3SUUA

Crystal structure of beta-hexosaminidase from paenibacillus sp. ts12 in complex with gal-pugnac
Total Genus 193
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
193
sequence length
519
structure length
504
Chain Sequence
HHHHSSGLVPRGSHMSQPSILPKPVSYTVGSGQFVLTKNASIFVAGNNVGETDELFNIGQALAKKLNASTGYTISVVKSNQPTAGSIYLTTVGGNAALGNEGYDLITTSNQVTLTANKPEGVFRGNQTLLQLLPAGIEKNTVVSGVQWVIPHSNISDKPEYEYRGLMLDVARHFFTVDEVKRQIDLASQYKINKFHMHLSDDQGWRIEIKSWPDLIEIGSKGQVGGGPGGYYTQEQFKDIVSYAAERYIEVIPEIDMPGHTNAALASYGELNPDGKRKAMRTDTAVGYSTLMPRAEITYQFVEDVISELAAISPSPYIHLGGDESNATSAADYDYFFGRVTAIANSYGKKVVGWDPSDTSSGATSDSVLQNWTCSASTGTAAKAKGMKVIVSPANAYLDMKYYSDSPIGLQWRGFVNTNRAYNWDPTDCIKGANIYGVESTLWTETFVTQDHLDYMLYPKLLSNAEVGWTARGDRNWDDFKERLIEHTPRLQNKGIKFFADPIV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
molecule keywords Beta-hexosaminidase
publication title Gaining insight into the inhibition of glycoside hydrolase family 20 exo-beta-N-acetylhexosaminidases using a structural approach
pubmed doi rcsb
source organism Paenibacillus
total genus 193
structure length 504
sequence length 519
ec nomenclature ec 3.2.1.52: Beta-N-acetylhexosaminidase.
pdb deposition date 2011-07-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00728 Glyco_hydro_20 Glycosyl hydrolase family 20, catalytic domain
A PF02838 Glyco_hydro_20b Glycosyl hydrolase family 20, domain 2
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3suuA01
3.30.379.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Chitobiase; domain 2 Chitobiase/beta-hexosaminidase domain 2-like 3suuA02
3AJ7A 4QDMA 2ZOXA 3VM7A 1H0IA 1DWJM 2AOSA 1CNVA 2VTFA 3WQVA 5A6BA 4P8WA 4KWUA 5I24A 3BLKA 1Y7VA 4X0NA 4BQ3A 6A3HA 1O6IA 2JIEA 2VNCA 2XJ7A 3A4AA 3ZJ6A 1G1YA 3RPMA 1C93A 5FOOA 3RMEA 2O9TA 3W37A 2WLZA 3MMWA 1GZJA 4IISA 4NF7A 2WZEA 3OZPA 4HTYA 2XHYA 3GM8A 1LL4A 1WDSA 1UWIA 2VZUA 3ZJKA 3N11A 1OM0A 2OYKA 3ZT7A 4UQAA 4B3KA 2OSWA 5A3HA 1K9DA 2CYGA 1KGXA 2YL6A 3PZNA 3CH9A 2CBVA 2EQDA 1E6QM 1GJUA 