The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
12
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sequence length |
58
|
structure length |
58
|
Chain Sequence |
DATFGMGDRVRKKSGAAWQGQIVGWYCTNLTPEGYAVESEAHPGSVQIYPVAALERIN
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Novel crystallization conditions for tandem variant R67 DHFR yield a wild-type crystal structure.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Dihydrofolate reductase type 2
|
| molecule tags |
Oxidoreductase
|
| source organism |
Escherichia coli
|
| total genus |
12
|
| structure length |
58
|
| sequence length |
58
|
| ec nomenclature |
ec
1.5.1.3: Dihydrofolate reductase. |
| pdb deposition date | 2011-06-13 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 type barrels. |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3T9N A; 1VIE A; 2VV5 A; 2RH2 A; 3UDC A; 2OAU A; 2RK2 A; 2RK1 A; 2GQV A; 1VIF A; 3SFM A; 2P4T A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2KT1 A; 3TU4 K; 1KQS P; 5GAN e; 2R58 A; 1H8K A; 3LGL A; 2P4R A; 5IAY A; 3L2V A; 2PUK B; 5DM7 R; 3MHX A; 1RAE B; 2HDA A; 3JCM X; 1KHC A; 4OB2 B; 3V8J A; 3A1P A; 2XIC A; 3C95 A; 3EFR A; 2WSE E; 1MND A; 4GLM A; 1VQ5 A; 2RJD A; 3VS0 A; 4JJC A; 2K5I A; 4LDY A; 3JV3 A; 1TUD A; 3QYG B; 3PMI A; 3PNW C; 3VS3 A; 2X4W A; 1YJW T; 1NPP A; 3QXE B; 4JLG A; 1ZBX A; 4P5N A; 1Q81 U; 5DLQ E; 2O4X B; 4J6Y A; 1ZSZ C; 2J05 A; 4IUR A; 1VQ4 T; 2AT1 B; 3P8B B; 4L59 A; 2A37 A; 2LCC A; 1R0B G; 2YUQ A; 2GBQ A; 1MMD A; 4M78 C; 1D1C A; 2FZC B; 4AFQ C; 2QTV A; 1KC8 U; 2ENM A; 2RN8 A; 4M78 G; 4D6W A; 4DBH A; 2M0O A; 5I21 A; 1JQQ A; 1ZA2 B; 5IXF A; 2XID A; 3JSC A; 1VQ8 Q; 3UF4 A; 1YJW A; 2CSQ A; 2PVD B; 4YTL A; 4F14 A; 1YHQ T; 2A08 A; 5J39 A; 1S1N A; 2DER A; 1VQ4 A; 3LH0 A; 3VS5 A; 4R56 A; 1ARK A; 3QDR B; 1Y96 B; 2P0K A; 4AG2 C; 3A8H B; 4FCY A; 5GAM f; 1UTI A; 4A4E A; 2ROL A; 2E5Q A; 3X24 B; 4E47 A; 3OYL A; 5FU6 C; 4M7A F; 2OI3 A; 2QG9 B; 3WXM B; 1WIE A; 1VYT A; 4N0A C; 4HT8 A; 2JTE A; 1YI2 A; 2DRM A; 4R0K A; 4A63 