3SBBC

Disulphide-mediated tetramer of t4 lysozyme r76c/r80c by synthetic symmetrization
Total Genus 57
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
57
sequence length
163
structure length
163
Chain Sequence
PMNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVCGILCNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords Lysozyme
publication title An approach to crystallizing proteins by metal-mediated synthetic symmetrization.
pubmed doi rcsb
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 57
structure length 163
sequence length 163
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2011-06-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
C PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 3sbbC00
1P3NA 1G1WA 1L43A 1L33A 162LA 1L35A 2L78A 1L21A 4W52A 1C67A 1P6YA 181LA 1C6FA 3G3XA 4ARLA 3GUMA 4PK0A 4DJHA 257LA 1C6PA 1L29A 143LA 1LGUA 110LA 4EXMA 1C61A 1L61A 1L50A 214LA 2RBSA 3GUNA 4ARMB 2HUKA 2RBNA 108LA 178LA 1L54A 2RAYX 191LA 1C68A 1LGXA 1L84A 1SWYA 1LI2A 234LA 1DYBA 1L58A 177LA 1QUHA 1L65A 3HUKA 3NY9A 3NYAA 3NY8A 1QTBA 3CDVA 4ARQA 130LA 3SB7A 2OU0X 1ZURA 1L81A 4I7RA 3G3WA 138LA 3SB9A 1L55A 1DYCA 1CU3A 1D3FA 230LA 1D3MA 1OYUA 1QTVA 226LA 2B6YA 1C6AA 1OWYA 1L13A 3DN4A 3DN6A 126LA 1L41A 1QS5A 173LA 1L28A 1QT8A 1L87A 1P56A 1C6QA 1PQMA 2B72A 1L98A 3DN2A 1B6IA 1OWZA 4EPIA 157LA 3OE9A 1L71A 206LA 3HU8A 211LA 224LA 185LA 1L27A 3FADA 1D2WA 1L01A 119LA 249LA 210LA 3HTDA 4ARMA 1T8GA 109LA 256LA 3FA0A 1CU0A 2OE9X 165LA 1OV5A 1L93A 262LA 188LA 248LA 2RH1A 1CV0A 3RZEA 1L52A 241LA 4PJZA 1L40A 212LA 1CV4A 1C6DA 1C60A 3CDRA 152LA 2HULA 240LA 4YXCA 2LC9A 1KY0A 1LYFA 1L51A 2F32A 175LA 195LA 1L76A 4W54A 3RUNA 3DN1A 137LA 1CX6A 4I7OA 4W59A 187LA 1T6HA 131LA 158LA 1L04A 2RAZX 1L88A 3HTFA 1C65A 1G0KA 1LYJA 1G0GA 1C6KA 159LA 3DKEX 4GBRB 156LA 3SN6R 3CDOA 103LA 247LA 235LA 147LA 1L00A 3VW7A 1L46A 1CU2A 3OE6A 4I7SA 1L94A 1L37A 245LA 4I7JA 2B7XA 1SSWA 1QTDA 2RB1X 1LPYA 1C6BA 1LI3A 3GUPA 3L2XA 