The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
12
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sequence length |
58
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structure length |
58
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Chain Sequence |
DATFGMGDRVRKKSGAAWQGQIVGWYCTNLTPEGYAVESEAHPGSVQIYPVAALERIN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Novel crystallization conditions for tandem variant R67 DHFR yield a wild-type crystal structure.
pubmed doi rcsb |
| molecule tags |
Oxidoreductase
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| source organism |
Escherichia coli
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| molecule keywords |
Dihydrofolate reductase type 2
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| total genus |
12
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| structure length |
58
|
| sequence length |
58
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| ec nomenclature |
ec
1.5.1.3: Dihydrofolate reductase. |
| pdb deposition date | 2011-06-13 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 type barrels. |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2P4T A; 1VIE A; 2RK1 A; 2GQV A; 3UDC A; 3SFM A; 3T9N A; 2RK2 A; 2OAU A; 2VV5 A; 1VIF A; 2RH2 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2CP5 A; 4PFO A; 1MGQ A; 2GTJ A; 3MPU B; 2YUN A; 2EQM A; 5I2M A; 4RTT A; 3OYM A; 2X3W D; 2GGR A; 1IZ6 A; 2KI7 A; 4A4E A; 6AT1 B; 4PJL A; 1YIT A; 2L0A A; 4J9G A; 1VYT A; 4IIO A; 3C95 A; 3QO3 A; 4E47 A; 4JJN K; 1ZQ1 A; 2K3Y A; 4F7U E; 2O2O A; 3A8L B; 1M90 U; 3GLX A; 2VWF A; 2J05 A; 3OY9 A; 3OYB A; 4PJM A; 1B34 A; 1RAA B; 2PUK B; 3EGU A; 5HKC A; 1X6O A; 2VXF A; 1Q86 U; 3NTI A; 4QQD A; 1YJW Q; 3VUB A; 4M7D D; 3M56 A; 3TQ7 P; 3REB B; 2FPE A; 3OBY A; 1TH7 A; 3CC4 T; 4E7J A; 1UGV A; 2QTV A; 3V7R A; 1M1F A; 3CCQ Q; 3DB4 A; 1FMV A; 2RQW A; 1WQ7 A; 2JJ9 A; 1I81 A; 2D6F A; 1QP3 A; 3MEV A; 2MK5 A; 1TUG B; 5GMK m; 5GAN g; 2V26 A; 2RM4 A; 2OJ2 A; 1PWT A; 2K6D A; 4JLG A; 3CCL A; 3JB9 D; 2EKH A; 3E1S A; 1GFD A; 3WVE B; 5FWC A; 