B; 2QDY B; 2L3R A; 1YHQ A; 4LDV A; 1EZZ B; 3SD4 A; 5GAN 3; 2LQW A; 5GAN g; 1Q81 C; 2LMJ A; 1OX8 A; 1VA7 A; 3EG9 B; 3CC4 A; 2NUZ A; 1KJW A; 4JZ3 A; 4BE2 A; 1WGS A; 1QQJ A; 5GMK i; 2YRC A; 1TTH B; 1GCP A; 5GAM j; 1RAG B; 4ATO A; 4KH1 B; 3UA6 A; 1VOM A; 1SKU B; 2CUB A; 2DD5 A; 1K4U S; 3CMA Q; 4OMP A; 3RIR A; 1VQM T; 1QCF A; 4OMN A; 3CCS Q; 1KC8 C; 3C12 A; 1PSE A; 4XTW A; 2E4H A; 3OMG A; 4WCI A; 3HL8 A; 1T0J A; 2FEI A; 2AKL A; 2YRD A; 3UPU A; 3CQT A; 2ZZD A; 3KUF A; 5EG2 A; 1NYG A; 4M77 E; 2NLU A; 4GY5 A; 3A8M B; 3LH5 A; 4JLI A; 4RTV A; 2RI2 A; 1FYN A; 3VS1 A; 1JJ2 A; 4LXC A; 3VUB A; 3ULR B; 3C0C A; 1JB0 E; 2OAU A; 2D0N A; 2VWF A; 4RTW A; 1KQS A; 3EFO A; 2L3P A; 2HKQ B; 2HL3 A; 4A4H A; 1Q95 G; 4F7U A; 4AG1 C; 5FRN A; 1VQM A; 4IUQ A; 3OA6 A; 2EKH A; 2EGC A; 1S72 Q; 4XU1 A; 4OF1 A; 1QP2 A; 2A28 A; 1CKB A; 1T0H A; 2IPO B; 1MMG A; 2I2L A; 4RUG A; 2RM4 A; 3THK A; 2EJ9 A; 3M4Y A; 1YFN A; 5GMK e; 2F2W A; 2GGR A; 5CVI A; 4C8Q E; 2MI6 A; 1HD3 A; 3R6N A; 4R55 A; 1MV3 A; 3HP9 A; 4QQ6 A; 1TWB A; 1BIA A; 4AT1 B; 3MP6 A; 1I4K 1; 2EQM A; 4J9I A; 2LJ3 A; 2YUN A; 1VQ6 A; 5LJ5 h; 4NL3 A; 1NJI U; 3JCM h; 2JMC A; 1VUB A; 2VV5 A; 2XHC A; 1I81 A; 1NG2 A; 1YNZ A; 5LJ5 d; 3JCM d; 4M75 D; 3WVD B; 1EX4 A; 2CS7 A; 1OU9 A; 3DLM A; 4FT2 A; 3OYD A; 1D0X A; 1VYU A; 4EDU A; 1NZ9 A; 4XU0 A; 4JS4 A; 1XOV A; 1HSQ A; 3V8L A; 5A2Q E; 3JB9 G; 3CCL T; 4FIB A; 2DXB A; 3CCQ T; 3CCJ Q; 1WI7 A; 4DEY A; 3CCU T; 1TUC A; 1RAA B; 1I1J A; 2D8J A; 3QG1 A; 4KBM B; 1VYV A; 5HKC A; 4Y91 A; 4HKE A; 2GTJ A; 1WXU A; 1M2O A; 3EHQ A; 2ZGW A; 3LW5 E; 2X4X A; 2PVG B; 1U5S A; 2M1H A; 2QAZ A; 2KI7 A; 3CBO A; 1YJ9 T; 2CSI A; 1Q86 R; 1TXQ A; 5IN1 A; 3H9N A; 2J7I A; 2HAX A; 2YSQ A; 1AZE A; 2QTX A; 5CKD A; 1VIF A; 2DZC A; 3A98 A; 1WA7 A; 1Y07 A; 2YLB A; 3CCL A; 2Y4Y A; 1VQN T; 2CP5 A; 1PNJ A; 3CCQ A; 1KSW A; 5AT1 B; 1M30 A; 3CCU A; 2DO3 A; 2KNB B; 1M4Z A; 5KYY A; 5ECA A; 3TCJ A; 2OTL Q; 3DB3 A; 2LVM A; 1NJI C; 2DTI A; 3V7S A; 4E7Z A; 5CR2 A; 3KXT A; 3EFO B; 5CAI A; 4M78 D; 2ZPG B; 1B3Q A; 1OYX A; 1TS9 A; 1B7T