2B75A 4I7PA 166LA 1CUQA 172LA 1D9WA 1P46A 4I7LA 7LZMA 139LA 242LA 1LI6A 3HT6A 1PQIA 1L67A 4K5YA 1L75A 4DKLA 239LA 1C6EA 3K2RA 3HDFA 4I7NA 1JTMA 201LA 1L38A 1JQUA 4W53A 1L0JA 3HH3A 3V2WA 1DYGA 1C62A 3GUKA 2B74A 3SB8A 148LE 1PQDA 1G0MA 229LA 2Z6BA 1SWZA 3C8SA 1L15A 1L89A 1L59A 1XEPA 180LA 216LA 3HH4A 4OO9A 142LA 3FI5A 3C7ZA 144LA 3C83A 1D3JA 1LW9A 1L17A 1NHBA 1L77A 1L05A 1ZWNA 1L64A 2RB0X 104LA 3QAKA 2ANVA 115LA 1C6IA 2A4TA 2B6ZA 2LCBA 238LA 4W51A 4ZPUA 1CUPA 1I6SA 1SX2A 1L36A 244LA 1QSBA 1L60A 3C8QA 1TLAA 228LA 6LZMA 3DMVA 3DMXA 3SBAA 225LA 1L14A 169LA 4EKPA 3V2YA 1L47A 1K28A 1CV3A 1C66A 3ODUA 1L62A 2QB0B 3F9LA 4GRVA 259LA 1L44A 118LA 176LA 2RBOA 4I7MA 170LA 250LA 3C81A 3GULA 1QTHA 1LYGA 189LA 3F8VA 1C63A 2O79A 4EKSA 2HUMA 3D4SA 2NTGA 4DAJA 1P64A 174LA 1EPYA 120LA 3HTBA 4E97A 218LA 213LA 3DNAA 1KW7A 1LYDA 3HT9A 4LDEA 2O7AA 232LA 1P37A 1L06A 3HH6A 2B6WA 217LA 231LA 167LA 2F2QA 4LDLA 3GUOA 1PQKA 2Q9DA 1C6NA 223LA 1L0KA 4EKQA 3C82A 1LYHA 1DYEA 2OTZX 236LA 3C7YA 1L63A 1SSYA 163LA 128LA 4ARJA 1CU5A 1T8AA 1L70A 146LA 3PBLA 3HUAA 260LA 3SB5A 4I7QA 227LA 2RBPA 129LA 4EKRA 1PQJA 1C6TA 2CUUA 3SBBC 1L39A 1KW5A 2B70A 199LA 2F47A 102LA 1KNIA 160LA 1L23A 1L79A 1L72A 4EPFA 2B6TA 1DYDA 1G0PA 1QT3A 205LA 1OVHA 1CTWA 2B73A 2OE7X 222LA 1QUDA 1L12A 1QTCA 1L07A 4IAPA 1L34A 1L53A 1CVKA 1L91A 3LZMA 1L48A 192LA 1LYEA 2O4WA 3L64A 113LA 1L24A 1C6MA 4EJ4A 2OU8A 1L25A 221LA 233LA 1L56A 3HT8A 243LA 4YX7C 197LA 3DMZA 3EMLA 4YXAC 1DYFA 1G1VA 1CV6A 141LA 2RBRA 1L11A 1L82A 2QARC 2OE4X 1G0QA 3HU9A 1L10A 1C6GA 1C6JA 1ZYTA 1LWGA 1QS9A 4W56A 1CV1A 1G0LA 3HDEA 251LA 2LZMA 190LA 1L99A 1P5CA 114LA 168LA 3DN0A 1L83A 4LDOA 3CDTA 4AQNA 219LA 150LA 1P36A 1QT7A 2OTYX 1L80A 107LA 3HH5A 151LA 184LA 1L32A 253LA 1QUGA 1L95A 1L68A 1LWKA 1L31A 1XJUA 3GUJA 3GUIA 1C69A 1D2YA 4I7TA 1KY1A 1L18A 1WTHA 1OVKA 1CX7A 164LA 2RBQA 1LLHA 1L49A 1L74A 1XJTA 3HUQA 155LA 1QTZA 3SB6A 140LA 1L09A 1OV7A 209LA 1L20A 261LA 1L08A 4W57A 1T8FA 1P7SA 252LA 1QSQA 1QUOA 215LA 