3V8K A; 1TSF A; 2ZPF B; 3JB9 H; 3S6W A; 3I55 T; 4FYX B; 8ATC B; 3CXC A; 2DXB A; 4LD6 A; 3CC4 A; 2O88 A; 3G4S T; 1QCO A; 1UB4 A; 2IPO B; 3M5A A; 2J6O A; 1M1K R; 4JLI A; 1A0N B; 3OA6 A; 2DO3 A; 5GAN 7; 1D0Z A; 1QVP A; 5DLO A; 4ZN1 A; 1KIK A; 2CP3 A; 2GNC A; 2BE9 B; 2X35 A; 2LCC A; 1GBR A; 2DYI A; 2HQE A; 1UGR B; 4L6V 5; 1WZO A; 2OTL Q; 5GAO m; 5CVI A; 2EPD A; 3CMA T; 1TTH B; 4JZ3 A; 1B07 A; 1YCS B; 1JXM A; 1OZ3 A; 2ESW A; 2SEM A; 1XOV A; 4XAX B; 2FHD A; 2M0O A; 2KGT A; 4BE2 A; 2EIF A; 2D8H A; 2DK3 A; 4M78 E; 4M4Z A; 5GMK h; 4DEX A; 1YJN T; 2HEQ A; 3LH5 A; 4PJO D; 1E6H A; 1MV3 A; 1VQ8 T; 2CYZ B; 2QYZ A; 3LH0 A; 2XU8 A; 2KBT A; 3JCM J; 4QW2 A; 2V1Q A; 2YUQ A; 2EYY A; 4RTW A; 2IVW A; 1AVZ C; 2NUP B; 2RO0 A; 2K79 A; 2VGN A; 1ZUY A; 3OW2 P; 4BAC A; 3A98 A; 1UHC A; 3A1P A; 2YUP A; 1YJN A; 3OS5 A; 2YT6 A; 4RTY A; 2HBW A; 2KRM A; 4JJC A; 5GAN 2; 1XTD A; 3OSV A; 1BI3 A; 4E7H A; 3GPL A; 3JCM e; 2WAC A; 2QAS A; 5CIU A; 4J7I A; 1KC8 U; 1BCM A; 2RB6 A; 2P4R A; 4KRT A; 5IT9 E; 3TCJ A; 3JAM E; 1VQP A; 3OMG A; 5GAN f; 3RKX A; 2QQS A; 2DLP A; 1OPL A; 3OMC A; 3UA6 A; 2YXY A; 5DM7 R; 1D3B A; 3QZ5 B; 1OV3 A; 3E9F A; 1PD1 A; 4C92 F; 4D6W A; 3PVQ A; 3QHS A; 1YNZ A; 1OU9 A; 2R5M A; 1WJR A; 2OAU A; 2RI2 A; 2PNI A; 2E4H A; 4B9X A; 1NBE B; 2K2V A; 4N4H A; 4E7K A; 1U1T A; 4N0A C; 1YJ9 T; 4HCZ A; 2P4T A; 1FMW A; 4KT0 E; 2A7Y A; 2E41 A; 1VIF A; 3EFO A; 1Q81 U; 5IHK A; 3QPH A; 1YIJ Q; 2VC8 A; 3CCE T; 1KJW A; 2M9U A; 1ZUU A; 1XNI A; 5DLQ E; 2VXE A; 3S3M A; 2RQU A; 2VYT A; 4Z8A A; 3CCR A; 4QQ6 A; 4AG2 C; 2O9S A; 3L2R A; 1YJ9 Q; 2XDB A; 4FU6 A; 2LQ8 A; 2OI3 A; 3G6E T; 1BB9 A; 1VQ6 T; 4O6J A; 4F7U A; 5GAN 4; 1NPP A; 3EAE A; 2K3X A; 1UGP B; 4XTX A; 2KMT A; 5CR2 A; 4IKF A; 3CCE A; 2L3Q A; 2R58 A; 5GAN 6; 1ARK A; 1PSF A; 3A8O B; 2JN0 A; 3G6E Q; 2EBP A; 1NYG A; 2QQ9 A; 2Y90 A; 1VQ6 Q; 1IRE B; 4LUE A; 2DYB A; 3EH1 A; 2E1H A; 3BDL A; 1PSE A; 1I07 A; 4KH1 B; 3JB9 J; 3M9Q A; 1I8F A; 3CCM T; 2GQI A; 1QKW A; 2QG9 B; 5IAY A; 1VQ7 T; 2HQX A; 1KQS S; 1K9A A; 2NUT A; 1T0J A; 4MMK A; 1X27 A; 2WSC E; 1GBQ A; 2DM1 A; 4MDW A; 2YLB A; 4XU3 A; 3MJX A; 3V7S A; 3GF5 A; 