1V0NA 1EHNA 2A3HA 3SUSA 3SUVA 4AD0A 1R86A 2XM2A 2DQXA 4M82A 7TAAA 1CDGA 4D6JA 2WHJA 2CXGA 2ZUWA 2X2YA 4UCFA 3WBEA 1J0YA 2J47A 2W63A 1OGBA 3AMKA 1VEMA 2E0PA 1B31A 3CUHA 4HOZA 4YPJA 2CHNA 4B9ZA 5M17A 2WCSA 3K8KA 3VX1A 3VMPA 1LJYA 2WWDA 3VIPA 3UG3A 1CXFA 1S46A 3WD0A 4EKJA 2VC9A 1O7AA 3N12A 3VNZA 1ZL1A 1RP8A 2V5DA 4A4AA 1C90A 1E6RA 3IJ8A 5DT5A 3ARSA 4CCCA 3L4TA 5CJ5A 1MFVA 1JL8A 1J10A 2E9BA 1UD2A 2A3BA 2C0HA 2ZWYA 2VJXA 2WMGA 2YL8A 3VGFA 1JDDA 3ZJ8A 1TA3B 3AS1A 3MSGA 1VENA 1UKPA 4W7UA 4AZCB 1UZ1A 1TVNA 2WKGA 2EBNA 3NSXA 3ZSSA 2W92A 3CPUA 2V3EA 4KGLA 3PZQA 1J0KA 2NSXA 1E73M 1JZ3A 1HL8A 2XVLA 4NZCA 3ARUA 3N1AA 4TX6A 1J18A 4DM1A 4WK9A 4CD7A 3SCVA 4PMOA 3VM5A 4Z2LA 2Y8VA 2DSUA 3W25A 3FXYA 2DIEA 2G8ZA 1W1PA 1OD0A 4P7RA 2XSAA 2BY0A 1W3LA 2D2OA 1QHZA 3OA5A 2IUZA 1TG7A 2CETA 3QOKA 3T2OA 1GOWA 1R8LA 1H11A 4XZBA 2XIIA 4MTVA 2VCCA 4PMXA 1OCQA 2WXDM 2X05A 5CGMA 2X0HA 1AQHA 5CPQA 4OUEA 5CSUA 3S6TA 2G3IA 1IZJA 4DWSD 1VB9A 2VZVA 2Q8XA 2YBUA 5D4YA 2JF7A 2J75A 3SUWA 4DWSA 4DUXA 4UFIA 2VZTA 3ARXA 1E43A 3OLEA 4UOZA 3SUUA 3CLWA 5EMYA 1DWAM 2WCAA 3IAPA 3WNMA 3MUY1 5HPOA 2OWXA 4ACYA 4RE4A 5I77A 4MNKA 2NW0A 3U7BA 1LG1A 4EAMA 1XCWA 1SYTA 1MW0A 3OG2A 3WMCA 3ZR6A 2QHAA 5A2BA 3AYSA 2Z1SA 1BYDA 1L8NA 2F61A 5EFFA 3SURA 4D1IA 1JIBA 3VIKA 2WMKA 2EPOA 2BXYA 3VOCA 4PEEA 1G9HA 3SCTA 4E8CA 3EYPA 4C7GA 3GNPA 2ZUTA 1MWOA 3CZGA 2XPKA 4NRSA 2G41A 2PWFA 1UWRA 3EDKA 3VGHA 3VTRA 1VF8A 1MQPA 3DYOA 1A47A 1DTUA 1BFNA 1E5NA 3AXIA 3CZKA 2YLAA 4W8BA 1UKSA 2YJQA 1V3LA 1ZB5A 1MQRA 4IUGA 2ZUUA 4HMDA 3K1DA 4MNLA 2YA1A 1OT1A 1KXVA 4Z2IA 3THCA 3T0BA 3OB8A 4M1RA 1K9FA 3A47A 1US3A 2EEXA 1E1EA 1WCGA 2E9LA 4P8UA 1E6XM 3UESA 2GUYA 4YHEA 3SCNA 4L4OA 3WNPA 1BSIA 2FH6A 1EA9C 3DECA 5FIPA 3VO0A 4AYSA 1GVIA 3E1F1 4CVUA 1CXHA 5KEZA 7A3HA 4LYPA 8A3HA 2DT3A 2EPLX 1EIBA 3CUGA 1UOKA 3GTNA 1UR4A 1HIZA 3EDFA 1V0KA 1R7AA 1GQLA 3J7HA 1QNRA 1NM9A 4QCFA 2O9OA 3MMDA 3AHTA 1DHKA 1CXEA 2BXZA 3LPOA 4EANA 2J7FA 1BAGA 1UWTA 1JD7A 4P8VA 3WNKA 1LF1A 4E8DA 2VQUA 1Q6DA 4KMQA 3AS2A 1LL6A 