3SURA

Crystal structure of beta-hexosaminidase from paenibacillus sp. ts12 in complex with nag-thiazoline.
Total Genus 191
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
191
sequence length
519
structure length
504
Chain Sequence
HHHHSSGLVPRGSHMSQPSILPKPVSYTVGSGQFVLTKNASIFVAGNNVGETDELFNIGQALAKKLNASTGYTISVVKSNQPTAGSIYLTTVGGNAALGNEGYDLITTSNQVTLTANKPEGVFRGNQTLLQLLPAGIEKNTVVSGVQWVIPHSNISDKPEYEYRGLMLDVARHFFTVDEVKRQIDLASQYKINKFHMHLSDDQGWRIEIKSWPDLIEIGSKGQVGGGPGGYYTQEQFKDIVSYAAERYIEVIPEIDMPGHTNAALASYGELNPDGKRKAMRTDTAVGYSTLMPRAEITYQFVEDVISELAAISPSPYIHLGGDESNATSAADYDYFFGRVTAIANSYGKKVVGWDPSDTSSGATSDSVLQNWTCSASTGTAAKAKGMKVIVSPANAYLDMKYYSDSPIGLQWRGFVNTNRAYNWDPTDCIKGANIYGVESTLWTETFVTQDHLDYMLYPKLLSNAEVGWTARGDRNWDDFKERLIEHTPRLQNKGIKFFADPIV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Beta-hexosaminidase
publication title Gaining insight into the inhibition of glycoside hydrolase family 20 exo-beta-N-acetylhexosaminidases using a structural approach
pubmed doi rcsb
source organism Paenibacillus
total genus 191
structure length 504
sequence length 519
ec nomenclature ec 3.2.1.52: Beta-N-acetylhexosaminidase.
pdb deposition date 2011-07-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00728 Glyco_hydro_20 Glycosyl hydrolase family 20, catalytic domain
A PF02838 Glyco_hydro_20b Glycosyl hydrolase family 20, domain 2
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3surA01
3.30.379.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Chitobiase; domain 2 Chitobiase/beta-hexosaminidase domain 2-like 3surA02