3OYD A; 3FB9 A; 2GTO A; 1OX8 A; 2RD1 A; 1RAI B; 2P84 A; 4F16 A; 2KQW A; 3RR6 A; 1VQ7 Q; 3V7C A; 1SHF A; 3N5B B; 2ZPB B; 2CGH A; 1ZX6 A; 3MP6 A; 3CCM A; 2JM9 A; 1X01 A; 5LJ3 d; 3UPU A; 1X2K A; 1GCQ C; 2K3B A; 3JCM X; 2BZX A; 1WI7 A; 1PRL C; 4PJO C; 1YP5 A; 2ROT A; 2PVG B; 1G3T A; 2DET A; 3AHU A; 1M4Z A; 2LRQ A; 2GCX A; 3VU3 C; 1K9M R; 1M1K C; 3QWX X; 2KXC A; 3BY7 A; 3SWN B; 4FYY B; 1KHI A; 3HPW A; 3L1A A; 2JUF A; 1YWP A; 1G8X A; 4AFQ C; 1HSQ A; 1OX9 A; 3TEE A; 4NOY A; 2F5T X; 1KHC A; 4M78 D; 2KNB B; 2HL5 C; 4HXJ A; 4MZP A; 1V29 B; 4M78 A; 3THK A; 2QGG A; 3D7S B; 3QII A; 4A4F A; 4J6W A; 4C8Q A; 4X1V A; 2EYX A; 4RTV A; 1HYO A; 3VJP A; 2DER A; 3JCM c; 3RMQ A; 2PUO B; 3HL8 A; 2AHJ B; 1P92 A; 3SHW A; 1W2B S; 4XTW A; 1S72 Q; 2FO0 A; 3M54 A; 3VV0 A; 2M02 A; 5GJW B; 1PKT A; 3HSB A; 2LX7 A; 1VQM A; 1KD1 R; 1H64 1; 3A8H B; 1VQO T; 1NLO C; 1QCF A; 1Y7X A; 4DBQ A; 2F2X A; 4OP0 A; 3M59 A; 4J9D A; 4JJD A; 2O31 A; 4M7A C; 3UWN A; 4C92 C; 1SF9 A; 1VA7 A; 1VQN T; 4P5N A; 1KQS A; 2G3R A; 2GBQ A; 4AFZ C; 1Y57 A; 2V8I A; 2A37 A; 3M0Q A; 4PLI A; 5KYW A; 2CZ6 B; 2DL4 A; 3SEM A; 2YLC A; 1VQO A; 3OYG A; 3L42 A; 2DIL A; 1J3T A; 3OYC A; 3FRN A; 2RHU A; 2L5Q A; 3DLL A; 3SFM A; 5GAN 3; 2J6F A; 1QWE A; 2CRE A; 1SPK A; 3EGX A; 1D1C A; 2M0Y A; 4XTU A; 1M90 R; 2YDL A; 2EYW A; 3FEO A; 1EIF A; 2LCL A; 4J9I A; 3M0R A; 4MML A; 5LJ3 j; 4RTU A; 1RAG B; 2A0F B; 4F04 B; 2MF2 A; 1C0M A; 1M30 A; 1RI9 A; 1VYV A; 1N9R A; 2LZ6 B; 2LNH B; 3NFC A; 1YI2 A; 2FZG B; 3V8L A; 5GMK e; 5A0D A; 3X26 B; 2JXB A; 4MZM A; 4E7I A; 4EPC A; 3MHX A; 4PNO A; 3J80 E; 4PJO E; 4LDY A; 1Y96 A; 2LT1 A; 3OBW A; 4J9F A; 2X4J A; 1C6V X; 3NHN A; 2RHY A; 2VAS A; 3OYJ A; 1PRM C; 4Z88 A; 3QSU A; 3OYI A; 2CKK A; 5FU6 B; 1NEG A; 1UJY A; 3I9Q A; 5GMK l; 3CQT A; 1SG5 A; 2JMC A; 2MPX C; 3JCM Q; 3NTK A; 1VQK Q; 3S3N A; 4AT1 B; 4ZGD B; 5CO7 A; 3T9N A; 2CS7 A; 5GAN d; 3CCS Q; 1PC0 A; 2DA9 A; 2KAF A; 1VQ9 A; 5FW9 A; 1JXO A; 2DL7 A; 3FJP A; 2VGM A; 5IHN A; 2EQJ A; 4BD3 A; 4KH0 B; 1AWX A; 1K1Z A; 3HTR A; 4KUI A; 5CKH A; 2LVM A; 5KYU B; 2MAM A; 2AT1 B; 1GRI A; 4HT8 A; 2HDA A; 5L8R E; 1UTI A; 4F14 