2CPUA 3VINA 4AEEA 2BY3A 3MV11 1UA7A 1B3YA 4MB4A 1M7XA 4DM2A 4Z2HA 2ZX5A 3N13A 4OBSA 2C8NA 3K8LA 3BC9A 4FLSA 1UH2A 1J11A 3BAYA 1CTNA 3OGVA 1H2JA 5D9PA 1CXIA 1VIWA 1X6NA 4UTFA 3I3EA 4UQBA 1GQKA 3EDDA 3W29A 4FLQA 3N18A 3W26A 2QLYA 3GH5A 3AMCA 5ABFA 3OBAA 1XYZA 4DWSC 5A6JA 1W3HA 5BXSA 5BXPA 3K4AA 4ZXOA 3EMCA 1W2PA 3VGGA 2DDXA 2F8QA 4HMEA 1CGUA 3CHCA 4CD6A 1JGIA 3T0DA 2J7EA 4AZ7A 4JCMA 5BYWA 3W24A 4J28A 3ARPA 1R7OA 1UD4A 4H41A 3RDKA 2J77A 2OYLA 1J0HA 4GPNA 1E1FA 2VX5A 3AHYA 2GJRA 2XGBA 1UD3A 3FAWA 1H09A 3VGEA 3CIVA 3W6MA 5ABHA 2PC8A 4GI6A 2WM0A 3WQ5A 4AXNA 2WVSA 1BYCA 4J27A 1C7TA 3VIFA 5BWFA 2UY5A 1EHAA 1KXTA 1E55A 2WVVA 4UFLA 4LXFA 2XVKA 4K68A 2XFYA 4J3TA 4S3JA 3WL1A 4HU8A 1L0PA 3T08A 5DEZA 4UFMA 1JYXA 2ZX9A 2XWEA 4PBGA 2J62A 1W1VA 3O2LA 4UQCA 1SFSA 1V0LA 3L4ZA 4ZE5A 1W9PA 3N9KA 2XWDA 3WEMA 4M29A 4OIFA 4BF7A 2W4XA 2QV4A 1W9VA 1IT0A 3WDRA 1KB3A 3ECQA 3U57A 3KL0A 2WMFA 1E4LA 4FLOA 1MW1A 1PZ2A 2WCGA 1GUVA 1H5VA 3ARWA 2BVTA 1EDGA 3WUFA 5AY7A 1GHSA 3ARTA 4WJXA 1JD9A 1V3JA 2J7HA 1I1XA 1VBUA 5F7UA 1WZMA 1CGYA 1FFQA 1BYBA 3WMBA 1U30A 4ATWA 2GVYA 2J25A 3ZT6A 2ZUSA 3WH6A 3F5KA 1Z32X 1OT2A 1E4NA 3CUJA 2WAGA 4U2ZA 1UQYA 2WKLA 4ML4A 5A2AA 3WD1A 4W7WA 4HA1A 3VVGA 4LX4A 4WLCA 4W89A 1QI0A 4MJ4A 2CBJA 3KL3A 1Q4NX 5DF0A 3VMOA 3OGSA 1UA3A 1KWKA 1CGTA 3WF2A 2J7DA 1X6LA 4RE3A 1E40A 5HXMA 1H49A 6CGTA 3VGBA 4CVWA 4MPKA 2JEQA 2YKKA 3WF0A 3W28A 1VEPA 2VURA 4RL3A 1B3VA 3VDAA 3ZMRA 1XGZA 4AZBA 4M56A 2QF8A 1XSJA 4GO9A 1YHTA 1K9EA 2CNCA 2BHYA 4D72A 4AISA 1NWUA 4PUDA 2W66A 5GQBA 4UNIA 1UD6A 4E4PA 3ARRA 2NT0A 5I23A 1ZBKA 5I78A 1UD5A 4PMNA 1BYAA 3L4UA 3IAQA 4PMQA 1WZAA 4B16A 4M8UA 3BSHA 1E15A 1KR0A 1ZBWA 5A94A 3VIMA 1GVYA 4JFTA 3SCPA 4TVDA 2ZXAA 1WDPA 3MANA 4CCEA 1JG9A 3UERA 1UUQA 3TOPA 2CKRA 3DHPA 1WNOA 1PAMA 3NDYA 3OGRA 1UH3A 4HZ6A 2D3LA 3PZ9A 1NWSA 1VFFA 5CSYA 2X1IA 2UY3A 2YDSA 2XVGA 2AMGA 3ZM8A 4ATLA 5A6BD 3ZSTA 5GNYA 3QGVA 4DUWA 4CU8A 3K46A 2XGIA 3CO4A 1EDQA 4JFUA 3VD3A 1WDQA 1FHLA 1IV8A 1JAEA 2G4FA 2OWCA 4F79A 5JIWA 4B15A 3GZAA 1E5JA 