3SUWA

Crystal structure of beta-hexosaminidase from paenibacillus sp. ts12 in complex with nhac-cas
Total Genus 193
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
193
sequence length
519
structure length
504
Chain Sequence
HHHHSSGLVPRGSHMSQPSILPKPVSYTVGSGQFVLTKNASIFVAGNNVGETDELFNIGQALAKKLNASTGYTISVVKSNQPTAGSIYLTTVGGNAALGNEGYDLITTSNQVTLTANKPEGVFRGNQTLLQLLPAGIEKNTVVSGVQWVIPHSNISDKPEYEYRGLMLDVARHFFTVDEVKRQIDLASQYKINKFHMHLSDDQGWRIEIKSWPDLIEIGSKGQVGGGPGGYYTQEQFKDIVSYAAERYIEVIPEIDMPGHTNAALASYGELNPDGKRKAMRTDTAVGYSTLMPRAEITYQFVEDVISELAAISPSPYIHLGGDESNATSAADYDYFFGRVTAIANSYGKKVVGWDPSDTSSGATSDSVLQNWTCSASTGTAAKAKGMKVIVSPANAYLDMKYYSDSPIGLQWRGFVNTNRAYNWDPTDCIKGANIYGVESTLWTETFVTQDHLDYMLYPKLLSNAEVGWTARGDRNWDDFKERLIEHTPRLQNKGIKFFADPIV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Beta-hexosaminidase
publication title Gaining insight into the inhibition of glycoside hydrolase family 20 exo-beta-N-acetylhexosaminidases using a structural approach
pubmed doi rcsb
source organism Paenibacillus
total genus 193
structure length 504
sequence length 519
ec nomenclature ec 3.2.1.52: Beta-N-acetylhexosaminidase.
pdb deposition date 2011-07-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00728 Glyco_hydro_20 Glycosyl hydrolase family 20, catalytic domain
A PF02838 Glyco_hydro_20b Glycosyl hydrolase family 20, domain 2
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3suwA01
3.30.379.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Chitobiase; domain 2 Chitobiase/beta-hexosaminidase domain 2-like 3suwA02
4W84A 1GOMA 1UZ4A 2WLZA 2ZUUA 1CEOA 3BGAA 5CGTA 5CPSA 2C7FA 1KGUA 3IAQA 3PZ9A 1HN1A 2WWDA 4LYPA 5E6YA 1EDGA 3UR7A 1BYCA 1PPIA 4P8XA 3VM7A 1QI5A 1OGGA 1OIMA 3AMKA 3NSXA 1TE1A 1W9VA 2J79A 2V5CA 3K4DA 5HPCA 4AC1X 3A6OA 1ITXA 5IFTA 1LL7A 5CPQA 3CO4A 4UZUA 2A3CA 3VKKA 4P8UA 3KL5A 1UD6A 3NJ3A 1YQ2A 3CUHA 1Q6GA 1NWUA 4MJ2A 4R5EA 1V02E 2VR5A 5D8ZA 5I78A 1PJ9A 2D0HA 1FHLA 3PTMA 3AS1A 1BG4A 1JDDA 1ESWA 3EMZA 