3S8XA

Crystal structure of human carbonic anhydrase isozyme ii with 4-{[(4-methyl-6-oxo-1,6-dihydro-2-pyrimidinyl)sulfanyl]acetyl}benzenesulfonamide
Total Genus 79
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
79
Knots found
sequence length
257
structure length
257
Chain Sequence
HWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase/lyase inhibitor
molecule keywords Carbonic anhydrase 2
publication title Design of [(2-pyrimidinylthio)acetyl]benzenesulfonamides as inhibitors of human carbonic anhydrases.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 79
structure length 257
sequence length 257
other databases KnotProt 2.0: K +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2011-05-31

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 3s8xA00
4Z1JA 5IPZA 1FQMA 5E5UA 3F7BA 3M2YA 1G4OA 4RN4A 4WW8A 5DSRA 1TBTX 5JESB 1BZMA 2NXRA 1RZDA 4ZWIA 3DCCA 1KOQA 1OKNA 2VVAX 3MZCA 1XEVA 2FOVA 3U47A 4Q06A 2IT4A 3CAJA 4Y0JA 3S74B 1LG6A 2NWYA 5FLSA 1G4JA 1CNXA 1HEDA 3BETA 4ZWXA 2POUA 4M2UA 1G53A 4CQ0A 3TMJA 4Q90A 1CNYA 1FSRA 4CNXA 4CNVA 1CNWA 3RYJB 4QIZA 5JGTB 5E28A 1JCZA 2NXTA 4Q87A 5L3OA 3U7CA 4YGLA 1IF7A 3HKTA 4CA2A 1CALA 3RZ7A 4G0CA 4JS6A 3B1BA 3HKNA 3M2ZA 1OKLA 5FL6A 2CA2A 2NNVA 2NN1A 1TE3X 1HUHA 3IAIA 4YGFA 2HD6A 2CBDA 4RFDA 2EZ7A 3U3AX 1IF6A 3KNEA 2Q1QA 5EHWA 1TTMA 3DVCA 3W6HA 1RZEA 1ZGFA 1BNVA 1CAZA 1IF4A 1ZSBA 5BYIA 1HCAA 3V5GA 3CYUA 4YGKA 5JG5B 1BV3A 1AVNA 2ZNCA 4FVOA 3IEOA 1DCBA 5AMLA 5JGSB 1CNJA 1URTA 3SAXA 3HFPA 1BNMA 3PJJA 3P5LA 4KUVA 1F2WA 1H9QA 1YO2A 1CNIA 2CBEA 5FLRA 4WUPA 4Q78A 2POWA 4KP8A 1CNKA 3DD0A 4FPTA 3M14A 3MHCA 2FW4A 3RYYA 2FMZA 3F8EA 1ZSCA 1KOPA 2HNCA 2QOAA 3DV7A 1XQ0A 2FOQA 4QK3A 2OSFA 3OYSA 4Q6DA 1CAOA 3V3HB 4Z1NA 1KWRA 2H4NA 3NB5A 1CAHA 4KUWA 2FNKA 8CA2A 3N4BA 3P58A 4ZAOA 4E9OX 2NWOA 2HL4A 1CIMA 2EU2A 1CAYA 1Y7WA 1DMYA 3F7UA 5J8ZA 5BRWA 4M2VA 4YXOA 3IBUA 3QYKA 4MDLA 3M3XA 3M98A 3R16A 4HF3A 4K1QA 4YX4A 3V2MA 3KOIA 1FSNA 3TVOX 3T82A 4DZ7A 1CCTA 5FNLA 3K7KA 3M96A 4PYYA 1LGDA 4Q6EA 2Q38A 2ILIA 4ZX1A 1V9EA 5FLTA 4YGJA 1RAYA 1CA3A 1AZMA 1BNUA 4LU3A 4QTLA 4WL4A 3RZ5A 2OSMA 3NI5A 4RH2A 1CCUA 1MOOA 2HKKA 4XIWA 3RG3A 1TB0X 5SZ5A 4E5QA 4KNNA 1UGAA 3FW3A 