3SUSA

Crystal structure of beta-hexosaminidase from paenibacillus sp. ts12 in complex with gal-nag-thiazoline
Total Genus 191
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
191
sequence length
519
structure length
504
Chain Sequence
HHHHSSGLVPRGSHMSQPSILPKPVSYTVGSGQFVLTKNASIFVAGNNVGETDELFNIGQALAKKLNASTGYTISVVKSNQPTAGSIYLTTVGGNAALGNEGYDLITTSNQVTLTANKPEGVFRGNQTLLQLLPAGIEKNTVVSGVQWVIPHSNISDKPEYEYRGLMLDVARHFFTVDEVKRQIDLASQYKINKFHMHLSDDQGWRIEIKSWPDLIEIGSKGQVGGGPGGYYTQEQFKDIVSYAAERYIEVIPEIDMPGHTNAALASYGELNPDGKRKAMRTDTAVGYSTLMPRAEITYQFVEDVISELAAISPSPYIHLGGDESNATSAADYDYFFGRVTAIANSYGKKVVGWDPSDTSSGATSDSVLQNWTCSASTGTAAKAKGMKVIVSPANAYLDMKYYSDSPIGLQWRGFVNTNRAYNWDPTDCIKGANIYGVESTLWTETFVTQDHLDYMLYPKLLSNAEVGWTARGDRNWDDFKERLIEHTPRLQNKGIKFFADPIV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Hydrolase
molecule keywords Beta-hexosaminidase
publication title Gaining insight into the inhibition of glycoside hydrolase family 20 exo-beta-N-acetylhexosaminidases using a structural approach
pubmed doi rcsb
source organism Paenibacillus
total genus 191
structure length 504
sequence length 519
ec nomenclature ec 3.2.1.52: Beta-N-acetylhexosaminidase.
pdb deposition date 2011-07-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00728 Glyco_hydro_20 Glycosyl hydrolase family 20, catalytic domain
A PF02838 Glyco_hydro_20b Glycosyl hydrolase family 20, domain 2
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3susA01
3.30.379.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Chitobiase; domain 2 Chitobiase/beta-hexosaminidase domain 2-like 3susA02
