3SCTA

Crystal structure of rice bglu1 e386g mutant complexed with cellotetraose
Total Genus 196
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
196
sequence length
472
structure length
472
Chain Sequence
NWLGGLSRAAFPKRFVFGTVTSAYQVEGMAASGGRGPSIWDAFAHTPGNVAGNQNGDVATDQYHRYKEDVNLMKSLNFDAYRFSISWSRIFPDGEGRVNQEGVAYYNNLINYLLQKGITPYVNLYHYDLPLALEKKYGGWLNAKMADLFTEYADFCFKTFGNRVKHWFTFNEPRIVALLGYDQGTNPPKRCTKCAAGGNSATEPYIVAHNFLLSHAAAVARYRTKYQAAQQGKVGIVLDFNWYEALSNSTEDQAAAQRARDFHIGWYLDPLINGHYPQIMQDLVKDRLPKFTPEQARLVKGSADYIGINQYTASYMKGQQLMQQTPTSYSADWQVTYVFAKNGKPIGPQANSNWLYIVPWGMYGCVNYIKQKYGNPTVVITGNGMDQPANLSRDQYLRDTTRVHFYRSYLTQLKKAIDEGANVAGYFAWSLLDNFEWLSGYTSKFGIVYVDFNTLERHPKASAYWFRDMLKH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Hydrolase
molecule keywords Beta-glucosidase 7
publication title Structural investigation of the basis for cellooligosaccharide synthesis by rice BGlu1 glycosynthases
rcsb
source organism Oryza sativa japonica group
total genus 196
structure length 472
sequence length 472
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.21: Beta-glucosidase.
pdb deposition date 2011-06-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00232 Glyco_hydro_1 Glycosyl hydrolase family 1
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3sctA00
2VRQA 1K6AA 1YHTA 3WDJA 4AZIA 4PMDA 2EPKX 2OSYA 3CLWA 3B9EA 1W91A 4NF7A 1GHRA 4GXPA 2WMIB 3WF0A 1E6XM 1HJSA 4AYSA 1GQKA 2NSXA 4H8VA 5ABFB 1CEOA 1V08A 4OZOA 6TAAA 3AJ7A 2J7FA 1EHNA 5ABGA 2X0HA 4TXEA 3WDIA 1MW1A 3AQUA 5I79A 4BA0A 4TTGA 1F4AA 2JE8A 3OGVA 2OLHA 2WBGA 3CGTA 5AY7A 2DSZA 4H04A 1KWKA 3SCTA 2EO7A 4GI6A 5HXMA 3F5LA 1JFHA 1UWQA 4JKKA 3ECQA 2PWHA 2WSPA 3A47A 5GNXA 1AMYA 1LG2A 5DT7A 3RM4A 1B1YA 1UD2A 5ABFA 2VT0A 4IPLA 1QHZA 2WVVB 1CENA 2ZXDA 3CO4A 5GPRA 1BYCA 3SCWA 3F5KA 3DYPA 3ZR6A 4KRUA 1V6WA 1CGXA 4F79A 2WMKA 4UFMA 5A6MA 2J8GA 1GOKA 3EBVA 4TVCA 4D6IA 3RJYA 2XVLA 1ZU8A 2BHUA 2YJQA 3WMSA 4Z2IA 