A; 1SSF A; 1YJ9 A; 4F7U B; 2LP5 A; 3G6E Q; 3CEY A; 2RQR A; 3OYA A; 3OYM A; 4M7D C; 1H64 1; 2HQH A; 4M7D G; 1N8R C; 5KYW A; 2KR3 A; 3SB2 A; 2ZPH B; 1FMK A; 1VQN A; 2K3B A; 2DL8 A; 3L42 A; 4EPC A; 3L2W A; 1MGQ A; 3QWX X; 2MCN A; 1VQ9 Q; 1RLP C; 2KBT A; 1WXT A; 1E6G A; 1NPR A; 4MZT A; 4RTY A; 3EFS A; 2VC8 A; 2VGM A; 3HKS A; 3CCV T; 1YBY A; 4BB7 A; 1M27 C; 4LNP A; 2CZ1 B; 5A0D A; 3CC2 A; 3VS6 A; 1JRI A; 1KQ1 A; 3OYK A; 3M53 A; 3QO3 A; 2CZ0 B; 2DF6 A; 2WSF E; 1FWZ A; 3M9Q A; 3MET A; 1MMN A; 2DLP A; 1V76 A; 2QEX T; 5KCH A; 1M8M A; 5LJ3 j; 2AK5 A; 3H41 A; 4EIK A; 4RMO A; 3OSV A; 4E7J A; 4EMK A; 2FL7 A; 3CBP A; 4C92 E; 8AT1 B; 5D6Y A; 3CCV A; 1VQ7 A; 1GCQ C; 4E7S A; 2KYM A; 2KGT A; 4KRT A; 3G71 T; 4ZTF A; 3X25 B; 3VS7 A; 1G3Y A; 2LQK A; 4PJJ A; 4WTO B; 4L5G A; 2DAQ A; 3CC7 T; 4A53 A; 2O2O A; 1BCO A; 3LYI A; 2CZ7 B; 4Q5W A; 3I56 Q; 3PMT A; 2VGN A; 2CYZ B; 2QEX A; 1AHJ B; 4IUU A; 2L5Q A; 1QW1 A; 2YHT A; 1G83 A; 4OP0 A; 3CME A; 5GAM h; 3L2R A; 1K73 R; 5FWB A; 2FVU A; 2DKG A; 3D7S B; 3EG1 A; 3J80 E; 3C94 A; 3G71 A; 5GAM d; 2FG0 A; 1IHW A; 5KYY B; 2CP0 A; 4LDW A; 1VIE A; 2JN0 A; 5GAO q; 2DIG A; 4FL6 A; 2K79 A; 1RL2 A; 2C0O A; 4JRK A; 1H92 A; 3CBM A; 3CC7 A; 4WF2 A; 4PJO E; 2LJ0 A; 4F16 A; 3EHR A; 1W2B S; 4KUI A; 3RR6 A; 2DL5 A; 2R5M A; 2W10 A; 3LWH A; 3CD6 Q; 1UUE A; 1PG5 B; 1QVF S; 4F17 A; 1QLY A; 1M3A A; 1GL5 A; 4J83 A; 4MZM A; 1K9M U; 1YIT A; 3CCR Q; 1U3O A; 2Y4X A; 4J5Y A; 4QVC A; 1CSK A; 3BE3 A; 4OB1 B; 2ECZ A; 1VQO Q; 1K8A U; 4XK8 E; 4C92 F; 3MJX A; 2EYQ A; 1Q7Y C; 2RJE A; 4HVV A; 1KD1 R; 3UT1 A; 1PM3 A; 2R5A A; 1R0C B; 3E9F A; 5GMK m; 4BE1 A; 2ZPE B; 2M51 A; 1U1S A; 1OZ3 A; 4N4G A; 4OMO A; 5GAN 2; 3ZL7 C; 4MDW A; 2MK5 A; 5CK9 A; 3JB9 D; 1TOV A; 1XQH A; 1YJN Q; 5LJ5 f; 3REB B; 3JCM f; 4M75 A; 4DBR A; 1G3W A; 3HTR A; 3JCM J; 4HCK A; 1RI0 A; 2D6F A; 2DD4 A; 2K3X A; 4PJM A; 3HSB A; 4RCB A; 1IB8 A; 2PVO B; 4B6M A; 1RAC B; 2RQW A; 2GFU A; 1Q82 C; 3PE0 A; 3DLL A; 5KYN A; 4RTX A; 4FW2 A; 4DBQ A; 3NTI A; 5IHI A; 1K9M C; 5LJ5 e; 2JMA A; 3JCM e; 1T3L A; 3UAT A; 