3SUVA

Crystal structure of beta-hexosaminidase from paenibacillus sp. ts12 in complex with nhac-dnj
Total Genus 192
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
192
sequence length
519
structure length
504
Chain Sequence
HHHHSSGLVPRGSHMSQPSILPKPVSYTVGSGQFVLTKNASIFVAGNNVGETDELFNIGQALAKKLNASTGYTISVVKSNQPTAGSIYLTTVGGNAALGNEGYDLITTSNQVTLTANKPEGVFRGNQTLLQLLPAGIEKNTVVSGVQWVIPHSNISDKPEYEYRGLMLDVARHFFTVDEVKRQIDLASQYKINKFHMHLSDDQGWRIEIKSWPDLIEIGSKGQVGGGPGGYYTQEQFKDIVSYAAERYIEVIPEIDMPGHTNAALASYGELNPDGKRKAMRTDTAVGYSTLMPRAEITYQFVEDVISELAAISPSPYIHLGGDESNATSAADYDYFFGRVTAIANSYGKKVVGWDPSDTSSGATSDSVLQNWTCSASTGTAAKAKGMKVIVSPANAYLDMKYYSDSPIGLQWRGFVNTNRAYNWDPTDCIKGANIYGVESTLWTETFVTQDHLDYMLYPKLLSNAEVGWTARGDRNWDDFKERLIEHTPRLQNKGIKFFADPIV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Beta-hexosaminidase
publication title Gaining insight into the inhibition of glycoside hydrolase family 20 exo-beta-N-acetylhexosaminidases using a structural approach
pubmed doi rcsb
source organism Paenibacillus
total genus 192
structure length 504
sequence length 519
ec nomenclature ec 3.2.1.52: Beta-N-acetylhexosaminidase.
pdb deposition date 2011-07-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00728 Glyco_hydro_20 Glycosyl hydrolase family 20, catalytic domain
A PF02838 Glyco_hydro_20b Glycosyl hydrolase family 20, domain 2
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3suvA01
3.30.379.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Chitobiase; domain 2 Chitobiase/beta-hexosaminidase domain 2-like 3suvA02