3FXYA 3K1DA 1JGIA 2PWHA 4GPNA 1V6XA 3VIJA 4MB4A 3PZIA 2D22A 4B9YA 3VD4A 1PAMA 4D6HA 5E6ZA 5ABEA 3GH5A 2J7CA 4RE4A 5I2UA 3AXXA 3WDJA 3ARPA 5D9OA 4M1RA 3D5HA 2CPUA 4KRTA 4U33A 3W24A 2Y8KA 2FGZA 4UQAA 4BCEA 1VIWA 1WKYA 3MS8A 1JNDA 1E56A 1LWJA 1JDCA 3ZM8A 5AY7A 1B3VA 4BZYA 2J62A 4FLQA 5AC4A 2V3EA 3PZMA 4AISA 2XUCA 5TD4A 4PRWA 3CUGA 2GDVA 5A6MA 2XSAA 4PYSA 2PC8A 3OA5A 1JZ5A 3SCPA 1J0KA 7A3HA 3VIMA 4Y7EA 4AD1A 2GJPA 3VIFA 2CYGA 3VDHA 3L4WA 3WF2A 1KR0A 2GK1B 3MUY1 4IISA 3K8MA 4W89A 1HNYA 1V3MA 4WKHA 2D3LA 4OZOA 3W27A 2V3FA 3ARRA 3ECQA 5I0DA 2UY3A 5DF0A 1JDAA 8CGTA 1HKKA 1W91A 4M82A 3TTYA 3BAXA 3ZSTA 2X0HA 4Z2KA 5IHRA 3L4YA 1CGYA 4B9ZA 4JL2A 3ZQ9A 1PX4A 2JIEA 3POCA 1EQPA 2VZUA 3OZPA 2BS9A 2OYKA 5FL0A 1E71M 4E8CA 1TVNA 4RE3A 3AFBA 3FAXA 1E40A 1V6WA 1UR1A 1XYZA 1FP9A 2Y24A 1ZBKA 2G4FA 1GOQA 1MFVA 3ZJ6A 2FH8A 4F79A 1JIBA 3BMWA 3UERA 2EPOA 3U7BA 1NOFA 1D7FA 1M01A 1UR0A 1IT0A 2XVPA 1XCWA 4HTYA 5EB8A 3MU7A 2PWFA 3CH9A 5BXTA 2CKSA 4WKFA 2YJQA 3BAKA 4KRUA 4JKKA 2BY1A 3G6MA 4QLLA 2BY3A 1W9BM 4D6CA 4K68A 1QNSA 3EMCA 1GHRA 2BHYA 1CGVA 1GQLA 2YA1A 2WANA 4LPCA 4KGJA 4TVUA 3ARWA 2QV4A 4QCEA 1UH2A 3KWXA 4YHEA 4OOUA 3W4RA 2TAAA 1UWTA 4IUGA 4ATWA 1TZ7A 3AZSA 1G5AA 2DIJA 1VEPA 3WELA 5DO8A 3CBWA 1TUXA 4H8HA 1JYXA 4B3LA 3CIVA 4W8AA 4EK7A 1ZBVA 3CHCA 3MMWA 2XWDA 2X05A 3WEZA 1DTUA 1BGGA 1IV8A 3PZGA 4CU6A 3SUVA 5A69A 1R8LA 4AZGA 1DHKA 4AXNA 3AHVA 1SFSA 1W3HA 2J74A 4CN6A 3S6TA 5C70A 4H8VA 5FD0A 3VIKA 3BMVA 4OKDA 4F9DA 4FMVA 1QNOA 1Q4NX 1GVIA 3OLDA 4JIEA 2F8QA 5JUVA 2BVDA 3HU7A 3UCQA 2VX4A 1GQIA 2J8GA 3RJYA 2ZICA 3WMSA 4Z2LA 3CHFA 4FLSA 1J9YA 3VGFA 3ZIZA 1UG6A 3GXMA 1BQCA 1HL9A 1TVPA 1JXJA 3VMOA 3CZEA 4AEFA 5A8OA 1CPUA 2OYMA 4WKAA 3ZT5A 1E6XM 3GXIA 1F4AA 3M7SA 1R87A 1GOOA 4H7VA 3CZKA 4MPKA 1HKJA 2G3MA 2JE8A 3WQ5A 3NSNA 1S46A 3AICA 5I77A 3TTSA 1ECEA 3L4VA 4MNLA 2YL9A 5I23A 4M81A 5M3WA 3T2PA 4U3CA 2X2YA 4MDOA 3VNZA 1NH6A 3WD3A 4X0NA 3BLPX 2WPGA 3AIWA 4KGLA 1KWGA 3ARXA 2E8YA 2ZUVA 1US2A 3L4TA 4HMCA 2OSXA 1OCQA 3SCQA 1I75A 5IFPA 2YDQA 4AYSA 