1E6H A; 4PJN A; 2D9T A; 2C06 A; 3VUZ A; 1GFC A; 2HNI A; 4F7U F; 3S3O A; 1F1B B; 2QK0 A; 1K8A C; 2JUF A; 2DA9 A; 4GLK A; 3CCM A; 2CGH A; 1QMC A; 4QW2 A; 2KMT A; 2M02 A; 1LJO A; 2DVE A; 2J6K A; 1WYX A; 1O9S A; 4JRP A; 2L3Q A; 2MF2 A; 5C6S A; 1UG1 A; 1C6V X; 4QQD A; 1IHV A; 1YJW Q; 4M7D D; 2CRE A; 1VQ4 Q; 3CPF A; 1RI9 A; 1G8X A; 2E41 A; 3IQL A; 1LNX A; 4K11 A; 2GCX A; 2O9V A; 4XU3 A; 2F1L A; 4M78 A; 4HVW A; 3M0T A; 1NM7 A; 2MAM A; 2YUO A; 4M75 G; 2QAS A; 4J7F A; 2XD0 A; 3VRZ A; 4M77 C; 1JJ2 S; 4OB3 B; 4M77 G; 1ZBJ A; 3MP8 A; 3M56 A; 2BZY A; 2ABL A; 1QKW A; 5KYU A; 3SEM A; 1FXX A; 1YI2 Q; 5GAN 5; 2DBM A; 1M8V A; 4Y92 A; 3OSS C; 5CIU A; 4M7A E; 4RTZ A; 3OYC A; 1WDX A; 3CPW P; 2GF7 A; 3CC4 Q; 2HBW A; 1M9S A; 4RG2 A; 2P0P A; 2HQE A; 2KY9 A; 2EQK A; 2CH4 W; 2YRV A; 1CKA A; 3RUX A; 1C0M A; 4N0A A; 5A0G A; 5DLO A; 3UA7 A; 2L2P A; 2RHX A; 4QQG A; 4ZGE B; 5GAN j; 4JZ4 A; 1IGU A; 4M75 B; 2EW3 A; 4BD3 A; 4C8Q C; 1WHH A; 2CT4 A; 4C5H A; 1EFN A; 4N4H A; 3RER A; 3SWN C; 2EWN A; 2QYZ A; 1BKB A; 3C4S A; 3M57 A; 2H3J A; 5FLX E; 2NWM A; 2MYS A; 4J7I A; 2DK3 A; 4ZNX A; 5IHK A; 2LNH B; 4BDZ A; 1WHJ A; 5CKH A; 4JJD A; 3LGF A; 1ZUU A; 2JJ9 A; 2FB7 A; 3OS2 A; 1VQP Q; 3FLG A; 3I55 Q; 4EMG A; 2F2X A; 1RUW A; 2K2V A; 2QA4 T; 3OYB A; 3PIP A; 3JRZ A; 1MV0 B; 5L8R E; 4EMH A; 4MDX A; 1MUZ A; 1K9A A; 4FYW B; 2VUB A; 4ZTJ A; 1QVG S; 3MP1 A; 3FRN A; 1ZLM A; 4VUB A; 4IUP A; 2PNI A; 4DOV A; 2K6D A; 1LOJ A; 2EQJ A; 1WHL A; 3HPW A; 5GAO n; 4IUT A; 1IRX A; 2J06 A; 1U8R A; 2RHY A; 5GAO m; 1VQ6 Q; 1WHK A; 2H3E B; 1M90 R; 3GP8 A; 3M55 A; 4OGC A; 2DL4 A; 2RD1 A; 4QKU A; 4M78 B; 2QA4 A; 2HBP A; 3QUI A; 1Q81 R; 2KXC A; 1I5L A; 2PUO B; 2X9H A; 5GAN 4; 1X6B A; 3J7A F; 1X01 A; 4FW1 A; 1AT1 B; 3FB9 A; 2QQR A; 5C0M A; 4HA8 A; 3MEA A; 4Z89 A; 4A4F A; 2DNU A; 3OQ5 A; 5GAM e; 1WLP B; 3SDZ A; 1WPY A; 3LLR A; 5KYU B; 2X51 A; 2KDS A; 2J6F A; 3NPF A; 1M3C A; 3E2U A; 4OMF B; 2ZAE A; 3PVQ A; 2OTJ T; 1LVK A; 4ZN1 A; 5FU6 B; 1RAH B; 2BZ8 A; 1QKX A; 3GOX A; 4UC4 A; 5CO7 A; 2MIO A; 2YLC A; 2HQX A; 5J3B A; 