1V0KA 1EIBA 4E2OA 1KGXA 4EANA 2AOSA 5A6AA 3WBAA 2GSJA 1ZJBA 4H8VA 4JFSA 1JGIA 4B3KA 4AD2A 2NSXA 2J74A 2DT1A 1ZL1A 4W7UA 1CENA 2WSPA 1OT1A 4PUDA 3ZT5A 3VGHA 1MQQA 2GJRA 2XYLA 3WMBA 4UFJA 4GZEA 1TR1A 4HP5A 4GO9A 2CITA 2YKKA 4AZ6A 3SCOA 3CZKA 3WFZA 1CXEA 4PMYA 1JYNA 1W1PA 3ZR6A 5BRPA 2YLAA 5ABHA 1NWUA 4AEEA 2WC3A 1ZU8A 1B31A 1QNOA 3AS3A 4U5IA 2DEPA 3IAQA 4PTVA 3PZNA 5FKYA 2J62A 3THDA 4HTYA 3N11A 1B90A 2FH8A 4E4PA 3AS2A 1WDQA 2ZE0A 4CCDA 4J3UA 1TVNA 1MW3A 4AISA 2XPKA 2X2YA 3N18A 3A4XA 4MB5A 4RE4A 4AYSA 3WH6A 3APGA 3SUWA 3W25A 1JZ6A 4FLQA 4JFTA 3N17A 1ZBCA 2DSZA 1VBUA 2X0HA 3TTQA 3AHZA 2PBOA 1C92A 2D0FA 2DH2A 5HPCA 2WXDM 2FGLA 2JEQA 3SCWA 1WZKA 3W24A 1HVXA 2EXOA 1K9EA 2ZUNA 1ISYA 4CKQA 1ISZA 2WWDA 1QBBA 4J7RA 4XB3A 1XYZA 4GPNA 3U5YA 5I6SA 2DIEA 1UR1A 4P8UA 3DYMA 1JZ3A 3OGSA 4W93A 3VIFA 1BVZA 4JKMA 4UOQA 3A4AA 4W89A 2VC9A 5E09A 3VIKA 2Q8XA 1W1VA 5LYRA 5HBFA 5IDIA 1AQHA 4TOQA 1AMYA 3WH9A 3PZVA 1J01A 2EQDA 1QHPA 4U2ZA 4W87A 2W63A 4QFUA 4FLRA 2E3ZA 1OIFA 2ZWYA 1E70M 3OLIA 2YL5A 1H5VA 4UCFA 3ARRA 1AQ0A 3AIEA 4K68A 1PZ3A 4LPCA 1H09A 4MJ2A 5E70A 5M3WA 1EH9A 3A3HA 2WANA 1ITXA 1JF6A 1JZ2A 3SUVA 1LL6A 3G6MA 2CETA 2JEPA 2DH3A 7A3HA 5E0CA 5I78A 1UKOA 1JIBA 2PC8A 2C7FA 4Y7EA 5E9AA 1EO5A 1UR0A 3PZIA 3ARQA 3NIYA 3GTNA 3NDZA 1EGZA 1PBGA 3AS1A 2IXUA 2VR4A 2YA1A 1HJVA 5BXPA 5AYIA 2VCAA 2ZICA 1XRVA 1BTCA 3PTMA 4P7OA 2V5DA 4M81A 1DEDA 2WMGA 3VD4A 2WLYA 2B31A 1OGBA 1ZBWA 2WYSA 3PZQA 2DT3A 3NJ3A 4PMOA 2ZXBA 1H2JA 4JCMA 3OLGA 3MO4A 1HIZA 4B9YA 5AC4A 1VENA 4JL1A 1EDTA 2WZHA 3VMOA 2DT2A 1DWFM 1EA9C 1BAGA 1V3LA 2JF6A 3WDQA 2XFYA 2D1ZA 2GJXB 1KQYA 1J0IA 1PZ2A 1MQPA 1FP8A 1JNDA 2D3LA 4UFMA 5CLWA 4UQDA 2D22A 1SMDA 4AXNA 2CXGA 1QI3A 3AMGA 3MMDA 3T2OA 4PMUA 3WD2A 3BH4A 4OIFA 1JD9A 1XH2A 3J7HA 3CZJA 2ZX6A 2D23A 5A6JA 4HMCA 1NOUA 4WIWA 1M03A 2DSUA 1JFXA 2PWDA 2D24A 5A6KA 2E40A 1CXKA 2XVPA 4OUEA 4X9YA 4AD4A 5DFAA 2W4XA 4GZJA 5HPOA 2ZX7A 3AIBA 1W9DM 2JIEA 3GBEA 4D6CA 2OSXA 3KL5A 4TX8A 2J75A 3K4DA 1XD0A 3BMWA 5CQ1A 4CVUA 3SUUA 3M6DA 1A3HA 4PTWA 1EHAA 5CPQA 2VX4A 3N13A 4CN6A 4CUCA 2W67A 1WDSA 2BXZA 1ODZA 1CBGA 