1CPUA 3GNPA 1BLIA 2E9BA 2UY3A 5A2CA 1I75A 1JD9A 3OBAA 1HF6A 1UKQA 3POCA 1J0YA 5ECUA 1HJVA 1KWGA 1FOBA 3IK2A 1H2JA 2X0HA 5GQBA 5HDRA 4JIEA 3WH6A 1ITXA 1DTUA 1UD4A 5A2AA 3TA9A 1W9DM 2JIWA 2PF0A 5BXSA 1JZ4A 2VL4A 1ISZA 9CGTA 1NOWA 4AD2A 2VR5A 3TTYA 1AVAA 1UQZA 1Q6EA 2CBUA 1GJUA 1HVQA 2YDQA 2WVVB 2JFEX 1O7AA 3VD5A 4HPGA 5BCAA 4W8LA 1W3KA 3WQ4A 1UR1A 2DH3A 3VUPA 1CEOA 4MNLA 2DPEA 1BPLB 4X0VA 1H5VA 2WSKA 4X0NA 5CPSA 5M17A 4B15A 3DECA 2F61A 4J3VA 2YL8A 1B2YA 3EMZA 1HKIA 2G41A 3HMCA 1J11A 3ARQA 3WDPP 1FFRA 2F8QA 4GXPA 4FLQA 4W8BA 1BF2A 1WCGA 2WHJA 4PMOA 2J77A 3RM8A 3MS8A 3PZQA 1NOUA 1GOWA 1YHTA 1VEMA 2CEQA 2OSYA 2X05A 5CPTA 3MV01 2G3NA 5E09A 5BROA 1O6IA 3VIHA 3BAXA 4PSRA 1DHKA 2D0FA 1JF5A 4AMCA 1UR9A 1XYZA 4Z2LA 2VUYA 3CMGA 5D4YA 3VIMA 4TVDA 3VX1A 1C93A 4AD4A 4B9YA 3VD9A 3SEPA 3KZSA 4WJXA 5BRPA 4AEEA 2ZXQA 1CECA 1P6WA 2CBJA 3K4AA 5A6KA 4GKLA 1VFMA 4N42A 5I78A 4CKQA 5C71A 4AISA 4HOZA 2ZUMA 3BLKA 4XZWA 1ZBVA 2WYSA 3AIRA 1CXEA 4JKMA 2XUCA 1G9HA 1JZ6A 4YPJA 1TVPA 3F5JA 1HX0A 2XPKA 1DWJM 2UY5A 1M01A 2NSXA 5FIPA 1K9DA 3TTOA 1WDPA 2E4TA 1LF1A 7CGTA 4URIA 4J3WA 3PTMA 1HXJA 4UCFA 1MW0A 3GXIA 1EXPA 2D2OA 1BAGA 3WDIA 2BV9A 1US3A 3VNZA 3NCOA 4HMEA 2VC9A 4D1JA 1WP6A 5ABFB 1OGSA 4LQ1A 1E0XA 2CNCA 3MKKA 4H7VA 1MXGA 4FMVA 4B9ZA 1E0WA 4EE9A 1E4LA 3F5KA 2VTFA 3N12A 2CXGA 2XWEA 2V5CA 1KGUA 4QAWA 3AISA 3UG4A 3AI0A 5DT7A 3O9NA 3ZT7A 2Y8VA 4AZ7A 1V08A 1J0KA 2J78A 1Z32X 5D8WA 4UFIA 4H8UA 4FLRA 1R7AA 3F4VA 3WNNA 5DF0A 4JZ5A 3EDEA 3PZ9A 3WN6A 3GNRA 3GXMA 1WAWA 4HMDA 1K9EA 3FHAA 3WDRA 4PMYA 3WFLA 1JYNA 3PTKA 3BAWA 2EJ1A 1TA3A 1EQPA 1XC6A 3AZRA 1V3IA 4KWUA 1E6RA 4PUDA 2CBIA 3CUGA 3GBEA 4DUXA 2WXDM 3VMOA 1ZJBA 2J7FA 2PWDA 3MMWA 3SCVA 2YA2A 4RL3A 4U5IA 2OLHA 3ZR5A 5DEZA 4HPHA 3VOCA 1XCXA 2JIEA 1VF8A 5I0DA 4W7UA 3DYMA 3NDZA 3A3HA 3UR8A 4XUYA 1QOXA 2XFYA 3L4VA 4HMCA 2DSWA 4W5UA 1E40A 1E4NA 2YL6A 4P8VA 2W62A 2VZTA 3D5HA 4M1RA 1WZLA 4PTVA 4J3XA 3WQVA 2ZXAA 3CPUA 4TUFA 2GJXB 2CHNA 4PBGA 2WC7A 1RP9A 1GZJA 1BHGA 2XIBA 1B31A 5A8MA 2WHKA 3UEQA 4W89A 3WF3A 3OZOA 4U3AA 2FGZA 1E0VA 2TAAA 3WQ6A 1UR0A 1KCLA 2G3IA 2VO5A 2XTKA 2XSBA 4L4PA 