1L92A 1QT6A 1L03A 1L69A 1P2LA 1L22A 2ANXA 3G3VA 149LA 3DN3A 1G07A 3PDSA 2Q9EA 1KS3A 4ARPA 196LA 1L96A 111LA 183LA 1L86A 186LA 3C7WA 1G0JA 1CV5A 3CDQA 3DN8A 4LZMA 237LA 123LA 1P2RA 2B6XA 200LA 125LA 255LA 122LA 1C6LA 1OVJA 1L16A 1L45A 4S0WA 1DYAA 1L42A 1L02A 3C80A 3C8RA 2OU9A 1G06A 1LYIA 1C64A 1JTNA 1SX7A 2RB2X 3HT7A 220LA 1L97A 1PQOA 1L66A 246LA 2IGCA 254LA 1QT5A 1L19A 3OE0A 1D3NA 3HWLA 5I14A 1L73A 161LA 3UONA 1LGWA 3OE8A 4ARQB 4W58A 1L85A 1L90A 4W55A 3HTGA 127LA 1CU6A 258LA 1T97A 2OEAX 4I7KA 2NTHA 3JR6A 5LZMA 112LA 171LA 198LA 1L57A 145LA 1QT4A 1L26A 1C6CA 182LA 1C6HA 1L30A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1LHKA 4H1PA 5I4YA 2L78A 3CT1A 4H8ZA 3QE8A 4W52A 1UICA 1UIBA 1C67A 3G3XA 2G4PA 2BQNA 5DL9A 4PK0A 4J1AA 3A34A 1C6PA 1B5XA 135LA 2RBNA 3AZ5A 108LA 1NDGC 1GF6A 3RW8A 3TMXA 4II8A 2RAYX 191LA 1LGXA 3CSRA 1DYBA 4R6CA 3TXGA 3NY9A 1HEQA 1JWRA 4XJBA 5APFA 1CKFA 1H87A 1NBYC 1LTMA 1QIOA 2Z38A 1UCOA 226LA 1QTVA 5C6LA 1GF3A 4NSIA 3DN6A 5KY1A 5B1FA 1LJEA 4DD7A 4LYOA 1L28A 4PGJB 1L87A 1QTKA 2B72A 1L98A 3DN2A 1B6IA 1GB9A 211LA 224LA 2W1YA 4DDAA 185LA 5HMJA 1DI4A 4H9CA 4NSJA 1KXWA 4NGJA 3CSQA 1LMAA 4GLVA 5FSTA 1GB7A 1CU0A 2OE9X 1NMMA 1IVMA 1D6PA 1JEFA 2D6BA 1LMQA 248LA 4LFXA 3RZEA 3LN2A 4DD2A 1GB6A 2DQAA 2F30A 1L40A 1UC0A 1CV4A 1GAYA 5LAFA 4QEQA 1C60A 1LYOA 4PRQA 4MSTA 5KXOA 1LYFA 1L51A 3CQLA 4W54A 4LT1A 5LVGA 4I7OA 1GB3A 4U3XB 3SP3A 3W3EA 4H9HA 1JTTL 1JUGA 1GB5A 1UACY 1D9UA 4NHSA 1YKZX 3IWRA 1SLYA 1G0GA 1VDSA 4DD3A 3DKEX 2ZNXY 3D3DA 247LA 4ZEEA 3VW7A 1GXV2 4WM4A 3J4GA 2B7XA 1LCNA 1QTDA 1C6BA 1EQ4A 3CT0A 1LPIA 1GD6A 1LJ4A 4YEOA 3WU8A 3WW5A 1CUQA 2XBRA 1LSEA 1B0DA 3GXRA 4M6DA 4WOAA 3AYQA 1LI6A 4RLNA 1L67A 239LA 2A7FA 2DQFC 1LJFA 1REYA 1REMA 3A96A 4P2EA 1EQ5A 1IP1A 1YANA 1JQUA 4W53A 2HEEA 1RFPA 148LE 1G0MA 229LA 1IWVA 1XEPA 180LA 4EMNA 4DYGA 144LA 3P68A 1LW9A 1IORA 4HPEA 1UIAA 2N5ZA 5I5QA 4IATA 115LA 1RI8B 2A4TA 1IO5A 1HF4A 9LYZA 2LHMA 1LZ9A 1CUPA 1HERA 2H9KA 5C6IA 1I6SA 4OW1A 1L60A 4NG1A 1TLAA 