4W8BA 9CGTA 4DWSC 3I3EA 2DQXA 4FF5A 4AZ7A 4ZEPA 1E6PA 3MSDA 3N1AA 1CLXA 2ZUVA 3RDKA 2GSJA 1QPKA 3WUEA 1RH9A 2ESCA 4UZUA 1HIZA 3ARUA 2C0HA 4JHOA 3AHXA 4AISA 4U3AA 4AIOA 1U30A 5CSUA 1ITXA 2DEPA 1G1YA 2VJXA 4WF7A 2ZXAA 4X0VA 1WZKA 5BCAA 4LQ1A 4JL1A 3W26A 5LA1A 3GH7A 5AYBA 3WQ5A 1C8XA 4QP0A 5CLWA 1VBRA 2PB1A 3W4RA 1UR9A 3KZSA 1AVAA 1FP9A 3ZT7A 2HISA 4WSJA 3PZTA 2VOTA 5EBAA 4UFIA 3WNLA 3BAIA 4RE2A 1HX0A 1V3LA 2EPLX 3N18A 3GNRA 2G3NA 4J3WA 1MFUA 5D9OA 4J7RA 2W61A 5FD0A 3A3HA 2C8NA 3SUUA 2D23A 2JF6A 2VCBA 4JFTA 1UR1A 4NSBA 2W63A 2EBNA 2W4XA 3AXXA 2DH3A 3APGA 1OD0A 3BAWA 3WL1A 3N17A 5E70A 1J0JA 3AMGA 1LQ0A 4PMXA 1E71M 4GO8A 2RGMA 5DEZA 3VNZA 4P7LA 4D6CA 3OB8A 3MV01 4MNKA 1TCMA 3FAXA 6A3HA 1FH7A 4ATLA 2VURA 5A8QA 1BGAA 1S46A 1OIFA 1Q6EA 1UHVA 4JFVA 1C7SA 1MWOA 1GVIA 5IFTA 3UR8A 3ZT5A 1QHPA 1UKQA 2GK1A 2XJ7A 5AYIA 3II1A 3AIBA 1EDGA 1LLOA 4L4PA 2BV9A 2ZWYA 2VCAA 3GBDA 5HDRA 2YL9A 1VEPA 4D71A 3AIUA 3AIWA 3KE0A 1NH6A 1W9UA 3NYDA 2XUCA 4UOQA 2J78A 2CXGA 2ZUMA 1KCLA 2VZTA 4PRWA 2PC8A 1QNRA 3AOFA 4PTVA 3CUJA 2WM0A 5FOOA 2J74A 2XG9A 1GUVA 1CGVA 5HPCA 1WZMA 1NWRA 3ZSTA 1OWQA 1V3IA 3MUAA 3U57A 2DPEA 1EQPA 2FH6A 3AIVA 3W28A 1RD6A 3VMOA 3RO8A 1XCXA 3L2MA 1O7AA 3WF2A 4CKQA 1BTCA 1UH3A 1B3WA 1FFRA 2BHYA 1W3KA 2W66A 5IFPA 5BXRA 3TONA 1DEDA 4KH2A 1JXJA 1W9VA 4YN5A 2YIHA 4J3TA 3NDYA 2JF7A 2Y8KA 1E70M 5DT5A 1GQIA 3DHPA 2VX6A 4GI8A 3U7BA 1E4MM 4CCEA 3EDFA 3ARTA 1HJQA 4LX4A 1GOMA 3MKKA 4HA1A 1W3JA 1VFFA 1CZ1A 1KXTA 2VC9A 1B31A 1G94A 3KL5A 4J27A 4PMNA 3AMLA 3AI0A 4MJ2A 5CGMA 1ODZA 3WD0A 3VOCA 1L0PA 2JFEX 1K9TA 1E5JA 4HA4A 1Q6CA 3FNDA 4HOZA 3CZKA 3ZIZA 4BQ2A 1UD4A 3PZIA 3WQWA 2VNCA 1KB3A 2O9OA 1E1EA 4J3XA 2ZICA 7CGTA 5A6BA 2E0PA 2WVSA 2HVMA 3EDDA 4D6JA 3HU7A 3IK2A 1MQPA 3N11A 1HF6A 4GQQA 1E6RA 1JDDA 2A3CA 1JZ6A 5BXPA 2JIEA 4W85A 4CD4A 1KR0A 2DSKA 1VFOA 1ISVA 3N9KA 4GZJA 2WB5A 3AMKA 3GXDA 1R87A 4EANA 2WWDA 4TVUA 5C70A 1A3HA 4QLKA 1UWRA 4AW7A 4GO9A 1EDTA 4P7NA 1E73M 2J4GA 2EPNA 1CYGA 