2VRQA 1Q6CA 4PCSA 3UCQA 4MADA 1LQ0A 4UQCA 2PWFA 1QBBA 4UFLA 2WB5A 1H4PA 4X9YA 3AROA 4PMXA 4WKAA 1BTCA 1UH3A 1GHRA 2WPGA 1E5JA 3RCNA 4QDMA 1UD3A 2WLZA 5EBAA 1G94A 3EDJA 1OIMA 2VR4A 2YA1A 2XFFA 3VGEA 1VAHA 4JFSA 4D6JA 4HP5A 1PZ2A 1EH9A 3PZIA 4ATLA 4TTUA 5DMYA 2GVYA 4BF7A 1XRVA 1PX8A 4C7DA 1NWTA 4MJ2A 1BYCA 2XGIA 4IISA 1B3VA 3SUWA 1SR0A 1SFSA 1ZBCA 3NYDA 3PZVA 4YHGA 1E6ZA 4TXEA 3AHZA 4H41A 2JF7A 3WDQA 2ZUWA 2CITA 1PPIA 3T2OA 4UFHA 3CHFA 4PRWA 4PMUA 1UQYA 4AY1A 2QLYA 2ZIDA 3WDJA 3M7SA 2BHYA 3PTQA 4AZBA 4ACZB 5FD0A 3SCSA 4V2XA 5FKYA 1GJWA 4AZIA 1FA2A 2PBOA 1DWAM 1GQLA 2PB1A 4OOUA 1EDTA 1IZKA 1WNOA 1QNPA 1VBRA 4K68A 3BLPX 2O9TA 1RD6A 1NWUA 2FGLA 2VX6A 4OZOA 5A6BD 1BGAA 3W38A 1OIFA 4LYPA 3HJEA 1FH9A 2RGMA 3GH4A 3ZT5A 3VIKA 3J7HA 4GZEA 4Z2IA 3OB8A 4AZCB 3BSGA 2BVTA 4AZHA 1ODZA 1GUVA 4KRTA 4D6GA 3WH8A 7TAAA 3MUZ1 1TUXA 3F5LA 3WDHA 5I5RA 1VJSA 4UTFA 7A3HA 3I3EA 3BAYA 1KR1A 2EPLX 2NT1A 2O9OA 1XHGA 1UA7A 3UESA 1QI4A 2OSXA 3OLEA 4QP0A 2EPOA 2WZHA 2XVKA 4WSJA 5HOSA 3WD4A 4QCFA 4IM4A 3RO8A 2YLLA 1JNDA 3S6TA 1QW8A 5GNYA 2X09A 2ZUTA 3AMCA 5BXPA 3RJXA 3W25A 1XSIA 2EPNA 3PHAA 5EFFA 5A6SA 4NSBA 1SYTA 1KB3A 1OB0A 5A1AA 3OLDA 2E9MA 1ITCA 3ARVA 2XSAA 3WMCA 1V6WA 3WEOA 1ISYA 8CGTA 5ABEA 2ZX6A 4OIFA 1J10A 1E5NA 2D24A 1CIUA 2ZXBA 2Y24A 4XV0A 3VGFA 4M8UA 3G6MA 4Z2GA 1HL8A 4QLKA 3AXIA 3BSHA 3CZLA 2OWXA 3LPFA 3N15A 2HVMA 1L0PA 1X6LA 5CSUA 2C0HA 3SUUA 5DO8A 3VM5A 1TR1A 3U7VA 1JIBA 3VDAA 5A8NA 4NRRA 2RGLA 3AHXA 4HA4A 4MPKA 1JL8A 1MQRA 5D9NA 2VCAA 1E3XA 2E40A 3AS1A 3PN8A 2CBVA 3BAKA 3SCNA 1JF6A 3AS3A 3ZJ6A 1GORA 2VCCA 3AIQA 3N1AA 4AEFA 3W81A 1HP4A 4PMZA 1CZ1A 2BS9A 3CZJA 1KGXA 5I6SA 4GI6A 2YKKA 1X6NA 2WKLA 3CTTA 1OT1A 5M03A 4PEEA 3VNYA 2QPSA 3WNLA 5BRQA 2J7BA 1BYAA 2WMIA 3MMDA 4FF5A 5BXRA 4AZGA 5CGMA 1D3CA 3CZGA 1US2A 4D6CA 4EK7A 3L4TA 2DH2A 3RPMA 4AW7A 5TD4A 3AZTA 4NI3A 3WEMA 2CESA 