3OGSA 3OG2A 2G41A 1WO2A 4U3AA 1MWOA 4KMQA 4AZ5A 1DWIM 3VD9A 2E40A 3MMDA 5JBDA 1E6PA 4S3JA 5A6LA 1ITCA 1PIGA 4XB3A 3AIVA 4JCLA 3K4AA 2ZE0A 3GH4A 1ISWA 2CETA 3GXFA 3WUGA 4W93A 1BG9A 2E4TA 2WMIA 2JEQA 4MJ4A 2WHKA 4MADA 4UQEA 3WDQA 4WF7A 3N13A 2PI6A 4FLRA 1L8NA 2DSUA 2VR4A 1B0IA 4ATDA 3APGA 5AYIA 1CLXA 2FH6A 2AMGA 3N18A 3QGVA 1XH2A 2GK1A 3MV01 1BYAA 1Q6CA 1DWJM 2EJ1A 1NOUA 1XSJA 1R7AA 2WZEA 4KWUA 3VD5A 4ZXOA 3M46A 3VMNA 3O9NA 1WZKA 2GFTA 4M24A 4MNKA 2YL8A 4HA3A 3WNLA 1WE5A 3WNNA 5ECUA 1UD5A 2ESCA 4X0VA 3OLGA 5HOSA 3SIMA 5BRPA 2ZX9A 1TA3A 2OSWA 1U2YA 2X8RA 2WHMA 4ZEPA 3TA9A 4NF7A 2VCBA 1SR0A 4H2CA 1HL8A 1HKIA 2PF0A 4OBSA 3FAWA 1GVYA 1BGAA 2XFRA 4GI8A 3BC9A 1UA7A 4GO9A 2VUYA 1JG9A 3WH8A 1KXVA 2ZX7A 1XD1A 1QNRA 1LG1A 3FN9A 4ZE5A 3VIIA 1EA9C 2BFGA 2ZUWA 4UCFA 5D4YA 4A4AA 2XFYA 2J78A 2VMFA 1QI3A 4P8WA 3AMLA 1EIBA 1HIZA 4W5ZA 1ZL1A 4PMRA 5CG0A 4PSPA 5DEZA 3GZAA 4GINA 1E70M 4PN2A 1NP2A 1XC6A 2D3NA 2EQDA 1D2KA 4UQCA 4U2ZA 2IUZA 1AQ0A 3EBVA 3ARVA 3N04A 2YA2A 3VX0A 1H09A 5CLTA 3HJEA 1ISYA 2PB1A 1GW1A 1CYGA 1QOXA 1E0WA 5BWFA 2IXUA 5A1AA 1E9LA 4URIA 1EDQA 3PZQA 1JZ2A 3MUAA 4KH2A 4Z2JA 3WF4A 2DDXA 2WZHA 2HISA 2J7DA 3SUTA 6A3HA 1H41A 3ZMRA 1M03A 1VJZA 3VMPA 3AYSA 1G94A 1HJUA 1UWSA 2WC4A 5A6BD 3W6LA 1JI1A 4JHOA 3W82A 3RJXA 3ARTA 1BF2A 1E3XA 1JF5A 2GVYA 5FOOA 1E6QM 5EFFA 1CIUA 5D8WA 1VENA 1LF1A 4UTFA 5IDIA 3NSMA 1A3HA 1PX8A 2YKKA 3VIOA 1EQCA 1J0HA 2DIEA 1WDPA 1O7AA 2J7BA 4UQ9A 5BYWA 4C91A 2J77A 5LA2A 2WVTA 1C8YA 2DQXA 1HP5A 3K46A 3KZSA 1X6NA 4JZ5A 4EANA 3AS0A 5BXPA 2WC3A 3WBAA 1TCMA 3WD1A 3BSHA 4J3VA 2XIIA 4AW7A 2YLAA 4HOZA 1JYWA 3CUJA 3W25A 1JZ4A 1X6LA 4W88A 1BSIA 1XD0A 4MAZA 1WB0A 4ACYA 2W61A 4AEEA 2C8NA 1OWQA 2GJXB 2QPUA 5A6SA 1H1NA 3AYRA 3UR8A 1V3LA 3O2LA 3N1AA 2WWCA 1K6AA 2W66A 1YHTA 4HZ6A 3N9KA 1CZ1A 4D72A 5A6JA 3WFZA 1HKMA 3ZR5A 2J75A 1JYNA 1LJYA 2VZVA 1M04A 1MW1A 1KCLA 1TG7A 1VFMA 5DMYA 5HNNA 5D9NA 1JD9A 4Q7NA 4CKQA 4PCTA 4XZWA 1EHAA 2EEXA 3WQ8A 1MW0A 2G3JA 1OSEA 1GORA 1E0XA 1SMAA 3EDJA 4HA4A 1EO7A 2Z1SA 1MXGA 