4HMDA 3VDHA 8CGTA 1H09A 3VD5A 3LPFA 1MW3A 1CXLA 3UEQA 3BLKA 4QLJA 3WH5A 4Z2JA 3RM8A 3PHAA 4M29A 3J7HA 2VO5A 3AZTA 4XB3A 4FK9A 3IJ8A 1QW8A 3OLGA 4FMVA 5FL1A 2YA2A 3VIGA 1E15A 3JUGA 1GORA 1MXGA 4MPKA 1ZJAA 5M3WA 1D7FA 1JYNA 4UFHA 4D6FA 1MQQA 4MB1A 4PUDA 1V3MA 2Z1KA 1H11A 2EPOA 2O92A 3T0DA 4P8VA 3BMWA 1VAHA 2VQUA 3ZO9A 2V3FA 4IISA 1GNXA 3ARSA 3BC9A 1V6VA 1DP0A 4JCMA 2GJRA 3ZJ6A 4PUEA 4GINA 2YL6A 2DGAA 5CXPA 1C92A 2VTFA 1KR1A 1W1PA 4CN6A 1W32A 1KXVA 3U5YA 3SCUA 5M5DA 1OCQA 2DT1A 3WFZA 1SR0A 1GQLA 5A6KA 1E1FA 1OGBA 3VIMA 2WZIA 1VRXA 3T2PA 2E40A 1BYAA 2EEXA 3EDKA 5IDIA 1DWGM 4H8UA 2YBTA 4YHGA 1C90A 3POCA 5A2BA 4PMYA 4MDOA 5GQBA 1LJYA 3ALFA 1V6UA 4TOQA 1HXJA 2VCCA 4CVWA 3GTNA 5JBDA 3POHA 1HJUA 3U5UA 2X0YA 2D2OA 2XWEA 1CBGA 3VM7A 2XGIA 4W7VA 1B3VA 5FCZA 3ARRA 3ARWA 4CN4A 4M1RA 2CHNA 2D0GA 3CZLA 5AC5A 4U2ZA 1WPCA 3MSGA 4HA3A 2OYLA 3CUHA 3PZNA 5TD4A 3BGAA 2GJXB 5BWFA 1IZKA 1G5AA 4S3KA 4UFJA 3VMPA 3UG5A 1CXHA 1VB9A 3AIEA 4H41A 3OLEA 2VR4A 4ZE5A 1H41A 4UQCA 3QHNA 2WKGA 1PX8A 1UA3A 1BSIA 1I1XA 1CDGA 1VJSA 1KCKA 1JD7A 3AXHA 4H7VA 3DYMA 1SYTA 2G41A 4RE4A 4OBRA 1QI4A 1RPKA 3QOMA 4HPGA 3GXIA 1QOXA 2PF0A 1PEZA 3OIHA 1EO7A 3W38A 1FP8A 4Z2HA 3CZ8A 1JNEA 3MUY1 4P7OA 1J9YA 2WW5A 4DWSA 3FW6A 4GZEA 2BVTA 1AQHA 4BS0A 3IAPA 1ZBVA 1ODUA 2UY3A 1E5NA 2QLYA 1XSKA 3WDPP 2D3NA 3K4DA 3GDBA 3WBEA 3L4YA 3WH8A 3RCNA 1E6NA 4PMUA 4MAZA 4HPHA 5BYWA 3VDCA 5DO8A 2YLAA 5HBFA 1NOUA 4B9YA 2WC3A 4NRSA 4DM1A 5C8BB 4JFSA 2G3MA 2X8RA 1CIUA 2ZX8A 2QMKA 2F61A 1ESWA 4WKAA 3SCVA 3AS0A 2V3GA 1JZ8A 4W88A 4FLQA 4J3SA 2VX7A 1NWUA 1US2A 3VVGA 3B9DA 4B3KA 5I77A 1NQ6A 1PJ9A 1UH2A 1OB0A 4MNLA 1JYWA 2UY4A 5D9MA 4JZ5A 1UH4A 1ITCA 1PAMA 2D20A 2XTKA 2Y5EA 4PBGA 1BHGA 4PMQA 3MU7A 1W1YA 3VIHA 4AZBA 3BSHA 1XGZA 4UR9A 1OGGA 1LWHA 1PIGA 2X2YA 2WZHA 5IHRA 1H3GA 1E6QM 1V6XA 2WANA 3O6AA 3PTMA 1M53A 2VQTA 2WYSA 3SCPA 1W2PA 4WKFA 3ARZA 2VRKA 2CITA 2WBKA 4CVUA 3AICA 2BVYA 4HOWA 3WL0A 1XYFA 5CPSA 1E72M 1NOWA 2W91A 2ZUUA 