3LPPA 4IPNB 4CN6A 5A2BA 2BNJA 4QFUA 3LPOA 5IDIA 5I3DA 2W92A 4UQDA 2D20A 2VZVA 4ZE5A 2W91A 1JZ2A 2FDMA 1XYFA 1K6AA 2WANA 1CYGA 3ARPA 2D3LA 2D3NA 3HN3A 3APGA 5A6JA 1UD2A 4U33A 1R85A 3DHPA 2ZX7A 3CUIA 4CGTA 2OYLA 5DT5A 3VU2A 5CG0A 1LL7A 4WIWA 3K4DA 1VFOA 3WUGA 1W1YA 4PMQA 2FHCA 2AAAA 4UOQA 5GNZA 3O2LA 1I1XA 4CN1A 2CYGA 4CD7A 2WW5A 2PWHA 4PTXA 3WQ5A 4LX4A 4CCDA 2IXUA 5E70A 1UUQA 5A69A 5CJ5A 1NOFA 5E6ZA 3U5YA 4M82A 2NW0A 1E15A 1F4HA 1PX4A 3U5UA 1ECEA 5I24A 3N11A 2J47A 3NSNA 1HKJA 3GBDA 4UOJA 3AJ7A 4B3KA 4IUGA 1QNRA 5BYWA 2WNWA 1KXVA 1RPKA 3VIIA 4B16A 2G3JA 4QCEA 1MW1A 1EO7A 3AICA 4HU0A 4DM1A 3ARWA 3ALFA 4UFMA 3UERA 3ZJKA 1MFVA 1XGZA 4P7LA 4A3YA 1B3WA 1LL6A 3WNMA 4CCCA 2ZUSA 1CTNA 2X8RA 3WBAA 5BXTA 2GK1A 2FHFA 5AC5A 1HIZA 2WVUA 3W0KA 3AYRA 4TX8A 3CZ8A 4XX6A 4MB1A 1JYWA 4M80A 4MB4A 2YBTA 4CU6A 2YBUA 3KEHA 1UZ1A 1V3MA 3VVGA 3TTQA 1V03A 4PSPA 4JFUA 4PUEA 2EPMX 1QI2A 4ML4A 2DT1A 1WDRA 1M03A 4UFKA 1VENA 2J7EA 3PZGA 3VD4A 4BZYA 4BQ4A 3WSUA 4AIOA 1CLVA 4P7RA 1E73M 2XHYA 3N13A 1PIFA 3AIBA 1PJ9A 1CXFA 3B9AA 4MB5A 2A3CA 1OSEA 2A3AA 3SCTA 1J0IA 2PI6A 1CGTA 2WMKA 4JFTA 1HJUA 3AXHA 5JIWA 1IT0A 3VTRA 1OCQA 1E6SM 1W1TA 4PMDA 3FY1A 4F9JA 1L8NA 1W3LA 3AFBA 1OM0A 4AC1X 1VJZA 4NF7A 3CBWA 1V02A 3AIEA 1G1YA 2QF8A 2ZUVA 2ZUNA 3ARTA 4AZ6A 4MAZA 4OOZA 2ZWYA 2D0GA 3FXYA 1ODUA 5D9PA 3THDA 1W9XA 5KZ6A 2XM1A 4OBSA 1MFUA 4FLOA 1HJWA 3CLWA 5ABGA 1GONA 4D6DA 1KXHA 1EO5A 1MQPA 5A6AA 2BY3A 4ZEPA 2WC3A 1H0GA 3WD3A 3W53A 3CHDA 2EQDA 2CPUA 1OBAA 3CMJA 4W7WA 3WF1A 4D1IA 2OSWA 1KGWA 5ABHA 3CGTA 1KR0A 1U30A 3N17A 5HPOA 2VNCA 4DWSA 2WLYA 2JEPA 3U7BA 2UWFA 4JCLA 2BY2A 1DEDA 2WZEA 2OYMA 1JI2A 1BSIA 1OGGA 1EHNA 1B90A 1JAEA 1M7XA 1TA3B 3CUJA 1R7OA 2XJ7A 2E8ZA 4W7VA 3VDHA 1WB0A 2XYLA 2DT3A 5M5DA 1E55A 1R86A 4WK9A 3SCOA 3WD2A 3UR7A 1CXHA 1H1NA 3DYPA 3N04A 1JNEA 2WBGA 1JDCA 2ZX5A 1GCYA 2XIIA 3L2LA 