3GYCA 2E9BA 3WF4A 3WQ8A 3VIPA 5KEZA 1B2YA 1GPFA 4UQ9A 1JI1A 3AMCA 2V5CA 2DQXA 3AS0A 2ESCA 1XYFA 3VTRA 1W9BM 1HP4A 4WKFA 4URIA 2D20A 3WL1A 5IHSA 1V08A 1VB9A 3VIMA 4M1RA 2G3MA 3HMCA 3BSGA 1IZJA 4UTFA 1CNVA 1NQ6A 2WB5A 1WDPA 3CTTA 1GQLA 4ATDA 2A3AA 4PMDA 3N12A 2VX6A 5I24A 1H11A 3VIGA 1D7FA 3GH4A 2GK1B 2NT1A 1CEOA 4QDMA 3CHDA 3W6LA 1G0CA 4MAZA 4JZ5A 4LQ1A 3WH7A 3RJXA 3OZPA 1JZ7A 3W26A 4BA0A 1DWJM 3VGEA 1GORA 2OYMA 3ARSA 4KRUA 2ZOXA 4DUXA 2EEXA 4PSRA 2J7DA 1CLVA 2XSAA 2J4GA 2XGBA 2O92A 3FAWA 2UY4A 1WCGA 1GOIA 2VZTA 3NSXA 3EMZA 5HXMA 5BRQA 2OWXA 4E8DA 4WSKA 5JUVA 3K8MA 3WD0A 4HOWA 1UR9A 1C7TA 1E40A 1V6VA 2JFEX 1HKIA 2QMJA 2WSKA 2WCSA 4V28A 3SCNA 4GZIA 1XD1A 3SUSA 4PTMA 1QNRA 5JIPA 1Q6EA 1YQ2A 3UERA 4PMXA 1DWIM 3AMLA 2ZUWA 1I1XA 4KRTA 1V3HA 1GQKA 1LL7A 2QPSA 4PEEA 2YOCA 4DWSA 2VL4A 1WDRA 1PX4A 3WNMA 3OB8A 2WZIA 2BXYA 1C7SA 3BAYA 1CIUA 1OD0A 2QHAA 1MFVA 1VEOA 2AAAA 5I0DA 3VDHA 4D1IA 3AYSA 5A6SA 1JF5A 3EMCA 3BGAA 2WNWA 4V2XA 3QGVA 1M53A 2WHMA 4RE2A 4D6EA 1QHOA 1FH8A 1XSJA 2Y5EA 2VVNA 1UR4A 2CBJA 1OCQA 2V3FA 3GH7A 1B0IA 2WHJA 4HMEA 2E8YA 4QLJA 5CLTA 4NRSA 1GJWA 4CD5A 2GDUA 1B3VA 5CJ5A 2J7GA 2J47A 2G3NA 3WUEA 1GOQA 4QCFA 3CMJA 5BCAA 2YBTA 4J3XA 2BVDA 2TAAA 1PX3A 2OYLA 3PZOA 4XZBA 3WEMA 1CPUA 3WDJA 3AZSA 1VFMA 3POHA 1E6NA 4H8UA 4PMVA 1TA3A 1E5NA 4IISA 4BQ3A 2VI0A 4AZIA 1CXLA 3B9AA 4M24A 4EKJA 3WEOA 4QLKA 1K6AA 2WK2A 4MB1A 3AIQA 1E0XA 1HJUA 1LLOA 1E5JA 1HL9A 2WM0A 3OIHA 1OD8A 1EHNA 3VVGA 1DP0A 4PN2A 3VGGA 3AHYA 5CPSA 3RMEA 3DYOA 4OKDA 4D1JA 2VX5A 3B9EA 3W6MA 1Z32X 6A3HA 3ZM8A 1UWIA 3KE0A 1UKPA 1HNYA 4B9ZA 1K9TA 1NARA 4X0NA 3CUJA 3LMYA 2XM2A 2A3BA 3VIJA 1SR0A 2E9LA 1E0VA 4QP0A 2J8FA 3K8KA 4AIUA 6CGTA 2PF0A 1EXPA 4W7WA 4CGTA 4Z2GA 1JD7A 4B16A 2BHZA 3K1DA 3VGDA 1OIMA 4UQAA 2ZX9A 3CPUA 5DT7A 2J7CA 3U7VA 3HJEA 2YDRA 5EFDA 4CU6A 1BG4A 5FL1A 1ZBVA 3TOPA 1ISWA 3AISA 3LPPA 