2DSZA 4AY1A 3WDRA 4BQ3A 3IANA 4HPGA 3M6DA 4V27A 3EDDA 5E0FA 4FLOA 4MNJA 3UG5A 2E9BA 1H11A 2DT3A 1I1WA 4H41A 4WLCA 1GPFA 3PZOA 4PMNA 2WMHA 2WVVA 4BQ2A 2A3EA 4PMZA 3OLIA 1E6NA 1PZ2A 2MANA 4TVDA 3ZSSA 5M03A 1KQZA 4F9JA 2WK2A 3VOCA 1E5NA 2EBNA 4C7GA 2OLHA 3BCFA 4XZBA 4AZCB 5BROA 2EPLX 2A3BA 2W4XA 1PEZA 4MB3A 5A3HA 2W91A 1MXDA 3VTRA 1KBBA 5FL1A 5GPRA 3W28A 1J18A 3MSGA 2J7HA 4HOXA 3EDKA 1XV8A 1ZJBA 4FK9A 2VX7A 4Q22A 3WUFA 2B31A 2CBUA 3VIHA 2DPEA 1N82A 1ODZA 2BVYA 3L4UA 2OWXA 1FFRA 2VNCA 2W5FA 2RGLA 1J0ZA 4X9YA 4MDPA 1UWQA 3PBGA 4J27A 5LA1A 5CPTA 2VX5A 1UKOA 3WY1A 2XM2A 4CD4A 4IPLA 1W9PA 3O6AA 3U57A 3N11A 1A47A 1CGUA 1QHZA 4OBRA 3CPUA 5A6AA 1JZ3A 4LXFA 4AZ7A 1W1YA 3WN6A 2DT1A 1DP0A 5AC5A 4ACZB 1UWRA 3IK2A 1VFUA 3RM4A 4BF7A 1UYQA 2AOSA 1V03A 3NCOA 4F66A 4GQRA 2PWGA 1RP9A 4LYQA 5I3DA 3DYMA 7CGTA 1UKTA 1W2PA 3KL3A 3VUPA 4AZBA 1QBBA 2WBKA 3IAPA 2VL4A 1B30A 1UWIA 1JFHA 2D20A 2JF6A 4W8LA 1C7TA 1GJWA 3JUGA 3LPOA 3W0KA 1C91A 3WL1A 4V2XA 4JFVA 1JAEA 1NOWA 1V3HA 2ZXAA 4QP0A 2BXZA 3N15A 1WCGA 4CU7A 4UOQA 2CCRA 1LL6A 3F5LA 2DSWA 3CUFA 5M5DA 1GZJA 2E8ZA 3WNMA 4LX4A 3B9DA 4DWSC 3EMQA 2WNWA 4E8DA 1GJUA 4D6DA 4CN4A 1K9DA 3ZO9A 1UD4A 3CUIA 3WDIA 3ZT7A 3SURA 3RDKA 5BRQA 2QMKA 4D6IA 2VVSA 4U2YA 4UFIA 1PX3A 4P7LA 2DT0A 1F4HA 4W86A 1JZ6A 4DWSB 4UOZA 4AD4A 4P7QA 1CGTA 1E6RA 2C0HA 3ZJ8A 1XRVA 2J7FA 2CBJA 1B90A 4MTVA 1V6YA 4EAMA 4D6EA 3CGTA 1CDGA 2X09A 1HJWA 4CU8A 1GOKA 3UETA 5KZ6A 2J7EA 3N12A 5ABFA 1JD7A 5CSUA 3SCUA 2OWCA 1QI0A 1QW8A 3VDCA 1KGXA 1ZS2A 2ZUSA 2Y2WA 2G8ZA 2W67A 3CLWA 5LYRA 2VZSA 1J01A 3RO8A 4QFUA 4IPNB 2CESA 3DYPA 3BSGA 4N42A 1MVYA 5GNXA 3ALGA 3FHAA 4MNMA 2EPNA 3CTTA 1OBAA 1XH1A 5D9PA 1UH3A 3IJ7A 1GONA 2JALA 1UD3A 1UA3A 5HBFA 2CITA 3WD4A 3BAYA 3IJ8A 3NYDA 2IXVA 2E9MA 3AI0A 3WNKA 2UY5A 1KBKA 3B9EA 5CZKA 4TVCA 1PBGA 4C7DA 1LWHA 1CECA 4W85A 2W92A 3K8LA 1EXPA 5GNZA 1NWRA 4CD8A 1WP6A 1E3ZA 2O92A 2G3IA 1UKSA 1B3WA 1WDQA 2ZXDA 5BXSA 1E4IA 1JAKA 2YLLA 2BXYA 1G1YA 2BY2A 3SCSA 1WNOA 1H49A 3QOKA 3VDAA 3SUSA 2D0GA 1CXLA 3TTOA 