1KQZA 4N0RA 2E4TA 1QI3A 2ZOXA 1VJSA 2UY2A 3U5UA 1L8NA 1KCLA 2BVDA 4M80A 2WMGA 2GDUA 3UESA 3BAXA 2CKSA 3AMKA 1JNDA 2GDVA 2E9MA 1B3ZA 3PZIA 5BRQA 3AXIA 4UOJA 5LYRA 2GFTA 1RH9A 2CNCA 1LWHA 1MQQA 4GI6A 3WFZA 1QI2A 2DGAA 3DYOA 5CSYA 2QHAA 2XPKA 2W92A 1JZ7A 4ZENA 3WQVA 4OOZA 1H49A 2CXGA 1JZ3A 2BS9A 3GH4A 2OWXA 1UWTA 4LGXA 1V6UA 4AZBA 5CLWA 1HP5A 4B16A 4UFJA 3AYSA 5A6JA 3WD4A 2YL6A 1QNOA 1J10A 1LL6A 3BCFA 1GQIA 1KXQA 2EXOA 2J7CA 3BAYA 3K8KA 4JIEA 4U5IA 3WQ8A 5DF0A 3UR8A 2AMGA 4X0VA 1FFRA 3BMWA 3WY1A 4AZ6A 1MWOA 1V0KA 4QCFA 1A3HA 2VNCA 2XHYA 3CHCA 1CLVA 3WF0A 2VRJA 4AZIA 1M03A 3WSUA 3A4WA 3NJ3A 1M04A 2GVYA 1XH1A 1UH3A 2CYGA 1XGZA 4CKQA 3ARUA 2DT1A 1NH6A 5F7UA 2W5FA 5CPQA 1US3A 4NRSA 3SUTA 7A3HA 3CUHA 2YA1A 3WH5A 2VX6A 2O9TA 2WANA 1V3HA 4MDOA 5E9AA 2VMFA 2J8FA 4TX8A 4QFUA 4Z2LA 1CXFA 1E6XM 2CEQA 1LWJA 5A6BD 3WQWA 2OSXA 4S3KA 4U2ZA 2WMKA 1FH7A 2WM0A 3U7VA 2J8GA 3B9AA 2VR5A 2WHLA 2J74A 5BYWA 1E72M 2ZUTA 1CBGA 1H09A 4AD1A 1W1VA 1CGTA 1FH9A 4GXPA 3N18A 4UFMA 2VC9A 3AQUA 3VIFA 4JKMA 1QNRA 3OLIA 4D6EA 4CD5A 3BAKA 2EBNA 4B3LA 3T2QA 4PRWA 4RL3A 3VD9A 4D6GA 2XIBA 3ARQA 1VJZA 1E6ZA 2W66A 1WO2A 1E1FA 2JF6A 3WD0A 1TFVA 2XGIA 4Z2GA 3W28A 1KWGA 1OD8A 4M24A 1JL8A 2BVTA 2E40A 5A8QA 4U3AA 4MJ2A 1E3ZA 1WZAA 1MFVA 2WLYA 2YL5A 3BLPX 4UTFA 4PUDA 2JE8A 3FY1A 2VTFA 3AIQA 1WDSA 1GJWA 5M17A 1ECEA 3CMJA 2WCSA 2ZXAA 1WB0A 3B8SA 2ZE0A 4M81A 3GYCA 3WEMA 5BXPA 1P6WA 3G6MA 3I3DA 4E8DA 3VDCA 4JKLA 2WVVB 4NSBA 4D6IA 2WC7A 1IZKA 3IAQA 1V0LA 3QHMA 3KE0A 3FNDA 1JD7A 4LYRA 3UERA 1E6PA 3FHQA 3CTTA 5ABFA 1OB0A 5CSUA 4HOWA 3PBGA 2PBGA 3D5HA 1NWRA 2F61A 2ZWZA 3B9EA 1VFUA 2YL8A 3N04A 4TUFA 2WVUA 1U33A 2O9OA 1JXKA 1UR8A 2BVYA 3W82A 1GCYA 5ABHA 2EPKX 1AQHA 3CZLA 5I6SA 3MSDA 4PTWA 3EMQA 4UQCA 4LPCA 2V3FA 3GXMA 3AS1A 2G8ZA 4CCEA 1UOKA 1EDTA 1R7AA 2OSYA 1LG1A 5IFTA 1R87A 3VD7A 2PC8A 4U33A 5I0DA 2YA0A 2V5CA 4W84A 1MQRA 3ZO9A 5I23A 2VZUA 3AMCA 5A3HA 4EE9A 4MB1A 2WAGA 1JZ8A 1WDQA 1JIBA 3ZOAA 4UQAA 5BROA 3L4ZA 1W9PA 2VZSA 1O7AA 4M56A 3SCNA 3OBAA 2W62A 1W1YA 1HJUA 4AEEA 4C7DA 4GQQA 2IXVA 3WQ4A 1B30A 2AAAA 3D3AA 4BQ4A 3MV01 1J0HA 1WZMA 1UQYA 2VJXA 2GK1B 