3A8L B; 2BE9 B; 2E5K A; 1VQ8 T; 3G4S T; 2EGE A; 1NYF A; 4FT4 A; 3QJY A; 3SFM A; 2BE7 D; 3CCL Q; 2KRM A; 3CCQ Q; 2H8H A; 1P92 A; 3S3N A; 3CCU Q; 1KK7 A; 4Z02 A; 3CPW A; 4LDX A; 2OTJ A; 3QSU A; 3CCE T; 5D7U A; 2K57 A; 2EYZ A; 4KUL A; 1PD0 A; 3OS5 A; 2VVK A; 4HCC A; 1U1T A; 2K4Y A; 1PWT A; 2LJ1 A; 1W6X A; 1AOJ A; 4LD6 A; 1B07 A; 1VQ8 A; 3G4S A; 3O5Z A; 2E70 A; 2P84 A; 5J26 A; 4IIM A; 4C92 C; 4LD9 K; 2YWW A; 2RJF A; 1WXB A; 3WVE B; 3EGX A; 5FU7 C; 3CXC S; 5GJV B; 3QJ6 A; 4J6X A; 3X26 B; 1VQK Q; 3OYG A; 3CCE A; 2LX9 A; 3PVL A; 2ZPF B; 3Q1J A; 2LNV A; 5GMK j; 1I8F A; 2JM8 A; 1I07 A; 4M7D A; 2XDP A; 1D1B A; 1AWJ A; 3CMA T; 1ACM B; 4M77 D; 3CCS T; 4X1V A; 2PZ1 A; 1X2Q A; 3GPL A; 5A0L A; 3CC2 Q; 4C0D C; 2A0F B; 1M5Q 1; 4RTU A; 5GAM g; 4ZN3 A; 2ROT A; 3V7C A; 5KH6 A; 4A4K A; 4IKF A; 4ELY C; 4HT9 A; 3M4G A; 3BDU A; 2JTM A; 1UHF A; 1YCY A; 1M1K R; 1VQ7 Q; 4PJO C; 4E2F B; 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5GAN 7; 4LUE A; 2EBP A; 3M58 A; 4AMC A; 1WJS A; 3QDF A; 4F04 B; 2QQB A; 1VQL T; 4X34 A; 3INZ A; 3G6E T; 2DPP B; 3M0P A; 3H0H A; 1QWE A; 3M59 A; 2E3H A; 1UFF A; 4A54 A; 2M0Y A; 1KD1 U; 3OW2 P; 4PK4 A; 1HK9 A; 5CKF A; 4AFS C; 1VQ9 T; 2ED0 A; 2RA2 A; 3M0U A; 3QKJ A; 2O31 A; 3G7Z A; 3HRS A; 4XQ3 A; 3BDL A; 2DL3 A; 1RAI B; 4J9B A; 3GNG A; 2COW A; 3M0R A; 1UDL A; 3CCM Q; 3G1J A; 4HCB A; 2YT6 A; 3P8D A; 4M7A C; 2KK4 A; 1K73 C; 1WX6 A; 4M4Z A; 4M7A G; 2BZX A; 1VQL A; 4F7U E; 4O6J A; 2JZ2 A; 2E6Z A; 3FEO A; 3F70 A; 1JXO A; 2NUT B; 2LTO A; 4OML A; 4JRQ A; 4J9G A; 2LRQ A; 1OEB A; 1W2B P; 3QII A; 3AT1 B; 1Q7Y R; 2RI5 A; 4J9D A; 4ZGJ B; 2EQU A; 1QVF P; 1BI1 A; 1WQ7 A; 1TH7 A; 2HZY A; 2V8I A; 2VXE A; 1RAB B; 4EMK C; 3I5S A; 1K0X A; 1KQ2 A; 4C0G A; 3TVT A; 2RO0 A; 4CC4 B; 3QBY A; 2JXB A; 2HSE B; 3VYG A; 3N5B B; 1BB9 A; 1OOT A; 1PKT A; 3I56 T; 2OAW A; 3ME9 A; 3GF5 A; 4JRI A; 4OGE A; 2LC4 A; 4M77 A; 2CUD A; 4ORZ A; 3JAM E; 2CP2 A; 4PJO D; 1Q82 R; 3EH1 A; 1OZ2 A; 1VQ5 Q; 2RK2 A; 4RCC A; 3OMC A; 2NUP B; 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