2GDUA 2XVNA 3DHUA 4D6FA 9CGTA 1B3YA 3LPFA 1U30A 3MMUA 1QI2A 5FIPA 3PZVA 5EMYA 1G0CA 3IJ9A 1CXHA 1PZ3A 2FGLA 1E6SM 3B8SA 3GH7A 3CZGA 5ABGA 1VEOA 2ZUTA 4HOWA 4B15A 3A3HA 3AIBA 3ARZA 2QMJA 3OB8A 4D6JA 2JF7A 4CCDA 3HN3A 1WDSA 3OIHA 1ZB5A 1FOBA 5D9MA 4PMDA 1JL8A 2Y4SA 4UFMA 3GBEA 4AIEA 1V02A 1BLIA 1HJSA 2D2OA 5I24A 4GXPA 5CQ1A 3EDEA 2RGMA 4AMCA 3AHXA 1RP8A 5AYBA 4WIWA 3NIYA 3SCRA 4P7RA 1ODUA 2YL5A 2E3ZA 3TTQA 1QBAA 1BFNA 1BYBA 1UR2A 4J7RA 5F7UA 3MV11 2WKGA 1H3GA 4ZE4A 1H0IA 4PTWA 1JI2A 3BH4A 1VJSA 4UFHA 2NT1A 4GKLA 3BAJA 3PTKA 1ZU8A 4GZEA 1KWKA 4UQDA 3GDBA 3WNPA 2VX6A 3AMCA 2XM1A 2DH3A 1ZJAA 5C71A 1JZ7A 1IZJA 1BPLB 6TAAA 4MB1A 3ZJKA 2VURA 4PTXA 2VRQA 3TONA 4UFKA 3AJ7A 1UR4A 4AIOA 5I5RA 4ML4A 1EOKA 5E0CA 4P8VA 2PWEA 3WD0A 4UNIA 4IM4A 2CXGA 3GXDA 2CNCA 4YPJA 2XYLA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4W84 A;  1GOM A;  1UZ4 A;  2WLZ A;  2ZUU A;  1CEO A;  3BGA A;  5CGT A;  5CPS A;  2C7F A;  1KGU A;  3IAQ A;  3PZ9 A;  1HN1 A;  2WWD A;  4LYP A;  5E6Y A;  1EDG A;  3UR7 A;  1BYC A;  1PPI A;  4P8X A;  3VM7 A;  1QI5 A;  1OGG A;  1OIM A;  3AMK A;  3NSX A;  1TE1 A;  1W9V A;  2J79 A;  2V5C A;  3K4D A;  5HPC A;  4AC1 X;  3A6O A;  1ITX A;  5IFT A;  1LL7 A;  5CPQ A;  3CO4 A;  4UZU A;  2A3C A;  3VKK A;  4P8U A;  3KL5 A;  1UD6 A;  3NJ3 A;  1YQ2 A;  3CUH A;  1Q6G A;  1NWU A;  4MJ2 A;  4R5E A;  1V02 E;  2VR5 A;  5D8Z A;  5I78 A;  1PJ9 A;  2D0H A;  1FHL A;  3PTM A;  3AS1 A;  1BG4 A;  1JDD A;  1ESW A;  3EMZ A;  3FXY A;  3K1D A;  1JGI A;  2PWH A;  4GPN A;  1V6X A;  3VIJ A;  4MB4 A;  3PZI A;  2D22 A;  4B9Y A;  3VD4 A;  1PAM A;  4D6H A;  5E6Z A;  5ABE A;  3GH5 A;  2J7C A;  4RE4 A;  5I2U A;  3AXX A;  3WDJ A;  3ARP A;  5D9O A;  4M1R A;  3D5H A;  2CPU A;  4KRT A;  4U33 A;  3W24 A;  2Y8K A;  2FGZ A;  4UQA A;  4BCE A;  1VIW A;  1WKY A;  3MS8 A;  1JND A;  1E56 A;  1LWJ A;  1JDC A;  3ZM8 A;  5AY7 A;  1B3V A;  4BZY A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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