4EKJA 1UD3A 1VAHA 5A8PA 1GOWA 5EMYA 3VX1A 5E6ZA 4U2YA 1NWTA 3LMYA 1E43A 2W61A 1V3MA 1OINA 3SCQA 4PUEA 2EPLX 5GQBA 3LPFA 4GO8A 1A47A 1V3KA 3NYDA 4XZBA 1JFHA 3CLWA 1QOXA 3DHPA 3OG2A 4UFHA 3VX0A 5I77A 2YIHA 4CN1A 4PTVA 1JF5A 5A2CA 1E6QM 3K46A 3OGVA 1JAKA 3AMDA 3WEZA 2BHYA 4HPGA 2V3DA 3W6LA 5A8MA 1E5NA 2XM1A 3ALFA 3BXWA 3LPGA 5LA2A 3EDJA 4P7OA 4PYSA 2A3HA 4W89A 3FAWA 1UWUA 5IXEA 2DT2A 3W25A 2E3ZA 1MFUA 2FGLA 2X1IA 1WP6A 2ZUUA 3NUKA 1CXIA 3DECA 1FA2A 3ALGA 1BYBA 5KEZA 4CN6A 5CPTA 3W29A 1PJ9A 5EFDA 4D72A 2D2OA 1G1YA 5M3WA 3WMCA 4MNLA 4AIOA 4KWUA 2G3NA 2WNWA 2G3MA 3VIPA 5D9PA 1C8QA 1JDDA 3GBEA 5FIPA 2G3IA 5BWFA 1ODUA 1H11A 3WH8A 2YLAA 4J3WA 3MUAA 4RE2A 1UYQA 1PX4A 4M29A 1E56A 1QNQA 4XV0A 3CZJA 3QGVA 4IM4A 1MW0A 2A3AA 3WNNA 4HZ8A 1ISVA 4AWEA 5CPSA 4DWSB 1ZS2A 1GJUA 1UZ1A 1XSJA 3PZQA 4UCFA 1WZLA 4TX6A 1RPKA 2G4FA 1LL4A 4P7NA 4OJYA 2C0HA 3CZEA 3VIMA 5FKYA 3AXHA 3WKZA 1WCGA 1VEPA 2GJXB 3EDEA 1JG9A 1BAGA 3AI0A 4UFKA 1TE1A 1PZ3A 2WC3A 2EO7A 3MSGA 3CHFA 2QPUA 1E4NA 1V03A 3BCDA 3BMVA 4E8CA 4UNIA 1J0YA 4CCCA 1V3JA 5EBAA 1D7FA 3N13A 3WBAA 5C8BB 2ZUVA 1W9DM 3K4AA 3AFBA 4GI8A 2QLYA 2QMKA 1LG2A 4HMCA 3APGA 4PMQA 5CXPA 1JF6A 1K9TA 1B9ZA 2W4XA 4AW7A 2UY4A 5A8NA 3OGSA 1HKIA 1D2KA 5IDIA 1CNVA 4IPLA 5I3DA 4A4AA 3WF1A 3O2LA 1BVZA 1CXEA 1CXLA 2WVVA 1UWIA 1GOMA 3VGFA 3AMLA 3WDIA 5JBFA 2D0GA 4ACYA 4HA3A 3SIMA 4Z2HA 3TP4A 3VDHA 2VURA 5A69A 2ZX7A 3A4AA 1KFWA 1HJQA 3GDBA 1US2A 1QW9A 3VO0A 1DWIM 1V02A 2FH6A 3T0BA 1HL8A 3ARXA 1JZ5A 1BFNA 1CECA 1W3KA 4YN5A 4ZE5A 3NDYA 1BYAA 2CBVA 1QNPA 2V3GA 4UOZA 1HIZA 4AIUA 1KXVA 2J7FA 1QI5A 3W37A 1OWQA 1SYTA 3NSXA 1BG4A 4QLJA 2BY0A 3EBVA 1Q4NX 4GZJA 1JDAA 1QBAA 1W1TA 3TTQA 3N11A 3MUY1 1NOWA 3A6OA 2OLHA 3VGDA 1QHPA 4PTXA 3WQ6A 4D6HA 1WDPA 3OZPA 3F4VA 3W27A 2XFFA 2GJPA 5BRPA 4AC1X 1BQCA 1M7XA 2PWHA 1MXGA 1XYZA 3TTOA 1RP8A 1PX8A 3M6DA 2OYKA 2GUYA 1OGBA 