGA 3OYWA 2P3KA 3ZXLA 3KM5A 3WZ1A 2V5YA 1OKQA 4ZFYB 1RITA 1DQ2A 1CE7B 3CNAA 2ZR1B 1SR4C 31BIA 3WCSA 2JE7A 1WBFA 3KMVA 3BTAA 1LOFC 1S0CA 2LTNA 2UWAA 2ZZJA 3TC2A 3QYDA 4J2KA 3O0VA 2NMOA 2CNAA 4GA9A 4XXAA 4Q8KA 2ZGRA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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