228LA 6LZMA 2ZILA 1VFBC 2BQGA 3SBAA 225LA 4HTQA 4DD9A 4WLYA 2ZQ4A 1L47A 1GBSA 4ETBA 4J1BA 1C66A 1D6QA 1HENA 5I53A 4WM6A 1KIQC 2Z19A 3C81A 1HSWA 189LA 1IWXA 4LYMA 2O79A 2I25L 2NTGA 174LA 4GLAA 120LA 1GFTA 3HTBA 3TXEA 1LYDA 232LA 4TWSA 3TXHA 4LDLA 3RZ4A 1FBIX 4FJRA 223LA 1L0KA 2IFFY 2XBSA 4CJ2A 1O23A 1YROA 163LA 4ARJA 2ZIJA 1CU5A 1TDYA 3PBLA 227LA 2I6ZA 3IJUA 2RBPA 1PQJA 3AZ6A 1YQVY 1JKDA 4GCBA 1HSXA 1B7MA 4EPFA 1DYDA 1BB3A 1G0PA 1IIZA 3WU9A 3P66A 5F9UA 2OE7X 1B7QA 1QUDA 1GFEA 1L53A 1CVKA 4Z41A 4LZTA 2MEFA 1BGIA 192LA 4EJ4A 2H5ZA 4LT0A 4NGLA 1OP9B 243LA 1NBZC 2XQOA 1L82A 1ZYTA 1LWGA 1QS9A 3N9CA 1CV1A 1G0LA 3HDEA 2MEAA 190LA 1LMNA 114LA 168LA 1GDWA 1OUIA 1GXXA 150LA 1GE4A 1QT7A 5B07A 1L80A 151LA 1IWYA 1GWDA 5DN4A 3GUJA 5APCA 1C69A 3B6LA 4OOTA 2XTHA 3ULRA 3K3TA 1GAZA 1GDXA 4NWHA 3AZ7A 3HUQA 1XJTA 1IR7A 2BQCA 4HJZA 1LZYA 1QUOA 4ETEA 2YBMA 1L92A 1QT6A 1LZ8A 1L22A 4Z3MA 1G07A 1KS3A 1LJKA 1L96A 3W6EA 1JHLA 6LYTA 1FKVA 1CV5A 3MGWA 5KJ9A 3TXDA 3F6ZA 2CJLA 1DKJA 1P2RA 1LHMA 200LA 1C6LA 5KXMA 1L45A 4S0WA 1XEIA 2OU9A 1G06A 1UA6Y 2ZWBA 5DN5A 5B05A 1JISA 3M18B 1L66A 2IGCA 1L19A 1L73A 161LA 132LA 1LGWA 2W1XA 4ARQB 1L90A 2MEEA 5KXZA 258LA 2OEAX 1HC0A 2W1MA 1JKAA 193LA 1C6CA 182LA 1JITA 1P3NA 1G7IC 1L43A 2YSSC 3CSZA 1P6YA 4ARLA 1WQRA 3GUMA 4C5FA 1GBXA 1LGUA 2CDSA 2DQGY 3B0IA 1C61A 1L61A 4LYBA 1L50A 4ZFPA 2BQEA 1UBZA 1HEPA 1C68A 4RW2A 1L84A 234LA 1L58A 3W6CA 1IC7Y 2YDGA 1KXYA 208LA 3NYAA 3CDVA 4ARQA 2ZYCA 4UWVA 138LA 1B7LA 4NWEA 1L55A 1CNSA 4HJVA 1CU3A 1GE3A 2MEDA 1TEWA 5EBHA 1D3MA 2B6YA 5HQ1A 3DN4A 1QUSA 5LVIA 4WM1A 1L41A 1OUDA 2Q0MX 4DC4A 5LVHA 2DBTA 1P56A 4LT3A 1PQMA 4EPIA 1C43A 3A6BY 1HEMA 1L71A 5B59A 4NGWA 1L27A 4B0DA 3LYOA 1LSYA 5KXPA 4ETCA 3LYZA 1JJ0A 256LA 1YAMA 3WXUA 1BB7A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1LHK A;  4H1P A;  5I4Y A;  2L78 A;  3CT1 A;  4H8Z A;  3QE8 A;  4W52 A;  1UIC A;  1UIB A;  1C67 A;  3G3X A;  2G4P A;  2BQN A;  5DL9 A;  4PK0 A;  4J1A A;  3A34 A;  1C6P A;  1B5X A;  135L A;  