5E0CA 4V28A 3WNKA 1G0CA 2YBUA 3CUGA 2A3CA 4WSJA 3CZGA 2CIPA 4LQ1A 2XVLA 1LQ0A 4PSPA 3VGGA 1XRVA 2J78A 1CZ1A 4HU8A 4GZIA 2BFGA 1UR9A 1KGWA 2WMFA 2WVSA 3AZTA 4D1IA 2FHFA 2DH2A 3ARSA 1TCMA 3VMNA 2PWFA 5AC5A 1G5AA 1BLIA 4BF7A 2UY3A 1AVAA 2WZIA 4FLRA 3SCTA 3B9DA 2CCRA 1H0IA 1R8LA 4FLQA 1B0IA 1H4PA 5I78A 4OBRA 5KZ6A 3W0KA 3M46A 3K1DA 1R7OA 2CHNA 2Q8XA 2DIJA 2VT0A 2VZTA 3OIHA 2WC4A 4XZWA 3SCRA 1EXPA 1HP4A 2GSJA 1PIFA 2OWWA 5JBDA 3VM5A 1E4IA 4PCSA 3WIJA 3BAWA 2W67A 2VL4A 4HZ6A 4W85A 4AZHA 1RD6A 4H8UA 4MB4A 2WSPA 5AYIA 3EDKA 4HOXA 2WK2A 4CD4A 1H1NA 1HKJA 3KL3A 4D71A 1ISXA 1CWYA 1SMDA 2XG9A 2WYSA 4UOQA 2WHJA 3ARZA 3ARVA 2D20A 3ZIZA 1WAWA 2VUYA 1MQPA 1E3XA 1KB3A 1KR0A 5BXTA 3RIKA 2XVNA 2F8QA 1NOFA 1ZL1A 1GUVA 2WMJA 1CDGA 1UKQA 3ZJ6A 2A3EA 3VMPA 2YL9A 3WEOA 2X05A 1EDQA 1W32A 3WNMA 3WNOA 4ZEPA 4DWSA 2DSKA 1LLOA 4OBSA 4PMDA 3AHZA 3SUSA 1J18A 4D6JA 3S2CA 2XVPA 1EHNA 4HP5A 2B31A 4WSKA 4BA0A 4WF7A 2J4GA 2O9RA 1OD0A 5BXRA 4UZUA 3W26A 2GJXA 4UQ9A 3TTSA 3VDAA 2QPSA 1QPKA 3S6TA 4J28A 1V0MA 1ODZA 1X6NA 3VIJA 3THCA 3L4WA 4J3XA 1V02E 4W5UA 3AIBA 3K4DA 2D0HA 2DQXA 1EQPA 2CITA 1GPFA 1OBAA 2F2HA 3OZOA 3WUBA 5AC4A 4D6CA 3AROA 2E0PA 1GQLA 2J62A 3ZSTA 1D3CA 2XYLA 4IUGA 4AMCA 1V3LA 1E55A 1OIFA 1BPLB 2DSZA 3CHEA 4ACZA 3W38A 1XCXA 5CLTA 1XCWA 3GBDA 2X0HA 1TUXA 3N15A 4JHOA 5ABGA 1CEOA 3GNRA 4M1RA 1K9DA 4UQEA 2YOCA 3ZMRA 3WDRA 1UD5A 4CUCA 4WKAA 2AOSA 2BY1A 1XYFA 1C91A 2BHZA 1O6IA 3LPOA 3EMZA 1HF6A 2WCGA 1EO7A 2XFRA 1B3XA 2Z1KA 4IPNB 4GZEA 1E0VA 5I5RA 3ZT5A 4LXFA 5A6KA 3QR3A 4CD7A 4F79A 3VGHA 3PTQA 2OYLA 2NW0A 1CGUA 4H41A 1I1WA 3OGRA 1W1PA 3ZR6A 3HU7A 3IK2A 4B15A 1CGWA 4YHGA 4B9ZA 4DM1A 4P8UA 1QHZA 4JKKA 4J3VA 3MS8A 2J7EA 2X09A 3VIIA 2VO5A 1KBKA 2IXUA 4W86A 1J01A 4AD3A 3WNPA 4RE3A 2X8RA 4W7WA 2XWDA 1DWAM 1KBBA 2PWDA 4ATLA 3QOKA 3AHVA 1E6NA 3GNPA 3J7HA 4MNJA 4UFLA 4F66A 1IV8A 4BZYA 