3EBVA 1FH9A 3ARPA 1UD6A 3VX0A 4W84A 3UR8A 1WZLA 5CPTA 1XH0A 4IM4A 1R7AA 2YL6A 3CZGA 3TTSA 1W9VA 4MB4A 3VMPA 2EPMX 1IT0A 1BPLB 4EK7A 1JAKA 2Y2WA 1C93A 4QAWA 1HJQA 3MKKA 1E6SM 1PIGA 1JDCA 2J79A 4TVCA 1VFFA 1LG2A 1UWQA 2WMFA 2J78A 1JYWA 2Y8VA 1J18A 3WF0A 1W91A 3UG3A 1MW0A 3WN6A 1WPCA 2VQTA 1E56A 2WBGA 1BYCA 4DM1A 4ZEPA 6TAAA 4HA4A 1JAEA 3RIKA 3U57A 4TVUA 1E6ZA 2O9PA 5AC5A 1B1YA 1NP0A 2WMIA 2W92A 1XV8A 8A3HA 3GBDA 1HJWA 1CECA 3AXHA 2W61A 2NT0A 2J25A 4Q7NA 4AD1A 3KWXA 4HZ6A 2W62A 2BVTA 4PSPA 1GHRA 4CD8A 2EPOA 3VM7A 3TTOA 1DWGM 1H41A 4ACZA 5GNZA 1KBKA 3L4XA 3EDEA 1UUQA 5DT5A 1KR0A 4EE9A 4UNIA 3EDFA 3DHUA 4P8WA 1JL8A 5HNNA 1GOOA 2QPUA 3O6AA 1C8QA 5CGMA 1JDAA 5CSYA 3DECA 4HZ7A 4U3AA 5DF0A 3L2LA 2X0YA 2WVVB 3B8SA 3IANA 1MXDA 5A6MA 3WDPP 2D0HA 1HKMA 1CGUA 2G3IA 3OG2A 2X8RA 2FHBA 2V3GA 1E3ZA 3ZIZA 1CDGA 1E55A 5TD4A 1FH7A 1WKYA 2J7BA 1NWRA 1GVIA 3VDAA 2GDVA 4F66A 4J3WA 1M7XA 1W2VA 5BXSA 3ARWA 2PWGA 2YBUA 1AQMA 2JE8A 5A8NA 4MADA 2XVKA 1UH3A 1JYXA 4FF5A 3HN3A 2IXVA 3FW6A 1FP9A 4F9JA 3MSGA 1CYGA 1BF2A 1GW1A 1KWKA 1RPKA 2Y4SA 2UY2A 5FIPA 4HMDA 3VD5A 3VUPA 4JL2A 2WKGA 5GNYA 4GXPA 3ZJKA 4J3TA 3FNDA 3OGVA 3N04A 1C8YA 3AHXA 3L4UA 1GQJA 4MDOA 1LJYA 1VJSA 2W66A 1UR2A 4C91A 5A1AA 3UG4A 1OGSA 3VD3A 3CHFA 1OB0A 4D71A 1R8LA 4PTXA 1V03A 4PMQA 1K9FA 1ECEA 2XWEA 1TE1A 4KMQA 4DWSD 1UZ1A 2OLHA 2F8QA 3CH9A 2VURA 3SCVA 1QW9A 1US2A 2VZOA 4AD3A 4A3HA 2W91A 1BYDA 1CLXA 1J0KA 3TONA 1QI0A 1TFVA 3SCRA 9CGTA 1X6LA 3VU2A 3ARYA 2HISA 1IV8A 5IFTA 4CN4A 5I77A 1TG7A 1CZ1A 1SFSA 5ABFA 4HZ8A 3NDYA 2D0GA 1J11A 2OWCA 1XH1A 3VDBA 4AZCB 3ARUA 3BLKA 1PEZA 2CKRA 1QBAA 3RCNA 3AZRA 2C0HA 2G8ZA 2XVLA 4KWUA 2CIPA 1V02E 4GKLA 3QR3A 1W3KA 4PUEA 2YDSA 4W8AA 3RO8A 5ABGA 3OZOA 5E6YA 5BROA 3VNZA 2E0PA 3ARVA 1V3KA 2CHNA 1V6WA 2J77A 1GHSA 1UYQA 2VCCA 1NOWA 1H49A 4P7RA 4X0VA 1QVBA 4PMZA 2V3EA 1GVYA 2XVGA 4DWSC 5EMYA 4NZCA 