3OIMA 5EH7A 1TH9A 5FNIA 5FLPA 1HEBA 4QJ0A 3MNHA 4KP5A 3HLJA 3MNJA 5SZ1A 1CA2A 5DSNA 1YDBA 3HKQA 3UYNA 3ZP9A 3N3JA 3K2FA 4YXUA 4N0XB 2FMGA 3P44A 1TEUX 1ZFKA 4KUYA 5JQ0A 4BF1A 4ITOA 4G7AA 1ZGEA 3M5TA 5FNJA 4RUXA 3IBLA 1I8ZA 4FRCA 1UGEA 2X7TA 3EFTA 3D93A 1RZAA 3FFPX 3RZ1B 1AM6A 5EHVA 4XIXA 4COQA 2FOYA 1BNNA 3M2NA 4FU5A 3B4FA 5E5RA 1KWQA 4HEWA 1I9OA 3M40A 5BRVA 5CJFA 1I9LA 5G0CA 3N0NA 4CACA 4PQ7A 5G0BA 2HFWA 2AW1A 2FOSA 5JEPB 4ZWYA 1G45A 1JD0A 3MNUA 3LXEA 3P4VA 4IDRX 3M5EA 4L5UA 1G3ZA 5EOIA 3RYXB 2QP6A 4Q49A 6CA2A 1TG9A 3KS3A 4QJOA 4Z1KA 3MHLA 2FOUA 3UYQA 1UGDA 1ZSAA 5EH5A 5A6HA 1RJ5A 1G54A 4IWZA 3KIGA 4MTYA 4Q8ZA 5JG3B 5JQTA 3PO6A 3M1JA 3OKVA 9CA2A 2CBBA 1CVBA 1HECA 5JEHB 5FL5A 1DCAA 4WW6A 3JXHC 3D8WA 3M2XA 3S75B 2AX2A 3TVNX 1THKA 1HCBA 4GL1X 2WEJA 7CA2A 5E2NA 1RJ6A 1G52A 2WEGA 3T85A 3MNAA 1YO0A 4RIUA 1CVDA 3RZ8A 3S97A 1BN4A 4X5SA 4BF6A 3DA2A 3KKXA 3CA2A 5CA2A 4N16A 4Q9YA 1UGGA 1BN3A 3M1QA 1DMXA 2WEHA 3M67A 2X7SA 1BCDA 3N2PA 1HVAA 2QO8A 2NWZA 4FL7A 4KNJA 1KEQA 3S8XA 1CNCA 3V3GB 4QK1A 4Q7VA 3V2JA 3KWAA 1I90A 2EU3A 3DD8A 4QK2A 4QSIA 4CNRA 3W6IA 5SZ0A 5SZ7A 3MMFA 3S9TA 4TWMA 3JXFA 4QJMA 5FNKA 4M2WA 4XZ5A 3T5ZA 4CNWA 1G0EA 3D9ZA 3OY0A 4UOVA 5SZ6A 3RYVB 1ZH9A 2NWPA 4HT0A 4KNMA 1I9QA 4QJWA 1CRMA 3PYKA 4RUZA 5G01A 4RUYA 4ZWZA 4PYXA 3S78B 4KV0A 4Q99A 5FNGA 3MHMA 4Q81A 4Q7WA 4JSWA 3V3FA 3S71B 5E2RA 1ZNCA 1YDCA 4DZ9A 4L5WA 4JSAA 4RFCA 4K0ZA 5DOGA 1I9PA 3D92A 3M1WA 2NN7A 1CVAA 2GD8A 4ILXA 3MYQA 2GEHA 3V3JA 4LHIA 1CILA 5EKHA 1RZBA 3DC3A 4QY3A 5FDCA 3SAPA 1OQ5A 4MLTA 3JXGA 3S77B 3V7XA 1UGCA 3HKUA 1A42A 12CAA 1T9NA 1V9IC 4QSBA 2CBCA 1YDAA 5JDVB 3RZ0B 1TEQX 4XFWA 3ML2A 5FDIA 1IF8A 5C8IA 4E3FA 2WD3A 2NNGA 5JEGB 3DAZA 1Z97A 4R5BA 3DVDA 1CCSA 2CBAA 1TG3A 3U45X 3DCWA 4C3TA 1G0FA 3HS4A 4E3GA 4R59A 4FVNA 4HBAA 4YXIA 1HEAA 4JSSA 5G03A 1EOUA 1XEGA 4Q09A 3F4XA 1CAMA 3P5AA 3RJ7A 3MNKA 3EFIA 3RGEA 2HOCA 3M04A 4ETQC 5HPJA 4E4AA 4MO8A 4K13A 5EZTX 4HEZA 4JSZA 3SBHA 4Q0LA 1IF5A 2WEOA 4HT2A 1OKMA 1G1DA 1XPZA 2H15A 3RYZA 4M2RA 5DVXA 4Z1EA 5LMDA 2POVA 1LZVA 1Z93A 3IBNA 4Q7SA 1G6VA 3BL1A 5DSLA 3RLDA 1H4NA 4Q8XA 5DRSA 1CNGA 3OILA 4E49A 1FQRA 2CABA 3K34A 5DSKA 3DCSA 3KOKA 5EIJA 5DSIA 3MHIA 1CVCA 4PZHA 3MWOA 1BICA 1CANA 