A; 5KYX B; 2MI6 A; 4F7U G; 4EIK A; 2QA4 A; 3MCA B; 1M27 C; 1FMK A; 2V8J A; 4XU2 A; 1NE8 A; 1OPK A; 4JS4 A; 4M75 A; 4QVC A; 1X6G A; 2XD0 A; 3Q1J A; 1YIT T; 3V8J A; 1SKU B; 1ZA1 B; 4M7A E; 5LJ5 d; 3TU4 K; 1LNX A; 1KFZ A; 4C92 E; 3H0I A; 2L2P A; 4RCB A; 1NJI R; 3OYE A; 3RES A; 1M5Q 1; 1VQL A; 1X69 A; 3VRY A; 2CT3 A; 3MKD A; 4E7S A; 1Z9Q A; 2M1H A; 3SWN C; 3R6N A; 2E65 A; 3HFN A; 3CXC P; 2I0N A; 1RAE B; 1BCO A; 1K9M C; 2MMP A; 4FCY A; 2VKN A; 1B34 B; 1JJ2 P; 4XQ3 A; 2EQK A; 2L3P A; 4ESR A; 3TVT A; 1NG2 A; 3QZ9 B; 1MMN A; 3NGP A; 7AT1 B; 2KRN A; 1D0X A; 1FYN A; 2OTJ A; 3L2V A; 1JQQ A; 1TU0 B; 4N0A A; 1HK9 A; 2AKL A; 1JRI A; 1TXQ A; 3CC7 A; 2NWM A; 3CCL T; 2QTX A; 2CP2 A; 3ZEH A; 1MNE A; 1OQK A; 2BUD A; 5GAM d; 1RLQ C; 3C94 A; 3M53 A; 4M7D A; 2KR3 A; 2YSQ A; 3OYK A; 1Q82 C; 4GLM A; 3U23 A; 3SDZ A; 3VS6 A; 4QKU A; 2QQA A; 2ENM A; 1N27 A; 3UAT A; 1OYX A; 2LJ3 A; 3PGG A; 3EHQ A; 3PMT A; 3I5R A; 3ASK A; 1KD1 C; 1QW1 A; 3PIP A; 1H8K A; 4C0D B; 2HQH A; 4OML A; 3VS5 A; 1N8R U; 1Q81 R; 3CC4 Q; 4IUU A; 2LC4 A; 4GBQ A; 2DL3 A; 5GAN j; 4FT4 A; 1CSK A; 2RMO A; 4HKE A; 4IUV A; 2KT1 A; 4M78 G; 2XI9 A; 5IH2 A; 2DKG A; 5CQX A; 3M4G A; 4EMH A; 4J9H A; 1K73 U; 3M58 A; 5KCO A; 4C8Q G; 4LDU A; 2K57 A; 4OGC A; 2XHC A; 4OMN A; 4M77 B; 3JCM W; 3HRS A; 3GOX A; 1K8A U; 3G1J A; 4EMK C; 1VQ4 A; 5KYY A; 2OX7 A; 5LJ5 h; 2ATC B; 3EFS A; 1OEB A; 1G3Y A; 2O01 E; 2YWW A; 1RL2 A; 1WXB A; 3X25 B; 3I55 Q; 1QVG S; 4F17 A; 2R5A A; 4KGV B; 3QDR B; 2P0Q A; 4JRQ A; 3G4S Q; 1Y07 A; 2QXF A; 4M77 F; 2RNA A; 2RQV A; 5LJ5 j; 1M90 C; 2EFI A; 5FWB A; 4PJJ A; 1N9S A; 1VOM A; 3BW1 A; 5IXB A; 4II1 A; 3MP1 A; 3I35 A; 3CME A; 2GFU A; 2XK0 A; 2D8J A; 2NYS A; 1NZ9 A; 1UJ0 A; 5EG2 A; 1QCN A; 3CMA Q; 5KH6 A; 1GCQ A; 3BDU A; 4O5V A; 4L5G A; 4PJO A; 5I22 A; 2KSS A; 2RJF A; 2OTL A; 2JOY A; 2DNU A; 3QJY A; 4IIM A; 2PQW A; 4FT2 A; 5GAM h; 1UHF A; 5FU6 C; 4OMP A; 3PFS A; 1VQP T; 3CCU T; 1YJN Q; 1RAD B; 4K11 A; 2LCS A; 2X4Y A; 2HNI A; 1I5O B; 2X9H A; 4WF2 A; 4IUR A; 2F1L A; 4PFP A; 1VQ8 Q; 2EYQ A; 5GAO q; 3HRU A; 5GAM j; 1F1B B; 3CPW S; 4ZTF A; 3LW5 E; 3VS2 A; 3OS1 A; 3EGD A; 2JS2 