1W3JA 4Z2KA 3THCA 1SYTA 4MTVA 3WNKA 1BQCA 1M04A 2WHLA 1D2KA 2ZX8A 1OINA 4S3JA 5M5DA 4A4AA 1HL8A 4J28A 3BXWA 3OLEA 1GOWA 3AMDA 4JIEA 3AYRA 3UESA 4D6GA 1JNEA 2VT0A 1HXJA 2VOTA 3ZJ8A 1KB3A 3CMGA 4YHGA 4LYQA 1GOKA 4MNJA 3WD1A 3E1F1 4UZSA 1E1FA 1W9UA 3AROA 4JFUA 1HJSA 2WKLA 1KGWA 1WAWA 3JUGA 4F8XA 3AFBA 2WVSA 1X1NA 1J0YA 3IJ7A 3MUAA 4P8XA 5C71A 2VRKA 1MFUA 1ISXA 4UFIA 3GM8A 3WQVA 3LPGA 1K9DA 4AC1X 4NF7A 1DWAM 4OZOA 4XX6A 1QNPA 1XSKA 3VMNA 3W0KA 4OOUA 4MJ4A 5IFPA 4CD4A 1J9YA 2WCAA 2ZUMA 1CXIA 4N42A 3W38A 1LWHA 4JCLA 2G41A 2XFRA 4BS0A 3WIJA 4R27A 3T2PA 2G3JA 4UFKA 1HT6A 3KL3A 2VQUA 4U3CA 3AHTA 3SCPA 4HA3A 3ZO9A 4Z2LA 3MS8A 4UFHA 3MUZ1 2VNCA 2PBGA 3DHPA 1V3IA 5I2UA 3MV11 3T09A 4JFVA 2MANA 3T0BA 5BWFA 4JHOA 8CGTA 3WUFA 2YDQA 3OA5A 3ZSSA 4CCCA 3NYDA 1G1YA 3ZSTA 2GJXA 3ARZA 3UCQA 3II1A 4YPJA 4N0RA 5D8WA 5BXRA 3MANA 2VCBA 3F5JA 1TCMA 2FHFA 5A6BA 4Z2HA 2JIWA 1E9LA 1CGXA 4C7FA 4BQ5A 5A8PA 1ZS2A 5E6ZA 4DUVA 2BY3A 1WB0A 3BCDA 2WAGA 1UD5A 1L8NA 3L4VA 5DEZA 1PX8A 3PTQA 4W5UA 2XM1A 3OGRA 4AZ5A 5A8OA 4LGXA 3MUIA 4W8BA 4HPGA 3M46A 3WSUA 5A2CA 3FHQA 3GZAA 3N1AA 3F5LA 4P7QA 1QOXA 5LA1A 4AZBA 1E4LA 1Q6FA 3SURA 1C91A 2CESA 1HX0A 3ZR5A 4XZWA 3WH5A 4F9DA 1NOFA 3VGFA 3W37A 1QPKA 2CNCA 3IK2A 5I79A 4J3SA 2E4TA 4ACYA 4UQEA 1SMAA 3AIWA 4GQRA 4UQBA 1E1EA 4PCTA 2ZUVA 4WK9A 1R85A 1OM0A 4BQ4A 3WUBA 1R86A 2XVNA 2AMGA 1UH2A 2DGAA 4IPNB 1TUXA 1ZBKA 3PZUA 3SCSA 3WNOA 1Y7VA 2DPEA 2FDMA 1VFOA 3NCOA 4AZGA 2EPNA 1UWTA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1V0K A;  1EIB A;  4E2O A;  1KGX A;  4EAN A;  2AOS A;  5A6A A;  3WBA A;  2GSJ A;  1ZJB A;  4H8V A;  4JFS A;  1JGI A;  4B3K A;  4AD2 A;  2NSX A;  2J74 A;  2DT1 A;  1ZL1 A;  4W7U A;  1CEN A;  2WSP A;  1OT1 A;  4PUD A;  3ZT5 A;  3VGH A;  1MQQ A;  2GJR A;  2XYL A;  3WMB A;  4UFJ A;  4GZE A;  1TR1 A;  4HP5 A;  4GO9 A;  2CIT A;  2YKK A;  