3N9KA 3UR7A 2DT0A 2WMIB 5JUVA 4LYQA 5HOSA 1E5JA 3WNLA 1DTUA 3WD1A 1W9XA 5E0FA 1CIUA 1WKYA 4C7FA 1W3JA 2GJRA 3ARYA 4UFIA 4Z2JA 5JIPA 2ESCA 2Y8KA 3T2OA 1E70M 1UD4A 3PZMA 4Q22A 2WLZA 2ZXQA 4XUYA 2O9PA 1J0KA 2JFEX 3VTRA 3QHOA 3SUUA 3U5YA 1HKMA 4BQ3A 1VIWA 5A2BA 1M01A 1JNEA 5D4YA 5I24A 4HOZA 4DWSD 3L4UA 2VZOA 3AHXA 3AIWA 3T08A 1R85A 3G6LA 2J7DA 1J11A 3WF2A 4DUWA 4MDPA 2XVKA 1XC6A 3AICA 1OT2A 1HN1A 1SMAA 4A3HA 1E6RA 2PF0A 1XSKA 4C90A 4QCEA 3THDA 1GW1A 1HJSA 3GNOA 1AQ0A 2JIEA 4URIA 4W5ZA 3DYMA 5FL1A 4R27A 3WDJA 3QHNA 4CU8A 1DHKA 5HPCA 1CTNA 3OLEA 1V6WA 5A95A 2VVSA 5A6SA 4P8WA 3EMCA 3VVGA 3ZSSA 4D6DA 1VFOA 1JGIA 4JFUA 4L4PA 2J7HA 4PMOA 2BNJA 4CN4A 4CCDA 2YA2A 4F9JA 1CGXA 3IJ7A 2OYMA 3CGTA 2VR4A 3RO8A 4CGTA 4X0NA 3VOCA 1UZ4A 4W8LA 4PMNA 1PX3A 1Q6CA 3CZKA 2X0YA 4NF7A 4QAWA 2O92A 1EHAA 2PWEA 1ZBCA 3LPPA 3K8LA 3N17A 1IT0A 2XWEA 1TVPA 1EH9A 8A3HA 2DSUA 2VCCA 4OUEA 5E09A 3ZM8A 2D3NA 1GNXA 1E73M 2VX7A 2FHBA 4TOQA 4WKFA 1TVNA 3UCQA 1Y7VA 3VIGA 1JZ4A 4FMVA 1L0PA 1YQ2A 2YBTA 1W2PA 2CPUA 1BSIA 1OT1A 3L4YA 1BGGA 2DSWA 3GXFA 2IUZA 1J9YA 1V3IA 1NWSA 1UA7A 2EPNA 1GOIA 1CXKA 3I3EA 4P8XA 4AZ5A 2XGBA 4ZXOA 4AZ7A 4DWSC 1AMYA 4QLLA 2VQTA 1G94A 1J0IA 3W81A 2WXDM 3NDZA 4W8AA 1E15A 4E2OA 1MYRA 4J27A 4AD4A 1E71M 5IHRA 1EQCA 4D1JA 4PN2A 1JXJA 5IFPA 3BH4A 2CHOA 7TAAA 2JEQA 3SCPA 3ZT7A 4PEEA 3SCVA 1OGSA 1FP9A 4MB3A 4BS0A 5HXMA 2ZICA 1ZJBA 4XX6A 5GNZA 1OCQA 3F5KA 1E4LA 1FH8A 2BXZA 3ECQA 5DT5A 3M07A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1KQZ A;  4N0R A;  2E4T A;  1QI3 A;  2ZOX A;  1VJS A;  2UY2 A;  3U5U A;  1L8N A;  1KCL A;  2BVD A;  4M80 A;  2WMG A;  2GDU A;  3UES A;  3BAX A;  2CKS A;  3AMK A;  1JND A;  2GDV A;  2E9M A;  1B3Z A;  3PZI A;  5BRQ A;  3AXI A;  4UOJ A;  5LYR A;  2GFT A;  1RH9 A;  2CNC A;  1LWH A;  1MQQ A;  4GI6 A;  3WFZ A;  1QI2 A;  2DGA A;  3DYO A;  5CSY A;  