4BQ5A 1J0HA 2EJ1A 2WZEA 2VZVA 4U5IA 4IM4A 3AXIA 3W24A 5JIWA 2B31A 5A69A 4KGJA 4CU8A 3AYSA 3CUGA 2IXUA 4D6DA 3GXMA 2YLLA 1V02E 3OGSA 5HPOA 4PMOA 1M04A 1I75A 3PZMA 3WUGA 2XM2A 1JAKA 1TE1A 1HJWA 3FY1A 5A8PA 1VBUA 1WDQA 2Q8XA 4PTMA 1Q6DA 1CGYA 4ZFMA 3FHAA 2EQDA 1B90A 3TTYA 3W29A 1R85A 1GPFA 1H5VA 2GVYA 1D3CA 4AXNA 3MMUA 4UFLA 1LL4A 1HJVA 1CXKA 2O9PA 3ZMRA 4CD6A 4URIA 5CPTA 4B3LA 2V5CA 1VF8A 3WEZA 1VEMA 5E9AA 4ZXLA 4BCEA 4UFKA 2ZX6A 5CG0A 1JNDA 1QNPA 1QW9A 2BY1A 1GJUA 2ZX5A 4F9DA 4WJXA 5A2AA 1TVPA 1W3LA 1E0XA 1KWGA 1QBAA 4LPCA 3N15A 3GNOA 2V5DA 2RGLA 1GOQA 4N0RA 2DSVA 2XVPA 4W87A 4HU8A 1KFWA 1X6NA 3CHFA 1WCGA 3SUTA 1E9LA 2TAAA 2CBVA 3WNMA 4AD1A 1OT1A 1WKYA 3MO4A 1BLIA 4UOJA 3KEHA 1JL8A 1ZB5A 3AFBA 1KBKA 3CHCA 3VD9A 2GK1B 1H2JA 2VR5A 1UKSA 4D1JA 2J7BA 3MMDA 3EDEA 1HP5A 4R5EA 3WSUA 2XSAA 4ATDA 4EK7A 3GBEA 1MYRA 2GDVA 2XFFA 1U2YA 2DDXA 2XGBA 4C7GA 1XC6A 5E0FA 1EHAA 3AHVA 3VGEA 4DUVA 1LWJA 1KQYA 4B9ZA 5I23A 1BAGA 5LA2A 3VGFA 1WNOA 3A4WA 4CD7A 1JGIA 1PPIA 2QMJA 4CN1A 2OYKA 5F7UA 4JCLA 3WEOA 4B16A 2DT0A 4F66A 5BXTA 4OIFA 3THCA 3SUVA 4EAMA 1W2VA 1CGUA 1ISXA 5EFDA 5A95A 2CBJA 1QI3A 2VL4A 1PZ2A 3A6OA 3IAQA 4H2CA 3WN6A 4D1IA 3CHEA 4MB5A 1B9ZA 4ZXOA 1E0WA 1QNQA 3L4UA 2DT2A 3WD1A 4P8UA 2WKLA 3VX1A 4D6EA 4CCDA 4W86A 1GVYA 2E3ZA 1V02A 2D3LA 1EXPA 2WVTA 1UUQA 3ZJ8A 1Q6FA 2CEQA 3AZRA 4UZSA 2J47A 4WK9A 2XPKA 1PZ3A 4UNIA 2QPSA 1QHOA 3PZUA 2QHAA 4OOUA 2BY2A 1UWIA 2WHLA 3DHUA 3NSXA 1UR0A 3BCDA 2F8QA 3VD7A 1GZJA 1V03A 5IHSA 1UR8A 1JZ2A 5BRPA 2XFYA 1LG1A 3VDAA 2BY3A 1V6YA 4MB4A 1JAEA 4TVDA 1BFNA 3VDBA 1BVNP 1ISWA 3QR3A 1WE5A 3W6LA 3CMGA 1UYQA 4WLCA 3RIKA 2WLYA 1FFQA 3WMBA 4MB3A 2QF8A 3BSGA 5GNYA 2EXOA 1BG9A 3WQ4A 1WDRA 2ZOXA 3WNOA 2VZOA 1JZ3A 1B0IA 1HJXA 4CD8A 2Y8VA 3AHYA 1BG4A 3S2CA 1H1NA 4W84A 4MNMA 1NM9A 3NCOA 2NW0A 4PCTA 3K1DA 3PTQA 3BAJA 1W9XA 2GFTA 3A4AA 2G8ZA 2CETA 2CPUA 2GJPA 3L2LA 5ECUA 3FN9A 1HNYA 4OUEA 5CSYA 1E40A 1IT0A 2X05A 3F5JA 6CGTA 3EDJA 2WHKA 3MS8A 3SCSA 1WDPA 