A; 1GL5 A; 2CSQ A; 1HJD A; 3ZL7 C; 4CC7 A; 1M1G A; 1BKB A; 3CBM A; 1WHM A; 3CCU A; 2NLU A; 2CP6 A; 2DD4 A; 2LMJ A; 2L8D A; 2NUP A; 4BUG A; 1MUZ A; 2LQK A; 2DEU A; 3CCR T; 3CCJ T; 2VUB A; 2WSF E; 1ZA2 B; 2RJD A; 1UGS B; 2YRD A; 4LDX A; 2HD0 A; 4J6Y A; 4M7A D; 2NUZ A; 2KE9 A; 1QQJ A; 4C92 D; 2VV5 A; 2XKO C; 3KBG A; 4M7A A; 1IRX A; 4C92 A; 1OOT A; 2RK2 A; 1QVG A; 4RTX A; 4HT9 A; 2PVD B; 3CCR Q; 4WCI A; 1BBZ A; 2FYK A; 2KDS A; 3E9G A; 5IXF A; 4HVV A; 2VVK A; 2FG0 A; 1NJI C; 3CCJ A; 4F7U B; 4LD9 K; 3CD6 T; 2IIM A; 1X6B A; 2WSE E; 4ZN3 A; 4CC4 B; 1U5S A; 2ECZ A; 3CCE Q; 1ZSZ A; 3PNW C; 2LJ1 A; 2BZY A; 4F7U F; 1X2Q A; 2CZ7 B; 2ABL A; 1VYU A; 4LNP A; 2DZ9 A; 3I5S A; 4M75 G; 1U06 A; 2D1X A; 2ZAE A; 2BKD N; 3OYL A; 3KFV A; 3VS1 A; 1M1K U; 4JRP A; 1E6G A; 3CC2 T; 3CD6 A; 4N4G A; 1AWJ A; 1M3C A; 1WGS A; 5CKB A; 3JRZ A; 1HXD A; 1PCX A; 5HK0 A; 2B8A A; 1T3S A; 1RUW A; 3CPW A; 1LOJ A; 3OYN A; 2MYS A; 2DXC A; 4JDS A; 2C0O A; 3IQL A; 4EDU A; 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1I1J A; 1YHQ T; 4CC2 A; 5A2Q E; 1T3L A; 1BI2 A; 1JO8 A; 1S72 A; 3HFO A; 3A8M B; 2DL5 A; 1W2B P; 3EGX B; 3FLG A; 2X4W A; 2E6Z A; 3M0T A; 2K4Y A; 4PJO G; 1LPL A; 1VQN Q; 4FIB A; 1WNL A; 3JCM h; 3CBO A; 3CCV A; 3ME9 A; 1YI2 T; 5LJ3 h; 2AZS A; 4X34 A; 2RI3 A; 3ZFJ A; 1U1S A; 3JCM P; 4XU0 A; 4J8O A; 2ED0 A; 4VUB A; 2GF7 A; 5KYN A; 3OB9 A; 2DL8 A; 2LJ0 A; 1M2V A; 4IUP A; 4R0K A; 3NTH A; 3G71 A; 4YTL A; 2EJ9 A; 3GP8 A; 1YHQ A; 1QP2 A; 1Q86 R; 1N6A A; 4QQG A; 2C06 A; 2DFU A; 1B7T A; 1JU5 C; 4KUD K; 1QVF A; 2JTM A; 2E70 A; 3LGL A; 1Y96 B; 4M77 E; 2BTT A; 4EMK A; 2PVO B; 2HSE B; 4L59 A; 3BFM A; 2XIC A; 2DAQ A; 4KUL A; 2QDY B; 2FRW A; 1VQ9 T; 2DRK A; 4OMM A; 2E64 A; 1BK2 A; 1ZUK A; 5ECA A; 3QG1 A; 2DTI A; 1R0B G; 2QEX A; 2J06 A; 3ULR B; 3VKI A; 2YRV A; 1WXU A; 5C0M A; 3LYI A; 1K73 R; 4M7A G; 3QJ6 A; 4GLK A; 5FRN A; 4C92 G; 3RER A; 3TSW A; 1WHJ A; 1UEC A; 2OAW A; 2QA4 T; 1K0S A; 5I2S A; 3H6Z A; 1OI1 A; 2MOX A; 1K8A R; 2DJQ A; 3OQ5 A; 1KK7 A; 4AFU C; 1LJO A; 1W4S A; 3ZBD A; 2K5I A; 2RPN A; 2GQV A; 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