1K6AA 4W84A 3ARQA 3S2CA 1JNDA 3IK2A 1HKKA 4R27A 4UZUA 4U5KA 1JI1A 2W61A 3M07A 1H0GA 1V6XA 1FA2A 2ZXQA 3GNOA 2PB1A 4XB3A 2VMFA 3GH7A 2V3FA 5BCAA 1WB0A 4A3HA 4J3XA 2BNJA 3AIBA 3EBVA 1KCLA 1X1NA 2YDRA 1EOKA 2BHUA 2ESCA 3T2PA 4FK9A 1BF2A 3L4XA 3WL0A 1MXGA 1FHDA 4P8XA 3O6AA 3VD5A 1BVZA 4AZCA 3M7SA 3LMYA 2Z1KA 4GZIA 5JBFA 1WPCA 3FAXA 1HJWA 2PF0A 1C92A 4BS0A 1VFOA 3N15A 1W1TA 2ZUMA 2YBTA 4HP5A 5I3DA 3A4WA 5A6AA 4H8VA 4IM4A 1XSIA 2O9PA 1BGGA 4GZEA 1FP9A 2D0GA 4PMRA 3WD2A 1QOXA 8CGTA 2PWDA 3MMUA 4M81A 4J3SA 4HOXA 3KE0A 1QNOA 4NI3A 1BLIA 5CLTA 4W87A 4N42A 3WD3A 4S3KA 5JIPA 2XVNA 5LA0A 1E6PA 2J8FA 4MB3A 3EMZA 4TTGA 3GYCA 5FD0A 1GQJA 3WNNA 2XVPA 3VIOA 1KWGA 5AYIA 1UR0A 1G01A 2J78A 4LYRA 4LYQA 2O9RA 3NDZA 1MW3A 2DT0A 1M03A 4J7RA 1QVBA 4CD4A 3SCWA 4PMYA 1UR1A 3L2LA 4Z2GA 3CMJA 2WBKA 3VIJA 4ZFMA 1ODUA 1GONA 1ITCA 2XTKA 1OIFA 2V3DA 5FL1A 4AZ5A 4PTMA 3K8MA 3MUIA 3FHQA 4CN4A 2PBGA 1UKOA 2CBUA 5EB8A 1JZ6A 4BQ2A 2DIJA 3QR3A 5E6ZA 5FL0A 4U3CA 4D1JA 1OGGA 2EJ1A 2WK2A 4JAWA 4QP0A 3WNOA 1FH8A 4AW7A 1CGXA 1VJSA 3AMGA 1PX8A 4M24A 2DGAA 2VRJA 1FP8A 2EPMX 2D20A 2WZHA 4LPCA 4CUCA 4OOZA 2W91A 1JZ5A 3EMQA 2ZX8A 1QBBA 1K9TA 2GK1B 2FDMA 3CHDA 3TONA 1V0MA 3T2QA 1TR1A 5FKYA 1HKJA 4FMVA 1HXJA 3UEQA 2BVDA 3THDA 4TVUA 4D6EA 2E40A 4Z2JA 5LA2A 3WH5A 1J12A 4H04A 2BY1A 2ZE0A 4BQ4A 3ZQ9A 3WSUA 3VUPA 3M46A 1LWJA 2GJXA 3WF3A 1JXKA 2CERA 2ZXDA 3ALGA 5BRQA 2CKSA 2V5CA 2XUCA 1BTCA 4D6FA 5E9AA 3AXXA 4AEFA 1U2YA 1XH1A 3UETA 1B30A 3WQ8A 1W91A 1E6NA 4W85A 1BPLB 1XH0A 1OINA 4Y7EA 4PTWA 1ZBCA 3GBEA 2VX6A 3I3DA 4GQQA 2VZOA 4WSKA 2VX7A 3ZO9A 1FOBA 1C8YA 2WC4A 1WP6A 2HISA 2YA0A 4A3YA 1G5AA 1R87A 4D71A 2ZWZA 2UY4A 3WUGA 2GJPA 2EPKX 2GDVA 2EO7A 2XYLA 3AIUA 2XSBA 1LG2A 2VI0A 1HJQA 1V6WA 1FH9A 1HX0A 3QHMA 5D9OA 3MSDA 5A6MA 3FNDA 1PZ3A 1V6UA 1M01A 3TTSA 1UYQA 1CECA 1JAKA 4ATDA 1VBRA 1HVXA 2VRQA 5IXEA 1CPUA 5A6KA 1UWQA 1QI5A 5ABGA 5M5DA 1KXHA 1QI2A 4MDOA 4PCSA 1GCYA 3WDJA 5JBDA 2OYMA 2YLLA 5HDRA 1XD1A 4PMUA 4WSJA 2DEPA 2VL4A 3WDHA 3ZT5A 3F5LA 4C7FA 3AISA 2WMIA 4FF5A 