2RBN A;  3AZ5 A;  108L A;  1NDG C;  1GF6 A;  3RW8 A;  3TMX A;  4II8 A;  2RAY X;  191L A;  1LGX A;  3CSR A;  1DYB A;  4R6C A;  3TXG A;  3NY9 A;  1HEQ A;  1JWR A;  4XJB A;  5APF A;  1CKF A;  1H87 A;  1NBY C;  1LTM A;  1QIO A;  2Z38 A;  1UCO A;  226L A;  1QTV A;  5C6L A;  1GF3 A;  4NSI A;  3DN6 A;  5KY1 A;  5B1F A;  1LJE A;  4DD7 A;  4LYO A;  1L28 A;  4PGJ B;  1L87 A;  1QTK A;  2B72 A;  1L98 A;  3DN2 A;  1B6I A;  1GB9 A;  211L A;  224L A;  2W1Y A;  4DDA A;  185L A;  5HMJ A;  1DI4 A;  4H9C A;  4NSJ A;  1KXW A;  4NGJ A;  3CSQ A;  1LMA A;  4GLV A;  5FST A;  1GB7 A;  1CU0 A;  2OE9 X;  1NMM A;  1IVM A;  1D6P A;  1JEF A;  2D6B A;  1LMQ A;  248L A;  4LFX A;  3RZE A;  3LN2 A;  4DD2 A;  1GB6 A;  2DQA A;  2F30 A;  1L40 A;  1UC0 A;  1CV4 A;  1GAY A;  5LAF A;  4QEQ A;  1C60 A;  1LYO A;  4PRQ A;  4MST A;  5KXO A;  1LYF A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
 1LHK A;  4H1P A;  5I4Y A;  2L78 A;  3CT1 A;  4H8Z A;  3QE8 A;  4W52 A;  1UIC A;  1UIB A;  1C67 A;  3G3X A;  2G4P A;  2BQN A;  5DL9 A;  4PK0 A;  4J1A A;  3A34 A;  1C6P A;  1B5X A;  135L A;  2RBN A;  3AZ5 A;  108L A;  1NDG C;  1GF6 A;  3RW8 A;  3TMX A;  4II8 A;  2RAY X;  191L A;  1LGX A;  3CSR A;  1DYB A;  4R6C A;  3TXG A;  3NY9 A;  1HEQ A;  1JWR A;  4XJB A;  5APF A;  1CKF A;  1H87 A;  1NBY C;  1LTM A;  1QIO A;  2Z38 A;  1UCO A;  226L A;  1QTV A;  5C6L A;  1GF3 A;  4NSI A;  3DN6 A;  5KY1 A;  5B1F A;  1LJE A;  4DD7 A;  4LYO A;  1L28 A;  4PGJ B;  1L87 A;  1QTK A;  2B72 A;  1L98 A;  3DN2 A;  1B6I A;  1GB9 A;  211L A;  224L A;  2W1Y A;  4DDA A;  185L A;  5HMJ A;  1DI4 A;  4H9C A;  4NSJ A;  1KXW A;  4NGJ A;  3CSQ A;  1LMA A;  4GLV A;  5FST A;  1GB7 A;  1CU0 A;  2OE9 X;  1NMM A;  1IVM A;  1D6P A;  1JEF A;  2D6B A;  1LMQ A;  248L A;  4LFX A;  3RZE A;  3LN2 A;  4DD2 A;  1GB6 A;  2DQA A;  2F30 A;  1L40 A;  1UC0 A;  1CV4 A;  1GAY A;  5LAF A;  4QEQ A;  1C60 A;  1LYO A;  4PRQ A;  4MST A;  5KXO A;  1LYF A; 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