4AZ6 A;  3SCO A;  3CZK A;  3WFZ A;  1CXE A;  4PMY A;  1JYN A;  1W1P A;  3ZR6 A;  5BRP A;  2YLA A;  5ABH A;  1NWU A;  4AEE A;  2WC3 A;  1ZU8 A;  1B31 A;  1QNO A;  3AS3 A;  4U5I A;  2DEP A;  3IAQ A;  4PTV A;  3PZN A;  5FKY A;  2J62 A;  3THD A;  4HTY A;  3N11 A;  1B90 A;  2FH8 A;  4E4P A;  3AS2 A;  1WDQ A;  2ZE0 A;  4CCD A;  4J3U A;  1TVN A;  1MW3 A;  4AIS A;  2XPK A;  2X2Y A;  3N18 A;  3A4X A;  4MB5 A;  4RE4 A;  4AYS A;  3WH6 A;  3APG A;  3SUW A;  3W25 A;  1JZ6 A;  4FLQ A;  4JFT A;  3N17 A;  1ZBC A;  2DSZ A;  1VBU A;  2X0H A;  3TTQ A;  3AHZ A;  2PBO A;  1C92 A;  2D0F A;  2DH2 A;  5HPC A;  2WXD M;  2FGL A;  2JEQ A;  3SCW A;  1WZK A;  3W24 A;  1HVX A;  2EXO A;  1K9E A;  2ZUN A;  1ISY A;  4CKQ A;  1ISZ A;  2WWD A;  1QBB A;  4J7R A;  4XB3 A;  1XYZ A;  4GPN A;  3U5Y A;  5I6S A;  2DIE A;  1UR1 A;  4P8U A;  3DYM A;  1JZ3 A;  3OGS A;  4W93 A;  3VIF A;  1BVZ A;  4JKM A;  4UOQ A;  3A4A A;  4W89 A;  2VC9 A;  5E09 A;  3VIK A;  2Q8X A;  1W1V A;  5LYR A;  5HBF A;  5IDI A;  1AQH A;  4TOQ A;  1AMY A;  3WH9 A;  3PZV A;  1J01 A;  2EQD A;  1QHP A;  4U2Z A;  4W87 A;  2W63 A;  4QFU A;  4FLR A;  2E3Z A;  1OIF A;  2ZWY A;  1E70 M;  3OLI A;  2YL5 A;  1H5V A;  4UCF A;  3ARR A;  1AQ0 A;  3AIE A;  4K68 A;  1PZ3 A;  4LPC A;  1H09 A;  4MJ2 A;  5E70 A;  5M3W A;  1EH9 A;  3A3H A;  2WAN A;  1ITX A;  1JF6 A;  1JZ2 A;  3SUV A;  1LL6 A;  3G6M A;  2CET A;  2JEP A;  2DH3 A;  7A3H A;  5E0C A;  5I78 A;  1UKO A;  1JIB A;  2PC8 A;  2C7F A;  4Y7E A;  5E9A A;  1EO5 A;  1UR0 A;  3PZI A;  3ARQ A;  3NIY A;  3GTN A;  3NDZ A;  1EGZ A;  1PBG A;  3AS1 A;  2IXU A;  2VR4 A;  2YA1 A;  1HJV A;  5BXP A;  5AYI A;  2VCA A;  2ZIC A;  1XRV A;  1BTC A;  3PTM A;  4P7O A;  2V5D A;  4M81 A;  1DED A;  2WMG A;  3VD4 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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