4WKFA 5I6SA 3WF1A 4JL1A 3W27A 3SUTA 2JEPA 3VNYA 1HP5A 4JFWA 2VVSA 4D6CA 3PN8A 1HVQA 3BCDA 3AROA 1AVAA 3AZSA 1JF5A 5M03A 2YL9A 1JZ2A 4QAWA 1E0XA 1F4HA 4JHZA 1ISXA 5LA1A 1WAWA 4WIWA 4PN2A 4UQEA 3QOMA 5E09A 1A3HA 1WZKA 2QMKA 2W67A 3WIJA 3G6LA 2WPGA 4PTVA 9CGTA 1MFUA 2XG9A 3BAIA 4MNMA 5DFAA 4ACZB 2CESA 1CWYA 3GXDA 3PHAA 2J74A 1ZS2A 1VJZA 3LPGA 1TVPA 3GXMA 5AC4A 2D23A 2J79A 3PTQA 5C71A 3L4YA 1N82A 2DT2A 3HU7A 5JUVA 4N0RA 3CMGA 4AWEA 4JKMA 3GBDA 1FFRA 3U7VA 1V08A 1AQ0A 3BAWA 1DWHM 3DYPA 3CBWA 4MDPA 1HT6A 2J8GA 4M80A 4U31A 5A6LA 1I1WA 3HN3A 5D9NA 5A8QA 4E2OA 3WQWA 4TX8A 2DH2A 3G6MA 1CBGA 3VMNA 3TP4A 2JF6A 4GO8A 4CGTA 2G3MA 5CZKA 3WELA 1EQCA 2JE8A 1QW8A 3RM4A 3UR8A 4OBRA 1JI2A 1W32A 3WH7A 3W0KA 3II1A 4PMVA 1CLXA 3FY1A 4Q7NA 3QHOA 3MV01 3ZJ7A 2Y4SA 2DSWA 4JKLA 4MJ2A 2WZIA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3AJ7 A;  4QDM A;  2ZOX A;  3VM7 A;  1H0I A;  1DWJ M;  2AOS A;  1CNV A;  2VTF A;  3WQV A;  5A6B A;  4P8W A;  4KWU A;  5I24 A;  3BLK A;  1Y7V A;  4X0N A;  4BQ3 A;  6A3H A;  1O6I A;  2JIE A;  2VNC A;  2XJ7 A;  3A4A A;  3ZJ6 A;  1G1Y A;  3RPM A;  1C93 A;  5FOO A;  3RME A;  2O9T A;  3W37 A;  2WLZ A;  3MMW A;  1GZJ A;  4IIS A;  4NF7 A;  2WZE A;  3OZP A;  4HTY A;  2XHY A;  3GM8 A;  1LL4 A;  1WDS A;  1UWI A;  2VZU A;  3ZJK A;  3N11 A;  1OM0 A;  2OYK A;  3ZT7 A;  4UQA A;  4B3K A;  2OSW A;  5A3H A;  1K9D A;  2CYG A;  1KGX A;  2YL6 A;  3PZN A;  3CH9 A;  2CBV A;  2EQD A;  1E6Q M;  1GJU A;  1V0N A;  1EHN A;  2A3H A;  3SUS A;  3SUV A;  4AD0 A;  1R86 A;  2XM2 A;  2DQX A;  4M82 A;  7TAA A;  1CDG A;  4D6J A;  2WHJ A;  2CXG A;  2ZUW A;  2X2Y A;  4UCF A;  3WBE A;  1J0Y A;  2J47 A;  2W63 A;  1OGB A;  3AMK A;  1VEM A;  2E0P A;  1B31 A;  3CUH A;  4HOZ A;  4YPJ A;  2CHN A;  4B9Z A;  5M17 A;  2WCS A;  3K8K A;  3VX1 A;  3VMP A;  1LJY A;  2WWD A;  3VIP A;  3UG3 A;  1CXF A;  1S46 A;  3WD0 A;  4EKJ A;  2VC9 A;  1O7A A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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