3BAJA 2G4FA 2ZWZA 3BMWA 4DWSC 3WEZA 4MDPA 4KH2A 1H3GA 4IPLA 4MTVA 4KGLA 1TFVA 2X0YA 4C7GA 1H09A 3SCRA 5IFPA 2WK2A 4S3KA 1UR4A 2CCRA 1JFHA 1JYXA 1W1VA 4W86A 3PZMA 3HU7A 1JZ8A 4U31A 1S46A 1J0ZA 3II1A 4Z2JA 3EBVA 2A3EA 1VFUA 2WSPA 3OLGA 3QHNA 1C91A 1M04A 3AZSA 2BHZA 4M29A 4JCMA 3AOFA 3FNDA 3KE0A 4AD1A 1E70M 5LA0A 3IJ9A 2GSJA 4CD5A 1AMYA 3MUAA 2DEPA 3QHOA 2V38A 3CZEA 4YHEA 4AWEA 3N9KA 1C90A 3G6LA 4GO8A 1BYDA 1SMAA 3BAIA 4MAVA 1KXTA 1PAMA 1CDGA 1E1FA 4WF7A 3TONA 2AOSA 3OZPA 2HISA 3K8KA 3E1F1 1Q6GA 2J7CA 4J28A 1B1YA 4W84A 4AXNA 4P8UA 5CLTA 3VGBA 5GNXA 1EOKA 4UZUA 5JBEA 3AS2A 4ZENA 4M81A 2JEQA 4JL1A 3BH4A 4FK9A 2Y2WA 4JKKA 4BQ5A 3QOMA 3VGDA 1RP8A 3ARZA 2ESCA 1XCWA 5CZKA 1E72M 4D6FA 1TVNA 2W61A 3ZM8A 2DQXA 3L2MA 1UA3A 4HZ6A 5D9OA 1C7TA 3WL0A 5M3WA 3MU7A 3WQWA 3WBEA 1Q6DA 2WZIA 2IXVA 2E9LA 3AIVA 1BQCA 3WD1A 1WZAA 3LMYA 3WMSA 1HJXA 1E56A 3VMNA 5A6LA 1U2YA 1UG6A 3EDDA 1TCMA 3M46A 1V3JA 2WC4A 4H8HA 4PCTA 5JUVA 4M24A 3FN9A 4CU8A 2VURA 2DGAA 2XM2A 3VKKA 4TX6A 2WMHA 4UOZA 2WVSA 4D6IA 4D72A 1MWOA 2BVDA 3ZOAA 1UKSA 3IJ8A 5AYBA 5AY7A 1JFXA 4E8DA 3BXWA 1ISWA 2PC8A 1TMQA 4D71A 2WMJA 3PZUA 2Y5EA 2GJRA 3ZO9A 3OA5A 3T0DA 1UD6A 4U2YA 3ARXA 4OJYA 1H0IA 4BQ3A 1UKTA 4C91A 4JL2A 6CGTA 1WKYA 3UG5A 1C8XA 1XSJA 3W29A 1E1EA 2VOTA 3CHCA 4H2CA 3L4XA 2ZUUA 3K8MA 3BCDA 5KEZA 2WWDA 4C7FA 4UFJA 4UQEA 1M53A 1QPKA 4UQAA 5EB8A 1XH0A 1EDGA 4CCEA 3RM9A 1CGVA 3MUY1 1V3KA 4GI9A 1GPFA 3AIUA 3N18A 4WSKA 3VM7A 4XZBA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1CPU A;  3GNP A;  1BLI A;  2E9B A;  2UY3 A;  5A2C A;  1I75 A;  1JD9 A;  3OBA A;  1HF6 A;  1UKQ A;  3POC A;  1J0Y A;  5ECU A;  1HJV A;  1KWG A;  1FOB A;  3IK2 A;  1H2J A;  2X0H A;  5GQB A;  5HDR A;  4JIE A;  3WH6 A;  1ITX A;  1DTU A;  1UD4 A;  5A2A A;  3TA9 A;  1W9D M;  2JIW A;  2PF0 A;  5BXS A;  1JZ4 A;  2VL4 A;  1ISZ A;  9CGT A;  1NOW