2QHA A;  2XPK A;  2W92 A;  1JZ7 A;  4ZEN A;  3WQV A;  4OOZ A;  1H49 A;  2CXG A;  1JZ3 A;  2BS9 A;  3GH4 A;  2OWX A;  1UWT A;  4LGX A;  1V6U A;  4AZB A;  5CLW A;  1HP5 A;  4B16 A;  4UFJ A;  3AYS A;  5A6J A;  3WD4 A;  2YL6 A;  1QNO A;  1J10 A;  1LL6 A;  3BCF A;  1GQI A;  1KXQ A;  2EXO A;  2J7C A;  3BAY A;  3K8K A;  4JIE A;  4U5I A;  3WQ8 A;  5DF0 A;  3UR8 A;  2AMG A;  4X0V A;  1FFR A;  3BMW A;  3WY1 A;  4AZ6 A;  1MWO A;  1V0K A;  4QCF A;  1A3H A;  2VNC A;  2XHY A;  3CHC A;  1CLV A;  3WF0 A;  2VRJ A;  4AZI A;  1M03 A;  3WSU A;  3A4W A;  3NJ3 A;  1M04 A;  2GVY A;  1XH1 A;  1UH3 A;  2CYG A;  1XGZ A;  4CKQ A;  3ARU A;  2DT1 A;  1NH6 A;  5F7U A;  2W5F A;  5CPQ A;  1US3 A;  4NRS A;  3SUT A;  7A3H A;  3CUH A;  2YA1 A;  3WH5 A;  2VX6 A;  2O9T A;  2WAN A;  1V3H A;  4MDO A;  5E9A A;  2VMF A;  2J8F A;  4TX8 A;  4QFU A;  4Z2L A;  1CXF A;  1E6X M;  2CEQ A;  1LWJ A;  5A6B D;  3WQW A;  2OSX A;  4S3K A;  4U2Z A;  2WMK A;  1FH7 A;  2WM0 A;  3U7V A;  2J8G A;  3B9A A;  2VR5 A;  2WHL A;  2J74 A;  5BYW A;  1E72 M;  2ZUT A;  1CBG A;  1H09 A;  4AD1 A;  1W1V A;  1CGT A;  1FH9 A;  4GXP A;  3N18 A;  4UFM A;  2VC9 A;  3AQU A;  3VIF A;  4JKM A;  1QNR A;  3OLI A;  4D6E A;  4CD5 A;  3BAK A;  2EBN A;  4B3L A;  3T2Q A;  4PRW A;  4RL3 A;  3VD9 A;  4D6G A;  2XIB A;  3ARQ A;  1VJZ A;  1E6Z A;  2W66 A;  1WO2 A;  1E1F A;  2JF6 A;  3WD0 A;  1TFV A;  2XGI A;  4Z2G A;  3W28 A;  1KWG A;  1OD8 A;  4M24 A;  1JL8 A;  2BVT A;  2E40 A;  5A8Q A;  4U3A A;  4MJ2 A;  1E3Z A;  1WZA A;  1MFV A;  2WLY A;  2YL5 A;  3BLP X;  4UTF A;  4PUD A;  2JE8 A;  3FY1 A;  2VTF A;  3AIQ A;  1WDS A;  1GJW A;  5M17 A;  1ECE A;  3CMJ A;  2WCS A;  2ZXA A;  1WB0 A;  3B8S A;  2ZE0 A;  4M81 A;  3GYC A;  3WEM A;  5BXP A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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