3WDQA 4W7WA 3CHDA 3VIFA 1MFVA 3E1F1 1XYZA 1WZAA 1DWJM 5FL0A 3RMEA 2PWDA 4AY1A 3RM9A 2BS9A 3LPPA 2VVSA 2DH2A 1QI2A 3AROA 3FHQA 3W82A 3WUBA 1MW2A 2XVNA 1J11A 1ZBCA 3O9NA 4PCSA 1HKIA 5D4YA 4HU0A 1OINA 1JZ5A 1AQMA 3EMQA 1UWSA 1DHKA 2WC4A 1DWAM 3AIRA 1E0VA 4A3HA 2Y4SA 4QCFA 2WNWA 1BF2A 1CTNA 3WBAA 3B8SA 1BYBA 2E8YA 3T0BA 4PN2A 4HMEA 2BXYA 2JEPA 4J28A 2F2HA 4OBSA 2WSKA 2X09A 4NI3A 1HKJA 5CLTA 1EQCA 5HNNA 3WDHA 4E2OA 1WZLA 3F4VA 4AD0A 1GQJA 1TFVA 3PZGA 2YDQA 4QCEA 1K9EA 5M03A 3K4AA 2PWGA 4D6GA 1MQRA 3PZVA 3OGRA 4F9JA 5AC4A 4RL3A 2ZUSA 2V3DA 3ZM8A 1KQZA 1W9BM 5A6LA 1KXHA 4HMCA 2CERA 3WH6A 4QFUA 4LGXA 3SCOA 5LA0A 2FGLA 4QLLA 3IANA 4QDMA 1TA3A 4W8LA 1O6IA 2O9TA 1E3XA 3ZQ9A 4BQ3A 4AD3A 1NWTA 1QNOA 1EIBA 2WHMA 4L4OA 2E9MA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2VRQ A;  1K6A A;  1YHT A;  3WDJ A;  4AZI A;  4PMD A;  2EPK X;  2OSY A;  3CLW A;  3B9E A;  1W91 A;  4NF7 A;  1GHR A;  4GXP A;  2WMI B;  3WF0 A;  1E6X M;  1HJS A;  4AYS A;  1GQK A;  2NSX A;  4H8V A;  5ABF B;  1CEO A;  1V08 A;  4OZO A;  6TAA A;  3AJ7 A;  2J7F A;  1EHN A;  5ABG A;  2X0H A;  4TXE A;  3WDI A;  1MW1 A;  3AQU A;  5I79 A;  4BA0 A;  4TTG A;  1F4A A;  2JE8 A;  3OGV A;  2OLH A;  2WBG A;  3CGT A;  5AY7 A;  2DSZ A;  4H04 A;  1KWK A;  3SCT A;  2EO7 A;  4GI6 A;  5HXM A;  3F5L A;  1JFH A;  1UWQ A;  4JKK A;  3ECQ A;  2PWH A;  2WSP A;  3A47 A;  5GNX A;  1AMY A;  1LG2 A;  5DT7 A;  3RM4 A;  1B1Y A;  1UD2 A;  5ABF A;  2VT0 A;  4IPL A;  1QHZ A;  2WVV B;  1CEN A;  2ZXD A;  3CO4 A;  5GPR A;  1BYC A;  3SCW A;  3F5K A;  3DYP A;  3ZR6 A;  4KRU A;  1V6W A;  1CGX A;  4F79 A;  2WMK A;  4UFM A;  5A6M A;  2J8G A;  1GOK A;  3EBV A;  4TVC A;  4D6I A;  3RJY A;  2XVL A;  1ZU8 A;  2BHU A;  2YJQ A;  3WMS A;  4Z2I A;  4W8B A;  9CGT A;  4DWS C;  3I3E A;  2DQX A;  4FF5 A;  4AZ7 A;  4ZEP A;  1E6P A;  3MSD A;  3N1A A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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