A;  4AD2 A;  2VR5 A;  3TTY A;  1AVA A;  1UQZ A;  1Q6E A;  2CBU A;  1GJU A;  1HVQ A;  2YDQ A;  2WVV B;  2JFE X;  1O7A A;  3VD5 A;  4HPG A;  5BCA A;  4W8L A;  1W3K A;  3WQ4 A;  1UR1 A;  2DH3 A;  3VUP A;  1CEO A;  4MNL A;  2DPE A;  1BPL B;  4X0V A;  1H5V A;  2WSK A;  4X0N A;  5CPS A;  5M17 A;  4B15 A;  3DEC A;  2F61 A;  4J3V A;  2YL8 A;  1B2Y A;  3EMZ A;  1HKI A;  2G41 A;  3HMC A;  1J11 A;  3ARQ A;  3WDP P;  1FFR A;  2F8Q A;  4GXP A;  4FLQ A;  4W8B A;  1BF2 A;  1WCG A;  2WHJ A;  4PMO A;  2J77 A;  3RM8 A;  3MS8 A;  3PZQ A;  1NOU A;  1GOW A;  1YHT A;  1VEM A;  2CEQ A;  2OSY A;  2X05 A;  5CPT A;  3MV0 1;  2G3N A;  5E09 A;  5BRO A;  1O6I A;  3VIH A;  3BAX A;  4PSR A;  1DHK A;  2D0F A;  1JF5 A;  4AMC A;  1UR9 A;  1XYZ A;  4Z2L A;  2VUY A;  3CMG A;  5D4Y A;  3VIM A;  4TVD A;  3VX1 A;  1C93 A;  4AD4 A;  4B9Y A;  3VD9 A;  3SEP A;  3KZS A;  4WJX A;  5BRP A;  4AEE A;  2ZXQ A;  1CEC A;  1P6W A;  2CBJ A;  3K4A A;  5A6K A;  4GKL A;  1VFM A;  4N42 A;  5I78 A;  4CKQ A;  5C71 A;  4AIS A;  4HOZ A;  2ZUM A;  3BLK A;  4XZW A;  1ZBV A;  2WYS A;  3AIR A;  1CXE A;  4JKM A;  2XUC A;  1G9H A;  1JZ6 A;  4YPJ A;  1TVP A;  3F5J A;  1HX0 A;  2XPK A;  1DWJ M;  2UY5 A;  1M01 A;  2NSX A;  5FIP A;  1K9D A;  3TTO A;  1WDP A;  2E4T A;  1LF1 A;  7CGT A;  4URI A;  4J3W A;  3PTM A;  1HXJ A;  4UCF A;  1MW0 A;  3GXI A;  1EXP A;  2D2O A;  1BAG A;  3WDI A;  2BV9 A;  1US3 A;  3VNZ A;  3NCO A;  4HME A;  2VC9 A;  4D1J A;  1WP6 A;  5ABF B;  1OGS A;  4LQ1 A;  1E0X A;  2CNC A;  3MKK A;  4H7V A;  1MXG A;  4FMV A;  4B9Z A;  1E0W A;  4EE9 A;  1E4L A;  3F5K A;  2VTF A;  3N12 A;  2CXG A;  2XWE A;  2V5C A;  1KGU A;  4QAW A;  3AIS A;  3UG4 A;  3AI0 A;  5DT7 A;  3O9N A;  3ZT7 A;  2Y8V A;  4AZ7 A;  1V08 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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