3MHOA 1I91A 1CVEA 1I9NA 2NMXA 3GZ0A 1FQLA 4Q7PA 3OIKA 1CZMA 4QSJA 4K0SA 4Q08A 5SZ3A 3T83A 1CVHA 2FNMA 4KAPA 1CINA 1J9WA 1IF9A 3S72B 1FSQA 4FIKA 4E3HA 5BNLA 1BNWA 3D0NA 3IBIA 3MDZA 2O4ZA 5BRUA 1CAIA 4ITPA 4KNIA 2WD2A 1H9NA 5FNHA 1BN1A 4Z0QA 5FNMA 4YWPA 4MLXA 5EKJA 1YDDA 4YGNA 1Z9YA 3S73B 4QIYA 4YYTA 3M1KA 5SZ4A 5EKMA 1CRAA 4R5AA 5DSPA 3M5SA 5FL4A 1RZCA 1LUGA 1FR4A 3KLDB 3IGPA 3NJ9A 5L6KA 5FLQA 2ABEA 4RIVA 3KONA 4HEYA 1MUAA 2NNOA 4WUQA 5E2KA 3DBUA 3DC9A 4YHAA 3MNIA 4E3DA 4QJPA 1HUGA 4QEFA 1JV0A 1BNTA 2Q1BA 4L5VA 3CZVA 5DSMA 5DSOA 5E2SA 5AMGA 5FLOA 1CNHA 5SZ2A 3RG4A 1UGBA 4YVYA 2F14A 1ZFQA 4QJXA 5EH8A 1CAJA 4PXXA 3T5UA 3BL0A 4K0TA 5E2MA 1RAZA 3DVBA 2FNNA 1UGFA 4LP6A 2X7UA 1YO1A 4TWLA 4ZX0A 4Q8YA 1CVFA 1LG5A 3R17B 3P3JA 4BCWA 5CACA 3Q31A 3L14A 1G46A 3C7PA 4XE1A 3SBIA 3OKUA 5DSJA 3FE4A 4Q07A 1FLJA 3P3HA 3ML5A 1FQNA 1FR7A 5CLUA 5DOHA 3T84A 3S76A 3V3IB 5A25A 4MDMA 5DSQA 1BNQA 3OYQA 5AMDA 1G48A 2NXSA 2VVBX 1CNBA 1CAKA 2W2JA 4QSAA 4Q83A 3VBDA 4HU1A 3P55A 2NNSA 1I9MA 4WR7A 5EHEA 1ZE8A 3ZNCA 4MDGA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4Z1J A;  5IPZ A;  1FQM A;  5E5U A;  3F7B A;  3M2Y A;  1G4O A;  4RN4 A;  4WW8 A;  5DSR A;  1TBT X;  5JES B;  1BZM A;  2NXR A;  1RZD A;  4ZWI A;  3DCC A;  1KOQ A;  1OKN A;  2VVA X;  3MZC A;  1XEV A;  2FOV A;  3U47 A;  4Q06 A;  2IT4 A;  3CAJ A;  4Y0J A;  3S74 B;  1LG6 A;  2NWY A;  5FLS A;  1G4J A;  1CNX A;  1HED A;  3BET A;  4ZWX A;  2POU A;  4M2U A;  1G53 A;  4CQ0 A;  3TMJ A;  4Q90 A;  1CNY A;  1FSR A;  4CNX A;  4CNV A;  1CNW A;  3RYJ B;  4QIZ A;  5JGT B;  5E28 A;  1JCZ A;  2NXT A;  4Q87 A;  5L3O A;  3U7C A;  4YGL A;  1IF7 A;  3HKT A;  4CA2 A;  1CAL A;  3RZ7 A;  4G0C A;  4JS6 A;  3B1B A;  3HKN A;  3M2Z A;  1OKL A;  5FL6 A;  2CA2 A;  2NNV A;  2NN1 A;  1TE3 X;  1HUH A;  3IAI A;  4YGF A;  2HD6 A;  2CBD A;  4RFD A;  2EZ7 A;  3U3A X;  1IF6 A;  3KNE A;  2Q1Q A;  5EHW A;  1TTM A;  3DVC A;  3W6H A;  1RZE A;  1ZGF A;  1BNV A;  1CAZ A;  1IF4 A;  1ZSB A;  5BYI A;  1HCA A;  3V5G A;  3CYU A;  4YGK A;  5JG5 B;  1BV3 A;  1AVN A;  2ZNC A;  4FVO A;  3IEO A;  1DCB A;  5AML A;  5JGS B;  1CNJ A;  1URT A;  3SAX A; 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